B1사는 종합연구소뿐만 아니라 1984년 국내최초로 과기부의 승인을 받아 비영리민간연구소를 설립하였다. 비영리민간연구소에서는 원천 기술 및 기초과학 분야의 중장기 연구 과제를 수행하며, 종합연구소에서는 제품화를 목표로 중단기 연구 과제를 통해 '93년 중에는 14품목의 신제품을 출시하였으며 '94년 중에는 수두예방주사 등을 시판하면서 매출액 1,000억 원 구간을 극복 하였다. 뿐만 아니라 연구 개발을 통해 독감백신과 신종플루백신은 WHO(세계보건기구)로부터 국제 입찰 참가자격이자 사전품질인증을 승인받아 국제적 기술력을 인정받았다.
B1사는 비영리민간연구소는 원천기술, 기초과학 분야 중장기 연구 과제를, 종합연구소는 제품화의 중단기 연구 과제를 수행하여 매출액 신장과 기술력 인정을 이뤘다.