Entretemps, Juquitiba était devenu une municipalité se séparant d'Itapecerica da Serra.
En 1891, la municipalité de Juquitiba a été officiellement créée, avec son propre conseil municipal et ses propres institutions. Cela a marqué un tournant important dans l'histoire de la région, permettant à la communauté de Juquitiba de se développer