मार्च 2007 की शुरुआत में, UDF के कई प्रमुख सदस्यों ने मुलुज़ी को 2009 में राष्ट्रपति पद के लिए दौड़ने के लिए बुलाया, पार्टी ने कहा कि उनके पास 11 मार्च तक यह घोषित करने के लिए होगा कि क्या उन्हें चलाने का इरादा है। , तदनुसार, उस दिन मुलुजी ने घोषणा की कि वह पार्टी के राष्ट्रपति पद के उम्मीदवार के रूप में नामांकन चाहते हैं। Of यह सवाल कि क्या मुलूज़ी फिर से दौड़ने के योग्य हैं, ने कुछ विवाद खड़े कर दिए हैं। क्योंकि संविधान लगातार दो कार्यकालों की सीमा को संदर्भित करता है, इसे एक पद के लिए कार्यालय से बाहर होने के बाद मुलुज़ी को फिर से चलाने में सक्षम माना जा सकता है। 

भ्रष्टाचार निरोधक ब्यूरो (एसीबी) के अध्यक्ष, एलेक्स नंपोटा ने 17 मार्च, 2008 को घोषणा की कि एसीबी ने मुलुज़ी के खिलाफ अपने व्यक्तिगत खाते में लगभग 11 मिलियन डॉलर के डोनर के पैसे को कथित रूप से फंसाने के लिए मुकदमा चलाने का इरादा किया है; नंपोता ने कहा कि एसीबी ने अदालतों से एक निषेधाज्ञा उठाने के लिए कहा था, जिससे मुलुज़ी से पूछताछ करने से रोका जा सके। यूडीएफ के महासचिव केनेडी मकवांगवाला ने इसे "राजनीतिक उत्पीड़न" कहा। 

24 अप्रैल, 2008 को, एक यूडीएफ सम्मेलन ने मुलुज़ी को पार्टी के 2009 के राष्ट्रपति पद के उम्मीदवार के रूप में चुना। उन्हें उप-राष्ट्रपति कासिम चिल्म्पा के लिए 38 के मुकाबले 1,950 वोट मिले । 

20 मार्च, 2009 को मलावी इलेक्टोरल कमीशन ने बकीली मुलुज़ी को तीसरी बार राष्ट्रपति पद के लिए दौड़ने से रोक दिया। मुलुज़ी ने इसे चुनौती दी, लेकिन चुनाव से केवल तीन दिन पहले 16 मई को, संवैधानिक न्यायालय ने फैसला सुनाया कि मुलुज़ी फिर से नहीं चल सकता। उस बिंदु तक, मुलुज़ी और यूडीएफ ने मलावी कांग्रेस पार्टी (MCP) के अध्यक्ष जॉन टेम्बो की उम्मीदवारी के पीछे अपना समर्थन दिया था। 

मुलुजी ने 23 दिसंबर, 2009 को घोषणा की कि वह सक्रिय राजनीति से सेवानिवृत्त हो रहे हैं और शुक्रवार को जुंबे उन्हें यूएफएफ नेता के रूप में बदल रहे हैं। 

2008 की गिरफ्तारी
2009 के राष्ट्रपति पद की उम्मीदवारी
व्यक्तिगत जीवन
पोस्ट-प्रेसीडेंसी