By determining the presence or absence of CSIs in an out-group species, one can infer whether the ancestral form of the CSI was an insert or deletion and this can be used to develop a rooted phylogenetic relationship among organisms.
Determinando a presenza ou ausencia de CSIs en especies fóra do grupo, pode inferirse se a forma ancestral do CSI foi unha inserción ou deleción e isto pode utilizarse para elaborar árbores enraizadas que indiquen as relacións filoxenéticas entre os organismos.