Selskapet ødela den portugisiske flåten og tok over beskyttelsen av de muslimske pilegrimsskipene til Mekka, men det var ingen harde følelser; portugiserne ga Bombay til kong Karl II i 1661 som en del av medgift av Catherine av Braganza.
Portugiserne visste at det var bedre å bli venner enn å fortsette å kjempe mot en mektigere motstander.