ಭೂಪ್ರಾದೇಶಿಕ ದತ್ತಾಂಶ ಉಗ್ರಾಣಗಳನ್ನು ಜೋಪಾನಮಾಡುವುದು ಬಹಳ ಕಷ್ಟ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿರುವ ಜಿಐಎಸ್ ದತ್ತಾಂಶಗಳು ಪದೇ ಪದೇ ಒಡೆದು ಹೋಗುವ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಗುಣಾಂಶಗಳನ್ನು ಮಿಶ್ರತಳಿ ದತ್ತಾಂಶ ಆಡಳಿತ ಮಂಡಲಿ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಗಣನ ಪದ್ಧತಿಯಲ್ಲಿ ಸಂಬಂಧಿ(ಗುಣ) ದತ್ತಾಂಶ ನಿರ್ವಹಣೆ ಮತ್ತು (ಗಣಕಯಂತ್ರದ)ತಂತಿಜಾಲ(ಲಕ್ಷಣ) ದತ್ತಾಂಶ ನಿರ್ವಹಣೆ ಗಣನೀಯ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ . ಇದು ಭೌಗೋಳಿಕ ದತ್ತಾಂಶ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆಗೆ ಮತ್ತು ವ್ಯಾಪ್ತಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಇದು ಸಹ ಅಪೂರ್ವವಾದ ಸವಾಲುಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಭೌಗೋಳಿಕ ದತ್ತಾಂಶದಲ್ಲಾದ ಡಿಜಿಟಲ್ ಕ್ರಾಂತಿಯು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾದ "ವೆಕ್ಟರ್" ಮತ್ತು "ರಾಸ್ಟರ್" ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಆಚೆಯ ಹೊಸ ಬಗೆಯ ದತ್ತಾಂಶ ವಿನ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸಿತು. ಭೌಗೋಳಿಕ ದತ್ತಾಂಶ ಭಂಡಾರಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಟ್ಟ ರಚನಾವಿನ್ಯಾಸದ ದತ್ತಾಂಶಗಳಾದ ಕಲ್ಪನೆಗಳು ಮತ್ತು ಭೂ-ಉಲ್ಲೇಖಿತ ಬಹುಮಾಧ್ಯಮಗಳು ಹೆಚ್ಚಾದವು . 
ಭೌಗೋಳಿಕ ಅರಿವಿನ ಅನ್ವೇಷಣೆ ಮತ್ತು ದತ್ತಾಂಶ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಸಾಕಷ್ಟು ಗಂಭೀರವಾದ ಸವಾಲುಗಳಿವೆ. ಮಿಲ್ಲರ್ ಮತ್ತು ಹಾನ್ ಪ್ರಕಟಿಸಿದ ಕ್ಷೇತ್ರಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಪಟ್ಟಂತಹ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ವಿಷಯಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಕೆಳಕಂಡಂತೆ ಇದೆ:


ಮಾರುಕಟ್ಟೆ ಸಮೀಕ್ಷೆ
ವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಇಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್
ಸವಾಲುಗಳು
ಇತರೆ