우선순위에 따라 주제가 선정되고, 선정된 주제에 대한 의료기술 비교효과연구를 통해정책적 근거를 마련하는 것은 근거를 바탕으로 하여 실제 정책이 결정되는 것은 다른 차원의 문제이다. 그러므로 의료기술 비교효과연구 결과의 정책화 과정에서의 한계점을 분석하고 해결방안을 모색하는 기획 연구가 필요하다. 특히, 비교효과연구의 연구 결과의 정책적반영을 극대화하기 위해서라도 연구와 정책간의 연계를 높이기 위한 방안들을 연구수행단계부터 고민해가도록 설계되어야 한다. 뿐만 아니라 한국적 상황에서 비교효과연구의 우선순위 선정을 위해 다양한 이해관계자가 어떠한 절차와 방법으로 참여되어야 할 것인지에 관한 연구가 추후 수행될 필요가 있을 것이다.
의료기술 비교효과연구 결과를 효과적으로 정책화하기 위해서는, 연구수행단계부터 연구와 정책간의 연계를 높여 설계해야 하고, 우선순위 선정 절차와 방식에 대한 추가 연구도 필요할 것이다.