Research in Matsalu became regular in 1945, when the Institute of Botany and Zoology of the Estonian Academy of Sciences established a research base in Penijõe.
Истраживање у Матсалу постало је редовно 1945. године када је Институт за ботанику и зоологију Естонске академије наука основао истраживачку базу у селу Пеничу.