"प्रिज़न ब्रेक" का विषय संगीत एवं प्रत्येक एपिसोड का प्रासंगिक-भाव संगीत रामीन जावडी के द्वारा बनाया गया। प्रथम दो सीज़न की स्वर-लिपि "प्रिज़न ब्रेक:ऑरिजिनल टेलिविज़न, साउंडट्रेक" में दिया गया है जो 28 अगस्त 2007 को रीलिज़ हुआ था। जावडी एवं फेरी कोर्सटेन ने इसके विषय संगीत के रिमिक्स का निर्माण "प्रिज़न ब्रेक थीम (फेरी कोर्सटेन ब्रेअकोउट मिक्स)" शीर्षक से फॉक्स म्यूजिक के द्वारा 2006 में रीलिज़ किया। यूरोप में, रैप गाने वाले फैफ लारागे के गीत "पास ले टेम्प्स" का उपयोग शो के वास्तविक विषय संगीत के स्थान पर फ्रांस में टेलीविजन नेटवर्क M6 द्वारा शीर्षक अनुक्रम में किया गया जिसने इसे स्थानीय स्तर पर प्रसिद्धि दिलाने में मदद किया। इसी प्रकार, "इच ग्लाउब" (प्रिज़न ब्रेक एंथेम) एक डिक (आजाद एवं एडेल टाविल के द्वारा अभिनीत) एवं "ओवर द रेनबो" (लेकी द्वारा अभिनीत) का प्रयोग क्रमश: जर्मनी एवं बेल्जियम में शीर्षक अनुक्रमों में किया जाता है। शो के चौथे सीज़न की समाप्ति पर 2 जून 2009 को एक अलग साउंडट्रैक डिस्क तीसरे एवं चौथे सीज़न के लिए रीलिज़ किया गया।

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