합성생물학은 명확한 유전자원 혹은 전통지식을 이용하여 개발된 GMO/LMO 기반의 생명산업과 달리 다양한 출처의 유전정보 및 전통지식의 이용, ICT 기술을 통한 유전 정보의 관리 및 비교 분석 기술과 고성능 유전자 합성/조합 기술을 이용하여 유전자원 및 전통지식의 출처가 불명확한 경우와 다양한 관련 당사자가 포함되는 경우가 일반적인 경우로, 나고야 의정서의 적용범위로 규제하기에는 한계를 가지고 있다. 이러한 합성생물학의 발전은 생물다양성의 보전과 생물 안전에 부정적인 요소로 작용할 수 있어, 새로운 생명산업의 모델이 개발되어야 한다. 생명산업을 포함한 다양한 산업은 지속적인 산업 발전을 위하여 자연 환경을 포함한 공공재 활용(물과 도로 등)및 공공재 관련 환경 파괴와 관련하여 특별세(예, 환경 부담금 등) 규정하여 소유가 명확하지 않거나 공공 소유의 자원 사용에 대한 특별 규정을 가지고 있다. 이러한 개념을 적용하여 국내외 생물자원 및 전통지식은 공공의 소유로 인식하여, 이러한 자원을 이용할 경우 공공재 이용에 따른 특별세 규정을 두어 국내외 생물다양성 보전을 위한 기금으로 사용할 수 있는 규정을 제정할 수 있다. 합성생물학 기반의 생명산업은 생명자원 이용과 관련된 특별세를 지불할 수 있으며 기업의 이윤을 보장할 수 있는 비즈니스 모델을 개발할 필요가 있다. 이렇게 조성된 기금은 국내외 생물다양성 보전을 지원하기 위하여 UN 중심의 국제기구를 통하여 집행할 수 있다.
합성생물학은 생물다양성 및 안전에 부정적 영향을 끼칠 수 있으므로, 새로운 생명 산업의 모델이 만들어져야 한다. 이에 공공재 이용에 따른 특별세 법안을 만들어 생물의 다양성 보전을 위한 지원을 도모해야 한다. 그리고 이것을 UN과 같은 국제기구를 통해 집행할 수 있도록 한다. 