On 3 August 2007, Thomas assumed command of the Australian Defence College, which on 14 January 2008 became Joint Education, Training and Warfare (JETW) Command (which encompasses the Australian Defence College Headquarters, the Australian Defence Force Academy, the Australian Command and Staff College, the Centre for Defence and Strategic Studies and the ADF Warfare Centre).
في 3 أغسطس 2007 تولى توماس قيادة كلية الدفاع الأسترالية التي أصبحت في 14 يناير 2008 قيادة مشتركة للتعليم والتدريب والحرب (التي تشمل مقر كلية الدفاع الأسترالية وأكاديمية قوة الدفاع الأسترالية والقيادة الأسترالية وكلية الموظفين الأستراليين ومركز الدفاع والدراسات الاستراتيجية ومركز حرب قوة الدفاع الأسترالي.