सन् 1994 में, पांच अनामिक असैनिक कॉनट्रैक्टर और कॉनट्रैक्टर वाल्टर कास्ज़ा तथा रॉबर्ट फ्रॉस्ट की विधवाओं ने USAF और अमेरिकी पर्यावरण संरक्षण एजेंसी पर मुकदमा कर दिया। उनके मुकदमे में, जिसमें उनका प्रतिनिधित्व जार्ज वाशिंगटन विश्वविद्यालय के विधि के प्रोफेसर जोनाथन टर्ली द्वारा किया गया, आरोप लगाया गया कि जब ग्रूम के खुले गड्ढों और खाइयों में विशाल मात्रा में अज्ञात रसायनों को जलाया गया तो वे वहां उपस्थित थे। शिकायतकर्ताओं से ली गयी बायोप्सीस का विश्लेषण, रुटगर्स विश्वविद्यालय के जीव रसायन विज्ञानियों ने किया, जिन्हें इस परीक्षण में उनके शारीरिक वसा में उच्च मात्रा में डाईओक्सिन, डाई बेंजोफ्फुरन और ट्राईक्लोरोइथीलीन रसायन मिले। शिकायतकर्ताओं ने आरोप लगाया कि ग्रूम पर काम करने के कारण उन्हें लगातार त्वचा, कलेजे और श्वसन सम्बन्धी परेशानियों का सामना करना पड़ा और फ्रोस्ट और कास्ज़ा की मौत का भी यही कारण बना। मुकदमे में लोगों को लगातार होने वाली परेशानियों के लिए मुआवजे की मांग इस दावे के साथ की गयी कि USAF ने विषाक्त पदार्थों का अवैध तरीके से प्रयोग किया और साथ ही EPA, संसाधन संरक्षण और वसूली अधिनियम (जो विषाक्त पदार्थों के उपयोग को नियंत्रित करता है) को लागू करने के अपने कर्त्तव्य में असफल रहा। उन्होंने जीवित व्यक्तियों की चिकित्सा में मदद मिलने की उम्मीद से रसायनों के बारे में विस्तृत जानकारी मांगी जिससे वे तथाकथित रूप से प्रभावित थे। खुफिया समिति सभा के पूर्व अध्यक्ष, कांग्रेसी ली एच. हैमिल्टन ने 
"60 मिनट्स" के संवाददाता लेस्ली स्टॉल को बताया,"वायु सेना स्वयं को मुकदमे से बचाने के लिए एरिया 51 से सम्बंधित सभी जानकारियों को वर्गीकृत कर रही है".

राज्य खुफिया विशेषाधिकार का हवाला देते हुए और साथ ही इस आरोप के साथ कि यह गोपनीय सूचनाओं का खुलासा कर सकता है और राष्ट्रीय सुरक्षा के लिए खतरा बन सकता है, सरकार ने U.S जिला न्यायाधीश फिलिप प्रो (लॉस वेगास में नेवाडा जिले के लिए संयुक्त राज्य अमेरिका जिला न्यायालय के न्यायाधीश) को गोपनीय दस्तावेजों के प्रकटीकरण या गुप्त गवाहों के निरीक्षण से इन्कार करने के सम्बन्ध में अर्जी दी है। जब न्यायाधीश प्रो ने सरकार के तर्क को खारिज कर दिया, तो राष्ट्रपति बिल क्लिंटन ने प्रेसिडेन्शिअल डिटर्मिनेशन जारी करते हुए "नेवादा में ग्रूम झील के पास वायु सेना के अभियान स्थल" को पर्यावरणीय प्रकटीकरण नियम से मुक्त कर दिया। नतीजतन, प्रो ने सबूत की कमी के कारण मुकदमा खारिज कर दिया। टर्ली ने नाईन्थ सर्किट के लिए U.S. कोर्ट ऑफ़ अपील में इस आधार पर प्रार्थना की कि सरकार चीज़ों को गोपनीय रखने के अपने अधिकार का दुरुपयोग कर रही थी। वायु सेना सचिव शीला ई.विडनाल ने एक पत्र देते हुए यह इंगित किया कि ग्रूम के निकट पानी और हवा में उपस्थित पदार्थों का खुलासा "सैन्य संचालन क्षमताओं अथवा गोपनीय अभियानों की प्रकृति और व्यापकता को उजागर कर सकता है।" नाईन्थ सर्किट ने टर्ली की अपील खारिज कर दी और U.S सुप्रीम कोर्ट ने इसे सुनने से मना करते हुए शिकायतकर्ताओं के मुकदमे को ख़त्म कर दिया।

राष्ट्रपति ने ग्रूम अपवाद पर सालाना एक निश्चय पत्र जारी करना जारी रखा। यह और सरकारी वक्तव्यों में प्रयुक्त इसी प्रकार के मौन शब्द ही U.S सरकार की ओर से दी गयी एकमात्र औपचारिक मान्यता है कि ग्रूम झील नेल्लिस परिसर के एक हिस्से से ज़्यादा कुछ और है।

सन् 2005 में वायु सेना की वेबसाइट पर F-117 नाइटहॉक सामग्री के सुरक्षित संचालन पर एक अवर्गीकृत ज्ञापन जारी किया गया। इस ज्ञापन में उन्हीं पदार्थों पर चर्चा की गयी थी जिन पर शिकायतकर्ताओं ने जानकारी के लिए अनुरोध किया था (जिन सूचनाओं के गोपनीय होने का सरकार ने दावा किया था). पत्रकारों के संज्ञान में आने के बाद ज्ञापन को शीघ्र ही हटा दिया गया।

एरिया 51 पर अमेरिकी सरकार की स्थिति
U-2 प्रोग्राम
पर्यावरण मुकदमा
ग्रूम झील के आस-पास फ़ौजी कार्यवाही