Selv om Zen hadde vært til stede i Japan siden det 12. århundre, begynte dens oppstigning under Kamakura-regimet, som fant den mystiske kinesiske filosofien beundringsverdig egnet for japansk følsomhet, impressionisme og kjærlighet til form og ritual.
Selv om Zen var til stede i Japan tidlig, ble det raskt utryddet av buddhister som søkte å ødelegge de som praktiserte det.