松井氏
清和源氏満政流
清和源氏満政流の松井氏は、源満政の6世の孫にして源頼朝の御家人となり、山城国綴喜郡の地頭職となった重行の系統がある（なお、同郡には、渡来人系（百済人とも）の松井氏があるがこれとは別系統である）。
子孫の一系統は、三河国に移り、後に徳川家康に仕え、幕臣・旗本となった。また、前掲の松井康之は清和源氏満政流で山城国綴喜郡松井庄の出身とする説もある。松井康之が肥後国移住の際、綴喜郡松井の菩提寺にあった父正之の墓を所領に移転したという。
清和源氏為義流
その祖は、清和源氏の源為義の子・源維義。維義が松井冠者を称したことから、維義の子の季義が松井姓を名乗ったとする。この系統には三河松井氏（後の松井松平家）・遠江松井氏。別流に丹波松井氏、近江松井氏がある。室町将軍家御家人の松井氏や、戦国時代に丹波国竹野郡に割拠した松井佐渡守（丹波松井氏）も同流を称する。江戸時代には、肥後熊本藩主・細川氏の筆頭家老で実質の八代城主になった。
三河松井氏
室町時代に今川氏家臣の遠江松井氏が三河国に入り、吉良氏の寄騎となった系統がある。これが三河松井氏である。松井忠次の代で今川氏・吉良氏の麾下を離れて徳川家康に従い、松平姓を受けて松平周防守康親と名乗った。これ以降、松平姓を受けた一族を松井松平家とも呼ぶ。譜代大名や旗本を出した。
特に大名の家は江戸時代に繁栄し、国政の中枢に座り、幕閣の老中・大坂城代・京都所司代・寺社奉行などを歴任した。
足利幕臣から細川氏の家老へ
松井氏は、室町時代には足利将軍家に仕える幕臣だった。足利義輝が永禄8年（1565年）に殺害されると（永禄の変）、松井正之の子松井康之は、同じく足利将軍家に仕えていた細川藤孝（幽斎）と共に、義輝の弟足利義昭を将軍に擁立するために行動する。
康之は、義昭が織田信長を頼ったときにもその宿所いたことが確認できる。やがて細川藤孝のもとで働くようになった康之は、藤孝の嫡男細川忠興（三斎）と明智光秀の三女玉（ガラシャ）の婚礼で玉姫の輿入請取役を務めている。
信長の下で細川氏は丹後国の領主となり、その重臣として康之は丹後国松倉城を任せられた。生涯50余度の合戦に出陣した康之は武功高く、石田三成の家老島左近や上杉景勝の家老直江兼続らと並んで世に名家老と謳われた。康之の働きぶりをみた豊臣秀吉は石見半国18万石に取り立てようともちかけたが、康之は引き続き細川家に仕えることを望んでこれを辞退した。その忠節に感じ入った秀吉は、康之が信長から拝領していた山城国相楽郡神童寺村及び愛宕郡八瀬村の知行を安堵する朱印状に「深山」の茶壺を添えて贈っている。これが後世「十八万石の壺」と呼ばれる名器である。
慶長5年（1600年）の関ヶ原の戦いに、康之と嫡男松井興長は藩主細川忠興に従って奮戦し、東軍勝利に貢献した。戦後細川氏は豊前国と豊後国（現在の福岡県と大分県の一部）で39万石余りの大名となり、康之は豊後国木付（杵築）城を任せられて2万5000石の知行地が与えられた。
興長は康之の次男として天正10年（1582年）に生まれ、兄が文禄・慶長の役で戦没すると嫡子となり、慶長16年（1611年）に康之が隠居すると家督を相続した。
肥後国八代城主へ
寛永9年（1632年）肥後国52万石の加藤忠広が改易されると、替わって細川忠利が54万石で熊本に入部した。肥後国で興長には玉名郡と合志郡に3万石が与えられた。藩主忠利の父忠興（三斎）は肥後国南部の八代城をその隠居城としたが、この城は薩摩の島津氏に対する押さえとして特に一国一城令の例外とされていた。正保2年（1646年）にその三斎が死去すると、八代城は興長が預かることになり、以後代々松井氏が八代城代を務めた。興長は忠興の次女古保（こお）を正室とし、三斎の六男を養嗣子に迎えて（松井寄之）、細川氏の別姓である「長岡」を賜り、長岡佐渡守と称した。こうして松井氏は熊本藩の実質的支藩である八代3万石の領主として幕末に至る。
松井氏は宮本武蔵と親交があったことで知られる。松井家には、武蔵が細川家に仕官する直前に興長に宛てた書状（長岡佐渡守宛書状）が残っており、また武蔵が熊本藩の客将となった後も寄之が武蔵を後援し、自身もその兵法の弟子となっている。寄之はやがて病床に臥すようになった武蔵の身の世話をしていたことも、寄之と武蔵の養子宮本伊織との間に交わされた多くの書状から明らかになっている。こうして武蔵の手による水墨画や工芸品などの文物の多くが松井家に伝えられた。
秀吉から安堵されていた山城国の知行地は幕府からも安堵を得ており、このため松井氏は細川家家臣として陪臣であるとともに幕府直参としての横顔も併せ持つ特殊な家となった。松井家当主の代替わりおよび将軍の代替わりに際しては、その都度江戸に出府して将軍に御目見得している。
細川家では世襲家老家の松井氏・米田氏・有吉氏を上卿三家と呼んだが、中でも松井氏は細川一門として代々筆頭家老を勤めた。
明治維新後は、万石以上の大身家老家として明治25年（1892年）に松井敏之が華族に列し男爵を授爵している。
松井神社
松井神社は、熊本県八代市北の丸町に鎮座する神社で、肥後細川氏筆頭家老であった松井氏初代・松井康之、2代・興長を祀る。明治14年（1881年）に松井氏の旧家臣団をはじめ、ゆかりのある人々により創建されたもので、境内には樹齢三百数十年の梅の名木「臥竜梅」（がりゅうばい）がある。
史料・史跡
松井家の城下町だった熊本県八代市の八代市立博物館や松井文庫には松井歴代史料が展示されており、近くには八代城跡や松井家の御茶屋だった松浜軒（しょうひんけん）もある。松井家系図等の史料は八代市立博物館「未来の森ミュージアム」などのウェブでも見ることができる。なお熊本市の水前寺成趣園内にある出水神社にも史料がある。
江戸初期までの当主
維義 - 義宗 - 宗信 - 維宗 - 宗保 - 保祐 - 宗次 - 助宗 - 助清 - 宗経 - 安広 - 寛次 - 宗富 - 長之 - 正之 - 康之 - 興長