"द मैट्रिक्स" वार्नर ब्रदर्स तथा ऑस्ट्रेलियन विलेज रोडशो पिक्चर्स का एक सहनिर्माण था और लगभग सभी दृश्य ऑस्ट्रेलिया के सिडनी में फॉक्स स्टूडियो के साथ-साथ इसी शहर में भी में फ़िल्माएं गए थे। शहर की महत्वपूर्ण पहचानों को शामिल नहीं किया गया ताकि जातीय अमेरिकन सेटिंगों को बनाये रखा जा सके। इसके बावजूद, सिडनी हार्बर ब्रिज, एजंक ब्रिज, एडब्लूए टावर, मार्टिन प्लेस तथा कॉमनवेल्थ बैंक ब्रांच आदि कुछ दृश्यों में दिखाई पड़ते हैं और ऐसे ही कुछ दृश्य जिसमें टेलस्ट्रा का सिडनी कार्यालय तथा आईबीएम कार्पोरेशन का साइनबोर्ड शामिल है। अन्य संकेतों के रूप में बायें हाथ की तरफ ट्राफिक बहाव तथा ऑस्ट्रेलियाई अंग्रेज़ी का प्रयोग जैसे "लिफ्ट" और "ऑथोराईस्ड" (अमरीकी अंग्रेज़ी में "एलिवेटर" तथा "ऑथराइज़्ड")।

निर्देशकों के अपने शहर शिकागो, इलिनोइस के सूक्ष्म नॉड्स को शिकागो आकाशीय रेखा, शहर के नक्शे के सूक्ष्मरूप से स्थापित तस्वीर के माध्यम से शामिल किये गये थे, भूमिगत रेलपथ में नियो तथा स्मिथ के बीच के लड़ाई के दौरान, जिसे "लूप" कहा गया है, स्थान जैसे कि एडम्स स्ट्रीट ब्रिज, कुएं तथा झील, फ्रैंकलीन तथा इरी, स्टेट एवं बाल्बो और वाबाश एवं झील भूमिगत रेलवे के गंतव्य के रूप में दिखाया गया है।

छत के उपर का सेट जिसे ट्रिनिटी एजेंट जोन्स से बचने के लिए फ़िल्म के प्रथम दृश्य में उपयोग करती है "डार्क सिटी" के निर्माण का बाकी अंश था जिसे फ़िल्म के कथानक की समानता के आधार पर चिन्हित कर रखा गया था। "द आर्ट ऑफ द मेट्रिक्स" के अनुसार फ़िल्म का एक पूरा दृश्य तथा कई प्रकार के एक्शन के छोटे-छोटे दृश्य फाइनल कट से पहले हटा दिए गए थे जिन्हें आज तक प्रदर्शित नहीं किया गया।

वाचोवस्की भाइयों ने इस बात पर ध्यान दिया था कि सभी शामिल लोग फ़िल्म के कथानक पृष्ठभूमि को समझें। उदाहरण के लिए, फ्रांसीसी दार्शनिक जीन बाउड्रीलार्ड की 1981 की एक रचना, "सिमुलाक्रा एंड सिमुलेशन" नामक फ़िल्म के पहले दृश्य में डिस्क को छुपाने के लिए जिस पुस्तक का प्रयोग किया गया था वह सभी प्रमुख चरित्र तथा सदस्य को अध्ययन के लिए आवश्यक था।

फ़िल्म निर्माण पर प्रभाव
कहानी
निर्माण
निरपेक्ष