한편 신민회는 이들 단체와 달리 국권 회복을 목적으로 1907년 4월 창설된 비밀 결사조직이다. 기독교 신자, 교사, 학생 등 수백 명이 가입했으며 평양의 대성학교와 청년학우회, 각종 회사를 운영하면서 민족의식과 독립사상을 고취하였다. 그러나 신민회는 1910년 12월 일제가 조작한 '105인 사건'으로 활동이 중지되고 말았다.
한편 교육을 통해 국권 회복을 지향했던 신교육운동은 전국에 사립학교를 설립하여 근대교육을 펼쳤다. 전국에 5천 개에 달하는 사립학교에는 여학교와 야학교도 상당수였고, 초등보통교육도 실시하였다. 서울에 규모가 큰 학교가 설립되어 고등 또는 전문과정이 개설되기도 했다. 설립자는 주로 관료 출신이나 각 지역 유지였다. 대한제국 정부의 정책과도 보조를 맞춘 움직임이었다. 그러자 일제는 1908년 사립학교령을 반포하여 이에 대해서도 규제를 가하였다.
신민회는 민족의식과 독립사상을 고취한 비밀결사조직이지만, 일제가 조작한 105인 사건으로 무너졌다. 전국에 야학교를 포함한 다수의 사립학교를 세우고 초등/고등 등의 근대교육을 실시한 신교육운동은 일제의 사립학교령으로 통제를 받았다.