한국의 건강보험 급여 의사결정은 대부분 의료기술평가와 분리되지 않고 있다. 이는 건강보험에 관한 의사결정이 정부 중심으로 중앙화되어 있기 때문이다. 캐나다 등과 같이 중앙화된 의료기술평가기구가 별도로 있더라도 실질적인 보험급여 적용 여부는 주정부에서 담당하는 이원화된 구조와는 차이가 있다. 다만 한국의 경우 선별등재제도가 적용되는 의약품의 경우 급여 여부에 대한 권고가 건강보험심사평가원의 약제급여평가위원회에서 이루어진 후 약가협상이 완료된 후 건강보험정책심의위원회를 거친 후 보건복지부장관이 고시하는 절차를 거치는 차이가 있다. 이는 프랑스와 같은 일부 국가에서 건강보험 급여 여부에 대한 평가 후 가격 협상을 하는 사례와 유사하다고 할 수 있다.
대한민국의 건강보험 관련 의사결정은 의료기술평가와 분리할 수 없다. 캐나다와 유사하게 중앙화된 평가기구가 존재해도 이원화된 구조와는 구별된다. 한국의 건강보험 급여는 프랑스의 사례와 유사하다.