1843 में स्टीफेंस जॉन लॉयड द्वारा लिखी पुस्तक "इंसीडेंट्स ऑफ़ ट्रैवल इन युक्टान" (जिसमें फ्रेडरिक कैथरवूड के चित्र शामिल हैं) के जरिए चीचेन इट्ज़ा लोकप्रिय कल्पना में शामिल हुआ। इस पुस्तक में स्टीफेंस के युक्टान दौरे और चीचेन इट्ज़ा सहित माया शहरों के उनके दौरे का ब्यौरा है। इस पुस्तक ने शहर के अन्य अन्वेषण को प्रेरित किया। 1860 में, डीज़ायर चारने ने चीचेन इट्ज़ा का सर्वेक्षण किया और कई तस्वीरें ली जिसे उन्होंने "Cités et ruines américaines" (1863) में प्रकाशित किया।

1875 में, ऑगस्टस ले पलोंजेओन और उसकी पत्नी एलिस ड़ीक्सों ले पलोंजेओन ने चीचेन का दौरा किया और खुदाई करके एक मूर्ति निकाली जो पीठ के बल थी, उसके घुटने ऊपर उठे हुए थे, ऊपरी धड़ कोहनियों के सहारे उठा था और पेट पर एक थाली रखी हुई थी। ऑगस्टस ले पलोंजेओन ने उसे "चाकमोल" नाम दिया (बाद में इसका नाम बदलकर "चक मूल," कर दिया गया, इस शब्द का उपयोग मेसोअमेरीका में पाए गए सभी प्रकार की प्रस्तरप्रतिमाओं का वर्णन करने के लिए किया जाता था). टीओबर्ट मालर और अल्फ्रेड मौडस्ले ने 1880 के दशक में चीचेन का अन्वेषण किया और दोनों ने उस स्थल पर कई हफ्ते बिताए और व्यापक तस्वीरें ली। मौडस्ले ने अपनी पुस्तक "बायोलोजिया सेनट्राली-अमेरिका" में चीचेन इट्ज़ा का पहला लंबा विवरण प्रकाशित किया।

1894 में, युक्टान के लिएसंयुक्त राज्य अमेरिका कौंसुल, एडवर्ड एच. थॉम्पसन ने हासिएंडा चीचेन को खरीद लिया, जिसमें चीचेन इटज़ा के खंडहर शामिल थे। 30 वर्षों के लिए, थॉम्पसन ने प्राचीन शहर का अन्वेषण किया। उनकी खोज में शामिल थे प्रारंभिक श्रृंखला के मंदिर में एक सरदल पर प्रारंभिक दिनों की नक्काशी और ओसारियो (उच्च पुजारी मंदिर) में कई कब्रों की खुदाई. थॉम्पसन, 1904 से 1910 तक सेनोट साग्राडो (सेक्रेड सेनोट) का निकर्षण करने के लिए सर्वाधिक प्रसिद्ध हैं, जहां उन्होंने स्वर्ण तांबे और नक़्क़ाशीदार जेड से बनी कलाकृतियों को बरामद किया और साथ ही साथ उन्होंने कुछ ऐसे नमूने एकत्रित किए जिन्हें पूर्व-कॉलमबियाई माया के कपड़ों और लकड़ी के हथियारों के प्रथम उदाहरण के रूप में देखा जाता है। थॉम्पसन ने कलाकृतियों के जखीरे को हार्वर्ड विश्वविद्यालय के पीबॉडी संग्रहालय में भेज दिया।

1913 में, पुरातत्वविद् सिलवेनस जी. मॉर्ले ने कार्नेगी संस्था को चीचेन इट्ज़ा में एक व्यापक पुरातात्विक परियोजना को वित्तपोषित करने के लिए राजी किया, जिसमें खंडहरों का मानचित्रण करना और कई स्मारकों को जीर्णोद्धार करना शामिल था। मैक्सिकन क्रांति और उसके बाद अस्थाई सरकार ने 1924 तक कार्नेगी को काम शुरू करने से बाधित किया। 10 वर्षों के दौरान, कार्नेगी शोधकर्ताओं ने योद्धाओं के मंदिर और कराकोल की खुदाई की और उसका जीर्णोद्धार किया। उसी समय, मैक्सिकन सरकार ने अल कासटीलो और ग्रेट बॉल कोर्ट की खुदाई और जीर्णोद्धार किया।

सन् 1926 में, मैक्सिकन सरकार ने एडवर्ड थॉम्पसन पर चोरी का आरोप लगाया, उन पर यह आरोप लगाया गया की वे सेनोट साग्राडो से कलाकृतियों को चुरा कर बाहर के दशों में उनकी तस्करी करते हैं। सरकार ने हासिएंडा चीचेन पर कब्जा कर लिया। थॉम्पसन, जो उस समय संयुक्त राज्य अमेरिका में थे कभी युक्टान वापस नहीं लौटे. उन्होंने माया संस्कृति पर अपने शोध और जांच के विषय में 1932 में प्रकाशित एक पुस्तक "पीपल ऑफ़ दी सर्पेंट" में लिखा. 1935 में न्यू जर्सी में उनका निधन हो गया। 1944 में मैक्सिकन सुप्रीम कोर्ट ने फैसला सुनाया कि थॉम्पसन ने कोई कानून नहीं तोड़ा था और उसके उत्तराधिकारियों को चीचेन इट्ज़ा लौटा दिया गया। थॉम्पसन परिवार ने हेसिंडा को, पर्यटन क्षेत्र में अग्रणी रहे फरनैनडो बारबाचानो पीओन को बेच दिया। 

बाद में सेनोट साग्राडो से कलाकृतियों को पुनः प्राप्त करने के दो अभियान चलाए गए एक 1961 में और दूसरा 1967 में. पहला अभियान नेशनल ज्योग्राफिक द्वारा और दूसरा निजी सहायता द्वारा प्रायोजित था। दोनों ही परियोजनाओं की देखरेख मैक्सिको के नेशनल इंस्टिट्यूट ऑफ ऐनथ्रोपोलॉजी एंड हिस्ट्री (INAH) के द्वारा की गई। INAH ने पुरातात्विक ज़ोन में आने वाले अन्य स्मारकों की खुदाई और जीर्णोद्धार के लिए अभी तक चल रहे एक प्रयास का प्रबंधन किया, जिसमें ओसारियो, अकब डज़िब और चीचेन विएजो (ओल्ड चीचेन) की कई इमारतें शामिल है।

2009 में, अल कैस्टिलो के पूर्व निर्धारित निर्माण की जांच करने के लिए, पुरातत्वविदों ने अल कैस्टिलो के निकट खुदाई शुरू की।

पुरातात्विक जांच
स्थान का वर्णन
हज़ार स्तंभों का समूह
ग्रेट बॉल कोर्ट