각 단계별 일차침전지를 거친 하수는 포기 또는 비포기 상태의 1번 간헐포기조로 유입되며, 간헐포기조가 비포기 상태일 경우 반송슬러지 중의 질산성질소는 유입하수 중의 유기물을 이용하여 탈질 및 인방출이 일어나고, 간헐포기조가 포기 상태일 경우 유기물의 분해와 질산화 반응이 이루어진다. 2, 3번 간헐포기접촉산화조는 비포기 상태에 공급되는 슬러지발효액의 이분해성유기물을 이용하여 탈질반응 및 인방출이 일어나며, 포기상태에서는 질산화반응이 일어난다. 후속되는 간헐포기조에서는 산소가 공급되는 호기 상태로 잔류 유기물 및 암모니아성 질소가 산화되고, 미생물은 방출된 인을 과잉섭취 한다. 인을 과잉섭취한 미생물은 이차침전지에서 침전분리되어 일부는 간헐포기조의 미생물량을 유지하기 위해 반송되고 초과된 미생물은 잉여슬러지로서 슬러지 처리공정으로 이송된다.
잉여슬러지량 및 슬러지 계면을 상시 모니터링하여야 하여 생물반응조에 문제가 발생하지 않도록 운영하여야 한다.