अधिकांश प्रमुख फ़ोटोग्राफ़ी 29 मार्च से 6 अगस्त 1971 के बीच संपन्न हुई, हालांकि पचीनो और कीटन के साथ एक दृश्य शरद ऋतु में फ़िल्माया गया - निर्माण बजट के 83 की तुलना में, उससे कुछ कम कुल 77 दिनों की शूटिंग चली.

फ़िल्म के सबसे चौंकाने वाले क्षणों में शामिल है असली घोड़े का कटा हुआ सिर. पशु अधिकार समूहों ने इस दृश्य के शामिल किए जाने का विरोध किया। कोपोला ने बाद में कहा गया कि घोड़े का सिर उन्हें एक कुत्तों के लिए खाना उपलब्ध कराने वाली कंपनी ने उन्हें दिया था; फ़िल्म के लिए एक घोड़े को विशेष रूप से नहीं मारा गया। यह दृश्य, पोर्ट वॉशिंगटन, न्यूयॉर्क में फ़िल्माया गया।

उपन्यास में, फ़िल्म निर्माता जैक वोल्ट्ज़ को, जिनके घोड़े का सिर उनके बिस्तर में डाल दिया जाता है, पीडोफ़ील के रूप में दिखाया जाता है, जब टॉम हेगन एक युवा लड़की (संभवतः वोल्ट्ज़ की बाल कलाकार) को वोल्ट्ज़ के कमरे से रोते हुए बाहर आते हुए देखता है। यह दृश्य थिएटर में रिलीज़ से काट दिया गया, लेकिन डीवीडी पर देखा जा सकता है (हालांकि फ़िल्म में वोल्ट्ज़ को लड़की के गाल पर चुंबन देते हुए देखा जा सकता है).

आंख के बीच से मो ग्रीन को गोली मारने वाला दृश्य, गैंग्स्टर बग्सी सीगल से प्रेरित था। इस प्रभाव को प्राप्त करने के लिए, अभिनेता अलेक्स रोक्को के चश्मे के फ़्रेम में दो ट्यूब छिपे थे। एक में ख़ून था और दूसरे में BB और संपीड़ित हवा थी। जब बंदूक से गोली चलाई गई, संपीड़ित हवा चश्मे के माध्यम से BB पर चली, जिससे वह अंदर से चकनाचूर हो गया। दूसरे ट्यूब ने तब खून छोड़ा.

इसी तरह का चौंकाने वाला मॅकक्लूस्की को गोली मारने का दृश्य, अभिनेता स्टर्लिंग हेडन के ऊपर नक़ली माथे के निर्माण द्वारा पूरा किया गया। बीच में एक ख़ाली जगह काटी गई, जिसमें नक़ली खून भरा गया और कृत्रिम मांस के डाट द्वारा बंद किया गया। फ़िल्माने के दौरान, डाट को मछली पकड़ने वाले कांटे से झटके से बाहर खींचा गया, जिससे हेडन के सिर में अचानक एक खूनी छेद प्रकट हो।

"द गॉडफ़ादर" का प्रारंभिक दृश्य एक लंबा, धीमे ज़ूम के साथ, डॉन कोरलियॉन के समक्ष याचना करने वाले अंडरटेकर बोनासेरा के क्लोज़-अप और पीछे की ओर से गॉडफ़ादर को फ़्रेम में दिखाते हुए समाप्त होता है। यह ज़ूम, जो लगभग तीन मिनट का है, टोनी कार्प द्वारा डिज़ाइन किए गए कंप्यूटर-नियंत्रित ज़ूम लेंस के साथ फ़िल्माया गया। यह लेंस "साइलेंट रनिंग" के निर्माण में भी इस्तेमाल किया गया था।

माइकल का मॅकक्लूस्की और सोलोज़ो के साथ ड्राइविंग दृश्य में पीछे से प्रोजेक्शन का प्रयोग, लागत के कारण टाल दिया गया। तकनीशियनों ने भ्रम पैदा करने के लिए, कार के पीछे से रोशनी को चलाया।

प्रारंभिक दृश्य में दिखाई देने वाली बिल्ली स्टूडियो के आस-पास घूमती रहती थी और उसे साज़-सामान संभालने वाले ने बस आख़िरी मिनट में ब्रैंडो की गोद में गिरा दिया था।

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कथानक