एज ऑफ एंपाइयर्स III  इकाइयां, ऐतिहासिक काल की अवधि के सैन्य वर्गों के आसपास, गेम के पिछले पुनरावृत्तियों के अनुसार आधारित हैं। खिलाड़ी कई असैनिक और सैन्य इकाइयों को नियंत्रित करता है, और उनका उपयोग उनकी सभ्यता के विस्तार और विकसित करने के लिए करता है, साथ ही विरोधियों के खिलाफ मजदूरी युद्ध भी करता है। खेल की आधार इकाई, आबादकार है, जो सभ्यता की अर्थव्यवस्था को सुधारने के लिए संसाधनों को इकट्ठा करने और इमारतों के निर्माण के लिए जिम्मेदार है। एक परिदृश्य में एक खिलाड़ी नियंत्रित कर सकते हैं इकाइयों की संख्या "जनसंख्या सीमा", एक आम वास्तविक समय रणनीति खेल मैकेनिक द्वारा सीमित है। घरों और नगर केन्द्रों की शुरुआत सीमा 200 से अधिक तक बढ़ जाती है, जबकि प्रत्येक इकाई का उत्पादन होता है, जनसंख्या की गणना बढ़ जाती है। मूलभूत इकाइयां जैसे कि बसने वालों और पैदल सेना की गणना 1 के रूप में की जाती है, लेकिन अन्य, जिनमें अधिकांश घुड़सवार और भाड़े के इन्फैंट्री भी शामिल हैं, 2 और अधिक शक्तिशाली इकाइयां, विशेष रूप से तोपखाने या भाड़े वाले घुड़सवार, 7 की आबादी के लिए अधिक संख्या में गणना कर सकते हैं। मूल योद्धाओं, खोजकर्ता, प्रशिक्षित और चराई वाले जानवरों, गर्म हवा के गुब्बारे और युद्धपोतों की गणना जनसंख्या सीमा के लिए नहीं की जाती है, लेकिन आम तौर पर एक निर्माण सीमा होती है, जिससे खिलाड़ी एक समय में केवल उन विशिष्ट इकाइयों की एक निश्चित संख्या को तैनात कर सकते हैं।

सैन्य इकाइयों का उपयोग अन्य खिलाड़ियों के खिलाफ मुकाबला करने के लिए किया जाता है। इन्फैंट्री क्रॉसबो से लेकर उन्नत राइफलों तक हथियारों का उपयोग करते हुए सबसे सस्ता इकाई प्रकार हैं और सभी भूमि आधारित हैं। भारी तोपखाने की कक्षाओं में सीमा हथियारों का इस्तेमाल होता है, मुख्य रूप से तोप और मोर्टार; हालांकि, ग्रेनेड से लैस तोपखाने भी हैं। घुड़सवार सैनिक भी मौजूद होते हैं, और हथियारों से लैस हैं, जैसे कि तलवारें, या हथियारों से लेकर, जैसे कि पिस्तौल इन इकाइयों में महत्वपूर्ण विशेषताएं हैं, जैसे कि स्किमिशर्स, जो पैदल सेना से बोनस क्षति करते हैं, और घुड़सवार सेना के अन्य घुड़सवारों के खिलाफ बोनस क्षति होती है।एज ऑफ एंपाइयर्स III में शुरू की गई एक नई इकाई एक्सप्लोरर है, जो खजाने को इकट्ठा करने के लिए मुख्य रूप से जिम्मेदार है, लेकिन वह ट्रेडिंग पोस्ट बनाने में भी सक्षम है और खिलाड़ी के आदेश पर इस्तेमाल किए जाने वाले विशेष हमले के लिए भी सक्षम है। इस इकाई को मार डाला नहीं जा सकता, लेकिन बेहोश गाया जा सकता है, जब अनुकूल इकाइयां रेंज में होंगी तो पुनर्जीवित होना चाहिए; इसके अलावा, एक फिरौती का भुगतान खिलाड़ी के शहर केंद्र पर फिर से प्रकट होने के लिए किया जा सकता है। यह फिरौती उस खिलाड़ी को श्रेय दिया जाता है जिसने उसे अक्षम कर दिया था, जब लागू हो। कुछ शिपमेंट कार्ड गेमप्ले में एक्सप्लोरर की प्रभावशीलता को बढ़ाते हैं; उदाहरण के लिए, इसे "युद्ध कुत्तों" के साथ प्रदान करने से स्काउटिंग और मुकाबला करने में मदद मिल सकती है एज ऑफ एंपाइयर्स III में, जहाजों के अधिकांश नक्शे पर उपलब्ध हैं। सैन्य जहाजों में तोप या ज्वलंत तीरों का उपयोग होता है, जबकि कुछ जहाज़ संसाधन एकत्र कर सकते हैं या भूमि इकाइयों को परिवहन कर सकते हैं।

भाड़े-सैनिक नई दुनिया में अपने अभियानों में खिलाड़ी की मदद कर सकते हैं। भाड़े-सैनिकों को मानक इकाइयों की तरह प्रशिक्षित नहीं किया जाता है; इसके बदले उन्हें होम सिटी से भेज दिया जा सकता है या सैलून से ज्यादा सिक्के के लिए किराए पर लिया जा सकता है, जिससे कि केवल आर्थिक रूप से शक्तिशाली खिलाडिय़ों को उनका रोजगार मिल सके। अधिकांश शक्तिशाली हैं, लेकिन उन्हें काम पर रखने के लिए अनुभव अंक नहीं प्रदान करता है, इसलिए भाड़े-सैनिक खिलाड़ियों की मानक सेना को प्रभावी रूप से प्रतिस्थापित नहीं कर सकते हैं, और अधिकतर उपयोग किए जाने पर खिलाड़ी की अर्थव्यवस्था को नकारात्मक रूप से प्रभावित कर सकते हैं। संयोग से, नायक / एक्सप्लोरर इकाइयों के साथ-साथ, मारेदारों को जासूसों, एजेंटों और निंजा जैसी इकाइयों की हत्या करनी पड़ती थी। ज्यादातर मामलों में, मूल अमेरिकी जनजातियों का चयन खेल के नक्शे को व्यवस्थित करता है, और अपने स्वयं के सैन्य इकाइयों का समर्थन करता है जिन्हें एक गठबंधन बनने के बाद प्रशिक्षित किया जा सकता है। कुछ निवासी अमेरिकी सैन्य इकाइयों ने मुंह के हथियार का इस्तेमाल किया, कुछ स्वदेशी रेंज के हथियारों का इस्तेमाल किया, जैसे धनुष और तीर या एटल-एटलस, जबकि अभी भी अन्य लोग यूरोपियन गनपाउडर हथियार लेकर आते हैं। ये इकाइयां आमतौर पर पैदल सेना या घुड़सवार वर्ग के वर्गों से संबंधित होती हैं, लेकिन, पानी के साथ नक्शे पर, गोदी के माध्यम से खिलाड़ी के लिए केनो भी उपलब्ध होते हैं।

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