미국의 기초연구정책은 개별부처나 기관에서 만들어지지는 않는다. 즉, 단일부처나 기관에서 기초연구정책과 지원을 전담하는 체제가 아니기 때문에 기초연구에 대한 연방정부의 지원은 연방정부 산하의 각 부처와 기관들을 통해 이루어진다. 그러나 대통령과 과학기술정책국 등을 통해 연방정부의 기초연구정책 및 지원들에 대한 방향이 설정되고 개별 기관에 대한 지원 규모도 조정된다. 그리고 이러한 연방정부의 지원방향에 대해 입법부의 견제와 균형이 이루어지게 된다. 즉, 기초연구정책 및 지원의 규모와 형태는 미 행정부와 입법부간 서로 견제와 균형 속에서 결정된다. 먼저 대통령은 과학기술자문위원회의 자문과 과학기술정책국(OSTP), 예산국(OMB)의 지원 속에서 기초연구정책과 지원안을 확정하며, 의회에서도 정부정책을 지원 및 보완하는 정책적 방향과 예산지원을 설정하고 NSF, NIH, DOE 등 각 부처와 기관의 업무범위와 예산규모를 조정하는 역할을 맡는다. 기초연구가 수행되는 장소는 대학 연구소 그리고 정부부처 산하의 연구소 등이지만 2013년 기준 기초연구의 51%가 대학에서 진행되었을 정도로 대학이 기초연구에서 차지하는 역할이 크다고 할 수 있다.
미국의 기초연구정책은 미 행정부와 입법부의 경제와 균형 속에 결정된다. 대통령은 과학기술자문위원회의 도움으로 지원안을 확정하고, 외회는 정책 방향·예산지원 설정과 업무범위·예산규모를 조정한다. 지원은 연방정부 산하의 각 부처·기관을 통해 이뤄지며, 대학 연구소, 정부부처 산하 연구소에서 연구가 수행된다. 