유전자 조작법(형질전환)의 경우 형질전환 기술이 적용된 초기에는 활용 가능한 유전자가 한정되는 있는 점 등 여러 가지 기술적인 문제가 있었으나, 점차 다양한 유전자가 발굴되고 유전자 발현 및 유전자 전달기술이 발달하면서 형광관상어, 저온내성, 질병내성, 대사효율 개선 등의 다양한 형질전환 어류들이 개발되고 있다. 양식생물에 적용된 사례는 캐나다의 형질전환 대서양 연어 로, 이는 왕연어의 성장 호르몬 유전자를 ‘Ocean pout(냉수성 어류)’의 항동결 유전자 프로모터와 조합하여 같은 양성기간에 약 6배 이상 빠르게 성장시켰다. 그리고 1999년에 개발 회사(AquaBounty Technologies)가 이 품종의 상업화를 미국 FDA에 신청하였으나, LMO와 관련하여 상용화에는 어려움을 겪고 있는 실정이다. 우리나라에서는 부경대학교에서 자가 성장 유전자를 미꾸라지와 잉어에 각각 삽입하여 미꾸라지는 6개월 만에 8g에서 255g으로(1999), 잉어는 250g에서 약 4 (2001)까지 빠르게 성장시킨 사례가 있다.
유전자 조작법(형질전환)의 경우 점차 다양한 유전자가 발굴되고 기술이 발달하면서 다양한 형질전환 어류들이 개발되고 있다. 그 사례로 캐나다의 형질전환 대서양 연어를 6배 이상 빠르게 성장시켰고 우리나라에서는 잉어와 미꾸라지를 빠르게 성장시켰다. 