یکی از بزرگ ترین چالش‌ها در انجام استخراج DNA این است که معمولا به تجهیزات بسیار گران قیمت نیاز دارد. ساعت‌ها طول می‌کشد. 
One of the biggest challenges in doing a DNA extraction is it usually requires very expensive equipment, and takes hours. 