इराक के खिलाफ संयुक्त राष्ट्र के प्रतिबंधों के खिलाफ मैयरेड मागुइरे ने कड़ा विरोध जताया, जिसका आरोप है कि कुछ लोगों ने सैकड़ों नागरिक मौतें कीं, उन्हें "अन्यायपूर्ण और अमानवीय", "एक नए तरह का बम" और "यहां तक कि" कहा हथियारों से ज्यादा क्रूर। ” मार्च 1999 में अर्जेंटीना के सहयोगी अडोल्फ़ो पेरेज़ एस्क्विवेल के साथ बगदाद की यात्रा के दौरान, मैगुइरे ने तत्कालीन अमेरिकी राष्ट्रपति बिल क्लिंटन और ब्रिटिश प्रधान मंत्री टोनी ब्लेयर से इराक की बमबारी को समाप्त करने और संयुक्त राष्ट्र की मंजूरी की अनुमति देने का आग्रह किया। मैगुइरे ने कहा, "मैंने बच्चों को अपनी माताओं के बगल में मरते देखा है। "वे सैनिक नहीं थे।" 

सितंबर 2001 में अमेरिका पर अल-कायदा के हमलों के बाद, क्योंकि यह स्पष्ट हो गया था कि अमेरिका अफगानिस्तान में सैनिकों की जवाबी कार्रवाई और तैनाती करेगा, मैगुएर ने आसन्न युद्ध के खिलाफ अभियान चलाया। भारत में उसने दावा किया कि "सैकड़ों भारतीय लोग शांति के लिए चल रहे हैं।" न्यूयॉर्क में, मैगुइरे को 10,000 प्रदर्शनकारियों के साथ मार्च करने की सूचना मिली थी, जिनमें 9/11 पीड़ितों के परिवार भी शामिल थे, क्योंकि अफगानिस्तान में तालिबान के ठिकानों पर हमला करने के लिए अमेरिकी युद्धक विमानों को पहले से ही मार्ग दिया गया था। 

ईराक के मार्च 2003 के आक्रमण की ओर अग्रसर होने की अवधि में, मायरेड मैगुइरे ने प्रत्याशित शत्रुता के खिलाफ सख्ती से अभियान चलाया। अगस्त 2002 में डबलिन, आयरलैंड में 23 वें युद्ध के अंतर्राष्ट्रीय सम्मेलन में बोलते हुए, मैगुइर ने आयरिश सरकार से इराक युद्ध का विरोध करने का आह्वान किया "हर यूरोपीय और विश्व फोरम में वे एक हिस्सा हैं।" 17 मार्च 2003 को सेंट पैट्रिक डे, मैगुइरे ने अन्य कार्यकर्ताओं, फ्रीडा बेरिगन के साथ संयुक्त राष्ट्र मुख्यालय के बाहर युद्ध का विरोध किया। 19 मार्च को, मैगुएर ने सिरैक्यूज़ के ले मोयने कॉलेज में एक चैपल में 300 लोगों के दर्शकों को संबोधित किया, एनवाई "उनके सभी सामूहिक विनाश के उन्नत हथियारों के साथ इराकी लोगों का सामना कर रहे हैं जिनके पास कुछ नहीं है," उसने भीड़ को बताया। "किसी की भाषा में, यह उचित नहीं है।" इस समय के दौरान, मैगुइरे ने 30-दिवसीय उपवास रखा और व्हाइट हाउस के बाहर 40-दिवसीय तरल उपवास शुरू किया, जिसमें पैक्स क्रिस्टी यूएसए और ईसाई चर्च के नेताओं ने भाग लिया। जैसा कि युद्ध के बाद के दिनों में युद्ध शुरू हुआ, मागुइरे ने आक्रमण को एक "चल रहा है और शर्मनाक वध" के रूप में वर्णित किया। मैगुइरे बाद में टिप्पणी करेंगे कि अमेरिका में मीडिया इराक से विकृत खबर है और अमेरिकी "आर्थिक और सैन्य हितों" की खोज में इराक युद्ध किया गया था। फरवरी 2006 में उसने विश्वास व्यक्त किया कि जॉर्ज डब्ल्यू बुश और टोनी ब्लेयर को "दुनिया में अवैध रूप से युद्ध के लिए और मानवता के खिलाफ युद्ध अपराधों के लिए जवाबदेह बनाया जाना चाहिए।" 

होलोकॉस्ट का संदर्भ
इराक और अफगानिस्तान
पुरस्कार और सम्मान
राष्ट्रपति बराक ओबामा की आलोचना