한편 환경부 산하 국립생물자원관은 생물 다양성 표본 및 한반도 자생생물자원 등을 수집하고 생물종에 관한 정보를 DB화 해왔다(국립생물자원관 2015). 특히 나고야 의정서 등 생물자원에 이용에 관한 국제 규제가 강화되면서 환경부에서는 국제 협약 대응 국가 생물 다양성 정보 관리체계의 필요성을 제기한 바 있고, 이를 뒷받침하기 위해 생물 다양성 관련 개별 기관들 간의 정보 공유 및 정보 공유체계의 통합 관리를 위해 국가 생물 다양성 센터를 설치, 2013년부터 국가 생물자원 종합관리시스템(KBR)을 운영하고 있다. 국립생물자원관은 나고야 의정서 발효와 함께 국가 생물 다양성 정보 공유체계(CBD-CHM) 기능 또한 담당하고 있다.
국립생물자원관은 생물자원에 이용에 관한 규제가 강화되자 관리체계의 필요성을 제기해 국가 생물 다양성 센터를 설치하여 생물자원 종합관리시스템을 운영하며 CBD-CHM 기능도 겸하고 있다. 