बैंड ने आठ संगीत वीडियो रिलीज किये हैं लेकिन केवल पहले दो में ही व्यक्तिगत उपस्थिति है, जिसके बारे में बैंड का कहना है कि ऐसा लोगों को "संगीत सुनने की बजाय इसमें शामिल व्यक्तित्वों पर ध्यान देने" से रोकने के लिए किया गया है। "हश" और "विकैरियस" के अपवाद के साथ, टूल के सभी संगीत वीडियो कुछ हद तक स्थिर गति का एनीमेशन दिखाते हैं। सभी वीडियो मुख्य रूप से एडम जोन्स द्वारा, अक्सर कलाकारों जैसे शेत ज़ार, एलेक्स ग्रे, और ओसियस लैबिरिंट के सहयोग से निर्मित हैं।

"सोबर" संगीत वीडियो ने विशेषकर अधिक ध्यान आकर्षित किया है। जोन्स ने बताया कि इसमें कोई कथानक शामिल नहीं है, लेकिन यह भी कहा कि उनका इरादा निजी भावनाओं को अपने काल्पनिक रूप में उभारना था। "रॉलिंग स्टोन" ने इस काल्पनिक चित्रण का वर्णन यह कहते हुए किया कि, वीडियो में, "शैतान नाटा व्यक्ति एक अँधेरे तहखाने में पाइपों के जरिये दीवार पर लगे मांस को नोंचते हुए दौड़ रहा है" और इसे एक "असाधारण", "पौराणिक" क्लिप बताया. "बिलबोर्ड" ने इसे "एक नए कलाकार का सर्वश्रेष्ठ वीडियो" चुना.

विकैरियस का वीडियो 18 दिसम्बर 2007 को डीवीडी पर रिलीज किया गया था। यह वीडियो भी उल्लेखनीय है क्योंकि यह पूर्णतः सीजीआई (CGI) के जरिये तैयार किया गया पहला टूल वीडियो है। 

गिटार वर्ल्ड के अप्रैल 2009 के अंक में, एडम जोन्स ने उल्लेख किया कि बैंड अपने गाने "द पॉट" के लिए एक वीडियो पर काम कर रहा है, लेकिन तब से कोई भी अपडेट नहीं किया गया है कि वे अपनी योजनाओं के अनुसार काम कर रहे हैं या नहीं.

संगीत शैली और प्रभाव
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