maladies infectieuses
COVID 19
Diagnostic du COVID 19
Tests par reverse transcriptase-PCR (RT-PCR) ou autres tests basés sur l'amplification des acides nucléiques sur les sécrétions des voies respiratoires hautes et basses Test antigénique sur les sécrétions des voies respiratoires supérieures Les sujets suivants doivent être testés à la recherche du COVID-19: Les personnes qui ont une Symptomatologie ; l'isolement est recommandé jusqu'à ce que des résultats négatifs soient obtenus Les sujets qui ont été en contact étroit avec une personne infectée par le COVID-19 mais qui sont asymptomatiques, se font tester au moins 5 jours après l'exposition; le port d'un masque est recommandé jusqu'à ce que des résultats négatifs soient obtenus Les sujets à qui un test est demandé du fait de la fréquentation d'une école, du lieu de travail, d'un environnement de soins, du fait d'exigences gouvernementales ou d'autres situations telles que des événements en intérieur Les sujets qui ont pris part à des activités qui les exposent à un risque plus élevé de COVID-19, telles qu'assister à de grands rassemblements ou se trouver dans des environnements denses sans port correct du masque, peuvent également vouloir être testés. Les tests diagnostiques du COVID-19 sont disponibles dans les laboratoires et les sites publics et peuvent également être effectués à domicile. Il existe deux principaux types de tests diagnostiques du COVID-19: la RT-PCR (ou un autre test d'amplification des acides nucléiques) et les tests antigéniques. Le choix du type de test diagnostique et son interprétation doivent dépendre de la probabilité que la personne soit atteinte par le COVID-19, ce qui est fonction de la prévalence du SARS-CoV-2 dans la population et de la symptomatologie ou de contacts rapprochés avec un sujet atteint de COVID-19. La RT-PCR a la plus haute sensibilité et spécificité analytique et est le test diagnostique de référence pour le COVID-19. D'autres plates-formes de test d'amplification des acides nucléiques sont généralement un peu moins sensibles que la RT-PCR avec une spécificité équivalente (voirCDC: Nucleic Acid Amplification Tests). Cependant, des tests PCR positifs n'indiquent pas toujours une infection active. Ils peuvent détecter des fragments d'acides nucléiques viraux non viables et rester positifs pendant au moins 3 mois après le diagnostic initial, indépendamment des symptômes. ). Ce qui peut être important pour identifier les cas asymptomatiques et interrompre la transmission du SARS-CoV-2. Les tests de détection de l'antigène au lit du malade ou à domicile sont moins sensibles que les tests d'amplification des acides nucléiques, en particulier au début de l'infection lorsque la charge virale peut être basse. La sensibilité de ces tests par rapport aux tests PCR varie selon le fabricant et l'évolution de l'infection, avec des gammes rapportées de 40 à 90% ( Références pour le diagnostic ). Par conséquent, il peut être nécessaire de confirmer certains résultats des tests antigéniques (p. ex., un test négatif chez une personne présentant des symptômes) par une RT-PCR ou un autre test d'amplification des acides nucléiques. De nombreux kits de tests de détection de l'antigène recommandent également de répéter le test en série sur plusieurs jours pour augmenter la probabilité de détecter une infection (voir aussi Les types de prélèvements appropriés pour les tests diagnostiques du COVID-19 sont le nasopharynx, l'oropharyngien, les cornets médians, la partie antérieure des narines et la salive. Se reporter aux instructions de prélèvement pour le laboratoire ou aux instructions de la notice du kit de test, car toutes les plates-formes et laboratoires de test peuvent ne pas être en mesure de tester tous les types d'échantillons. Ceux-ci peuvent être recueillis par un professionnel de santé ou auto-collectés, à l'exception des prélèvements nasopharyngés, qui ne doivent être recueillis que par un praticien correctement formé et accrédité. Pour les prélèvements nasopharyngés et oropharyngés, utiliser uniquement des écouvillons en fibres synthétiques avec des tiges en plastique ou métalliques. Ne pas utiliser des écouvillons à l'alginate de calcium ou des écouvillons en bois, car ils peuvent contenir des substances qui inactivent certains virus et inhibent les tests PCR. Les écouvillons doivent être placés immédiatement dans le tube de transport fourni. Il faut maintenir un contrôle approprié de l'infection lors de la collecte des échantillons. Pour des raisons de biosécurité, les institutions et les laboratoires locaux ne doivent pas tenter d'isoler le virus en culture cellulaire. Les résultats positifs obtenus en laboratoire ou dans un établissement de soins sont transmis aux services de santé locaux et de l'État. Certains services de santé locaux utilisent également des systèmes de déclaration des résultats positifs à domicile. Les tests sérologiques, ou par anticorps, ne doivent pas être utilisés pour diagnostiquer la maladie aiguë à COVID-19 parce que les anticorps ne deviennent le plus souvent détectables que 1 à 3 semaines après le début des symptômes. Des tests anticorps sont disponibles et ciblent l'antigène nucléocapsidique du SARS-CoV-2, l'antigène spike et le domaine de liaison au récepteur de l'antigène spike. Les tests qui détectent les anticorps dirigés contre la protéine nucléocapside sont recommandés pour évaluer l'existence d'une infection antérieure chez les sujets vaccinés car cet antigène n'est pas inclus dans le vaccin. Des dosages quantitatifs et semi-quantitatifs d'anticorps sont disponibles, mais il n'existe actuellement aucune corrélation acceptée avec l'immunité et les tests ne sont pas recommandés pour déterminer la réponse immunitaire à la vaccination ou à l'infection (voirCDC: Interim Guidelines for COVID-19 Antibody Testing). Les examens de laboratoire de routine en cas de maladie grave comprennent une lymphopénie ainsi que des signes moins spécifiques tels que des taux élevés d'aminotransaminase (ALT, AST), des taux élevés de lactate déshydrogénase (LDH), de D-dimère, de ferritine et de marqueurs inflammatoires tels que C-reactive protéine. Les patients qui présentent une dyspnée, une hypoxie à l'oxymétrie à domicile ou d'autres symptômes inquiétants doivent être adressés pour une évaluation médicale comprenant une mesure de la saturation en oxygène et un suivi des signes de détérioration clinique. L'imagerie thoracique peut être normale en cas de maladie modérée et s'aggraver avec la sévérité de la maladie. Les signes typiques sont compatibles avec une pneumonie virale et comprennent des opacités en verre dépoli et une consolidation à la rx ou à la TDM du thorax. L'imagerie thoracique n'est pas recommandée comme outil de dépistage systématique du COVID-19. 1.Drain PK: Rapid diagnostic testing for SARS-CoV-2.N Engl J Med386(3):264-272, 2022. doi: 10.1056/NEJMcp2117115 2.Ford L, Lee C, Pray IW, et al: Epidemiologic characteristics associated with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) antigen-based test results, real-time reverse transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) cycle threshold values, subgenomic RNA, and viral culture results from university testing.Clin Infect Dis73(6):e1348-e1355, 2021. doi: 10.1093/cid/ciab303 3.Wu S, Archuleta S, Lim SM, et al: Serial antigen rapid testing in staff of a large acute hospital.Lancet Infect Dis22(1):14-15, 2022. doi: 10.1016/S1473-3099(21)00723-4 4.Dinnes J, Sharma P, Berhane S: Rapid, point-of-care antigen tests for diagnosis of SARS-CoV-2 infection.Cochrane Database Sys RevJuly 22, 2022. doi: 10.1002/14651858.CD013705.pub3/full 