アトバコン
副作用
治験で見られた主な副作用は、悪心（16%）、発疹（18%）、嘔吐（9%）、下痢（6%）、頭痛（6%）、発熱（4%）である。
重大な副作用として、皮膚粘膜眼症候群（Stevens-Johnson症候群）、多形紅斑、重度の肝機能障害、無顆粒球症、白血球減少 が添付文書に記載されている。
プログアニルとの合剤での重大な副作用は上記の他に、肝炎、胆汁うっ滞、アナフィラキシー、汎血球減少症 である。
作用機序
ミトコンドリア内膜に存在する呼吸鎖複合体I、II、III、IVの内、IIIを構成するチトクロームbとユビキノン（CoQ10）との結合を阻害し、P. jirovecii の呼吸を抑制する。P. jirovecii の近縁種であるP. carinii では呼吸阻害のIC₅₀は0.043µMであり、ヒト肝臓のミトコンドリアに対するIC₅₀は約150倍〜600倍であるので選択性があると言える。これはチトクロームbの275番アミノ酸の違いによると考えられ、P. jirovecii の近縁種とされるイースト菌を用いた実験では、275番アミノ酸の変異で耐性が出現した。