संरचनात्मक रूप से, "वॉचमेन" कुछ पहलुओं में उस समय की कॉमिक्स पुस्तकों के नियमों से भटक गया, विशेष रूप से पैनल ले-आउट और रंग के मामले में. विभिन्न आकार के पैनल के बजाय, रचनाकारों ने प्रत्येक पृष्ठ को नौ पैनल ग्रिड में विभाजित किया। गिबन्स ने इसके "अधिकार" के कारण नौ पैनल ग्रिड प्रणाली को पसंद किया। मूर ने नौ पैनल ग्रिड प्रारूप के प्रयोग को स्वीकार किया, जिसने गिबन्स के अनुसार "उन्हें कथा-वाचन पर नियंत्रण का एक स्तर दिया, जो उनके पास पहले नहीं था". "वहां गति और दृश्य प्रभाव का ऐसा तत्व था जिसके बारे में अब वे पूर्वानुमान लगा सकते थे और इसका इस्तेमाल नाटकीय प्रभाव के लिए कर सकते थे।" द कॉमिक्स जर्नल के भोब स्टीवर्ट ने 1987 में गिबन्स से उल्लेख किया कि पेज ले-आउट EC कॉमिक्स की याद दिलाता है, खुद कला के अलावा, जिसमें स्टीवर्ट को विशेष रूप से जॉन सेवेरिन की प्रतिध्वनि महसूस हुई. गिबन्स सहमत थे कि EC शैली के ले-आउट की गूंज "एक बहुत ही जान बूझकर की जाने वाली बात थी", हालांकि उनकी प्रेरणा हार्वे कुर्ट्ज़मन थे, लेकिन इसे श्रृंखला को एक अनूठा रूप देने के लिए काफी बदल दिया गया।

प्रत्येक अंक का मुख पृष्ठ कहानी के लिए पहले पैनल के रूप में कार्य करता है। गिबन्स ने कहा, ""वॉचमेन" का मुख-पृष्ठ यथार्थ दुनिया में है और बहुत असली दिखता है, लेकिन यह एक कॉमिक्स पुस्तक में बदलने लगा, एक दूसरे आयाम का प्रवेश-द्वार." मुख-पृष्ठों को क्लोज़-अप्स के रूप में तैयार किया गया था, जो बिना इंसानी तत्वों की मौजूदगी के, एक एकल विस्तार पर ध्यान केंद्रित करता है। कई अवसरों पर रचनाकारों ने अंक की सामग्री ले-आउट के साथ प्रयोग किया। गिबन्स ने "फिअरफुल सिमेट्री" शीर्षक के अंक पांच को बनाया, तो पहला पृष्ठ, अंतिम को प्रतिबिंबित करता है (फ्रेम व्यवस्था के संदर्भ में), सेंटर स्प्रेड से पहले एक दूसरे को प्रतिबिंबित करते निम्न पन्ने (मोटे तौर पर) ले-आउट में सममित हैं।

प्रत्येक अंक के अंत (अंक बारह को छोड़ कर) में मूर द्वारा लिखित अनुपूरक गद्यांश होते हैं। विषयवस्तु में शामिल है काल्पनिक पुस्तक अध्याय, पत्र, रिपोर्ट और विभिन्न "वॉचमेन" पात्रों द्वारा लिखे लेख. "वॉचमेन" के अंकों में विज्ञापन जगह बेचने में DC को मुसीबत पेश हुई, जिसने प्रत्येक अंक में आठ से नौ अतिरिक्त पन्ने छोड़े. DC ने जगह को भरने के लिए गृह विज्ञापन और लम्बे अक्षर के कॉलम डालने की योजना बनाई, लेकिन संपादक लेन वेन को लगा कि यह उस प्रत्येक व्यक्ति के लिए गलत होगा, जिसने भी श्रृंखला के अंतिम चार अंकों के दौरान लिखा. उन्होंने श्रृंखला की पृष्ठकथा भरने के लिए अतिरिक्त पृष्ठों के उपयोग का फैसला किया। मूर ने कहा, "जब तक हम लगभग #3, #4 या आगे के अंक तक पहुंचे, हमने सोचा कि किताब, बिना अक्षर के पृष्ठ के अच्छी लग रही है। यह एक कॉमिक्स की किताब की तरह कम ही लग रही थी, इसलिए हम इसी पर टिके रहे.

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