İşgal rejimi Kudüs‘ü tam anlamıyla bir yahudi şehri haline getirebilmek ve buradaki İslami mirası yok etmek için de yoğun bir faaliyet içine girdi. Bunun için en önce şehirdeki cadde, sokak, mahalle ve umuma açık yerlerin adlarını değiştirme yoluna gitti. Daha sonra Müslümanlara ait mukaddes mekanlara yönelik saldırılar oldu. Bu saldırılarda en büyük pay Mescidi Aksa‘ya düştü. Bu saldırılardan ileride tafsilatlı olarak söz edeceğiz.
İşgalcilerin Kudüs‘teki İslami mirasa yönelik saldırılarında ve kasıtlı uygulamalarında sadece Mescidi Aksa hedef alınmamıştır. Bunun yanı sıra Mescidi Aksa bünyesindeki vakıflara ait binalara el konulmuş ve birçoğu yıkılmıştır. Diğer İslami eserlerden de bazıları tamamen yıkılmış, bazıları amacı dışında örneğin bar ve eğlence yeri olarak kullanılmak üzere yahudilere teslim edilmiş, ayakta kalabilenler de daha önce geçtiği üzere ilgisizliğe terkedilmiştir. Örneğin 11 Nisan 1982’de İsrail askerleri Kubbetu’s-Sahra’ya saldırıda bulundular. Müslümanların camiyi savunmak istemeleri üzerine çıkan çatışmada bir Müslüman şehid oldu, 44 Müslüman da yaralandı. Cevheriye medresesi 1974’te tamamen yerle bir edildi. Vadi’l-Amud, Selvan, Vadi’l-Cevze ve et-Tavr adlı mıntıkalarda İslami vakıflara ait 36 dönüm arazi gasp edilerek buralardaki İslami izler tamamen ortadan kaldırıldı. Birçok ilim adamının ve bazı sahabilerin mezarlarının bulunduğu er-Rahme kabristanının bir bölümü yol genişletme çalışmaları gerekçe gösterilerek düzlendi. Me’menu’llah ve el-Maliha kabristanları da düzlenerek otopark alanı yapıldı.