अरूप चटर्जी ने कहा कि मदर टेरेसा की "गरीबों की मददगार" के रूप में सार्वजनिक छवि भ्रामक थी, और उनकी संस्था की सबसे बड़ी शाखाओं द्वारा भी केवल कुछ सौ लोगों की ही सेवा की जाती है। 1998 में, कलकत्ता में काम करने वाले 200 परोपकारी सहायता संगठनों में से मिशनरीज़ ऑफ़ चैरिटी को सबसे बड़े चैरिटी संगठनों में स्थान नहीं मिला- असेंबली अव गॉड, जो प्रतिदिन 18,000 से अधिक ग़रीबों को भोजन खिला रहा था, वह इनसे अधिक संख्या में लोगों की सेवा कर रहा था। 

चटर्जी ने आरोप लगाया कि इस संस्था की कई शाखाएँ किसी भी प्रकार की परोपकार गतिविधि में संलग्न नहीं हैं, इसके बजाय ये अपने धन का उपयोग मिशनरी कार्य के लिए करते हैं। उदाहरण के तौर पर उन्होंने बताया, पापुआ न्यू गिनी में मिशनरी ऑफ चैरिटी चलाने वाली आठ शाखाओं में से एक में भी व्यक्ति रहने के लिए नहीं है, बल्कि इनका इकलौता मक़सद स्थानीय लोगों को कैथोलिक धर्म में परिवर्तित करना है। 

उसे कभी-कभी हिंदुओं द्वारा अपने दत्तक देश भारत में "चोरी-छिपे" द्वारा गरीबों को कैथोलिक धर्म में परिवर्तित करने की कोशिश का आरोप लगाया गया था। 

क्रिस्टोफर हिचेन्स ने मदर टेरेसा के संगठन को एक ऐसे पंथ के रूप में वर्णित किया जिसने "दुख को बढ़ावा दिया और जरूरतमंदों की मदद नहीं की"। उन्होंने कहा कि मदर टेरेसा के गरीबी के बारे में अपने स्वयं के शब्दों ने साबित कर दिया कि उनका उद्देश्य लोगों की मदद करना नहीं था। ऐसा हिचेन्स ने 1981 में एक प्रेस कॉन्फ्रेंस में मदर टेरेसा के शब्दों को उद्धृत करते हुए जिसमें उनसे पूछा गया था: "क्या आप गरीबों को सिखाती हैं कि उन्हें अपना दर्द सहना चाहिए?" उन्होंने जवाब दिया: "मुझे लगता है कि यह बहुत सुंदर है कि गरीब इसे स्वीकार करें। इसे ईसा मसीह के पैशन के साथ साझा करें। मुझे लगता है कि गरीब लोगों की पीड़ा से दुनिया को बहुत मदद मिल रही है।" 

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