26 मार्च 1996, चेम्नित्ज़ के लिए करार करने के तुरंत बाद डेनमार्क के खिलाफ बल्लैक ने राष्ट्रीय यू21 टीम के लिए पहला मैच खेला। सभी 19 मैच उन्होंने खेला और इस पक्ष के लिए उन्होंने चार गोल किए. फिर, कैसेर्सलॉतेर्ण में चले जाने पर राष्ट्रीय कोच बर्ती वोग्त्स ने उन्हें वरिष्ठ टीम के लिए बुला लिया।

बहरहाल, बल्लैक पहली उपस्थिति 28 अप्रैल 1999 से पहले तब तक नहीं हुई, जब तक कि वे स्कॉटलैंड के खिलाफ मैच में डिटमार हमन्न के स्थान पर आए.

यूईएफए यूरो 2000 चैंपियन्स में बल्लैक केवल 63‍ मिनट खेलें. 2002 फीफा विश्व में संयुक्त राज्य अमेरिका और दक्षिण कोरिया के खिलाफ नॉकआउट के दौर के मैचों में उन्होंने गोल किया, गौरतलब है कि जर्मनी फाइनल में पहुंच गया। हालांकि, दक्षिण कोरिया के खिलाफ सेमी-फाइनल मैच के दौरान सुनियोजित फाउल के लिए उन्हें पकड़ा गया और फाइनल के लिए उन्हें निलंबित कर दिया गया, जिसमें जर्मनी 2-0 से ब्राजील से हार गया। उन्हें वर्ल्ड कप ऑल स्टार टीम में शामिल किया गया।

चैम्पियनशिप के बाद यूईएफए यूरो 2004 चैंपियनशिप के बाद राष्ट्रीय टीम के शीर्ष पर जगह रूडी वोलर की जगह जुर्गेन क्लिन्समैन को और ओलिवर क्हान की जगह बल्लैक को कप्तान बनाया गया।

कप में 2006 फीफा विश्व कप में, पिंडली में खिंचाव के कारण कोस्टा रिका के खिलाफ जर्मनी के पहले मैच में वे खेल पाने में असमर्थ थे, लेकिन बाद के पांच मैचों में उन्होंने खेला। सेमी-फाइनल में जर्मनी बाहर हो गया, लेकिन पुर्तगाल के खिलाफ मैच में तीसरा स्थान प्राप्त करने में वे कामयाब हो गए। इक्वाडोर और अर्जेंटीना के खिलाफ खेलों में उन्हें मैन ऑफ द मैच नामित किया गया, और फीफा'ज वर्ल्ड कप ऑल स्टार टीम के लिए लगातार दूसरे साल उन्हें शामिल किया गया।

चोटिल होने के बाद 6 फ़रवरी 2008 को ऑस्ट्रिया पर 3-0 के मैत्री जीत में बल्लैक ने पहला मैच खेला।

पोलैंड के खिलाफ यूईएफए यूरो 2008 चैंपियनशिप के जर्मनी के पहले खेल से बल्लैक ने शुरू किया और कप्तानी की. जर्मनी को फाइनल में पहुंचकर क्रोएशिया से हार के सदमे से उबरने के बाद मिडफील्ड में वे एक प्रभावशाली व्यक्ति साबित हुए, इसमें उन्होंने ऑस्ट्रिया के खिलाफ फ्री किक से गोल कर 1-0 से जीत दिला कर जर्मनी को सुरक्षित कर दिया और क्वार्टर फाइनल में जगह बना दी. क्वार्टर फाइनल में, पुर्तगाल के खिलाफ 60वें मिनट में बस्टियन श्चवेंस्टिगर की फ्री किक के सहयोग के बाद उन्होंने एक विवादास्पद हेडर के साथ 3-1 के स्कोर को 3-2 पर लाकर जीत दिलाया, इससे जर्मन‍ी को सेमी फाइनल में जाने में मदद मिली. सेमी-फाइनल में जर्मनी ने 3-2 से तुर्की को हरा दिया. फाइनल से पहले, बल्लैक को पिंडली में चोट लगी, लेकिन अंतत: ठीक समय पर वे इससे उबर गए। बहरहाल, जर्मनी स्पेन से 1-0 से हार गया। फिर भी, टूर्नामेंट की टीम में उन्हें नामित किया गया।

बल्लैक घमंड कर सकते हैं कि जून 2005 से पहले जब कभी उन्होंने गोल किया, जर्मनी कभी नहीं हारा. उन्होंने 2010 विश्व कप क्वालिफायर में चार गोल किए. हालांकि, एफए कप फाइनल में केविन प्रिंस बोटेंग द्वारा फाउल किए जाने से उन्हें टखने में चोट लग जाने के कारण 2010 फीफा विश्व कप उन्होंने नहीं खेला। बोटेंग जर्मनी यू21 के पूर्व खिलाड़ी हैं और मौजूदा अंतर्राष्ट्रीय खिलाड़ी जेरोम बोटेंग के सौतेले भाई हैं। विश्व कप ग्रुप स्टेज में जर्मन टीम के खिलाफ केविन-प्रिंस बोटेंग घाना के लिए खेलने गए।

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