इस समय के दौरान यूसुफ खान ने पुरी थेवर के साथ लड़ाई की, जो नेरकटट्टसेवल (मूल नाम नेलकेट्टासेसेवल) का एक पॉलीगर था, जो मदुरै के दक्षिण-पश्चिम में एक छोटा सा शहर था। पुली थेवर नवाब और अंग्रेजों के खिलाफ विद्रोह कर रहे थे। यूसुफ खान (मारुधान्यगम) ने त्रावणकोर राजा और पुली थेवर के बीच गठबंधन तोड़ दिया, जो त्रावणकोर के राजा को आरकोट नवाब के साथ गठबंधन समझौते में प्रवेश करने के लिए विश्वास दिलाते थे। यूसुफ खान ने कुछ पुली थेवर के किलों पर कब्जा कर लिया था, जिन्हें पहले मोहम्मद अली के तहत अंग्रेजों और नवाब सेनाओं ने असफल तरीके से प्रयास किया था। 1760 में, नेटकट्टनसेवल या पुली थेवर युद्ध के लिए युद्ध पर, यूसुफ खान को पुली थेवर के हाथों अपमानजनक हार का सामना करना पड़ा। इसे स्थानीय किंवदंतियों और लोक गीतों के माध्यम से ऐतिहासिक रूप से दर्ज किया गया है, जो कहते हैं कि यूसुफ खान और उनकी सेनाओं को सचमुच नेटकट्टनसेवल से दूर चलाया गया था और पुली थेवर और उनकी सेनाओं द्वारा मदुरै के बाहरी इलाके में सभी तरह का पीछा किया गया था। लेकिन बाद में 1761 में, जब ब्रिटिश ईस्ट इंडिया कंपनी के अधिक उन्नत सैन्य हथियार के साथ लगभग दस हजार मजबूत पैदल सेना को पुली थेवर के केवल दो हजार मजबूत पैदल सेना के खिलाफ नियोजित किया गया था, जो केवल कांस्य युग के हथियार जैसे लांस और तलवार से लैस थे, पुली थेवर को पकड़ा गया था लेकिन केवल एक क्रूर लड़ाई के बाद। पुली थेवर की सेना हालांकि आकार में कई बार छोटे और हथियारों के मामले में कम उन्नत नवाब और कंपनी बलों पर गंभीर हताहतों का कारण बन गया। कब्जा करने पर, पुली थेवर को शंकरकोविल को भेजा गया जहां उन्हें फांसी के लिए योजना बनाई गई थी। हालांकि, बाद में पुली थेवर शंकरकोविल से बच निकले और माना जाता है कि उनके बारे में और जानकारी के साथ भागने पर गायब हो गए हैं। (पुली थेवर आज तमिलनाडु सरकार द्वारा स्वतंत्रता सेनानी के रूप में मान्यता प्राप्त है)। इसके अलावा इस दौरान डच ने अलवार्तिरुनगारी शहर पर कब्जा कर लिया, जिस पर यूसुफ खान ने उन्हें तुतीकोरिन में लगी अपने जहाजों पर वापस पीछा करके बदला लिया।

पलायककर के साथ विवादास्पद युद्ध
विवाद की शुरुआत
मदुरै को भेजा गया
उनकी मृत्यु की किंवदंतियों