FEMA står også overfor spesielle oppdragsrelaterte utfordringer, inkludert å gi rettidige svar på katastrofehjelpforespørsler, forhindre eller redusere skade og tap fra fremtidige katastrofer gjennom kostnadseffektive begrensningsarbeid og jobbe effektivt med andre føderale, statlige og lokale programmer.
FEMA hjelper også flyktninger med å få hjem i krigstider.