با این حال، مخالفان به طور کلی به محصولات GM به دلایل متعددی از جمله نگرانی های زیست محیطی، اینکه آیا غذای تولید شده از محصولات GM ایمن است، اینکه آیا محصولات GM برای رفع نیازهای غذایی جهان لازم است و نگرانی های اقتصادی ناشی از این واقعیت که این ارگانیسم ها مشمول قانون مالکیت معنوی هستند، اعتراض کرده اند.