 मौखिक पोलियो वैक्सीन (ओपीवी) के बारे में एक प्रमुख मुद्दा है, इसकी खुद को ऐसे स्वरुप में लौटा लेने की विदित क्षमता, जिससे की स्नायविक संक्रमण और पक्षाघात हो सकता है। टीका व्युत्पन्न पोलियो वायरस (VDPV) द्वारा प्रेरित, पक्षाघात सहित, अन्य नैदानिक रोग, जंगली पोलियो वायरस द्वारा प्रेरित रोगों से अविभेद्य हैं। हालाँकि इसे एक दुर्लभ घटना माना जाता है, वैक्सीन से जुड़े पक्षाघाती पोलियोमाइलिटिस (VAPP) के प्रकोप को दर्ज किया गया है, और यह निम्न ओपीवी कवरेज वाले क्षेत्रों में प्रवृत्त होता है, सम्भवतः क्योकि ओपीवी स्वयं सम्बंधित प्रकोप के प्रति सुरक्षात्मक है। 

जैसे जैसे जंगली पोलियो की घटनाएं कम हो रही हैं, अनेक देश मौखिक टीके के इस्तेमाल से इंजेक्शन टीके की तरफ लौट रहे हैं, क्योकि ओपीवी से उत्पन्न iatrogenic पोलियो (VAPP) का प्रत्यक्ष खतरा ओपीवी के प्रारंभिक संचरण के अप्रत्याशित लाभ से ज्यादा महत्वपूर्ण है। आई पी वी के इस्तेमाल से परावर्तन मुमकिन नहीं है लेकिन परावर्तित ओपीवी या जंगली पोलियो विषाणु से अरक्षितता होने पर नैदानिक संक्रमण का थोडा जोखिम बना रहता है। मध्य 1950 के दशक में पोलियो टीके के व्यापक उपयोग के बाद कई औद्योगिक देशों में पोलियो की घटनाओं में तेजी से गिरावट आई है। 2000 में संयुक्त राज्य अमेरिका में ओपीवी का इस्तेमाल बंद कर दिया गया और 2004 में ब्रिटेन में भी इसका इस्तेमाल बंद कर दिया गया है, लेकिन दुनिया भर में इसका इस्तेमाल जारी है।

VAPP (टीका सम्बंधित पक्षघाती पोलियो) की दर क्षेत्र विशेष के साथ साथ बदलती रहती है, लेकिन आमतौर पर यह प्रति ७५०,००० टीका प्राप्तकर्ताओं में से एक की है। VAPP के बच्चों की तुलना में वयस्कों में होने की संभावना अधिक है। प्रतिरक्षाहीन (immunodeficient) बच्चों में VAPP होने का जोखिम लगभग 7,000 गुना ज्यादा होता है, विशेषकर बी lymphocyte विकारों (जैसे की agammaglobulinemia और hypogammaglobulinemia) वाले व्यक्तियों में, जिनसे की सुरक्षात्मक रोग्प्रतिकारकों का संस्लेषण कम हो जाता हैं। विश्व स्वास्थ्य संगठन का मानना है की टीका व्युत्पन्न पोलियो के जोखिम की तुलना में टीकाकरण के फायदों का पलड़ा काफी भारी है। टीका व्युत्पन्न पोलियो के प्रकोप को उच्च गुणवत्ता वाले टीकाकरण के कईं दौर के द्वारा रोका गया है, ताकि पूरी जनसंख्या को प्रतिरक्षित किया जा सके.

VAPP ka प्रकोप स्वतंत्र रूप से बेलारूस (1965-1966), कनाडा (1966-1968), मिस्र (1983-१९९३),Hispaniola(2000-2001), फिलीपींस (2001), मेडागास्कर (2001-2002), और हैती (2002) में हुआ, जहां राजनीतिक संघर्ष और गरीबी ने टीकाकरण के प्रयासों में दखल दिया. 2006 में चीन में वैक्सीन व्युत्पन्न पोलियो वायरस फैला. कंबोडिया (2005-2006), म्यांमार (2006 -2007), इरान (1995 -2007), सीरिया, कुवैत और मिस्र में भी मामले दर्ज किये गए। 2005 के बाद से, विश्व स्वास्थ्य संगठनउत्तरी नाइजीरिया में जीवित मौखिक पोलियो टीके में उत्परिवर्तन के कारण हुए टीका व्युत्पन्न पोलियो पर नज़र रख रहा है।

संदूषण से जुड़े मुद्ददे
मौखिक टीका
Iatrogenic (वैक्सीन प्रेरित) पोलियो
निष्क्रिय टीके