वर्तमान में यांगशाओ तथा होंगशान संस्कृतियां फेंग शुई के इस्तेमाल के आरंभिक सबूत प्रदान करती हैं। चुंबकीय कम्पास का अविष्कार होने तक, मानव एवं ब्रह्मांड के परस्पर संबंधों का पता लगाने के लिए फेंग शुई विद्या निश्चित रूप से ज्योतिष विद्या पर निर्भर थी। और जब यांगशाओ तथा होंगशान संस्कृतियों का वर्तमान चीन के उत्तर पूर्वी क्षेत्र में उदय हुआ, तो वहां गैर चीनी रहते थे और अंदरूनी क्षेत्रों में रहने वाले हान चीनी उन्हें जंगली कहते थे।

4000 ई.पू. में, बैंपो (Banpo) आवास के दरवाजे ठीक शिशिर अयनांत के बाद "यिंगशी" नक्षत्र की दिशा में होते थे - जिसके कारण घरों को सौर ऊर्जा मिलती थी। झोउ युग के दौरान, "यिंगशी" को "डिंग" के नाम से जाना जाता था तथा "शीजिंग" के अनुसार, इसका प्रयोग एक मुख्य शहर के निर्माण हेतु उचित समय बताने के लिए किया जाता था। दादीवान में बाद के यांगशाओ स्थल पर (3500-3000 ई.पू. के आसपास) एक महल जैसा भवन (F901) केंद्र में स्थित है। भवन का मुख दक्षिण की ओर है और एक बड़े मैदान को घेरे हुए है। यह उत्तर-दक्षिण अक्ष पर एक अन्य भवन के साथ स्थित है जिसमें स्पष्ट रूप से साम्प्रदायिक गतिविधियां होती थीं। हो सकता है कि भवन का प्रयोग क्षेत्रीय समुदायों द्वारा किया जाता हो.

पुयांग में एक कब्र पर (4000 ई.पू. के आसपास) जिसमें चमकते हुए शीशे के टुकड़े लगे हैं - वास्तव में ड्रैगन तथा टाइगर नक्षत्रों तथा बिदोयू (Beidou) (सप्तऋषि, चमचा या टोकरी) तारों का चीनी नक्शा है - उत्तर-दक्षिण अक्ष पर स्थित है। होंगशान अनुष्ठान केंद्र तथा लुटाइगैंग की पूर्वोत्तर लोंगशान बस्ती में पुयांग मक़बरे पर बनी गोल तथा चौकोर दोनों आकृतियां इस बात का इशारा करती हैं कि चीनी समाज में "झोउ बी सुआन जिंग" के उदय से बहुत पहले ही "गेटियन" कॉस्मोग्राफी (ब्रह्मांड के रेखाचित्र) (स्वर्ग-गोल, धरती-चौकोर) मौजूद थी।

3000 ई.पू. के आसपास हानशान में खुदाई के दौरान निकाले गये एक सजावटी पत्थर पर आधुनिक फेंगशुई के उपकरणों और फ़ॉर्मूलों से आश्चर्यजनक रूप से मेल खाने वाली कॉस्मोग्राफी (ब्रह्मांड रेखाचित्र) प्राप्त हुई थी। पुरातत्ववेत्ता ली जूकिन के अनुसार इस डिजाइन का सम्बन्ध "लियुरेन" यंत्र," झिनान झेन" तथा लुओपान से है।

एर्लीटोऊ पर शानदार संरचनाओं की शुरुआत के साथ, चीन के सभी मुख्य शहरों ने अपने डिजाइन तथा लेआउट के लिए फेंग शुई के नियमों का पालन किया। झोउ युग के दौरान ये सभी नियम "काओगोंग" ; "शिल्पकला की निर्देशिका") में कूटबद्ध किये गए। भवन निर्माताओं के लिए बनाए गए नियमों को बढ़ई की निर्देश-पुस्तिका (carpenter's manual) "लू बान जिंग" (; "लू बान की पांडुलिपि") में कूटबद्ध किया गया था। पुयांग से मावांगडुई और उससे बाहर के कब्रों और मक़बरों के लिए भी फेंग शुई के नियमों का पालन किया गया। शुरूआती तथ्यों से ऐसा प्रतीत होता है कि कब्रों तथा आवासों की संरचनाओं के लिए बनाए गए नियम एक समान थे।

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