दो धमाके ने समझौता एक्सप्रेस के दो डिब्बों को १८ फरवरी २००७ की अाधी रात को हिला कर रख दिया था। धमाके के बाद लगी आग में ६८ लोग मारे गए अौर दर्जनों घायल हुए। कथित तौर पर इसे अभिनव भारत, एक हिन्दू कट्टरपंथी संगठन से जोड़ा गया। नवंबर २००८ में सूचना दी गई थी की महाराष्ट्र आतंकवाद-विरोधी दस्तों (ATS) को शक हुआ की यह धमाके प्रसाद श्रीकांत पुरोहित, जो भारतीय सेना का एक अफसर है अौर अभिनव भारत का एक सदस्य भी। पुरोहित ने खुद दावा किया की उन्होंने अभिनव भारत में घुसपैठ की थी। सेना की कोर्ट की जांच के दौरीन, ५९ गवाहों ने उन अफसरों के साथ जिन्होंने गवाही दी, कोर्ट को बताया की वह उग्रवादी संगठनों में घुसपैठ कर खुफिया जानकारी इकट्ठा कर रहा था। ८ जनवरी सन् २०११ में स्वामी असीमानंद, राष्ट्रीय स्वयंसेवक संघ के एक प्रचारक, ने कबूला की वह समझौता एक्सप्रेस धमाके में उनका हाथ था, एक कथन जिसे उन्होनें तनाव में अाके दिया। असीमानंद ने कहा की उन्हें ज़ोर-ज़बरदस्ती करके गलत बयान देने पर मजबूर किया।

कहा गया है कि लश्कर-ऐ-तैयबा धमाके के लिए दोषी है। अम्रिका ने अरिफ कस्मानी, एक पाकिस्तानी और कथित तौर पर लश्कर-ऐ-तैयबा का वित्तदाता, को २००६ की ट्रेन धमाके और २००७ समझौता एक्सप्रेस धमाके के लिए दोषी थैराया, और उन्हें 'युनाईटेड नेशन्स' (United Nations) द्वारा एक अंतराष्ट्रिय आतंकवादी घोषित कराया। २०१३ तक, भारत में किसी को भी इस अपराध के लिए सज़ा नहीं मिली। 

मक्का मस्जिद धमाका
२००७ अजमेर दरगाह धमाका
अंतराष्ट्रिय प्रतिक्रिया
२००७ समझौता एक्सप्रेस धमाका