नियाग्रा फ्रंटियर ट्रांसपोर्टेशन अथोरिटी (एनएफटीए) बफ़ेलो क्षेत्र में बफ़ेलो नियाग्रा अंतरराष्ट्रीय हवाई अड्डे, नियाग्रा फॉल्स अंतरराष्ट्रीय हवाई अड्डे तथा सार्वजनिक परिवहन प्रणाली का संचालन कर रही है। एनएफटीए शहर और उपनगरों में बस सेवाएं संचालित करती है, साथ ही शहर में मेट्रो रेल ट्रांजिट सिस्टम भी.

मेट्रो रेल एक लंबी एकल पंक्ति हलकी रेल प्रणाली है जो बफ़ेलो के व्यापारिक केन्द्र में एरी नहर हार्बर से शहर के उत्तरी भाग में यूनिवर्सिटी हाइट्स जिले (विशेष रूप से बफ़ेलो विश्वविद्यालय के दक्षिणी परिसर) तक जाती है। डाउनटाउन अनुभाग में मेट्रो रेल लाइन जमीन के ऊपर से जाती है तथा यात्रियों के लिए निशुल्क है। थिएटर स्टेशन के उत्तर में डाउनटान के उत्तरी छोर पर, रेल लाईन भूमिगत हो जाती है और यूनिवर्सिटी हाइट्स पर उत्तरी टर्मिनस तक भूमिगत ही रहती है। रेल के इस खंड की सवारी करने के लिये यात्रियों को किराया भुगतान करना होता है।

एनएफटीए की एक नई परियोजना चल रही है जिसे अक्सर 'कार्स ऑन मेन स्ट्रीट' कहा जाता है, मेट्रो रेल मुख्य शहर के हिस्से को संशोधित करेगा. इससे वाहनों का यातायात और मेट्रो रेल कार सैन फ्रांसिस्को की ट्रॉलियों की भांति मेन स्ट्रीट को साझा कर सकेंगे. नई योजना में नये स्टेशन तथा पैदल यात्रियों के अनुकूल सुधार भी शामिल है। एडवर्ड एवं पश्चिम टपर के बीच मेन स्ट्रीट पर दो तरफा यातायात बहाल करने संबंधी कार्य 2009 में पूरा हुआ। अगले कुछ वर्षों में जब पूरी परियोजना पूर्ण हो जायेगी, तो मेनस्ट्रीट का डउनटाउन भाग वाहनों के यातायात के लिए पुनः खोल दिया जायेगा.हो जाएगा फिर से लगभग 30 वर्षों में पहली बार के लिए खोला गया।

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