कुनैन परिवार की क्लोरोक्वीन (अंग्रेजी: "chloroquine") मलेरिया के लिये सबसे सस्ती तथा प्रभावी दवा मानी जाती रही है और इसका प्रयोग वर्षों तक बहुत किया गया। किंतु हाल में परजीवी इसके प्रति प्रतिरोधी हो गये हैं, खासकर "पी. फैल्सीपैरम"। ऐसे परजीवी कुनैन तथा एमोडियाक्वीन (अंग्रेजी: "amodiaquine") के प्रति भी प्रतिरोध विकसित कर लेते हैं। जिन क्षेत्रों में परजीवी अब भी क्लोरोक्वीन के प्रति संवेदनशील हैं, वहाँ इसे ही सबसे पहले इस्तेमाल किया जाता है। अन्य दवाओं में प्रिमाक्वीन (अंग्रेजी: "primaquine"), हाइड्रॉक्सीक्लोरोक्वीन (अंग्रेजी: "hydroxychloroquine"), पैमाक्वीन (अंग्रेजी: "pamaquine") और मेफ्लोक्वीन (अंग्रेजी: "mefloquine") शामिल हैं। इनमें से कुनैन और प्रिमाक्वीन केवल उपचार में प्रयुक्त होती हैं (प्रिमाक्वीन केवल "पी. विवैक्स" और "पी. ओवेल" के विरुद्ध), जबकि क्लोरोक्वीन, हाइड्रॉक्सीक्लोरोक्वीन और मेफ्लोक्वीन को उपचार और निरोध दोनों के लिए प्रयोग में लाया जाता है।

आयुर्वैदिक उपचार
औषधि संयोजन
नकली दवाएँ
कुनैन जैसी औषधियाँ