ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಮೊದಲು ಅಮೊನಿಯಾ(ನೈಟ್ರಿಫಿಕೇಷನ್)ವನ್ನು ನೈಟ್ರೋಜನ್ ನ ಜೈವಿಕ ಆಮ್ಲಜನಕಕರಣದ ಮೂಲಕ ನೈಟ್ರೇಟ್ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ನಂತರ ನೈಟ್ರೇಟ್ ಅನ್ನು ಡಿನೈಟ್ರಿಫಿಕೇಷನ್ ಗೆ ಒಳಪಡಿಸಿ ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಅನಿಲವನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಅನಿಲವು ವಾತಾವರಣಕ್ಕೆ ಬಿಡಲಾಗುವುದರ ಮೂಲಕ ನೀರಿನಿಂದ ಹೊರಹಾಕುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಮುಗಿಯುತ್ತದೆ.

ನೈಟ್ರಿಫಿಕೇಷನ್ ಕ್ರಮವೇ ಎರಡು-ಹಂತಗಳ ಗಾಳಿಗೊಡ್ಡುವ ವಿಧಿಯಾಗಿದ್ದು, ಪ್ರತಿ ಹಂತದಲ್ಲೂ ಬೇರೆ ಬೇರೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಮೋನಿಯಾವನ್ನು ಆಮ್ಲಜನಕ-ಕರಣಗೊಳಿಸಿ (NH) ನೈಟ್ರೈಟ್(NO) ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವುದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ "ನೈಟ್ರೋಸೋಮೋನಾಸ್" spp.ಗಳಿಂದ ನೆರವೇರುತ್ತದೆ (ನೈಟ್ರೋಸೋ ಎಂದರೆ ರಚಿತವಾದ ನೈಟ್ರೋಸೋ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವರ್ಗ).

ಡಿನೈಟ್ರಿಫಿಕೇಷನ್ ಗೆ ಬೇಕಾದ ಸೂಕ್ತ ಜೈವಿಕ ಸಮುದಾಯಗಳು ಉತ್ಪಾದನೆಯಾಗಲು ಉತ್ತೇಜನ ಸಿಗಬೇಕಾದರೆ ಆಮ್ಲಜನಕರಹಿತ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಯು ಇರಬೇಕಾದುದು ಅಗತ್ಯ. ಇದನ್ನು ವಿವಿಧ ರೀತಿಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಅನುವುಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತವೆ. ಮರಳಿನ ಶೋಧಕಗಳು, ಖಾರಿಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ದೇಟುಹಾಸಿಗೆಗಳನ್ನು ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಕಡಿಮೆಗೊಳಿಸುವ ಸಾಧನಗಳಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು, ಆದರೆ ಕ್ರಿಯಾನ್ವಿತ ಬಗ್ಗಡ ಕ್ರಮವು (ಸರಿಯಾಗಿ ರಚಿತವಾದಲ್ಲಿ) ಇವೆಲ್ಲಕ್ಕಿಂತಲೂ ಸುಲಭವಾಗಿ ಕಾರ್ಯವೆಸಗಬಲ್ಲದು. ಡಿನೈಟ್ರಿಫಿಕೇಷನ್ ನೈಟ್ರೇಟ್ ಗಳನ್ನು ಡಿನೈಟ್ರೋಜನ್ ಅನಿಲದ ರೂಪಕ್ಕೆ ಇಳಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾದುದರಿಂದ ವಿದ್ಯುನ್ಮಾನ ದಾಯಕದ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ. ಇದು ವ್ಯರ್ಥನೀರಿನ, ಜೈವಿಕ ವಸ್ತುಗಳ (ಮಲದಿಂದ), ಸಲ್ಫೈಡ್ ಗಳ, ಅಥವಾ ಮಿಥೆನಾಲ್ ನಂತಹ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ದಾಯಕಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ.

ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ವಿಷಕಾರಕ ಅಮೋನಿಯಾವನ್ನು ನೈಟ್ರೇಟ್ ಆಗಿ ಬದಲಾಯಿಸುವ ವಿಧಿಯನ್ನೇ ತೃತೀಯ ಸಂಸ್ಕರಣವೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.

ಹಲವಾರು ಕೊಳಚೆನೀರು ಸಂಸ್ಕರಣ ಘಟಕಗಳು ಅಕ್ಷಕ್ರಮದ ಹರಿವು ಪಂಪ್(ಆಕ್ಸಿಯಲ್ ಫ್ಲೋ ಪಂಪ್)ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಮಿಶ್ರಿತ ಮದ್ಯವನ್ನು ಆಮ್ಲಸಹಿತ ಪ್ರದೇಶದಿಂದ ಆಮ್ಲರಹಿತ ಪ್ರದೇಶಕ್ಕೆ, ಡಿನೈಟ್ರಿಫಿಕೇಷನ್ ಉದ್ದೇಶಕ್ಕಾಗಿ, ರವಾನಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ಪಂಪ್ ಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ "ಇಂಟರ್ನಲ್ ಮಿಕ್ಸ್ಡ್ ಲಿಕ್ಕರ್ ರೀಸೈಕಲ್ ಪಂಪ್" (IMLR ಪಂಪ್)ಗಳೆಂದು ಕರೆಯುತ್ತಾರೆ.

ಚುರುಕುಗೊಳಿಸಿದ ಕೆಸರು
ಗೊಬ್ಬರಗೊಳಿಸುವಿಕೆ
ಮಾಧ್ಯಮಿಕ ಸಂಸ್ಕರಣೆ
ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವಿಕೆ