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मैकियास ने अपने परिवार के कई सदस्यों की हत्याओं का आदेश देने के बाद, जिसमें ओबियांग के भाई, ओबियांग और मैकियास के अंदरूनी सर्कल के अन्य लोग शामिल थे, को आशंका थी कि राष्ट्रपति पागल हो गए हैं। ओबियांग ने 3 अगस्त 1979 को एक खूनी तख्तापलट ,  अपने चाचा को उखाड़ फेंका और पिछले एक दशक में बूबी लोगों के नरसंहार सहित अपने कार्यों के लिए परीक्षण पर रखा । मैकियास को 29 सितंबर 1979 को फायरिंग दस्ते द्वारा मौत की सजा दी गई थी। फायरिंग दस्ते के गठन के लिए एक नए मोरक्को के राष्ट्रपति गार्ड की आवश्यकता थी, क्योंकि स्थानीय सैनिकों को उसकी कथित जादुई शक्तियों का डर था। 

ओबियांग ने घोषणा की कि नई सरकार मैकियास की क्रूर और दमनकारी शासन से एक नई शुरुआत करेगी। उन्होंने राजनीतिक कैदियों को माफी दी, और पिछले श्रम की जबरन व्यवस्था को समाप्त कर दिया। हालाँकि, उन्होंने अपने चाचा के शासन में हुए अत्याचारों में अपनी भूमिका का कोई उल्लेख नहीं किया। 

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