फ्रैंक कैसल शहर का सबसे ज्यादा वांछित व्यक्ति और सबसे रहस्यमय सतर्कता है, जिसे "पनिशर" कहा जाता है। उन्होंने पिछले पाँच वर्षों में १२५ अपराधियों को मार डाला है। एक पूर्व पुलिस अधिकारी के अनुसार, कैसल के परिवार की हत्या एक भीड़ में हुई थी, जिसमें कैसल भी मार चुका था। कैसल के हमले करके गुंडों को मारने के कारण, उसे पनिशर कहा जाने लगा।

पनिशर एक नाले में रहते हुए, संगठित अपराध के खिलाफ एक-एक आदमी के मारने लगता हैं, जिसमें उनका एकमात्र दोस्त शेक, एक पुराने शराबी उसका साथ देती है, जो एक पूर्व स्टेज अभिनेता भी हैं। अब कानूनी रूप से मृत घोषित, कैसल अपमी कब्र की आड़ में गुंडों को खोज कर, उन्हें मारता हैं। उनके के खिलाफ उनके युद्ध के कारण, माफिया के परिवार बहुत कमजोर हो जाती हैं। इस सब के कारण वे एक माफिया परिवार के नेता, गिएननी फ्रेंको को रिटायर होने के लिए मजबूर कर देता है।

इस समस्या से समाधान पाने के लिए फ्रेंको सभी माफिया परिवारों को एकजुट करता हैं। जिससें, एशिया की सबसे शक्तिशाली अपराधी सिंडिकेट याकाजा का भी ध्यान आकर्षित होता है। लेडी तनाका के नेतृत्व में, याकुजा माफिया परिवारों और उनके सभी हितों को खत्म करने का फैसला लेती हैं। माफिया परिवारों को खत्म करने के लिए वह उनके बच्चों का अपहरण कर लेती हैं।

अब दूसरी तरफ शेक उन बच्चों को बचाने के लिए पनिशर से प्रार्थना करता हैं, जिन्हें अरब के व्यापारियों को बेचे जाने की संभावना है। (चाहे माफिया उन्हें फिरौती दें या नहीं।) अब पनिशर याकुजा की व्यवसायों पर हमला करता है और हर एक दिन बच्चों को कैद रखने के लिए याकुजा को उसकी किमत चुकाने की चेतावनी भी देता हैं। इससे याकुजा को अपनी संपत्ति का भारी नुकसान झेलना पड़ता हैं। बाद में याकुजा पनिशर और शेक कब्जा को पकड लेती हैं और उन्हें और उन्हें यातना देने का प्रयास करती है। लेकिन पनिशर आपने आप को आजाद कर लेता हैं और वहाँ से एक बस के जरिये बच्चों को लेकर वहाँ से भाग जाता हैं। लेकिन वहाँ टॉमी फ्रेंको बच जाता हैं, जिसे पहले से ही याकुजा मुख्यालय में ले जाया गया हैं।

जब बच्चों की बस लोड हो रही है, तो पनिशर एक पुलिस के द्वारा रोडब्लॉक में चला जाता है और पकड़ा जाता हैं। अब जब पुलिस उन्हें गाडी में ले जा रही थी, कैसल अपने पुराने साझेदार के साथ फिर से मिलता है और उससे बाते करने लगता हैं। बाद में एक मोड पर फ्रैंको के आदमियों कैसल को छूड़ा लिया जाता हैं। अब वे आदमी कैसल को फ्रेंको के पास ले जाते हैं, जहाँ फ्रेंको अपने बेटे को बचाने के लिए, लाया पनिशर से प्रार्थना करता हैं और वो अपने आप को कैसल के परिवार की हत्या का दोषी भी बताता हैं। अब कैसल अपने पुराने दुश्मन के साथ मिलकर जापानी आपराधिक अंडरवर्ल्ड का अमेरिकी आधार बंद कर देता हैं।

अब फ्रेंको और पनिशर याकुजा के मुख्यालय में जाते हैं, जैसा वे लेक तनाका और उसकी बेटी समेत आदी के मारते हुए आगे बढ़ते हैं और अंत में याकुजा से लड़कर, उसे भी मार डालते हैं। अपना बेटा मिलने पर, फ्रेंको पनिशर को भी मारने की कोशिश करता हैं, लेकिन कैसल ने खुद को बचा कर फ्रेंको को ही मार डालता हैं। अब फ्रेंको का बेटे ने फिर अपने पिता की हत्या के बाद पनिशर को धमकी देता हैं। लेकिन खुद को उन्हें चोट पहुंचाने के लिए तैयार नहीं कर पाता। अब कैसल फ्रैंको के बेटे को समझता हैं कि वह अपने पिता के दुर्व्यवहारों का पालन न करके, " एक अच्छा लड़का रहें, और बड़े होकर एक अच्छा आदमी बने "। उसके बाद वे वहाँ से गायब हो जाते है। बाद में पुलिस वहाँ आती है, लेकिन उन्हें वहाँ पनिशर का कोई निशान नहीं मिलता। इस सब के बीच, कैसल दर्शकों को ये बताता हैं कि वे अंधेरे में इंतजार करेंगे और शहर में न्याय बनाए रखेगें।

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