On 6 June 2012, he returned to Anorthosis Famagusta, signing a one-year contract with the club, but in September 2012, Boaventura forced to stop his career at 32 years old because he was treated heart problems.
6 червня 2012 року він повернувся в «Анортосіс», підписавши контракт з клубом на один рік, але у вересні 2012 року Боавентура змушений припинити свою кар'єру в 32 роки через проблеми з серцем.