21 नवम्बर 2006 को पांच सालों में पहली बार, "साइ फाइ के ईसीडब्लू" के प्रकरण पर, हार्डी और जेफ ने एक साथ प्रतिद्वन्दिता की और फुल ब्लडेड इटालियन को पराजित किया। सरवाइवर सीरीज पर हार्डी बॉयज़ ने सीएम पंक और डी जेनेरेशन X (ट्रिपल एच और शॉन माइकल) टीम डीX बनाम रेटेड-आर के ओ जिसमें (एज, रैन्डी ॲर्टन, जॉनी नाइट्रो, साथ ही मेलिना, माइक नॉक्स और ग्रेगरी हेल्म्स) एक परंपरागत सरवाइवर सीरीज में टीम के सदस्य के रूप में शामिल थे। मैच के आखिरी में ॲर्टन को निकालकर टीम DX ने विजय प्राप्त की. दिसंबर से डिसमेम्बर तक हार्डी बॉयज़ ने हर टैग टीम को खुली चुनौती दे डाली जो उनका सामना करना चाहते थे। एमएनएम उनकी चुनौती के जवाब में दिसंबर से डिसमेम्बर पर पुनः इकटठा हुए, लेकिन अंततः वो हार्डी बॉयज़ से हार गए। अर्मागेड्डों पर हार्डी और जेफ ने डब्लू डब्लू ई टैग टीम चैम्पियनशिप के लैडर मैच के लिए पॉल लंदन और ब्रायन केन्ड्रीक, एमएनएम और डेव टेलर और विलियम रीगल के खिलाफ प्रतिद्वन्दिता की लेकिन हार गए। अर्मागेड्डों 2006 पर उस जायज घटना जहां उन्होंने मर्करी के चेहरे को जख्मी कर दिया था उसके बाद ही, वह और जेफ जॉय मर्करी और जॉनी नाइट्रो के दुश्मन बन गए। इसकी वजह से उनमें दीर्घकालिक कठोर प्रतिद्वंद्विता चली और रॉयल रंबल 2007 पर हार्डी और जेफ ने एमएनएम को हरा दिया. मर्करी और हार्डी में दुश्मनी जारी रही जबतक मर्करी मार्च में डब्लू डब्लू ई से निकाल नहीं दिए गए। मर्करी के निष्कासन से पहले हार्डी ने उसे रेसलमैनिया 23 के मनी इन द बैंक लैडर मैच में अपना स्थान बनाने के लिए पराजित किया, जिसमें अन्त में जीत मि. कैनेडी की हुई. 

अगली रात को "रॉ" पर, हार्डियों ने विश्व टैग टीम चैम्पियनशिप के 10-टीम बैटल रॉयल के लिए प्रतिद्वन्दिता की.लांस केड और ट्रेवर मर्डोक को पराजित कर उन्होंने छठी बार यह खिताब जीता. केड और मर्डोक से लड़ाई समाप्त करने के बाद हार्डियों ने बैकलैश पर विश्व टैग टीम चैम्पियनशिप खिताब को पहली बार अपने लिए सुरक्षित कर लिया। इसी तरह के परिणाम जजमेंट डे पर भी आए. एक महीने के बाद, एक रात के लिए उन्होंने लैडर मैच में विश्व की सबसे बड़ी टैग टीम को हराकर खिताब जीता. उसके बाद की रात को "रॉ" पर, हार्डिज़ ने अपना खिताब केड और मर्डोक के हाथों गवां दिया, जब मर्डोक ने केड के पिनफॉल के समय जेफ को पैरों से पकड़ कर नीचे की रस्सी से बाहर की ओर धक्का दे दिया, जिसके कारण तीन ही की गिनती जारी रही. वो पर केड और मर्डोक के खिलाफ मैच को फिर से करने की मांग करने लगे, लेकिन उन्हें सफलता नहीं मिली.

वर्ल्ड रेस्लिंग एंटरटेन्मेंट में वापसी (2010)
संयुक्त राज्य और ई सी डब्लू चैंपियन (2008-2009)
हार्डी का पुनर्मिलन (2006-2007)
स्मैकडाउन! पर वापसी और प्रस्थान (2009-2010)