It is not clear how the cell determines the locations of de novo DNA methylation, but evidence suggests that, for many (though not all) locations, RNA-directed DNA methylation (RdDM) is involved.
Non está claro como fai a célula para determinar a localización da metilación do ADN de novo, pero a evidencia suxire que, na determinación de moitas (aínda que non todas) as localización está implicada a metilación do ADN ARN dirixida (RdDM).