생체인식 기술은 오랫동안 건물 등 보안 및 출입통제 목적으로 활용되어 왔다. 국가간 이동을 통제하는 ‘출입국 관리’의 목적으로도 활용되고 있다. 특히 미국에서의 911 테러 이후 생체인식 전자여권이 도입되고 공항에서도 생체인식을 통한 출입국 수속 시스템이 추진되고 있다. 현재 세계 대부분의 국가에서 생체인식 전자여권을 도입하고 있다. 한편 일반적인 출입통제 목적의 생체인식 장치는 일반 가정의 도어락에서부터 보안시설의 출입통제, 그리고 출퇴근 확인 및 근태관리용도로까지 광범하게 보급되어 있다. 이와 같은 생체인식 기기는 구성원들의 동의도 없이 설치하고 지문날인 등 생체인식 정보 제공을 강요하여 종종 논란이 되고 있다.
생체인식 기술은 보안, 출입국관리, 근태관리, 전자여권 도입 등의 목적으로 폭넓게 활용 중이다. 그러나 이러한 기술은 이용자들의 무동의 설치나 생체인식 정보가 강요되는 등 문제가 있다.