1346 में, प्लेग से मरने वाले मंगोल योद्धाओं की लाशों को क्रीमिया के घेराबंद काफा (वर्तमान में थियोडोसिया) शहर की दीवारों पर फेंक दिया गया। एक लम्बी घेराबंदी के बाद, जिस दौरान जेनी बेग अधीनस्थ मंगोल सेना रोग से पीड़ित थी, उन्होंने काफा शहर के निवासियों को संक्रमित करने के उद्देश्य से संक्रमित लाशों को शहर की दीवारों पर फेंक दिया। ऐसा अनुमान है कि यूरोप में ब्लैक डेथ के आगमन के पीछे शायद उनके इसी करतूत का हाथ था।

कई अलग-अलग घातक बीमारियों के आगमन की वजह से पुरानी दुनिया के साथ संपर्क स्थापित होने के बाद मूल अमेरिकी जनसंख्या तबाह हो गई थी। हालांकि रोगाणु युद्ध का केवल एक प्रलेखित मामला सामने आया है जिसमें ब्रिटिश कमांडर जेफ्री एमहर्स्ट और स्विस-ब्रिटिश अधिकारी कर्नल हेनरी बूके शामिल थे जिनके पत्र-व्यव्हार में फ़्रांसिसी और भारतीय युद्ध के अंतिम दौर में पिट किले की घेराबंदी (1763) के दौरान होने वाले पोंटियक विद्रोह के नाम से मशहूर होने वाली एक घटना के भाग के रूप में भारतीयों को चेचक-संक्रमित कम्बल देने वाले विचार का एक सन्दर्भ शामिल था। यह अनिश्चित है कि क्या इस प्रलेखित ब्रिटिश प्रयास ने सफलतापूर्वक भारतीयों को संक्रमित किया था।
चीन-जापान युद्ध (1937-1945) के दौरान, इम्पीरियल जापानीज़ आर्मी के यूनिट 731 ने हजारों लोगों, ज्यादातर चीनियों, पर इंसानी प्रयोग किया। सैन्य अभियान में जापानी सेना ने चीनी सैनिकों और नागरिकों पर जैविक हथियारों का इस्तेमाल किया। विभिन्न ठिकानों पर प्लेग पिस्सू, संक्रमित वस्त्र और संक्रमित सामग्री युक्त बम गिराए गए। इसके परिणामस्वरूप उत्पन्न होने वाले हैजा, एंथ्रेक्स और प्लेग से लगभग 400,000 चीनी नागरिकों के मारे जाने का अनुमान था।

हथियार के रूप में इस्तेमाल किए जाने वाले रोगों में एंथ्रेक्स, ईबोला, मारबर्ग विषाणु, प्लेग, हैजा, सन्निपात, रॉकी माउन्टेन स्पॉटेड बुखार, ट्यूलेरेमिया, ब्रूसीलोसिस, क्यू बुखार, माचुपो, कॉकिडियॉड्स माइकोसिस, ग्लैंडर्स, मेलियोडोसिस, शिगेला, शुकरोग (सिटाकोसिस), जापानी बी इन्सेफेलाइटिस, रिफ्ट वैली बुखार, पीला बुखार और चेचक शामिल हैं। 

हथियार के रूप में इस्तेमाल किए जाने वाले एंथ्रेक्स के बीजाणुओं का उद्गम गलती से 1979 में स्वर्डर्लोव्स्क नामक एक सोवियत बंद शहर के पास एक सैन्य केंद्र से हुआ था। स्वर्डर्लोव्स्क एंथ्रेक्स रिसाव को कभी-कभी "जैविक चेर्नोबिल" कहा जाता है। संभवतः 1980 के दशक के अंतिम दौर में चीन के एक जैविक हथियार संयंत्र में गंभीर दुर्घटना हुई थी। सोवियत संघ का संदेह था कि 1980 के दशक के अंतिम दौर में चीनी वैज्ञानिकों द्वारा विषाणुजनित रोगों को हथियार का रूप दिए जा रहे प्रयोगशाला में एक दुर्घटना की वजह से क्षेत्र में रक्तस्रावी बुखार की दो अलग-अलग महामारियों का प्रसार हुआ था। जनवरी 2009 में, अल्जीरिया में प्लेग से अल-कायदा के एक प्रशिक्षण शिविर का सफाया हो गया जिसमें लगभग 40 इस्लामी अतिवादियों की मौत हुई थी। विशेषज्ञों ने कहा कि यह दल जैविक हथियार विकसित कर रहा था। 

चेचक (स्मॉलपॉक्स)
सन्निपात (टाइफ़स)
विषाणुजनित रक्तस्रावी बुखार
जैविक युद्ध