The guide RNA and the Cas9 protein complex together go bouncing along the genome, and when they find a spot where the guide RNA matches, then it inserts between the two strands of the double helix, it rips them apart, that triggers the Cas9 protein to cut, and all of a sudden, you've got a cell that's in total panic because now it's got a piece of DNA that's broken.
Насочващата РНК и  белтъчният комплекс Cas9 се движат заедно по генома докато намерят място,  където насочващата РНК се свързва. След това се вмъква между  двете вериги на двойната спирала, разделя ги, което активира Cas9 и  той осъществява срязване. И изведнъж имате клетка,  която е в тотална паника, защото в нея е налична ДНК с нарушена цялост.