 6 जुलाई, 1 9 74 को, हनीफ़ेन को पोप पॉल VI ने डेन्वेर के सहायक बिशप और एबरकोनिया के टाइटलर बिशप नियुक्त किया गया। उन्होंने आर्कबिशप कैसी से 20 सितंबर को अपने बिशप संस्कार को प्राप्त किया, बिशप जॉर्ज आर इवांस और चार्ल्स ए। बसवेल के सह-संस्कारकर्ता के रूप में सेवा दे रहे थे। एक सहायक बिशप के रूप में, उन्होंने 1 975 से 1 9 84 तक Archdiocese के दक्षिणी क्षेत्र के लिए बिशप के पद के रूप में सेवा की।
 1 9 78 अगस्त की पोप सम्मेलन में पोप जॉन पॉल की चुने जाने पर हनीफेन रोम में एक महीने के अध्ययन के लिए विश्राम का समय था; बाद में उन्होंने उस वर्ष के 3 सितंबर को नए पोप के उद्घाटन के मास में भाग लिया।

डेनवर
बिशप का पद
कोलोराडो स्प्रिंग्स
पुजारी