प्राथमिक ओरोफेसियल परिसर्प की तत्काल पहचान उन व्यक्तियों के रोग-विषयक परीक्षा के माध्यम से की जाती है जिन्हें कभी घाव नहीं हुआ है और जो कभी ज्ञात एचएसवी-1 (HSV-1) संक्रमण वाले किसी व्यक्ति के संपर्क में आया है। आम तौर पर इन लोगों में घावों की उपस्थिति और वितरण एकाधिक, गोल, सतही मौखिक अल्सरों के रूप में सामने आता है जिसके साथ-साथ मसूड़ों में तीव्र सूजन भी हो जाता है। जिन व्यस्क व्यक्तियों में यह आम रूप सामने नहीं आता है उनके रोगों की पहचान कर पाना ज्यादा मुश्किल होता है। पूर्व लक्षण जो दादा घावों के सामने आने से पहले नज़र आते हैं, वे एचएसवी (HSV) के लक्षणों को एलर्जी सम्बन्धी स्टोमेटाइटिस जैसे अन्य विकारों एक एक जैसे दिखने वाले लक्षणों में अंतर स्थापित करने में मदद करते हैं। जब मुंह में घाव नज़र नहीं आते हैं, तो प्राथमिक ओरोफेसियल परिसर्प को कभी-कभी इम्पेटिगो समझने की भूल हो जाती है जो कि जीवाणुओं से होने वाला एक संक्रमण है। मुंह में होने वाले आम घाव (अफ्थाउस अल्सर) भी इंट्रामौखिक परिसर्प जैसे ही लगते हैं, लेकिन इनमें कोई वेसिक्यूलर चरण मौजूद नहीं होता है।

मौखिक परिसर्प की तुलना में जननांगी परिसर्प की पहचान कर पाना ज्यादा मुश्किल हो सकता है क्योंकि अधिकांश एचएसवी-2 (HSV-2)-संक्रमित व्यक्तियों का कोई पारंपरिक लक्षण नहीं होता है। इसके अलावा रोग की पहचान में भ्रम होने की वजह से कई अन्य स्थितियां जननांगी परिसर्प जैसे लगते हैं जिसमें लिचेन प्लेनस, ऐटोपिक त्वचाशोध और यूरेथ्राइटिस शामिल हैं। जननांगी परिसर्प की पहचान की पुष्टि करने के लिए अक्सर प्रयोगशाला परीक्षण का उपयोग किया जाता है। प्रयोगशाला परीक्षणों में शामिल हैं: विषाणु का संवर्धन, विषाणु का पता लगाने के लिए डायरेक्ट फ्लोरिसेंट एंटीबॉडी (डीएफए (DFA)) के अध्ययन, त्वचा बायोप्सी और विषाणुजनित डीएनए (DNA) की उपस्थिति के परीक्षण के लिए पॉलिमेरेस चेन रिएक्शन (पीसीआर (PCR)). यद्यपि इन प्रक्रियाओं द्वारा किया जाने वाला रोग-परीक्षण बहुत अधिक संवेदनशील और विशिष्ट होता है, लेकिन फिर भी इन प्रक्रियाओं की ऊंची लागत और समय की कमी, रोग-विषयक इलाज़ के नियमित प्रयोग को हतोत्साहित कर देते हैं।

एचएसवी (HSV) में एंटीबॉडी के सीरमीय परीक्षण शायद ही कभी उपयोगी साबित होते हैं और रोग-विषयक प्रयास में इनका नियमित रूप से इस्तेमाल नहीं किया जाता है लेकिन ये महामारी विज्ञान के अध्ययनों में महत्वपूर्ण होते हैं। सेरोलॉजिक जांच, जननांगी विषाणुओं या मौखिक एचएसवी (HSV) संक्रमण के प्रतिक्रियास्वरूप प्रवाहित एंटीबॉडियों के बीच अंतर नहीं बता सकते हैं। एचएसवी-2 (HSV-2) में एंटीबॉडी की अनुपस्थिति एचएसवी-1 (HSV-1) के कारण होने वाले जननांगी संक्रमणों की बढती हुई घटना के कारण जननांगी संक्रमण को नहीं निकालता है।

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