생물학적, 의학적 검체 내에서 구조나 농도의 정성적, 정량적 변화를 통해 질환여부를 비롯한 다양한 정보를 제공해주는 생체분자들을 통틀어 바이오마커(Biomarker)라 한다. 이러한 바이오마커에는 DNA, 단백질, 펩타이드, 지질 등 여러 분자들이 포함된다. 이와 같이 유전자, 단백질, 분자에 대한 분석은 바이오마커를 발굴하는 것이며, 앞으로의 생명공학 연구에 있어서 기반이 되는 중요한 역할을 할 것으로 기대된다. 가령, 암 환자의 경우 정상인과는 달리 암 세포에서만 발견되는 물질이 존재하는데, 이를 발굴해 냄으로써 암의 진원지를 파악할 수 있고, 악성여부를 판단할 수 있다.
바이오마커는 질환을 포함한 여러 정보를 제공하는 생체분자이며, 그에 대한 분석은 질병의 진원지와 악성 여부를 파악할 수 있기 때문에 생명공학 연구에 있어서 필수적이다. 