The number of Protestants and Muslims declined significantly after September 1999 because these groups were disproportionately represented among supporters of integration with Indonesia and among the Indonesian civil servants assigned to work in the province from other parts of Indonesia, many of whom left the country in 1999.
انخفض عدد البروتستانت والمسلمين بشكل ملحوظ بعد سبتمبر من عام 1999 لأن هذه المجموعات كانت ممثلة بشكل غير متناسب بين مؤيدي التكامل مع إندونيسيا وبين موظفي الخدمة المدنية الإندونيسيين المعينين للعمل في المقاطعة والقادمين من أجزاء أخرى من إندونيسيا، وغادر العديد منهم البلاد في عام 1999.