생산량과 씨받이 양이 많다는 이유로 대부분 국내에서 자생하는 삽주(A.japonica K.)보다는 중국에서 들여온 큰꽃 삽주(A.macrocephala K.)를 재배한다. 큰꽃삽주를 재배할 경우 반드시 검토해야 할 문제 중 하나가 역병 등 뿌리썩음병이다. 큰꽃삽주가 역병 피해가 아주 큰 약초 중 하나이기 때문인데, 특히 여름철 장마기에 병이 급격히 증가해 수확량에 큰 영향을 미친다. 유묘기(幼苗期)의 지상부 잎과 줄기가 변색하거나 말라 죽는 것으로 관찰되며 장마기 이후 고온기에 물빼기가 불량한 지점에서 병이 확대되는 것을 확인할 수 있다. 발병 초기에는 지상부가 시들고 노랗게 변하며, 점차 갈변되어 결국 말라 죽고 심하면 뿌리까지 완전히 썩어서 재배 농가에 큰 피해를 준다. 아인산염을 포기별로 줄 경우 역병 등 흙전염병에 취약한 다른 작물처럼 방제 효과가 약간 있다고 보고되었으나 철저한 방제에는 한계가 있다.
중국에서 들여온 큰꽃 삽주는 생산량과 씨받이 양이 많아 재배를 선호하나, 역병 등 뿌리썩음병이 많아서 재배 농가에 큰 피해를 줄 수 있다. 아인산염은 방제 효과가 약간 있다고 보고되었으나 철저한 방제에는 한계가 있다.