Note that there is no clear distinction between obligate and non-obligate interaction, rather there exist a continuum between them which depends on various conditions e.g. pH, protein concentration etc. However, there are important distinctions between the properties of transient and permanent/stable interactions: stable interactions are highly conserved but transient interactions are far less conserved, interacting proteins on the two sides of a stable interaction have more tendency of being co-expressed than those of a transient interaction (in fact, co-expression probability between two transiently interacting proteins is not higher than two random proteins), and transient interactions are much less co-localized than stable interactions.
Nótese que non hai unha distinción clara entre as interaccións obrigadas e non obrigadas, senón que o que hai é un continuo entre elas, que depende de varias condicións, por exemplo o pH, concentración de proteínas etc. Porén, hai importantes diferenzas nas propiedades das interaccións transitorias e as das permanetes/estables, xa que as estables están moi conservadas e as transitorias moito menos conservadas, e dúas proteínas que interaccionan nunha interacción estable teñen unha maior tendencia a ser coexpresadas que as que interveñen en interaccións transitorias (de feito, a probabilidade de coexpresión entre dúas proteínas que interaccionan transitoriamente non é maior que a de dúas proteínas calquera tomadas aleatoriamente), e as interaccións transitorias están moito menos colocalizadas que as interaccións estables.