"कंटिन्नम" शीर्षक से मेयर का तीसरा स्टूडियो एल्बम 12 सितम्बर 2006 को रिलीज़ हुआ जिसका निर्माण मेयर तथा स्टीव जोर्डन ने मिलकर किया। मेयर का ऐसा मानना था कि इस एल्बम का मकसद उनके पॉप संगीत सिग्नेचर के साथ ब्लूज़ की ध्वनि, लीक और संवेदनशीलता का संयोजन करना था। इसी सिलसिले में, त्रयियों ने दो ट्रैक रिकॉर्ड रिलीज़ किए - "ट्राई!" —द फंकी "वल्चर्स" एवं द ब्लूज़ का आकर्षण केंद्र "ग्रैविटी"— जिन्हें "कंटिन्नम" में शामिल कर लिया गया। मेयर ने कहा है कि उन्होंने जितने गीतों की रचना की है उनमें "ग्रेविटी" सबसे महत्वपूर्ण है।

"कंटिन्नम" का पहला एकल "वेटिंग ऑन द वर्ल्ड टू चेंज" था, जिसने "द रॉन ऐंड द फेज़ शो" से अपना श्री गणेश किया। 11 जुलाई 2006 को अपनी रिलीज़ किए जाने के बाद ही आइ ट्यून्स म्यूजिक स्टोर में एक सप्ताह में सर्वाधिक डाउनलोड किया जाने वाला यह गाना था और इसने "बिलबोर्ड" हॉट 100 के चार्ट पर #25वें पायदान से अपनी शुरुआत की. 23 अगस्त 2006 को, मेयर ने सम्पूर्ण एल्बम को लॉस एंजिल्स रेडियो स्टेशन पर स्टार 98.7 पर प्रत्येक ट्रैक पर अपनी कमेंट्री देते हुए शुरुआत की. दूसरे ही दिन पूर्वावलोकन की छिपी बहती अंतर्धारा के रूप में क्लिअर चैनेल म्यूजिक के वेबसाईट पर रिलीज़ किया गया। 21 सितम्बर 2006 को मेयर "वेटिंग ऑन द वर्ल्ड टू चेंज" और "स्लो डांसिंग इन अ बर्निंग रूम" में प्रदर्शन करते हुए "" पर दिखाई दिए. टेलिविज़न सिरीज़ "हाउस" के "केन ऐंड एबल" एवं "नंब3र्स" के एपिसोड में "ग्रेविटी" गाने को विशेष रूप से दर्शाया गया। उन्होंने 22 अक्टूबर 2006 को एब्बेरोड स्टूडियो में ब्रिटिश कार्यक्रम "लाइव फॉर्म एब्बे रोड" के लिए एक सत्र रिकॉर्ड किया।

7 दिसम्बर 2006 को, मेयर को पांच 2007 ग्रैमिस के लिए नामांकन मिला जिनमें "एल्बम ऑफ़ द इयर" भी शामिल था। जॉन मेयर त्रयी को भी उनके एल्बम "ट्राई!" के लिए एक नामांकन मिला. उन्होंने "वेटिंग ऑन द वर्ल्ड टू चेंज" के गायन के लिए बेस्ट पॉप साँग तथा "कंटिन्नम" के लिए बेस्ट पॉप एल्बम का खिताब जीता. मेयर ने अपने एकल "वेटिंग ऑन द वर्ल्ड टू चेंज" का अपने साथी संगीतकार बेन हार्पर के गायन के संयोजन के साथ ध्वनिक संस्करण का रिमिक्स तैयार किया। "कंटिन्नम" की रिकॉर्डिंग की तैयारी में, मेयर ने दिग्गज संगीतकार रॉबी मैकइनटोश के साथ अपने पांच गानों की पांच डेमो ध्वनिक संस्करणों की रिकॉर्डिंग के लिए लॉस एंजिल्स में विलेज रिकॉर्डर को अनुबंधित किया था। ये रिकॉर्डिंग 12 दिसम्बर 2006 को रिलीज़ हुई एक EP का "विलेज सेशंस" हो गई। हमेशा की तरह मेयर ने रिलीज़ की कलाकृति पर विशेष रूप से गौर किया।

फरवरी 2007 में "रॉलिंग स्टोन" (#1020) के कवर पर मेयर को जॉन फ्रस्सिनेट तथा डेरेक ट्रक्स के साथ विशेष रूप से दर्शाया गया। उनका नाम एक "न्यू गिटार गाइड्स" के रूप में लिया गया और कवर पर "स्लोहैण्ड जूनियर" का उपनाम दिया गया जो एरिक क्लैप्टन से संदर्भित था। इसके अतिरिक्त "टाइम" पत्रिका के संपादकों ने उन्हें 2007 के 100 सर्वाधिक प्रभावशाली लोगों की श्रेणी में उन्हें चुना और कलाकारों तथा मनोरंजकों में उन्हें सूचीबद्ध किया।

20 नवम्बर 2007 को, फिर से जारी किए गए "कंटिन्नम" को ऑनलाइन एवं स्टोरों में उपलब्ध कराया गया। इस रिलीज़ में सन 2007 के दौरे के छः गानों के सीधे प्रसारण के डिस्क को बोनस के रूप में शामिल किया गया, जिनमें से पांच "कंटिन्नम" से थे और एक रे चार्ल्स के गाने "आइ डोंट नीड नो डॉक्टर" का एक कवर था। उनके नए एकल, "से" भी आई ट्यून्स के माध्यम से उपलब्ध हो गया। 6 दिसम्बर 2007 को, "बिलीफ" बेस्ट मेल पॉप वोकल के 50वें ऐनुयल ग्रैमी अवार्ड में नामांकित हुआ। उन्होंने समारोह में अलिशिया कीज़ के गाने "नो वन" में उसके साथ गिटार बजाया.

फरवरी 2008 को, मेयर ने एक तीन दिवसीय कैरेबियन क्रूज समारोह का आयोजन किया जिसमें कई संगीतकारों के साथ-साथ डेविड रियान हैरिस ब्रेट डेन्नें एवं कॉल्बी कैलेट के प्रदर्शन भी शामिल थे। इस पूरे आयोजन की घटना को "द मेयरक्राफ्ट करियर" कहा गया और क्रूज़ शिप पर ""कार्निवल विक्ट्री" " के नाम से इसका आयोजन किया गया। साथ ही साथ लाँग बीच, कैलिफोर्निया से "मेयरक्राफ्ट करियर 2" नाम से एक क्रूज़ रवाना हुआ जिसपर 27 से 31 मार्च के बीच कार्निवल स्प्लेंडर का आयोजन किया गया।

1 जुलाई 2008 को मेयर ने निकिया थिएटर ला लाइव में 8 दिसम्बर 2007 को किए गए प्रदर्शन पर आधारित समारोह के सीधे प्रसारण को "व्हेर द लाईट इज़" नाम से एक फ़िल्म रिलीज़ की. इस फ़िल्म का निर्देशन डैनी क्लीनच ने किया। इसमें एक ध्वनिक मंच और जॉन मेयर त्रयी के साथ एक मंच को विशेष रूप से दर्शाया गया है, जिसके बाद ही "कंटिन्नम" एल्बम से जॉन के सेट को भी फीचर किया गया। DVD और ब्लूरे बोनस सामग्रियों में मेयर के बैकस्टेज के फुटेज एवं मूलहोल्लैंड ड्राइव पर बाहर बजाने के दृश्य भी शामिल थे। 

ऑस्ट्रेलियाई कलाकार गाइ सेबस्टियन ने मेयर को अपने 2009 के एल्बम "लाइक इट लाइक दैट" के तीन गानों में सहयोग के लिए आमंत्रित किया। क्रॉसबाइ लौग्गिंस की 10 जुलाई 2009 को रिलीज़ की गई शुरूआती LP, "टाइम टू मूव", के टाइटल ट्रैक के लिए मेयर ने भी गिटार बजाया.

7 जुलाई 2009 को, मेयर ने जैक्सन की यादगार के आयोजित श्रद्धांजलि -सभा में माइकल जैक्सन के "ह्युमन नेचर" का यांत्रिक गिटार संस्करण प्रस्तुत किया।

"कंटिन्नम" युग
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कैरियर
जॉन मेयर त्रयी