बेरी की दो बार शादी हुई हैं. उनकी पहली शादी 1 जनवरी 1993 को ठीक आधी रात के बाद पूर्व बेसबॉल खिलाड़ी डेविड जस्टिस से हुई. दोनों सन् 1996 में अलग हो गए और सन् 1997 में उनके तलाक को अंतिम रूप दे दिया गया. जस्टिस, अटलांटा ब्रेव्स के साथ खेले और प्रसिद्धि की एक हद का अनुभव किया जब टीम ने सन् 1990 के दशक के आरम्भ में प्रमुखता हासिल की. जब वे बेसबॉल खेल रहे होते थे और जब वह कहीं फिल्म की शूटिंग में व्यस्त रहती थी तो दोनों के लिए अपने सम्बन्ध को बनाए रखना मुश्किल जाता था. बेरी ने सार्वजनिक तौर पर कहा है कि जस्टिस से अलग होने के बाद वह इतनी उदास हो गई थी कि उन्होंने अपनी जान लेने का विचार कर लिया लेकिन अपनी मां को अपनी लाश मिलने की बात को वह सहन नहीं कर सकती थी.

बेरी की दूसरी शादी संगीतकार एरिक बेनेट के साथ हुई थी. वे सन् 1997 में मिले और सन् 2001 के आरम्भ में सैंटा बारबरा में एक बीच पर उन्होंने शादी कर ली. बेरी ने उस समर्थन का श्रेय बेनेट को दिया जब वह फ़रवरी 2000 के यातायात दुर्घटना में फंस गई थी जिसमें उन्हें चोट लग गई थी और पुलिस के पहुंचने से पहले वह दुर्घटना स्थल को छोड़कर चली गई थी. मीडिया के कुछ लोगों ने शिकायत की कि सबसे पहले उनके टक्कर मारकर भागने के अपराध पर कार्यवाही की जानी चाहिए थी; तीन साल पहले घटी एक कथित टक्कर मारकर भागने वाली घटना में भी वही चालक थी जिसमें उनके खिलाफ़ कोई आरोप नहीं लगाया गया था. यह घटना हास्य कलाकारों के लिए एक चारा बन गया. बेरी ने कोई प्रतिवाद नहीं किया, सामुदायिक सेवा की, जुर्माना दिया और उन्हें तीन साल की निगरानी पर रखा गया. दीवानी मुक़दमे को अदालत के बाहर निपटा लिया गया.

दोनों सन् 2003 में अलग हो गए. अलग होने के बाद, बेरी ने बताया, "मुझे प्यार चाहिए और मुझे उम्मीद है कि मुझें यह जरूर मिलेगी". बेनेट से शादी करने के बावजूद बेरी ने अपनी बेटी, इंडिया को गोद लिया. जनवरी 2005 में तलाक को अंतिम रूप दे दिया गया.

बेरी घरेलू हिंसा का शिकार रही हैं और अब वह अन्य शिकारग्रस्त लोगों की मदद करने का काम करती हैं. सन् 2005 में उन्होंने कहा, "घरेलू हिंसा के बारे में मैं तब से जानती हूं जब मैं एक बच्ची थी. मेरी मां इसका शिकार थी. अपने जीवन के शुरू में मैंने कुछ चुनाव किए और मैं उन पुरुषों को चुना जो अभद्र थे क्योंकि यह वही बात थी जिसके बारे में मुझे अपने बड़े होने के दौरान मालूम हुआ...पहली बार ऐसा हुआ, मुझे अच्छी तरह से मालूम था कि मुझे और आगे बढ़ना था."

नवम्बर 2005 में, बेरी ने खुद से नौ वर्ष छोटे फ़्रांसिसी-कैनेडियन सुपर मॉडल गैब्रियल ऑब्री से डेटिंग शुरू की. दोनों की मुलाक़ात वर्सेस की एक फोटोशूटिंग में हुई. ऑब्री के साथ छः महीनों के बाद, उन्होंने एक साक्षात्कार में बताया, "मैं अपनी निजी जिन्दगी में वाकई बहुत खुश हूं, जो मेरे लिए एक नई बात है. आपको पता है, मैं वह लड़की नहीं हूं जिसे सबसे अच्छे सम्बन्ध प्राप्त हुए हैं".

एक बार, बेरी ने संकेत दिया था कि बच्चों को गोद लेने की उनकी योजना थी लेकिन "थिंग्स वी लॉस्ट इन द फ़ायर" में मां की भूमिका निभाने के उनके अनुभव ने मातृत्व की सम्भावना के लिए उनके मन के द्वार खोल दिए. शुरू में अफवाहों से इनकार करने के बाद उन्होंने सितम्बर 2007 में इस बात की पुष्टि की कि वह तीन महीनों से गर्भवती थी. बेरी ने 16 मार्च 2008 को लॉस एंजिलिस के सेडार्स-सिनाई मेडिकल सेंटर में एक लड़की को जन्म दिया जिसका नाम नाहला ऐरिएला ऑब्री पड़ा. अरबी भाषा में नाहला का अर्थ "मधुमक्खी" है; ऐरिएला "ईश्वर के लिए सिंह" का हिब्रू शब्द है." अपनी अजन्मे शिशु के विरूद्ध जातिवादी धमकियों के मिलने के बाद बेरी ने सुरक्षा गार्डों को काम पर रखा जिसमें एक शिकारी के तरफ से कहा गया था कि उनके बच्चे को "सैकड़ों टुकड़ों में काट" दिया जाएगा.

एक बार, बेरी ने संकेत दिया कि उनका दुबारा शादी करने का इरादा नहीं था और इस बात पर ज़ोर दिया कि दोनों की जिन्दगी बिना शादी की जरूरत के पहले से ही परिपूर्ण थी. उन्होंने बताया है कि उन्होंने बस कुछ ही दिनों में एक दूसरा बच्चा होने की उम्मीद है." ऑब्री ने हाल ही में "इन टच" मैगज़ीन को बताया, "मैं चाहता हूं कि नाहला को सन् 2009 में एक भाई या बहन मिले."

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