पशु टैगिंग के लिए डिज़ाइन किये गए प्रत्यारोपित किये जाने वाले RFID चिप, अब इंसानों में इस्तेमाल किये जा रहे हैं। RFID प्रत्यारोपण के साथ एक आरंभिक प्रयोग, साइबरनेटिक्स के ब्रिटिश प्रोफेसर केविन वारविक द्वारा किया गया जिन्होंने 1998 में अपने हाथ में एक चिप प्रत्यारोपित किया। 2004 में कॉनराड चेस ने बार्सिलोना और रॉटरडैम में अपने नाईट क्लब में अपने VIP ग्राहकों की पहचान के लिए जो इसका प्रयोग पेय के भुगतान के लिए करते थे, प्रत्यारोपित चिप्स की पेशकश की।

2004 में, मैक्सिकन अटार्नी जनरल के कार्यालय ने अपने स्टाफ के 18 सदस्यों में वेरीचिप प्रत्यारोपित किया ताकि एक सुरक्षित डेटा कमरे में अभिगम को नियंत्रित किया जा सके।

सुरक्षा विशेषज्ञों ने पहचान की चोरी के जोखिम के कारण लोगों के सत्यापन के लिए RFID का उपयोग करने के खिलाफ चेतावनी दी है। उदाहरण के लिए एक मध्य व्यक्ति हमला एक हमलावर को वास्तविक समय में एक व्यक्ति की पहचान चोरी करने में सक्षम बनाएगा। RFID के संसाधन कमी के कारण हमलों के ऐसे मॉडल के खिलाफ सुरक्षा वस्तुतः असंभव है, क्योंकि इसमें जटिल दूरी-बंधन प्रोटोकॉल की आवश्यकता होती है।

गोपनीयता के पैरोकारों ने प्रत्यारोपण योग्य RFID चिप के खिलाफ विरोध किया है और संभावित दुरुपयोग की चेतावनी देते हुए इस प्रकार के RFID उपकरणों को "जासूसचिप्स" कह कर इसकी निंदा की है, साथ ही सरकार द्वारा इसके इस्तेमाल से नागरिक अधिकारों की हानि हो सकती है और दुरुपयोग भी आसान हो जाएगा। ऐसे दुरुपयोग का एक मामला ट्रैकिंग उपकरण के रूप में माइक्रोचिप का दोहरा उपयोग होगा। इस तरह की चिंताएं संयुक्त राज्य अमेरिका में उचित साबित हुई जब पता चला कि CIA के कार्यक्रम COINTELPRO का उपयोग उच्च प्रोफ़ाइल राजनीतिक कार्यकर्ताओं और असंतुष्ट व्यक्तियों की गतिविधियों पर नज़र रखने के लिए किया गया। ऐसी भी संभावना है कि चिप की जानकारी, सरकारों के अलावा निजी व्यवसाय जैसे अन्य लोगों को उपलब्ध होगी, जिसके कारण नियोक्ता को कर्मचारियों की अत्यंत व्यक्तिगत जानकारी प्राप्त हो जायेगी। इसके अलावा, गोपनीयता के पैरोकार यह कहते हैं कि इस चिप में मौजूद जानकारी को आसानी से चुराया जा सकता है, इसलिए इसमें किसी भी प्रकार के निजी भंडारण से पहचान की चोरी का जोखिम रहेगा.

FDA के अनुसार, RFID चिप का प्रत्यारोपण से चिकित्सा सम्बंधित संभावित खतरे भी हैं। बिजली के खतरे, MRI असंगति, प्रतिकूल ऊतक प्रतिक्रिया और प्रत्यारोपित ट्रांसपोंडर का प्रवास, कुछ संभावित खतरे हैं जो वेरीचिप ID प्रत्यारोपण उपकरण से जुड़े हैं, खाद्य एवं औषधि प्रशासन (FDA) द्वारा जारी एक 12 अक्टूबर 2004 के पत्र के अनुसार.


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