31 मार्च 2007 को वित्तीय वर्ष के अंत में सिंगापुर एयरलाइंस समूह में कुल 29,457 कर्मचारी कार्यरत थे। प्रमुख एयरलाइन ने खुद 13,942 (47.3%) कर्मचारियों को रोजगार दिया, जिसमें से 2,174 पायलट और 6,914 केबिन क्रू (चालक दल) के सदस्य थे। समूह के कर्मचारियों का प्रतिनिधित्व पांच श्रमिक संघों के द्वारा किया जाता है, नामतः सिंगापुर एयरलाइंस स्टाफ यूनियन (SIASU), एसआईए इंजीनियरिंग कम्पनी इंजीनियर्स एंड एक्ज़ीक्यूटिव यूनियन (SEEU), सिंगापुर एयरपोर्ट टर्मिनल सर्विसेज़ वर्कर'स यूनियन (SATSWU), एयर ट्रांसपोर्ट एक्ज़ीक्यूटिव स्टाफ यूनियन (AESU) और एयर लाइन पायलट'स एसोसिएशन सिंगापुर (ALPA-S)। 
श्रमिक संघों और समूह प्रबंधन के बीच सम्बन्ध कई बार बिगड़े, विशेष रूप से वेतन में कटौती के बाद, कर्मचारियों की छंटनी के बाद ऐसी स्थिति पैदा हुई और मुश्किल आर्थिक स्थितियों जैसे 2003 में सार्स के प्रादुर्भाव (SARS outbreak) के दौरान और बाद में समय पूर्व होने वाली सेवानिवृति ने स्टाफ के मनोबल को प्रभावित किया। अकेले एएलपीए, मई 1981 में इसके पंजीकरण (इसका निर्माण इसके पूर्ववर्ती के बाद हुआ, जब 1980 में सिंगापुर एयरलाइंस पायलट एसोसिएशन के 15 EXCO सदस्यों पर गैर क़ानूनी औद्योगिक कार्रवाई का आरोप लगाया गया, जिससे प्रबंधन के साथ विवाद उत्पन्न हुआ और 26 फ़रवरी 1981 को एसआईएपीए का पंजीकरण रद्द कर दिया गया) के बाद से 30 नवम्बर 2003 तक समूह प्रबंधन के साथ कम से कम 24 विवादों में शामिल रहा है, जब जनशक्ति मंत्रालय (सिंगापुर) ने एएलपीए-एस के संविधान में एक आइटम को रद्द करने के लिए ट्रेड यूनियन अधिनियम में संशोधन किया, जिसके लिए कार्यकारी समिती से जुड़े बातचीत के समझौते हेतू सामान्य सदस्यता से औपचारिक अनुसमर्थन की आवश्यकता थी। 2007 में, एयरलाइन फिर से सुर्खियों में रहा जब एएलपीए-एस ने एयरबस-380 को उड़ाने वाले पायलटों के लिए प्रबंधन की प्रस्तावित वेतन दरों से असहमति जतायी, और इस मामले को औद्योगिक निर्णायक कोर्ट के द्वारा हल किया जाना था। 
एसआईए के पायलटों की वेतन दरों को सुनवाई के पहले दिन सार्वजनिक कर दिया गया और प्रेस ने नोट किया कि एयरलाइन के 935 कप्तान (S$233,270) जो बोईंग 777 उड़ाते हैं, उन्हें कम्पनी के 36 उपाध्यक्षों की तुलना में अधिक वेतन (S$270,000 से अधिक) दिया जा रहा था।
इन विवादों ने यूनियनों को भी प्रभावित किया है, कई बार तो ये विवाद इतने गंभीर रहे कि इनमें सरकारी हस्तक्षेप अनिवार्य बन गया। एएलपीए-एस में आंतरिक झगड़ों के परिणामस्वरूप 17 नवम्बर 2003 को 22 सदस्यों की पूरी कार्यकारी समिति को बेदखल कर दिया गया, इन झगड़ों को "आंतरिक राजनीति" के लिए जिम्मेदार ठहराया गया और ऐसे सिद्धांत भी दिए गए कि इसने पूर्व पायलटों को भी इस प्रक्रिया में शामिल किया है, जो एसआईएपीए के पंजीकरण के रद्द किये जाने में शामिल रहे। 
जनवरी 2008 में, एनटीयूसी के से महासचिव-लिम स्वी साय, एसआईएएसयू में एक आंतरिक विवाद में शामिल दलों के द्वारा की गयी क़ानूनी कार्रवाई के खिलाफ बोले. 
2 अप्रैल 2007 को एयरलाइन समूह और इसके संघों ने संबंधों में सुधार लाने के लिए संयुक्त रूप से "सिंगापुर एयरलाइन समूह यूनियन-प्रबंधन भागीदारी" और श्रम आन्दोलन 2011 (LM2011) की शुरुआत की, इन्होने क्रमशः "श्रमिकों" और "व्यापार" के लिए वचनबद्धता दी। 
अप्रैल 2008 में, एयरलाइन के अध्यक्ष स्टीफन ली ने पिहले दो वर्षों में प्रबंधन और यूनियन के बीच संबंधों का वर्णन करते हुए इसे "स्थिर और सौहार्दपूर्ण" बताया, उन्होंने उनके बीच बेहतर संचार की बात की। 
उन्होंने कहा कि मंत्री और अनुभवी सलाहकार ली कुआन यू सहित कई सरकारी व्यक्तियों ने मतभेदों को कम करने के लिए हस्तक्षेप किया है और कहा कि दोनों पक्षों के बीच अधिक नियमित विनिमय और बैठकों का आयोजन किया गया है।

क्रिसफ्लायर (KrisFlyer)
सेवाएं
संरचना
कर्मचारी दल