Basilikaens høydepunkt, og generelt akseptert som et arbeid av en ung Giotto, er Francis Life (1296-1304) rørende feiret i 28 scener langs den nedre nivå (start fra høyre transsept), mens 32 fresker i øvre nivå illustrerer scener fra Det gamle og nye testamente.
Scener i den nedre nivået ble skapt av Giotto nær slutten av livet sitt.