एक आदमी, जिसके जैक्स सोनिअर होने का पता चलता है, उसका पीछा सीलास नाम के एक रहस्यमय नकाबपोश व्यक्ति द्वारा पेरिस में लूव्र में ग्रैंड गैलरी में किया जाता है। सीलास, प्रायरी के "clef de voûte" या "कीस्टोन" के स्थान का पता मांगता है। मौत की धमकी के तहत, सौनिअर अंततः कबूल करता है कि कीस्टोन चर्च ऑफ़ सेंट सल्पाइस के भण्डार-गृह में रखा हुआ है, "गुलाब के नीचे।" सीलास उसे धन्यवाद देता है और फिर उसे पेट में गोली मार देता है।

इस बीच, अमेरिकी प्रतीक-विज्ञानी रॉबर्ट लेंग्डन (टॉम हैंक्स) से, जो पेरिस में प्रतीकों और पवित्र स्त्री पर एक AUP अतिथि व्याख्याता के रूप में गए थे, फ्रेंच पुलिस संपर्क करती है और लूव्र में अपराध स्थान का अवलोकन करने के लिए बुलाती है। वे पाते हैं कि सौनिअर ने मरते हुए हल्की काली स्याही और अपने स्वयं के शरीर और रक्त का उपयोग करते हुए जटिल रूप से कुछ प्रदर्शित करने की कोशिश की है। कप्तान बेजु फाक (जीन रेनो) उनसे उस पहेलीनुमा दृश्य की उनकी विवेचना के बारे में पूछते हैं।

सीलास, ""द टीचर" " नाम के एक रहस्यमय आदमी को बुलाता है और खुलासा करता है कि उसने कीस्टोन के सभी चार संरक्षकों को मार दिया है और यह भी कहा कि मारे गए सभी ने उसी ख़ास स्थान की पुष्टि की है। वह अपनी जांघ पर एक धातु का रोमच्छद पहनता है और हत्या के पापों के लिए एक चाबुक से खुद को कोड़े मारता है। इसके बाद सीलास, बिशप मैनुअल अरिंगारोसा द्वारा सुविधा हासिल करके सेंट-सल्पाइस जाता है और उसे एक बुजुर्ग नन द्वारा भर्ती किया जाता है; अकेले होने पर, वह चर्च की फर्श खोदता है उसे एक पत्थर मिलता है जिस पर लिखा होता है जॉब 38:11. उसका सामना नन से होता है, जो एक पंक्ति को उद्धृत करती है: "हिदर्टु शैल दाऊ कम, बट नो फर्दर" (यहां तक तुम आए हो, लेकिन इससे आगे नहीं). यह एहसास होने पर कि उसे धोखा दिया गया है, सीलास ख़फ़ा हो जाता है और नन को मार देता है।

सोफी नेवू (ऑड्रे तौटो), जो फ्रांस की पुलिस में एक कूट-विशेषज्ञ है, लूव्र में प्रवेश करता है और लेंग्डन को गुप्त रूप से एक संदेश देता है जो उसे पुरुषों के कमरे तक ले जाता है। वहां, सोफी उससे मिलती है और उसे बताती है कि उस पर नज़र रखी जा रही है, एक GPS ट्रैकिंग डॉट को (जो उसे ज्ञात नहीं) उसकी जैकेट में डाल दिया गया है और कहा कि लाश के पास मिली एक पंक्ति की वजह से वह इस हत्या के मामले में मुख्य संदिग्ध है ("पी. एस. रॉबर्ट लेंग्डन को खोजो)". सोफी हालांकि मानती है कि, सौनिअर, जो पता चलता है कि उसके दादा थे, उसे एक गुप्त संदेश देना चाहते थे और वह लेंग्डन को इस समीकरण में लाना चाहते थे ताकि वह कोड को तोड़ने में सोफी की मदद कर सके।

ट्रैकिंग उपकरण को हटाने के द्वारा प्राप्त हुए समय में वे दोनों लूव्र को खंगालना शुरू करते हैं और उन्हें सौनिअर द्वारा छोड़े गए कुछ और अनाग्राम संदेश मिलते हैं। इनमें से कई, लियोनार्डो दा विंची की कला से संबंधित होते हैं और दोनों को मैडोना ऑफ़ द रॉक्स के पीछे कुमुदिनी के फूल के साथ एक चाबी मिलती है।

फ्रांस की पुलिस द्वारा पीछा किये जाने और अमेरिकी दूतावास से कट जाने के बाद वे दोनों बच कर Bois de Boulogne जाते हैं जहां लेंग्डन उस चाबी का गहन निरीक्षण करता है। एक सिरे पर उन्हें कुछ अंकित दिखता है जो एक पता है। वह पता उन्हें ज्यूरिख के डिपॉजिटरी बैंक की तरफ निर्देशित करता है जहां उस चाबी का इस्तेमाल एक सेफ्टी बॉक्स के लिए किया जाता है।

बैंक में उन्हें सौनिअर का जमा बॉक्स मिलता है और वे उसे 10 अंको वाले फिबोनैकी संख्या के क्रम (1123581321) का उपयोग करके खोलते हैं। बॉक्स के अंदर, उन्हें शीशम का एक कंटेनर मिलता है, जिसमें एक गुप्तलेख होता है: पांच वर्णानुक्रमिक अंक पट्ट वाला एक बेलनाकार कंटेनर जिसके पांच अक्षरों वाले कूट को पढ़ने के लिए उसे सही अनुक्रम में करना आवश्यक होता है ताकि उसे फिर खोल कर उसके अन्दर रखे चर्मपत्र सन्देश को देखा जा सके। उस गुप्तलेख को जबरदस्ती खोलने पर उसके अन्दर रखी सिरका की शीशी टूट जाएगी जो चर्मपत्र को खराब करते हुए संदेश को नष्ट कर देगी.

दुर्भाग्य से, एक सुरक्षा गार्ड द्वारा पुलिस को बुला लिया जाता है और उन्हें उस जगह को छोड़ने पर मजबूर होना पड़ता है। बैंक मैनेजर, आंद्रे वेर्नेट, बच कर निकलने में उनकी सहायता करते हैं और उन्हें पुलिस द्वारा की जाने वाली नियमित जांच से बचाने के लिए एक बख़्तरबंद वैन में यात्रियों के रूप में ले जाते हैं। ट्रक के पीछे बैठे लेंग्डन और नेवू के बीच गुप्तलेख को लेकर एक लंबी चर्चा होती है और नेवू कहती है कि उसके दादा अक्सर गुप्तलेख लेकर उसके साथ खेला करते थे। लेंग्डन कहते हैं कि गुप्तलेख में बहुमूल्य जानकारी हो सकती है या जो वे खोजने की कोशिश कर रहे हैं उसके बारे में एक और सुराग हो सकता है। अंततः, वे एक जगह अचानक रुक जाते हैं और वेर्नेट उनसे बंदूक की नोक पर गुप्तलेख देने को कहता है। लेंग्डन, झांसा देकर वेर्नेट को निहत्था कर देता है और वह और सोफी गुप्तलेख के साथ वहां से बच कर भाग जाते हैं।

लेंग्डन सुझाव देता है कि उस गुप्तलेख को खोलने में मदद पाने के लिए उन लोगों को उसके मित्र, ले टीबिंग (इयान मेकेलेन) के यहां जाना चाहिए। ले टीबिंग, पवित्र ग्रेल का एक उत्साही खोजी निकलता है, जो यह मानता है कि वास्तव में, ग्रेल कोई कप नहीं है, बल्कि मेरी मेग्डेलेन है जिसे इसलिए भगा दिया गया था क्योंकि यीशु के अनुयायी, अपने नेता की हत्या के बाद एक औरत का अनुगमन नहीं करना चाहते थे। मेरी उस समय गर्भवती थी और टीबिंग, सोफी को बताता है कि यीशु के वंश की रक्षा करने के लिए एक गुप्त समाज का गठन किया गया। माना जाता है कि जैक सौनिअर इस समाज का एक हिस्सा थे और टीबिंग को संदेह है कि वह सोफी को इसमें शामिल होने के लिए प्रशिक्षण दे रहे थे। सीलास, इस बीच, टीबिंग की हवेली में घुस जाता है और गुप्तलेख को चुराने का प्रयास करता है। टीबिंग, अपनी छड़ी का उपयोग करते हुए सीलास को बेहोश कर देता है और फिर वे लोग नौकर, रेमी जीन और सीलास को लेकर वहां से बच कर निकल जाते हैं। टीबिंग के विमान से यह दल अगले सुराग का पीछा करते हुए लंदन पहुंचता है।

यह पता चलता है कि रेमी जीन भी वास्तव में द टीचर का एक अनुयायी है, मगर एक रहस्यमय आदमी द्वारा सीलास को मुक्त कराने के बाद उसे मार दिया जाता है। सीलास पर पुलिस द्वारा हमला किया जाता है और शुरू हुई गोलीबारी में वह अकस्मात बिशप मैनुअल अरिंगारोसा को गोली मार देता है। दु:ख से अभिभूत होकर सिलास, पुलिस की गोलियों से आत्महत्या में मर जाता है और अरिंगारोसा को अस्पताल ले जाया जाता है, साथ ही साथ फाक उसे धोखा देने के जुर्म में गिरफ्तार कर लेता है।

जैसे-जैसे लेंग्डन रहस्य को सुलझाने के करीब होता जाता है, उसे टीबिंग द्वारा धोखा दिया जाता है, जिसके फिर द टीचर होने का पता चलता है। टीबिंग बताता है कि वह मेरी मेग्डेलेन के अवशेष खोजना चाहता है ताकि वह साबित कर सके कि पवित्र ग्रेल के बारे में वह सही था और धमकी देता है कि अगर लेंग्डन ने कोड को नहीं खोला तो वह सोफी को गोली मार देगा। जवाब में लेंग्डन गुप्तलेख को हवा में फेंक देता है। टीबिंग उसको लपकता है, लेकिन वह ज़मीन पर गिर जाता है। सिरका की शीशी टूट जाती है और जाहिरा तौर पर दस्तावेज़ पर फैल कर उसे नष्ट कर देती है।

टीबिंग के गिरफ्तार होने के बाद, यह पता चलता है कि लेंग्डन ने कोड को सुलझा लिया है ('Apple') और उसे फेंकने से पहले गुप्तलेख से सुराग हटा दिया था। सुराग के प्रयोग से, वे स्कॉटलैंड में रौज़लिन चैपल जाते हैं जहां मेग्डेलेन के अवशेषों को पहले छिपाया गया था। वहां, वे गुप्त संगठन के अन्य सदस्यों से मिलते हैं जिसने उसकी रक्षा की थी। यह पता चलता है कि सोफी, वास्तव में मेग्डेलेन की वंशज है और इसलिए वह जीसस क्राइस्ट की वर्तमान जीवित वंशज है। वे उसे सुरक्षित रखने की कसम खाते हैं। लेंग्डन और सोफी इसके शीघ्र बाद अलग हो जाते हैं।

हजामत बनाते वक्त लेंग्डन गलती से खुद को काट लेता है और सिंक पर खून की रेखा उसे गुलाब रेखा की याद दिलाती है। वह गुलाब रेखा का अनुसरण करता है और पवित्र ग्रेल के स्थान का पता लगाता है, जो लूव्र में पिरामिड में नीचे दफ़न है। लेंग्डन फिर मेरी मेग्डेलेन की कब्र के सामने घुटने टेकता है, जैसा कि टेमप्लर नाइट्स ने उसके सामने किया था।



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