रजत गुप्ता, अश्विनी कुमार गुप्ता और प्राण कुमारी गुप्ता के पुत्र हैं, जिनकी तीन और संतानें हैं। उनके पिता आनंद बाजार पत्रिका समूह में एक पत्रकार थे। वे एक प्रमुख स्वतंत्रता सेनानी थे और कई बार जेल गये थे। उसकी माँ मोंटेसरी स्कूल में पढ़ाती थीं।

पांच वर्ष की आयु में उनका परिवार दिल्ली आ गया जहां उनके पिता ने हिन्दुस्तान स्टेंडर्ड की शुरुआत की। रजत जब सोलह वर्ष के थे, उनके पिता की मृत्यु हो गयी और अट्ठारह वर्ष की आयु में उनकी माँ भी चल बसीं।

वे दिल्ली पब्लिक स्कूल में एक उत्कृष्ट छात्र थे। उन्होंने भारतीय प्रौद्योगिकी संस्थान दिल्ली से मेकेनिकल इंजीनियरिंग में प्रोद्योगिकी स्नातक की डिग्री प्राप्त की है और हार्वर्ड बिज़नस स्कूल से एम.बी.ए. किया है।

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