माराडोना की कप्तानी में अर्जेन्टीना की राष्ट्रीय टीम ने, मेक्सिको में खेले गए निर्णायक मैच में पश्चिम जर्मनी को हरा कर 1986 के FIFA विश्वकप में जीत हासिल किया। 1986 के विश्व कप के दौरान माराडोना ने अपने वर्चस्व को कायम रखा और वे टूर्नामेंट के सबसे सक्रिय खिलाड़ी थे। उन्होंने अर्जेन्टीना गेम के हर क्षण को खेला, 5 गोल दागे और 5 में सहायता की। यद्यपि, उनकी ख्याति को पुख्ता करने वाले वे दो गोल थे जो उन्होंने इंग्लैंड के खिलाफ 2-1 से जीते गए क्वार्टर फाइनल मैच के दौरान किए। 

विशेषकर यह मैच अर्जेन्टीना और ग्रेट ब्रिटेन के यूनाइटेड किंगडम और उत्तरी आयरलैंड (इंग्लैंड जिसका एक हिस्सा है) के मध्य चल रही फाल्कलैंड्स युद्ध के दौरान खेली गई और इससे जुड़ी भावनाएं मैच के दौरान भी वातावरण में देखी गई। रिप्ले से पता चला कि उसका पहला गोल हाथ से गेंद को मार कर किया गया था। मैराडोना शर्मीले कपटपूर्ण थे, उन्होंने उसकी व्याख्या "मैराडोना के सर से थोड़ा और थोड़ा भगवान के हाथों से" के रूप में की। यह हैंड ऑफ़ गॉड या "la mano de Dios" के नाम से जाना जाता है। आख़िरकार, 22 अगस्त 2005 में अपने एक टी.वी. शो पर माराडोना ने यह स्वीकार किया कि उन्होंने गेंद को जानबूझ कर कर हाथों से मारा था और उन्हें तुरंत ही इस बात का एहसास हो गया था कि वह गोल नाजायज़ था। हालांकि, इंग्लैंड के खिलाड़ियों के क्रोध के बावजूद, इस गोल का वजूद कायम रहा। 

माराडोना के दूसरे गोल को बाद में FIFA द्वारा विश्व कप के इतिहास का सर्वश्रेष्ट गोल नामित किया जाना था। उन्हें गेंद अपने हिस्से में प्राप्त हुई, उन्होंने गेंद को घुमाया और उसे 11 बार छूते हुए और इंग्लैंड के 5 आउटफील्ड खिलाडियों (जिसमें ग्लेन होडल, पीटर रीड, केनी सैनसम, टेरी बुचर और टेरी फेन्विक शामिल थे) और गोलरक्षक पीटर शिलटन को चकमा देते हुए फील्ड की आधी लम्बाई दौड़ कर तय किया। इस गोल को 2002 में FIFA द्वारा आयोजित एक ऑनलाइन चुनाव में सदी का सर्वश्रेष्ठ गोल चुना गया।

इसके बाद माराडोना ने बेल्जियम के खिलाफ सेमी-फाइनल में दो और गोल किए, जिसके दूसरे गोल में उनका एक और कलाप्रवीण ड्रिब्लिंग प्रदर्शन शामिल था। फाइनल में, विरोधी पक्ष पश्चिमी जर्मन ने डबल-मार्किंग के द्वारा उन्हें नियंत्रित करने की कोशिश की, लेकिन फिर भी उन्होंने विजयी गोल के लिए जॉर्ज बुरुचागा को अंतिम पास देने के लिए स्थान खोज ही लिया। अर्जेन्टीना ने अज्टेका स्टेडियम में 115,000 दर्शकों के सामने पश्चिमी जर्मनी को 3-2 से हराया और माराडोना ने विश्व कप ट्राफी को अपने हाथों से ग्रहण किया और यह सुनिश्चित किया कि फ़ुटबॉल के इतिहास में उन्हें एक महान हस्ती के रूप में याद किया जाएगा. उनके लिए एक श्रद्धांजलि में, अज्टेका स्टेडियम के अधिकारियों ने "सदी का गोल" दागती उनकी एक मूर्ति बनवाई और उसे स्टेडियम के प्रवेश-द्वार पर स्थापित किया।

खिलाड़ी
1986 विश्व कप
1982 विश्व कप
1990 विश्व कप