ऑनलाइन डेबिट कार्ड के हर लेनदेन पर इलेक्ट्रॉनिक अनुज्ञप्ति की जरूरत होती है और डेबिट उपयोगकर्ता के खाते में तुरंत दिखाई दे देता है। हो सकता है लेनदेन को पर्सनल आईडेंटिफिकेशन नंबर (PIN) अनुज्ञप्ति पद्धति से अतिरिक्त सुरक्षित हो और कुछ ऑनलाइन कार्ड को हरेक लेनदेन में ऐसी अनुज्ञप्ति की जरूरत होती है, स्वचालित टेलर मशीन (ATM) कार्डों में अनिवार्य रूप से यह जरूरी है। ऑनलाइन डेबिट कार्ड के उपयोग में एक दिक्कत यह है कि इसमें प्वाइंट ऑफ सेल (POS) में इलेक्ट्रॉनिक अनुज्ञप्ति उपकरण जरूरी है और कभी-कभी पिन नंबर डालने के लिए एक अलग पिनपैड की जरूरत होती है, हालांकि बहुत सारे देशों में यह हर तरह के कार्ड के जरिए लेनदेन में आम होता जा रहा है। कुल मिलाकर ऑनलाइन डेबिट को इसके सुरक्षित अनुज्ञप्ति पद्धति और लाइव स्थिति के कारण ऑफलाइन डेबिट कार्ड से कहीं ज्यादा श्रेष्ट माना जाता है, जो केवल ऑनलाइन डेबिट कार्ड के मामले में लेनदेन पर प्रक्रमण विलंबन के साथ समस्याओं का निदान कर देता है।

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ऑनलाइन डेबिट पद्धति