सामुराई वर्ग द्वारा शासित लंबी सामंती अवधि में, कुछ तरीके जो योद्धाओं को प्रशिक्षित करने के लिए उपयोग किए जाते थे, उन्हें आधुनिक काल में सुव्यवस्थित मार्शल आर्ट के रूप में विकसित किया गया था, जिसे सामूहिक रूप से कोरियो कहा जाता था। उदाहरणों में शामिल हैं केनजुटसू , केन्डो, कीउदो , सोजऊतसू , जूजूत्सू, और सूमो, जो सभी में स्थापित किए गए थे ईदो अवधि । मीजी बहाली में तेजी से सामाजिक बदलाव के बाद, कुछ मार्शल आर्ट आधुनिक खेलों में बदल गए, जिसे गेंदाई बुड कहा जाता है। जूडो का विकास कानो ज़िगोरो द्वारा किया गया था, जिन्होंने जुजुत्सु के कुछ संप्रदायों का अध्ययन किया था। वर्तमान जापान और अन्य देशों में ये खेल अभी भी व्यापक रूप से प्रचलित हैं। बेसबॉल, एसोसिएशन फुटबॉल और अन्य लोकप्रिय पश्चिमी खेल मीजी अवधि में जापान में आयात किए गए थे। ये खेल आमतौर पर स्कूलों में पारंपरिक मार्शल आर्ट के साथ अभ्यास किया जाता है। बेसबॉल, फुटबॉल, फुटबॉल और पिंग पोंग जापान में सबसे लोकप्रिय खेल हैं। 1991 में जे लीग ( जापान प्रोफेशनल फुटबॉल लीग ) की स्थापना के बाद एसोसिएशन फुटबॉल को जापान में प्रमुखता मिली। जापान ने 2002 फीफा विश्व कप की सह-मेजबानी भी की। इसके अलावा, कई अर्ध-पेशेवर संगठन हैं, जो निजी कंपनियों द्वारा प्रायोजित हैं: उदाहरण के लिए, वॉलीबॉल, बास्केटबॉल, रग्बी यूनियन, टेबल टेनिस, और इसी तरह। 

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