Dat leidt vaker plaatselijk tot overstromingen en bedreigt de bomen in die gebieden.
Ook klimaatverandering bedreigt het Amazonewoud. Door de opwarming van de aarde neemt de hoeveelheid waterdamp in de lucht afkomstig van zee toe. Dit geeft meer neerslag in het regenseizoen die in hevigere buien naar beneden komt. Dat leidt vaker plaatselijk tot overstromingen en bedreigt de bomen in die gebieden. Aan de andere kant neemt door de opwarming de droogte toe in het droge seizoen en duurt ook langer, vooral in het droge zuidoosten. In de afgelopen 40 jaar is het droge seizoen 6 tot 14 dagen langer geworden. De effecten van ontbossing en de effecten van klimaatverandering versterken elkaar dus.