रोचेस्टर शहर को रोचेस्टर सिटी स्कूल डिस्ट्रिक्ट की सेवा प्राप्त होती है जिसमें सभी सार्वजनिक प्राथमिक और माध्यमिक शिक्षा शामिल है। इस जिले का संचालन लोकप्रिय ढंग से निर्वाचित सात सदस्यों वाले बोर्ड ऑफ एडुकेशन द्वारा किया जाता है। इस शहर में सीमित और निजी प्राथमिक और माध्यमिक विद्यालय भी स्थित हैं। रोचेस्टर सिटी के स्कूल, न्यूयॉर्क राज्य के बाकी स्कूलों की तुलना में लगातार औसत से नीचे का परिणाम दर्शाते रहे हैं।
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