다성분 분석법의 경우는 분석 조작 1회당 검사가 가능한 동물용의약품의 수가 수십 가지 이상으로 분석효율은 매우 높으나 각각의 성분에 대한 분석의 정밀도나 신뢰성은 다소 열등한 단점이 있다. 즉 다성분 분석법에서는 대상성분들을 물리화학적 특성 범위별로 분류하고 그룹별로 검체 추출, 정제 및 기기분석과정에 의하여 검체분석을 수행하므로 1개 분석 대상성분마다 최적의 분석법을 적용하는 것이 불가능하다. 따라서 각 대상성분에 대하여 최적화된 검체 조제 및 기기분석조건이 적용되는 개별 분석법에 비하여 분석 감도, 정밀성 및 신뢰도가 떨어질 수밖에 없다. 이에 따라 다성분 분석법은 적정한 분석기준을 만족하면서 분석효율에 중점을 두어 개발되었으며 주로 잔류동물용의약품 검색용 (screening) 목적에 적합하다. 다성분 분석법의 대표적인 예로 미국의 식품안전조사국 (Food Safety and Inspection Service, FSIS) 의 축산물 중 55 품목의 잔류동물용의약품을 동시에 분석할 수 있는 스크리닝 분석법 (CLG-MRM103)을 들 수 있다.
다성분 분석법은 물리화학적 특성 범위별로 나눈 대상성분 그룹별로 분석을 진행해 분석효율이 높지만, 각 성분마다의 최적 분석법을 적용하기는 어려워 상대적으로 정밀도가 부족하다. 분석효율 중심으로 개발된 이 방법은 잔류동물용의약품 검색용으로 적합하며, 예시로 미국 스크리닝 분석법이 있다.