सुप्रीम कोर्ट मे रॉबर्ट्स ने बताया था कि वह कुछ गर्भपात प्रतिबंधों का समर्थन करते हैं। "गोन्जालेस बनाम कारहार्ट" (2007) में, रॉबर्ट्स के शामिल होने के बाद न्यायालय ने केवल एक ही महत्वपूर्ण गर्भपात के मामले में निर्णय दिया है जिसमें उन्होंने बहुमत से आंशिक-जन्म गर्भपात निषेध कानून की संवैधानिकता के समर्थन में मत दिया था। न्यायमूर्ति एन्टीनी कैनेडी ने पांच न्यायाधीशों के बहुमत को लिखते हुये "स्टेनबर्ग बनाम कारहार्ट" में अन्तर किया तथा निष्कर्ष निकाला कि "प्लान्ड पैरेन्टहुड बनाम केसी" मामले में न्यायालय का पूर्व निर्णय कांग्रेस को प्रक्रिया पर प्रतिबन्ध लगाने से नहीं रोकता. निर्णय ने भविष्य में लागू होने वाली चुनौतियो के लिये दरवाजे खुले रखे, तथा इस बारे में कुछ नहीं कहा कि क्या कांग्रेस को कानून बनाने का अधिकार है। इस व्यापक प्रश्न की ओर ध्यान नही दिया. न्यायमूर्ति क्लेरेन्स थॉमस ने सहमति प्रस्ताव करते हुए कहा कि "रो बनाम वेड" तथा "केसी" मे न्यायालय के पूर्व के फैसलों को उलट दिया जाये, रॉबर्ट्स ने उस प्रस्ताव में शामिल होने से मना कर दिया.

"स्टेयर डिसीसिस (फैसले पर नजर)"
गर्भपात
अपने न्याय शास्त्र पर रॉबर्ट्स का शपथ पत्र
मिलिट्री ट्रिब्यूनल