प्रतिजैविक-प्रतिरोधक सूक्ष्मजीव, जिन्हें कभी-कभी "सुपरबग" के रूप में संदर्भित किया जाता है, वर्तमान में अच्छी तरह से नियंत्रित की गई बीमारियों के पुनरागमन में योगदान कर सकते हैं। उदाहरण के लिए, परंपरागत प्रभावी उपचार के प्रतिरोधक तपेदिक के मामले, स्वास्थ्य पेशेवरों के लिए बहुत बड़ी चिंता के कारण बने रहते हैं। अनुमान है कि दुनिया भर में हर साल बहुऔषध-प्रतिरोधक तपेदिक (एमडीआर-टीबी) के लगभग आधे मिलियन नए मामले सामने आते हैं। भारत के बाद चीन के बहुऔषध-प्रतिरोधक टीबी दर सबसे अधिक है। विश्व स्वास्थ्य संगठन (डब्ल्यूएचओ) की रिपोर्ट है कि दुनिया भर में लगभग 50 लाख लोग एमडीआर टीबी से संक्रमित है जिसमें से 79 प्रतिशत मामले तीन या तीन से अधिक प्रतिजैविकों के प्रतिरोधक हैं। 2005 में, संयुक्त राज्य अमेरिका में एमडीआर टीबी के 124 मामलों की सूचना मिली थी। 2006 में अफ्रीका में अत्यंत औषध-प्रतिरोधक तपेदिक (एक्सडीआर टीबी) की पहचान की गई थी और बाद में 49 देशों में इसके अस्तित्व का पता चला था जिसमें अमेरिका भी शामिल था। डब्ल्यूएचओ का अनुमान है कि हर साल एक्सडीआर-टीबी के मामलों लगभग 40,000 नए मामले सामने आते हैं।

प्लेग जीवाणु "येर्सिनिया पेस्टिस" औषध-प्रतिरोध को विकसित कर सकता है और एक प्रमुख स्वास्थ्य जोखिम बन सकता है। प्लेग महामारियों का प्रकोप सम्पूर्ण मानव इतिहास में हुआ है जिसकी वजह से दुनिया भर में 200 मिलियन से अधिक लोगों की मौत हुई है। प्लेग के खिलाफ इस्तेमाल किए गए कई प्रतिजैविक दवाओं की प्रतिरोधक क्षमता अब तक केवल मेडागास्कर में रोग के केवल एक मामले में पाया गया है। 

पिछले 20 वर्षों में, "स्टाफाइलोकॉकस ऑरियस", "सेरेशिया मार्सेसेंस" और एंटरोकॉकस सहित आम जीवाणुओं में वैनकॉमायसिन जैसी विभिन्न प्रतिजैविक दवाओं के साथ-साथ अमीनोग्लाइकोसाइड और सिफालोस्पोरिन जैसे प्रतिजैविक दवाओं के सम्पूर्ण वर्गों के प्रतिरोध का विकास हुआ है। प्रतिजैविक प्रतिरोधक जीव, स्वास्थ्य-सेवा सम्बन्धी (अस्पताल सम्बन्धी) संक्रमणों (एचएआई/HAI) का एक महत्वपूर्ण कारण बन गए हैं। इसके अलावा, हाल के वर्षों में अन्य प्रकार से स्वस्थ व्यक्तियों में मेथिसिलिन-प्रतिरोधक "स्टाफाइलोकॉकस ऑरियस" (एमआरएसए/MRSA) की समुदाय-उपार्जित नस्लों की वजह से होने वाले संक्रमण कुछ ज्यादा ही हो रहे हैं। 

अनुचित प्रतिजैविक उपचार और प्रतिजैविक दवाओं का अतिउपयोग, प्रतिरोधक जीवाणुओं के उद्भव का एक तत्व है। एक योग्य चिकित्सक के दिशा निर्देशों के बिना व्यक्तियों द्वारा खुद से ली जाने वाली प्रतिजैविक दवाओं के उपयोग और कृषि में वृद्धि प्रवार्धकों के रूप में प्रतिजैविक दवाओं के गैर-चिकित्सीय उपयोग की वजह से यह समस्या और बढ़ गई है।

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