식약처는 HACCP의 점진적 확대를 위해 단계적 의무화를 추진한다. 단, 영세 업체의 종업원 수를 고려해 HACCP 의무 적용 시기를 세분화시켰다. 순대 제조업체는 종업원 2명 이상인 경우 2016년까지, 2명 미만인 경우 2017년까지 HACCP을 의무적으로 적 용해야 한다. 계란 가공업체는 5명 이상인 경우 2016년까지, 5명 미만인 경우 2017년까지 HACCP 의무 적용을 완료해야 한다. 떡볶이 떡 제조업체의 경우 5단계(종업원 10명 이상인 경우 2017년까지 우선 적용)로 세분화할 방침이다. 이들 제조업체들이 대부분 연매출액 5억 원 미만(순대 94%, 계란 64%, 떡볶이 95%)인 데다 종업원 5명이 되지 않는 곳(순대 89%, 계란 36%)이 많기 때문에 식약처는 또한 소규모 순대‧ 알 가공품‧ 떡볶이 떡 제조업체들이 HACCP을 조속히 도입할 수 있도록 컨설팅 비용은 물론, 위생안전시설 개선비용을 국고로 지원할 예정이다.
HACCP의 점진적 확대를 위해 단계적 의무화를 추진 하는 상황에서 떡볶이 재료 제조업체와 같이 연매출액과 종업원의 규모가 크지 않은 곳에 한하여 식약처는 국고로 다양한 비용을 지원할 예정이다.