मोमोआ का जन्म 1979 में होनोलुलु, हवाई में हुआ था। वे अपने माता-पिता की इकलौती औलाद हैं। उनकी माता, जिनका नाम कोनी है, फोटोग्राफर हैं जबकि उनके पिता, जोसफ मोमोआ, चित्रकार हैं। उनका लालन-पालन नोरवॉक, जो कि आईओवा (अमरीकी राज्य) में है, में उनकी माता द्वारा हुआ। उच्च शिक्षा के बाद, मोमोआ ने कॉलेज में समुद्री जीव विज्ञान की पढ़ाई की। 
नौजवान होने पर, मोमो ने बहुत ज्यादा भ्रमण किया। उन्होंने पेरिस में पस्टेल पेंटिंग्स सीखी तथा तिब्बत में बौद्धिक ज्ञान प्राप्त किया।

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