पेंगुइन के विकास के इतिहास की अच्छी तरह छानबीन की गयी है और यह विकासवादी जैव भूगोल का प्रतिनिधित्व करता है, हालांकि किसी भी एक प्रजाति के रूप में पेंगुइन की हड्डियों के आकार में काफी भिन्नता है और कुछ अच्छे नमूने ज्ञात हैं, कई प्रागैतिहासिक ज्ञात रूपों के अल्फा वर्गीकरण में अभी भी बहुत कुछ ज्ञात होना बाकी है। पेंगुइन के प्रागितिहास के बारे में कुछ लेख 2005 के बाद से प्रकाशित किये गये हैं, माना जाता है कि वर्तमान पीढ़ी के विकास को अब समझ लिया गया है। 

बेसल पेंगुइन क्रीटेशस-टियर्टरी विलुप्त होने घटना के आसपास के समय (दक्षिणी) न्यूजीलैंड और ब्यर्ड लैंड, अंटार्कटिक के सामान्य क्षेत्रों में रहते थे। प्लेट टेक्टोनिस के कारण, इन क्षेत्रों की आपस में दूरी आज की तुलना में कम थी। सबसे हाल ही में पेंगुइन के आम पूर्वज और उनके उप वंशजों को कैम्पेनियन-मास्त्रीशीयन, 70-68 mya के आसपास का माना जाता है।
प्रत्यक्ष सबूत (जीवाश्म) के अभाव में कहा जा सकता है कि क्रीटेशस के अंत तक, पेंगुइन वंश अलग ढंग से विकसित हो गये थे, यद्यपि आकृति के रूप में आज जैसे नहीं थे; यह काफी संभावना है कि वे उस समय पूरी तरह उड़ानविहीन नहीं थे, चूंकि उड़ने में असमर्थ पक्षियों की क्षमता आम तौर पर बहुत कम होती है जिससे कम क्षमता के चलते उनके सामूहिक रूप से विलुप्त होने की वजह का प्रारंभिक चरण शुरू होता है। ("यह भी देखें" फ्लाईटलेस कॉर्मोरांट) 

व्युत्पत्ति
शारीरिक रचना और शरीर विज्ञान
विकास
व्यवहार