इसका और साथ के अन्य द्वीप देशों का नाम भारत के पुराणों में "दीपान्तर" भारत (अर्थात सागर पार भारत) है। यूरोप के लेखकों ने १५० वर्ष पूर्व इसे "इंडोनेशिया" ("इंद"= भारत + "नेसोस" = "द्वीप" के लिये) दिया और यह धीरे धीरे लोकप्रिय हो गया। की हजर देवान्तर‎ पहला देशी था जिसने अपने राष्ट्र के लिये इंडोनेशिया नाम का प्रयोग किया। कावी भाषा में लिखा भिन्नेक तुंग्गल इक ("भिन्नता में एकत्व") देश का आदर्श वाक्य है। "दीपान्तर" नाम अभी भी प्रचलित है इंडोनेशिया अथवा जावा भाषा के शब्द नुसान्तर में। इस शब्द से लोग बृहद इंदोनेशिया समझते हैं।

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