In this case, neither global nor local alignment is entirely appropriate: a global alignment would attempt to force the alignment to extend beyond the region of overlap, while a local alignment might not fully cover the region of overlap.
Neste caso, nin o aliñamento global nin o local son completamente adecuados: un aliñamento global intentará forzar á aliñación a estenderse máis alá da rexión de solapamento, mentres que o aliñamento local non cubrirá totalmente a rexión solapada.