During the course of the game, the protagonist uncovers clues to his past and true identity while helping other stalkers and fighting the mutated creatures that inhabit The Zone.
V průběhu hry protagonista odhaluje stopy ke své minulosti a skutečné identitě, a zároveň pomáhá ostatním stalkerům bojovat proti zmutovaným bytostem a lidem, kteří obývají Zónu.