சிம்பியன் இயக்கமுறைமை பல்வேறு வைரஸ்களின் தாக்குதலைப் பெற்றுள்ளது. அதில் கபீர் சிறப்பாக அறியப்படுகிறது. இவை வழக்கமாக ப்ளூடூத் அழியாக ஒரு போனில் இருந்து மற்றொரு போனுக்குப் பரவுகிறது. இதுவரை சிம்பியன் இயக்கமுறைமையின் எந்த குறைபாடுகளையும் ஆதாயமாக எவரும் எடுத்துக் கொள்ளவில்லை – பதிலாக அவர்கள் அனைவரும் மென்பொருளின் நம்பகத்தன்மையை தெளிவான எச்சரிக்கைகளுடன் பயனர்களுக்கு அதை நிறுவுவதற்கு வினா எழுப்புகின்றனர்.

எனினும் விலை மலிவான மொபைல் போன் பயனர் பாதுகாப்பைப் பற்றிக் கண்டிப்பாக கவலை கொள்ளத் தேவையில்லை. UNIX-பாணி தகுதியுடைய மாடல்களுக்கு சிம்பியன் இயக்கமுறைமை 9.x உருவாக்கப்பட்டுள்ளது (இதில் ஒவ்வொரு செயல்பாட்டிற்கு அனுமதி வேண்டப்படுகிறது ஒவ்வொரு விசயங்களுக்கும் அல்ல). நிறுவப்பட்ட மென்பொருள் என்பது கோட்பாடு சார்ந்து டிஜிட்டல் முறையில் கையொப்பமிடாமல் (நெட்வொர்க் தரவை அனுப்புவதன் மூலம் பயனருக்கு அதிகம் செலவு வைப்பது போன்றவை) எதையும் சேதப்படுத்துவதாக இருப்பதில்லை – ஆகையால் இதன் உருவாக்கம் அறியப்படும் ஒன்றாகவே உள்ளது. வணிகரீதியான உருவாக்குனர்கள் அவர்களது மென்பொருளுக்கு செலவு செய்து சிம்பியன் கையொப்பமிடக்கூடிய நிரல் வழியாக கையொப்பத்தைப் பெறுகின்றனர். உருவாக்குனர்கள் அவர்களது நிரல்களில் சுய-கையொப்பத்தையும் இடும் தேர்வைப் பெற்றுள்ளனர். எனினும் இந்த தொகுப்பில் கிடைக்கக்கூடிய சிறப்பியல்புகளானது ப்ளூடூத், IrDA, GSM CellID, குரல் அழைப்புகள், GPS மற்றும் பிறப் பண்புகளின் அணுக்கத்தை உள்ளடக்கியிருக்கவில்லை. சிம்பியன் கையொப்பமிடப்பட்ட சான்றிதழ்களைத் தவிர பிற அனைத்து சான்றிதழ்களையும் சில இயக்குநர்கள் செயல் இழக்கச்செய்கின்றனர்.

சில பிற எதிர்ப்பு நிரல்கள் கீழே பட்டியலிடப்பட்டுள்ளன. ஆனால் இவை அனைத்தும் இயக்குவதற்கு பயனரின் உள்ளீடு தேவைப்படுகிறது.

பாதுகாப்பு
சிம்பியன் இயக்கமுறைமை 81
தீம்பொருள்
சிம்பியன் இயக்கமுறைமை 91 மற்றும் திறந்த மூலத்தின் உருவாக்கம்