इस प्राधिकरण की स्थापना 28 जनवरी 2009 को एक अधिसूचना के द्वारा योजना आयोग के संबद्ध कार्यालय के रूप में 115 अधिकारियों और स्टाफ की कोर टीम के साथ की गई। अधिसूचना के अधीन 3 पद (महानिदेशक, उपमहानिदेशक, सहायक महानिदेशक) मुख्यालय हेतु एवं विशिष्ट पहचान आयुक्तों के 35 पद प्रत्येक राज्यों हेतु स्वीकृत किये गये हैं। इसके बाद यह निर्णय लिया गया कि बंगलुरु, चंडीगढ़, दिल्ली, हैदराबाद, गुवाहाटी, लखनऊ, मुम्बई एवं रांची में क्षेत्रीय कार्यालय खोले जायें। एक तकनीकी केन्द्र बंगलूरू में स्थापित किया गया।

इस प्राधिकरण के गठन के वक्त इंफोसिस के सह-संस्थापक नंदन निलेकणि को कैबिनेट मंत्री के दर्जे के साथ भारतीय विशिष्ट पहचान प्राधिकरण का अध्यक्ष बनाया गया। मार्च २०१४ में भारत के आम चुनावों में भाग लेने के लिए नंदन ने अपने पद से इस्तीफा दे दिया। इसके बाद से भारतीय प्रशासनिक सेवा के अधिकारी श्री विजय एस. मदान ने भारतीय विशिष्ट पहचान प्राधिकरण के महानिदेशक एवं मिशन निदेशक के रूप में पदभार ग्रहण किया। भारतीय राष्ट्रीय काँग्रेस के टिकट पर बैंगलोर से चुनाव लड रहे निलेकणी चुनाव में भाजपा के अनंत कुमार से हार गये।

आधार डिजिटल पहचान के रूप में
शीर्ष अनुभाग
आधार परियोजना: क्षेत्र और लाभ
स्थापना