현재 출연(연) 평가시스템은 세분화된 지표를 통해 이루어진다. 날리지웍스(2011)의 조사결과에 따르면, 출연(연)의 연구인력 평가지표는 재정기여도, 지식재산권, 기술료, 특성성과, 과제성과, 조직성과 인사고과(역량, 업적) 등으로 구성된다(날리지웍스, 2011:9-10). 기관별로 항목별 비중은 편차가 있지만 대다수 기관이 재정기여도, 지식재산권, 기술료 등 다양한 형태의 정량지표를 활용하고 있다. 각각의 평가지표는 다시 세부 평가지표를 통해 값이 산출된다. 예를 들어, 지식재산권 평가방법은 국내특허출원, 국내특허등록, 해외특허출원, 해외특허등록, 실용신안등록, 의장등록, S/W등록, SCI, SCIE, 해외학술지, 국내학술지, 학회발표, 전문기술서적 등에 부여된 배점에 따라 실적 점수를 합산한다.
현재 출연 평가시스템은 대다수 기관별로 연구인력 평가지표를 통해 이루어지며, 이들은 다시 세부 평가지표를 통해 값이 산출된다.