또한 안전점검과 정밀안전진단 자체의 내용도 중복되는 면이 있으며 그 목적이 명확히 구분되지 않고 있다. 현행법상 안전점검은 매년, 정밀안전진단은 2년에 한 번 실시하도록 규정하고 있으나 실시 내용(법, 시행령 및 지침 참고) 및 비용에 큰 차이가 없으며, 이에 따라 기관차원에서 점검과 진단을 동시에 수행하는 것이 합리적이라고 판단하여 점검과 진단을 미구분하여 매년 실시하고 있는 실정이다. 이는 매 2년마다 이루어지고 있는 실태조사 결과에서도 찾아 볼 수 있다. 이영순 외(2013)의 실태조사 보고서에 따르면, 실태조사에서는 연구실 정기점검이 제대로 이루어지고 있는지를 묻고 있는 항목이 있다. 그러나 정기점검과 정밀안전진단간에 내용과 비용적으로 차이가 없고 또한 정밀안전진단 대상 연구실을 따로 파악하지 않은 곳이 많아 대부분의 기관에서는 안전점검과 정밀안전진단 대상에 대한 구분 없이 이를 번갈아 실시하는 경우가 많으며, 특히 대학의 경우 이러한 면이 두드러지는 것으로 나타난다. 특정 해에 안전점검을 실시하지 않았다고 하더라도 그 해에 정밀안전진잔을 실시하였을 가능성이 높은 것으로 파악되었다.
안전점검은 매년,정밀안전진단은 2년마다 실시해야 하나 내용과 비용에 차이가 없어 기관차원에서 점검과 진단을 구분하지 않고 매년 실시하고 있다. 2년마다 하는 실태조사에서도 대부분 기관에서 안전점검과 정밀안전진단 대상을 구분 않고 번갈이 실시하는 것을 볼 수 있었고 특히 대학에 이런 면이 많았다.