फ़िल्म की पटकथा लेखन का श्रेय लॉर्ड और रोडनी रोथमैन को दिया गया है, तथा इसकी कहानी लॉर्ड ने लिखी है - यह पहली फ़िल्म है, जिसकी कहानी उन्होंने मिलर के बिना ही लिखी है। चूंकि स्पाइडर-मैन पर आधारित कई फ़िल्में पहले भी बन चुकी थीं, टीम ने महसूस किया कि उन्हें पहले यह तय करना चाहिए कि इसे बनाने की ज़रूरत क्यों है; उनका उत्तर माइल्स मोरालिस की कहानी बताने के लिए था, जो अभी तक पिछली किसी भी फ़िल्म में दिखाई नहीं दिया था। माइल्स मोरालिस के सह-निर्माता, ब्रायन माइकल बेंडिस ने फ़िल्म अनुकूलन पर परामर्श किया। फ़िल्म के लिए एनिमेटिक्स और स्टोरीबोर्ड का पहला पूर्ण कट दो घंटे से अधिक लंबा था, जो कि एनिमेटेड फ़िल्मों के लिए असामान्य है, और निर्देशकों ने इसके लिए ज्यादातर लॉर्ड और मिलर को जिम्मेदार ठहराया और फ़िल्म में कई तत्वों को जोड़ने के उनके इस दृष्टिकोण को, जिसमें वे यह देखने के इरादे से चीज़ें जोड़ते गए कि फ़िल्म कितनी चीजें "संभाल" सकती है, और फिर वहां से फ़िल्म को आकार देना शुरू किया। उन्होंने कहा कि अंतिम रनटाइम उस और ९० मिनट के बीच होगा, जो एक एनिमेटेड फ़िल्म की मानक लंबाई है, और फ़िल्म के दो महत्वपूर्ण तत्वों के बीच संतुलन बनाया जाएगा ताकि यह एक बड़े बच्चे-आधारित दर्शक वर्ग की एक एनिमेटेड फ़िल्म की अपेक्षाओं पर, और कहानी की आवश्यकताओं पर खरी उतरे, जो कि - निर्देशकों के अनुसार - स्पाइडर मैन की अधिकतर लाइव-एक्शन फ़िल्मों के समान थी, क्योंकि फ़िल्म में बड़ी संख्या में पात्र थे।

फ़िल्म में मूल रूप से माइल्स मोरालिस और स्पाइडर-ग्वेन के बीच रोमांस को दर्शाने की तैयारी की गई थी। जब इस विचार को निरस्त कर दिया गया था, उसके बाद भी स्पाइडर-ग्वेन को फ़िल्म में प्रमुखता से दिखाया गया, ज्यादातर निर्माता क्रिस्टीना स्टाइनबर्ग के प्रयासों के कारण, जिस पर लॉर्ड ने कहा कि "क्रिस्टीना ने हमें ईमानदार रखा, [हम] पांच लड़कों ने जहाँ एक फ़िल्म बनाई, वहाँ एक और फ़िल्म निर्माता का होना बहुत अच्छा था, जो बोले कि 'मुझे नहीं लगता आप लोग इसे इस तरह करना चाहते हैं।'" अगस्त २०१८ तक, निर्देशकों ने फ़िल्म के लिए एक संभावित पोस्ट-क्रेडिट दृश्य भी तय कर लिया; यह देखते हुए कि दर्शकों को मार्वल फ़िल्मों से अब इनकी अपेक्षा रहती है।

कथानक
पात्र चयन
टेलीविजन श्रृंखला
लेखन