2001 के रिकॉर्ड "रेप्टाइल" के जारी होने के बाद, एरिक ने 2002 में पार्टी एट द पैलेस में "लैला" और "व्हाइल माई गिटार जेन्टली वीप्स" का प्रदर्शन किया। उस वर्ष 29 नवम्बर को रॉयल अल्बर्ट हॉल में अ कॉन्सर्ट फॉर जॉर्ज आयोजित किया गया, यह जॉर्ज हैरिसन को एक श्रद्धांजलि थी जो एक वर्ष पहले कैंसर से मर गए थे। क्लैप्टन वहां एक कलाकार थे और संगीत निर्देशक भी. उस कार्यक्रम में पॉल मेकार्टनी, रिंगो स्टार, जैफ लीन, टॉम पेट्टी, रवि शंकर और अन्य शामिल थे। 2004 में, क्लैप्टन ने दो एल्बम जारी किया जिसमें महान ब्लू-वादक रॉबर्ट जॉनसन के कवर "मी एंड मिस्टर जॉनसन" और "सेशंस फॉर रॉबर्ट जूनियर" भरे हुए थे। उसी वर्ष "रॉलिंग स्टोन" ने अपनी "सर्वकालिक 100 महानतम कलाकारों" की सूची पर क्लैप्टन को #53 पर रखा। 
22 जनवरी 2005 को क्लैप्टन ने कार्डिफ में मिलेनियम स्टेडियम में आयोजित सुनामी राहत कार्यक्रम में 2004 के भारतीय महासागर भूकंप के पीड़ितों के सहायतार्थ प्रदर्शन किया। मई 2005 में, एरिक क्लैप्टन, जैक ब्रूस और जिंजर बेकर ने लंदन में रॉयल अल्बर्ट हॉल में कार्यक्रमों की एक श्रृंखला के लिए क्रीम के रूप में फिर से हाथ मिलाया। कार्यक्रम की रिकॉर्डिंग को CD और DVD पर जारी किया गया। बाद में, क्रीम ने न्यूयॉर्क में मैडिसन स्क्वायर गार्डन में प्रदर्शन किया। लगभग पांच सालों में क्लैप्टन का मूल सामग्री वाला नया एल्बम, "बैक होम", 30 अगस्त को रीप्राइस रिकॉर्ड्स पर जारी किया गया। 2006 में उन्होंने डेरेक ट्रक और डोयल ब्रमहाल II को अपने 2006-2007 के विश्व दौरे के लिए अपने बैंड में शामिल होने के लिए आमंत्रित किया। ट्रक्स, क्लैप्टन का सहयोग करने वाले द ऑलमन ब्रदर्स बैंड के तीसरे सदस्य थे, दूसरे थे पियानोवादक/कीबोर्डवादक चक लेवल जो "MTV अनप्लग्ड" और "24 नाइट्स" के प्रदर्शन पर लंदन के रॉयल अल्बर्ट हॉल थिएटर में 1990 में और 1991 में और साथ ही साथ क्लैप्टन के 1992 के अमेरिका दौरे पर दिखाई दिए थे।

20 मई 2006 को, क्लैप्टन ने कंट्रीसाइड एलायंस के समर्थन में हाईक्लेरे कैसल में क्वीन के ड्रम वादक रोजर टेलर और पिंक फ्लोयड के पूर्व बॉस वादक रोजर वाटर्स के साथ प्रदर्शन किया। 13 अगस्त 2006 को, क्लैप्टन ने कोलंबस ओहियो में बॉब डिलन के संगीत कार्यक्रम में एक अतिथि के रूप में प्रस्तुति दी और जिमी वॉन के आरंभिक अंक में तीन गानों पर गिटार बजाया. गिटारवादक जे जे काले के साथ "द रोड टु इस्कॉनडिडो" शीर्षक की एक सहभागिता को 7 नवम्बर 2006 को जारी किया, जिसमें बिली प्रेस्टन और डेरेक ट्रक्स शामिल थे। 14 ट्रैक वाली इस CD का उत्पादन और रेकॉर्डिंग दोनों ने कैलिफोर्निया में अगस्त 2005 में किया था। क्लैप्टन और ट्रक्स के बीच के मेल ने उन्हें द डेरेक ट्रक्स बैंड को, क्लैप्टन के 2007 क्रॉसरोड्स गिटार फेस्टिवल में सेट का शुभारम्भ करने के लिए आमंत्रित करने को प्रेरित किया, जिसमें बाद में सेट पर ट्रक रह जाते हैं और वे क्लैप्टन के बैंड के साथ उनके सभी प्रदर्शन में साथ देते हैं और उनके साथ एक विश्व दौरे पर भी जाते हैं।

क्रिस्टोफर सिमोन साइक्स द्वारा लिखित और 2007 में प्रकाशित क्लैप्टन के आधिकारिक संस्मरण के अधिकार, 2005 फ्रेंकफर्ट पुस्तक मेले में USD $4 मिलियन में बिके.

26 फ़रवरी 2008 को यह सूचना दी गई कि उत्तर कोरियाई अधिकारियों ने क्लैप्टन को कम्युनिस्ट देश में एक संगीत कार्यक्रम में वादन के लिए आमंत्रित किया है। रिपोर्टों के अनुसार, क्लैप्टन के प्रबंधन को निमंत्रण मिला और उन्होंने इसे गायक तक पहुंचाया, जो सिद्धांत रूप से सहमत हो गए और सुझाव दिया कि यह 2009 में कभी आयोजित होगा। एक प्रवक्ता, क्रिस्टन फोस्टर ने कहा, "एरिक क्लैप्टन को दुनिया के कई देशों में प्रस्तुति देने के लिए आमंत्रण मिलता है" और "उत्तरी कोरिया में उनके कार्यक्रम के लिए कोई समझौता नहीं है।"

2007 में, क्लैप्टन को अपने पिता के बारे में और अधिक जानकारी मिली, एक कनाडाई सैनिक जिन्होंने युद्ध के बाद ब्रिटेन को छोड़ दिया। यद्यपि क्लैप्टन के दादा-दादी ने अंततः उन्हें उनके पितृत्व के बारे में सच बता दिया, उन्हें सिर्फ इतना पता था कि उनके पिता का नाम एडवर्ड फ्रायर था। क्लैप्टन के लिए यह एक बेचैनी का कारण था, जो 1998 के उनके गीत "माई फादर्स आई" में झलकता है। माइकल वोलोसचुक नाम के मॉन्ट्रियल के एक पत्रकार ने कनाडा के सशस्त्र बलों के सेवा रिकॉर्ड का अनुसंधान किया और फ्रायर के परिवार के सदस्यों को खोज निकाला और अंत में कहानी को एक साथ जोड़ा. उन्हें पता चला कि क्लैप्टन के पिता एडवर्ड वाल्टर फ्रायर का जन्म मॉन्ट्रियल में 21 मार्च 1920 को हुआ था और उनकी मृत्यु 15 मई 1985 को न्यूमार्केट, ओंटारियो में हुई। फ्रायर एक संगीतकार (पियानो और सैक्सोफोन) और एक आजीवन घुमक्कड़ थे, जिन्होंने कई शादियां कीं और उनके कई बच्चे थे और जाहिरा तौर पर उन्हें कभी यह नहीं पता चला कि वे एरिक क्लैप्टन के पिता हैं। क्लैप्टन ने ओटावा, कनाडा में मेक्डोनाल्ड कार्टिअर हवाई अड्डे पर आमना-सामना होने पर वोलोसचुक को धन्यवाद दिया। 

फरवरी 2008 में, क्लैप्टन ने मैडिसन स्क्वायर गार्डन में अपने लम्बे समय के दोस्त स्टीव विनवुड के साथ प्रदर्शन किया और विनवुड के एल्बम "नाइन लाइव्स" में उनके रिकॉर्ड किये गए एकल में अतिथि कलाकार बने। ब्लाइंड फेथ के ये दो पूर्व साथी, जून 2009 में सम्पूर्ण अमेरिका में 14 संगीत कार्यक्रमों की एक श्रृंखला के लिए दोबारा साथ आए।

क्लैप्टन का 2008 ग्रीष्मकालीन दौरा, फोर्ड एम्फ़ीथियेटर, टंपा बे, फ्लोरिडा में 3 मई को शुरू हुआ और फिर कनाडा, आयरलैंड, इंग्लैंड, नार्वे, आइसलैंड, डेनमार्क, पोलैंड, जर्मनी और मोनाको पहुंचा। 28 जून 2008 को, एरिक क्लैप्टन ने लन्दन के हाइडे पार्क (पूर्व में हाइडे पार्क कॉलिंग) हार्ड रॉक कॉलिंग 2008 के लिए सैटरडे नाईट में प्रमुख कार्यक्रम प्रस्तुत किया जिसमें उन्हें शेरिल क्रो और जॉन मेयर से समर्थन मिला। सितम्बर 2008 में, क्लैप्टन ने सोहो, लंदन में फ्लोरिडिटा में कंट्रीसाइड एलायंस के लिए एक निजी धर्मार्थ निधीयन पर प्रदर्शन किया, जिसमें लन्दन के मेयर बोरिस जॉनसन जैसे मेहमान उपस्थित थे।
मार्च 2009 में, क्लैप्टन ने (अन्य उल्लेखनीय मेहमानों के साथ) ऑलमन ब्रदर्स बैंड 40वें वर्ष के उत्सव में प्रदर्शन किया और बीकन थियेटर में अपने वार्षिक कार्यक्रम में डुऐन ऑलमन को श्रद्धांजलि दी, इस कार्यक्रम में उनके साथ थे ड्रम वादक बुच ट्रक्स जिन्होंने कहा कि "प्रस्तुति के लिए आमंत्रित किए गए मेहमानों की संख्या और अंतर को देखते हुए "यह" प्रदर्शन ठेठ ऑलमन ब्रदर्स के अनुभव वाला नहीं था। "एरिक क्लैप्टन "हमें" सिखाया!", ट्रक्स ने कहा. गाने जैसे, "इन मेमोरी ऑफ़ एलिजाबेथ रीड" में अन्य भी शामिल थे जैसे "द वेट", लेवोन हेल्म के साथ; हेंड्रिक्स के "रेड हाउस" के प्रेक्षक में जॉनी विंटर और बेशक "लैला". 4 मई 2009 को क्लैप्टन, रॉयल एल्बर्ट हॉल में एक फीचर अतिथि के रूप में प्रस्तुत हुए और उन्होंने जो बोनामस्सा के साथ "फर्दर ऑन द रोड" पेश किया।

30 अक्टूबर 2009 को मैडिसन स्क्वायर गार्डन में रॉक एंड रोल हॉल ऑफ़ फेम की 25वीं सालगिरह पर प्रदर्शन करने वाले कलाकारों में क्लैप्टन का कार्यक्रम निर्धारित था, लेकिन गालस्टोन सर्जरी के कारण इसे रद्द कर देना पड़ा. वैन मोरिसन ने (इन्होने भी रद्द किया) एक इंटरव्यू में कहा कि उन्हें और क्लैप्टन को "कुछ गीत प्रस्तुत करने थे" लेकिन अब वे "खेल के किसी अन्य चरण में" एक साथ कुछ और करेंगे। क्लैप्टन ने जेफ बेक के साथ, लंदन के O2 अरेना पर 13-14 फ़रवरी 2010 को दो रात्रि का कार्यक्रम पेश किया। यार्डबर्ड्स के इन दो पूर्व सदस्यों ने अपने 2010 के दौरे को बढ़ाते हुए मैडिसन स्क्वायर गार्डन, एयर कनाडा सेंटर और मॉन्ट्रियल में बेल सेंटर को भी शामिल किया। क्लैप्टन ने 25 फ़रवरी से 13 मार्च 2010 तक संयुक्त राज्य अमेरिका के 11 शहरों में संगीत कार्यक्रमों की एक श्रृंखला का प्रदर्शन किया। स्टीव विनवुड के साथ उनका तीसरा यूरोपीय दौरा 18 मई से 13 जून के बीच चलेगा. 

प्रेरणा
2006-07 टूर बैंड
बैंड
2000 का दशक