During the Bosnian war, he served in the Army of the Republic of Bosnia and Herzegovina and received the Golden Lily — the highest military decoration awarded by the Bosnian-Herzegovinian government.
V průběhu bosenské války sloužil Komšić v Armádě Republiky Bosna a Hercegovina a obdržel Zlatou lilii – nejvyšší vojenské vyznamenání udělované bosenskou vládou.