बाल्मर 11 जून 1980 को माइक्रोसॉफ्ट से जुड़ गए और गेट्स द्वारा नियुक्त किए गए प्रथम व्यापार प्रबंधक के रूप मेंमाइक्रोसॉफ्ट के 24 वें कर्मचारी बन गए। बाल्मर को माइक्रोसॉफ्ट में काम करना बहुत अच्छा लगता था। शुरुआत में उन्हें 50,000 डॉलर वेतन के के साथ कंपनी के कुछ प्रतिशत स्वामित्व की पेशकश की गई थी। 1981 में जब माइक्रोसॉफ्ट को निगमित किया गया, तब बाल्मर कंपनी के पास 8 प्रतिशत का स्वामित्व था। उन्होंने "ऑपरेटिंग सिस्टम विकास", "परिचालन" और "बिक्री और समर्थन" के साथ माइक्रोसॉफ्ट की कई डिवीजनों नेतृत्व किया है। जनवरी 2000 में, उन्हें आधिकारिक तौर पर प्रमुख कार्यकारी अधिकारी बनाया गया. सीईओ के रूप में बाल्मर ने कंपनी का वित्त प्रबंधन संभाला, हालांकि गेट्स ने तभी भी "तकनीकी विजन" पर अपना नियंत्रण बनाए रखा। 2003 में बाल्मर ने अपने पास कंपनी का 4% स्टेक रखते हुए 8.3% शेयर्स बेच दिए। उसी वर्ष, बाल्मर ने माइक्रोसॉफ्ट के कर्मचारी स्टॉक विकल्प प्रोग्राम को बदल दिया।

2009 में, बिल गेट्स के अध्यक्ष के रूप में माइक्रोसॉफ्ट छोड़ने के बाद उन्हेंने इतिहास में पहली बार सीईएस (CES) में मुख्य वक्ता के रूप में भाषण दिया।

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