जिन मिसौरीवासियों की पहचान धर्म के आधार पर होती है उनमें से पांच में से तीन प्रोटेस्टेंट थे। राज्य के कुछ भागों में मध्यम-आकार वाली एक रोमन कैथोलिक समुदाय भी है; लगभग पांच मिसौरीवासियों में से एक रोमन कैथोलिक हैं। बड़े कैथोलिक समुदायों वाले क्षेत्रों में सेंट लुई, जेफ़रसन शहर, वेस्टप्लेक्स और मिसौरी राइनलैंड (विशेष रूप से मिसौरी नदी का दक्षिणी भाग) शामिल हैं। सेंट लुई और कन्सास शहर के महानगरीय क्षेत्रों में भी महत्वपूर्ण यहूदी समुदायों की उपस्थिति है जिन्होंने शहरों की संस्कृति और दान-कर्मों में काफी योगदान दिया है; अभी बिलकुल हाल ही में, उन्हीं क्षेत्रों में रहने वाले भारतीय और पाकिस्तानी आप्रवासियों ने हिन्दू और मुस्लिम सभाओं का भी निर्माण किया है।

अमेरिकी धार्मिक पहचान सर्वेक्षण के अनुसार मिसौरी के लोगों की धार्मिक सम्बद्धता:

2000 में अनुयायियों की संख्या के आधार पर सबसे बड़ी संख्या में रोमन कैथोलिक चर्च जिनकी संख्या 856,964 थी; दक्षिणी बैप्टिस्ट कॉन्वेंशन जिनकी संख्या 797,732 थी; और युनाइटेड मेथोडिस्ट चर्च थे जिनकी संख्या 226,578 थी।

कई धार्मिक संगठनों के मुख्यालय मिसौरी में है, जिसमें लुथरन चर्च-मिसौरी धर्मसभा भी शामिल है जिसके अपने मुख्यालय किर्कवुड में है और साथ ही साथ युनाइटेड पेंटेकोस्टल चर्च इंटरनैशनल का हैज़लवुड में है जो दोनों सेंट लुई के बाहर है। कन्सास शहर नाज़रीन के चर्च का मुख्यालय है। कन्सास शहर के पास स्थित इंडिपेंडेंस, मसीह का समुदाय (पहले रिऑर्गनाइज़्ड चर्च ऑफ़ जीसस क्राइस्ट ऑफ़ लैटर डे सेंट्स) और रेमनेंट चर्च ऑफ़ जीसस क्राइस्ट ऑफ़ लैटर डे सेंट्स का मुख्यालय है। मिसौरी के इस क्षेत्र और अन्य भागों का द चर्च ऑफ़ जीसस क्राइस्ट ऑफ़ लैटर डे सेंट्स (मोर्मोन) के लिए भी महत्वपूर्ण धार्मिक और ऐतिहासिक महत्व है जो कई स्थलों/आगंतुक केन्द्रों का रखरखाव करते हैं और जिसके सदस्यों की संख्या, मिसौरी की जनसंख्या का लगभग 1 प्रतिशत या 62,217 है। स्प्रिंगफील्ड, असेम्बलीज़ ऑफ़ गॉड और बैप्टिस्ट बाइबल फ़ेलोशिप इंटरनैशनल का मुख्यालय है। जनरल एसोसिएशन ऑफ़ जनरल बैप्टिस्ट्स के मुख्यालय पोपलर ब्लफ़ में हैं। पेंटेकोस्टल चर्च ऑफ़ गॉड का मुख्यालय जोप्लिन में है। यूनिटी चर्च का मुख्यालय यूनिटी गांव में है।

यातायात
धर्म
एक राजनीतिक कसौटी के रूप में इसका स्तर
महत्वपूर्ण शहर और कस्बें