ब्रिटिश हिंद महासागर क्षेत्र में, जिसे आमतौर पर "BIOT" के रूप में जाना जाता है, डिएगो गार्सिया सबसे बड़ा और एकमात्र बसा हुआ द्वीप है। यह एक ब्रिटेन का ओवरसीज क्षेत्र है और BIOT की सरकार में महारानी द्वारा नियुक्त कमिश्नर शामिल है। आयुक्त को कुछ कर्मचारियों की सहायता प्रदान की जाती है और यह लंदन में स्थित है और विदेशी राष्ट्रमंडल कार्यालय का निवासी होता है। यह प्रशासन, डिएगो गार्सिया "ब्रिट रेप" पर कमांडिंग ब्रिटिश बल अधिकारी द्वारा क्षेत्र में प्रतिनिधित्व करता है। कानून और विनियमों को आयुक्त द्वारा प्रवर्तित किया जाता है और ब्रिट रेप द्वारा लागू होता है।

यहां कोई नागरिक या प्रशासक नहीं हैं और ब्रिटेन इस क्षेत्र का प्रतिनिधित्व अंतरराष्ट्रीय स्तर पर करता है। एक सामान्य रूप से अपेक्षित एक स्थानीय सरकार अस्तित्व में नहीं है।

BIOT सरकार के लिए प्रमुख चिंता डिएगो गार्सिया पर अमेरिकी सैन्य बलों निवासी के साथ संबंध है। एक वार्षिक बैठक जिसे "द पोल-मिल वार्ता" (राजनैतिक-सैनिकों के लिए) कहते हैं, में सभी प्रासंगिक मुद्दों से को हल करने के लिए लंदन में विदेशी और राष्ट्रमंडल कार्यालय में आयोजित की जाती है। इन संकल्पों को एक "एक्सचेंज ऑफ नोट्स" या 2001 के बाद से एक "एक्सचेंज ऑफ लेटर्स" द्वारा निश्चित रूप दिया जाता है।

यहां दो अंतरराष्ट्रीय राजनीतिक मुद्दे हैं जो ब्रिटिश सरकार के माध्यम से डिएगो गार्सिया और BIOT को प्रभावित कर रहे हैं।

सबसे पहला है, मॉरीशस द्वीप देश द्वारा छागोस द्वीपसमूह पर दावा (जो BIOT के साथ सह-सम्बद्ध है) जिसमें डिएगो गार्सिया भी शामिल है। 1 अप्रैल 10 को ब्रिटेन सरकार की घोषणा के प्रतिक्रिया स्वरूप मॉरिशस का विरोध एक सहायक मुद्दा है, जिसमें BIOT को संरक्षित समुद्री क्षेत्र के रूप में घोषित किया गया जहां मछली और निष्कर्षण उद्योग वर्जित है (जिसमें तेल और गैस खोज शामिल है).

दूसरा, 1973 के बाद से निर्वासित पूर्व निवासियों की क्षतिपूर्ति और प्रत्यावर्तन का मुद्दा था, पूर्व निवासियों के एक समूह द्वारा इसे ज्वलंत रूप से रखा गया है और इस लेखन तक (23 अगस्त 2010) इसे एक मानव अधिकार के यूरोपीय न्यायालय में प्रस्तुत किया गया है।

चूंकि इन मुद्दों ने केवल डियगो गार्सिया के द्वीपों को ही नहीं बल्कि BIOT को सम्पूर्ण रूप से प्रभावित किया, उन्हें विकिपीडिया लेख ब्रिटिश इंडियन ओसियन टेरिटरी और डिपोपुलेशन ऑफ डियगो गार्सिया में अधिक उचित और पूरी तरह से संबोधित किया गया है।

अन्य मुद्दे जो डिएगो गार्सिया पर अमेरिकी अड्डे के लिए चिंता का विषय हैं वे हैं- यह आरोप कि इस्लामी आतंकवादी या तो प्रवालद्वीप या अमेरिकी जहाज में एक झील के शिविर पर मौजूद हैं, या प्रवालद्वीप पर अमेरिकी हवाई क्षेत्र के माध्यम से एक्स्ट्राओडनरी रेनडेशन विमान के विस्तार में.

2004 जून में, ब्रिटिश विदेश मंत्री जैक स्ट्रॉ ने कहा कि अमेरिकी अधिकारियों ने उसे लगातार आश्वासन दिया था कि डिएगो गार्सिया के माध्यम किसी भी बंदी को पारित नहीं किया गया था या या वहां किसी को जहाज से उतारा नहीं गया था। अक्टूबर 2007 में सर्वदलीय ब्रिटिश संसद के विदेश मामलों की समिति ने घोषणा की कि डिएगो गार्सिया पर एक जेल शिविर के जारी आरोपों के एक जांच को शुरू किया जाएगा, जो कि एक सेवानिवृत्त अमेरिकी सेना जनरल बैरी मैककैफ्रे द्वारा टिप्पणी से दो बार पुष्टि करने का इसने दावा किया था। 31 जुलाई 2008 को एक अनाम पूर्व व्हाइट हाउस के अधिकारी ने आरोप लगाया कि अमेरिका ने 2002 के दौरान और संभवतः 2003 में डिएगो गार्सिया के कम से कम एक संदेही को कैद किया था उससे पूछताछ की थी।

यातना पर संयुक्त राष्ट्र के विशेष दूतों में से एक दूत, मैनफ्रेड नोवाक का कहना है कि आरोपित आतंकवादियों के लिए सजाए काला पानी के रूप में डिएगो गार्सिया के इस्तेमाल किये जाने का कथित तौर पर आरोप मौजूद है। मानवाधिकार संगठन रीप्राइव का आरोप है कि अमेरिका-संचालित डिएगो गार्सिया के जल क्षेत्र के बाहर पोतों का इस्तेमाल बंदियों को कैद करने और यातना देने के लिए किया गया था।

कई समूहों का दावा है कि अमेरिकी सरकार द्वारा डिएगो गार्सिया पर आधारित सैन्य का इस्तेमाल बंदियों को एक स्थान से दूसरे स्थान में ले जाने के लिए किया जाता था जिसमें विवादास्पद असाधारण रेन्डिशन प्रोग्राम शामिल था, जिसमें एक जून 2007 में काउंसिल ऑफ यूरोप में सूचना देने का औपचारिक आरोप है। 21 फ़रवरी 2008 को ब्रिटिश विदेश सचिव डेविड मलिबैंड ने स्वीकार किया कि दो अमेरिकी असाधारण रेन्डिशन विमान को 2002 में डिएगो गार्सिया पर इंधन भरा गया था। हालांकि उस समय कैदियों को विमान में लाया गया था कि नहीं इसके बारे में कोई उल्लेख नहीं किया गया है।

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डिएगो गार्सिया पर गिबेन-हर्जबर्ग (ताजा पानी) लेंस
अमेरिकी पूर्व-तैनात पोत
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