ロックマンX4
概要
ロックマンXシリーズ第4作。ゼロが全般的に操作できる正式なプレイヤーキャラクターになったことに加え、アニメカットシーンやボイスの導入、グラフィックや音源の鮮明化など、ハード移行に伴ってより高い表現力を実現している。ゲーム内アニメパートは『ロックマン8 メタルヒーローズ』と同様、XEBECが製作を担当している。ゲームアーカイブス版では、『ポケモンショック』の影響後、点滅表現が変更や削除されるなどの対応がとられていない（ただし、2018年7月25日にPC版で発売され、後に同年7月26日にコンソール版で発売された『ロックマンX アニバーサリー コレクション』では、点滅表現が変更や削除されるなどの対応がとられている）。
本作ではゲーム開始時にエックスとゼロのどちらかを選択する「ダブルヒーロー制」を導入している。ゼロの攻撃は前作のバスター主体からゼットセイバー主体へと変更され、従来のシューティング感覚の強い操作性と一線を画したその操作性は、後続の作品にも強く影響を与えている。ストーリーの内容は根本こそ同じだが登場キャラクターや挿入される展開が多少変わり、ゼロの場合はより濃密となっている。しかし、それに反してエックスの扱いが軽すぎるため、「影が薄くなった」事を非難されている。
パッケージデザインはPS版は従来と同じく各キャラクターを載せたものとなっているが、SS版では暗闇の中にスポットライトのような光を当てられたゼロが一人だけ佇んでいるというデザインに変更されている。
ストーリー
大規模な災害時に迅速な対応をするために設置されたレプリロイドで構成された軍隊、レプリフォースはイレギュラーハンターと共にイレギュラーを回収していた。両者はこれまでお互いに助け合い、協力しながら、それぞれの任務を行っていた。
だがある日、巨大イレギュラーによって、空中都市スカイラグーンが占拠されその影響で下の町に落下、巨大イレギュラーがレプリフォース仕様のものであった事、レプリフォースの主力戦力として採用されている「ノットベレー」の姿が現場で見受けられた事などから、レプリフォースに疑いがかかる。
この事態にイレギュラーハンター側は、現場にいた指揮官･カーネルに事情聴取の為の投降を要請したが、軍人としてのプライドを優先したカーネルはこの要請を拒否。その結果、巨大な軍事力を持ったレプリフォースが最高司令官･ジェネラルをリーダーとして一斉にクーデターを起こし、各地を占拠してしまった。 
イレギュラーハンター司令部は直ちにレプリフォース全体をイレギュラーと認定し、エックス、及びゼロに出撃命令を下した。
アルティメットアーマー
本作初登場の隠しアーマー。ライト博士曰く、「禁断のパーツ」でエックスの戦闘能力を最大限まで引き出せるが、安全性が保証できないとされており、設定上は諸刃の剣とも言えるアーマー（ゲーム上では特にデメリットなどはない）。本作を機にX7以外のXシリーズに隠しアーマーとして登場する。通常のプレイでは登場せず、プレイヤー選択画面で特定の隠しコマンドを入力することによりゲーム中での入手が可能となる（通常のパーツを入手するカプセルが、アルティメットアーマー一式を入手するカプセルに置き換わる）。前述のコマンド入力が成功した状態でゲームを開始すると、その目印としてエックスの基本カラーが微妙に変化する。このコマンドは後述のブラックゼロ入手コマンドと共にカプコンのホームページで公開されている。
ゲーム中での基本的な性能は通常のアーマーとほぼ同じだが、ノヴァ・ストライクの使用可能回数が無制限（ゲージが常時満タン）になり、発動中は完全な無敵状態になる（通常は一部の敵に接触するとダメージを受けてしまう）などの性能強化が行われている。 アームパーツはプラズマチャージショットで固定されており、ストックチャージショットへの交換は不可。なお、ゲーム中のエックスの会話デモでは通常のヘッドパーツとボディパーツの状態になっている。アルティメットアーマーの性能は『ロックマンX コマンドミッション』と『ロックマンX8』を除き、すべて本作の性能が元となっている。
ゲーム未登場の能力の設定として、バスターからビームブレードを発生させる機能、背中のブースター（ノヴァ・ストライク時に出現）で飛行する機能、アーマー自体をボード状の支援飛行メカに変形・別働させる機能が存在し、それぞれ公式イラストも描かれている。これらは限定版付属のキット（バンダイから発売されていた『メガアーマー』シリーズ）で立体化されている。
ブラックゼロ
黒いカラーリングのゼロ。エックスのアルティメットアーマー同様隠しキャラクターのような位置付けであり通常のプレイでは登場せず、プレイヤー選択画面で特定の隠しコマンドを入力することによりゲーム中での使用が可能となる。
アルティメットアーマーとは異なり、外見が変化する以外通常のゼロとの性能差は一切無く、ムービー中やダッシュ時の残像は赤いままである。
スカイラグーン落下事件
レプリフォースに偽造された巨大イレギュラー＝イレギオンがスカイラグーンを襲撃し動力炉（浮遊装置）が破壊される。地上の市街地に落下し多数の犠牲者を出す大惨事となった。カーネルはラグーン落下の報を受け、ほぼ同時にイレギュラーに拉致されたアイリスの救助を兼ね遅れて自分の受け持っていた部隊と共に駆けつけた。
ハンター司令部は「レプリフォースがスカイラグーンを占拠」という情報を現場に向かったハンター達同様受けており、エックス（ゼロ）はばったり会ったカーネルに武装解除・任意同行を要請する。カーネルはこれを断りその場を去り、エックス（ゼロ）及びハンター本部はレプリフォース全体への疑いを強めた。
この落下事件がきっかけとなり組織にイレギュラー疑惑が向けられた事を受け、ジェネラルはレプリロイドだけの国家を造る事を決意。彼自身によってTV生中継による独立宣言が行われた。そして各地でレプリフォースのクーデターが相次いで勃発。大量のライフライン施設を破壊・占拠し多くの犠牲者を出すに及んで、慎重な姿勢を見せていたイレギュラーハンターもレプリフォース組織全体をイレギュラー認定せざるを得なくなる。
かくして後に「レプリフォース大戦」と呼ばれる戦争の導火線に火が着いた。
カーネルとアイリスの関係
レプリフォースはかつて、ロックマンのような闘争心と平和を愛する心を持ったレプリロイドの開発を計画していたが、いざ実験を行うと結果は失敗となってしまった。その際に相反した先の2つの心が分離し、闘争心がカーネル、そして平和を愛する心がアイリスに変じ兄妹レプリロイドとなったとされる。
両者が同じCPUを使用しプログラムの大半が似通っており、互いを想う言動を見せる。