'프로듀스 X 101'에 이어 '프로듀스48' 또한 조작 의혹에 휩싸였다. 30일 KBS의 보도에 따르면, 수학과 교수들과 함께 투표 결과를 분석한 결과 2018년 방송된 '프로듀스 48' 역시 투표 조작 정황이 포착됐다. KBS 측이 '프로듀스 48' 최종회에 출연한 연습생 20인의 득표수를 전체 투표수 4,452,177표로 나눠 득표율을 확인한 결과, 소수점 다섯째 자리에서 반올림할 경우 모두 소수점 둘째 자리로 떨어지는 값이 나온다고 분석했다. 이에 대해 Mnet 측은 "확인해보겠다"는 입장을 밝혔다. 이는 현재 논란이 되고 있는 Mnet '프로듀스 X 101'도 조작 정황과 유사하다. '프로듀스 X 101' 제작진은 조작 의혹이 불거? 봉? 당시 "생방송 중 투표 집계를 담당한 제작진은 득표수로 순위를 집계한 후, 각 연습생의 득표율도 계산해 최종 순위를 복수의 방법으로 검증했다. 그러나 해당 제작진이 순위를 재차 검증하는 과정에서 득표율을 소수점 둘째 자리로 반올림했고, 이 반올림된 득표율로 환산된 득표수가 생방송 현장에 전달됐다"고 해명하며 "이 과정에서 순위의 변동이 없었다"고 강조했다. 현재 '프로듀스 X 101' 투표 조작 의혹과 관련 수사가 진행중인 가운데 압수된 제작진의 휴대전화에서 조작 정황이 의심되는 녹음파일이 발견된 것으로 알려졌다.
30일 KBS가 수학과 교수들과 투표 결과를 분석한 결과, 소수점 다섯째 자리에서 반올림할 경우 모두 소수점 둘째 자리로 떨어지는 값이 나오자, '프로듀스 X 101'에 이어 2018년 방송된 '프로듀스 48' 도 투표 조작 정황이 포착되었다고 보도하였다.