शाहीन एयर मुख्य रूप से घरेलू और खाड़ी के देशो के लिए उड़ाने उपलब्ध कराती है. पाकिस्तान के प्रमुख शहरों जैसे कि कराची, लाहोर, इस्लामाबाद, पेशावर आदि के लिए सेवा प्रदान करने के अलावा यह दुबई, मॅनचेस्टर (यू. के..) अबू धाबी, रियाद, दोहा और मस्कट के लिए भी पाकिस्तान के सभी बड़े अंतरराष्ट्रीय हवाई अड्डों से उड़ाने संचालित करता है. 

यह पाकिस्तान के तीन भिन्न शहरों से रियाद के लिए विमान सेवा प्रदान करती है. इसने हाल ही मे दममम के लिए भी उड़ाने संचालित करनी शुरू की हैं. 

२०१५ मे यह पूर्व की ओर चीन के ग्वंगज़्यू शाहर के लिए पाकिस्तान के लाहोर से सीधी सेवा प्रदान करने वाली पहली निजी एयरलाइन्स बन गयी. हाल ही मे इसने मॅनचेस्टर और इस्लामाबाद के बीच भी उड़ान शुरू की है. थाइलॅंड, डेनमार्क, नॉर्वे, इटली और शंघाई (चीन) के लिए कई नयी उड़ाने प्रस्तावित हैं. 

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