강조한 바와 같이 과학자들의 자율성은 과학기술 특정 분야 전문성에 근간을 두고 있으며 과학자들의 자율과 책임의 논의가 일반적인 자율과 책임의 것과 성격이 다른 이유에도 마찬가지로 과학자들의 전문성이 자리하고 있다. 황광선(2016)은 과학기술 분야 연구자들에 대한 인터뷰 자료에 근거하여, 과학자들은 연구자로서의 ‘자존감’이 상당하고 이것이 연구자로서의 행태에 상당한 영향을 준다고 보고한 바 있다. 자존감을 통한 연구자들의 행위를 움직이는 가장 중요한 요소는 ‘자율’이다. 과학자들의 자율성에 대한 요구는 과학자들 스스로가 과학기술 및 사회 발전에 대한 고민이 충분하다는 전제에서 나오는 것으로, 지나친 정부의 책무 요구와는 충돌이 발생하기도 한다. 정부의 책무는 과학기술 개발을 통한 경제적 책임에 방점이 있다면, 연구자들이 생각하는 책무는 기술 발전에 무게가 있다(황광선, 2016).
과학자의 자율성은 일반적인 자율과 책임의 것과 다르며 이것은 전문성에 근간을 두고 있다. 과학자는 연구자로서의 자존감이 상당한데, 연구자로서의 행태에 영향을 준다고 보고되었다. 지나친 요구와 책무는 자존감을 통한 자율과 충돌한다.