南阿蘇鉄道MT-3000形気動車
車体
2両とも両運転台、MT-3001は前面非貫通式で、秋田内陸縦貫鉄道AN8900形、高千穂鉄道TR-300形によく似た前面形状、MT-3010は両運転台、正面貫通型で、レトロ調の外観となった。乗務員室は左側で、乗務員用扉が設けられた。引き戸の客用扉が片側2か所、運転室がない側はMT-3001では車端に、MT-3010では小窓を挟んだ位置に、運転室がある側は2両とも乗務員用扉の直後に設けられた。客用扉の幅はMT-3001では850 mm、MT-3010では900 mmとなった。扉間には上段固定、下段上昇の幅1,200 mmの窓6組が設けられた。MT-3001では運転室がない側の客用扉の後ろに400 mm幅の固定窓があり、排気管のある位置の開閉窓の幅は800 mmとなっている。2両ともトイレの装備はない。MT-3001の外部塗装はシルバーをベースとし、グリーンとパープルの帯と阿蘇五岳が水に映るイメージが意匠化され、MT-3010はモスグリーンを基調に窓下にゴールドの枠、中央に阿蘇の野花のイラストが描かれた。屋根上にはダミーのモニタールーフが設けられた。
MT-3001の車内はセミクロスシートで、車体中央部に4人掛けボックスシートが通路の両側に4組ずつ配置されている。MT-2000形に対してシートピッチが拡大されている。MT-3010は4人掛ボックスシートを基本とするが、車端の4個所は車端を向いた2人掛となっている。MT-3010の内装は木目調、天井に丸形灯具、窓側上部にすずらん灯を設けたレトロ調となっている。2両ともワンマン運転用の機器を備える。
走行装置
2両の走行装置は共通で、エンジンは、新潟鐵工所製DMF13HSディーゼルエンジンを1基搭載、定格出力184 kW（250 PS） / 1,900 rpmに設定された。動力は新潟コンバーター製TACN-22-1105液体変速機（変速1段・直結2段）を介して2軸駆動の台車に伝達される。台車は上枕空気ばね、軸ばね式軸箱支持のNP125D/Tが採用された。制動装置は排気ブレーキ・機関ブレーキ併用DE1A自動空気ブレーキである。
空調装置
暖房装置はエンジン排熱を利用した温風式である。冷房装置は能力24.0 kW（20,600 kcal/h）のR134-Aが設置された。
運用
南阿蘇鉄道は国鉄の特定地方交通線だった高森線を第三セクターに転換して1986年（昭和61年）4月に気動車3両で開業、翌1987年（昭和62年）に予備車確保のため国鉄キハ52形を購入してMT-2100形としたが、各部が老朽化してきたうえ、ワンマン運転に対応していないことから、合理化のため新製した車両と置き換えることになり、MT-3000形MT-3001が1993年（平成5年）12月に製造された。その後、くまもと未来国体が1999年（平成11年）に熊本県で開催されることが決まり、南阿蘇鉄道沿線でも各種競技が開催されることから輸送力を増加させる必要が発生、1998年（平成10年）3月に日本宝くじ協会の助成を受けてMT-3010が製造された。くまもと未来国体終了までは第2、第4土曜のみの運転とされ、国体終了後に通常の運用に投入された。
2002年（平成14年）度にMT-3001の外部塗装が上半分シルバーグレー、下半分イエローに変更され、室内もロングシートに改造された。2013年（平成25年）度には、MT-3010の外部塗装がダークピンクに変更されている。