मैकडॉनल्ड्स कई मुकदमों और अन्य कानूनी मसलों में सम्मिलित रहा है, जिनमें से ज़्यादातर ट्रेडमार्क विवाद रहे हैं। कंपनी ने कई खाद्य व्यापारों को कानूनन धमकी दी, जबतक कि उन्होंने अपने व्यापारिक नाम से "Mc" या "Mac" को हटा नहीं लिया। एक उल्लेखनीय केस में, मैकडॉनल्ड्स ने मैकडॉनल्ड नामक एक स्कॉटिश कैफे पर केस किया, यद्यपि इस प्रश्न में यह व्यापर एक शताब्दी से भी ज्यादा पीछे ले जाता है (शेरिफ कोर्ट ग्लासगो और स्त्रेथ्केल्विन, 21 नवम्बर 1952). 8 सितम्बर 2009, मलेसियन मैकडॉनल्ड्स संचालन खुद को मैककरी कहने वाले एक रेस्तरां को बंद करवाने का मुकदमा हार गया। मैकडॉनल्ड्स, मलेशिया की उच्चतम कोर्ट, द फेडेरल कोर्ट में अपनी अपील हार गया।

इसने कई मानहानि के मुकदमे भी किये हैं। उदाहरण के लिए, मैक्लिबेल केस में, मैकडॉनल्ड्स ने दो कार्यकर्ताओं पर उसके वातावरण, कार्य और स्वास्थ्य रिकॉर्ड पर आक्रमण करने वाले पत्रक बांटने के लिए मुकदमा किया था। यूके कानून के इतिहास में सबसे बड़े केस के बाद, मैकडॉनल्ड्स यह दर्शाने के लिए तकनीकी जीत जीता कि कुछ आरोप असत्य थे। मैक्लिबेल केस मैकडॉनल्ड्स के लिए एक बड़ी पब्लिक रिलेशन मुसीबत भी था, क्योंकि जज ने भी यह पाया था कि पत्रक में दी गयी आधी से ज्यादा बातें सत्य थी, जिनमें से ज़्यादातर कार्यकर्ताओं के मत थे और इसीलिए विचारनीय नहीं थे।

मैकडॉनल्ड्स ने कई मुकदमों में खुद का बचाव किया, जिसमें कार्यकर्ताओं के अधिकार भी शामिल है। 2001 में, कंपनी पर लन्दन के अपने एक रेस्तरां में गैरकानूनी रूप से रोजगार देने और बाल श्रम करवाने के लिए ब्रिटिश मजिस्ट्रेट द्वारा £12,400 का जुरमाना लगाया गया। इसे बाल श्रम की स्थिति से सम्बंधित कानून को तोड़ने के लिए किसी कंपनी पर लगाया सबसे बड़ा जुर्माना मन जाता है। अप्रैल 2007 पर्थ, पश्चिमी ऑस्ट्रेलिया में, मैकडॉनल्ड्स अपनी एक दूकान में 15 वर्ष की आयु से कम उम्र के बच्चों को रोजगार देने से सम्बंधित 5 अभियोगों में दोषी पाया गया और उसपर 8,000 ऑस्ट्रलियन डॉलर का जुर्माना लगाया गया।

संभवतः मैकडॉनल्ड्स से सम्बंधित सबसे कुख्यात कानूनी मामला 1994 का मैकडॉनल्ड्स कॉफ़ी मामले का निर्णय था।

मैकडॉनल्ड्स अमेरिकन आइडल की मूर्ति के प्रचार में, वह मूर्ति जो "न्यू वेव निगेल" का प्रतिनिधित्व कर रही थी, उसने ऐसा कुछ पहना था जो काफी हद तक डेवो के एनर्जी डोम से मिलता था, जिसे बैंड के एल्बम के कवर "फ्रीडम ऑफ़ चॉईस" पर प्रदर्शित किया गया था। मूर्ति की छवि के अतिरिक्त, यह एक ट्यून भी बजा रहा था जो डेवो के गाने "डॉक्टर डिट्रोइट" का बदला हुआ संस्करण लग रहा था। एनर्जी डोम डेवो का कॉपीराईट और ट्रेडमार्क है और उसने मैकडॉनल्ड्स के विरुद्ध कानूनी कार्यवाही की.

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