The Mate 9 is preloaded with Android 7.0 "Nougat" and Huawei's Emotion UI (EMUI) 5.0, which improves the system's performance over previous versions.
Telefon je vybaven operačním systémem Android 7.0 Nougat a Huawei nadstavbou EMUI 5.0, která zlepšuje výkonnost systému oproti starším verzím.