전공의의 교육 부분을 구분하기 매우 모호한데, 이들이 현재 수련과정에 있기 때문에 하루 종일 교육받는 것으로 볼 수 있는 측면이 존재한다. 대한병원협회의 「수련시간 계측 방법 표준안」에 따르면 정규 수련시간 외의 학습, 저널이나 발표를 준비하거나, 논문을 작성하는 시간은 자기개발 시간이므로 수련시간에서 제외하되, 수련시간 이내 또는 기관장 승인 하의 논문작성 등은 수련시간으로 인정된다. 그러나 전공의들은 세미나, 컨퍼런스 참석도 업무의 하나로 보았으므로 이를 자기개발로 보는 대한병원협회와 전공의 간의 시각차가 존재함을 알 수 있다. 의료교육 자체가 도제식 교육이기 때문에 교육과 업무의 구분 자체가 모호한 점이 분명 존재하고 있다.
전공의는 사실상 하루 종일 수련을 받지만 대한병원협회의 표준안은 정규 수련시간 외의 업무는 수련시간으로 인정하지 않는다. 그러나 도제식 의료교육에서 교육과 업무를 구분하기란 어렵다.