वैकल्पिक डाटा स्ट्रीम एक से अधिक डाटा स्ट्रीम को एक फ़ाइल नाम के साथ, फ़ाइल नाम प्रारूप-"फ़ाइल नाम:स्ट्रीमनाम"(उदहारण के लिए: "text.txt:extrastream") का प्रयोग कर के जोड़ती है। वैकल्पिक विषय Windows Explorer में सूचीबद्ध नहीं हैं और उनका साइज़ फ़ाइल के साइज़ में शामिल नहीं है। जब एक फ़ाइल जो ईमेल अथवा वेबसाइट से अपलोड करके नेटवर्क शेयर या FAT द्वारा फॉर्मेट USB ड्राइव में कॉपी की जाती है तो उस फ़ाइल की केवल मुख्य स्ट्रीम ही संरक्षित होती है। परिणामस्वरुप, महत्वपूर्ण डाटा के लिए वैकल्पिक स्ट्रीम का प्रयोग समस्या पैदा कर सकता है।

मैलवेयर वैकल्पिक डाटा स्ट्रीम का इस्तेमाल अपने कोड को छिपाने के लिए करते हैं; कुछ मैलवेयर स्कैनर और अन्य विशेष उपकरण अब वैकल्पिक स्ट्रीम में डाटा की जाँच करते हैं।

बाहरी साइटों से डाउनलोड की गयी फ़ाइलों को चिन्हित करने के लिए बहुत छोटे ADS Internet Explorer में (और अब अन्य ब्रॉउजर में भी) जोड़े जाते हैं: उन्हें स्थानीय रूप से चलाना असुरक्षित हो सकता है और स्थानीय सिस्टम को उन्हें खोलने से पहले यूज़र से पुष्टि की आवश्यकता होगी। जब यूज़र यह इंगित करता है उसे कन्फर्मेशन डायलॉग की और आवश्यकता नहीं है, तो डाउनलोड की गयी फ़ाइलों के लिए MFT प्रविष्टि में इस ADS को हटा दिया जाता है।

कुछ मीडिया के दिग्गजों ने भी मीडिया फ़ाइलों की प्रभावी डाटा सामग्री को संशोधित किये बगैर, संग्रह को व्यवस्थित करने के लिए, कस्टम मेटाडाटा का मीडिया फ़ाइलों में संग्रहण के लिए ADS का प्रयोग किया है (मीडिया फ़ाइल प्रारूप द्वारा समर्थित एम्बेडेड टैग जैसे MPEG और OGG कंटेनर की सहायता से). इन मेटाडाटा को Windows Explorer में अतिरिक्त जानकारी कॉलम के रूप में एक पंजीकृत Windows Shell एक्सटेंशन की सहायता से दिखाया जा सकता है, जो उन्हें उन्हें पार्स कर सकते हैं। लेकिन ज्यादातर मीडिया दिग्गज इन सूचनाओं के संग्रहण के लिए ADS की बजाए अपने अलग डाटाबेस का प्रयोग करते हैं (चूंकि ADS अलग अलग यूज़र सुरक्षा सैटिंग के अभाव में इन फ़ाइलों के सभी यूज़र्स को दिखाई देते हैं और उनके मूल्य यूज़र की वरीयता के अनुसार परिभाषित होते हैं।)

स्पार्स फ़ाइलें
वैकल्पिक डाटा स्ट्रीम (ADS)
एकल चरण संग्रहण (SIS)
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