स्टैनफोर्ड से जुड़े अन्य संस्थानों में शामिल हैं। SLAC नेशनल एक्सीलिरेटर लेबोरेटरी (मूलतः स्टैनफोर्ड लिनियर एक्सीलिरेटर सेंटर) और स्टैनफोर्ड रीसर्च इंस्टूट्यूट, अब एक स्वतंत्र संस्था है, स्टैनफोर्ड मानविकी केंद्र की वृद्धि में इसका उद्भव विश्वविद्यालय में हुआ था।

स्टैनफोर्ड में एक प्रमुख सार्वजनिक नीति का विचार केंद्र, हूवर इंस्टीट्यूशन ऑन वार, रेवुलुशन एंड पीस भी है जो दुनिया भर से विद्वानों को आकर्षित करता है और फ्रीमेन स्पोगली इंस्टूट्यूट फॉर इंटरनेशनल स्टडिज जो अंतर्राष्ट्रीय संबंधों के विशिष्ट अध्ययन को समर्पित है। अपने पुस्तकालयों में कोई भी प्रतिलिपि प्राप्त ना कर पाने की स्थिति में, सोवियत संघ ने हूवर इंस्टीट्यूशन से "प्रावडा" के मूल संस्करण की एक माइक्रोफिल्म मांगी (दिनांक 5 मार्च 1917).

स्टैनफोर्ड सेंटर एक गहन भाषा प्रशिक्षण संस्थान को मूलतः नेशनल ताइवान विश्वविद्यालय (NTU) में स्थापित किया गया था ताकि स्टैनफोर्ड में स्नातक छात्रों को चीनी मंदारिन में प्रशिक्षण की जरूरतों को पूरा किया जा सके. बाद में, अन्य प्रतिष्ठित विश्वविद्यालय बोर्ड में शामिल हुए और संस्थान का नाम बदल कर इंटर यूनिवर्सिटी प्रोग्राम (IUP) रखा गया.
वर्तमान में IUP, बीजिंग स्थानांतरित हो गया है, जबकि ताइपे में मूल प्रोग्राम NTU के एक संस्थान के रूप में मौजूद है और वर्तमान में अंतरराष्ट्रीय चीनी भाषा प्रोग्राम (ICLP) के रूप में जाना जाता है। 

व्यावसायिक पत्रकार के लिए जॉन एस नाइट फैलोशिप की शुरूआत स्टैनफोर्ड से हुई.

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