ट्रेचर कोलिन्स सिंड्रोम के लक्षण अलग अलग लोगों में अलग-अलग होते हैं। कुछ व्यक्ति इतने हल्के से प्रभावित होते हैं कि वे उनमे लक्षण दिखाई ही नही देते, जबकि अन्यों में सामान्य स्तर से  लेकर  गंभीर लक्षण जैसे चेहरे में विकार और वायुमार्ग में बाधा होना, जो की जान लेवा भी साबित हो सकता है । टीसीएस के अधिकांश लक्ष्ण एक जैसे ही है और उन्हें जन्म के वक़्त पहचाना जा सकता है ।

ट्रेचर कोलिन्स सिंड्रोम का सबसे आम लक्षण निचले जबड़े और गाल की हड्डी का सही तरीके से विकसित न होना है और जीभ का भी ठीक से काम न कर पाती । छोटे जबडे होने के परिणामस्वरूप दांत सही तरीके से नही बनते । गंभीर मामलों में, सांस लेने या खाने को निगलने में अधिक  परेशानी होती है। गाल की हड्डी का कम विकास होने की वजह से गाल अन्दर की तरफ धँस जाता है।

टीसीएस से संक्रमित लोगों का बाहरी कान कभी-कभी छोटा, घूर्णन, विकृत या अनुपस्थित होता है।बाहरी कान की नालियों का सममित(Symmetric), द्विपक्षीय संकीर्ण या उनकी अनुपस्थिति भी देखी गयी है। ज्यादातर मामलों में, मध्य कान की हड्डी और मध्य कान गुहा की हड्डियां विकृत अवस्था में हैं। आंतरिक कान विकृतियों का शायद ही कभी वर्णन किया जाता है। इन असामान्यताओं के परिणामस्वरूप, टीसीएस वाले अधिकांश व्यक्तियों में प्रवाहकीय श्रवण क्षमता होती है

अधिक प्रभावित लोगों को दृष्टि रोग जैसे निचली पलकों में कोलोबोमाटा (notches), या पलकों पर बालो की आंशिक या पूर्ण अनुपस्थिति,कोण से झुकी हुई पलके , ऊपरी और निचले पलकें का झूलना , और आंसू नलिकाओं को संकुचन सहित आंखों में दृष्टि का नुकसान हो सकता है और देखने की शाकी का नुकसान स्ट्रैबिस्मस, अपवर्तक त्रुटियों, और एनीसोमेट्रोपिया आदि से जुड़ा हुआ है। यह गंभीर रूप से सूखी आंखों, कम पलक असामान्यताओं और लगातार आंखों के संक्रमण के परिणामस्वरूप भी हो सकता है।

यद्यपि एक असामान्य आकार की खोपड़ी ट्रेचर कोलिन्स सिंड्रोम के लिए विशिष्ट नहीं है, लेकिन कभी-कभी बिटकिमोरल संकीर्णता वाले ब्रैचिसेफली को देखा जाता है। क्लेफ्ट ताल (Cleft Palate) भी आम लक्षण है।

दंत अजनन (33%), मलिनकिरण (enamel opacities) (20%), maxillary पहले molars (13%), और दांतों की चौड़ी दूरी के malplacement  सहित 60% प्रभावित लोगों में चिकित्सकीय विसंगतियों को देखा जाता है। कुछ मामलों में, अनिवार्य hypoplasia के साथ संयोजन में दांत विसंगतियों के परिणामस्वरूप एक malocclusion में परिणाम। यह भोजन के सेवन और मुंह को बंद करने की क्षमता के साथ समस्याओं का कारण बन सकता है।टीसीएस से कम प्रभावित व्यक्ति में आमतौर पे विशेषताएं जैसे की श्वास की समस्याओं में शामिल हो सकती हैं, जिनमें सोते वक़्त स्वसावरोध  भी शामिल है। चोनाल एट्रेसिया या स्टेनोसिस, चनाना की एक संकुचित या अनुपस्थिति है, जो नाक के मार्गों का आंतरिक खुलता है। फेरनक्स का अविकवरण वायुमार्ग को भी संकीर्ण कर सकता है।

टीसीएस से संबंधित विशेषताएं जो कम देखी जाती हैं, उनमें नाक संबंधी विकृतियां, उच्च-कमाना वाले ताल, मैक्रोस्टोमिया, प्रीौरीक्युलर हेयर विस्थापन, क्लेफ्ट ताल, हाइपरटेलोरिज्म, ऊपरी पलकें, और जन्मजात हृदय दोष शामिल हैं। आम जनता चेहरे की विकृति के साथ और बौद्धिक विकास में देरी को भी जोड़ सकती है। विकलांगता, लेकिन टीसीएस से प्रभावित 95% से अधिक लोगों में सामान्य बुद्धि है। चेहरे की विकृति, से जुडी मनोवैज्ञानिक और सामाजिक समस्याएं टीसीएस वाले व्यक्तियों के जीवन में गुणवत्ता को प्रभावित कर सकती हैं।

प्रसवपूर्व निदान (Prenatal diagnosis)
TCOF1
जेनेटिक परामर्श
लक्षण और संकेत