De maximale diepte van dit kanaal ligt zuiver theoretisch op 1,80 meter, de diepte van de sluisdrempels, maar in de praktijk moet je onder normale omstandigheden op hooguit 1,60 meter rekenen.
Het meest kritische deel qua diepgang is dat Canal entre Champagne et Bourgogne, het hoogst gelegen deel van deze route. Van alle doorgangkanalen in Midden-Frankrijk tref je hier de meest betrouwbare watertoevoer. De maximale diepte van dit kanaal ligt zuiver theoretisch op 1,80 meter, de diepte van de sluisdrempels, maar in de praktijk moet je onder normale omstandigheden op hooguit 1,60 meter rekenen. Bedenk hierbij dat je in zoet water ongeveer 2,5 procent lager drijft dan in zout water. Ofwel, steekt je jacht in zee 1,60 meter diep, dan komt daar op de zoetwaterkanalen ongeveer 4 centimeter bij.