द्वीप के सर्वप्रथम वानस्पतिक प्रेक्षण 1883 में ह्यूम द्वारा उस समय किए गए, जब पूरी सदी भर से नारियल के बाग़ान प्रचालन में रहे थे। परवर्ती अध्ययन व रोपण युग के दौरान संग्रहण 1885, 1905, 1939 और 1967 में संपन्न हुए. इस प्रकार, संपर्क से पूर्व की वनस्पति की प्रकृति के बारे में बहुत ही कम जानकारी मौजूद है।

स्मिथसोनियन द्वारा प्रकाशित 1967 का सर्वेक्षण, हाल ही के अनुसंधान के लिए सबसे प्राधिकृत आधार-रेखा के रूप में प्रयुक्त किया जाता है। इन अध्ययनों से संकेत मिलता है कि शायद द्वीप की वनस्पति में तेजी से बदलाव आ रहे हैं। उदाहरण के लिए, JMW टॉप ने 1993-2003 के बीच वार्षिक रूप से आंकड़े संग्रहित किए और पाया कि मुख्य रूप से डिएगो गार्सिया में, औसतन प्रत्येक वर्ष पौधों की तीन प्रजातियां आ रही हैं। उनके शोध ने स्टोडार्ट की प्रजातियों में एक तिहाई से अधिक प्रजातियों को जोड़ा. टॉप और क्यू गार्डन के मार्टिन हैमिल्टन ने 2009 में अभी हाल ही की वनस्पति जांचसूची को संकलित किया, जिसे इसकी पाद टिप्पणी में देखा जा सकता है।

1967 में, स्टोडार्ट ने डिएगो गार्सिया के भू क्षेत्र को स्केवोला टकाडा" के तटवर्ती बाड़ से घिरा हुआ और अंदर की ओर कोकोस न्यूसीफ़ेरा" (नारियल) को द्वीप का अधिकांश भाग आच्छादित करने वाले प्रमुख पेड़ के रूप में वर्णित किया। उप-खंड बाग़ के समान व्यवस्थित था, जहां निचले खंड में 0.5 मीटर ऊंचाई से कम पौधे या वे पौधे मौजूद थे, जिन्हें उन्होंने "कोकोस बॉन-डियु" नाम दिया, जो तरुण वृक्षों का मध्यवर्ती खंड था और निचला स्तर स्व-रोपित पौधों से समृद्ध, जो उन क्षेत्रों को अपेक्षाकृत अभेद्य बनाता था।

रोपण-युगीन ग्राम स्थलों पर उष्णकटिबंधीय सख्त काष्ठ के वन और "कैशुरिना इक्विसेटिफ़ोलिया" (आयरन वुड पाइन) के जंगल भी शेष हैं।

1997 में, अमेरिकी नौसेना ने एक वनस्पति सर्वेक्षण करवाया और डिएगो गार्सिया में स्थलीय संवहनी पौधों की लगभग 280 प्रजातियों की पहचान की। इनमें से कोई भी स्थानिकमारी नहीं थीं और 2005 में एक और सर्वेक्षण ने 36 प्रजातियों की "देशीय" के रूप में पहचान की, यानी मानवों की सहायता के बिना उगने वाली और दुनिया में कहीं और न पाए जाने वाली. इस समय स्थलीय पौधों की कोई भी प्रजाति, किसी संरक्षण चिंता का कारण नहीं हैं।

डिएगो गार्सिया के 36 देशीय पौधों में, 12 वृक्ष, पांच झाड़ियां, सात द्विबीजपत्री शाक, तीन घास, चार बेल और पांच फ़र्न हैं।

वृक्ष की बारह प्रजातियां हैं: बैरिनग्टोनिया एशियाटिका" (मछली-विष पेड़), कैलोफ़ाइलम इनोफ़ाइलम" (अलेक्ज़ेंड्रियन लारेल), "कोकोस न्यूसिफ़ेरा", कॉर्डिया सबकॉर्डेटा" , ग्वेटार्डा स्पिशियोसा" , इन्ट्सिया बिजुगा" , हर्नांदिया सोनोरा" , मोरिंडा सिट्रिफ़ोलिया" , नेइसोस्पर्मा ऑपोज़िटिफ़ोलियम" , पाइसोनिया ग्रैंडिस" , टर्मिनालिया काटापा" और हीलियोट्रोपियम फ़ोर्थेरिएनम" . अन्य तीन पेड़ सामान्य हैं और देशीय हो सकते हैं, लेकिन संभव है कि इन्हें मनुष्यों ने रोपा हो: "कैशुरिना इक्विसेटिफ़ोलिया", हाइबिस्कस टिलियास्शियस" , और "पाइपटुरस अर्जेन्शियस" .

पांच देशीय झाडियां हैं: सिसालपिनिया बॉन्डक" , पेम्फ़िस एसिडुला" , प्रेम्ना सेराटिफ़ोलिया" , "स्केवोला टकाडा" (अक्सर “स्केवियोला” के रूप में ग़लत उच्चरित) और सुरियाना मरिटिमा" .

इसके साथ ही "अपतृण से भरे" या "देशीयकृत विदेशी प्रजातियां" के रूप में वर्गीकृत पौधों की 134 प्रजातियां भी मौजूद हैं, जो अनजाने में मनुष्य द्वारा रोपी गई या जानबूझ कर सजावटी या फसली पौधों के रूप में रोपी गई हो सकती है, जो अब "देशी बन गई" हैं, जिनमें 1995 से 32 नई प्रजातियां दर्ज की गई हैं, जो रोपे जाने वाले पौधों के दर में तीव्र वृद्धि दर्शाते हैं। प्रजातियों की सूची में शेष में शामिल हैं उगाई जाने वाली खाद्य या सजावटी प्रजातियां, जिनमें अधिकांश प्रतिबंधित वातावरण में उगाई जाती हैं, जिनमें कुछ एकल रोपक के व्यक्तिगत गमले में उगाई गई हो सकती हैं।

2004 में, प्रवालद्वीप के किनारे पर 10 मान्यता प्राप्त पौधों के समुदाय मौजूद थे:

1. कैलोफ़िलम वन में प्रचुर "कैलोफ़िलम इनोफ़िलम" मौजूद थे जिनके तने 2 मीटर व्यास से अधिक विकसित होते थे। इस वन में अक्सर किनारों पर "प्रेम्ना ऑब्टुसिफ़ोलिया" सहित "हर्नांदिया सोनोरा", "कोकोस न्यूसिफ़ेरा" और "ग्वेटार्डा स्पिशियोसा" शामिल होते हैं। समुद्र तट पर पाए जाने पर, "कैलिफ़ाइलम" अक्सर प्रवालद्वीप के जल में फैल जाते हैं और लाल टांगों वाले बूबीस को छिपने में मदद देते हैं, जैसा कि "बैरिंग्टोनिया एशियाटिका" भी करते हैं। अधिकांशतः प्रवालद्वीप के पूर्वी दिशा में पाए जाते हैं।

2. कोकोस वन, अनिवार्य रूप से एक-प्रतिरूपी ("कोकोस बॉन डियु") है, जिसकी निचली पंक्ति में कोकोस के पौधे होते हैं।

3. कोकोस-हर्नांदिया वन, दो वितानी प्रजातियों से छाया रहता है - "कोकोस न्यूसीफेरा" और "हर्नांदिया सोनोरा" .

4. कोकोस-ग्वेटार्डा वन, "कोकोस न्यूसिफ़ेरा" और "ग्वेटार्डा स्पिशियोसा" से छाए रहते हैं। इसकी निचली पंक्ति में "नेइसोस्पर्मा ऑपोज़िटीफ़ोलियम" का मिश्रण और समुद्र तट पर "स्केवोला टाकाडा" और "टूर्नेफ़ोर्टिया अर्जेन्टी" मौजूद रहते हैं।
5. हरनांदिया वन, वितान स्तर पर अधिक "हरनांदिया सोनोरा" द्वारा छाए होते हैं। इस तरह के वन प्रवालद्वीप के अविकसित भाग में, अधिकांशतः पूर्वी क्षेत्र में देखे जा सकते हैं। अक्सर "कैलोफ़िलम इनोफ़ाइलम" और "कोकोस न्यूसीफ़ेरा" मौजूद रहते हैं। इस वन की संग्रहित प्रजातियों में अक्सर "मोरिंडा सिट्रिफ़ोलिया", कोकोस पौधे और "एस्प्लेनियम निडस" (पक्षी का फ़र्न घोंसला) और कभी-कभी, "निसोस्पर्मा ऑपोसिटिफ़ोलियम" और "ग्वेटार्डा स्पिशियोसा" शामिल होते हैं।
6. प्रेम्ना श्रबलैंड, आम तौर पर दलदली क्षेत्र और वन क्षेत्रों के बीच मौजूद होते हैं। सबसे विशिष्ट वनस्पति है "प्रेम्ना ऑब्टुसिफ़ोलिया", जब कि सीमांत पर "कैशुरिना इक्विसेटिफ़ोलिया" और "स्केवोला टाकेडा" हैं। घने भू-आवरण में फ़िम्ब्रिस्टिलिस साइमोसा" , इपोमोई पेस्कप्रे" (बीच मॉर्निंग ग्लोरी) और "ट्रायमफ़ेटा प्रोकम्बेन्स" जैसी प्रजातियां शामिल हैं। प्रेम्ना श्रबलैंड अधिकांशतः प्रवालद्वीप के विकसित क्षेत्रों के आस-पास, विशेषकर कुंओं वाले क्षेत्रों में विकसित होता है।

7. द्वीप के लगभग संपूर्ण समुद्री तट और समुद्रतल के किनारे तटीय झाड़ियों की पंक्तियां. इसमें "टकाडा स्केवोला" अधिक हैं, लेकिन छितरे हुए नारियल के पेड़, "ग्वेटार्डा स्पेसिओसा" और "पाइसोनिया ग्रैंडिस" भी देखे जा सकते हैं। समुद्र की ओर, इसमें "टूरनेफ़ोर्शिया अर्जेंटी" और "सुरियाना मरिटिमा" भी शामिल है। समुद्रीताल की ओर, इसमें लेप्टुरस रिपेन्स" , ट्राइयमफ़ेटा प्रोकम्बेन्स" और "साइप्रस लिगुलैरिस" भी शामिल हो सकते हैं। वहां समुद्रीताल के पूर्वी छोर पर "बैसिन्गटोनिया एशियाटिका" के बड़े संचय भी मौजूद हैं।

8. अनुरक्षित घास और नरकट क्षेत्र जो नियमित रूप से काटे गए हों. द्वीप की हवाई तस्वीरें स्पष्ट रूप से घास के बड़े मैदान और बग़ीचे जैसे सवाना क्षेत्र प्रदर्शित करती हैं जिन पर अमेरिकी सेना ने एंटेना फ़ील्ड और हवाई अड्डे जैसी विशाल आउटडोर सुविधाओं का निर्माण किया है।

9 मिश्रित मूल वन, जिसमें कोई प्रमुख वितान प्रजातियां मौजूद नहीं।

10. दलदल तीन अलग प्रकारों में विभाजित है: कैटेल ("टाइफ़ा डोमिनजेनसिस" ), आर्द्रभूमि और मिश्रित प्रजाति. कैटेल दलदल में लगभग पूरी तरह से कैटेल निहित है। ये क्षेत्र अक्सर मानव निर्मित जलाशयों या निकास-जल होते हैं जोकि लगभग पूरी तरह से प्रतिरूपी होते हैं। आर्द्रभूमि क्षेत्र में मौजूद वनस्पति और कुछ मात्रा में ताजे पानी पर आधारित हैं। मिश्रित प्रजाति के दलदल बहुत ही परिवर्तनीय रहे हैं और आम तौर पर यहां कोई स्थिर पानी नहीं था।

सामरिक महत्व
वनस्पति
ETOPS आपातकालीन लैंडिंग स्थल
अमेरिकी पूर्व-तैनात पोत