法華口駅
駅構造
片面ホーム1面1線。西側に木造の駅舎を持ち、駅舎内は無人化後、待合室が駐輪場となっていた。駅舎は1915年の開業当時に建設されたものである。この駅舎とプラットホームおよび便所について、文化審議会は2013年11月に登録有形文化財とする答申を文部科学大臣に提出した（他に播磨下里駅・長駅も対象）。
国鉄時代からの古い駅名標が残されている。隣駅が網引駅と播磨下里駅になった1943年から、1945年頃までに書かれたと思われる右横書きの駅名(ローマ字は無し)も読み取る事が出来る。
国鉄時代の末期は中間駅で唯一の有人駅（業務委託駅）だったが、現在は無人駅となっている。国鉄時代に列車交換設備を廃止したが、かつての相対式ホーム跡が残っている。交換設備の復活が予定されているが、復活には至っていない。無人駅のまま交換駅とすることが検討されているが、理論的な保証を得ることと、費用の面が課題になっている。2018年2月、加西市の支援により交換設備を「2019年度」に復活させる構想があることが神戸新聞により報じられた。2018年3月に策定された「加西市地域公共交通網形成計画」には、「2018（H30）年度～2019（H31）年度」を実施時期とした「法華口駅鉄道交差施設整備事業」が含まれている。
以前は汲み取り式便所（便器は全穴和式）があったが、2012年1月、地元ボランティアらの寄付や協力によって洋式水洗トイレが完成した。
2012年11月に、駅舎パン工房～Mon favori～（モンファボリ）が開店した。店長はボランティア駅長を兼務していたが、2017年10月をもってボランティア駅長を退任した。ボランティア駅長を目当てに北条鉄道に乗車する人も少なくなく、2017年度の北条鉄道の営業収益減少の原因の一つに、ボランティア駅長の退任も挙げられていた。
駅西側には自転車置き場が新設された。駅南側には駐車場が整備される予定。
かつての駅構造
1958年（昭和33年）以前は、列車交換設備と貨物側線があった。
北条町駅方面側には駅本屋と貨物側線があり、駅本屋の直近には貨物上屋、駅本屋から少し離れたところに農業倉庫 があり、それぞれに貨物ホームがあった。さらに以前は粟生駅方面側にも側線があった。貨物ホームは、線路側は石の三段積みで、反対側はゆるい傾斜がついており、トラックなどが着けるようになっていた。貨物上屋の北条町駅側には倉庫があったのだが、これは改装らしかった。旅客ホームは石の二段積みで、貨物ホームより低かった。