또 2016년 7월 7일에 개최된 10차 무역투자진흥회의와 2016년 9월 8일 개최된 국가정책조정회의에서 약가제도 개선 내용이 본격적으로 포함되었다. 그 내용을 살펴보면, 최근 정부는 글로벌 혁신신약의 약가를 대체약제 최고가의 10%까지 가산할 수 있도록 하였으며, 약가 협상 기간을 60일에서 30일로 단축하여 신속 등재가 가능하도록 하고, 세계 최초 신약에 대해 경제성 평가를 면제하고 유사 약제에 대한 선진국 가격을 참조하여 가격을 책정하도록 하였다. 또 최초로 시장에 진입하는 바이오시밀러와 바이오베터의 약가는 10% 가산하고, 고함량 생물의약품에 대해서는 약가를 남은 함량 약가의 1.9배(기존은 1.75배까지)까지 가능하도록 하는 약가 기준 개선을 시행하며, 실거래가 약가 인하 주기도 현행 1년에서 2년으로 연장하였다(보건복지부 2016a; 국가정책조정회의, 2016).
2016년 하반기의 무역투자진흥회의와 국가정책조정회의에서 기존의 약값 산정 및 조정 시기 등에 관한 기존 제약 가격 체제를 적극적으로 현실을 반영하여 개편한 내용이 채택되었다.