ソニックバトル
ストーリー
ソニックがビーチに来ると、謎のロボットが倒れていた。そのロボットをテイルスのところに連れて行くと、突然シャドウが現れる。ロボットを引き渡すように要求するシャドウ。ソニックがそれを拒否すると、シャドウは戦いを挑んでくるのだった。
ストーリーモード
今作は、ソニック、テイルス、ルージュ、ナックルズ、エミー、クリーム、シャドウ、エメルの8人のキャラクターのシナリオが存在する。ただし、最初はソニックしか選べず、ソニックシナリオをクリアするとテイルスシナリオがプレイできる、というようにクリアするたびに次のキャラクターのシナリオがプレイ出来るようになる。なお、各キャラクターのシナリオは、同じ時間の物語を別キャラ視点でプレイ、というものではなく全てのシナリオの物語が順番につながっている。
ストーリーモードでは、マップ上の特定のポイントでイベント、戦闘が発生し、ストーリーが進んでいく。戦闘では現在プレイ中のシナリオの主人公キャラ、およびエメルを使用することになる。
バトルモード
マップやルール、キャラクターを自由に設定し、戦うモード。ストーリーモードにおいてガンマ、カオスに出会うことで、彼らを使用することもできるようになる。
チャレンジモード
コンピュータを相手に全5戦のバトルを勝ち抜くモード。バトルの内容に応じて得点がもらえ、最終的な合計得点を競う。
トレーニングモード
対戦相手の動作を設定し、ダメージが加算されない相手に対して練習するモード。
スキルについて
ストーリーモードにおいてエメルが戦闘に参加している場合、戦闘が終了するとスキル、スキルポイントを手に入れることが出来る。スキルは、その戦闘に参加していたキャラクターのスキルのうち、いずれかをランダムで入手できるが、極稀にレアスキルを入手できることがある。スキルポイントは、ノーダメージだと5ポイント、ノーミスだと2ポイント、1回以上ダウンした場合は1ポイント貰える。手に入れたスキルは、エメルに装備することで強化、カスタマイズができる。ただし、装備するためには一定のスキルポイントが必要である。当然、スキルによって必要なスキルポイントは異なる。スキルポイントは、500までしか溜めることは出来ない。ストーリーモードにおいて、カオスエメラルドの入手イベントを見ることでスキルポイントを10ポイント手に入れることが出来る。なお、スキル、スキルポイントのデータは全てのシナリオで共通である。
戦闘の流れ
まず最初に全てのキャラクターが必殺技を選択し、戦闘を開始する。通常技や必殺技を使って戦う。ヒットポイントはMAX 100となっている。0になるとダウンしてしまうといって戦闘が終了するわけではない（例外：エメルのストーリーモードでのバーチャルトレーニング）。ヒットポイントが0になったプレイヤーは、再び必殺技を選択し、フィールドの好きな場所を選択し、復帰できる。復帰した場合、ヒットポイントは満タンになり、イチコロゲージはダウン前の状態が引き継がれる。こうして、だれかが戦闘終了条件を満たすまでひたすら戦い続けることになる。
必殺技について
どのキャラクターも、グランドショット、エリアルショット、グランドパワー、エリアルパワー、グランドセット、エリアルセットの6つの必殺技を持っている。このうち、2種類を選択し、戦うことになる。グランド〜と着いているものは地上で、エリアル〜と着いているものは空中で使える必殺技である。2種類選択するとき、グランド同士、エリアル同士、という組み合わせで選ぶことは出来ない。また、ショット同士、パワー同士、セット同士、という組み合わせも出来ない。そのため、ショット系、パワー系、セット系のうち、一つを地上、一つを空中で使用することになる。選ばなかった系統は、相手の必殺技に対して無敵になる（例えば、グランドショットとエリアルセットを選択した場合、敵が使用したパワー系必殺技が一切効かなくなる）。なお、イチコロゲージがMAXになると、キャラクーが点滅する。この状態で必殺技を当てると相手を一撃で倒せる。ただし、相手がその系統の必殺技に対して無敵になっていた場合は無効になってしまい、その相手のイチコロゲージがMAXになってしまう。
キャラクター
ここでは、本作におけるキャラクターの特徴を記述する。各キャラクターの詳細な設定などは、ソニックシリーズの項を参照。