The profile matrix for each conserved region is arranged like a scoring matrix but its frequency counts for each amino acid or nucleotide at each position are derived from the conserved region's character distribution rather than from a more general empirical distribution.
A matriz do perfil de cada rexión conservada disponse como unha matriz de puntuación, mais as súas cifras de frecuencias para cada aminoácido ou nucleótido en cada posición derívanse da distribución dos caracteres da rexión conservada, en lugar dunha distribución empírica máis xeral.