सूअरों से मनुष्य में सूअर फ्लू वायरस का सीधा संक्रमण कभी-कभी ही संभव हो सकता है (इसे जूनोटिक सूअर फ्लू कहा जाता है). चिकित्सा साहित्य के रिपोर्ट अनुसार वर्ष 1958 में दर्ज पहले केस से आज तक 50 केस प्राप्त हो चुके हैं जिन में से छह मौत हो गयी हैं। छह लोगों में से एक गर्भवती थी, एक को खून का कैंसर था, एक होद्ग्किन का रोगी था और दो स्वस्थ बताये जाते हैं। यद्यपि ये संक्रमण की कम संख्या है, संक्रमण के सही दर का पता नहीं है, क्योंकि ज्यादातर मामलों में केवल बहुत ही हल्का रोग हो सकता है, जो न तो रिपोर्ट किये जायेगें या इनका कभी निदान ही हो पायेगा.
केंद्र रोग नियंत्रण और रोकथाम (सीडीसी), के अनुसार मानव में सूअर फ्लू 2009 के "H1N1 वायरस" इन्फ्लूएंजा और इन्फ्लूएंजा के समान बीमारी की तरह ही लगता है। इन लक्षणों में बुखार, खाँसी, गले में दर्द, शरीर में दर्द, सिरदर्द, ठंड और थकान शामिल हैं। वर्ष 2009 के प्रकोप में ज्यादातर रोगियों को दस्त और उल्टी होते दिखाई दिए हैं। वर्ष 2009 का H1N1 वायरस जूनोटिक सूअर फ्लू नहीं है, क्योंकि यह सूअर से मनुष्य में प्रेषित नहीं होता है, व्यक्ति से व्यक्ति को होता है। 

क्योंकि ये लक्षण सूअर फ्लू के लिए विशिष्ट नहीं हैं। "संभावित " सूअर फ्लू का एक विभेदक निदान हैं कि सूअर फ्लू में व्यक्ति में वे लक्षण दिखने चाहिए जो उस व्यक्ति के हाल के इतिहास की वजह से है। उदाहरण के लिए, 2009 में संयुक्त राज्य में सूअर फ्लू फैलने के दौरान सीडीसी ने चिकित्सकों से कहा कि वे "सूअर फ्लू से पीड़ित लोगों को जिनमें ज्वर के साथ-साथ गंभीर सांस की बीमारी की पुष्टि हुई है, वे जो स्वाइन फ्लू के व्यक्तियों से संपर्क प्राप्त कर चुके हैं, जो संयुक्त राष्ट्र के उन पांच राज्यों में थे जहाँ से स्वाइन फ्लू से लोग ग्रस्त हुए हैं, जो बीमार होने से 7 दिन पहले मेक्सिको में निवास कर रहे थे, पर विचार करने को कहा है". स्वाइन फ्लू की "पुष्टि " के लिए प्रयोगशाला परीक्षण की आवश्यकता है (नाक और गले की साधारण परीक्षा)

सूअर में
इन्फ्ल्यूएंजा A
उपचार
इंसानों में