स्टैंटन ने फिल्म के विषय का वर्णन इस प्रकार किया, "अतार्किक प्रेम से जीवन की प्रोग्रामिंग की पराजय होती है". 
मुझे यह अहसास था कि मैं इन दो क्रमादेशित रोबोटों के जरिए यह जताने की इच्छा रखता था कि वे जीवन का क्या मतलब है, इसे जानने की कोशिश करें...वे किस तरह बनाये गये हैं, इसे जाने बिना इसके विरुद्ध जाकर वे अतार्किक प्रेम में पड़ जाते हैं।..मुझे एहसास हुआ कि यह वास्तविक जीवन के लिए एक आदर्श रूपक है। हम जाने या अनजाने जीवन से बचने के लिए अपनी आदतों, अपनी दिनचर्या और अपनी लीकों में फंसे रहते हैं। गड़बड़ी वाले भाग से बचने की कोशिश करते हैं। अन्य लोगों के साथ रिश्ते बनाने से बचा करते हैं। अपने बगल के व्यक्ति से संपर्क बनाने से बचते हैं। इसी कारण हम सब अपने सेल फोन के साथ गुजारा कर सकते हैं और एक-दूसरे के साथ लेन-देन नहीं रखते. मैंने सोचा, 'यही है फिल्म के पूरे मुद्दे का एक आदर्श विस्तारण.' मैं विज्ञान के साथ इस तरह चलना चाहता था कि यह सब तार्किक रूप से उभर सके.

स्टैंटन ने ध्यान दिया कि कई टिप्पणीकारों ने मानवता के शिष्टाचार के पर्यावरणीय पहलू पर जोर दिया है, क्योंकि "वो अलगाव एक कारण बनने जा रही है, परोक्ष रूप से, जीवन में जो कुछ हो रहा है वह मानवता या ग्रह के लिए ख़राब है।" स्टैंटन ने कहा कि काम करने के प्रयास को दूर ले जाने के द्वारा, संबंधों को बनाने के प्रयास की मानवता की जरुरत को भी रोबोट दूर ले जा रहे हैं। ईसाई पत्रकार रॉड ड्रेहर ने प्रौद्योगिकी को फिल्म के एक जटिल खलनायक के रूप में देखा. "एक्सियॉम" में मनुष्य की कृत्रिम जीवन शैली उन्हें प्रकृति से अलग कर देती है, "उन्हें प्रौद्योगिकी और अपनी बुनियादी प्रवृत्ति दोनों का गुलाम बनाती है और इससे वे वो सब खो देते हैं जो उन्हें मानव बनाता है।" ड्रेहर ने यान के साफ-सुथरे चिकने रोबोटों के साथ कठोर परिश्रमी, मैले-कुचैले WALL-E की तुलना की। बहरहाल, यह रोबोट नहीं बल्कि मानव ही हैं जिन्होंने उन्हें अतिशय बनाया और अंत में आभार के दौरान मनुष्य और रोबोट को पृथ्वी के नवीनीकरण में एक दूसरे के साथ काम करते दिखाया जाता है। ""WALL-E" कोई तकनीक विरोधी फिल्म नहीं है," उन्होंने कहा. "यह तकनीक का शैतानीकरण नहीं करता है। इसका सिर्फ इतना कहना है कि मानव की सच्ची प्रकृति के विकास में प्रौद्योगिकी का उपयोग किया जाय- यह भी कि मानवता की समृद्धि में इसे अधीनस्थ होना ही चाहिए और इस दिशा में बढ़ने में मददगार होना चाहिए."

स्टैंटन, जो कि ईसाई हैं, ने EVE का नाम बाइबिल पात्र से लिया क्योंकि WALL-E का अकेलापन उन्हें उस आदम की याद दिलाता है, जिसकी पत्नी का सृजन भगवान ने बाद में किया। ड्रेहर ने EVE के बाइबिल नाम पर गौर किया और उसके निदेश को कहानी का एक व्युत्क्रम माना; EVE पौधे का इस्तेमाल करके मानवता को पृथ्वी पर लौट जाने और "झूठे भगवान" BnL से और उसकी दी सुस्त जीवन शैली से दूर हो जाने को कहती है। ड्रेहर ने इसे पारंपरिक ईसाई दृष्टिकोण से भी भटकाव माना, जहां आदम श्रम को "शाप" देता है, जबकि "WALL-E" का कहना है कि कठोर परिश्रम ही मनुष्य को मनुष्य बनाता है। ड्रेहर ने नकली भगवान को BnL के सदृश्य बताते हुए उस दृश्य का हवाला दिया जहां एक रोबोट शिशुओं को सिखाता है, "बी से बाय एन लार्ज, तुम्हारा सबसे अच्छा दोस्त", उसने इसकी तुलना मैकडॉनल्ड्स जैसे आधुनिक निगमों से की जो बच्चों में ब्रांड के प्रति वफादारी भर रहे हैं। "वर्ल्ड" पत्रिका के मेगान बाशम ने विश्राम की खोज करने के लिए फिल्म की आलोचना की, जबकि WALL-E अपने प्रबंधन कार्य में भगवान के सृजन की सच्ची सराहना करना सीखता है।

लेखन के दौरान, एक पिक्सर कर्मचारी ने जिम रियरडन को बताया कि EVE से नोआह के आर्क की कहानी के जैतून की टहनी लिए कबूतर की याद ताजा हो आती है और कहानी पर फिर से काम किया गया और EVE अपनी यात्रा से वापस मानवता की ओर लौटने के लिए एक पौधा ढूंढती है। WALL-E की खुद की तुलना प्रोमीथियस, सिसीफस, और बुटाडेस से की गयी: एक निबंध में WALL-E को खुद पिक्सर के कलात्मक प्रयास का प्रतिनिधि बताया गया, ह्रग वर्तेनियन ने एक दृश्य में WALL-E की तुलना बुटाडेस से की, जहां EVE के प्रति अपना प्रेम अभिव्यक्त करने के लिए रोबोट स्पेयर पार्ट्स से एक मूर्ति बनाता है। "अपने प्रेमी के युद्ध में जाने से पहले दीवार पर पड़ रही उसकी छाया के निशान को सुरक्षित रखने की एक कोरिंथियन अपरिणीता की लालसा से कला के जन्म से जुड़ी है प्राचीन यूनानी परंपरा. मिथक हमें याद दिलाता है कि कला का जन्म लालसा से हुआ है और अक्सर यह वाग्देवी के बजाय रचयिता का ही साधन होती है। ठीक इसी तरह स्टैंटन और उनकी पिक्सर टीम ने हमें उनके सिनेमा के प्रति प्रेम के बारे में एक बहुत ही गहरी व्यक्तिगत कहानी सुनायी है और सभी प्रकार के संबंधों के समपार्श्व के जरिए अपने एनीमेशन की दृष्टि के बारे में बताया है।"

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