漫画『クロノアイズ』を掲載した出版社は何
クロノアイズ
ハデス
ハデスサイズの首領。全ての歴史を支配する事を目論む。普段は道化師のような仮面とローブで素顔を隠しており、素顔は大きなロイド眼鏡を掛けた長い髪の女性。その身体はほぼナノマシンで構成された細胞レベルでのサイボーグであり、不死に近い寿命と周囲のあらゆる物質を取り込む事による驚異的な再生能力持つ。しかしナノマシン細胞に精神まで侵蝕され、更に不死となった事で我欲に歯止めが効かなくなり、人間性を失いつつある。この身体はパペッティアが齎した未来の技術によるもの。
元々はある歴史上重要人物の娘である以外は普通の少女だったのだが、母の失踪と父が事故で行方不明になった事から自分の生きる歴史そのものを憎悪するようになり、パペッティアに付け込まれた事でハデスへと変貌した。タイキとはあさからぬ因縁があり、それゆえ彼に執着する一面も見せている。パペッティアに唆された事と、サイボーグ化による人間性の欠如で悪逆非道の"冥王"と化してしまっているが、本来は決してそのような人物ではなく、ハデスにならない最良解においては20年もの歳月を掛けて宇宙で行方不明となった父を助け出したほどの強さを持った女性であった。
アトランティスでの戦いの後、クロノアイズの上層部を唆してクロノスを拘束し、未来世界の支配者となる。未来に乗り込んできたタイキ達を一度は敗北に追い込み、タイキを「歴史通りの死を辿らせる」形で抹殺。更にアナ達も公開処刑しようとしたが、戻ってきたタイキからクロノアイズとタイムパラドックスの真実を聞かされ半狂乱に陥り、心身のバランスが崩れた結果、ナノマシンの機能が暴走して巨大な怪物へと変貌。世界の全てと同化するべく暴れ始める。
最後は自身の制御すら出来なくなったまま時空間を暴れ回るも、タイキと共に時空貫通弾で太陽系誕生の瞬間に飛ばされる。しかし最期の瞬間に本来の自分を取り戻し、妄念を晴らしてくれたタイキに感謝しながら、原始太陽誕生の爆発からその身と引き換えに彼を守って消滅した。この際の暴走で、図らずも「父が事故の一年後に無事帰還する」という部分分枝を生み出しており、クロノスは敢えてその時間枝に手を出さないように命じた。
パペッティア
首領ハデス直属のビメイダー。所属不明のクロノダイバー「パペッティア」と様々なスペシャルドレス（追加兵装）を駆使する。
ペルなどの他のビメイダーとは異なり殺人ができる（偶然未来社会に迷い込んだ金子を殺害している）が、誰かに「殺してよい」と許可されない限り行うことはできない。
実は311世紀よりも更に未来から来た存在であり、ビメイダーが迫害される暗黒時代の到来を防ぐべくある時代から送り込まれた。自分に都合の良い命令をする傀儡として「強い意志で歴史を恨む者」を探し、その結果ハデス（の前身）を覇道にそそのかした張本人でもある。だがハデスを本人の望み通りに細胞のナノマシン化を行った事でその野望は暴走を始め、自分の思惑から外れた為に望み通りの命令をしなくなったハデスを始末しようと画策。自身を敗北に追い込んだペルに協力を持ち掛けるも一蹴された為、ハデスが完全に人間でなくなった時を見計らって自ら始末しようとした。しかしその前にハデスが怪物と化した事で、ハデスを再び唆して制御下に置こうととするが、パペッティアこそが自分を狂わせた全ての元凶だと思い出したハデスに吸収される。死の間際、ハデスを「失敗だった」として最期の力で攻撃し、結果的にそれがタイキ達がハデスを止める一手となった。
プロフェッサー・スパイディ
四大幹部の一人。科学者。全てが管理された未来世界を嫌悪し、（殺人や戦争を含む）あらゆる自由が認められた世界を作る事が目的。スーパージェッターに登場する時間犯罪者スパイダーから名付けられた[8]。タイキと最初に戦ったハデスサイズでもある。目的の為に手段を選ばない冷徹な悪女だが、タイキにあっさり投げ飛ばされたりジャギィのテンションにキレるなどコミカルな姿を見せる事もしばしば。
最終的にパペッティアの戦闘力を引き出す為の捨て駒にされ、タイキに助けようとしてもらった（一緒に踏み潰された）事で彼に好意を抱くようになった。ハデスに見限られた事で四大幹部共々、タイキを新たなリーダーとして頼ってきたがそれがタイキの命を救い[9]、未来をも救う切っ掛けとなる。時空間の真実を知った後は自分のしてきた犯罪行為の無意味さ[10]を悟って歴史改変を諦めた。ハデスとの最終決戦では恥ずかしがりながら偽クレオに扮し、偽クロノアイズとしてタイキに協力した。決戦後は他の3人共々逮捕されるが、事態の収束に貢献した事もあってか4人とも軽い罪で済んだ。
第2部ではドクター・スパイディと呼称され、「未来屋」の協力者としてカロス17のAIの性格設計をした。カロス17が大破した際にも修理に協力している。タイキへは未だ好意を持っているらしく、アナに対してはそっけない態度を取る。それは彼女が設計したカロス17の性格にも現れている。
ジャギィ
四大幹部の一人。ハンターを名乗る。グルメで、あらゆる種類の絶滅動物（または一時代限定の食品[11]）を食べるのがハデスサイズに所属する目的であり、歴史の改変自体には興味は無い。幹部の中でも極めて能天気で考えなしに行動するトラブルメーカーで、時間犯罪とは関係無しに美味しいもの目当てで20世紀を訪れていたりする。やはりスーパージェッターの時間犯罪者ジャガーから名付けられている。
時空間の真実を知った際は「どこかに絶滅動物が大繁殖してる世界があるなんて思っただけで食欲を無くす」と、時間犯罪者をやめた。ハデスとの最終決戦では偽クロノアイズの一員として偽エルザに扮した。
自他共に「学が無い」と認められるタイプだが、妹は出来が良いらしい。アポロ11号の中でタイキ、エルザと共に三日間過ごした事もあり、その際にエルザと仲良くなった。
侵略大帝（しんりゃくたいてい）
四大幹部の黒一点で全身鎧を着ている。「大帝」は自分で名乗っているだけなので、「大帝なのに幹部」という事に作中でもツッコまれている。「未来では男性の肩身が狭い」として、女性の社会進出が本格化した20世紀に織田信長や武田信玄など男性の象徴たる戦国武将を呼び込み、再び覇権争いをさせる事で未来の女性中心社会を変えようとした。しかしその動機は自分が恐妻家である為、歴史を変えて「妻」の存在を消そうとした事である。せこい小悪党じみた性格だが戦闘能力はあり、肉弾戦でも相応に戦える。
あくまで妻から自由になれればよい為、時空間の真実を知った際にもあまりショックを受けた様子は無かった。ハデスとの最終決戦では偽クロノアイズとして偽退屈丸に扮した。
第2部ではクロノアイズの極秘下部組織「地図作製人（マッパー）」において時間樹の学術的研究を行う傍ら、グランサーへの依頼人の仲介もしている（ルール違反）。また、素顔は美男子であるという事実も明かされた。素顔の時は紳士だが、鎧を着用した際には普段通りの三下っぽいハイテンションな性格に変わる。タイキ曰く、「付き合いは長いけどあれはよく分からない」。この鎧は私物であり、損傷した際には未来屋に修復を依頼している。妻との離婚も成立し、ナスターシャと婚約するが思わぬ方面から反対される。
千界の王との決戦の際に置いてけぼりを喰ったヒルダの連絡を受けて協力する。以後ナスターシャ、ニンニくんと共に「未来屋」の新メンバー（バックアップ）として参加する事となる。
よく似た同名の人物が『マップス』と『わかりすぎた結末 あるいは失笑した宇宙 もしくはキャプテン・オーマイガーの華麗なる挑戦』にも登場しているがこの3者は全くの別人である。また本作品以降にも『スタジオ秘密基地劇場』等にセルフパロディとして登場している。
スリーピィ
四大幹部の一人。首のない女騎士の姿をしたサイボーグ。時空の狭間でなくした自分の頭部を探している。
首が無い状態でどうやって思考しているかは不明だが身体の方は生身な為、鎧なしの状態だと不気味すぎて仲間内でも不評。幹部の中では最もドライ且つ冷静な性格で、時空間の真実を知った際も「諦めてサイボーグの頭を付けちゃおうか」と吹っ切れていた。変装時にはマネキンやズダ袋などの「ダミー頭部」を着けており、ハデスとの最終決戦ではラクガキ状態のダミー頭部を付けて偽アナに扮した。