Bên cạnh kết quả đạt được như nêu trên, mức thuế suất thuế tài nguyên hiện hành đã bộc lộ một số tồn tại, hạn chế. Đối với nhóm khoáng sản kim loại, kết quả thực hiện sau 3 năm cho thấy cần thiết phải rà soát điều chỉnh lại mức thuế suất đối với một số loại tài nguyên. Việc tăng thuế, theo Bộ Tài chính là nhằm thực hiện mục tiêu không khuyến khích việc khai thác tài nguyên không tái tạo có giá trị kinh tế lớn, bảo vệ nguồn tài nguyên để phục vụ sản xuất trong nước, đảm bảo hài hoà lợi ích giữa Nhà nước, doanh nghiệp và người dân nơi có khoáng sản được khai thác. Cụ thể, mặt hàng sắt tăng khung thuế suất lên 7- 20, từ mức thuế suất hiện hành là 10. Nước ta có tổng trữ lượng quặng sắt khoảng 960 6 triệu tấn, trong đó trữ lượng đã thăm dò đạt 760 6 triệu tấn. Sản lượng khai thác các năm gần đây bình quân khoảng 3 5 triệu tấn tinh quặng/ năm. Để góp phần bảo vệ nguồn quặng sắt phục vụ sản xuất trong nước, khuyến khích doanh nghiệp khai thác đầu tư đổi mới dây chuyền công nghệ trong khai thác và chế biến quặng sắt, Bộ Tài chính đề nghị tăng mức thuế suất thuế tài nguyên đối với sắt từ 10 lên 15. Với việc tăng mức thuế suất nêu trên, số thu thuế tài nguyên đối với quặng sắt dự kiến khoảng 320 3 tỷ đồng/ năm, tăng khoảng 106 8 tỷ đồng. Mặt hàng titan được đề xuất tăng khung thuế suất lên 7- 20 từ mức thuế suất hiện hành là 11. Hiện việc khai thác và xuất khẩu titan phần lớn là ở dạng thô( quặng il men it, rutile tự nhiên và bột Zircon), hiệu quả chưa cao, chủ yếu xuất khẩu sang thị trường Trung Quốc. Để đảm bảo phục vụ nhu cầ ụ trong nước, hạn chế xuất khẩu thô tinh quặng và khuyến khích các doanh nghiệp khai thác đầu tư công nghệ tiên tiến chế biến sâu tinh quặng titan để xuất khẩu, ban soạn thảo đề nghị tăng mức thuế suất thuế tài nguyên đối với titan từ 11 lên 16. Theo tính toán, với mức thuế suất hiện hành là 11, lợi nhuận/ 1 đơn vị tài nguyên khai thác là 53.532 đồng/ tấn. Với mức thuế suất dự kiến tăng lên 16, lợi nhuận/ 1 đơn vị tài nguyên khai thác giảm còn 7.266 đồng/ tấn. Với việc tăng mức thuế suất nêu trên, số thu thuế tài nguyên dự kiến khoảng 123 8 tỷ đồng/ năm, tăng khoảng 38 7 tỷ đồng. Mặt hàng vàng cũng được đề nghị áp thuế ở mức 9- 25, thuế suất hiện hành là 15. Tổng trữ lượng vàng nước ta khoảng 154 tấn, trong đó trữ lượng thăm dò chỉ đạt 42 7 tấn. Theo Bộ Tài chính, công nghệ khai thác, chế biến vàng của các doanh nghiệp trong nước chưa cao, hiệu quả kinh tế đạt thấp, gây lãng phí tài nguyên và phát sinh tác động xấu về môi trường. Ngoài ra, sản lượng khai thác vàng rất khó quản lý. Do đó, để hạn chế việc khai thác tài nguyên quý hiếm với trữ lượng có hạn, khuyến khích doanh nghiệp thăm dò, khai thác vàng hiệu quả và hạn chế gây ô nhiễm môi trường, đề nghị tăng mức thuế suất thuế tài nguyên đối với vàng từ 15 lên mức kịch trần 25. Với việc tăng mức thuế suất nêu trên, số thu thuế tài nguyên dự kiến khoảng 348 3 tỷ đồng/ năm, tăng khoảng 139 3 tỷ đồng.