कुछ कर्कट रोगज़नक़ के संक्रमण के कारण हो सकते हैं। कई कैंसर एक वायरस के संक्रमण के कारण होते हैं; यह विशेष रूप से जंतुओं जैसे पक्षियों में देखा जाता है, लेकिन मनुष्यों में भी ऐसा होता है, पूरी दुनिया में 15% मानव कैंसर के लिए वायरस ही जिम्मेदार हैं। 
मानव के कैंसर से सम्बंधित मुख्य वायरस हैं मानव पेपिलोमा वायरस, हैपेटाइटिस बी और हेपेटाइटिस सी वायरस, एपस्टीन-बार वायरस और मानव टी -लिम्फोट्रोपिक वायरस.

प्रायोगिक और महामारी आंकडे वायरस की एक कारक भूमिका का संकेत देते हैं और वे मानव में कैंसर के विकास के लिए दूसरे सबसे महत्वपूर्ण जोखिम कारक के रूप में सामने आये हैं, जबकि पहला कारक तम्बाकू का उपयोग है। वायरस-प्रेरित गांठों को दो प्रकारों में विभाजित किया जा सकता है, "तीव्रता से रूपांतरित होने वाले" और "धीरे धीरे रूपांतरित होने वाले" .

तीव्रता से रूपांतरित होने वाले वायरसों में वायरस एक अतिसक्रिय ओंकोजीन को संवाहित करता है जिसे वायरल-ओंकोजीन (v-onc) कहा जाता है और संक्रमित कोशिका v-onc की अभिव्यक्ति के साथ तुंरत ही रूपांतरित हो जाती है। 
इसके विपरीत, धीरे धीरे रूपांतरित होने वाले वायरस में, वायरस जीनोम, पोषी के जीनोम में एक प्रोटो-ओंकोजीन के पास प्रविष्ट होता है।

अब वायरल प्रवर्तक या अन्य प्रतिलेखन विनियमन तत्व उस प्रोटो-ओंकोजीन की अति-अभिव्यक्ति का कारण बनते हैं। इसमें अनियंत्रित कोशिका विभाजन शामिल है। क्योंकि प्रविष्टि का स्थान प्रोटो-ओंकोजीन के लिए विशिष्ट नहीं होता है और किसी भी प्रोटो-ओंकोजीन के पास प्रविष्टि की सम्भावना कम होती है, धीमी गति से रूपांतरित होने वाले वायरस, तीव्रता से रूपांतरित होने वाले वायरस की तुलना में, संक्रमण के अधिक लम्बे समय के बाद गाँठ पैदा करते हैं।

हैपेटाइटिस बी और हेपेटाइटिस सी सहित हेपेटाइटिस वायरस, एक दीर्घकालिक (क्रोनिक) वायरल संक्रमण को प्रेरित कर सकता है, जो प्रतिवर्ष हैपेटाइटिस बी के 0.47% रोगियों में (विशेष रूप से एशिया में, उत्तरी अमेरिका में ऐसा कम देखा गया है) और प्रति वर्ष हेपेटाइटिस सी के 1.4% रोगियों में यकृत कैंसर का कारण है। लीवर सिरोसिस, चाहे क्रोनिक वायरल हैपेटाइटिस संक्रमण के कारण हो या शराब पीने के कारण, यह यकृत कैंसर के विकास से सम्बंधित होता है और सिरोसिस और वायरल हैपेटाइटिस का संयोजन यकृत कैंसर विकास के उच्चतम जोखिम का कारण है। दुनिया भर में वायरल हैपेटाइटिस के संचरण और रोग के भारी बोझ के कारण, यकृत कैंसर सबसे आम और सबसे अधिक घातक कैंसरों में से एक है।

कैंसर अनुसंधान में आधुनिकीकरण ने कैंसर को रोकने के लिए एक वेक्सीन को डिजाइन किया है। 2006 में, यू. एस. फूड एंड ड्रग एडमिनिस्ट्रेशन ने एक मानव पेपिलोमा वायरस वेक्सीन को स्वीकृति दी जिसे गार्दासिल कहा जाता है। वेक्सीन चार HPV (एचपीवी) प्रकारों से सुरक्षा करती है, जो 70% गर्भाशय ग्रीवा के कैंसर और 90% जननांग मस्सों का कारण हैं। मार्च 2007 में, यू. एस. सेंटर्स फॉर डिजीज कंट्रोल एंड प्रिवेंशन (CDC) प्रतिरक्षा प्रक्रियाओं पर सलाहकार समिटी (ACIP) ने अधिकारिक रूप से सलाह दी की 11-12 आयु वर्ग की लड़कियों को वेक्सीन दी जानी चाहिए और इंगित किया कि 9 साल की छोटी लड़कियों से लेकर 26 साल की आयु तक की महिलाएं इस प्रतिरक्षा के लिए पात्र हैं अर्थात उन्हें यह टीका लगाया जा सकता है।

वायरस के अलावा, शोधकर्ताओं ने जीवाणु और कुछ विशेष प्रकार के कर्कट के बीच सम्बन्ध पाया है। सबसे प्रमुख उदाहरण है आमाशय के कर्कट और आमाशय की दीवार के "हेलिकोबेक्टर पायलोरी" के द्वारा जीर्ण संक्रमण के बीच सम्बन्ध. हालांकि बहुत कम मामलों में "हेलिकोबेक्टर" का संक्रमण जीर्णमें विकसित होता है, चूंकि यह रोगजनक बहुत आम है, यह संभवतया इस प्रकार के अधिकांश कर्कटों के लिए उत्तरदायी है।

अधि-अनुवांशिकी
लक्षण नियंत्रण
वायरस या जीवाणु का संक्रमण
गर्भाशये (इन युट्रो)