6 अप्रैल 2009 को, राष्ट्रीय अभियोग प्राधिकरण (NPA) ने, अभियोजन पक्ष में गंभीर दोषों के नए रहस्योद्घाटन की रौशनी में, ज़ूमा और सह अभियुक्त फ्रेंच हथियार कंपनी थिंट के खिलाफ सभी आरोपों को वापस ले लिया। यह रहस्योद्घाटन फोन वार्ता के टुकड़ों के रूप में थे जो यह दिखाते थे कि स्कोर्पियन के अध्यक्ष, लीओनार्ड मैकार्थी और सार्वजनिक अभियोजन के पूर्व राष्ट्रीय निदेशक, बुलेलानी न्गकुका ने ज़ूमा पर अभियोग चलाए जाने के समय को लेकर साज़िश रची थी, जो संभाव्यतः ज़ूमा के राजनीतिक प्रतिद्वंद्वी, राष्ट्रपति थाबो मबेकी के राजनीतिक लाभ के लिए था। आरोप वापस लेने की घोषणा NPA के कार्यकारी अध्यक्ष, मोकोथेडी एम्प्शे द्वारा किया गया, जिन्होनें इस बात पर ज़ोर दिया कि आरोपों की वापसी उन दुरुपयोगों के कारण हुई जिसे कानूनी प्रक्रिया को "दागी" बनाया और यह दोषमुक्ति के बराबर नहीं है।

NPA की घोषणा के तुरंत बाद, हालांकि, कम से कम दो राजनीतिक दलों ने सूचित किया कि आरोपों को वापस लिए जाने की स्थिति में वे अपने से कानूनी कार्रवाई पर विचार करेंगे। डेमोक्रेटिक एलायंस ने बाद में NPA के फैसले की एक न्यायिक समीक्षा करने की अपील दायर की, जिसके सन्दर्भ में उनके पार्टी के नेता हेलेन जिले ने स्पष्ट किया कि एम्प्शे ने "कानून पर आधारित निर्णय नहीं लिया, लेकिन [उसके बजाए] राजनीतिक दबाव से बंधा हुआ निर्णय लिया". 9 जून 2009 को, इस मामले की सुनवाई का दिन तय किया गया। जबकि ज़ूमा ने अपनी प्रतिक्रिया को कालोचित रूप से दायर किया, एम्प्शे ने मामले की सुनवाई में देरी की, जिसमें उन्होंने NPA की प्रतिक्रिया को पेश करने के लिए दो विस्तारण का अनुरोध किया। NPA के प्रवक्ता म्थुन्ज़ी महागा ने कहा कि वे कागजात दाखिल नहीं करेंगे क्योंकि "बकाया मामले" ऐसे हैं जिन्हें हल किया जाना बाकी है। डेमोक्रेटिक एलायंस पार्टी प्रमुख जिले ने तर्क दिया कि ज़ूमा की प्रतिक्रिया मौलिक रूप से गलत है और "उनमें कोई संवैधानिक आधार नहीं हैं". जबकि कानूनी चुनौतियां जारी रही, जून 2009 को हुए एक सर्वेक्षण से पता चला कि, आधे से ज्यादा दक्षिण अफ्रीकी यह मानते हैं कि राष्ट्रपति जेकब ज़ूमा अच्छा काम कर रहे हैं। जून 2009 के अंत में TNS रिसर्च स्टडीज़ द्वारा किए गए चुनाव में यह ज़ाहिर हो गया कि ज़ूमा के अनुमोदन स्तर में लगातार सुधार हुआ है। सर्वेक्षण में शामिल लोगों में से लगभग 57% ने कहा कि वे सोचते हैं कि ज़ूमा एक सक्षम नेता हैं - यह तादाद अप्रैल 2009 में राष्ट्रपति के नाम उद्घाटन के मुकाबले 3% तक अधिक थी। नवंबर 2008 में, पूर्व राष्ट्रपति थाबो मबेकी का नाम वापस ले लिए जाने और ज़ूमा के भ्रष्टाचार के आरोपों का सामना करने के बस कुछ ही महीने बाद, केवल 36% दक्षिण अफ्रीकी ही उनके विषय में सकारात्मक थे।

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