यूनिक्स प्रणालियों की तरह, लिनक्स एक बहु-उपयोगकर्ता वातावरण जहां उन विशिष्ट विशेषाधिकार प्रदान कर रहे हैं और वहाँ लागू किया अभिगम नियंत्रण के कुछ फार्म है लागू करता है। एक लिनक्स सिस्टम पर नियंत्रण हासिल करने के लिए या सिस्टम में ही करने के लिए किसी भी गंभीर परिणाम पैदा करने के लिए, मैलवेयर प्रणाली के लिए रूट पहुँच प्राप्त करने के लिए होगा। 

अतीत में, यह सुझाव दिया गया कि लिनक्स क्योंकि इसकी कम बाजार हिस्सेदारी यह एक कम लाभदायक लक्ष्य बनाया इतने कम मैलवेयर था। 

२००८ में मैलवेयर लक्ष्यीकरण लिनक्स की मात्रा बढ़ रही है के रूप में जाने जाते थे। शेन कोर्सेन, केसपरसकाई लैब के साथ एक वरिष्ठ तकनीकी सलाहकार, समय में कहा, "लिनक्स मैलवेयर में वृद्धि बस अपने बढ़ती लोकप्रियता की वजह से है, विशेष रूप से एक डेस्कटॉप ऑपरेटिंग सिस्टम के रूप में ... एक ऑपरेटिंग सिस्टम के उपयोग के सीधे करने के लिए जोड़ा जाता है मैलवेयर लेखकों द्वारा ब्याज कि ओएस के लिए मैलवेयर विकसित करने के लिए। " 

टॉम फेरिस, सुरक्षा प्रोटोकॉल के साथ एक शोधकर्ता, केसपरसकाई के रिपोर्टों में से एक पर टिप्पणी करते हुए कहा, "लोगों के मन में, अगर यह गैर- विंडोज है, यह सुरक्षित है, और कहा कि ऐसा नहीं है। उन्हें लगता है कोई भी लेखन लिनक्स या मैक ओएस एक्स के लिए मैलवेयर लेकिन इसका आवश्यक सच नहीं है। " 

कुछ लिनक्स उपयोगकर्ताओं स्कैन असुरक्षित दस्तावेज़ों और ईमेल जो से आता है या विंडोज उपयोगकर्ताओं के लिए जा रहा है करने के लिए लिनक्स आधारित एंटी-वायरस सॉफ्टवेयर चला सकता हूँ। 

क्योंकि वे मुख्य रूप से मेल सर्वर जो अन्य ऑपरेटिंग सिस्टम चला रहे कंप्यूटर को मेल भेज सकते हैं पर उपयोग किया जाता है, लिनक्स वायरस स्कैनर आम तौर पर के लिए परिभाषाओं का उपयोग, और सभी कंप्यूटर प्लेटफॉर्म के लिए के लिए स्कैन, सभी ज्ञात वायरस। उदाहरण के लिए, खुला स्रोत ClamAV "का पता लगाता है ... वायरस, वॉर्म और ट्रोजन, माइक्रोसॉफ्ट ऑफिस मैक्रो वायरस, मोबाइल मैलवेयर, और अन्य खतरों भी शामिल है।" 

लिनक्स भेद्यता
बफ़र ओवररन हो गया
क्रॉस-प्लेटफ़ॉर्म वायरस
माइक्रोसॉफ्ट विंडोज- विशिष्ट खतरों के लिए