基于M78亚类的存在，一些研究者认为索马里人起源于哪里？
根据Sanchez等人的Y染色体研究。（《2005年》，Cruciani等人，2005年）。（2004年、2007年），索马里人与非洲东北部其他亚非语系群体有着父系的密切关系。E1b1b1a（以前称为E3b1a）单倍型除了构成索马里人Y-DNA的大部分外，在埃塞俄比亚人、苏丹人、埃及人、柏柏尔人、北非阿拉伯人以及许多地中海居民的父系DNA中也占很大比例。Sanchez等人（2004年）。（2005）在大约77%的索马里男性样本中观察到E1b1b的M78亚类。According to Cruciani et al.（2007年），在霍恩地区出现的这一亚群可能代表了古埃及/利比亚移民的痕迹。在索马里人中，仅次于E1b1b单倍体的第二个最常见的Y-DNA单倍体是西亚单倍体T（M70）。在索马里男性中，这一比例略高于10%。单倍型组T，与单倍型组E1b1b一样，通常也存在于非洲东北部、北非、近东和地中海的人群中。
埃及/利比亚