जब लेखन टीम एक एपिसोड पर काम करती है, प्रत्येक लेखक एक चरित्र लेता है और उसके इर्दगिर्द के अकेले दृश्य लिखता है. फिर इन कहानियों को जोड़ा जाता है और एपिसोड लेखक को दिया जाता है. यह प्रणाली प्रत्येक लेखक को प्रत्येक एपिसोड में योगदान करने की अनुमति देती है और लेखन टीम को स्क्रिप्ट को जल्दी खत्म करने में सक्षम बनाती है ताकि शूटिंग दल एक स्थान पर अधिक दृश्य शूट कर सकें. टिम क्रिंग लेखन प्रक्रिया को सहयोगात्मक मानते हैं और कहते हैं कि सहयोग की प्रक्रिया महत्वपूर्ण है क्योंकि प्रोड्क्शन को एक ही स्थान पर कई दृश्यों को शूट करना होता है. ऐसा करने के लिए, कई स्क्रिप्ट तैयार होनी चाहिये. जेसी अलेक्जेंडर सह-निर्माता और लेखक बताते हैं कि श्रंखलाबद्ध नाटक में यह प्रक्रिया महत्वपूर्ण है क्योंकि यह जानना पड़ता है कि प्रत्येक पात्र किस दिशा में आगे बढ़ रहा है.

दूसरे सीज़न में WGA लेखक हड़ताल हुई, जिसका अर्थ था कि योजनाबद्ध 24 एपिसोड में से केवल 11 का ही निर्माण होगा. इसने निर्माताओं को पूर्व निर्धारित योजना के अनुसार बनने वाले तीन एपिसोड में से केवल "जनरेशन्स" को शामिल कर के सीज़न को पुनः डिज़ाइन करने पर मजबूर कर दिया. तीसरा योजनाबद्ध भाग, "एग्ज़ोडस (भारी संख्या में पलायन)" जो मूल रूप से कहानी में शांति वायरस के 138 प्रकारों के प्रभावों को परिलक्षित करता है, रद्द कर दिया गया. चौथे योजनाबद्ध भाग, "विलेन" को तीसरे भाग में बदला गया और सीज़न तीन में ले जाया गया. भाग दो "पॉवरलेस" के समापन दृश्यों को "एग्ज़ोडस" के रद्द होने की वजह से पुनः फ़िल्माना पड़ा और सभी सिरों को "जनरेशन्स" की ढीली कहानी के सिरों से जोड़ना पड़ा.

"एंटरटेनमेंट वीकली" के साथ एक साक्षात्कार में निर्माता टिम क्रिंग ने दो सीज़न की आलोचनाओं और "श्रृंखला" की रेटिंग में 15% की गिरावट पर टिप्पणी की. क्रिंग ने कहा कि उन्होनें सीज़न दो के निर्देशन में गलतियाँ की थीं. उन्होनें सोचा कि दर्शक "पात्रों का विकास और उनकी शक्तियों की खोज" को देखना चाह रहे थे, सीज़न एक के विपरीत, जब दर्शक "रोमांच" के लिए देख रहे थे. क्रिंग ने यह भी कहा कि उनके अनुसार कहानी के विकास में समस्याएं थीं, यह कहते हुए कि दूसरे सीज़न को "बड़ी कहानी बनने में काफी अधिक समय लगा", वर्णन किया कि पीटर के वायरल से अंतिम युद्ध की परिकल्पना सातवें के बजाए पहले एपिसोड में होनी चाहिए थी. उनका मानना है कि मुख्य कहानी के सन्दर्भ में माया और ऐलेजैंड्रो की अलग कहानी के बजाए नये पात्रों को लाना बेहतर होता जैसे कि एली. क्रिंग ने यह भी स्वीकार किया कि उन्हें "हीरोज़ इन जापान" कहानी को अधिक जल्दी खत्म करना चाहिए था और यह भी कि रोमांटिक कहानियां ठीक नहीं चल रहीं हैं. क्लेयर और वेस्ट तथा हीरोज़ और येको के सन्दर्भ में उन्होंने कहा, "मैंने टीवी पर और अधिक विश्वसनीय रोमांस देखा है. उस सन्दर्भ में, मुझे नहीं लगता कि रोमांस हमारे लिए प्राकृतिक रूप से फिट है."

टीवी गाइड के टिम मोलोय ने कहा कि चौथे भाग से "हीरोज़" अपने मूल की ओर वापिस लौटेगा.
"फ्यूज़ीटिव" नए दर्शकों को आकर्षित करने और उन दर्शकों के वापिस लाने का प्रयास है, जिन्होंने अत्याधिक पात्रों और कहानी के कारण शो देखना छोड़ दिया था. "फ्यूज़ीटिव" की शुरुआत नाथन पेट्रेली द्वारा राष्ट्रपति को यह बताने से होती है कि ऐसे लोग मौजूद हैं जिनके पास अतिमानवीय क्षमताएं हैं. राष्ट्रपति ऐसे व्यक्तियों को पकड़ने के लिए नाथन को अधिकृत करते हैं और ज़ाईलर के सिवा सभी मुख्य पात्र इकठ्ठे होते हैं जो अपने जैविक पिता का पता लगाने के प्रयास में नाथन के एजेंटों की पहुँच से निकल भागता है. हीरोज़ एक रहस्यमयी सहयोगी "रेबेल" की मदद लेते हैं, जिसका बाद में मीका सैंडर्स के रूप में खुलासा होता है.

नवम्बर 2008 में, NBC ने रचनात्मक मतभेद और बजट समस्याओं के कारण "हीरोज़" के प्रोड्क्शन स्टाफ से जेसी अलेक्जेंडर और जेफ लोएब को निकाल दिया. परिणामस्वरूप, टिम क्रिंग को पात्रों के विकास और सरल कहानी वाली श्रृंखला पर पुनः ध्यान केन्द्रित करना पड़ा. हालांकि, एक उच्च स्तर के अंदरूनी सूत्र ने "टी वी गाइड" को बताया कि NBC या यूनिवर्सल मीडिया के दबाव के बजाए हाल ही में लड़खड़ाई रेटिंग के परिणामस्वरूप, स्वयं क्रिंग ने अलेक्ज़ेन्डर और लोएब को निकाल दिया है क्योंकि दोनों ने पहले सीज़न को लोकप्रिय बनाने वाली पात्र आधारित कहानियों को ज़ारी रखने से मना कर दिया था. दिसंबर 2008 में, ब्रायन फुलर ने अपनी एबीसी श्रृंखला "पुशिंग डेज़िज़" के रद्द होने के बाद यूनिवर्सल स्टूडियोज मीडिया के साथ 2 वर्ष के सौदे पर हस्ताक्षर किए. उन्होनें सीज़न तीन के 20वें एपिसोड से शुरू होने वाले "हीरोज़" के लेखन स्टाफ के साथ काम आरंभ किया और उनकी श्रंखला के "लेखन और निर्देशन में महत्वपूर्ण भूमिका" थी. लेकिन 22 जून को यह पता चला कि अन्य परियोजनाओं पर काम करने के लिए फुलर ने "हीरोज़" को छोड़ दिया. फुलर ने हाल ही में "पुशिंग डेज़िज़" की अभिनेत्री स्वूसी कार्ट्ज़ का मिली नामक महिला पात्र लिखा था, एक ऐसा चरित्र जिसे "हीरोज़" में बार बार दिखने वाले पात्र के रूप में बढ़ावा दिया जा सकता था. 28 अप्रैल 2009 को, लेखक/निर्देशक/निर्माता ग्रेग बीमान को NBC से निकाल दिया गया.

संगीत
"हीरोज़ : ऑरिजिंस "
DVD लोकार्पण
लेखन