किसी अन्य एंटीबायोटिक औषधि क़िस्मों की तुलना में फ़्लोरोक्विनोलोन के साथ गंभीर प्रतिकूल घटनाएं आम तौर पर अधिक होती हैं। अधिकांशतः प्रतिकूल प्रतिक्रियाएं मंद से मध्यम के बीच होती हैं, लेकिन कभी-कभी गंभीर प्रतिकूल प्रभाव भी हो सकते हैं। ऐसी प्रतिकूल प्रतिक्रियाओं की वजह से, असंख्य नियामक कार्रवाइयां की गई हैं, जिनमें शामिल हैं चेतावनियों का प्रकाशन पैकेज निविष्टियों में अतिरिक्त चेतावनियों और सुरक्षा सूचनाओं का समायोजन, जिनमें ब्लैक बॉक्स चेतावनियां भी सम्मिलित हैं, जिनके साथ हैं ब्लैक बॉक्स चेतावनियों को हाल ही में जोड़ने से संबंधित "प्रिय डॉक्टर पत्र". 

2004 में FDA ने अनुरोध किया कि परिधीय न्यूरोपथी (अपरिवर्तनीय तंत्रिका क्षति), कण्डरा क्षति, हृदय रोग (लंबा QT अंतराल/Torsades de pointes), कृत्रिम झिल्लीमय वृहदांत्रशोथ, रेखीपेशीलयन (पेशी क्षयकारी), स्टीवन जॉनसन सिंड्रोम, और इन प्रतिक्रियाओँ की गंभीरता में योगदान देने वाले NSAID के समवर्ती उपयोग के लिए, लिवोफ़्लॉक्सिन सहित सभी फ़्लोरोक्विनोलोन के लिए नई चेतावनी लेबल जोड़ें.

इसके बाद, 25 जून 2007 को, FDA ने निर्माता से अपेक्षा की कि वे पैकेज निविष्टियों में अतिरिक्त चेतावनी जोड़ें, जिसमें उल्लेख हो कि "लिवोफ़्लॉक्सासिन सहित क्विनोलोन का उपचार प्राप्त करने वाले मरीज़ों में, कुछ मामलों में अतिसंवेदनशीलता, तथा कुछ में अनिश्चित निदानशास्त्र के कारण, कतिपय गंभीर और कभी-कभी घातक घटनाओं की रिपोर्ट मिली है।

लिवोफ़्लॉक्सासिन चिकित्सा के परिणामस्वरूप जो गंभीर प्रतिकूल प्रभाव हो सकते हैं उनमें शामिल हैं अपरिवर्तनीय परिधीय न्यूरोपथी, सहज कंडरा विदर और कंडरा शोथ, QTc प्रवर्द्धन/torsades de pointes, विषाक्त बाह्यत्वचा संबंधी ऊतिलयन (TEN) और स्टीवेन्स-जॉनसन सिंड्रोम, बहुरूपी पर्विल, जब्ती सहित गंभीर केंद्रीय तंत्रिका प्रणाली विकार (CNS), तथा क्लॉस्ट्राइडियम डिफ़ीसाइल से जुड़े रोग (CDAD: कृत्रिम झिल्लीमय बृहदांत्रशोथ) प्रकाशसुग्राहिता/ प्रकाशविषाक्तता प्रतिक्रियाएं, घातक अल्पग्लूकोज़रक्तता, गुर्दा क्षति,
रेखीपेशीलयन (पेशी क्षयकारी) और तीवग्राहिताभ प्रतिक्रियाएं और पेशीदुर्बलता संकट.

अतिरिक्त गंभीर प्रतिकूल प्रतिक्रियाओं में शामिल हैं तीव्र अग्नाशयशोथ, स्थाई और अस्थाई दृष्टि लोप, अपरिवर्तनीय दोहरी दृष्टि,
ख़राब रंग दृष्टि, स्फोटक ज्वर, पेट दर्द, व्यग्रता, दवा बुखार, अपसंवेदन और इसिनोफ़ीलिया। लिवोफ़्लॉक्सासिन की गंभीर प्रतिकूल प्रतिक्रिया के रूप में कृत्रिमट्यूमर प्रमस्तिष्क, जो सामान्यतः अज्ञातहेतुक अंतःकपालीय उच्च रक्तचाप (IIH) के रूप में जाना जाता है, (वर्धित अंतःकपालीय दबाव के रूप में भी विख्यात), रिपोर्ट किया गया है। एक अन्य गंभीर प्रतिकूल प्रभाव है स्वरोगक्षम रक्तलायी अरक्तता.

पुराने रोगियों में, विशेष रूप से सहवर्ती कॉर्टिकोस्टेरॉयड के उपयोग के साथ, कंडरा संबंधी (फटन सहित) काफ़ी जोखिम रहता है और ऐसे रोगी QT अंतराल प्रवर्धन के प्रति अधिक रोगप्रवण होते हैं। ज्ञात प्रवर्द्धन सहित, अल्पपोटाशियमरक्तता वाले या QT अंतराल को प्रवर्द्धित करने वाली अन्य दवाओं के साथ उपचार किए जाने वाले मरीज़ों को लिवाक्विन के प्रयोग से बचना चाहिए. एकाधिक खुराकों के बाद रक्त संबंधी प्रतिक्रियाएं (कणीश्वेतकोशिकाहीनता, बिम्बाणु-अल्पता सहित) और गुर्दे की विषाक्तता हो सकती है।

बच्चे और बुजुर्गों द्वारा ऐसी प्रतिकूल प्रतिक्रियाएं अनुभव करने का ज़्यादा ख़तरा है। इस तरह की प्रतिक्रियाएं फ़्लोरोक्विनोलोन उपचार के दौरान और साथ ही, उपचार रोक दिए जाने के बाद भी प्रकट हो सकती हैं।

फ़्लोरोक्विनोलोन नेत्र चिकित्सा के साथ गंभीर दृश्य जटिलताएं भी रिपोर्ट की गई हैं, जो लिवोफ़्लॉक्सासिन आई ड्रॉप्स के साथ भी हो सकती है, विशेष रूप से नेत्रपटल वेध, साथ ही, आशयनिष्कासन और समूलनिष्कासन. नेत्रपटल वेध की घटनाओं में यह वृद्धि, पंजरीय कोलेजन में फ़्लोरोक्विनोलोन द्वारा प्रवर्तित परिवर्तनों के कारण हो सकती है, जिससे विवर्तनिक शक्ति में कमी हो जाती है। पहले देखे गए अनुसार स्थाई दोहरी दृष्टि (द्विगुणदृष्टि) भी रिपोर्ट की गई है।

कुछ समूह इन प्रतिकूल घटनाओं को "फ़्लोरोक्विनोलोन विषाक्तता" के रूप में संदर्भित करते हैं। लोगों के इन समूहों का दावा है कि फ़्लोरोक्विनोलोन के उपयोग से उन्हें अपने स्वास्थ्य के प्रति गंभीर दीर्घकालिक नुकसान उठाना पड़ा. इसके कारण फ़्लोरोक्विनोलोन के प्रयोग से हानि उठाने वाले लोगों द्वारा वर्ग कार्रवाई मुकदमा दायर किया गया और उपभोक्ता पैरवी समूह पब्लिक सिटीज़न द्वारा भी क़ानूनी कार्रवाई की गई। आंशिक रूप से इलिनॉइस राज्य और पब्लिक सिटीज़न के प्रयासों के परिणामस्वरूप FDA ने उपभोक्ताओं को फ़्लोरोक्विनोलोन का कंडराओं पर संभाव्य विषाक्त प्रभाव के बारे में सूचित करते हुए सभी फ़्लोरोक्विनोलोन पर ब्लैक बॉक्स चेतावनियों को जारी करने का आदेश दिया.

कार्रवाई तंत्र
वर्तमान मुकदमेबाज़ी
औषधबलगतिकी
प्रतिकूल प्रभाव