1995 में, बैरीमोर ने व्यावसायिक भागीदार नैन्सी जुवोनेन के साथ फ़्लावर फ़िल्म्स नामक एक निर्माण कंपनी की स्थापना की। कंपनी द्वारा निर्मित पहली फ़िल्म थी 1999 की "नेवर बीन किस्ड" . कंपनी की दूसरी पेशकश थी, 
"चार्लीज़ एन्जिल्स" (2000), जो वर्ष 2000 में बॉक्स ऑफिस पर भारी रूप से सफल होते हुए बैरीमोर और कंपनी, दोनों की प्रतिष्ठा को मज़बूत करने में मददगार साबित हुई। 

जब रिचर्ड केली की पहली फ़िल्म "डॉनी डार्को" के निर्माण में अड़चन की धमकी दी गई, तब बैरीमोर फ्लॉवर फ़िल्म्स की ओर से वित्त पोषण के साथ आगे आईं और करेन पोमेरॉय, शीर्षक किरदार की अंग्रेज़ी शिक्षिका की छोटी भूमिका अदा की। हालांकि फ़िल्म 9/11 के परिणामस्वरूप बॉक्स ऑफ़िस पर सफल होते-होते रह गई, लेकिन डीवीडी रिलीज़ के बाद पंथ फ़िल्म के स्तर को छू गईं, जब उसने साज़िश के चक्कर को सुलझाने और ख़ुलासा करने वाले समर्पित असंख्य वेबसाइटों को प्रोत्साहित किया।

2003 में, उन्होंने "" में डीलन सैंडर्स के रूप में अपनी भूमिका को दोहराया, उन्हें "ऑलिव, द अदर रेनडीअर" में अपने प्रदर्शन के लिए एम्मी पुरस्कार हेतु नामित किया गया और 2003 में वे "ड्यूप्लेक्स" में बेन स्टिलर के साथ नज़र आईं। 2004 में फ़्लावर फ़िल्म्स ने सह-अभिनेता एडम सैंडलर की हैप्पी मेडिसन कंपनी के साथ "50 फ़र्स्ट डेट्स" का निर्माण किया। बैरीमोर के आकर्षण का समाहार करते हुए रोजर एबर्ट ने "50 फ़र्स्ट डेट्स" की अपनी समीक्षा में बैरीमोर को "मुस्कुराती, संकोची सद्भावना" वाली तथा फ़िल्म को "अनुग्रह पाने लायक और पसंद करने योग्य" कहा।

"50 फ़र्स्ट डेट्स" के बाद "फ़ीवर पिच" (2005) और 2007 में "म्यूज़िक एंड लिरिक्स" और "लकी यू" जारी हुईं. बैरीमोर की अभी हाल की परियोजनाओं में 2008 की "बेवर्ली हिल्स चिहुआहुआ" और 2009 की "ही इज़ जस्ट नॉट दैट इन्टू यू", "ग्रे गार्डन्स" तथा "एवरीबडी इज़ फ़ाइन" शामिल हैं।

बैरीमोर द्वारा निर्देशित पहली फ़िल्म "व्हिप इट", 2009 अक्टूबर में जारी की गई। "व्हिप इट" में एलेन पेज और मार्शिया गे हार्डन ने अभिनय किया और यह सौंदर्य प्रतियोगिताओं के जुनून और ऑस्टिन, टेक्सास गर्ल्स रोलर डर्बी टीम पर केंद्रित है। बैरीमोर ने भी इस फ़िल्म में अभिनय किया।

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