BRC에 관한 국가 조정 장치가 없는 상황에서 개별법 및 계획에 의해 운영되는 범부처 실무협의회의 기능은 제한적일 수밖에 없다. 생명연구 자원 책임기관 협의회에서 기탁등록보존기관 관리에 대한 기술협력, 정보 공유 및 연계 등을 협의할 수 있도록 하고 있지만, 부처 간 분야 간 협력 구도가 정착되지 않은 상황에서 실무진의 기술 협의를 진전시키는데 구조적인 한계가 존재한다. 예를 들어, 부처 간 정보 연계나 표준을 설정하는 데 있어 부처 간 주도권 경쟁이 불가피하게 발생한다. 과학적 기술적 우수성, 사용 편의성 등과 같은 범용적 기준을 설정할 수 있음에도 불구하고 개별 부처에서 구축해 온 시스템을 쉽게 전환하지 못하게 되는 것이다. 또한 실무 차원에서 협력할 수 있는 일 조차도 소관 부처 간 경쟁으로 현장에서 바로 의사결정을 내리지 못하고 소관 부처의 허가를 받아야 하는 상황이 발생한다. 이러한 비효율의 저변에는 BRC 사업 예산 및 인사권을 두고 심화되는 부처 간 경쟁구도가 존재한다(이현우 외 2012:52).
범부처 실무협의회로 운영되는 BRC 사업 관련 업무는 예산 및 인사권 등 여러가지 측면에서 부처 간 주도권 경쟁이 심하게 벌어지고 있어, 상위의 국가 조정 장치 설립이 반드시 필요한 상황이다.