Nusaybin Sınır Kapısı yapım işi tamamlanmıştır ancak Suriye’de devam etmekte olan iç karışıklıklar ve karşı tarafta sınır kapısı tesislerinin bulunmaması sebepleriyle bu tesis sınır kapısı olarak hizmet verememektedir. Bu nedenle Nusaybin‘in sınır kapısı olarak faaliyete geçeceği tarihe kadar söz konusu sahanın İç Gümrük Müdürlüğü olarak kullanılması amacıyla gerekli sözleşme değişikliği yapılmış ve 30.10.2013 tarihi itibariyle İç Gümrük Müdürlüğü olarak hizmete açılmıştır.