थायरॉयड थेरेपी में वर्तमान मानक उपचार केवल लेवोथायरोक्सिन है और अमेरिकन एसोसिएशन ऑफ़ क्लिनिकल एंडोक्रिनोलोजिस्ट (AACE) के अनुसार निर्जलीकृत थायरॉयड हॉर्मोन, थायरॉयड हॉर्मोन के संयोजन, या ट्राईआयोडोथायरोनिन का उपयोग सामान्य रूप से प्रतिस्थापन थेरेपी के लिए नहीं किया जाना चाहिए. फिर भी, इस बात पर कुछ विवाद है कि यह उपचार प्रोटोकॉल अनुकूल है या नहीं और हाल ही अध्ययनों ने कुछ विरोधी परिणाम प्रस्तुत किये हैं। 

हाल ही में किये गए दो अध्ययन जिनमें संश्लेषित T4 की तुलना संश्लेषित T4 + T3 से की गयी है, दर्शाते हैं कि " संयोजन थेरेपी से अनुभूति और मूड दोनों में सुधार हुए हैं।एक और अध्ययन जिसमें संश्लेषित T4 और निर्जलीकृत थायरॉयड निष्कर्ष की तुलना की गयी, दर्शाते हैं कि जब विशिष्ट मरीजों को संश्लेषित T4 से बदल कर निर्जलीकृत थायरॉयड निष्कर्ष दिया गया तब सभी लक्षणों की श्रेणियों में सुधार देखा गया. 

हालांकि, अन्य अध्ययनों में देखा गया कि जिन लोगों को संयोजन थेरेपी दी गयी और संभवतया अनैदानिक हाइपोथायरायडिज्म से बीमार व्यक्ति में, मानसिक क्षमता और मूड में किसी भी प्रकार का सुधार नहीं देखा गया.
साथ ही, 2007 में नौ नियंत्रित अध्ययनों के विश्लेषण, जिन्हें बाद में प्रकाशित किया गया, उनमें मनोवैज्ञानिक लक्षणों पर प्रभाव में कोई महत्वपूर्ण अंतर नहीं पाया गया. 

कई चिकित्सक T3 के उपयोग के बारे में मुद्दे उठाते हैं क्योंकि इसका अर्द्ध आयु काल कम होता है। 

खुद T3 को जब उपचार के रूप में प्रयुक्त किया जाता है, थायरॉयड हॉर्मोन के स्तर में एक दिन में बार बार उतार चढ़ाव आते हैं और संयुक्त T3/T4 थेरेपी के साथ हर दिन बहुत अधिक परिवर्तन निरंतर होता रहता है। 

कारण
लक्षण
उपचार को लेकर विवाद
सामान्य मनोवैज्ञानिक संघ (General psychological associations)