넷째, 정부 R&D 전략 수립 방향성의 재설정을 위해 고려해야 할 사항으로 사업기획과정에서의 전문가 참여 확대와 평가제도의 개선, 국가 차원의 중장기 R&D 전략수립 기능 강화, 연구기관(연구자)들에 대한 자율성 보장 및 책임 강화 등을 제시하였다. 그동안 성장동력산업을 기획함에 있어 상향식에 가까운 방법을 선택하여 운영해 왔으나 이러한 방식에서 벗어나 국가 차원의 정부 R&D 전략기획 기능을 강화하고,  사업기획 단계에서는 전문가 중심의 의사결정 채널을 구축하여 사업기획 분야의 전문성을 강화해야 한다고 판단된다. 또한 앞서 언급한 바와 같이 그간 과학기술기본계획은 소관부처 중심의 예산 체계에서 대형연구개발사업을 진행하는 등 국가 차원의 전략적 관점이 아닌 수요부처의 필요에 따라 단기적 관점에서 진행되고 있는바, 이에 따른 성과의 부진을 개선하기 위해 거시적 관점에서의 정부 R&D 전략으로의 재편이 필요하다고 판단된다.
정부 R&D 전략 수립을 위해서는 사업기획과정에서부터 전문가를 참여시켜 의사결정 채널을 구축하여 사업기획 분야의 전문성을 강화해야 한다. 또한 수요부처의 필요한 단기적 관점이 아닌 거시적 관점에서의 정부 R&D 전략으로 개편되어야 한다.