एचबीवी का जीनोम चक्रीय डीएनए से बना होता है, लेकिन यह आसमान्य है क्योंकि डीएनए पूरी तरह से दुगुना-भूग्रस्त नहीं होता. पूर्ण धंसी हुई लंबाई का एक अन्तिम भाग वायरल डीएनए पोलीमरेज से जुड़ा होता है। जीनोम 3020-3320 न्युक्लियोटाइड्स लंबा (पूर्ण लंबाई भूग्रस्त) और 1700-2800 न्युक्लियोटाइड्स लंबा (कम लंबाई भूग्रस्त के लिए) होता है। नकारात्मक भावना, (नॉन-कोडिंग), वायरल mRNA का पूरक होता है। केन्द्रक में कोशिका के संक्रमण के तुरंत बाद ही वायरल डीएनए पाया जाता है। आंशिक रूप से दुगना-भूग्रस्त डीएनए (+) सेन्स स्ट्रैंड के पूरा होने और (-) सेन्स स्ट्रैंड से प्रोटीन मॉलिकुल को हटाने तथा (+) सेन्स स्ट्रैंड से आरएनए के एक लघु क्रम के द्वारा समतल किया जाता है। गैर-कोडिंग आधारों को (-) सेन्स स्ट्रैंड के छोर से हटाया जाता है और छोर को दुबारा जोड़ा जाता है। जिनॉम द्वारा कोडित किए गए सी, एक्स, पी, तथा एस नामक चार ज्ञात जीन हैं। कोर प्रोटीन जीन सी (HBeAg) द्वारा कोडित किये जाते हैं और इनका शुरूआती कोडोन एक ऊर्ध्वप्रवाह इन-फ्रेम AUG शुरूआती कोडोन के बाद होता है, जिससे प्री-कोर प्रोटीन पैदा किए जाते हैं। HBeAg प्री-कोर प्रोटीन के प्रोटियोलिटिक प्रक्रिया द्वारा पैदा किए जाते हैं। डीएनए पोलीमरेज़ को जीन P द्वारा कोडित किया जाता है। जीन S ऐसे जीन हैं जो सतह एंटिजेन (HBsAg) के लिए कोड करते हैं। HBsAg जीन एक लंबी खुली रिडिंग फ्रेम हैं लेकिन उनमें तीन इनफ्रेम "स्टार्ट" होते हैं जो जीन को तीन वर्गों में विभाजित करते हैं, प्री-S1, प्री-S2 और S. विविध स्टार्ट कोडोन्स के कारण दीर्घ, मध्यम और लघु (प्री-S1+ प्री-S2+S, प्री-S2+S या S) नामक तीन भिन्न आकार के पॉलिपेप्टाइड्स पैदा होते हैं। जीन एक्स द्वारा कोडित प्रोटीन का कार्य पूरी तरह से ज्ञात नहीं है, लेकिन यह लीवर कैंसर के विकास से जुड़ा होता है। यह जीनों को उत्तेजित करता है जो कोशिका की वृद्धि को बढ़ावा देते हैं और विकास का विनियमन करने वाले अणुओं को निष्क्रिय कर देते हैं।

जीनोम
इतिहास
जानपदिक रोग विज्ञान (एपिडेमियोलॉजी)
रोकथाम