उनकी सबसे बड़ी उपलब्धि भारत में धार्मिक विज्ञान के पुनर्जागरण और मदारिस (मदरसे / स्कूलों) के लिए मार्गदर्शन सिद्धांतों के निर्माण के लिए एक शैक्षणिक आंदोलन का पुनरुद्धार था। उनके ध्यान और पर्यवेक्षण के तहत, मदरसों की स्थापना थानाभवन, गलौत्ती, केराना, दानापुर, मेरठ और मुरादाबाद जैसे क्षेत्रों में हुई थी। उनमें से अधिकतर अभी भी मौजूद हैं, उनके आसपास के क्षेत्र में शैक्षिक और धार्मिक सेवाएं प्रदान करते हैं। अपने जीवनकाल के दौरान, ईसाई धर्म भारत में बढ़ने लगा और भारत के लोगों को बदलने के लिए शानदार प्रयास किए गए। जब नैनोत्वी ने दिल्ली में अपने समय के दौरान इस स्थिति को देखा, तो उन्होंने अपने विद्यार्थियों को बाजारों में खड़े होने और ईसाई धर्म के खिलाफ उपदेश देने का आदेश दिया। एक दिन, वह खुद को अज्ञात रूप से एक सभा में भाग लिया और बाजार में ईसाई धर्म के खिलाफ व्याख्यान दिया।

राजनीतिक और क्रांतिकारी गतिविधियां
ध्रुवीय बहस
पवित्रता
इस्लामी स्कूलों की स्थापना