Les inclusions peuvent être propres à une espèce minérale, nous donnant ainsi la clé de leur identification.
Un des nombreux avantages offerts par un microscope est de pouvoir détecter et afficher les caractéristiques de clarté, également appelées inclusions. Ces inclusions sont la clé pour séparer les pierres précieuses synthétiques. Les inclusions peuvent être propres à une espèce minérale, nous donnant ainsi la clé de leur identification. Les caractéristiques de clarté aident également à détecter les traitements et les améliorations, et parfois même l'origine de la pierre.