जलवायु परिवर्तन ने इन कब्रों के संरक्षण को खतरे में डालने वाले पर्माफ्रॉस्ट के पिघलने का कारण बना है। पिछले 100 वर्षों में पूरे एशिया में तापमान में 1°C की वृद्धि हुई है और अल्ताई के तराई पर तापमान में 2°C की वृद्धि हुई है, जहाँ सर्दियों और वसंत में अधिक वृद्धि देखी जाती है। 

इस क्षेत्र में ग्लेशियल के पिघलने से आई बाढ़ एक समस्या बन गई है। विशेष रूप से, क्षेत्र में सोफिसकी ग्लेशियर 18 मीटर प्रति वर्ष की दर से पीछे पिघल रहा है। 

तापमान में वृद्धि से इस पर्वतीय क्षेत्र में पाये जाने वाले विभिन्न लुप्तप्राय प्रजातियों पर भी खतरा मंडरा रहा हैं। इन प्रजातियों में स्नो लेपर्ड, अर्गली पर्वत भेड़, स्टेपी ईगल और ब्लैक स्टॉर्क शामिल हैं। 

संरक्षण के प्रयास
जलवायु खतरे
सांस्कृतिक मूल्य
ब्रिटिश संग्रहालय प्रदर्शनी विवाद