मेडागास्कर और पश्चिमी भारत के बीच संबंध 18 वीं शताब्दी में शुरू हुए और कम से कम 19 वीं शताब्दी के अंत तक दोनों देश नियमित रूप से व्यापार करते रहे। 1954 में अंतरराज्यीय संबंध तब शुरू हुए जब स्वतंत्र भारत ने फ्रांसीसी-नियंत्रित मेडागास्कर में अपने वाणिज्य दूतावास (consulate) की स्थापना की। जब 1960 में मेडागास्कर स्वतंत्र हो गया, तो वाणिज्य दूतावास को दूतावास (embassy) का दर्जा दिया गया। 

फरवरी 2011 में, संबंधों को सौहार्दपूर्ण माना गया, कई उच्च-स्तरीय अधिकारियों ने संबंधों के दौरान यात्राओं का आदान-प्रदान हुआ। भारतीय मूल के लगभग 20,000 लोग मेडागास्कर में रहते थे, जिनमें 2,500 भारतीय नागरिक शामिल थे। 

मार्च 2018 में, राम नाथ कोविन्द मेडागास्कर जाने वाले पहले भारत के पहले राष्ट्रपति बने। कोविंद को मेडागास्कर के प्रधानमंत्री ओलिवियर सोलोनांड्रसन ने द्वितीय श्रेणी का ग्रैंड क्रॉस, गैर-नागरिकों के लिए मेडागास्कर का सर्वोच्च सम्मान दिया। 

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