Allerdings waren ihre Experimente zur Wellenbewegung ihre bedeutendste Arbeit.
Durch Ayrtons Experimente entdeckte sie den Grund für das Zischen von Bogenlaternen – das Zusammentreffen von Sauerstoff und Kohlestäben. Allerdings waren ihre Experimente zur Wellenbewegung ihre bedeutendste Arbeit. In ihrer Forschungsarbeit erklärte sie, wie sich Kräuselungen bilden und sich gegenseitig herstellen. Sie wandte ihre Theorien über die Kräuselungsbewegung in Wasser und Luft während des Ersten Weltkrieges an: Dies führte zur Erfindung des „Ayrton Fans“, der verwendet wurde, um Gasangriffe abzuwehren. Das Geheimnis der Wellen entdeckt zu haben, ist ihr dauerhaftes Erbe und ihr Beitrag zum Kanon der Naturwissenschaft.