上丸子駅
駅構造
廃止時点で、単式ホーム1面1線を有する地上駅であった。ホームは線路の西側（丸子町方面に向かって右手側）に存在した。列車交換設備は有していなかったが、側線を1線有していた。この側線は晩年に撤去されたとのことだが、1969年（昭和44年）3月時点では撤去されていなかった。
無人駅となっていたが、有人駅時代の駅舎が残っていた。駅舎はホーム中央部分に接していた。
駅跡
2007年（平成19年）8月時点では、遺構は無くなっていた。2010年（平成22年）10月時点では、空地になっていた。
また、1996年（平成8年）時点では、丸子町駅附近から電鉄大屋駅附近までの線路跡は丸子町道（後に上田市道）となっていた。舗装道路となって整備されているため、2007年（平成19年）8月時点では遺構は無かった。2010年（平成22年）10月時点でも道路は健在であった。
西丸子線連絡線計画
上田丸子電鉄としての車輛運用の合理化を計るため、当駅と西丸子線寿町駅とを連絡する0.8kmの路線を作って別所線と丸子線を結ぶ計画を立て、1951年（昭和26年）7月31日に運輸省（現・国土交通省）から路線敷設認可が交付された。しかし用地買収が困難になり計画変更、八日堂駅 - 別所線上田駅間を連絡する（八田線/八日堂線）案を進めることとなった。当駅 - 寿町駅間の免許は1956年（昭和31年）8月17日に失効、未成線となった。