6 जून, 1 9 5 9 को, इंटेलैक्यूलेट कॉन्सेप्शन के कैथेड्रल में आर्कििशश शहरी जे। वायर द्वारा हनीफ़ेन को पुजारी बनाया गया था। उनकी पहली नियुक्ति एस्टेस पार्क में माउंटेनस चर्च में अंडर लेडी ऑफ में सहायक पादरी के रूप में थी। इसके बाद उन्होंने 1 9 66 तक पवित्र गर्भधारण के कैथेड्रल में कार्य किया, जब उन्हें कैथोलिक विश्वविद्यालय में अपनी पढ़ाई के लिए भेजा गया। उन्होंने 1 9 66 में मार्गदर्शन और परामर्श में मास्टर ऑफ आर्ट्स की डिग्री हासिल की।
1 9 68 में, हनीफ़ेन ने रोम में पेंटीफिक लेटरन यूनिवर्सिटी से कैनन लॉ का लाइसेंसधारी अर्जित किया रोम में अपने समय के दौरान, वह और उसके कुछ साथी छात्रों ने फ्लोरेंस की यात्रा की, जिसके दौरान उन्होंने नदी अरनो की विनाशकारी बाढ़ का अनुभव किया। डेनवर पर उनकी वापसी के बाद, उन्होंने आर्किडिश के उपाध्यक्ष और 1 968 से 1 9 6 9 तक आर्कबिशप जेम्स वी। केसी के सचिव के रूप में सेवा की। 1 9 6 9 से 1 9 76 तक उन्होंने आर्काडीओसीज के कुलपति के रूप में सेवा की।

कोलोराडो स्प्रिंग्स
बाद का जीवन
पुजारी
बिशप का पद