25 अगस्त 1994 को जोएल और उनकी दूसरी पत्नी क्रिस्टी ब्रिंकले का तलाक हुआ। 31 दिसम्बर 1999 को जोएल ने न्यूयॉर्क के मैडिसन स्क्वायर गार्डन में कार्यक्रम पेश किया। उस समय जोएल ने कहा कि यह उनका आखिरी संगीत समारोह होगा। संगीत समारोह (द नाइट ऑफ द 2000 इयर के रूप में डब किया गया) लगभग चार घंटे चला और बाद में इसे रिलीज किया गया।""

1997 "टू मेक यू फिल माई लव" (To Make You Feel My Love) और "हे गर्ल" (Hey Girl) दोनों को जोएल के "ग्रेटेस्ट हिट्स वॉल्यूम III" में स्थान दिया गया।

2001 में, जोएल ने शास्त्रीय पियानो के एक हिस्से के रूप में "फैंटासीज एण्ड डिल्यूशन" (Fantasies & Delusions) का संग्रह रिलीज किया। ये सभी जोएल द्वारा रचित और जू रिचर्ड द्वारा गाए गए थे। अपने लाइव कार्यक्रमों में जोएल अक्सर इन गीतों का टुकड़ा गूंथ कर पेश करते और उनमें से कुछ हिट शो "मूविन' आउट" (Movin' Out) का हिस्सा था। शास्त्रीय चार्ट में एलबम शीर्ष #1 पर पहुंचा। 21 सितंबर 2001 को जोएल ने "न्यू यॉर्क स्टेट ऑफ माइंड" (New York State of Mind) का लाइव प्रदर्शन लाभार्थ संगीत कार्यक्रम के तौर पर गाया और 20 अक्टूबर 2001 को न्यू यॉर्क सिटी के मैडिसन स्क्वायर गार्डेन में "मियामी 2017 (सीन द लाइट्स गो आउट ऑन ब्रॉडवे (Seen the Lights Go Out on Broadway))" के साथ संगीत कार्यक्रम में गाया. उस रात, उन्होंने एल्टन जॉन के साथ "योर सॉन्ग" भी गाया.

वर्ष 2005 में कोलंबिया ने एक बॉक्स सेट "माई लाइव्स" (My Lives) रिलीज किया, जो एक बड़े हद तक डेमो, कुछ छिटपुट चीजों के साथ लाइव/वैकल्पिक संस्करण और साथ में कुछ टॉप 40 हिट गानों का संकलन हैं। इस संकलन में उमिक्सिट (Umixit) सॉफ्टवेयर भी सम्मिलित है, जिसमें लोग अपने पीसी (PC) में "जैंजिबर" (Zanzibar, "ओनली द गुड डाई यंग" (Only the Good Die Young), किपइन द फेथ () और "आई गो टू एक्सट्रिम्स" (I Go to Extremes) और "मूविन' आउट" (Movin' Out) (एंथोनी के गीत) रिमिक्स कर सकते हैं। साथ में इसमें "रिवर ऑफ ड्रीम्स" (River of Dreams) दौरे के शो का डीवीडी (DVD) भी शामिल है।

7 जनवरी 2006 को जोएल ने पूरे संयुक्त राज्य अमेरिका का दौरा शुरू किया। 13 सालों में कोई भी गाना नहीं लिखा गया, न ही कम से कम रिलीज हुआ, उन्होंने अपने पूरे कैरियर में गानों का एक नमूना तैयार किया, जिसमें कुछ मुख्य हिट्स के साथ ही साथ "जैंजिबर" (Zanzibar) और "ऑल फॉर लेयना" (All for Leyna) जैसे अधूरे धुन शामिल हैं। उनके दौरे में न्यू यॉर्क सिटी के मैडिसन स्क्वायर गार्डेन में कई महीनों तक 12 बिक चुके अभूतपूर्व संगीत कार्यक्रम शामिल हैं। मैडिसन स्क्वायर गार्डन में इस गायक ने अपनी कार्यावधि में 12 शो करके न्यू जर्सी के निवासी ब्रूश स्प्रिंगस्टीन का पिछला रिकॉर्ड तोड़ डाला, जिन्होंने उस मंच से अग्रिम रूप से बिक चुके 10 शो किये थे। जोएल ने इस एरिना में पहले निवृत्त संख्या (12) का रिकॉर्ड बनाया, वह एक गैर खिलाड़ी द्वारा अर्जित रिकॉर्ड है। इसके लिए जोएल का सम्मान फिलाडेल्फिया में वाचोविया सेंटर में किया गया, जहां जोएल के सम्मान में 46 फिलाडेल्फिया सोल्ड आउट शो (46 Philadelphia sold-out shows) के लिए फिलाडेल्फिया फ्ल्येर्स के रंगों में एक बैनर लगाया गया। न्यू यॉर्क के अलबनी के टाइम्स यूनियन सेंटर (पूर्व में क्निकरबोकर एरिना और पेप्सी एरिना) के इतिहास में सर्वाधिक कार्यक्रम पेश करने के लिए एक उनके नाम का बैनर लगाया गया। यह सम्मान उन्हें 17 अप्रैल 2007 को वहां किए गए शो के हिस्से के रूप में दिया गया। 13 जून 2006 को कोलंबिया ने "12 गार्डेन लाइव" नाम के डबल एलबम को रिलीज किया, जो जोएल के 2006 दौरे के समय मैडिसन सस्क्वायर गार्डेन में हुए 12 विभिन्न शो से 32 लाइव रिकॉर्डिंग का संग्रह है।

2006 में ही, इतने सालों में पहली बार बिली जोएल ने यूनाइटेड किंगडम और आयरलैंड (2006 के दौरे में यूरोपियन चरण के अंग रूप में) का दौरा किया। 31 जुलाई 2006 को जोएल ने रोम के एक नि:शुल्क संगीत समारोह में कोलोजियम के साथ पृष्ठभूमि में गाना गया। आयोजकों ने अनुमान लगाया इस संगीत समारोह में 500,000 लोगों ने भाग लिया, जिसका प्रारंभ ब्रायन एडम्स द्वारा किया गया था।

2006 के अंत में जोएल ने दक्षिण अफ्रीका, ऑस्ट्रेलिया, जापान और हवाई का दौरा किया और इसके बाद 2007 में मिडवेस्ट में बसंत आ जाने से पहले ही फरवरी और मार्च 2007 में दक्षिणपूर्व संयुक्त राज्य अमेरिका का दौरा किया। उसी साल 3 जनवरी को "न्यूयॉर्क पोस्ट" में यह खबर लीक हो गयी कि बिली ने एक नया गाना गीत के साथ रिकॉर्ड किया है - लगभग 14 वर्षों में यह पहला नया गाना था जिसे उन्होंने गीत के साथ लिखा था। यह "ऑल माई लाइफ" (All My Life) शीर्षक गाना था, जोएल का नवीनतम एकल (2006 में मैडिसन स्क्वायर गार्डन में लाइव "यू'आर माई होम" (You're My Home) के दूसरे ट्रैक के साथ) था और 27 फ़रवरी 2007 को दुकानों में रिलीज हुआ। 4 फ़रवरी को जोएल ने सुपर बाउल XLI (Super Bowl XLI) के लिए राष्ट्रीय गीत गाया, और सुपर बाउल. (Super Bowl.) में दो बार राष्ट्रीय गीत गाने वाले पहले गायक बन गए तथा 17 अप्रैल 2007 को न्यूयॉर्क, अलबनी के टाइम्स यूनियन सेंटर में उनके नौवें संगीत समारोह के लिए जोएल को सम्मानित किया गया। इस क्षेत्र में बॉक्स ऑफिस में किसी कलाकार की उपस्थिति के मामले में अब वे शीर्ष पर है। यह उपलब्धि हासिल करने के लिए उनके सम्मान में एक बैनर लगाया गया।

1 दिसम्बर 2007 को जोएल ने अपने नए गाने का "क्रिसमस इन फल्लुजाह" (Christmas in Fallujah) का प्रीमियर किया। गाना लौंग आईलैंड के एक नए संगीतकार कैस डीलॉन (Cass Dillon) द्वारा गाया गया, क्योंकि जोएल को लगा कि यह गाना किसी ऐसे किसीके द्वारा गाया जाना चाहिए जिसका दर्जा सैनिक के उम्र जितना हो। यह गाना इराक में रह रहे सैनिकों को समर्पित किया गया। जोएल ने सितंबर 2007 में इसे इराक में रह रहे अमेरिकी सैनिकों के भेजे गए कई पत्रों को पढ़ने के बाद लिखा. 1993 में "रिवर ऑफ ड्रीम्स" (River of Dreams) के बाद जोएल द्वारा रिलीज किया गया "क्रिसमस इन फल्लुजाह" दूसरा पॉप/रॉक गीत है। गाने से हुई आय से होम्स फॉर आवर ट्रूप्स (Homes For Our Troops) फाउंडेशन लाभान्वित हुआ।

1994-2007
निजी जीवन
प्रारंभिक जीवन
जीवन और कैरियर