단위해역 평가는 실질적으로 연안이용·개발이 이루어지는 해역의 생태환경요인, 해역·토지이용용도, 지역경제수준 등을 종합적으로 분석해 단위해역의 이용가치를 정하기 위한 것이다. 단위해역별 평가결과에 따라 동일한 해역이용행위라 하더라도 단위해역의 보전가치와 개발가치의 비교형량을 통해 해역 사용료·점용료를 다르게 책정할 수 있다. 또한 해역이용행위는 해역이용의 규모와 방식에 따라 해양환경·생태계에 미치는 영향이 다르며 해역이용·개발에 의해 발생하는 경제적 수익에서도 차이가 난다. 해역이용 적정가격은 단위해역의 가치평가와 해역이용행위별에 따른 이용강도와 환경영향을 고려하여 산정하도록 하는 것이다.
단위해역의 이용가치, 해역이용행위의 규모와 방식, 그에 따른  환경영향에 따라 수익에 차이가 있어  해역이용 적정가격은 이러한 요소들을 고려하여 산정된다.