PhyloCode
PhyloCode (ファイロコード) は、正式名称を International Code of Phylogenetic Nomenclature (系統学の学名命名法の国際規則)といい、系統学の学名命名規則を規定する公式な規則の草案である。最新版では、種名の管理を既存の階級主体の命名規則 （ICN,ICZN,ICNB,ICTV）の精度を維持しながらも、特別にクレードの命名を規定できるようにしている。
PhyloCodeは、ISPNの管理下にある。
分岐学の観点を重視した命名規則
PhyloCodeは、ホモニムまたはシノニムそしてシノニムまたはホモニムの一組といったもので承認されることが見込まれるもの（一般に最初に登録されたもの）といった制定検討中である学名とその定義についてどのように決定するかのルールを提供することによって、系統学上の命名規定を提案するものである 。PhyloCodeは、側系統群や多系統群から由来するタクソン名ではなく、単系統群のクレードのタクソン名のみを適正なものとし、標本・種・共有派生形質といった分岐学の観点からのみを公式の学名の基準と見做す。ただし、PhyloCodeは、既存の学名を置き換えるものではなく、あくまでその補完をするものである。
バージョン
PhyloCodeの草案は何回かの改訂を経ている。 古いバージョンはすべてWebサイトに残してある。 2018年11月時点でのバージョンは4cである。
構成
他の命名規則と同様に、PhyloCodeの規則は条項として構成され、次に章として構成されている。各条項には、注釈、例、および推薦状も含まれている。
登録データベース
一度実装されると、 PhyloCodeは "RegNum" と呼ばれる登録データベースに関連付けられ、承認されることが想定される全てのクレード名と定義が保存される。クレード名を定義に関連づける為のパブリックで利用可能なツールが提供され、(TreeBASEなどの) 系統樹データベースを介して、サブタクソンや標本などのセットと関連づけられることが期待されている。
しかしながら、現在計画されているように、 "RegNum" の最重要な使用目的は、保存の場合を除けば、最少の登録番号を持つシノニムまたはホモニムの内のどのデータのものを選択するかの決定である。
歴史
(Condensed from the PhyloCode'の序文の要約)
PhyloCodeは、1998年8月にハーバード大学でワークショップを開き 、その範囲と内容について決められた。ワークショップ参加者の多くは、後でプロジェクトに加わった他の数人の人々とともに、諮問グループとして働いた。 2000年4月、ウェブ上で草案が公開され、科学者コミュニティからコメントが求められた。
2002年7月にイェール大学で第2回ワークショップが開催され、PhyloCodeの規則と推薦にいくつかの変更が加えられた。 他の改訂も時折実施されている。
2004年7月6日から2004年7月9日までフランスのパリで開催された第1回国際系統学命名会議には、11ヶ国からおよそ70名の体系学者と進化生物学者が参加した。これは、系統学的な命名規則に全面的に焦点を当てた最初の公開された複数日開催の会議であり、ISPNの発足の場を提供するものになった。ISPNの会員は、PhyloCodeのコンセプト作りの初期段階を監督した諮問グループの役割を引き継いだ系統学的命名委員会(CPN)を選出した。
2006年6月28日から2006年7月2日まで、米国コネチカット州ニューヘイブンにあるイェール大学で第2回国際系統発生学会が開催された。
第3回国際系統学命名会議は、2008年7月21日から2008年7月22日までカナダノバスコシア州ハリファックスにあるダルハウジー大学でで開催された。
影響
PhyloCodeの理論的基盤は、系統樹の一部を参照することでタクソン名を定義することができたという初期の示唆によって始まりとなるデ・ケイロスとゴーティエによる一連の論文で創られた。
可能な限り、 PhyloCodeの命名者は、モデルとして階級主体のアプローチを単一の規則に統一しようとしたBioCodeの草案を使用した。それゆえ、PhyloCodeの構成、その専門用語のいくつかと特定の規則の表現はBioCodeに由来する。他の規則では、特に植物学と動物学で階級主体の規則が1つかそれ以上は由来している。しかしながら、PhyloCodeの多くのルールは、代替となるような体系の定義基盤の根本的な相違の為に、分類学上の階級に基づく規則には対応しない。
将来
PhyloCodeは議論の余地があり、何人かの分類学者からかなりの批判を受けた。10年以上前に発足したが、PhyloCodeの普及を促進する支持者の数は依然として少ない。2018年の時点で、規則が実施されたとしても、実際にどれほど広範に実施されるようになるかは不透明である。一部の支持者は、少なくとも最初は、関連する登録データベース "RegNum" に付随する一連の規則としてのみ実装すべきだと考えており、科学者らのコミュニティによる受け入れは、クレード名とその定義を見つけるためのユーティリティとしての "RegNum" の利用普及への段階に移れるかもしれない。
PhyloCodeの公開された批評のリストは、反論のリストと同様に、ISPNのウェブサイトで見ることが出来る。