또한 본 연구의 후반부에는 국내외의 주요 현황, 정책, 관리 방안, 감시 체계 운영 등에 대해 조사한 자료를 바탕으로 학계 전문가와 정부가 한자리에 모여 2차례의 토론회를 개최하여 합의된 의견을 도출하였다. 토론회에 참석한 패널로는 지난 수년간 KONIS 체계 운영에 핵심 역할을 담당한 대한병원감염관리학회, 항생제 올바로 사용하기 캠페인을 운영 중인 대한감염학회를 대표한 연구진이 참석하였으며 우리나라의 감염병 관련 정부 시책을 담당하는 질병관리본부 내 감염병 관련 주요과(감염병감시과, 감염병관리과, 약제내성과 등)의 책임자들이 참여하였다. 또한 의료관련감염병과 항생제 내성균 관리 분야에 핵심적인 조언을 할 수 있는 주요 학계 인사들의 의견을 듣기 위해서 대한화학요법학회, 대한임상미생물학회를 대표하는 참석자들을 통해 각 분야의 의견을 최대한 수렴하기 위해 노력하였다. 이러한 토론회를 바탕으로 본 연구에서는 학계와 정부에서 모두 수긍할 수 있는 합의안을 도출할 수 있었다.
국내외 주요 현황·정책 등 자료에 대해 학계 전문가 및 정부 관계자는 토론회를 통해 의견을 모았다. 토론회 패널로는 대한감염학회 연구진, 질병관리본부 내 감염병 관련 책임자뿐 아니라 관련 전문가들의 조언을 위해 대한화학요법학회·대한임상미생물학회 관계자도 참석했다.