바이오산업발전방안의 부처별 계획을 살펴보면, 먼저 산업자원부는 2월 ‘생물산업 발전 종합대책’을 보완할 구체적 계획으로, ① 산업화 기반조성을 위한 인프라확충, ② 핵심 분야의 산업기술 및 응용기술 개발 지원, ③ 생물산업 시장의 활성화, ④ 생물산업 제품의 안전성 관리 및 소비자 보호 정책을 제시했다. 산업화 기반조성을 위한 인프라 확충을 위해 산업자원부는 한국생물산업협회와 공동으로 ‘바이오산업 통합정보시스템’을 구축하여 전문 인력 정보, 국내외 바이오제품 개발추이, 시장동향 등의 정보를 제공하기로 했다. 그리고 민간의 핵심기술 중 단백질 칩, 환경친화 미생물농약, 산업용 미생물 등 특정 분야를 선정하여 집중 지원하고 대학부설병원을 중심으로 유전체 연구실을 설치하여 응용연구를 지원할 계획도 마련했다. 과학기술부는 제1차 생명공학육성기본계획을 토대로 바이오산업과 관련된 생명공학 기초연구와 기술개발을 확충하는 데 계속 주력하기로 했다. 특히 대학의 고급인력 양성과 연구개발을 촉진하기 위해 대학우수연구센터와 창의적 연구사업단을 2002년까지 50개로 확대하고 각각을 핵심기술별(유전체 연구, 단백체 연구, 생물정보학 등)로 특성화하기로 했다.
산업자원부의 바이오산업발전방안인 생물산업 발전 종합대책을 보완할 구체적 계획으로, ‘바이오산업 통합정보시스템’을 구축해 산업화 기반조성을 위한 인프라확충, 민간의 핵심기술중 특정 분야를 선정해 산업기술 및 응용기술 개발 지원, 생물산업 시장의 활성화, 생물산업 제품의 안전성 관리 및 소비자 보호 정책을 제시했다. 