२००८ में क्लब ने अपनी पहली राष्ट्रीय प्रतियोगिता में खेले जब उन्होंने २००८ आई-लीग द्वितीय डिवीजन में भाग लिया। क्लब को ग्रुप बी में मोहम्मडन, इंडियन बैंक, एमिटी यूनाइटेड, ऑयल इंडिया और नई दिल्ली हीरोज के साथ रखा गया था। क्लब ने अपने समूह में अपने पहले चार मैचों में जीता, केवल मोहम्मडन के खिलाफ ग्रुप स्टेज के फाइनल मैच को हराया, जो इससे कोई फर्क नहीं पड़ा क्योंकि क्लब पहले दौर के लिए पहले से ही योग्य था। क्लब ने अंतिम दौर के अपने पहले मैच जीते जो मोहम्मडन के खिलाफ बदला मैच था। क्लब ने तब स्थानीय प्रतिद्वंद्वियों को पुणे में अपने इतिहास में पहली बार खेले और इस प्रकार महा डर्बी (हालांकि मैच तटस्थ क्षेत्र पर था) के साथ मुम्बई ने मैच जीता। क्लब ने वास्को के खिलाफ किया, जिसके बाद इंडियन बैंक पर दो-गोल की जीत थी। और आधिकारिक तौर पर आई-लीग को पदोन्नति हासिल की, जब पराजित चिराग युनाइटेड के साथ-साथ एक मैन डाउन भी था।.

२००८ – २००९: आई-लीग
खालिद जमील एरा (२००९–२०१६)
आई-लीग द्वितीय डिवीजन
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