비용-효과분석은 경제성 분석 방법 중 하나로 두 가지 이상 중재법의 비용과 효과를 비교분석하는 방법이다. 특별히, 효과를 질보정생명연수(quality-adjusted life-year, QALY)로 보는 방법을 비용-효용분석(cost-utility analysis)이라고 하며 비교하고자 하는 두 가지의 중재법의 효과와 비용의 차이 비율을 점증적 비용-효과비율(incremental cost-effectiveness ratio, ICER) 지표로 나타내어 평가한다. 재정영향분석은 새로운 의료기술의 도입과 확산이 보험재정에 미치는 재정적 영향을 파악하고자 하는 방법이다. 비용-효과분석은 새로운 의료기술이 비용에 합당한 가치가 있는지 여부를 평가하는 것인 반면, 재정영향분석은 그 의료기술의 도입을 감당할 수 있는지(affordability)를 판단하는 것이다.
의료 기술에 대한 분석 중 비용-효과분석은 신 의료 기술이 비용 대비 가치의 합당성을 평가한다. 반면 재정영향분석은 그 의료 기술을 도입할 수 있는지 능력을 검토하는 것이다.