क्लब के सदस्यों ने 1990 के दशक के बाद से हमेशा महिलाओं की सदस्यता से इनकार किया है, क्योंकि इसके लिए आवश्यक दो तिहाई मतदान कभी भी नहीं किया गया। सितम्बर 1998 में महिला सदस्यता को 70 प्रतिशत बहुमत मिला, जिससे 212 वर्षों की पुरुष विशिष्टता का अंत हुआ। इस समय तक क्लब की सरंक्षक के रूप में क्वीन एक मात्र महिला थीं (घरेलू स्टाफ के अलावा) जिन्हें खेल के दौरान पेविलियन में प्रवेश करने की अनुमती दी गयी। बाद में पांच महिलाओं को खिलाडी सदस्यों के रूप में शामिल होने के लिए आमंत्रित किया गया।

अगला विवाद 2005 में हुआ जब इंग्लैण्ड और वेल्स क्रिकेट बोर्ड का पक्ष लेने के लिए क्लब की आलोचना की गयी (इसके कुछ अपने सदस्यों सहित). जबकि क्लब ने टेस्ट क्रिकेट के ब्रिटिश स्काई प्रसारण के फैसले का पक्ष नहीं लिया। उस समय के एमसीसी के सचिव और प्रमुख कार्यकारी रोजर नाईट ने ECB के बोर्ड पर क्लब का प्रतिनिधित्व किया और वे इस विवादास्पद और आलोचनात्मक फैसले के पक्ष में थे।

एक और विवाद में शामिल था कि एमसीसी ने सदस्यों तथा दर्शकों को सभी मैचों में ग्राउंड पर सीमित मात्रा में एल्कोहल युत पेय पदार्थ लाने की अनुमति देने का फैसला किया था। इस फैसले ने आईसीसी को चुनौती दी, जो दुनिया भर में सभी अंतर्राष्ट्रीय मैचों में इस प्रथा को पूरी तरह से प्रतिबंधित करने का प्रयास कर रहा था। एमसीसी साल में एक बार आईसीसी को लिखता है कि लोर्ड क्रिकेट ग्राउंड में एल्कोहल लाने के लिए दर्शकों तथा सदस्यों को अनुमति दी जाये. किसी अन्य ग्राउंड प्राधिकरण को कभी इस बात की जरुरत महसूस नहीं हुई कि क्रिकेट के मैदान में वे दर्शकों और सदस्यों के लिए एल्कोहल लाने के लिए आईसीसी से अनुमति की मांग करें. या खुद वहां एल्कोहल पेय बेचकर धन कमायें. 

इस विरासत को देखते हुए एमसीसी ने इंग्लिश क्रिकेट के प्रशासन में हिस्सा लेना जारी रखा और 2010 में लोर्ड'स को पकिस्तान के लिए एक "घरेलू" टेस्ट मैच के लिए प्राकृतिक स्थान के रूप में प्रस्तुत किया गया, यह मैच आईसीसी के द्वारा निर्धारित किया गया था जो ऑस्ट्रेलिया के साथ होने वाला था; हालांकि इस खेल का परिवाम विवादास्पद साबित हुआ, आतंकवाद से त्रस्त पाकिस्तान के लिए यह अंतर्राष्ट्रीय क्रिकेट का वह क्षेत्र था जहां उसे जाने की अनुमति नहीं थी। फिर भी वह इस अंतर्राष्ट्रीय क्रिकेट फोल्ड में बना रहा. क्लब के सचिव और प्रमुख कार्यकारी का इंग्लैण्ड और वेल्स क्रिकेट बोर्ड के प्रशासन बोर्ड पर एक स्थान है और यह कहा गया है कि कीथ ब्रेड्षा (वर्तमान सचिव और प्रमुख कार्यकारी) अप्रैल 2007 में इंग्लैण्ड कोच डंकन फ्लेचर के कार्यालय से हटाने में प्रभावी हो सकता है।

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