பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸின் செயல்பாட்டு மையங்கள் மணிலா மற்றும் செபுவில் இருந்தாலும், மணிலாவில் இருந்துதான் பெரும்பாலான விமானங்கள் இயக்கப்படுகின்றன. பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸின் முக்கிய இலக்குகளாக ஆசிய-பசுபிக் நாடுகள், வட அமெரிக்கா மற்றும் ஆஸ்திரேலியாவினைக் கொண்டுள்ளன. முக்கியமாக வெளிநாடுகளில் வாழும் பிலிப்பைன் நாட்டு மக்களைக் கருத்தில் கொண்டு இந்நிறுவனம் செயல்படுகிறது. பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸ் தற்போது மணிலா - ஜெனரல் சான்டோஸினை முக்கியமான உள்நாட்டு இலக்காகவும், இரு செயல்பாட்டு மையங்களைத் தவிர்த்த வழித்தடங்களான டார்வின் – பிரிஸ்பான் மற்றும் வான்கௌவெர் – டொரன்டோ ஆகியவற்றையும் இலக்குகளாகக் கொண்டுள்ளன.

இதற்கு முன்னர் பல செயல்பாட்டு மையங்களற்ற இடங்களுக்கு பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸ் தனது சேவையினை புரிந்தனர். அத்துடன் எந்தவித இடங்களிலும் நிறுத்தமற்ற சேவைகளையும் புரிந்தனர். இந்தச் சேவைகள் குறிப்பாக ஐரோப்பா நாடுகளில் செயல்படுத்தப்பட்டன. ஆசியாவின் நிதி பிரச்சினையால் இது போன்ற பல சேவைகள் நிறுத்தப்பட்டன. பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸின் உள்நாட்டு செயல்பாட்டுப் பாதைகளான மணிலா – நாகா, மணிலா - டுகேகரௌ மற்றும் தற்போது மணிலா – ஓஸமிஸ் போன்றவை ஏர்பில் எக்ஸ்பிரஸால் எடுத்துக்கொள்ளப்பட்டன. அத்துடன் மணிலா – செபு நகரம், டவௌ நகரம், லெகஸ்பி நகரம், புரெடோ பிரின்செஸா, புட்டுவன், ககயன் டி ஓரோ, கொடபடோ நகரம், டிபோலோக், ஸம்பௌங்க நகரம், டுமங்குட் மற்றும் டக்ளோபன் போன்ற இடங்கள் ஏர்பில் எக்ஸ்பிரஸால் நடத்தப்பட்டன. மார்ச் 1, 2014 முதல் இவற்றை பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸ் நிறுவனமே நடத்துகிறது.

இலக்குகள்
விமானக் குழு விவரங்கள்
கோட்ஷேர் ஒப்பந்தங்கள்
பிலிப்பைன் ஏர்லைன்ஸின் உயர்தர வழித்தடங்கள்