야콘은 땅 속에 저장하는 것이 가장 좋지만 가정에서는 스티로폼 상자에 넣어 직사광선을 피해 서늘한 곳에 보관하면 된다. 고령지 농업연구소에서는 저장 방법에 따른 야콘의 병 발생률과 수분 변화를 알아보기 위해 플라스틱, 비닐 덮은 플라스틱, 스티로폼, 종이상자, 땅 속 저장의 5가지로 나눠 4개월 간 실험했다. 그 결과, 땅 속에 보관하는 것이 병 발생이 가장 적었고, 스티로폼 < 플라스틱< 종이 < 비닐 덮은 플라스틱 상자 순이었다. 또한, 수분 함량은 플라스틱 상자를 제외하고 나머지는 비슷한 수준으로 유지되는 것으로 나타났다. 야콘 장기 저장기술은 야콘을 재배하는 농가뿐만 아니라 가공 업체와 소비자에게 유익한 정보가 될 것이다.
고령지 농업연구소에서 야콘의 병 발생률과 수분 변화에 대해 실험한 결과, 땅 속 보관이 병 발생률이 제일 낮았다.