क्लार्क के नेतृत्व में, लेवर 1999 से 2008 तक संसद में सबसे बड़ी पार्टी बनी। क्लार्क न्यूजीलैंड की प्रधान मंत्री के रूप में सेवा करने वाली दूसरी महिला बनीं, और पहली बार चुनाव में कार्यालय जीतीं। उन्होंने अपने पूरे प्रीमियर के दौरान कला, संस्कृति और विरासत मंत्री के रूप में भी काम किया। उनके पास न्यूजीलैंड सुरक्षा खुफिया सेवा (NZSIS) और मंत्रिस्तरीय सेवाओं के लिए अतिरिक्त मंत्री जिम्मेदारी थी। कार्यालय में उनकी अवधि के दौरान, महिलाओं ने न्यूजीलैंड में कई प्रमुख निर्वाचित और नियुक्त कार्यालयों का आयोजन किया, जैसे कि गवर्नर-जनरल , प्रतिनिधि सभा के अध्यक्ष और मुख्य न्यायाधीश- राज्य के प्रमुख कार्यालयों में एक साथ मार्च 2005 के बीच महिलाओं का कब्जा था। और अगस्त 2006. सरकार की एक महिला प्रमुख के रूप में, क्लार्क महिला विश्व नेताओं की परिषद की सदस्य थीं । 

मिश्रित सदस्य आनुपातिक मतदान प्रणाली को अपनाने के ठीक तीन साल बाद, क्लार्क ने कार्यालय में प्रवेश किया, जिसने बोल्गर और शिपले के नेतृत्व में एक अस्थिर राष्ट्रीय नेतृत्व वाली सरकार का निर्माण किया था। क्लार्क ने क्रमिक गठबंधन सरकारों के गठन पर बातचीत की। राजनीतिक वैज्ञानिक ब्राइस एडवर्ड्स ने क्लार्क की अपनी सबसे महत्वपूर्ण उपलब्धि के रूप में स्थिर सरकारों का नेतृत्व करने की क्षमता की पहचान करते हुए तर्क दिया कि गठबंधन सहयोगियों की एक किस्म के साथ काम करने की उनकी क्षमता - एलायंस , जिम एंडर्टन की प्रोग्रेसिव पार्टी , ग्रीन , यूनाइटेड फ्यूचर और न्यूज़ीलैंड फर्स्ट -कॉन्सेन्स्ड पब्लिक के लिए समर्थन। 

क्लार्क के विशेष हितों में सामाजिक नीति और अंतर्राष्ट्रीय मामले शामिल थे। परमाणु निरस्त्रीकरण के एक मजबूत समर्थक, क्लार्क ने प्रशांत क्षेत्र के भीतर शांति बनाने की नीति अपनाई। उसने खुद को " पारिस्थितिक रूप से न्यूजीलैंड की विशिष्ट राष्ट्रीय पहचान" के रूप में वर्णित करते हुए, न्यूजीलैंड को पहला पारिस्थितिक रूप से स्थायी राष्ट्र बनाने का कार्य निर्धारित किया। उनकी सरकार की प्रमुख नीतिगत उपलब्धियों में फैमिली पैकेज के लिए कार्य करना , न्यूनतम वेतन 5% बढ़ाना, ब्याज मुक्त छात्र ऋण, जिला स्वास्थ्य बोर्डों का निर्माण, कई कर क्रेडिटों की शुरूआत, एनसीईए की शुरुआत करके माध्यमिक विद्यालय की योग्यता को पूरा करना शामिल है। , और चौदह सप्ताह के माता-पिता की छुट्टी का परिचय। टिप्पणीकारों ने क्लार्क ( माइकल कुलेन , वित्त मंत्री के साथ ) की निरंतर और स्थिर आर्थिक विकास की अवधि की देखरेख के लिए, रोजगार में वृद्धि के साथ बेरोजगारी की दर में क्रमशः 3.6% (2005 में) के कम रिकॉर्ड स्तर पर वृद्धि की सराहना की । 

क्लार्क ने यह सुनिश्चित करने के लिए हर प्रयास किया कि राजनीति में लिंग एक मुद्दा नहीं था। हालाँकि, ब्रायस एडवर्ड्स कहते हैं कि दूसरों ने किया। क्लार्क को रक्तपात, ठंड और विनोदी के रूप में चित्रित किया गया था। क्लार्क खुद कहती हैं कि जब उनके पुरुष समकक्षों ने मीडिया में बात की, तो वे मजबूत और दृढ़ दिखे, जबकि जब उन्होंने उन्हीं विशेषताओं को चित्रित किया, तो मीडिया ने उन्हें यह देखने के लिए बनाया कि वह "कठिन" और "भद्दी" हैं। 

2006 में क्लार्क "फोर्ब्स" पत्रिका की दुनिया की 100 सबसे शक्तिशाली महिलाओं की रैंकिंग में 20 वें स्थान पर थीं । 2008 में उसने पद छोड़ दिया तब तक यह गिरकर 56 वें पर आ गया थी। 

विपक्ष के नेता
संयुक्त राष्ट्र विकास कार्यक्रम
दूसरा कार्यकाल: 2002-2005
प्रधान मंत्री (1999-2008)