부산항운노조의 구조적 비리가 좀처럼 근절되지 않고 있다. 부산항운노조 전·현직 간부들이 취업 및 승진을 대가로 금품을 수수하는 등 구조적 비리가 여전한 것으로 확인됐다. 2005년에도 검찰 수사로 40여명이 구속 기소됐었다. 부산지방검찰청 특수부(부장 박승대)는 지난 2월부터 약 4개월간 부산항운노조를 수사해 김모(53), 이모(70)씨 등 전 위원장 2명을 비롯해 터미널운영사 임직원 4명, 일용직 공급업체 대표 2명 등 모두 31명을 적발했다고 밝혔다. 검찰은 김씨 등 16명을 구속하고 달아난 항운노조 지부장 1명을 지명수배했다. 이 전 위원장 등 14명은 취업 승진 복직, 정년 연장 등을 해주고 1000만~5000만원의 검은돈을 받아 챙겼다. 김 전 위원장과 노조 지도부는 2013년부터 올해 초까지 노조 간부 친인척 등 외부인 135명을 유령 조합원으로 올린 뒤 이 중 105명을 부산신항 물류업체에 전환 배치한 혐의를 받고 있다. 신항 업체에 숙련된 인력을 제공한다는 전환 배치 취지와 달리 항만 근무 경험이 없는 외부인을 항운노조원으로 꾸며 취업시켰다. 불법 취업한 이들 중 60%가 반장 이상 노조 간부의 친인척이거나 주변 사람이었다. 또 터미널운영사로부터 정리해고, 임단협 과정에서 항운노조 반발을 무마해 주는 대가로 1500만원을 받아 챙겼다. 부산항운노조와 일용직 공급업체, 터미널운영사의 유착도 드러났다. 부산항운노조는 2014년부터 일용직 항운노조원을 터미널운영사 등에 공급하며 노무관리를 Y사에 대행하도록 했다. 항운노조 지부장의 친형이 운영한 Y사는 일용직 공급권을 독점하며 설립 2년 만에 연매출 200억원을 거두는 등 급성장했다. Y사는 법인 자금 50억원을 빼돌려 부동산과 외제 차를 구매하는 등 사적으로 사용했다. Y사 대표는 항운노조 간부나 터미널운영사 간부 등에게 금품로비를 하고 독점 노무 공급권을 유지했다. 이모(55) 국가인권위원회 팀장은 부산소장 재직 시절 채용 비리로 구속된 이 전 위원장의 가석방과 특별면회 등 편의를 알선해 주는 대가로 3000만원을 받은 혐의로 구속됐다. 검찰은 수사 결과에서 드러난 부산항운노조 문제점을 부산지방해양수산청 등 감독기관에 통보하기로 했다.
2005년 채용비리로 구속 수사를 받았던 부산항운노조가 전·현직 간부들의 취업 및 승진 대가 금품 수수 등 또다시 채용비리가 적발되는 등 구조적 비리가 근절되지 않고 있는 것으로 나타났다.