पचिनो को बिग बॉय कैपराईस पात्र के जीवंत अभिनय के लिए एक ऑस्कर नामांकन प्राप्त हुआ, जो बॉक्स ऑफिस पर हिट हुई "डिक ट्रेसी" (1990) के लिए था, उसके बाद उनके सबसे प्रसिद्ध पात्र माइकल कोरलीओनी की वापसी "द गॉडफादर पार्ट III" (1990) में हुई.

1991 में पचिनो को मिशेल फाईफार के साथ "फ्रैंकी एंड जॉनी" में अभिनय का मौका मिला जो उनके साथ "स्कारफेस" में सह अभिनेता थे। आखिरकार उन्होंने मार्टिन ब्रेस्ट की फिल्म "सेंट ऑफ़ अ वूमन" (1992) के लिए सर्वश्रेष्ठ अभिनेता का एकेडमी अवार्ड जीत लिया, जिसमें उन्होंने लेफ्टिनेंट कर्नल फ्रैंक स्लेड का अभिनय किया है। उसी वर्ष उन्हें "ग्लेनगैरी ग्लेन रॉस" के लिए सर्वश्रेष्ठ सहायक अभिनेता के तौर पर भी नामांकित किया गया, जिससे पचिनो पहले ऐसे पुरुष अभिनेता बन गये जिसे एक ही वर्ष में दो अलग-अलग फिल्मों के लिए नामांकित किया गया। इसी प्रकार की कामयाबी उन्हें जैमी फाक्सएक्स 2004 में मुख्य भूमिका निभाने के लिए मिली.
1990 के दशक के दौरान पचिनो ने "कार्लितोज वे" (1993), "डौनी ब्रास्को" (1997) और ऑस्कर के लिए कई नामांकन वाली फिल्म "द इनसाइडर" (1999) जैसी अपराध ड्रामा से जुड़ी फिल्मों में अभिनय किया। 1995 में पचिनो को माइकल मान की फिल्म "हीट" में मौका मिला जिसमें वे फिल्म आइकन रॉबर्ट डि नीरो के साथ पहली बार एक साथ परदे पर प्रकट हुए (हालांकि पचिनो और डि नीरो, दोनों ने "गॉडफादर पार्ट II" में काम किया था लेकिन वे किसी भी दृश्य में एक साथ नहीं थे). 1996 में पचिनो ने नाटकीयता से भरपूर फिल्म "लुकिंग फॉर रिचर्ड" में काम किया और 1997 में अलौकिक रोमांचक फिल्म "द डेविल्स एडवोकेट" में उनकी शैतान की भूमिका की प्रशंसा हुई. पचिनो ने 1999 में ओलिवर स्टोन की समीक्षकों द्वारा बहुप्रशंसित फिल्म "ऐनी गीवेन संडे" में भी अभिनय किया। 
पचिनो "सेंट ऑफ़ ए वूमन" के बाद फिर एकेडमी के लिए नामांकित नहीं किये गये लेकिन पिछले दशक में उन्होंने दो गोल्डन ग्लोब जीता, पहला सेसिल बी. डी मिले अवार्ड 2001 में मोशन पिक्चर्स का लाइफटाइम एचीवमेंट और दूसरा किसी अभिनेता के सर्वश्रेष्ठ अभिनय का उनकी मैक कर्थीएट रॉय कोहन की भूमिका के लिए, जो उन्होंने HBO मिनी सीरिज की 2004 की बहुप्रशंसित फिल्म "एंजेल्स इन अमरीका" निभायी थी। पचिनो ने श्रेष्ठ मुख्य अभिनेता का एमी अवार्ड और अपनी भूमिका के लिए श्रेष्ठ अभिनेता का गोल्डन ग्लोब अवार्ड भी जीता.
पचिनो की इस दौर की मंचीय प्रस्तुति में यूजीन ओ'नील की "हीउई" और ऑस्कर वाइल्ड के "सलोम" की पुनर्प्रस्तुति शामिल है। 

2000 का दशक
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