लोटस-रीनौल्ट में सेना ने अपने पहले वर्ष में इतालवी ड्राइवर इलियो डे एंजेलिस के साथ भागीदारी की। सीज़न के दूसरे दौर में, पुर्तगाली ग्रांड प्रिक्स में सेना ने अपने फॉर्मूला 1 करियर में पहली बार प्रथम पोल स्थान प्राप्त किया। इसे उन्होंने रेस में प्रथम जीत के रूप में परिवर्तित किया, जिसका आयोजन काफी नमी भरी परिस्थितियों में किया गया था और उन्होंने एक मिनट से अधिक अंतराल से मिचेल अल्बर्टो से जीत हासिल की। मध्य के समय में तीन बार पोल स्थान प्राप्त करने के बावजूद ऑस्ट्रिया ग्रांड प्रिक्स में दूसरे स्थान पर आने तक वे फिर से अंक में समापन नहीं कर सके। (मोनाको ग्रांड प्रिक्स में पोल स्थान प्राप्त करने के दृढ़ संकल्प ने अल्बोरेटो और निकी लौडा को कुपित कर दिया; सेना ने प्रारम्भ में तेज समय सेट किया और उन पर आरोप लगाया गया कि आवश्यक लैप की बजाए अतिरिक्त लैप चलाकर उन्होंने जानबूझकर अन्य ड्राइवरों के सामने रूकावट डालने की कोशिश की, एक ऐसा आरोप जिसका उन्होंने खंडन किया।) इसके बाद उन्होंने हॉलैंड और इटली में दो और पोडिएम प्राप्त किए, लेकिन उससे पहले बेल्जियम में सर्किट डे स्पा-फ्रैंकोरचैंप्स में उन्होंने अपने करियर की दूसरी जीत हासिल की और इस बार भी यह नम परिस्थितियों में थी। उस सीज़न के दौरान डी एंजिलेस और सेना के रिश्ते में कटुता आ गई, क्योंकि दोनों ही ड्राइवरों की लोटस में शीर्ष चालक स्तर की मांग थी और टीम में छह साल बिताने के बाद डी एंजिलेस वर्ष के अंत में ब्राभम के लिए रवाना हुए, क्योंकि उन्हें यह दृढ़ विश्वास हो गया था कि लोटस का ध्यान अब केवल ब्राजिलियन पर केंद्रित हो चुका है। सेना और डी एंजिलेस ने उस सीजन के ड्राइवर रैंकिंग में क्रमशः चौथे और पांचवें स्थान पर समाप्ति की, दोनों में पांच अंकों की दूरी थी। योग्यता के मामले में, हालांकि सेना ने खुद को क्षेत्र में सबसे तेज के रूप में स्थापित करना शुरू किया: उस सीज़न में उनके सात पोल की संख्या अन्य ड्राइवरों से कहीं अधिक थी।

सेना ने डेरेक वार्विक को टीम में शामिल करने से इनकार कर दिया और कहा कि लोटस एक ही समय दो शीर्ष ड्राइवरों के लिए प्रतिस्पर्धी कारों को चलाने में सक्षम नहीं है, जिसके बाद लोटस में डी एंजिलेस के स्थान पर स्कॉटिश साथी जॉनी डमफ्राइज को शामिल किया गया। हालांकि सेना ने बाद में यह माना कि "यह गलत था, बहुत गलत. उस समय तक डेरेक के साथ मेरे संबंध अच्छे थे।" सेना ने सीज़न की शुरूआत अच्छी की, ब्राजील में वे दूसरे स्थान पर आए और निगेल मानसेल से केवल 0.014s द्वारा स्पेनिश ग्रांड प्रिक्स के विजेता बने - जो कि फार्मूला वन के इतिहास में सबसे करीबी समाप्ति थी - और दो रेस के बाद उन्होंने अपने आप को विश्व चैंपियंस में सबसे अग्रणी पाया। हालांकि, खास तौर पर सीज़न के दूसरे चरण में खराब विश्वसनीयता के चलते, वे विलियम्स के मानसेल और पिकेट की जोड़ी के आलावा अंतिम रूप से चैंपियन रहे अलेन प्रोस्ट से पीछे रह गए। बहरहाल, आठ पोल के साथ सेना एक बार फिर शीर्ष क्वालीफायर रहे और छह पोडियम के साथ सीज़न को समाप्त किया, जिसमें डेट्रोएट ग्रांड प्रिक्स में एक और जीत शामिल है और 55 अंक के साथ उन्होंने ड्राइवर तालिका में चौथे स्थान पर सीज़न को समाप्त किया।

1987 में लोटस ने एक नए इंजन का सौदा किया और वही होंडा इंजन का इस्तेमाल किया जो विलियम्स ने पिछले वर्ष कंसट्रक्टर्स चैंपियनशिप जीतने के लिए किया था और उसके साथ टीम में एक नए साथी को शामिल किया, जो कि 34 वर्षीय जापानी ड्राइवर सटोरो निकाजिमा था। इस सीज़न की शुरूआत में सेना का प्रदर्शन मिला-जुला रहा; स्पा-फ्रैंकरचैंप्स की अगली रेस में सैन मरीनो ग्रांड प्रिक्स पर एक पोडिएम विवादों से ग्रस्त रहा, जहां सेना की भीड़न्त मानसेल से हुई और बाद में उनका सामना पिट में गर्माए अग्रेजों से हुआ। उसके बाद सेना ने एक क्रम में दो रेस जीती: आगामी मोनाको ग्रांड प्रिक्स में (उस प्रदेश में रिकॉर्ड छः जीत में पहली) और डेट्रोएट ग्रांड प्रिक्स में, विश्व चैंपियनसिप में लीड लेने के लिए मिचिगन स्ट्रीट सर्किट में दो वर्षों में उनकी दूसरी जीत थी। जैसे-जैसे चैम्पियनशिप आगे बढ़ती गई, यह स्पष्ट हो गया कि विलियम्स की कारें फील्ड पर लाभ की स्थति में हैं, होंडा-इंजन टीमों के बीच अंतर ब्रिटिश ग्रांड प्रिक्स में सर्वाधिक स्पष्ट हो गया जहां मेंसल और पिकेट ने सेना और नाकाजिमा के लोटस को पीछे कर दिया। सेना, लोटस पर अपने मौके से काफी असंतुष्ट हो गए और मोन्ज़ा में यह घोषणा की गई कि वर्ष 1998 के लिए वे मैकलेरन से जुड़ेंगे. सेना ने काफी मज़बूती के साथ सीज़न को समाप्त किया और जापान और ऑस्ट्रेलिया में आयोजित अंतिम दो रेसों में वे दूसरे स्थान पर रहे, हालांकि रेस के बाद वाले परिक्षण में पाया गया कि अंतिम रेस में उनके लोटस की ब्रेक नलिकाएं नियम के विरुद्ध काफी चौड़ी थी और उन्हें अयोग्य करार दिया गया, जिसके चलते लोटस के साथ उनका अंतिम और सबसे सफल सीज़न कड़वाहट के साथ समाप्त हुआ। अंतिम रूप से सेना, 57 अंकों, एक पोल स्थान और छह पोडिएम समाप्ति के साथ तीसरे स्थान पर रहे। यह सीज़न सेना के करियर में एक मोड़ लेकर आया, क्योंकि पूरे साल भर उन्होंने होंडा के साथ एक गहरे रिश्ते का निर्माण किया, एक ऐसा रिश्ता जिसने उनको एक बड़ा लाभांश प्रदान किया, क्योंकि मैकलेरन ने वर्ष 1988 के लिए विलियम्स के होंडा की V6 टर्बो इंजन आरक्षित कर ली थी।


प्रारम्भिक करियर
1985-1987: लोटस
मृत्यु
1984: टोलमैन