The Union was largely run by the Polish and increasingly Polonized Lithuanian and Ruthenian nobility, through the system of the central parliament and local assemblies, but from 1573 led by elected kings.
Uniooni juhtis suuresti Poola ning üha poloniseeritum Leedu ja Vene aadel, keskvõimu parlamendi ja kohalike nõukogude süsteemi kaudu, mida aastast 1573 juhatasid valitud kuningad.