प्राकृतिक चिकित्सा का ध्यान कुछ ख्दास पद्धतियों के बजाय प्राकृतिक स्व-चिकित्सा के दर्शन पर केंद्रित होता है और चिकित्सक उपचार के लिए विभिन्न तरह के तरीकों का उपयोग करते हैं। कुछ तरीके सारहीन अहम ऊर्जा क्षेत्रों पर निर्भर होते हैं, जिनका अस्तित्व सिद्ध नहीं किया गया है और वहाँ यह भी चिंता रहती है कि प्राकृतिक चिकित्सा एक ऐसा क्षेत्र है, जो आम वैज्ञानिक मान्यता से अलग होता है, हालांकि बास्तर, एनसीएनएम और सीसीएनएम वर्तमान अनुसंधान कार्यक्रमों को बरकरार रख्ने हुए हैं। बास्तर एनआईएच से अनुसंधान के लिए अनुदान भी प्राप्त करते हैं, जिससे उनका रिश्ता 1984 में तब शुरू हुआ, जब बास्तर एनआईएच से अनुसंधान के लिए अनुदारन पाने वाले पहले स्कूल बने. एक संपूर्ण प्रणाली के रूप में प्राकृतिक चिकित्सा की प्रभावशीलता का व्यवस्थित मूल्यांकन नहीं किया गया है और व्यक्तिगत तरीकों की प्रभावकारिता अलग-अलग होती है।

आमतौर पर परामर्श रोगी के एक लंबे साक्षात्कार से शुरू होता है, जिसमें रोगी की जीवन शैली, चिकित्सा संबंधी इतिहास, भावनात्मक अनुभूति और साथ ही शारीरिक परीक्षण से शुरू होता है। पारंपरिक प्राकृतिक चिकित्सक जीवन शैली में परिवर्तन और दृष्टिकोणों पर केंद्रित होती है, जो शरीर की सहज चिकित्सा क्षमता का समर्थन करती है। पारंपरिक प्राकृतिक चिकित्सक रोग की पहचान और निदान नहीं शुरू करते हैं, बलिक वे पूरे शरीर के स्वस्थ होने और शरीर के खुद निरोग होने की प्रक्रिया पर ध्यान केंद्रित करते हैं। पारंपरिक नेचुरोपैथ न तो कोई दवा लिखते हैं और न ही दवा, सीरम, तरल दवा, सर्जरी या रोग के लिए खास उपचार या पारंपरिक दवाओं का प्रयोग करते हैं। प्राकृतिक चिकित्सा के चिकित्सक स्वयं को प्राथमिक देखभाल प्रदाता के रूप में पेश करते हैं और इसके अलावा विभिन्न प्राकृतिक तरीकों निर्धारित पुरानी दवाएं लिखते हैं, छोटी-मोटी सर्जरी करते हैं, नहीं तो अपनी प्रैक्टिस को विभिन्न अन्य पारंपरिक चिकित्सा प्रणाली पर केंद्रित करते हैं। नेचुरोपैथ जरूरी नहीं कि एंटीबायोटिक व टीके की सलाह दें और वे अनुपयुक्त वैकल्पिक उपचार भी कर सकते हैं, जिसके लिए सबूत पर आधारित दवाएं प्रभावी बताई गई हैं। प्राकृतिक चिकित्सा शिक्षा के सभी रूपों में बुनियादी विज्ञान से असंगत अवधारणाएं शामिल होती हैं और जरूरी नहीं कि चिकित्सक उचित निदान और या निदान की सिफ़ारिशें करने के लिए तैयार हो.

50% से भी से कम प्राकृतिक चिकित्सकों का कहना है कि वे बुखार से पीड़ित 2-सप्ताह के शिशु को उस स्थिति में भी रेफर कर सकते हैं, जहां वास्तविक नुकसान की संभावना हो.

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