दो रेल स्टेशन, बफ़ेलो -डिप्यू तथा बफ़ेलो -एक्सचेंज स्ट्रीट शहर की सेवा कर रहे हैं तथा ऐमट्रैक द्वारा संचालित है।

बफ़ेलो के लिए माल ढुलाई सेवा सीएसएक्स परिवहन तथा नोरफ्लोक साउथ (एन एस), कैनेडियन नेशनल (सीएन), कैनेडियन पैसीफिक (सीपी) रेलमार्गों द्वारा सीमा पार से प्रदान की जा रही है। क्षेत्र में 4 बड़े रेल यार्ड हैं: फ्रंटियर (सीएसएक्स), बाइसन (एन एस), एस के (एन एस /सीपी) तथा बफ़ेलो क्रीक (एन एस / सीएएक्स). तरल प्रोपेन और एनहाइड्रस अमोनिया जैसे खतरनाक माल की एक बड़ी राशि भी बफ़ेलो क्षेत्र से होकर गुजरती है

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