महत्वपूर्ण निर्मित वस्तुओं में ताड़ का तेल, मद्यकरण, वस्त्र और सीमेंट शामिल हैं। मोटरवाहन और सायकिल संकलित किये जाते हैं, और शहर में कई आरा मिल संचालित है। पेट्रोलियम उत्पाद, बाक्साइट और लोहा प्रमुख निर्यात हैं। तेल के लिए अपतटीय प्लेटफ़ॉर्म ड्रिलिंग किये गये हैं। शहर ऑटोमोटिव व्यापार के लिए एक केंद्र है, जिसमें यूरोपीय ब्रांड विशाल खुली हवा में पार्किंग स्थल से बेचे जाते हैं। 

2012 तक, गिनी की खाड़ी में समुद्री डकैती ने कोटोनौ के बंदरगाह पर व्यापार को काफी कम कर दिया था। 

मिस्सेबो क्षेत्र में, कोटोनौ अफ्रीकी प्रिंट का एक वस्त्र बाजार है जो मुख्य रूप से भारतीय थोक विक्रेताओं और खुदरा विक्रेताओं द्वारा नियंत्रित किया जाता है। 

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