सलमान खान का जन्म अमेरिका के लुइसियाना केमेटैरी में एक बंगाली परिवार में हुआ था। उनके पिता बारिसाल, बांग्लादेश से थे, और उनकी माँ मुर्शिदाबाद, पश्चिम बंगाल, भारत से थीं। उन्होंने पब्लिक स्कूल ग्रेस किंग हाई स्कूल में भाग लिया, जहाँ, वे याद करते हैं, "कुछ सहपाठी जेल से बाहर आ गए थे और अन्य शीर्ष विश्वविद्यालयों के लिए बाध्य थे।" उन्होंने १ ९९ में वेलेडिक्टोरियन स्नातक किया। 

खान ने मैसाचुसेट्स इंस्टीट्यूट ऑफ टेक्नोलॉजी(एमआईटी) में भाग लिया, पाठ्यक्रम 6 ( इलेक्ट्रिकल इंजीनियरिंगऔर कंप्यूटर विज्ञान) में बैचलर ऑफ साइंसऔर मास्टर ऑफ साइंस कीडिग्री के साथ, और 1998 में पाठ्यक्रम 18 ( गणित) में एक और स्नातक की डिग्री प्राप्त की। अपने वरिष्ठ वर्ष में कक्षा अध्यक्ष थे। 

खान हार्वर्ड बिजनेस स्कूलसे बिजनेस एडमिनिस्ट्रेशन के मास्टर डिग्री भी हैं। 

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