मुनि जिनविजय द्वारा सम्पादित ग्रंथों की सूची विशाल है। सिंघी जैन ग्रंथमाला के कुछ प्रकाशन हैं: "जैन पुस्तक प्रशस्ति संग्रह", "पुरातन प्रबंध संग्रह", "प्रबंध चितामणि", "विविध तीर्थ कल्प (जिनप्रभ सूरि कृत)", "कुवलयमाला", "धर्मोपदेशमाला", "खरतरगच्छपट्टावलि (जिनपाल कृत)" तथा "खरतरगच्छबृहदगुर्वावलि"। १९३५ में डॉ॰ दशरथ शर्मा ने "पट्टावलियों" के ऐतिहासिक महत्व का विवेचन किया था।

जिनविजय मुनि अभिनन्दन ग्रन्थ के अनुसार मुनिजी ने राजस्थान पुरातत्व मंदिर के निर्देशक रूप में ८६ ग्रन्थ प्रकाशित किये थे। मुनिजी ने स्वयं जिन ग्रंथों का संपादन किया उनकी सूची निम्नलिखित है:


लाहौर कांग्रेस अधिवेशन तथा दांडी यात्रा
सम्पादित ग्रन्थ
भारतीय विद्या भवन की स्थापना
आरंभिक जीवन