산업계 소속 평가위원은 융합에 대한 기술분류가 어렵고, 융합 사업들은 사업 및 과제의 성격이 명확하지 않아 평가결과가 좋게 나올 수 없다는 의견을 제시하였다. 따라서 융합 사업의 경우, 사업 및 과제를 기획하는 PD의 역할이 매우 중요한데, 대다수의 PD가 겸직 교수로 구성되어 있어 현장과 괴리가 생긴다는 의견을 주었다. 따라서 PD가 사업에 전념하기 위해서 겸직에 대한 개선이 필요하며, 사업 및 과제기획 시 기업의 참여를 유도할 유인책이 필요하다고 하였다. 특히 기업 입장에서는 불확실성이 큰 융합연구 수행에서 환경변화에 따라 동태적으로 연구내용을 조정할 필요가 있으나, 정부 사업에서는 매우 어려운 구조라고 응답하였다.
융합사업 PD들은 대개 교수를 겸직하고 있어 사업에 몰두할 수 있도록 개선이 필요하며, 정부사업에서는 연구내용을 유동적으로 조정하기 어려우나 기업은 이를 원할 것이기에 유인책이 필요하다.