जबकि अलग NTFS संस्करणों के अधिकांश भाग पूरी तरह से आगे और पीछे जाने में सक्षमहैं, Microsoft Windows के पुराने संस्करणों में नए NTFS संस्करणों पर कुछ तकनीकी कारणों से परेशानियाँ हैं। ये दोहरी बूटिंग और बाहरी पोर्टेबल हार्ड ड्राइव को प्रभावित करता है।

उदाहरण के लिए, एक ऑपरेटिंग सिस्टम, जो सहायक नहीं है, पर NTFS पार्टीशन पर पिछला संस्करण (अथार्त वोल्यूम शैडो कॉपी) प्राप्त करने की कोशिश करने के परिणामस्वरूप पिछले संस्करण की सामग्री खो जायेगी.

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वोल्यूम शैडो की प्रतिलिपि