बोलोग्ना के बाद मिलान इटली का दूसरा रेलवे केंद्र है और मिलान के पांच प्रमुख स्टेशनों के बीच मिलान सेंट्रल स्टेशन, इटली का सबसे व्यस्त स्टेशन है। मिलान का प्रथम निर्मित रेलरोड, मिलान एंड मॉन्ज़ा रेल रोड 17 अगस्त 1840 को सेवा के लिए खोला गया।

13 दिसम्बर 2009 से दो उच्च गति रेल लाइनें, मिलान को एक दिशा में बोलोग्ना, फ्लॉरेंस, रोम, नेपल्स और सेलर्नो से जोड़ती हैं और दूसरी दिशा में टोरिनो से.

अज़ेंडा ट्रांस्पोर्टी मिलानेज़ी (ATM), तीन महानगरीय रेलवे लाइनें और ट्राम, ट्रॉली बस और बस लाइनों से मिल कर बने सार्वजनिक परिवहन नेटवर्क का प्रबंधन संभालते हुए, महानगरीय क्षेत्र के भीतर संचालित होती है। ATM ट्रैमवे बेड़े में शामिल हैं मूल रूप से 1928 में बनी कई पीटर विट कारें, जो अभी भी काम कर रही हैं। कुल मिला कर नेटवर्क, 86 नगरपालिकाओं तक पहुंचते हुए लगभग 1,400 कि॰मी॰ आवृत करता है। सार्वजनिक परिवहन के अलावा ATM, सोस्टामिलानो पार्किंग कार्ड सिस्टम का उपयोग करते हुए, ऐतिहासिक केंद्रों और वाणिज्यिक अंचलों में, अंतर्बदल पार्किंग समूह और सड़कों पर पार्किंग स्थलों का प्रबंधन करता है।

मिलान में मिलान मेट्रो नामक प्रणाली में तीन भूमिगत रेल लाइनें हैं, जिसका नेटवर्क आकार 80 कि॰मी॰ से भी ज़्यादा विस्तृत है। इसमें तीन लाइनें शामिल हैं; रेड लाइन, जो उत्तरपूर्व से पश्चिम की दिशा में, ग्रीन लाइन, जो उत्तरपूर्व और दक्षिणपश्चिमी दिशा में और यल्लो लाइन जो उत्तर से दक्षिण दिशा में चलती हैं।

दस उपनगरीय लाइनों से बनी उपनगरीय रेल सेवा लाइनें, मिलान संकुल को महानगरीय क्षेत्र से जोड़ते हैं। 2008 में अधिक लाइनें शुरू होनी थीं, लेकिन यथा जनवरी 2009, कोई भी पूरी नहीं हुई है। दूसरी ओर, क्षेत्रीय रेलवे सेवा, मिलान को शेष लोम्बार्डी और राष्ट्रीय रेल प्रणाली से जोड़ती है। शहरी ट्राम नेटवर्क में लगभग ट्रैक और 1७ लाइनें शामिल हैं। बस लाइनें 1,070 कि॰मी॰ आवृत करती हैं।

मिलान में निजी कंपनियों द्वारा संचालित और सिटी ऑफ़ मिलान ("कम्यूने डी मिलानो") द्वारा लाइसेंसकृत टैक्सी सेवा भी है। सभी टैक्सियां एक ही रंग की, सफ़ेद हैं। क़ीमतें, शुरूआत में एक निश्चित किराए पर और गुज़रे समय और तय दूरी के अनुसार अतिरिक्त किराए पर आधारित है। वर्तमान टैक्सी ड्राइवरों की पैरवी द्वारा लाइसेंस की संख्या कम हैं। व्यस्ततम घंटों में या बरसात के दिनों में टैक्सी ढूंढ़ना मुश्किल हो सकता है और अक्सर होने वाले, सार्वजनिक परिवहन हड़तालों के दौरान नामुमकिन.

मिलान शहर में तीन अंतर्राष्ट्रीय हवाई अड्डे कार्यरत हैं। इटली का दूसरा सबसे बड़ा हवाई अड्डा, मालपेन्सा अंतर्राष्ट्रीय हवाई अड्डा, केंद्रीय मिलान से लगभग 50 कि॰मी॰ की दूरी पर है और ""मालपेन्सा एक्सप्रेस" " रेल सेवा के साथ शहर से जुड़ा है। इसने 2007 में 23.8 लाख यात्रियों को संभाला. शहर की सीमा के निकट स्थित लाइनेट हवाई अड्डा, मुख्यतः घरेलू और छोटी अंतर्राष्ट्रीय उड़ानों के लिए इस्तेमाल होता है, जहां 2007 में 9 लाख से ज़्यादा यात्रियों ने सफ़र किया। बर्गामो शहर के समीप स्थित ओरियो अल सेरियो हवाई अड्डा, मिसान की कम लागत वाली यातायात सेवा है (2007 में क़रीब 6 लाख यात्री).

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