De wetenschappers zijn nog voorzichtig met betrekking tot het geven van concrete voedingsadviezen.
Een gezond microbioom zorgt voor betere gezondheid. De exacte samenstelling van het microbioom wordt, naast erfelijke factoren en medicatie ook  bepaald door wat we eten. De wetenschappers zijn nog voorzichtig met betrekking tot het geven van concrete voedingsadviezen. Wel zien ze een positief verband tussen een plantaardig eetpatroon en een gunstige microbioom. Vezelrijke voedingsmiddelen (groente, fruit, noten, volkoren granen) zijn de basis voor een gezondmicrobioom.