जेरिको ने सर्वाइवर सीरीज में ट्रिपल एच, बतिस्ता, एज और सनित्स्की का सामना करने के लिए रेंडी ओर्टन, क्रिस बेनोइट और मेवेन के साथ दल बनाया। इस मैच की शर्त के अनुसार विजेता टीम का प्रत्येक सदस्य अगले चार सप्ताह के लिए रॉ का महाप्रबंधक बन जाएगा. जेरिको की टीम विजयी रही, इसलिए उन्होंने जनरल मैनेजर के रूप में अपना हिस्सा लिया। महाप्रबंधक के रूप में अपनी बारी के समय जेरिको ने ट्रिपल एच से उसका विश्व हैवीवेट चैम्पियनशिप खिताब छीन लिया क्योंकि एक सप्ताह पहले खिताब के लिए ट्रिपल थ्रेट मैच अनिर्णीत रहा था। न्यू इअर्स रेवोल्यूशन पर, जेरिको ने रिक्त पड़े वर्ल्ड हैवीवेट चैम्पियनशिप के लिए एलिमिनेशन चेम्बर में ट्रिपल एच, क्रिस बेनोइट, बतिस्ता, रेंडी ओर्टन और एज के खिलाफ मुकाबला किया। शौन माइकल्स विशेष अतिथि रेफरी था। जेरिको ने बेनोइट के साथ मैच शुरू किया लेकिन बतिस्ता ने अंततः जेरिको को बाहर कर दिया। 

रेसलमेनिया 21 में, जेरिको ने पहली बार मनी इन द बैंक लैडर मैच में भाग लिया। जेरिको ने मैच अवधारणा का सुझाव दिया और उन्होंने बेन्जामिन, क्रिस बेनोइट, केन, क्रिस्टियन और एज के खिलाफ मुकाबला किया। जेरिको तब हार गया जब एज ने ब्रीफकेस का दावा किया। बैकलेश में, क्रिस जेरिको ने एक बार फिर इंटरकांटिनेंटल चैम्पियनशिप के लिए शेल्टन बेंजामिन को चुनौती दी, लेकिन मैच हार गए। 12 जून 2005 को, जेरिको ने ECW वन नाईट स्टैंड के पे-पर-व्यू कार्यक्रम के पहले मैच में लांस स्टॉर्म के खिलाफ मुकाबला किया। जेरिको ने अपनी अधिक प्रसिद्ध 'Y2J' (वाईटुजे) नौटंकी की बजाय अपनी 'लोयनहार्ट' नौटंकी का इस्तेमाल किया। जेरिको तब परास्त हो गए जब जेसन और जस्टिन क्रेडिबल ने उनके ऊपर एक सिंगापुर केन से हमला किया जिससे स्टॉर्म को उन्हें पिन करने का मौक़ा मिल गया।

बाद में उसी जून, जेरिको, WWE चैंपियन जॉन सीना को उत्तेजित करके WWE में तीसरी बार एक हील बन गए। WWE चैम्पियनशिप के लिए वेंजेंस में हुए एक ट्रिपल थ्रेट मैच में जेरिको हार गए जिसमें क्रिस्टियन और सीना भी शामिल थे। यह लड़ाई गर्मी भर जारी रही और समरस्लैम में एक चैम्पियनशिप मैच में सीना ने जेरिको को हरा दिया। अगली रात "रॉ" पर, जेरिको ने एक पुनर्मेच में सीना का सामना किया और इस बार "यु आर फायर्ड" मैच में. सीना एक बार फिर जीत गए और रॉ के महाप्रबंधक एरिक बिशोफ़ ने सिफ़ारिश कर रहे जेरिको को निकाल देने का दिखावा किया, जिन्हें सुरक्षा बालों द्वारा बाहर कर दिया गया।

वर्ल्ड चैम्पियनशिप रेसलिंग (1996–1999)
विभिन्न लड़ाइयां (2007-2008)
रॉ पर वापसी (2010-वर्तमान)
विश्व खिताब का पीछा (2005)