Bovendien vereist het handhaven van het delicate evenwicht van voedingsstoffen, pH en lichtniveaus in hydrocultuursystemen zorgvuldige monitoring en regelmatige aanpassingen, wat tijdrovend kan zijn.
Organische hydrocultuur brengt echter ook bepaalde uitdagingen met zich mee. De initiële opstartkosten kunnen hoger zijn in vergelijking met traditionele landbouwmethoden. Gespecialiseerde apparatuur, infrastructuur en organische inputs kunnen aanvullende investeringen vergen. Bovendien vereist het handhaven van het delicate evenwicht van voedingsstoffen, pH en lichtniveaus in hydrocultuursystemen zorgvuldige monitoring en regelmatige aanpassingen, wat tijdrovend kan zijn. Bovendien moeten biologische hydrocultuurboerderijen de juiste biologische certificeringen verkrijgen om het vertrouwen van de consument te garanderen en te voldoen aan de normen die zijn vastgesteld door biologische regelgevende instanties.