मजारा की स्थापना 9 वीं शताब्दी ईसा पूर्व में फीनिशियों ने मजार (द रॉक) के नाम से की थी। इसके बाद वर्ष 827 ई। में अरबों के कब्जे में आने से पहले यह यूनानियों, कार्थाजिनियों, रोमनों, वांडलों, ओस्ट्रोगोथ्स, बीजान्टिनों के नियंत्रण में रहा। अरब काल के दौरान, सिसिली को तीन अलग-अलग प्रशासनिक क्षेत्रों में विभाजित किया गया था, वैल डि नोटो, वैल डेमोन और वैल डी मजारा, जो शहर को एक महत्वपूर्ण वाणिज्यिक बंदरगाह और सीखने का केंद्र बनाते हैं। शहर का केंद्र, जिसे कसाब के नाम से जाना जाता है, अरब स्थापत्य प्रभावों को बरकरार रखता है।

1072 में, मज़ारा को नॉर्मन्स द्वारा जीत लिया गया, जिसकी अध्यक्षता रोजर प्रथम ने की । उस अवधि के दौरान, 1093 में, मजारा डेल वालो के रोमन कैथोलिक सूबा की स्थापना की गई थी।

सम्राट फ्रेडरिक द्वितीय की मृत्यु के बाद, सिसिली एंजेविंस में चली गई, उसके बाद आरागॉन के स्पैनियार्ड्स ने पीछा किया। आरागॉन अवधि (1282-1409) में माजरा के राजनीतिक, आर्थिक और जनसांख्यिकीय गिरावट की विशेषता है। यह शहर 1713 में हाउस ऑफ सवॉय के नियंत्रण में पारित हुआ, एक शासनकाल जो केवल पांच वर्षों तक चला, हैब्सबर्ग साम्राज्य (16 वर्षों के लिए) के बाद बोर्बोंस द्वारा प्रतिस्थापित किया गया। 1860 में शहर को आखिरकार गिउसेप गैरीबाल्डी और मिले ने जीत लिया, इस प्रकार इटली के तत्कालीन नवगठित साम्राज्य में शामिल हो गया।

द्वितीय विश्व युद्ध के समय तक इस शहर को माज़रा डेल वालो के नाम से जाना जाता था, जिसके बाद वर्तनी को बदलकर मजारा डेल वालो कर दिया गया।

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