In onze darmen is continu een strijd gaande tussen afweercellen en goede en slechte bacteriën.
Een tweede functie van het microbioom is dat het je immuunsysteem versterkt. Het immuunsysteem bestaat uit afweercellen die schadelijke virussen, schimmels en bacteriën vernietigen. Tachtig procent daarvan bevindt zich in onze darmen. De darmen zijn dus de eerste en belangrijkste barrière die ons lichaam opwerpt tegen ongewenste indringers. In onze darmen is continu een strijd gaande tussen afweercellen en goede en slechte bacteriën. In het ideale geval bestaat er een evenwicht in de darmen, waarbij de goede bacteriën ons dus beschermen tegen ziekteverwekkende micro-organismen zoals virussen en schimmels.