डलास मॉर्निंग न्यूज़ ने एक सैनिक के सबवे दुकान की सबवे द्वारा जब्ती का मामला रिपोर्ट किया, जब वह 2006 में अफ़गानिस्तान में तैनात था। दुकान सेना के एक रिज़र्व-सैनिक लियॉन बेटी, जूनियर के स्वामित्व में था, जिसे अपने पहले सबवे की खरीदी के तीन साल बाद, मार्च 2005 में स्वतंत्रता तक संग्राम के लिए आह्वान भेजा गया। बेटी ने आरोप लगाया कि सबवे ने अमेरिकी सैनिक नागरिक राहत अधिनियम का उल्लंघन किया है। बेटी द्वारा सबवे के प्रति दायर एक संघीय मुकदमा खारिज कर दिया गया। इसके बाद बेटी ने डलास काउंटी, टेक्सास के राज्य अदालत में मुकदमा दायर किया। मुकदमेबाजी का निपटारा किया गया और दिसम्बर, 2009 को पूर्वाग्रह सहित खारिज कर दिया गया।

एरिक स्क्लॉज़र द्वारा लिखित 2001 की पुस्तक "फ़ास्ट फ़ूड नेशन" में सबवे की फ़्रैंचाइज़िंग नीतियों की आलोचना की गई।
उसमें दावा किया गया कि 1990 के दशक में, सबवे अपने फ़्रैंचाइज़ियों के साथ कई कानूनी विवादों में फंसा था, जो आम तौर पर अतिक्रमण से संबंधित थे (अत्यधिक आक्रामक विस्तार, जिसमें दो रेस्तरां इतने नज़दीक अवस्थित हैं कि उन्हें एक दूसरे के साथ प्रतिस्पर्धा करना पड़ता है).

पुस्तक ने क्षेत्रीय रूप से कंपनी के विकास का कार्य संभालने वाले "विकास एजेंटों" को दोषी ठहराया. वे अपने फ़्रैंचाइज़ी शुल्क का कुछ प्रतिशत अपने स्थानीय क्षेत्र के लिए बनाए रखते हैं और इसलिए उनके हित में है कि क्षेत्रीय सबवे अवस्थितियों पर उसके प्रभाव के बावजूद क्षेत्र में सबवे रेस्तरां से बाज़ार को भर दें. हालांकि इससे प्रत्येक सबवे स्थान के प्रति कम मुनाफ़ा हो सकता है, लेकिन समग्र क्षेत्र के लिए यह उच्चतर लाभ हासिल कर सकता है और इसलिए संपूर्ण श्रृंखला और विकास एजेंट को अधिक लाभ मिलता है।

सबवे के तेजी से विकास के लिए अधिकांशतः उसके असामान्य व्यापार मॉडल को जिम्मेदार ठहराया जा सकता है। अधिकांश फ़्रैंचाइज़ियों के विपरीत, मूल कंपनी कोई रेस्तरां संचालित नहीं करती है। स्थानीय फ़्रैन्चाइज़ी दुकान चलाता है और ज्यादातर बाज़ारों में सबवे फ़्रैन्चाइज़ी के साथ उस क्षेत्र के लिए उसे अपना विकास एजेंट बनने के लिए अनुबंध करता है। उसके बाद विकास एजेंट नए स्थानों को विकसित करने, कम से कम मासिक आधार पर दुकानों के मूल्यांकन और फ़्रैन्चाइज़ियों की जो भी ज़रूरत हो उसमें मदद देने के लिए जिम्मेदार होता है। DAI प्रत्येक दुकान से सभी निवल बिक्री पर 8% रॉयल्टी लेता है।

निवल बिक्री का एक अंश फ़्रैन्चाइज़ी विज्ञापन निधि के लिए भी एकत्रित किया जाता है, जिसे आम तौर पर FAF संक्षिप्त नाम से निर्दिष्ट किया जाता है। संप्रति सर्वाधिक सामान्य दर है निवल बिक्री का 4.5%, लेकिन कुछ बाज़ारों में दर 3 से 5% तक हो सकता है। संयुक्त राज्य अमेरिका, कनाडा और ऑस्ट्रेलिया में, सबवे फ़्रैन्चाइज़ी विज्ञापन निधि न्यास, जो SFAFT नाम से भी जाना जाता है, विज्ञापन के लिए इस निधि के उपयोग को नियंत्रित करता है, जबकि अन्य बाज़ारों में इसका नियंत्रण अंतर्राष्ट्रीय फ़्रैन्चाइज़ी विज्ञापन निधि द्वारा किया जाता है, जो iFAF के रूप में भी जाना जाता है। SFAFT एक स्वतंत्र निजी न्यास है, जिसे सबवे के फ़्रैन्चाइज़ियों द्वारा मतदान से चयनित निदेशक मंडल द्वारा संचालित किया जाता है, जबकि iFAF का संचालन DAI द्वारा किया जाता है। स्थानीय बाज़ार फ़्रैन्चाइज़ियों के एक स्थानीय मंडल का भी चुनाव करते हैं जो अपने बाज़ार के लिए विशिष्ट विज्ञापन पर निर्णय लेते हैं। अन्य प्रमुख फ़्रैन्चाइज़ियों के विपरीत, सबवे की मूल कंपनी श्रृंखला के विज्ञापन की दिशा में कोई योगदान नहीं देती है।

DAI और SFAFT, एक दूसरे के साथ SFAFT द्वारा अत्यधिक प्रशासनिक और कर्मचारी लागत और एकतरफ़ा निर्णय लेने के दावों पर क़ानूनी लड़ाइयों में उलझी है, जो अंततः DAI द्वारा, मौजूदा फ़्रैन्चाइज़ियों के लिए लाभकारी नहीं होगा. इस विवाद के उपफल के रूप में, संयुक्त राज्य अमेरिका, कनाडा और ऑस्ट्रेलिया के बाहर के बाज़ारों के लिए एक नए संगठन, अंतर्राष्ट्रीय फ़्रैन्चाइज़ी विज्ञापन निधि का गठन किया गया। यथा 1 जनवरी 2009 से SFAFT अब उन बाज़ारों के विज्ञापन में शामिल नहीं है।

फ़्रैन्चाइज़ संबंध
वैश्विक अवस्थिति
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