अंक के दौरान, खिलाड़ी सेंट जॉन के शूरवीर की कमान संभालने वाला है, जो स्पेनिश सभ्यता के समान होता है (भले ही खेले गए गुट वास्तव में माल्टीज़ हैं)। पूरे अंक में स्पैनिश के क्षेत्र में कई उपनिवेश थे।

16 वीं शताब्दी के अंत में सेट, एकल-खिलाड़ी अभियान का पहला कार्य मॉर्गन ब्लैक की भूमिका में शुरू होता है- नाइट्स ऑफ़ सेंट जॉन-से माल्टा पर साहिन "तुर्क साम्राज्य का फाल्कन" से अंतिम गढ़ का बचाव (माल्टा के महान घेराबंदी के एक बयान में)। मोर्गन को अपने वरिष्ठ अलैन मैगनन द्वारा समुद्र तट पर साहिन को पकड़ने का आदेश दिया जाता है, जो कि वे तब रोखते है जब तक कि ओटोमैन अपने महान बमबारी को उभरते नहीं हैं। मॉर्गन तब एलन की अगुआई वाली घुड़सवार सेना में सहायता करने के लिए एक संकेत आग लाता है, जो तुर्क वापस चलाते हैं और वे बेस की रक्षा करते हैं।

 मॉर्गन और एलन कब्जा कर लिया हुआ तुर्क तोप का उपयोग करते हुए ओटोमैन्स को माल्टा से हकालते है और पास की गुफाओं में ओटोमन हथियार कैश को उड़ा देते है। अंदर, उन्हें पता चलता है कि ओटोमैन वास्तव में एक छिपी हुई पत्थर की लाइब्रेरी में रूचि रखते थे, जिसमें चंद्रमा के झील की कहानी है, जिसमें फाउंटेन ऑफ़ यूथ, एक गुप्त निवासी अमेरिकीअवशेष शामिल है, जिसे बताया जाता है कि इसमें अनन्त जीवन देने की क्षमता है, और गुप्त समाज, जिसे ओसस के सर्किल कहा जाता है, जो इसे अपने लाभ के लिए खोजते हैं। एलन मॉर्गन को झील की खोज के लिए नई दुनिया में जाने का आदेश देता है, लेकिन मॉर्गन पे समुद्री डाकू एलिज़ाबेथ रामीसे (लीसी द पायरेट)  हमला करती है और उन्हें कैरेबियाई द्वीपों में उतरने के लिए मजबूर करतथ है। लीसी को फिर से लढ़के पराजित करने के बाद, मॉर्गन के लोगों को कुछ नेविगेशन चार्ट मिलते हैं जो उन्हें सुरक्षित रूप से नई स्पेन में मार्गदर्शन करते हैं।

युकाटन में, मॉर्गन झील की खोज करते हुए 
साहिन और ओटोमैन्स को ढूँडके ओटोमन बेस को नष्ट कर देते हैं। हालांकि स्पेनिश सेनानी फ्रांसिस्को जुआन डेल्गाडो डी लियोन, मॉरगन से पहले साहिन और कुछ अन्य ओटोमैन सैनिकों को पकड़ लेते हैं। मॉर्गन स्पैनिश लड़ने और हराने के लिए मजबूर किया जाता है, जो मॉर्गन के नए सहयोगियों, एज़टेक पर हमला कर रहे हैं। एज़्टेक की रक्षा के लिए उनकी लड़ाई के बाद, मॉर्गन को पता चलता है कि डेल्गाडो और स्पैनिश एज़टेक के शहर वर्ग में मोज़ेक के रूप में प्रच्छन्न चंद्रमा के झील के नक्शे खोज रहे थे। मोज़ेक फ्लोरिडा में होने वाले चंद्रमा के झील को दर्शाता है।

मॉर्गन ने फ्लोरिडा के लिए सैल कर दिया, जहां वो स्पेनिश को हराता है, लेकिन उसके बेड़े में आने वाले तूफान से क्षतिग्रस्त हो जाता है और उसे क्यूबा में डॉक करने के लिए मजबूर किया गया, जहां उन्होंने हवाना में अपना जहाज छोड़ देना पड़ता है। वहां वह लीसी द समुद्री डाकू का सम्मान कमाता है और एक सौदे पर हमला करता है, जो उसने स्पेनिश खज़ाने के बेड़े से लीसी को सोने का वादा करता है अगर वह उसे फ्लोरिडा ले जातथ है तो। 

फ्लोरिडा में, मॉर्गन और लीसी एलन मैगनन से मिलते हैं, जो मॉर्गन को स्पैनिश खजाना जहाजों को पकड़ने के लिए आदेश देते हैं, जब वे झील को पकड़ने के लिए आगे बढ़ते हैं एक साथ मॉर्गन और लीसी ने बेड़े पर कब्जा कर लेते हैं, इस प्रक्रिया में डेल्गाडो की हत्या कर दी, और साहिन को पकड़ लेते हैं। साहिन मॉर्गन को बताता है कि सर्किल का मानना ​​है कि चंद्रमा की झील युवा का फाउंटेन है और शुरुआत से ही उसका उद्देश्य फॉर्टेन प्राप्त करने से सर्किल को रोकना था।

एलेन मैगनान झील से लौटते हैं और मॉर्गन को अपने मूल सहयोगियों और साहिन को मारने का आदेश देते हैं, लेकिन साहिन और लीसी ने मॉर्गन को समझाते हैं, कि एलन वास्तव में ओसस के सर्किल का नेता हैं। इसलिए, नाइट, तुर्क और समुद्री डाकू युवाओं के फाउंटेन को नष्ट करने और नई दुनिया के वर्चस्व के लिए सर्किल की योजना को स्थायी रूप से बंद करने के लिए मिलकर काम करने का निर्णय लेते हैं।

चंद्रमा के झील पर पहुंचने पर, समूह अपने किले भर में सर्कल के शहर से "फिक्स्ड गन" नामक एक विशाल स्थिर तोप को पकड़ कर रखता है। फिक्स्ड गन का इस्तेमाल करते हुए, लीज़ी का फायर पोत साहिंस के विस्फोटकों से भरे हुए खजाना जहाजों से बना है, और मॉर्गन की जमीन सेना ने सर्किल के संभ्रांत बोनगार्ड को पकड़े हुए, वे फाउंटेन को नष्ट कर देते हैं। फाउंटेन के बढ़ते नुकसान के कारण, अलैन मैगनान व्यक्तिगत रूप से मुठभेड़ में बोनगार्ड की एक ताकत उठाता है और लड़ाई के दौरान मार दिया जाता है। 

 फव्वारा नष्ट हो जाने के बाद और सर्किल को हराने के बाद, साहिन तुर्की लौटने के लिए निकलता है और लीसी, अपने सभी स्पैनिश स्वर्ण झील के नीचे खोकर, कैरेबियन के लिए निकलती है: हालांकि, यह अस्पष्ट रूप से कहा गया है कि वह और मॉर्गन कई सालों बाद फिर से आए और एक प्रेमपूर्ण रिश्ता अंततः उन दोनों के बीच में उग आया, जिसका अर्थ है कि वह मॉर्गन के बच्चों की मां थी, जिससे उन्हें अभियान में दिखाए गए भविष्य के सभी ब्लैक के पूर्वज भी बनाते थे। मोर्गन आखिरी बार फाउंटेन के महत्व के बारे में सोच रहा था और क्या यह सचमुच युवा का फाउंटेन था, और झील के पानी से अपने खाली कैंटीन को फिर से भरना देखा जाता है।

सिन्गल प्लेयर
अंक 1: ब्लड
ग्राफिक्स
अंक III: स्टील