पर्सेपोलिस पुल्वर नामक एक छोटी नदी के पास स्थित है जो कुर (काईरस) नदी में जाकर मिलती है। इस साइट में 125,000 वर्ग मीटर की एक छत, जिसका कुछ भाग कृत्रिम रूप से निर्मित है और कुछ भाग पहाड़ से काट कर बनाया गया है और इसका पूर्वी हिस्सा कुह-ए रहमत ("दया का पहाड़") की तरफ झुका हुआ है। इसके अन्य तीन हिस्सों का निर्माण दीवारें खड़ी करके की गई है जिनकी ऊँचाई जमीन के ढलान के साथ अलग-अलग है। पश्चिमी हिस्से पर 5 से 13 मीटर की दूरी पर एक दोहरी सीढ़ी धीरे से ऊपर की तरफ जाती है। स्तरीय छत का निर्माण करने के लिए गड्ढों को मिट्टी और धातु की क्लिपों से जुड़ी भारी चट्टानों से भर दिया गया था।

518 ई.पू. के आसपास एक बड़ी सीढ़ी का निर्माण कार्य शुरू किया गया। जमीन से 20 मीटर ऊपर छत के मुख्य द्वार के रूप में सीढ़ी का निर्माण करने की योजना बनाई गई। महान दीवार के पश्चिमी हिस्से पर संतुलित रूप से इस दोहरी सीढ़ी का निर्माण किया गया जो पर्सेपोलिटन सीढ़ी के नाम से मशहूर हुई. 111 चरणों वाली इस सीढ़ी के प्रत्येक चरण के सतह की ऊँचाई 10 सेंटीमीटर, चौड़ाई 31 सेंटीमीटर और लम्बाई 6.9 मीटर थी। ऐसा माना जाता था कि वास्तव में घोड़े की पीठ पर बैठकर रईसों और शाही लोगों के उतरने के लिए ऐसे चरणों का निर्माण किया गया था। नए सिद्धांतों से पता चलता है कि उतरते समय एक शाही उपस्थिति को बनाए रखने में दौरे पर निकलने वाले गणमान्य व्यक्तियों को सीढ़ियों के इन उथले उठाव से मदद मिलती थी। सीढ़ियों का ऊपरी हिस्सा गेट ऑफ नेशंस (राष्ट्र द्वार) के विपरीत छत के उत्तरी-पूर्वी हिस्से में स्थित एक छोटे से आँगन की तरफ जाता था।

पर्सेपोलिस में मुख्य निर्माण सामग्रियों के रूप में भूरा चूना पत्थर का इस्तेमाल किया गया था। प्राकृतिक चट्टान को बराबर करने और गड्ढों को भरने के बाद छत का निर्माण किया गया था। मलजल निकासी के लिए चट्टानों के बीच से प्रमुख नहरें खोदकर निकाली गई थी। पहाड़ की पश्चिमी तराई पर एक बहुत ऊंची जल भण्डारण टंकी बनाई गई थी। प्रोफ़ेसर ओल्मस्टीड ने बताया कि कुंड का निर्माण उसी समय किया गया था जिस समय मीनारों का निर्माण शुरू हुआ था।

छत की नींव का असमान योजना ने एक महल की तरह काम किया जिसकी तिरछी दीवारें इसके रक्षकों को बाहरी सामने के हिस्से के किसी भी भाग से निशाना लगाने में मददगार साबित हुई. डियोडोरस लिखते हैं कि पर्सेपोलिस में परकोटा युक्त तीन दीवारें थीं जिनमें से सभी दीवारों पर रक्षा कर्मियों के लिए संरक्षण स्थान प्रदान करने के लिए मीनारें थीं। पहली दीवार 7 मीटर लंबी थी, दूसरी 14 मीटर और चारों हिस्सों को कवर करने वाली तीसरी दीवार की ऊँचाई 27 मीटर थी हालाँकि आज वहां इस दीवार का कोई वजूद नहीं है।

पर्सेपोलिस की सामग्रियों का प्रदर्शन करने वाले संग्रहालय (ईरान के बाहर)
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अपादना महल