과학기술정책연구원(2004)은 2005년도 국가연구개발투자 방향 설정을 위해 국가연구개발투자의 현황과 특징, 국가연구개발투자 구조 분석 등을 수행하였다. 특히 국가연구개발투자 구조분석과 관련하여 NTIS DB 및 연구개발활동조사 DB를 활용하여 기술분야별 투자구조, 연구개발단계별 투자구조, 미래유망 신기술별 투자구조, 지역별 투자구조에 초점을 맞추어 비교 분석하였다. 그리고 이를 통해 다음과 같은 시사점을 도출하고 있다. 기술분야별에서 보건, 환경, 생명공학 등 미래유망 신기술과 관련된 분야에서 정부 투자는 대기업의 기술별 연구개발투자 방향과는 차이가 있으나 중소기업과는 비슷한 방향으로 가고 있다. 연구개발단계별에서 정부의 기초연구 투자는 확대될 필요가 있다. 미래유망 신기술별에서는 정부의 IT 기술에 대한 투자에 있어서 전략적 접근방식을 채택할 필요가 있다.
과학기술정책연구원은 2005년 국가 연구 개발 투자를 위해 정부는 미래 유망 신기술 분야에서 중소기업과 투자 방향이 비슷하고, 기초 연구 투자 확대와  IT 기술 투자에 대한 전략적 접근 방식을 채택할 필요가 있다고 분석했다.