Hierdoor vermindert de hoeveelheid triglyceriden en C-reactieve eiwitten, stoffen die gelinkt zijn aan ontstekingen.
Polyfenolen van cacao kunnen de hoeveelheid Bifidobacteriën en lactobacilli verhogen en de hoeveelheid schadelijke clostridia verminderen. Hierdoor vermindert de hoeveelheid triglyceriden en C-reactieve eiwitten, stoffen die gelinkt zijn aan ontstekingen. Polyfenolen in rode wijn hebben een gelijkaardig effect en zouden ook de goede bacteriën stimuleren bij mensen met metabolisch syndroom.