संरक्षण जीव-विज्ञानियों ने अग्रणी वैश्विक अर्थशास्त्रियों के साथ यह निर्धारित करने के लिए सहयोग शुरू किया है कि प्रकृति की संपदा और सेवाओं को कैसे मापा जाए और इन वैश्विक बाज़ार लेन-देन में इन मूल्यों को स्पष्ट किया जाए। इस लेखा प्रणाली को "प्राकृतिक पूंजी" कहा जाता है और उदाहरण के लिए, विकास हेतु रास्ता बनाने से पहले पारिस्थितिकी तंत्र का मूल्य दर्ज किया जाता है। WWF अपना "लिविंग प्लैनेट रिपोर्ट" प्रकाशित करता है और 1,686 कशेरुकी प्रजातियों (स्तनधारी, पक्षी, मछली, सरीसृप और उभयचर) की लगभग 5, 000 आबादियों की निगरानी द्वारा जैव विविधता के वैश्विक सूचकांक और जिस प्रकार शेयर बाज़ार को ट्रैक किया जाता है लगभग उसी के समान रुझान को उपलब्ध कराता है।

प्रकृति के वैश्विक आर्थिक लाभ को मापने की यह विधि जी8+5 के नेताओं और यूरोपीय आयोग द्वारा समर्थन प्राप्त है। प्रकृति विभिन्न पारिस्थितिकी-तंत्र सेवाओं को थामे रखता है जो मानवता को लाभ पहुंचाते हैं। पृथ्वी की कई पारिस्थितिकी-तंत्र सेवाएं बिना बाज़ार की सार्वजनिक वस्तुएं हैं और इसलिए कोई क़ीमत या मूल्य नहीं है। जब "शेयर बाजार" वित्तीय संकट दर्ज करता है, वॉल स्ट्रीट के व्यापारी शेयर व्यापार के व्यवसाय में नहीं हैं क्योंकि ग्रह की अधिकांश जीवित प्राकृतिक पूंजी पारिस्थितिक प्रणालियों में संग्रहित है। समाज के लिए मूल्यवान पारिस्थितिक-तंत्र सेवाओं की धारणीय आपूर्ति उपलब्ध कराने वाले समुद्री घोड़े, उभयचर, कीट और अन्य जीवों के लिए निवेश संविभाग के साथ कोई प्राकृतिक शेयर बाज़ार मौजूद नहीं है। समाज के पारिस्थितिक पदचिह्न ने ग्रह के पारिस्थितिक तंत्र की जैव-पुनर्योजी क्षमता सीमाओं को लगभग 30 प्रतिशत से पार किया है, जो कि कशेरुकी आबादी की वही प्रतिशतता है जिसने 1970 से 2005 तक गिरावट दर्ज की है।

निहित प्राकृतिक अर्थव्यवस्था मानवता को बनाए रखने में आवश्यक भूमिका निभाता है, जिसमें वैश्विक परिवेशीय रसायन, परागण फसल, कीट नियंत्रण, मिट्टी के पोषक तत्वों का आवर्तन, हमारी जल आपूर्ति का शुद्धिकरण, दवाओं की आपूर्ति और स्वास्थ्य लाभ, और जीवन सुधार की अपरिमाणित गुणवत्ता शामिल है। बाज़ार तथा प्राकृतिक पूंजी और सामाजिक आय असमानता और जैव-विविधता हानि के बीच एक रिश्ता, सह-संबंध मौजूद है। इसका मतलब यह है कि जहां संपत्ति की अधिक असमानता है, उन स्थानों में जैव-विविधता क्षति की दरें भी अधिक है।

हालांकि प्राकृतिक पूंजी की प्रत्यक्ष बाज़ार तुलना मानव मूल्यों की दृष्टि से अपर्याप्त होने की संभावना है, पारिस्थितिकी-तंत्र सेवाओं का एक माप योगदान की मात्रा को वार्षिक तौर पर अरबों डॉलरों में होने का संकेत देता है। उदाहरणार्थ, उत्तरी अमेरिका के जंगलों के एक खंड का वार्षिक मूल्य 250 बिलियन डॉलर निर्धारित किया गया है; एक और उदाहरण में, मधुमक्खी परागण से प्रति वर्ष 10 से 18 बिलियन डॉलरों के बीच मूल्य प्रदान करने का अनुमान है। न्यूजीलैंड के एक द्वीप पर पारिस्थितिकी तंत्र सेवाओं का मूल्य उस क्षेत्र के सकल घरेलू उत्पाद जितना अधिक अध्यारोपित किया गया है। मानव समाज की मांग पृथ्वी की जैव-पुनर्योजी क्षमता से अधिक होने के कारण ग्रहों की यह समृद्धि अविश्वसनीय दर पर खोती जा रही है। जबकि जैव विविधता और पारिस्थितिकी प्रणालियां लचीली हैं, उन्हें खोने का खतरा है कि मानव प्रौद्योगिकीय नवाचार के माध्यम से कई पारिस्थितिकी तंत्र के कार्यों की पुनर्रचना नहीं कर सकते हैं।
संरक्षण की परिपक्वता
आर्थिक मूल्य और प्राकृतिक पूंजी
जैव विविधता के लिए संकट
परजीवियों का जैविक संरक्षण