मिनेसोटा विधायिका में अपने समय के दौरान, उमर इजरायल सरकार के आलोचक थी और बॉयकॉट, विभाजन और प्रतिबंध (बीडीएस) आंदोलन को प्रतिबंधित करने के उद्देश्य से एक कानून का विरोध किया। उन्होंने दक्षिण अफ्रीका में रंगभेद के "बहिष्कार" में संलग्न लोगों के आंदोलन की तुलना की। अपने सदन अभियान के दौरान, उन्होंने कहा कि उन्होंने बीडीएस आंदोलन का समर्थन नहीं किया, इसे शांति के प्रति प्रतिकारपूर्ण बताया। चुनाव के बाद, उसकी स्थिति बदल गई, क्योंकि उसके अभियान कार्यालय ने "मुस्लिम लड़की को" बताया कि वह "स्थायी समाधान पूरा करने में आंदोलन की प्रभावशीलता पर आरक्षण" के बावजूद बीडीएस आंदोलन का समर्थन करती है। उमर ने इजरायल-फिलिस्तीनी संघर्ष को हल करने के लिए दो-राज्य समाधान के लिए समर्थन दिया है। उसने वेस्ट बैंक में कब्जे वाले फिलिस्तीनी क्षेत्रों में इजरायल के निपटान की आलोचना की। 

2018 में, उमर मिनेसोटा विधायिका में होने से पहले इजरायल के बारे में दिए गए बयानों के लिए आलोचना की। 2012 के एक ट्वीट में, उसने लिखा, "इज़राइल ने दुनिया को सम्मोहित कर दिया है, अल्लाह लोगों को जागृत कर सकता है और उन्हें इज़राइल के बुरे कामों को देखने में मदद कर सकता है।" टिप्पणी, विशेष रूप से यह धारणा कि इजरायलियों ने "दुनिया को सम्मोहित कर दिया था" की आलोचना की गई थी, जो कि यहूदी विरोधी ट्रॉप पर ड्राइंग के रूप में की गई थी। "न्यूयॉर्क टाइम्स के" स्तंभकार बारी वीस ने लिखा है कि उमर का बयान एक सहस्राब्दी पुराने "यहूदी सिद्धांत को सम्मोहक साजिशकर्ता" के रूप में बांधा गया है। एक साक्षात्कार में जब उनसे पूछा गया कि वह उन अमेरिकी यहूदियों को कैसे जवाब देंगी जिन्होंने टिप्पणी को अपमानजनक पाया, तो उमर ने कहा, "मुझे नहीं पता कि मेरी टिप्पणी यहूदी अमेरिकियों के लिए कैसे आक्रामक होगी। मेरी टिप्पणियाँ सटीक रूप से यह बता रही हैं कि गाजा युद्ध के दौरान क्या हो रहा था और मैं स्पष्ट रूप से उस युद्ध में इजरायल के शासन का संचालन करने के तरीके के बारे में बोल रही हूं। " बाद में, वीस की टिप्पणी को पढ़ने के बाद, उमर ने "अनजाने में इस्तेमाल किए गए विरोधी सेमेटिक ट्रॉप का अनादर नहीं करने" के लिए माफी मांगी। 

फरवरी 2019 में पत्रकार ग्लेन ग्रीनवल्ड के साथ एक आदान-प्रदान में, उमर ने ट्वीट किया, "यह सब बेंजामिन बेबी के बारे में है" अमेरिकी राजनेताओं के इजरायल के समर्थन के संदर्भ में और अमेरिकी इजरायल पब्लिक अफेयर्स कमेटी (एआईपीएसी) का आह्वान किया। डेमोक्रेटिक नेताओं की एक संख्या - जिसमें हाउस स्पीकर नैन्सी पेलोसी , मेजरिटी लीडर स्टेनी होयर और मेजरिटी व्हिप जिम क्लाइबर्न ने ट्वीट को प्रमुखता से शामिल किया, जिसकी व्याख्या यह थी कि यह अर्थ लगाया जाता था कि पैसे अमेरिकी इजराइल के समर्थन को बढ़ावा दे रहे थे। डेमोक्रेटिक हाउस के नेतृत्व ने एक बयान जारी किया जिसमें उमर के ट्वीट को असामाजिक और "गहरा आक्रामक" कहा गया। यहूदी डेमोक्रेटिक काउंसिल ऑफ अमेरिका ने उनके बयानों की निंदा की। उमर ने अगले दिन माफी जारी करते हुए कहा, "मैं यहूदी सहयोगियों और सहकर्मियों के लिए आभारी हूं, जो मुझे अर्ध-विरोधी ट्रॉप्स के दर्दनाक इतिहास पर शिक्षित कर रहे हैं", जोड़ते हुए, "मैं हमारी राजनीति में लॉबिस्टों की समस्यापूर्ण भूमिका की पुष्टि करती हूं। " 

27 फरवरी, 2019 को, उमर ने एक किताब की दुकान पर बात की और अपने आलोचकों से कहा, "मैं इस देश में राजनीतिक प्रभाव के बारे में बात करना चाहता हूं जो कहता है कि लोगों को किसी विदेशी देश के प्रति निष्ठा के लिए धक्का देना ठीक है।" दोहरे निष्ठा के यहूदी विरोधी रस्सियों पर कथित रूप से ड्राइंग के रूप में बयानों की आलोचना की गई। हाउस फॉरेन अफेयर्स कमेटी के अध्यक्ष एलियट एंगेल ने कहा कि "साथी अमेरिकी नागरिकों की वफादारी पर सवाल उठाना गहरा था" और उमर को उनके बयान को वापस लेने के लिए कहा। हाउस एप्रूवमेंट्स कमेटी की अध्यक्ष नीता लोवे ने माफी भी मांगी और 3 मार्च के ट्वीट में बयानों की आलोचना की, जिससे दोनों के बीच ऑनलाइन आदान-प्रदान हुआ। जवाब में, उमर ने अपनी टिप्पणी की पुष्टि की, जिसमें उन्होंने कहा कि "कांग्रेस में मेरे देश की सेवा करने या समिति पर सेवा करने के लिए किसी विदेशी देश के प्रति निष्ठा / प्रतिज्ञा समर्थन की उम्मीद नहीं की जानी चाहिए।" उमर के प्रवक्ता जेरेमी स्लेविन ने कहा कि उमर "विदेशी हितों के लिए लॉबिंग समूहों के अनुचित प्रभाव" के बारे में बात कर रहे थे। सीनेटर एलिजाबेथ वारेन , कमला हैरिस , और बर्नी सैंडर्स ने उमर का बचाव करते हुए उनकी टिप्पणियों के खिलाफ प्रतिक्रिया दी। सैंडर्स ने कहा कि हाउस फॉरेन अफेयर्स कमेटी से उमर को हटाने की आलोचना और प्रयास "उद्देश्य था कि इजरायल के साथ अमेरिकी नीति के बारे में चर्चा को रोकना।" ब्लैक कॉकस के कुछ सदस्यों का मानना था कि उमर को गलत तरीके से निशाना बनाया गया था क्योंकि वह एक अश्वेत मुस्लिम था, यह देखते हुए कि "डेमोक्रेटिक नेतृत्व ने डोनाल्ड ट्रम्प या अन्य श्वेत पुरुष रिपब्लिकन की निंदा करने वाले प्रस्ताव की निंदा नहीं की।" दूसरे दौर की टिप्पणियों ने डेमोक्रेटिक नेतृत्व को एक प्रस्ताव पेश करने के लिए प्रेरित किया जो असामाजिकता की निंदा करता है लेकिन उमर का नाम लिए बिना। कई प्रगतिशील प्रगतिशील डेमोक्रेट्स की आपत्तियों के बाद, इस्लामोफोबिया, नस्लवाद और होमोफोबिया को शामिल करने के लिए प्रस्ताव में संशोधन किया गया, और 7 मार्च को सदन ने संशोधित प्रस्ताव पारित किया। उमर ने संकल्प को "कई मोर्चों पर ऐतिहासिक" कहा, और कहा, "हमें एक ऐसे शरीर का हिस्सा होने पर गर्व है, जिसने यहूदी-विरोधी, जातिवाद, और सफेद वर्चस्व सहित सभी प्रकार के कट्टरपंथियों की निंदा की है।" 

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