이러한 점을 고려한다면, 어촌공동체 실태조사 담당 기관은 지구별 수협과 지자체(시･도)의 산하 조직 등을 들 수 있다. 이들 기관 중에서 현재 어촌 지역에 설립되어 있고, 어촌계의 지도･감독을 수행하고 있는 수협 계통조직이 어촌공동체 실태조사를 맡는 것이 효율적이라 판단한다. 또한 수협중앙회에서는 자료의 신뢰성 문제는 있지만 매년 ‘어촌계 분류 평정’을 발간하고 있기도 하다. 2016년 기준으로 지구별 수협은 전국 시･군 행정구역 단위로 70개가 설립되어 있고 각 수협별로 지도과가 있으며, 상위 조직인 수협중앙회에도 지도 경제사업 부서가 있다. 이러한 수협의 계통조직을 활용해서 기존 어촌계 분류 평정의 조사체계를 수정･보완하여 적용한다면 어촌공동체 실태조사를 원활하게 추진할 수 있을 것이다. 만일 어느 지역의 지구별 수협에서 어촌공동체 실태조사가 힘들 경우, 지자체(시･도)의 산하 조직인 어업기술센터, 수산기술사업소 등과 협력하여 추진하는 방안도 강구할 필요가 있다.
어촌공동체 실태조사 담당기관 중 수협이 가장 효율적인 편이다. 매년 '에촌계 분류 평정'을 발간하고 있으며, 명확한 계통 조직을 활용해 조사체계를 수정･보완 적용해 실태조사를 추진 가능해보인다. 만약의 경우 산하조직등과 협력, 추진하는 방안도 있다.