2005 के वसंत के मौसम में, बैंड ने ब्रेंडन ओ'ब्रायन के साथ स्टूडियो में वापसी की। जुलाई 2005 के अंतिम दौर में सोनी फिल्म "स्टील्थ" के साउंडट्रैक एल्बम के हिस्से के रूप में तीन नए गानों को रिलीज़ किया गया। ""मेक ए मूव" " ट्रैक को मई के अंत में रेडियो पर रिलीज़ किया गया जिसके बाद यह गाना #17 (मॉडर्न रॉक चार्ट्स) और #19 (मेनस्ट्रीम रॉक चार्ट्स) पर पहुंच गया। "मेक ए मूव" के प्रति प्रशंसकों की प्रतिक्रिया गुनगुने पानी की तरह था लेकिन अन्य दो गानों - "एडमिरेशन" और "नाइदर ऑफ़ अस कैन सी" (क्रिसी हाइंड के साथ एक युगल) को शायद बहुत ज्यादा अच्छी तरह से पसंद किया गया।

जनवरी 2006 में, बैंड ने इंटरनेट के माध्यम से इनक्यूबस के पॉडकास्टों की एक श्रृंखला में से पहले पॉडकास्ट को रिलीज़ किया। इसके अलावा, इस पॉडकास्ट में बैंड के 2005 के दक्षिण अमेरिकी दौरे के बारे में उनके विचार, उनके नए एल्बम पर कुछ जानकारी, "ड्राइव" और ट्यूपैक के "बेटर डेज़" का एक मैश-अप, साउंडगार्डन के "ब्लैक होल सन" का एक कवर और कुछ लाइव अन्तःसंगीत कार्यक्रम शामिल थे।

1 अगस्त 2006 को बैंड ने घोषणा की कि उनके छठे एल्बम, "लाइट ग्रेनेड्स", को बहुत जल्द रिलीज़ किया जाएगा और साथ में उन्होंने यह भी बताया कि इसे ब्रेंडन ओ'ब्रायन द्वारा निर्मित किया जा रहा है। कुछ सप्ताह बाद, इसे मंगलवार, 28 नवम्बर को रिलीज़ किए जाने की पुष्टि की गई। रिलीज़ होने पर "लाइट ग्रेनेड्स" ने बिलबोर्ड चार्ट्स पर #1 पर शुरुआत की, ऐसा पहली बार हुआ था जब इनक्यूबस के किसी एल्बम ने चार्टों पर सबसे ऊंचा स्थान प्राप्त किया था, जबकि इसके रिलीज़ होने के पहले सप्ताह में इसकी केवल 165,000 प्रतियों की ही बिक्री हुई थी (जो "मेक योरसेल्फ" के बाद से सबसे कम बिक्री वाला एल्बम था).

नवम्बर में, इनक्यूबस ने बर्लिन और लन्दन में दो विशेष यूरोपीय कार्यक्रमों में प्रदर्शन किया। इन दोनों स्थानों की क्षमता 2000 से भी कम थी लेकिन यह बैंड और उनके प्रशंसकों के लिए एक विशेष अवसर था (क्योंकि इनक्यूबस को मुख्यधारा में सफलता मिली थी, बैंड अब आम तौर पर दुनिया भर के बड़े-बड़े रंगमंचों में अपने कार्यक्रम प्रस्तुत करता है). बैंड ने इन कार्यक्रमों में "लाइट ग्रेनेड्स" की नई सामग्रियों का प्रदर्शन किया।

बैंड के पहले एकल, ऐना मॉली, में एक संगीत वीडियो था जिसने मुख्यधारा में सफलता हासिल की थी।

27 दिसम्बर 2006 को इनक्यूबस ने "आई डिग इनक्यूबस" प्रतियोगिता की शुरुआत की जिसमें प्रतियोगियों ने एक सम्पूर्ण संगीत वीडियो का निर्माण करने के लिए बैंड के एकल, "डिग", के प्रदर्शन की क्लिपों में कांट-छांट की। 1 फ़रवरी 2007 को "आई डिग इनक्यूबस" प्रतियोगिता के पांच अंतिम प्रतियोगियों के नाम की घोषणा की गई। "ब्लेंडर" पर एक वीडियो साक्षात्कार में, बासवादक एवं गायक बेन केनी ने कहा, "शायद ऐसा कुछ होगा जिसे करने की हमारा इच्छा है या नहीं है। लोग इन गानों के लिए अपने खुद के वीडियो बनाएंगे. यह हमारे और कलात्मक प्रशंसकों के आपस में एक दूसरे से मिलने-मिलाने का बहुत ही अच्छा तरीका है। 4 अगस्त 2007 को इनक्यूबस ने द पुलिस और बीस्टी बॉयज जैसे बैंडों के साथ बाल्टीमोर के वर्जिन फेस्टिवल की प्रथम दिवस को अपना कार्यक्रम प्रस्तुत किया।

माइकल आइन्ज़िगर कार्पल टनल सिंड्रोम से जूझ रहे थे और हालांकि उन्होंने ऑपरेशन करवा लिया था जिससे उनकी इस समस्या का समाधान हो गया था, लेकिन फिर भी उन्हें कुछ महीनों के लिए आराम करने की जरूरत थी, इसलिए हाल के दौरे की योजनाओं को स्थगित कर दिया गया था। इनक्यूबस ने प्रशंसकों से माफ़ी मांगी और गर्मियों और शरद ऋतु में अपने दौरे को जारी रखा।

फरवरी और मार्च 2008 में, इनक्यूबस ने द ऑफस्प्रिंग और एलेक्सिसनफायर के साथ ऑस्ट्रेलिया में साउंडवेव फेस्टिवल की हेडलाइनिंग और न्यूजीलैंड में एक बार फिर से अपना दौरा शुरू किया और सेल-आउट भीड़ के सामने प्रदार्शन करने के लिए एशिया का दौरा किया। सिंगापुर मेंके चंगी एयरपोर्ट में एक मीट एण्ड ग्रीट स्तर में प्रशंसकों से मुलाकात की और फोर्ट कैनिंग हिल में प्रदर्शन किया। 
अप्रैल में इनक्यूबस ने द स्मैशिंग पम्पकिंस और ड्यूरन ड्यूरन नामक बैंडों के साथ कोस्टा रिका में फेस्टिवल इम्पीरियल में और बाद में वेनेजुएला में पोलिएद्रो डी कराकास में प्रदर्शन किया।
इनक्यूबस इस गर्मियों में पूरे यूरोप में कई कार्यक्रमों में भी प्रदर्शन करेंगे जिसमें जर्मनी का रॉक ऐम रिंग फेस्टिवल और रॉक इम पार्क फेस्टिवल, ऑस्ट्रिया का नोवा रॉक फेस्टिवल, नेदरलैंड्स का पिंकपॉप फेस्टिवल और इंग्लैण्ड का डाउनलोड फेस्टिवल भी शामिल है। जुलाई 2008 में, फू फाइटर्स (Foo Fighters), पर्ल जैम (Pearl Jam) और द फ्लेमिंग लिप्स (The Flaming Lips) के साथ-साथ इनक्यूबस ने भी द हू के लिए वीएच1 (VH1) की एक श्रद्धांजलि कार्यक्रम में प्रदर्शन किया।

"मॉर्निंग व्यू" (2001-2002)
सातवां स्टूडियो एल्बम (2008-वर्तमान)
इतिहास
"लाइट ग्रेनेड्स" (2005-2008)