By annual re-elections Endecott served nearly continuously until his death in 1664/5; for two periods (1650–1651 and 1654–1655) he was deputy governor.
Ежегодно переизбираясь, он руководил колонией почти непрерывно до своей смерти в 1664/5; в течение двух периодов (1650-1651 и 1654-1655 гг.) он был заместителем губернатора.