이와 같은 농업금융시장의 특성으로 인하여 농업부문에 자금이 원활히 공급되지 못하는 문제를 해결하는 정책적 수단의 하나가 농신보의 신용보증이다. 신용력이 부족한 농어가에 신용보증하기 위한 것이다. 그렇지만 생활자금인 소비금융이 아닌 생산 유통 가공사업에 필요한 생산자금에 대해서만 신용보증을 해주고 있다. 가계와 생산이 미분리되어 있는 농어가의 경우 생산용 자금과 생활자금을 엄격히 구분하는 것이 어려워서 자금의 혼용성이 높다. 농가의 자금혼용성 때문에 생활자금에 대해서도 신용보증을 해야 한다는 주장이 제기되기도 한다. 특히 최근 농가의 사금융 의존비율이 높아지고 있는 점을 고려할 때 어느 정도 타당성이 있다고 볼 수 있다.
농업부문의 자금 공급이 원활하지 못할 때, 농신보는 신용보증을 통하여 생산 유통 가공사업에 대한 보증을 해준다. 농가의 자금혼용성에 의해, 생활자금도 신용보증이 필요하다는 주장이 있다. 