दूसरा सीज़न इस पलायन के आठ घंटे बाद आरम्भ होता है और मुख्य रूप से भगोड़ों पर ही केन्द्रित रहता है। सीरिज़ के निर्माता पॉल शिउरिंग इस द्वितीय सीज़न का वर्णन ""द फ्यूजिटिव" टाईम्स एइट" के रूप में करते हैं तथा इसे ""द ग्रेट इस्केप" " का सैकेंड हाफ कहना पसंद करते हैं। सभी भगोड़ों का अपना एक विशिष्ट उद्देश्य है इसलिए वे सभी अपने करीबी प्राधिकारियों के साथ मिलकर देश के दूसरे हिस्सों में बंट जाते हैं। ब्राड बेलिक (वेड विलियम्स) को जेल की नौकरी से निकाल दिया जाता है जहां वह एक गार्ड के तौर पर काम करता था और वह पुरस्कार राशि को प्राप्त करने के लिए कारावासियों का पीछा करता है। भगोडों में कुछ एक बड़े धन के गुप्त भण्डार की खोज में एकीकृत होते हैं जिसे बहुत पहले दूसरे कैदी द्वारा दफ्न किया गया था। संघीय अभिकर्ता एलेक्जेंडर महोने (विलियम फिचनर) को उन आठों भगोड़ों को खोज निकालने एवं बंदी बनाने के लिए नियुक्त किया गया है लेकिन यह भेद खुल जाता है कि वह "द कंपनी" के लिए काम करता है जो उन आठों की मृत्यु चाहती है। जब सारा अपने मृत पिता, गवर्नर फ्रैंक टैनक्रेडी को ढूंढ़ निकालती है तो वह माइकल से मिलती है और उनके साथ ही रहती है जबकि वे भाई वर्तमान अध्यक्ष को उसके पद से नीचे उतारने की कोशिश करते हैं जो कि कंपनी का एक सदस्य है। इन भाइयों की सुरक्षा निश्चित करने के लिए, सारा स्वयं को गिरफ्तार करवा लेती है एवं मुक़दमे का सामना करती है। मुक़दमे के दौरान, पूर्व गुप्तचर सेवा अभिकर्ता पॉल केलरमैन की घोषणा से लिंकन और सारा दोष मुक्त हो जाते हैं जो कि कंपनी नियंत्रित अध्यक्ष के लिए कार्य करता था। पलायितो में कुछ मार दिए जाते हैं या बंदी बना लिए जाते हैं, पर दोनों भाई पनामा पलायन करने में सफल हो जाते हैं। माइकल, टी बैग, महोने और बेलिक पनामनियन अधिकारियों के द्वारा गिरफ्तार कर लिए जाते हैं और पेनिटेन्शियरीया फेडेरल डी सोना में बन्दी बना दिए जाते हैं।

ऑनलाइन वितरण
सीज़न 2
अवधारणा
आभिकथित कॉपीराइट उल्लंघन