총인의 경우, 두 가지 방법 모두 시료의 산화 이후 발색 및 흡광광도법을 통해 시료 중의 총인의 농도를 결정한다는 점에서는 공통적이다. 수질오염공정시험기준 상에는 산화방법으로 과황산칼륨법을 지정하고 있으나, 국가수질자동측정망에서는 과황산칼륨법과 UV산화법 두가지 모두를 사용하고 있다. 아래 [그림 3-4]는 총인 분석에 있어서 수질오염공정시험기준과 국가수질자동측정망 측정기기의 분석 방법을 비교한 그림이다. 그림에서 알 수 있듯이, 기기의 유지 관리를 위해 산화 이전에 100 μm 필터를 이용해 하천수를 여과한다는 차이가 있다. 또한, 여과 이전에 하천수 이송 시에 펌프를 이용한다는 차이점 또한 포함된다. 아래 [표 3-2]는 국가 수질자동측정망에서 이용 중인 대표적인 총인 측정 장비의 특징 및 측정 흐름을 정리한 표이다.
수질오염공정시험기준과 국가수질자동측정망 측정기기의 분석의 차이는 기기의 유지 관리를 위해 산화 이전에 100 μm 필터를 이용해 하천수를 여과하는 것과 여과 이전에 하천수 이송 시에 펌프를 이용한다는 차이점이 있다.