मूल शिखा नीला था। बवेरिया के रंग 1954 में पहली बार के लिए शामिल किया गया। शिखा का आधुनिक संस्करण कई कदम 1954 में संस्करण से विकसित किया गया है। शिखा ही ज्यादातर समय के लिए एक ही रंग के शामिल हुए, अर्थात् नीले या लाल, वर्तमान (2008) शिखा, नीले, लाल और सफेद है। यह इसके केंद्र में बवेरिया के रंग है और एफसी बेयर्न म्यूनिख बवेरियन रंग संलग्न एक लाल चक्र पर सफेद में लिखा है।

मूल क्लब संविधान में, बेयर्न का रंग सफेद और नीले रंग के रूप में नामित किया गया है, लेकिन क्लब बेयर्न एमएससी में शामिल हो गए जब 1905, जब तक काले शॉर्ट्स के साथ सफेद शर्ट में खेला था। एमएससी फुटबॉल खिलाड़ी लाल शॉर्ट्स में खेलने के लिए होगा फैसला सुनाया. इसके अलावा युवा खिलाड़ियों के अपमान के रूप में मतलब था जो लाल शॉर्ट्स, कहा जाता था। बेयर्न अपने अस्तित्व के अधिकांश के लिए लाल और सफेद में निभाई है, लेकिन नीले अवसर पर शामिल किया गया है।

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