आबे ने बाद में बताया कि प्रधानमंत्री के रूप में अपनी पहली अवधि समाप्त करने वाली बीमारी में अल्सरेटिव बृहदांत्रशोथ था, लेकिन बाद में वह एक दवा आसाकॉल तक पहुँचने के कारण बरामद हुआ, जो कि पहले जापान में उपलब्ध नहीं था। जब वह पद पर लौट आए तो उन्होंने अपने ही मामले का इस्तेमाल करके संभावित नवीन दवाओं को स्वीकृति देने के लिए समय कम करने का तर्क दिया। प्रधानमंत्री के रूप में इस्तीफा देने के बाद, आबे संसद में बने रहे और 2009 के चुनाव में अपने यामागुची चौथे जिले में फिर से निर्वाचित हुए जब एलडीपी जापान की डेमोक्रेटिक पार्टी से हार गई।
26 सितंबर 2012 को, आबे को विपक्षी लिबरल डेमोक्रेटिक पार्टी के राष्ट्रपति के रूप में फिर से निर्वाचित किया गया, जिसमें पूर्व रक्षा मंत्री शिगेरू इशिबा को 108 मतों में से 89 वोटों से हराया। राजनीतिक अशांति के समय आबे एलडीपी के नेतृत्व में लौट आए, परमाणु नीतियों पर पार्टी का विभाजन और कैबिनेट की चाल 5 से 10 प्रतिशत तक बढ़ने के लिए शासित डीपीजे ने निचले सदन में अपनी बहुमत खो दिया था। प्रधानमंत्री योशिहिको नोडा को उपभोग कर विधेयक पारित करने के लिए एलडीपी पर भरोसा करने के लिए मजबूर किया गया था और बदले में आबे और विपक्षी दलों द्वारा एक तस्वीर सामान्य चुनाव कराने के लिए दबाव डाला गया था। नोडा शर्तों पर यह करने के लिए सहमत है कि एलडीपी एक बांड-वित्तपोषण बिल पारित कर दिया, और सामाजिक सुरक्षा प्रणाली में सुधार और अगले संसद सत्र में चुनावी malapportionment पता करने के लिए एक आयोग का समर्थन करेंगे।

अलोकप्रियता और अचानक इस्तीफा
व्यक्तिगत जीवन
ताइवान
इंटर-प्रीमियरशिप (2007-2012)