रंगीन मर्ले कुत्तों को हल्के से गंभीर बहरेपन, अंतःचाक्षुश दबाव, दृष्टिदोष अपसामान्य दृष्टि, लघु नेत्र और नेत्रविदर की शिकायत हो सकती है। मर्ले कुत्ते जिनके माता-पिता दोनों मर्ले हों, वे ढांचे, हृदय संबंधी या प्रजनन संबंधी मामलों में असामान्यताओं से ग्रस्त हो सकते हैं।

पोमेरेनियन नस्ल में लक्सेटिंग पटेलास एक अन्य आम बीमारी है। यह तब होता है जब अन्य विकृति या चोट की वजह से घुटने में घुटने का जोड़ बनाने वाली मेड़ सही स्थिति में न हो या इतना उथला हो कि जानुफलक को सही और सुरक्षित ढंग से बैठने नहीं दे रहा हो. यह जानुफलक को अपनी जगह से खिसका (खांचे से बाहर निकालना) सकता है जिससे पैर मुड़ना बंद हो जाएगा और तलवा जमीन से ऊपर रहेगा. जबकि मांसपेशियों के संकुचित होने की वजह से घुटने की चक्की सही स्थिति में नहीं लौट सकती. प्रारंभिक दर्द घुटने के ऊपर की हड्डी (नी कैप) के जांघ की हड्डी के मेड के पार फिसलने से होता है। एक बार जगह से हट जाने के बाद, कुत्ते को स्लिप डिस्क की वजह से कोई दर्द महसूस नहीं होता है। ऐसी स्थिति छोटी नस्ल में, विशेष रूप से छोटे और टॉय पूडलस में अधिक आम होती है। 
सांस की नली का विफल होना (त्रचेल कोलैप्स) सांस की नली में श्वशन छल्लों की कमजोरी के कारण होता है। यह तब होता है जब सामान्य रूप से सांस की नली के आकार को बनाये रखने वाले छल्ले विफल होकर हवा का मार्ग बंद कर देते हैं। यह आमतौर पर पोमेरेनियनों और यॉर्कशायर टेरियर तथा पूडल और छोटी नस्ल के अन्य कुत्तों में देखा जाता है। इस विफलता के लक्षण में भोंपू जैसी खांसी जो बतख की चीख जैसी सुनाई देती है, व्यायाम के लिए असहिष्णुता, बेहोशी के दौरे और गर्म मौसम, व्यायाम तथा उत्तेजना से बिगड़ी हुई खांसी शामिल है।

पोमेरेनियनों को अक्सर "काली त्वचा की बीमारी" हो जाती है जो गंजापन (बालों के झड़ने) और अतिवर्णकता (त्वचा का अस्वाभाविक रूप से काला हो जाना) का संयोजन है। इस अवस्था के अन्य नाम हैं ऊनी कोट, कोट दुर्गंध, छद्म कुशिंग रोग या बालों का बुरी तरह से झड़ना. यह बीमारी मादा की तुलना में नर पोमेनेरियनों को अधिक प्रभावित करती है और वंशानुगत हो सकती है। कई अन्य नस्लों को भी यह त्वचा विकार होता है, जिनमें अमेरिकी जल स्पेनियल (शिकारी कुत्ता), डाक्सहूण्ड (छोटे-छोटे पैरों वाले कुत्ते की एक जाति), कीसहूण्ड (हॉलैण्ड के कुत्तों की एक नस्ल) और चाउ चाउ (चीन के कुत्तों की एक नस्ल) शामिल है। हालांकि अधिकतर कुत्तों में यौवन में यह लक्षण दिखता है, लेकिन यह किसी भी उम्र में हो सकता है। कुशिंग सिंड्रोम, हाइपोथायरायडिज्म त्वचा में दीर्घकालिक संक्रमण और प्रजनन हार्मोन विकारों सहित कई स्थितियां इस स्थिति के सदृश्य हो सकती हैं।

गुप्‍तवृषणता नर पोमेरेनिअनों में होने वाला एक अन्य आम विकार है। यह तब होता है जब या तो एक या दोनों अंडकोष नहीं उतरते. इस मामले में उन्हें मुक्त करने के लिए पेट की शल्य-क्रिया की आवश्यकता होती है। अच्छी खबर यह है कि यह उन्हें स्वस्थ बनाता है और अन्य समस्याओं के साथ कैंसर के जोखिम को कम करता है।

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