अपने इनवेलप प्रोटिनों में मौजूद एंटिजेनिक इपिटॉप्स के आधार पर वायरस चार प्रमुख सेरोटाइप्स में और जिनॉम के संपूर्ण न्युक्लियोटाइड्स क्रम परिवर्तन के अनुसार आठ जीनोटाइप्स (A-H) में विभाजित किए जाते हैं। जीनोटाइप्स के पास एक विशिष्ट भौगोलिक वितरण होता है और इनका उपयोग वायरस की पहचान, विकास और संचरण में किया जाता है। जीनोटाइप के बीच अन्तर रोग की गंभीरता, कोर्स तथा जटिलताओं की समभावना, तथा उपचार के प्रभाव और संभवत: टीकाकरण को प्रभावित करता है।

जीनोटाइप अपने अनुक्रम के कम से कम 8% से अलग होता है और असकी प्रथम सूचना 1988 में मिलि जब छवों को व्याख्यायित किया गया (A-F). दो बाद के प्रकारों को अब तक व्याख्यायित किया गया है (G और H). विशिष्ट गुणों के साथ अधिकतर जेनोटाइप्स सबजेनोटाइप्स में विभाजित किए जाते हैं।

जीनोटाइप अधिकतर प्राय: अमेरिका, अफ्रीका, भारत और पश्चिमी यूरोप में पाया जाता है। जीनोटाइप बी अधिकतर प्राय: एशिया और संयुक्त राज्य अमेरिका में पाया जाता है। जीनोटाइप B1 जापान में हावी है, बी2 चीन और वियतनाम में जबकि बी3 इंडोनेशिया में सीमित है। B4 वियतनाम तक ही सीमित है। ये सभी उपभेद सेरोटाइप ayw1 को निर्दिष्ट करते हैं। B5 फिलीपींस में सबसे आम है। जीनोटाइप सी एशिया में और संयुक्त राज्य अमेरिका में सबसे आम है। सबजेनोटाइप C1 जापान, कोरिया और चीन में आम है। C2 चीन, दक्षिण पूर्व एशिया और बांग्लादेश में आम है और C3 ओशिनिया में. ये सभी उपभेद सेरोटाइप adrq को निर्दिष्ट करते हैं। C4 को निर्दिष्ट करने वाला ayw3 ऑस्ट्रेलिया के आदिवासियों में पाया जाता है। जीनोटाइप डी सबसे आम रूप में दक्षिणी यूरोप, भारत और संयुक्त राज्य अमेरिका में पाया जाता है और 8 उपप्रकारों (D1-D8) में विभाजित किया गया है। तुर्की में जीनोटाइप डी भी सबसे आम प्रकार है। D1-D4 के बारे में परिभाषित भौगोलिक वितरण का तरीका कम स्पष्ट है जहाँ ये सबजिनोटाइप्स व्यापक रूप से यूरोप, अफ्रीका और एशिया के भीतर फैले हुए हैं। यह जिनोटाइप्स बी और सी की तुलना में पहले घटित उनके अन्तर के कारण हो सकता है। D4 सबसे पुराना विभाजन हो गया लगता है और अभी भी ओशिनिया में डी के सबजिनोटाइप्स पर हावी है। ई प्रकार सबसे आम रूप में पश्चिम और दक्षिणी अफ्रीका में पाया जाता है। प्रकार एफ सबसे आम रूप में मध्य और दक्षिण अमेरिका में पाया जाता है और दो उपसमूहों (F1 और F2) में विभाजित किया गया है। जीनोटाइप जी कोर जीन में 36 न्युक्लियोटाइड्स की एक प्रविष्टि है और फ्रांस और संयुक्त राज्य अमेरिका में पाया जाता है।प्रकार एच सबसे आम रूप में संयुक्त राज्य अमेरिका के मध्य और दक्षिण अमेरिका और कैलिफोर्निया में पाया जाता है। अफ्रीका में पांच जीनोटाइप्स (A-E) हैं। इनमें से प्रभावी जीनोटाइप हैं केन्या में ए, मिस्र में डी एवं बी, ट्यूनीशिया में डी, नाइजीरिया में दक्षिण अफ्रीका में ए-डी. जीनोटाइप एच संभवत: नई दुनिया के भीतर जिनोटाइप एफ से अलग हो गया.

सेरोटाइप्स और जीनोटाइप्स
वाइरोलोजी
निदान
जानपदिक रोग विज्ञान (एपिडेमियोलॉजी)