टूलबार पर लेआउट और बटनों को अनुकूलित करने की क्षमता को विन्डोज़ विस्टा के एक्सप्लोरर से हटा दिया गया है, जैसा कि पहले उसमें एक जिप फ़ाइल (संपीड़ित फोल्डर) में एक पासवर्ड जोड़ने की क्षमता थी। एक्सप्लोरर में उस टूलबार बटन को भी हटा दिया गया है जिससे वर्तमान फोल्डर से एक फ़ोल्डर ऊपर या नीचे जाया जाता था (लेकिन यह सुविधा अभी भी मौजूद है, एक व्यक्ति Alt+↑ को दबाकर एक फ़ोल्डर ऊपर जा सकता है). हालांकि मेनू और कीबोर्ड शॉर्टकट से अभी भी पूरी तरह उपलब्ध होते हुए कट, कॉपी, पेस्ट, अन्डू, डिलीट, प्रोपर्टीज़ के टूलबार बटन और कुछ अन्य अब उपलब्ध नहीं हैं। मेनू बार भी अब डिफ़ॉल्ट रूप से छुपा हुआ है, लेकिन "Alt" कुंजी दबाने पर अभी भी उपलब्ध है, या लेआउट विकल्प में में उसकी दृश्यता बदलने पर. कई अन्य सुविधाओं को हटा दिया गया है, जैसे चीज़ों को बिना चुने हुए स्टेटस बार पर आकार को दिखाना, मेटाडाटा को NTFS सेकेंडरी स्ट्रीम में भंडारित करना, आईकॉलमप्रोवाइडर (IColumnProvider) इंटरफ़ेस जो एक्सप्लोरर पर अनुकूलित खंड जोड़ने की अनुमति देता था और "desktop.ini" का उपयोग करते हुए फ़ोल्डर पृष्ठभूमि अनुकूलन.

"मैनेजिंग पेयर्स ऑफ़ वेब पेजेस एंड फ़ोल्डर्स" के विकल्प को भी हटा दिया गया है और उपयोगकर्ता के पास विस्टा को यह बताने का कोई रास्ता नहीं है कि एक .html फ़ाइल और एक ही नाम वाला फ़ोल्डर जिसे IE से एक पूरा वेब पेज सहेजते समय निर्मित किया गया था उसे पृथक रूप से संभालना चाहिए, यानी, आप html फ़ाइल को बिना मिटाए फ़ोल्डर को नहीं मिटा सकते.
इसका एक समाधान (http://windowsxp.mvps.org/webpairs.htm) पर दिया गया है। उसके बाद webpairs.reg फ़ाइल को रजिस्ट्री में विलय कर दिया गया है, "मैनेजिंग पेयर्स ऑफ़ वेब पेजेस एंड फ़ोल्डर्स" का विकल्प फ़ोल्डर ऑप्शन के व्यू टैब में उपलब्ध है।

किसी फ़ोल्डर पर राईट क्लिक कर के "सर्च" को हिट करने की क्षमता को हटा दिया गया है और साथ में अपने खोज को अनुकूलित करने के लिए भरे जाने वाले क्षेत्रों को भी हटा दिया गया है। अब आपको उस फ़ोल्डर को हाईलाईट करना होगा जिसे आप खोजना चाहते हैं और खोज क्षेत्र में ऊपर दाईं तरफ अपने खोजशब्द को दर्ज करना होगा और जब तक उस एक (या कुछ) खोजशब्द के आधार पर कम्प्यूटर ने संपूर्ण फ़ोल्डर में अपनी खोज को समाप्त न कर लिया हो आप कोई अन्य खोज मापदंड दर्ज नहीं कर सकते. तभी "अडवांस्ड सर्च" बटन प्रदर्शित होगा और आपको आगे के खोज मापदंडों को प्रवेश करने की इजाजत देगा. इस स्थिति को नजरअंदाज किया जा सकता है। विन्डोज़ एक्स्प्लोरर में F3 कुंजी हिट है। इससे "अडवांस्ड सर्च" बॉक्स सामने आता है।

हटाई और बदली गई विशेषताएं
विस्तारशीलता
हटाई और बदली गई विशेषताएं
विन्डोज़ विस्टा और विन्डोज़ सर्वर 2008