पुनर्वास के लिए, स्टॉफ़ेनबर्ग को अपने घर भेज दिया गया, श्लोस लाउटलिंगेन (आज एक संग्रहालय) उस वक्त वह दक्षिणी जर्मनी में स्टॉफ़ेनबर्ग महल था। प्रारंभ में, वे इस बात से निराश हुए कि वे खुद एक तख्तापलट करने की स्थिति में नहीं हैं। लेकिन 1943 के सितंबर की शुरुआत से, अपने जख्मों से कुछ उबरने के बाद, उन्हें साजिश कर्ताओं द्वारा तैनात किया गया और उनकी मुलाक़ात हेनिंग वॉन ट्रेस्कोव से कराई गई जो "एर्सात्ज़हीर" ("प्रतिस्थापक सेना" - जिसका काम था सैनिकों को मोर्चे पर पुनः भेजने के लिए प्रशिक्षण देना) के मुख्यालय के लिए एक स्टाफ अधिकारी थे, जो बर्लिन में "बेंडलस्ट्रासे" (बाद में "स्टॉफ़ेनबर्गस्ट्रासे") पर स्थित था।

वहां, स्टॉफ़ेनबर्ग का एक वरिष्ठ था जनरल फ्रेडरिक ओल्ब्रिष्ट जो प्रतिरोध आन्दोलन का एक प्रतिबद्ध सदस्य था। "एर्सात्ज़हीर" के पास एक तख्तापलट शुरू करने का एक अद्वितीय अवसर था, क्योंकि उनका एक कार्य था ऑपरेशन वैलकिरी को व्यवस्थित करना। यह एक आपात उपाय था जो उन्हें उस हालात में "राइक" का नियंत्रण हासिल करने देता जब आंतरिक गड़बड़ी उच्च सैन्य शासन तक संचार को अवरुद्ध कर दे। विडंबना यह थी कि "वैलकिरी" योजना पर हिटलर ने अपनी सहमती दी थी पर जिसे अब चुपके से उसकी मृत्यु के बाद उसके बाकी शासन का सफाया करने के उद्देश्य में परिवर्तित कर दिया गया था।

एक विस्तृत सैन्य योजना को न सिर्फ बर्लिन पर कब्जा करने के लिए विकसित किया गया, बल्कि 1943 में नवम्बर के अंत में एक्सेल वोन डेम बुशे द्वारा पूर्व प्रशिया में हिटलर की आत्मघाती हत्या के बाद सैन्य बालों द्वारा विभिन्न जर्मन मुख्यालयों पर कब्जा करने के लिए भी बनाया गया। स्टॉफ़ेनबर्ग ने वोन डेम बुशे द्वारा इन लिखित आदेश को मेजर कुन तक व्यक्तिगत रूप से पहुंचाने की योजना बनाई जब वे पूर्व प्रशिया में रास्टेनबर्ग के नज़दीक "वोल्फशान्ज़" (भेड़िये की मांद) पहुंचते. हालांकि, हिटलर के साथ बैठक रद्द होने के बाद वॉन डेम बुशे पूर्वी मोर्चे के लिए वोल्फशांज़ से निकल पड़ा था और प्रयास नहीं किया जा सका। कुन ने इन गुप्त दस्तावेजों को OKW स्थित एक निगरानी टॉवर के नीचे छुपाया था, जो वोल्फशान्ज़ से ज्यादा दूर नहीं था।

20 जुलाई की साजिश के बाद कुन सोवियत संघ का युद्धबंदी बन गया। वह फरवरी 1945 में दस्तावेजों को छिपाने के स्थान पर सोवियत संघ को ले गया। 1989 में सोवियत नेता मिखाइल गोर्बाचेव ने उस वक्त के जर्मन चांसलर डॉ॰ हेल्मुट कोल को ये दस्तावेज़ सुपुर्द किये। इन दस्तावेजों ने जिन्हें 1943 में स्टॉफ़ेनबर्ग और उनके साथी अधिकारियों द्वारा बर्लिन में प्रस्तुत किया गया, प्रतिरोध समूह की आदर्शवादी प्रेरणा का खुलासा किया। इस पर शक किया गया था और जर्मनी में वर्षों के लिए चर्चा का विषय युद्ध के बाद किया गया था। कुछ लोगों का मानना था कि साजिशकर्ता हिटलर को इसलिए समाप्त करना चाहते थे ताकि वे युद्ध को समाप्त कर सकें और पेशेवर अधिकारियों के रूप में अपने विशेषाधिकार के नुकसान को बचा सकें.

6 जून 1944 को मित्र राष्ट्र स्वंतंत्रता दिवस के दिन फ्रांस पहुंचे। अधिकांश अन्य जर्मन पेशेवर सैन्य अधिकारियों की तरह स्टॉफ़ेनबर्ग को भी बिल्कुल कोई शक नहीं था कि युद्ध हारा जा चुका है। केवल एक तत्काल युद्धविराम ही अनावश्यक रक्तपात और जर्मनी की, इसके लोगों की और अन्य यूरोपीय देशों की अधिक क्षति को बचा सकता है। हालांकि, 1943 के अंत में, उन्होंने कुछ मांगे रखी जो उनके विचार से जर्मनी द्वारा तत्काल शांति पर सहमत होने के लिए मित्र राष्ट्रों द्वारा अनुपालन आवश्यक है। इन मांगों में शामिल था कि जर्मनी 1914 के अपनी पूर्वी सीमाओं को बनाए रखेगा जिसमें शामिल था विल्कोपोल्स्का और पॉज़्नान के पोलिश के क्षेत्र. अन्य मांगों में था ऑस्ट्रिया और सुदेतनलैंड के क्षेत्रीय लाभ पर राइक का कब्जा और अल्सेस-लोरेन को स्वायत्तता देना और दक्षिण में जर्मनी की वर्तमान युद्ध सीमाओं को टेरोल को बोल्जानो और मेरान तक कब्जा कर के बढ़ाना. गैर क्षेत्रीय मांगों में शामिल था मित्र राष्ट्रों द्वारा जर्मनी के किसी भी हिस्से पर कब्जे से इनकार, साथ ही साथ युद्ध अपराधियों को सौंपने से इनकार जिन पर उस देश में ही निपटने का कार्य होगा। इन प्रस्तावों को केवल पश्चिमी मित्र राष्ट्रों के लिए निर्देशित किया गया था - स्टॉफ़ेनबर्ग चाहते थे कि जर्मनी केवल पश्चिमी, दक्षिणी और पूर्वी मोर्चों से पीछे हटे, जबकि पूर्व की ओर उन्होंने प्रादेशिक लाभ के लिए जर्मन सैनिक कब्जे को जारी रखने की मांग की। 

अन्य दृष्टिकोण
प्रतिरोध में, 1943-1944
पोलैंड पर विजय, 1939
ट्यूनीशिया, 1942