The Emajõgi is sometimes called the Suur Emajõgi ("Great Emajõgi"), in contrast with the Väike Emajõgi ("Little Emajõgi"), another river which flows into the southern end of Lake Võrtsjärv.
Emajõgi jest czasami nazywana Suur Emajõgi (Wielka Emajõgi), w przeciwieństwie do Väike Emajõgi (Mała Emajõgi), innej rzeki uchodzącej do jeziora Võrtsjärv.