मूल रूप से, "बायोशॉक" की पटकथा इसके रिलीज़ किये गये संस्करण की पटकथा से बहुत अधिक भिन्न थी: इसका मुख्य पात्र एक "सनकी डीप्रोग्रामर"- किसी व्यक्ति को एक संप्रदाय से बचाने और उस व्यक्ति को मानसिक व मनोवैज्ञानिक रूप से सामान्य जीवन जीने के लिये समायोजित करने की धुन से ग्रस्त एक व्यक्ति- था। उदाहरण के लिये, केन लेवाइन इस बात का एक उदाहरण देते हैं कि एक सनकी डीप्रोग्रामर क्या करता है" "[दुनिया में] ऐसे लोग हैं, जिन्होंने [उदाहरणार्थ] एक समलैंगिक संबंध में रह चुकी अपनी बेटी को डीप्रोग्राम करने के लिये लोगों की सेवाएं लीं हैं। वे उसका अपहरण कर लेते हैं और उसे पुनःप्रोग्राम करते हैं और वास्तव में यह एक गूढ़ व्यक्ति था और तुम यही [इसी प्रकार के] पात्र थे। इस कहानी का स्वरूप अधिक राजनैतिक रहा होता, जिसमें एक सांसद द्वारा पात्र की सेवाएं लीं जातीं. "बायोशॉक" पर किये जा रहे विकास की 2004 में आधिकारिक रूप से घोषणा किये जाने तक, इसकी कथा और पृष्ठभूमि में बहुत अधिक बदलाव हो गया था। अब यह खेल द्वितीय विश्व-युद्ध की एक परित्यक्त भूमिगत प्रयोग शाला में खेला जाता है, जिसे इक्कीसवीं सदी के वैज्ञानिकों ने अभी हाल ही में ज़मीन से बाहर निकाला है। प्रयोगशाला के भीतर चल रहे जेनेटिक अनुसंधानों ने स्वयं को जीवों की तीन "जातियों", जिनका उल्लेख "चालकहीन वायुयानों", "सैनिकों" और "परभक्षियों" के रूप में किया गया है, के आस-पास केंद्रित एक पारिस्थितिक-तंत्र में निर्मित कर लिया है। अंततः यह "कृत्रिम पारिस्थितिकी" गत्यात्मक खेल में दिखाई देने वाली "लिटिल सिस्टर्स", "बिग डैडी" और "स्प्लाइसर" के लिये आधार का निर्माण करेगी।

हालांकि, इस कहानी का गेमप्ले खेल के रिलीज़ किये गये संस्करण के समान था, लेकिन इसकी कथा में परिवर्तन हुए, जो कि लेवाइन के अनुसार खेल के डिज़ाइन को पहले रखने के खेल के तत्कालीन-अतार्किक निर्देशक सिद्धांत के साथ सुसंगत थे। लेवाइन ने इस बात का भी उल्लेख किया कि "खेल के लिये दो अंत बनाना कभी भी मेरा इरादा नहीं था। एक तरह से यह विचार बहुत बाद में आया और यह कुछ ऐसा था, जिसका निवेदन खाद्य-श्रृंखला में मुझसे ऊपर स्थित किसी व्यक्ति ने किया था।

एक साक्षात्कार के दौरान खेल की कथा और पृष्ठभूमि के बारे में गेमिंग वेबसाइट आईजीएन द्वारा पूछे गये एक प्रश्न के उत्तर में लेवाइन ने कहा, "मेरे पास मुक्त-कला की मेरी अनुपयोगी उपाधि है, अतः मैंने ऐन रैण्ड और जॉर्ज ऑर्वेल की सामग्री और बीसवीं सदी का सभी तरह का आदर्शवादी व मनहूस लेखन पढ़ा, जो सचमुच मुझे दिलचस्प लगा।" लेवाइन ने "स्टेम सेल अनुसंधान और <nowiki>[इससे]</nowiki> संबंधित नैतिक मुद्दों में" अपनी रुचि का भी उल्लेख किया है। कलात्मक प्रभाव के सन्दर्भ में, लेवाइन ने "नाइनटीन एटी-फोर" और "लोगान्स रन" पुस्तकों का उल्लेख किया है, जो कि ऐसे समाजों का प्रतिनिधित्व करती हैं, जिनके पास "वास्तव में कुछ दिलचस्प विचार हैं, जो इस तथ्य के द्वारा विकृत हो गये हैं कि हम लोग हैं।"

विकासकर्ताओं के अनुसार, "बायोशॉक", "सिस्टम शॉक" खेलों का एक आध्यात्मिक अनुवर्ती है और इसका उत्पादन उसी श्रृंखला के पूर्व विकासकर्ताओं द्वारा किया गया था। लेवाइन का दावा है कि जब उन्होंने "सिस्टम शॉक 2" का निर्माण किया था, उसी समय से उनकी टीम उसी तरह का एक अन्य खेल बनाने के बारे में विचार करती रही थी। पहली बार ई3 2006 में प्रदर्शित एक वीडियो के अपने वर्णन में, लेवाइन ने इन खेलों के बीच अनेक समानताओं की ओर सूचित किया है। इनमें अनेक तुलना-योग्य गेमप्ले तत्व हैं: "बायोशॉक" में "ईव हाइपोस" द्वारा दिये जाने वाले प्लास्मिड वही कार्य करते हैं, जो "सिस्टम शॉक 2" में "पीएसआई हाइपोस" द्वारा दी जाने वाली "सायोनि्क क्षमताओं" द्वारा किया जाता है; दोनों ही खेलों में खिलाड़ी को सुरक्षा कैमरों, मशीन गन बुर्जों का मुकाबला करना पड़ता है और उसके पास उनमें सेंध लगाने की क्षमता होती है; युद्ध-सामग्री के संरक्षण का उल्लेख "गेमप्ले की एक मुख्य विशेषता" के रूप में किया गया है; और कथा सुनाती हुई ऑडियो टेप रिकार्डिंग उसी भूमिका की पूर्ति करती है, जो "सिस्टम शॉक" खेलों में ई-मेल अभिलेखों द्वारा निभाई गई थी। एकाधिक शस्र प्रकारों वाले संशोधनीय हथियारों और अधिक क्षति पहुंचाने के लिये शत्रु को ढूंढने की समानता की ही तरह “"सिस्टम शॉक 2" में प्रयुक्त “घोस्ट” (ऐसे छायाचित्र, जो दुःखद घटनाओं को उनके घटना-स्थलों पर पुनर्चित्रित करते हैं) "बायोशॉक" में भी उपस्थित हैं। इसके अतिरिक्त, ऐटलस रेडियो के द्वारा लगभग उसी तरह खिलाड़ी का मार्गदर्शन करता है, जिस प्रकार "सिस्टम शॉक 2" में जेनिस पोलिटो द्वारा किया जाता है और इनमें से प्रत्येक पात्र का खेल के बीच इसे एक समान मोड़ देता है। दोनों ही खेल खिलाड़ी को कार्यों की पूर्ति की एक से अधिक विधियां प्रदान करते हैं, जिससे आकस्मिक गेमप्ले का मौका मिलता है।

कथा
मूल कथा
सारांश
पृष्ठभूमि