한편 ‘건강보험 DB’의 질병통계(정보공개>통계자료실>건강보험 DB)에서 웹으로 원하는 변수들만 선택한 후 엑셀로 해당 자료를 다운받아 사용할 수도 있다. 건강보험통계연보와 담고 있는 내용은 동일하나 매년 발간되는 통계연보의 경우 시계열 자료 확보를 위해서는 각 연도의 통계연보를 다운받아 해당 질환의 비용을 각각 가져와야 하는 반면, ‘건강보험DB’를 활용하면 2004년 이후 시계열 자료를 한 번에 확인할 수 있다. 또한 원하는 질환이 여럿일 경우 통계연보에서는 하나씩 복사해서 가져와야 하지만 통계 DB에서는 ‘조회범위 상세설정하기’를 통해 해당 질환들만 선택하면 한 번에 결과가 제시된다. 298분류의경우 통계연보에서는 숫자로만 제시되어 있어 별도의 표를 보고 해당 질환을 확인해야 하지만 통계 DB에서는 숫자 및 질환명이 함께 있어 유용하다.
통계연보와 달리 건강보험DB는 순자와 질환명을 함께 제공하며, 시계열 자료와 같이 필요한 변수만 골라 엑셀로 확인할 수 있고, 조회범위 상세설정을 통해 확인하고자 하는 질환별로 검색도 가능하다.