प्यूज़ो के उपन्यास के प्राथमिक भागों में जिसका फ़िल्म में उपयोग नहीं किया गया था, वह था वीटो कोरलियॉन की पिछली ज़िंदगी की फ़्लैश-बैक कहानी, जिसमें शामिल है अमेरिका प्रवास के हालात, उसका प्रारंभिक पारिवारिक जीवन, उसके द्वारा डॉन फ़ानुक्की की हत्या और माफिया में उसके महत्व की बढ़ोतरी, जिन सबका बाद में "गॉडफ़ादर भाग II" में इस्तेमाल किया गया।

कई उप-कथानकों की, मुद्रित पृष्ठों से परदे पर रूपांतरित करते समय छंटनी की गई:


कार्लो की मौत पर माइकल के साथ कोनी का आमना-सामना भी कुछ अलग ढंग से दर्शाया गया है। हालांकि शुरूआत में वह सन्नी की क्रूर हत्या का बदला लेने के लिए, माइकल पर अपने पति को मौत के घाट उतारने का आरोप लगाते हुए परेशान रहती है, तथापि क़िताब में कुछ दिनों बाद यह कहते हुए वह माइकल से माफ़ी मांगती है कि वह ग़लत थी, ज़ाहिरा तौर पर खुश होती है कि उसके साथ दुर्व्यवहार करने वाले कार्लो से छुटकारा मिल गया है और सन्नी का बदला लिया गया है। वह एक साल से कम समय में दुबारा शादी कर लेती है।

उपन्यास की तुलना में फ़िल्म में छोटी भूमिकाओं में शामिल हैं जॉनी फ़ॉन्टेन, लुसी मैनसिनी, रोक्को लैम्पोन और ऍल नेरी (अंतिम दो को बिना संवाद वाले किरदार बन कर रह गए हैं). डॉ॰ सेगल के अलावा फ़िल्मी रूपांतरण में हटाए गए पात्रों में शामिल हैं प्राणघातक बीमारी से ग्रस्त वीटो के सलाहकार, जेन्को अबान्डंडो (केवल उनकी चर्चा होती है, वे "द गॉडफ़ादर सागा" के एक काट दिए गए दृश्य में शामिल थे; "द गॉडफादर II" में वे पहली बार नज़र आए), पारिवारिक मित्र नीनो वैलेंटी और डॉ॰ ताज़ा सिसिली. इसके अलावा, क़िताब में माइकल और के के दो बेटे हैं, जबकि फ़िल्म में उनके एक बेटा और एक बेटी है।

सिसिली में माइकल के अंगरक्षक फ़ैब्रिज़ियो और कैलो की नियति भी उपन्यास और फ़िल्म में अलग है। फ़िल्म में उन दोनों को जीवित दिखाया गया है (वस्तुतः कैलो, तीसरी किस्त में दिखाई देता है). बहरहाल, क़िताब में यह कहा गया है कि कैलो कार विस्फोट में अपोलोनिया के साथ मर जाता है और फ़ैब्रिज़ियो को, जो बमबारी में एक सहयोगी के रूप में फंसता है, प्रसिद्ध "बपतिस्मा दृश्य" में एक और शिकार के रूप में गोली मार दी जाती है, जब पता चलता है कि वह बफ़ेलो में एक पिज़्ज़ा पार्लर चला रहा है। फ़ैब्रिज़ियो की हत्या वाला दृश्य फ़िल्म से हटा दिया गया, लेकिन प्रचार तस्वीरों में वह दृश्य मौजूद है। (बाद में उसे "द गॉडफ़ादर सागा" में एक पूरी तरह से अलग दृश्य में मार दिया जाता है, जिसे "द गॉडफादर भाग II" से हटा दिया गया।)

इस क़िताब का समापन फ़िल्म से अलग है: जहां फ़िल्म में के को अचानक पता चलता है कि माइकल "अपने परिवार की तरह" बन गया है, क़िताब में इस नाटकीयता को कम कर दिया गया है। वह माइकल को छोड़ देती है और अपने माता-पिता के साथ रहने चली जाती है। जब टॉम हेगन उसे मिलने वहां पर जाता है, तो वह अपने परिवार के राज़ उसे बताता है और उसके मुताबिक, यदि माइकल को उसके द्वारा किए गए ख़ुलासे के बारे में पता लग जाए, तो उसे मार दिया जाएगा. के एक असहज समझौते में माइकल के पास लौटती है; वह उसे चाहती है, ख़ुद को उसके काम के ब्यौरों से अलग रखती है और मां कोरलियॉन के साथ हर रोज़ कैथोलिक प्रार्थना सभाओं में शामिल होती है तथा ठीक उसी तरह माइकल की आत्मा के लिए प्रार्थना करती है, जैसे मां ने वीटो के लिए किया था।

अतिरिक्त दृश्य
उपन्यास से अंतर
रूपांतरण
कथानक