10 मई 2001 को राष्ट्रपति जॉर्ज डब्ल्यू. बुश ने रॉबर्ट्स को डी. सी. सर्किट के एक अलग पद पर नामित किया जिसे जेम्स एल. बकले द्वारा रिक्त किया गया था। उस समय सीनेट, हालांकि, डेमोक्रेट सदस्यों द्वारा नियंत्रित थी, जो कि बुश से उनके न्यायिक नामांकनों के लेकर संघर्षरत थी। सीनेट न्यायिक समिति अध्यक्ष पैट्रिक लीहे, डी.वी.टी., ने 107वीं काँग्रेस में रॉबर्ट्स को सुनवाई देने से मना कर दिया. जी.ओ.पी. ने 7 जनवरी 2003 को सीनेट का नियंत्रण अपने हाथ में ले लिया एवं बुश ने उसी दिन रॉबर्ट्स का नामांकन पुनः प्रस्तुत किया। 8 मई 2003 को रॉबर्ट्स की पुष्टि की गयी। उन्होंने 2 जून 2003 को अपना कमीशन प्राप्त किया। डी.सी.सर्किट में अपने दो वर्ष के कार्यकाल के दौरान रॉबर्ट्स ने 49 धारणायें लिखी, अन्य न्यायाधीशों से दो मतभेदों (विसम्मति) पर स्प्ष्टीकरण प्राप्त किया, एवं स्वयं के तीन मतभेद लिखे. 

डी.सी.सर्किट के उल्लेखनीय निर्णयों में निम्नलिखित शामिल हैं:

प्रारंभिक कानूनी करियर
पुष्टीकरण
डीसी सर्किट में
पूर्व-सूचना और सुनवाई का अवसर