लिवोफ़्लॉक्सासिन और अन्य फ़्लोरोक्विनोलोन के प्रति, उपचार के दौरान भी, प्रतिरोध तेजी से विकसित हो सकती है। "स्टैफ़ीलोकॉकस ऑरियस", एनटरोकॉकी और "स्ट्रोप्टोकॉकस पायोजीन्स" सहित अब कई रोगजनक दुनिया भर में प्रतिरोध प्रदर्शित कर रहे हैं। प्रतिरोध के तीन ज्ञात तंत्र मौजूद हैं। बहिःस्राव पंप के कुछ प्रकार अंतःकोशिकी क्विनोलोन सांद्रता को कम करने का कार्य कर सकते हैं। ग्राम-नेगेटिव बैक्टीरिया में, प्लाज़्मिड-मध्यस्थता प्रतिरोध जीन ऐसे प्रोटीन का उत्पादन कर सकते हैं, जो DNA कर्णक से बंध सकते हैं, जिससे वे क्विनोलोन के प्रभाव से बच सके. अंततः, DNA कर्णक या टोपोइसोमरेज़ IV में महत्वपूर्ण स्थलों पर उत्परिवर्तन क्विनोलोन के प्रति अपने बंधकारी घनिष्ठता को कम कर सकते हैं, जिससे दवा का प्रभाव कम हो सकता है।

बरसों पहले FDA ने ऐसे नुस्ख़ों के दुरुपयोग से निपटने के लिए पैकेज निविष्टियों के अंदर लिवाक्विन के समुचित उपयोग के बारे में चेतावनी जोड़ी थी। चिकित्सकों को यह सलाह देते हुए कि लिवोफ़्लॉक्सासिन: "... का उपयोग केवल ऐसे उपचार या संक्रमण को रोकने के लिए की जानी चाहिए, जिसमें बैक्टीरिया द्वारा बीमारी का ख़तरा साबित हुआ हो या सुदृढ़ रूप से प्रत्याशित हो..."

"आम तौर पर लिवोफ़्लॉक्सासिन का उपयोग "केवल" उन रोगियों में किया जाना चाहिए, जो कम से कम एक पूर्व चिकित्सा में विफल रहे हैं। गंभीर रूप से बीमार मरीज़ और जिन्हें तत्काल अस्पताल में भर्ती कराने की आवश्यकता हो सकती है, उनके लिए आरक्षित" हालांकि गंभीर और प्राणघातक बैक्टीरिया के संक्रमणों के इलाज के लिए बहुत महत्वपूर्ण और जरूरी दवा मानी जाती है, संबद्ध लिवोफ़्लॉक्सासिन नुस्ख़ों का दुरुपयोग अबाधित रहा है, जिसने बैक्टीरिया प्रतिरोध की समस्या में योगदान दिया है। ओटिटिस मीडिया से पीड़ित बच्चों के साथ हो रहे जैसे एंटीबायोटिक के अति प्रयोग ने एक सुपर बैक्टीरिया की नस्ल को जन्म दिया है, जो एंटीबायोटिक दवाओं के लिए पूरी तरह से प्रतिरोधी रहे हैं।

2002 में लिवोफ़्लॉक्सासिन सहित फ़्लोरोक्विनोलोन, वयस्कों के लिए निर्धारित एंटीबायोटिक दवाओं का वर्ग बन गया था। एक अध्ययन के अनुसार, जिसे अंशतः हेल्थकेयर अनुसंधान और गुणवत्ता की एजेंसी द्वारा समर्थित किया गया है, इन नुस्ख़ों में से लगभग आधे (42%) ऐसी स्थितियों के लिए थे, जो FDA द्वारा अनुमोदित नहीं थे। इसके अलावा, आम तौर पर उन्हें ऐसी चिकित्सा दशाओं के लिए निर्धारित किया जाता है, जो बैक्टीरिया से संबंधित भी नहीं हैं, जैसे वायरल संक्रमण, या उनके लिए जिनका कोई सिद्ध लाभ मौजूद नहीं है।

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एंटीबायोटिक दुरुपयोग और बैक्टीरिया प्रतिरोध