यह ख़बर थी कि 2006 के अंत में लोपेज़ और एंथोनी हॉलीवुड, कैलिफ़ोर्निया के चर्च आफ़ साउनटॉलोजी सेलेब्रिटी सेंटर में व्यावसायिक व्यापार बैठकों में भाग ले रहे हैं। यह भी अफवाह थी कि लोपेज़ और एंथोनी, "किंग आफ़ क्विन्स" की अभिनेत्री और साइंटॉलोजिस्ट ले रेमिनी के पति एंजेलो पागान की सहायता से उस अवधि के दौरान साइंटॉलेजिस्ट बने। उन रिपोर्टों से ठीक पहले, लोपेज़ ने NBC से कहा, "मैं एक साइंटॉलोजिस्ट नहीं हूँ, मेरा पालन-पोषण बतौर कैथोलिक हुआ था। लेकिन दिल्लगी है कि लोग ऐसी धारणा बना रहे हैं। मेरे लिए यह बहुत अजीब बात है। ये ऐसे अच्छे लोग हैं, जिनसे मैंने अपनी जिंदगी में मुलाक़ात की है।" उन्होंने कहा, "मेरे पिताजी 20 साल से साइंटॉलोजिस्ट रहे हैं। वे ऐसे बढ़िया इन्सान हैं, जिन्हें मैंने अपनी ज़िंदगी में जाना है, मुझे अजीब लगता है कि लोग इसे नकारात्मक तरीक़े से रंगना चाहते हैं।

7 नवम्बर 2007 को, "एन कनसर्टो" दौरे की अंतिम रात, लोपेज़ ने पुष्टि की कि वह अपने पति मार्क एंथोनी के साथ पहले बच्चे की उम्मीद कर रही है। घोषणा ने उनकी गर्भावस्था से संबंधित महीनों से चल रही अटकलों को बंद किया। बाद में उनके पिता ने 5 फ़रवरी 2008 को पुष्टि की कि वे जुड़वा बच्चों की उम्मीद कर रही हैं। लोपेज़ ने 22 फ़रवरी 2008 को सहोदर जुड़वां लड़की और लड़का, एम्मे मरिबेल मुनिज़ और मैक्समिलियन "मैक्स" डेविड मुनिज़ को जन्म दिया। जुड़वां बच्चों को "पीपल" पत्रिका के 11 मार्च 2008 अंक में प्रस्तुत किया गया, जिसके लिए पत्रिका ने उन्हें 6 करोड़ डॉलर का भुगतान किया।

1999-2001: "ऑन द 6" और "जे लो"
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