लेक ओंटारियो पर स्थित रोचेस्टर पोर्ट पर समुद्री नाव यात्रा सेवा प्रदान की जाती है जो सेंट लॉरेंस समुद्री मार्ग के माध्यम से अटलांटिक महासागर से जुड़ा हुआ है।

एक अल्पकालिक, उच्च-गति यात्री/वाहन फेरी स्पिरिट ऑफ ओंटारियो, उपनाम द ब्रीज या द फास्ट फेरी, के माध्यम से रोचेस्टर, लेक ओंटारियो के आरपार ओंटारियो के टोरंटो से जुड़ा था। इसका संचालन 17 जून 2004 से लेकर 12 दिसम्बर 2005 तक हुआ और इसकी वजह से शहर को 42.5 मिलियन डॉलर का खर्च उठाना पड़ा. इसे फोर्डे रीडेरेई सीटूरिस्टिक नामक एक जर्मन कंपनी को 30 मिलियन डॉलर में बेच दिया गया।

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