सामान्य जनसंख्या का लगभग तीन प्रतिशत भाग हाइपोथायरायडिज्म से पीड़ित है। कुछ कारक जैसे आयोडीन की कमी या आयोडीन-131 के संपर्क में आने से इसका ख़तरा बढ़ जाता है। 

हाइपोथायरायडिज्म के कई कारण हैं। इतिहास में और वर्तमान में कई विकसित देशों में, आयोडीन की कमी दुनिया भर में हाइपोथायरायडिज्म का सबसे आम कारण है। जिन व्यक्तियों में आयोडीन पर्याप्त मात्रा में होता है, उनमें हाइपोथायरायडिज्म अधिकतर हाशिमोटो थायरोडिटिस के कारण होता है, या थायरॉयड ग्रंथि की कमी के कारण या हाइपोथेलेमस या पीयूष ग्रंथि में से किसी एक के हॉर्मोन की कमी के कारण होता है।
हाइपोथायरायडिज्म प्रसव पश्चात थायरोडिटिस (postpartum thyroiditis) के परिणामस्वरूप भी हो सकता है, यह एक ऐसी स्थिति है जो लगभग 5% महिलाओं को बच्चे को जन्म देने के बाद एक वर्ष के भीतर प्रभावित करती है।

पहली प्रावस्था प्रारूपिक रूप से हाइपोथायरायडिज्म होती है। इसके बाद या तो थायरॉयड अपनी सामान्य अवस्था में लौट जाती है या महिला में हाइपोथायरायडिज्म विकसित हो जाता है। वे महिलाएं जिनमें प्रसव पश्चात थायरोडिटिस से सम्बंधित हाइपोथायरायडिज्म होता है, ऐसी महिलाओं में प्रत्येक पांच में से एक महिला स्थायी रूप से हाइपोथायरायडिज्म का शिकार हो जाती है जिसे जिन्दगी भर इसके उपचार की जरुरत होती है। 

हाइपोथायरायडिज्म कभी कभी आनुवंशिकी के परिणामस्वरूप भी होता है, कभी कभी यह अलिंग गुणसूत्र (autosomal) पर अप्रभावी लक्षण (recessive) के रूप में उपस्थित होता है। 

हाइपोथायरायडिज्म पालतू कुत्तों में एक अधिक सामान्य यौन रोग है, कुछ विशिष्ट नस्लों में इसकी निश्चित पूर्व प्रवृति पायी जाती है।

अस्थायी हाइपोथायरायडिज्म वोल्फ-शैकोफ़ प्रभाव (Wolff-Chaikoff effect) के कारण हो सकता है। आयोडीन की बहुत उच्च मात्रा का उपयोग अस्थायी रूप से हाइपोथायरायडिज्म के इलाज के लिए किया जा सकता है, विशेष रूप से ऐसा आपातकालीन स्थिति में किया जाता है। 

हालांकि आयोडीन थायरॉयड होरमोन के लिए एक सबस्ट्रेट है, इसके उच्च स्तर थायरॉयड ग्रंथि को भोजन के साथ कम मात्रा में आयोडीन लेने के संकेत देते हैं, जिससे हॉर्मोन का उत्पादन कम हो जाता है। 

हाइपोथायरायडिज्म को अक्सर इसकी उत्पत्ति के अंग के द्वारा वर्गीकृत किया जाता है:

सामान्य मनोवैज्ञानिक संघ (General psychological associations)
उपनैदानिक हाइपोथायरायडिज्म
लक्षण
कारण