दूसरी फ़िल्म की शुरुआत राजकुमार चार्मिंग से होती है जो राजकुमारी फियोना को ड्रैगन से बचाने के लिए निकला हुआ है। जब वह वहां पहुँचता है तो वहां उसे लिटल रेड राईडिंग हूड के रूप में भेडिया मिलता है। पूछने पर वह बताता है की फियोना अपने पति श्रेक के साथ हनीमून पर गई हुई है। जब श्रेक और ड्रैगन लौटते हैं तब उन्हें दलदल में गधा मिलता है जो ड्रैगन के साथ झगड कर बैठा होता है। उन्हें फ़ार फ़ार अवे से फियोना के माता-पिता का निमंत्रण आता है जो उन्हें उनकी शादी के लिए आशीर्वाद देना चाहते हैं। जब वे दोनों वहां पहुँचते हैं तो फियोना के मैके वाले अचंबित हो जाते हैं क्योंकि वे फियोना को इस रूप में नहीं चाहते थे। दुष्ट राजकुमार चार्मिंग और उसकी माँ, परी गोडमदर श्रेक और फियोना की शादी तोड़ने की कोशिश करते हैं ताकि चार्मिंग के साथ फियोना प्यार में गिर सके परन्तु वे इसमें असफल होते हैं। श्रेक और गधे को एक नया साथी पूस इन बूट्स मिलता है और तीनों गोडमदर की फैक्टरी से प्यार की बूटी खोजने के लंबे मिशन पर निकल पड़ते हैं। फ़िल्म के अंत में राजा हैरोल्ड वापस एक मेंढक में बदल जाता है।

"श्रेक द थर्ड" (२००७)
"श्रेक फ़ोरेवर आफ़्टर" (२०१०)
"श्रेक" (२००१)
"श्रेक 2" (२००४)