An intuitive representation is the distance matrix, which is a two-dimensional matrix containing all pairwise distances between some subset of the atoms in each structure (such as the alpha carbons).
Unha representación intuitiva é a matriz de distancias, que é unha matriz bidimensional que contén as distancias de todos os emparellamentos entre algún subconxunto dos átomos de cada estrutura (por exemplo, o carbono alfa).