प्राचीन काल में, हमाना झील एक ताजे पानी की झील थी। हालांकि, 1498 में आये एक बड़ा भूकंप से इस क्षेत्र की स्थलाकृति बदल गई। नतीजतन, झील बाहरी मेढ़ तोड़ समुद्र से जा मिला और अब इसमें खारा पानी हैं।

इस झील का पुराना नाम तोहोत्सू-फ़ूमि (遠つ 淡海) है, जिसका अर्थ है "पास में ताजा पानी की झील" और बाद में टोकोमी (遠江) में बदल दिया गया। राजधानी कनाई से, टोटोमी अन्य प्रसिद्ध झील, चिकात्सू-एफ़ुमी (अब बिवा झील), "पास में ताजे पानी की झील" से कहीं ज्यादा दूर था। टोटोमी का नाम पूर्व प्रांत (टोटोमी प्रांत) के लिए भी इस्तेमाल किया गया था जिसमें झील स्थित है।

दूसरे विश्व युद्ध के अंत में दो प्रायोगिक 4ची-टू टैंकों को झील में फेंक दिया गया था ताकि दुश्मनों के कब्जा में ना आ जाये। हलांकि एक टैंक को अमेरिकी सेना ने झील से वापस निकाल लिया था, लेकिन दुसरे टैंक झील में ही छोड़ दिया गया था। 2013 में जापान द्वारा दूसरे टैंक का पता लगाने का प्रयास किए गए थे, लेकिन वह नहीं मिला।

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