कोंकणा, मुकुल शर्मा (विज्ञान लेखक एवम पत्रकार) और अपर्णा सेन (फिल्म निर्माता एवम अभिनेत्री) की बेटी हैं। उनकी एक बड़ी बहन, कमलिनी चैटर्जी, भी हैं. कोंकणा के नाना, चिदानंद दासगुप्ता, एक फिल्म आलोचक, विद्वान, प्रोफेसर, लेखक और कलकत्ता फिल्म सोसाइटी के सहसंस्थापक हैं। उनकी स्वर्गीय दादी, सुप्रिया दासगुप्ता, प्रसिद्द आधुनिक बंगाली कवि जीबनआनंद दास की चचेरी बहन हैं।

कोंकणा के पास दिल्ली के सेंट स्टीफेन कॉलेज से अंग्रेजी में डिग्री है, जो उन्हें 2001 में मिली थी। वह माडर्न हाई स्कूल फॉर गर्ल्स, कलकत्ता और कलकत्ता इंटरनैश्नल स्कूल की छात्रा थीं.

प्रारंभिक जीवन
रंगमंच
प्रारंभिक कैरियर
जीवन के विशेष मोड़, 2005- से अबतक