होगन का दूसरा दौर एक साल तक चला, जिसके दौरान उन्होंने फ़िल्म "नो होल्ड्स बार्ड" में अभिनय किया। यह फ़िल्म होगन के सह-कलाकार टॉम लिस्टर, जूनियर के साथ लड़ाई की प्रेरणा थी, जो कुश्ती आयोजनों में अपने फ़िल्मी चरित्र ज़्यूस के रूप में दिखाई दिए। ज़्यूस एक दैत्य खलनायक था, जो होगन के उच्च पारिश्रमिक को लेकर "ईर्ष्यालु" था और बदला लेना चाहता था। बहरहाल, 1989 के अंत में देश भर में आयोजित मुकाबलों की श्रृंखला, जो समरस्लैम के एक टैग मैच, जिसमें होगन और ब्रुटस बीफ़केक ने ज़्यूस और सैवेज को हराया, से शुरु हुई, में होगन आसानी से ज़्यूस को हराने में सफ़ल हुए. नो होल्ड्स बार्ड के एक प्रति-दृश्य-भुगतान के दौरान दोबारा हुए एक मुकाबले में होगन और बीफ़केक द्वारा ज़्यूस और सैवेज को हराए जाने पर इस लड़ाई का अंत हुआ।

अपने इस दूसरे दौर में होगन ने 1990 रॉयल रंबल मैच भी जीता। रेसलमेनिया VI में एक खिताब बनाम खिताब मुकाबले में उन्होंने यह खिताब अन्तरमहाद्वीपीय विजेता द अल्टिमेट वारियर के लिए छोड़ दिया.

जल्दी ही मई 1990 में होगन 470-पाउण्ड के अर्थक्वेक के साथ एक भीषण लड़ाई में उलझ गए, जिन्होंने "द ब्रदर लव शो" के गुप्त आक्रमण में होगन की पसलियां तोड़ दीं। टेलीविजन पर, उदघोषकों ने स्पष्ट किया कि होगन की चोटों और रेसलमेनिया VI में द अल्टिमेट वारियर से उनकी हार ने लड़ने के उनके जोश पर इतना अधिक प्रभाव डाला कि वे सन्यास लेना चाहते थे। दर्शकों से होगन को पत्र लिखने और उनकी वापसी की मांग करने वाले पोस्टकार्ड भेजने को कहा गया (बदले में उन्हें "धन्यवाद" के रूप में होगन द्वारा हस्ताक्षरित पोस्टकार्ड-आकार के चित्र मिलते थे)। समरस्लैम 1990 से होगन वापस लौटे और कुछ महीनों तक, देश भर में आयोजित मुकाबलों की श्रृंखला में अर्थक्वेक पर हावी रहे। इस अप्रत्याशित रूप से बड़े दुश्मन को हराने की घटना ने होगन को चौथी आवश्यकता: अपने आप में विश्वास करना, जोड़ने पर बाध्य किया। वे "द इम्मोर्टल" हल्क होगन के रूप में भी जाने जाने लगे। फ़िर 1991 रॉयल रंबल मुकाबला जीतकर होगन लगातार दो रॉयल रंबल मुकाबले जीतने वाले पहले पहलवान बने। 

रेसलमेनिया VII में होगन USA की ओर से सार्जन्ट स्लॉटर के खिलाफ़ लड़े और उन्हें हराकर अपना तीसरा WWF खिताब जीता। 1991 की शरद ऋतु में, होगन को उनके वास्तविक-जीवन के प्रतिद्वंद्वी रिक फ्लेयर, पूर्व NWA विजेता, जो हाल ही में WWF में आए थे, ने चुनौती दी। यह लड़ाई अनिर्णीत रही क्योंकि सर्वाइवर श्रृंखला में होगन अपना WWF खिताब द अण्डरटेकर से हार गए और छः दिनों बाद उन्होंने दिस ट्यूज्डे इन टेक्सास (This Tuesday in Texas) में उसे फ़िर जीता। फ्लेयर ने दोनों मुकाबलों में दखल दिया था और इसके परिणामस्वरूप उपजे विवाद के कारण खिताब को फ़िर रिक्त घोषित किया गया। 

WWF खिताब का निर्णय रॉयल रंबल मुकाबले में 1992 रॉयल रंबल पर लिया गया। अपने मित्र सिड जस्टिस द्वारा बाहर कर दिये जाने के कारण होगन खिताब को वापस पा सकने में विफ़ल रहे और बदले में उन्होंने सिड को बाहर करवा दिया, जिससे रिक फ्लेयर की जीत हुई और वे नए विजेता बन गए। होगन और सिड ने मुद्दों को सुलझा लिया और 8 फ़रवरी 1992 को "सैटरडे नाइट'स मेन इवेंट" के संस्करण में रिक फ्लेयर और अण्डरटेकर के खिलाफ़ जोड़ी बनाई, लेकिन मुकाबले के दौरान सिड ने बीच में ही होगन का साथ छोड़ दिया, जिससे पुनः शत्रुता प्रारंभ हो गई। रेसलमेनिया VIII में होगन ने सिड के प्रबंधक हार्वे विपलमैन द्वारा दखल दिए जाने के कारण अपात्रता के माध्यम से सिड को हराया. उसके बाद पापा शैंगो द्वारा होगन पर हमला किया गया और वापस लौट आए अल्टिमेट वारियर ने उन्हें बचाया.

इसी समय, समाचार सूत्रों ने यह आरोप लगाना प्रारंभ किया कि पेन्सिल्वेनिया राज्य खेल आयोग (Pennsylvania State Athletic Commission) के एक चिकित्सक डॉक्टर जॉर्ज ज़होरियन गैर-कानूनी रूप से सामान्यतः पहलवानों को और विशिष्टतः होगन को प्रतिबंधित दवाएं बेचते रहे थे। इन आरोपों का खण्डन करने के लिए होगन द आर्सेनियो हॉल शो के एक भाग में दिखाई दिए। गहन सार्वजनिक छानबीन के कारण होगन ने कम्पनी से अनुपस्थिति का अवकाश ले लिया।

उत्तरकालीन खिताबी शासनकाल (1989-1992)
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मि अमरीका (2003)
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