In the beginning of the KEGG project, KEGG LIGAND consisted of three databases: KEGG COMPOUND for chemical compounds, KEGG REACTION for chemical reactions, and KEGG ENZYME for reactions in the enzyme nomenclature.
Ao principio do proxecto KEGG, KEGG LIGAND constaba de tres bases de datos: KEGG COMPOUND para compostos químicos, KEGG REACTION para reaccións químicas, e KEGG ENZYME para reaccións na nomenclatura encimática.