한편 의약품 부문에서는 2007년부터 임상적 유효성, 비용효과성 등을 근거로 하여 등재 의약품을 선별하는 선별목록제도가 시행되면서, 기등재 의약품에 대해서도 새로운 등재 기준에 따라 재평가하여 급여 등재 여부를 다시 판단하고자 하는 시도가 있었다. 즉 2006년 12월 이전까지 임상적 유용성과 비용효과성에 대한 검토 없이 자동적으로 보험 급여 등재되었던 의약품 전체에 대하여 새로운 선별목록제도의 급여 기준에 따라 급여의 적정성 여부를 평가하고자 하였다. 그리하여 건강보험에서 급여하는 모든 의약품이 임상적 유용성과 비용효과성을 포함하는 선별목록의 기준에 적합하도록 급여 목록과 가격을 재구성하는 것이 당초 목표였다.
임상적 유효성, 비용효과성 등을 평가한 선별목록제도 시행시에 기 등록된 의약품 전체를 대상으로 보험 급여의 타당성 여부를 재검토하여 급여 목록과 가격의 재편성을 계획했었다.      