علاوه بر نظریه همزیستی شناخته شده منشأ سلولی میتوکندری و کلروپلاست، نظریاتی وجود دارد که سلول‌ها به پراکسی‌زوم‌ها، اسپیرکت‌ها به مژک‌ها و تاژک‌ها، و احتمالاً یک ویروس DNA به هسته سلولی منجر شدند، اگرچه هیچ کدام از آنها به طور گسترده پذیرفته نشده‌اند. 