한편, 환경영향평가는 다양한 개발사업(계획)이 지하수계에 미치는 영향을 평가하는 규정을 포함하고 있지만, 그 영향이 상당한 사업의 경우에도 지하수 항목의 평가가 미흡한 실정이다. 특히 지하수 개발이 사업에 포함된 경우 ｢지하수법｣에 근거하여 지하수영향조사가 미리 시행되고, 환경영향평가 시 그 결과를 인용하는 정도에 머물러 사업이 지하수계에 미치는 영향에 관한 평가가 부실하게 이루어지고 있다. 이 결과는 지하수 개발의 적정성을 판단하는 지하수영향조사와 사업의 지하수 영향을 검토하는 환경영향평가제도 사이의 애매한 성격차이 때문에 발생한다. 즉, 평가자가 지하수(관정) 개발 사업의 허가를 그 사업이 지하수에 악영향을 미치지 않는 것으로 오해하기 때문이다. 따라서 평가자들의 지하수계에 대한 이해도를 높이고, 전반적으로 지하수 항목에 대한 가중치를 낮게 부여하는 평가 체계를 개선해야 한다.
환경영향평가는 다양한 개발 사업이 지하수계에 미치는 영향을 평가하는 규정이다. 그러나 지하수 항목의 평가가 미흡한 실정이다. 따라서 평가자들은 이해도를 높여서 신중한 평가 체계를 개선해야 한다.