Because progressive methods are heuristics that are not guaranteed to converge to a global optimum, alignment quality can be difficult to evaluate and their true biological significance can be obscure.
Como os métodos progresivos son heurísticos e, por tanto, non garanten a converxencia a un óptimo global, a calidade do aliñamento pode ser difícil de avaliar, e a súa verdadeira significación biolóxica pode ser escura.