विन्डोज़ विस्टा और विंडोज सर्वर 2008 में विन्डोज़ एक्स्प्लोरर एक नए लेआउट का परिचय कराता है। विन्डोज़ XP के टास्कपेन को शीर्ष पर एक टूलबार और बाईं तरफ एक "नेविगेशन पेन" द्वारा प्रतिस्थापित कर दिया गया है। "नेविगेशन पेन" में आम तौर पर अभिगामित फोल्डर और प्रीपोपुलेटेड "सर्च फोल्डर" शामिल होते हैं। फ़ाइलों और फ़ोल्डरों को देखने के लिए सात अलग-अलग व्यू उपलब्ध हैं, जिनके नाम हैं, "लिस्ट, डिटेल्स, स्मॉल आइकन्स, मीडिअम आइकन्स, लार्ज आइकन्स, एक्स्ट्रा लार्ज आइकन्स या टाइल्स" . "ऑटोमेटिक फ़ोल्डर टाइप डिस्कवरी", स्वचालित रूप से एक फोल्डर की सामग्री का पता लगाता है और सटीक डिटेल सेटिंग्स प्रदर्शित करता है। फ़ाइल और फोल्डर क्रियाएं जैसे कि कट, कॉपी, पेस्ट, अन्डू, रीडू, डिलीट, रिनेम और प्रोपर्टीज़ को एक ड्रॉपडाउन मेनू में निर्मित किया जाता है जो तब प्रकट होता है जब "ओर्गनाइज़" बटन क्लिक किया जाता है। ओर्गनाइज़ बटन का उपयोग करके एक्सप्लोरर विंडो का लेआउट बदलना भी संभव है। उपयोगकर्ता चुन सकते हैं कि वे "क्लासिक मेनू," एक "सर्च पेन", एक "प्रीव्यू पेन", एक "रीडिंग पेन" प्रदर्शित करना चाहते हैं या "नेविगेशन पेन" . डिटेल्स पेन के अलावा, "प्रीव्यू पेन" फ़ाइलों (दस्तावेजों को देखना और मीडिया फ़ाइलों को चलाना) के पूर्वावलोकन की अनुमति देता है। इसके अलावा, एक्सप्लोरर किसी भी इमेज फॉर्मेट के लिए पूर्वावलोकन प्रदान कर सकता है यदि उस फॉर्मेट के लिए आवश्यक कोडेक "विंडोज इमेजिंग कॉम्पोनेन्ट" में स्थापित है तो.

नेविगेशन को आसान बनाने के लिए ऐड्रेस बार को एक "ब्रेडक्रम्ब्स बार" से प्रतिस्थापित किया गया है। यह वर्तमान स्थान के लिए पूर्ण पथ दिखाता है। बार-बार बैक बटन दबाने के बजाय, पथ पदानुक्रम में किसी भी स्थान पर क्लिक करने से उपयोगकर्ता उस स्तर पर पहुंच जाता है। यह वैसा ही है जैसा विन्डोज़ XP में संभव है, जिसमें "बैक" के बगल में स्थित एक छोटे अधोमुखी तीर को दबाकर पूर्व के अभिगमित फोल्डर की सूची से किसी भी फोल्डर का चयन किया जाता था। अंतिम आइटम के दाईं ओर के तीर का उपयोग करते हुए वर्तमान फ़ोल्डर के किसी सबफ़ोल्डर में जाना भी संभव है, या इसी के दाएं तरफ के स्थान पर क्लिक करके इस मार्ग को स्वयं कॉपी या संपादित किया जा सकता है। जैसा कि माइक्रोसॉफ्ट द्वारा निर्मित कई अन्य विन्डोज़ विस्टा अनुप्रयोगों के मामले में है, यहां भी मेनू बार डिफ़ॉल्ट रूप से छुपा है। आल्ट (Alt) कुंजी को दबाने से मेनू बार दिखाई देता है।

विन्डोज़ एक्स्प्लोरर में चेक बक्से एकाधिक फ़ाइलों के चयन की अनुमति देते हैं। सभी ड्राइव पर रिक्त और प्रयुक्त स्पेस को क्षैतिज सूचक बार में दिखाया जाता है। विभिन्न आकारों के आइकन का समर्थन दिया गया है - "16 x 16 24 x 24 32 x 32 48, x 48 64, x 64 96, x, 128 96 x 128 और 256 x 256." विन्डोज़ एक्स्प्लोरर एक स्लाइडर का इस्तेमाल करते हुए आइकन को बड़ा या छोटा कर सकता है या फिर "Ctrl" (कंट्रोल) कुंजी को दबाकर माउस के चक्के का इस्तेमाल करते हुए भी ऐसा किया जा सकता है।

विन्डोज़ विस्टा और विन्डोज़ सर्वर 2008
खोज, आयोजन और मेटाडेटा
लेआउट और आइकन
विन्डोज़ XP और विन्डोज़ सर्वर 2003