주요 개편 내용은 수업연한을 6년 즉, “2+4”학제(2년 기초․교양 + 4년 전공교육)를 도입하는 것이다. 도입 시점은 2005년을 기준으로 중학교 3학년 학생이 대학에 입학하는 2009학년을 기준으로 하였다. 약학교육을 전공하기 위해서는 우선 대학 학부과정을 2년 이상 이수하고, 약학대학입문자격시험(Pharmacy Education Eligibility Test, 이하 PEET) 성적을 제출해야 한다. 시행을 지원하는 교육인적자원부는 다각적인 행․재정적 지원 대책을 마련하여 새롭게 도입되는 학제를 조속히 정착하게 하고 약학교육의 질 제고를 지원하기로 했다.
이번 개편을 통해 2009년 신입생을 기준으로 “2+4”학제가 도입되며, 교육인적자원부는 지원을 통한 학제의 빠른 정착과 약학 교육의 질적 제고를 약속했다.