मौलवी का जन्म 1873 में वक्कम, चिरायंकिल तालुक, त्रावणकोर में तिरुवनंतपुरम में हुआ था। उनका जन्म एक प्रमुख मुस्लिम परिवार पुन्थरन में हुआ था, जिसमें मदुरै और हैदराबाद की पैतृक जड़ें थीं, और उनके कई पूर्वजों ने राज्य सरकार की सेना के लिए काम किया था।

उनके पिता, एक प्रमुख व्यापारी ने दूर-दराज के स्थानों से कई विद्वानों को शामिल किया, जिसमें एक यात्रा करने वाले अरब savant भी शामिल थे, जो उन्हें सीखने के लिए हर विषय सिखाते थे। मौलवी ने इतनी तेजी से प्रगति की, कि उनके कुछ शिक्षकों ने जल्द ही पाया कि उनका ज्ञान का ज्ञान समाप्त हो गया था और उनमें से कम से कम एक ने स्वीकार किया था कि वह अपने छात्र से उसे सिखा सकता था उससे ज्यादा सीख लिया था। थोड़े ही समय में, मौलवी ने अरबी, फारसी, उर्दू, तमिल, संस्कृत और अंग्रेजी समेत कई भाषाओं को सीखा था। 

1900 के दशक की शुरुआत में, मौलवी का विवाह अलियार कुंजु पुंथरन विलाकोम और पथुमा कायलपुरम की बेटी हलीमा से हुआ था। मौलवी - हलीमा जोड़े के एक बेटे अब्दुल सलाम थे। हेलिमा अपने पहले बच्चे के जन्म के तुरंत बाद ही मृत्यु हो गई। एक साल बाद, मौलवी ने आमिन उम्मल से विवाह किया। इस जोड़े के दस बच्चे थे, इसमें अब्दुल है, अब्दुल वहाब, अब्दुल क़ादर जूनियर अब्दुल हक़, ओबायदुल्ला, अमीना, याहिया, सेकेना, मोहम्मद ईजा और मोहम्मद इकबाल शामिल थे। उनके बेटे, अब्दुल सलाम, अब्दुल वहाब और मोहम्मद ईजा इस्लामिक अध्ययन के लेखकों और विद्वान थे, और अब्दुल खदर जूनियर एक लेखक, साहित्यिक आलोचक और पत्रकार थे। उनके भतीजे वाक्कोम मजीद में से एक भारतीय स्वतंत्रता सेनानी और त्रावणकोर-कोचीन राज्य विधानसभा के पूर्व सदस्य और एक अन्य भतीजे पी। हाबीब मोहम्मद, केरल के त्रावणकोर उच्च न्यायालय के पहले मुस्लिम न्यायाधीश थे। उनके शिष्यों में केरल सेठी साहिब, केरल विधानसभा के पूर्व अध्यक्ष और केरल मुस्लिमों के बीच एक सामाजिक सुधारक शामिल थे।

पत्रकारिता और स्वदेशभूमि
वाककोम मौलवी फाउंडेशन ट्रस्ट (वीएमएफटी)
सामाजिक सुधार
प्रारंभिक जीवन और परिवार