Htt प्रोटीन 100 से ज़्यादा अन्य प्रोटीनों के साथ परस्पर क्रि‍या करता है और इसमें एकाधि‍क जैविक कार्यों की मौजूदगी प्रतीत होती है। उत्परि‍वर्ती mHtt प्रोटीन के व्यवहार को पूरी तरह नहीं समझा गया है, परंतु यह कुछेक प्रकार की कोशि‍काओं के लिए वि‍षाक्त है, वि‍शेष रूप से मस्तिष्क के लिए. मुख्यतः क्षति स्ट्रिएटम को पहुंचती है, लेकिन जैसे-जैसे रोग बढ़ता है, मस्तिष्क के अन्य हिस्से भी पर्याप्त रूप से प्रभावित होते हैं। क्षति के जमा होने पर, मस्ति‍ष्क के इन भागों के कार्यों से जुड़े लक्षण प्रकट होते हैं। गति की योजना और नियंत्रण स्ट्रिएटम के मुख्य कार्य हैं और इनमें परेशानियां प्रारंभिक लक्षण हैं।

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