थेरॉन अपने प्रेमी स्टुअर्ड टाउनसेंड, जिनके साथ 2004 में उन्होंने फ़िल्म "हेड इन द क्लाउड्स", 2002 में फ़िल्म "ट्रैप्ड" और 2005 में "एऑन फ्लक्स" में अभिनय किया था, के साथ लॉस एंजिल्स में रहती हैं। उन्होंने कहा है कि वे तब तक शादी नहीं करेंगी, जब तक कि समान लिंग वाले जोड़ों की शादी को मान्यता नहीं मिल जाती. स्टुअर्ड टाउनसेंड ने कहा कि वे खुद को और थेरॉन को पति-पत्नी मानते हैं। "हमलोगों ने कोई समारोह आयोजित नहीं किया।" उन्होंने कहा. "इसे इस तरह कहा जाय कि मुझे किसी प्रमाणपत्र या राज्य या चर्च की जरूरत नहीं है। इसलिए कोई बड़ा आधिकारिक मामला इसमें नहीं है, लेकिन हमलोग शादीशुदा हैं।.. मैं उसे अपनी पत्नी मानता हूं और वह मुझे अपना पति." जनवरी 2010 को यह जोड़ी अलग हो गयी।

मई 2007 को थेरॉन संयुक्त राज्य अमेरिका की सहजात नागरिक बनीं.

2009 में थेरॉन ने विलियम मॉरिस एंडीव्यॉर के साथ एक समझौता किया और CEO एरी एम्युअल द्वारा इसका प्रतिनिधित्व किया गया।

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