सन् 2000 में एससीओ (SCO) ने अपना पूरा यूनिक्स व्यापर और सम्पति काल्डेरा प्रणाली को बेच दी जिससे बाद में इसका नाम SCO समूह कर दिया।

डॉट-कोंम बब्ल (2001-2003) यूनिक्स के संस्करणों को महत्वपूर्ण समेकन की और ले गए। यूनिक्स की बहुत से व्यापारी रुचियों में से, जो कि 1980 में उत्पन्न हुई थी केवल सोलारीज,HP-UX और AIX अभी भी बाज़ार मैं अपेक्षाकृत अच्छा कर रहीं है हालाँकि SGI की IRIX कुछ समय के लिए बनी रही। इनमें से, सोलारीज का बाज़ार में सबसे बड़ा हिस्सा है।

सन् 2003 में SCO समूह ने विभिन्न उपयोगकर्ताओं और लिनिक्स के विक्रेताओं के खिलाफ कानूनी कार्रवाई शुरू कर दी। SCO ने आरोप लगाया कि लिनिक्स के पास यूनिक्स कोड के बहुत से नक़ल के अधिकार (कोपीराईट) है जिन पर अब SCO का स्वामित्व है। अन्य आरोपों में IBM द्वारा व्यापर रहस्यों का उलंघन करना, या संता क्रूज़ के पूर्व ग्राहकों, जो अब लिनिक्स कि तरफ परिवर्तित हो चुक हैं, द्वारा अनुबंध का उलंघन करना। हालांकि, नोवेल ने यूनिक्स स्रोत पर आधारित SCO समूह का कॉपीराईट दावा विवादित बताया। नॉवेल के अनुसार, SCO (और फिर SCO समूह) प्रभावी ढंग से नॉवेल के विशेष विक्रय के प्रचारक थे, जिसने भीतरी कोपीराईट, SCO की भविष्य की गतिविधियों पर वीटो का अधिकार और लाइसेंसिंग राजस्व के 95% को भी कायम रखा। SCO समूह इसके साथ सहमत नहीं है और इस विवाद का परिणाम "SCO और नॉवेल के बीच" मुकद्दमा है। 10 अगस्त 2007, मामले का एक बड़ा हिस्सा (इस तथ्य पर कि नोवेल यूनिक्स के लिए कॉपीराइट था एससीओ समूह ने नॉवेल के पैसे को अनुचित तरीके से रखा था) नोवेल पक्ष में निर्णय लिया गया। अदालत ने फैसला सुनाया कि "SCO नॉवेल के परित्याग को पहचानने के SCO के IBM और सिकेन्ट के दावे के लिए बाध्य नहीं है". निर्णय के बाद, नोवेल ने घोषणा की और कहा कि उन्हें यूनिक्स के लोगों पर मुकदमा करने में कोई दिलचस्पी नहीं है, हम विश्वास नहीं करते कि यहाँ लिनक्स में यूनिक्स है। SCO ने 24 अगस्त 2009 को सर्किट कोर्ट के पास दसवी अपील की, यह निर्णय करने के लिए जिसमें मुकदमा वापिस अदालत में भेजा जाए.

सन 2005 में, सन माइक्रोसिस्टम्स ने अपने सोलारिस सिस्टम संकेत का परिमाण (यूनिक्स प्रणाली V रिलीस 4 पर आधारित) एक ओपनसोलारिस नामक खुले स्त्रोत परियोजन में जारी किया। न्यू सन OS तकनीकें अब पहले खुले स्रोत संकेत के रूप में ओपनसोलारिस परियोजना के माध्यम से ZFS फ़ाइल प्रणाली के रूप में जारी की जाती हैं; ओपन सोलारिस ने स्किलिक्स (SchilliX), बेलेनिक्स (Belenix), नेक्सता (Nexenta), जारिस ओएस (Jaris OS) और मर टक्स (MarTux) के रूप में कई गैर सन वितरक पैदा किये हैं।

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