दुनिया भर से फ्रैंकफर्ट हवाई अड्डे पर ("फ्लुघाफेन फ्रैंकफर्ट एम मेन") के माध्यम से इस शहर में पहुंचा जा सकता है। 
शहर केंद्र से पर स्थित है। हवाई अड्डे के तीन रनवे हैं और यहां से 265 ठिकानों की अविराम उड़ानों को सेवा प्रदान की जाती है। विश्व के दस शीर्ष हवाई अड्डों में यह शामिल है और यूरोप में यह सबसे बड़ा कार्गो हवाई अड्डा है। यह हवाई अड्डा एयर इंडिया, कोंडोर के लिए एक हब की भी सेवा प्रदान करता है और जर्मन फ्लैग कैरियर लुफ्थांसा के लिए मुख्य हब के रूप में काम आता है। यात्रियों या उड़ानों की कुल संख्या के आधार पर यह यूरोप में लंदन के हीथ्रो हवाई अड्डे और पेरिस के चार्ल्स डी गाल हवाई अड्डे के साथ-साथ दूसरा या तीसरा व्यस्ततम हवाई अड्डा है। 2009 में फ्रैंकफर्ट हवाई अड्डे में आने-जानेवाले यात्रियों की संख्या 50.9 मिलियन थी।
कार या बस से हवाई अड्डे पहुंचा जा सकता है और यहां दो ट्रेन स्टेशन भी हैं, एक क्षेत्रीय और एक लंबी दूरी के यातायात के लिए। एस-बान की S8 और S9 लाइनें ("फ्रैंकफर्ट (मेन) Hbf", "ओफ्फेनबाख ost या "हनाऊ" की ओर), क्षेत्रीय ट्रैफिक स्टेशन से छूटकर 10-15 मिनट में सेंट्रल स्टेशन और सिटी सेंटर पहुंच जाती हैं और IC और ICE ट्रेनें भी लंबी दूरी के ट्रैफिक स्टेशन से चलकर 10-15 मिनट में अपने गंतव्यों तक पहुंच जाती हैं। 

नाम के बावजूद, फ्रैंकफर्ट हान हवाई अड्डा ("फ्लुघाफेन फ्रैंकफर्ट हान") फ्रैंकफर्ट के पास स्थित नहीं है, बल्कि शहर से लगभग दूर लौत्जेनहौसेन शहर (राईनलैंड-पैलाटीनेट) में है। केवल कार या बस से इस हवाई अड्डे तक पहुंचा जा सकता है। फ्रैंकफर्ट सेंट्रल स्टेशन से घंटे-घंटे की बस सेवा है, जिसे 1 घंटा और 45 मिनट का समय लगता है। रेनायर जैसी कम लागत एयरलाइंस का उपयोग करने के लिए पिछले साल 4 मिलियन से अधिक यात्रियों ने इस हवाई अड्डे का इस्तेमाल किया।

फ्रैंकफर्ट ईगल्सबाख हवाई अड्डा एक व्यस्त आम विमानन हवाई अड्डा है, जो ईगल्सबाख शहर के करीब फ्रैंकफर्ट अंतर्राष्ट्रीय हवाई अड्डे के दक्षिण-पूर्व में स्थित है।

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