이러한 세부사업 중심의 예산평가와 배분은 다양한 정책들을 해결하기 위한 사업의 구성이 세부사업단위로 이루어지고 있음을 의미한다. 즉, 정책과제 해결을 위한 문제의 단위가 세부사업단위로 구성됨을 의미한다. 이것은 세부사업단위의 문제정의가 국가가 해결해야 할 정책적 과제를 종합적으로 기획하고 관리하는데 한계가 있으며 세부사업 단위의 부분적인 접근과 해결책 마련으로 종합적인 효과를 창출하는데 구조적으로 한계가 있음을 나타낸다. 더구나 복합화 및 융합화 되어가고 있는 최근의 국가사회문제들의 속성들을 고려할 때 세부사업단위의 문제 구조화는 그 성과 및 역할이 상당한 제한적일 수밖에 없다.
정책과제 해결을 위한 사업의 구성은 세부사업 단위로 실행되고 있는데, 이는 정책적 과제를 종합적으로 실행하는 데에 구조적 한계를 가져와 성과 및 역할에 어려움을 주고 있다.