इस मस्जिद को घुमदान पैलेस की स्थान पर बनाया गया, जो सना के अल-कुआती और अल-सलेह के दो क्षेत्रों के बीच बना है। धार्मिक भवन से निकटता के कारण शहर के बज़ार को मस्जिद के निकट में स्थानांतरित कर दिया गया था, जो की सुरक्षा की दृष्टि से ठीक था। मस्जिद के साथ-साथ, महल की पास एक जेल और सशस्त्र बलों के लिए एक बैरक भी था, जो ओटोमन साम्राज्य के दौरान बनाया गया था। 

बाद के वर्षों में, शहर की योजना, विस्तार और अभिविन्यास महान मस्जिद और शहर के उत्तर की ओर दो अन्य मस्जिदों के निर्माण से काफी प्रभावित हुए थे। हालांकि पुराने शहर में सौ से अधिक मस्जिदें हैं, सना की महान मस्जिद उनमें से सबसे बड़ी और उल्लेखनीय है। 
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