I de neste tre århundrene hadde Nepal tre bystater ved siden av hverandre i dalen Kantipur (nå kjent som Kathmandu), Lalitpur (nå kjent som Patan) og Bhaktapur (også noen ganger kalt Bhadgaon), sammen med deres innlandet.
Nepal mistet endelig disse bystatene i det attende århundre på grunn av en intern konflikt.