प्रोटेस्टेंट धर्म की प्रगति को अवरूद्ध करने के लिए इन्क्वीजिशन नामक धार्मिक न्यायालय विभिन्न देशों में स्थापित किये गये। इनकी स्थापना और गतिविधियों में जेसुइट पादरियों और धर्माधिकारियों का सबसे अधिक हाथ रहा। 

इस विशिष्ट धार्मिक न्यायालय को 1552 ई. में पोप पॉल तृतीय ने रोम में पुनर्जीवित किया। यह न्यायालय सर्वोच्च अधिकारों युक्त था। नास्तिकों को ढूँढ निकालने, उनको कठोरतम दंड देने, केथोलिक चर्च के सिद्धांतों को बलपूर्वक लागू करने, केथोलिक धर्म के विरोधियों को निर्ममता से कुचलने के लिए, दूसरे देशों से धर्म के मुकदमों में अपीलें सुनने आदि के कार्य यह न्यायालय करता था। प्रोटेस्टेंटों के विरूद्ध इस न्यायालय ने कठोरतम उपाय किये। इस न्यायालय में बड़ी संख्या में मृत्यु दण्ड और जीवित जला देने की सजाएँ भी दीं। इससे कालांतर में यह न्यायालय कुख्यात हो गया।

इन्क्वीजिशन (धार्मिक न्यायालय)
धर्म-सुधार-विरोधी आंदोलन के प्रयास और साधन
ट्रेन्ट की धर्म सभाएँ (1545 ई-1565 ई)
जीसस संघ के कार्य और उपलब्धियाँ