Several international and human rights organisations, such as Human Rights Watch and the Organization for Security and Co-operation in Europe in 1993, the UN Human Rights Council in 2008 have found no evidence or pattern of systematic abuse of human rights or discrimination on ethnic grounds, while others, such as Amnesty International in 2009, have raised concerns regarding Estonia's significant Russophone minority.
Mitmete inimõiguse organisatsioonide, nagu Human Rights Watch ja Euroopa Julgeoleku- ja Koostööorganisatsiooni aastal 1993 ja ÜRO inimõiguste nõukogu aastal 2008 läbi viidud uuring ei tuvastanud süstemaatilisi inimõiguste rikkumisi ega etniliste gruppide tagakiusamisi, siiski tundis Amnesty International 2009. aastal muret Eestis asuva rohkearvulise vene kogukonna pärast.