ऐतिहासिक रूप से, भारत, चीन, पुर्तगाल, अरब और नीदरलैंड से आप्रवासन देश के भीतर धर्म और संस्कृति की विविधता में एक बड़ा योगदानकर्ता रहा है। हालांकि, इन पहलुओं में बदलाव आया है क्योंकि इंडोनेशियाई संस्कृति के अनुरूप कुछ संशोधन किए गए हैं। इस्लाम, ईसाई धर्म और यहूदी धर्म के अब्राहमिक विश्वासों के आगमन से पहले, इस क्षेत्र में लोकप्रिय विश्वास प्रणाली हिंदू धर्म और बौद्ध धर्म के माध्यम से धार्मिक दर्शन से पूरी तरह से प्रभावित थीं। इन धर्मों को क्रमशः दूसरी और चौथी शताब्दियों के आसपास इंडोनेशिया लाया गया था, जब भारतीय व्यापारी सुमात्रा, जावा और सुलावेसी के द्वीपों पर पहुंचे, जिससे उनका धर्म आ गया। पांचवें शताब्दी ईस्वी में जावा में शैववादी परंपराओं का हिंदू धर्म विकसित होना शुरू हुआ। व्यापारियों ने इंडोनेशिया में बौद्ध धर्म भी स्थापित किया जो निम्नलिखित शताब्दी में आगे विकसित हुआ और कई हिंदू और बौद्ध प्रभावित साम्राज्यों की स्थापना की गई, जैसे कुट्टाई, श्रीविजय, माजापाहित और सेलेंद्र।

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