Cuijpers wijst er ook op dat publicatie-biases, het feit dat veel studies die niet de gewenste resultaten opleverden niet gepubliceerd worden, de waarheid kan vertekenen.
Naast dit zogenaamde ‘researcher allegiance’-effect noemt Huibers meer methodologische bezwaren die kleven aan de meta-analyse, zoals het vergelijken van verschillende populaties, behandelsettingen en protocollen, waardoor geen valide conclusie getrokken kan worden. Dit wordt beaamd door Pim Cuijpers, door Huibers ’s werelds meest vermaarde “meta-analyticus” genoemd, die per mail aangeeft niet te spreken te zijn over de kwaliteit van de meta-analyse en bezig te zijn met een heranalyse van de gegevens. Cuijpers wijst er ook op dat publicatie-biases, het feit dat veel studies die niet de gewenste resultaten opleverden niet gepubliceerd worden, de waarheid kan vertekenen.