신의료기술평가위원회가 의료행위에 대한 안전성을 부작용 및 합병증 그리고 사망지표를 중심으로 판단하고 유효성에 대해서는 진단의 경우 검사정확도, 시술인 경우 임상적 의료성과 향상 등을 기준으로 판단한 후에는 급여 의사결정을 위해 의료행위전문평가위원회 및 치료재료전문평가위원회의 심의를 거친다. 이 때 급여 및 수가가 함께 결정되는데 이를 위해 대체가능성 및 비용효과성을 중심으로 하는 경제성 및 보험급여 원리와 건강보험 재정 상태를 중심으로 하는 급여 적정성을 판단하게 된다. 그러나 의료행위 및 치료재료와 관련하여 급여의 적정성 외 경제성은 현재 관련 평가 및 자료 제출이 명문화되어 있지 않으며 이에 따라 실질적인 경제성평가는 이루어지지 않고 있다고 할 수 있다. 설혹 내부적으로 이루어지고 있다고 하더라도 공식화되거나 대내외에 공개되어 있는 기준 등은 찾기 어렵다
신의료기술평가위원회는 의료행위의 안전성을 판단하여 급여 결정을 위해 전문평가위원회와 치료재료전문평가위원의 심의를 받는다. 그러나 급여의 경제성 평가나 공개된 공식 기준은 찾아보기 어렵다.