जुलाई 1996 में कुल छः द्वीपों को शामिल करके फुनाफुति समुद्री संरक्षित क्षेत्र की स्थापना की गयी थी। इसका क्षेत्रफल 33 वर्ग कि॰मी॰ है, जो कि फुनाफुति के चट्टानी क्षेत्र का 20% है। इन छः द्वीपों का कुल संरक्षित क्षेत्रफल 8 हेक्टेयर (0.08 वर्ग किमी) है। इन द्वीपों का उत्तर से दक्षिण तक के संरक्षित क्षेत्र का क्षेत्रफल हेक्टेयर में निम्न है-


फुनाफुति समुद्री संरक्षित क्षेत्र में नाव के द्वारा जाया जा सकता है। यह क्षेत्र मुख्य द्वीप फोंगाफाले से दूर है
अनूप (लैगून)
फुनाफुति के द्वीप
फुनाफुति के गाँव
फुनाफुति समुद्री संरक्षित क्षेत्र