माना जाता है कि पारसी धर्म का जन्म 1800 से 800 ईसा पूर्व के बीच अफगानिस्तान में हुआ है, क्योंकि इसके संस्थापक ज़रथुष्ट्र बल्ख़ में रहे और यहीं उनकी मृत्यु हो गई थी, जबकि उस समय क्षेत्र को एरियाना के रूप में जाना जाता था। पारसी धर्म के उदय के समय इस क्षेत्र में प्राचीन पूर्वी ईरानी भाषाएँ बोली जाती थीं। 6 वीं शताब्दी ईसा पूर्व के मध्य तक, अक्मेनिड्स ने मेदों को खत्म कर दिया और अपनी पूर्वी सीमाओं के भीतर अरकोसिया, एरिया और बैक्ट्रिया को शामिल किया। फारस के दारायस प्रथम के मकबरे पर एक शिलालेख में 29 राज्यों की एक सूची में काबुल घाटी का उल्लेख किया है जिस पर उन्होंने विजय प्राप्त की थी।

अफगानिस्तान के शिया
ईसाई धर्म, कैथोलिक चर्च और अफगानिस्तान में प्रोटेस्टेंटिज्म
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हिंदू धर्म