박사학위과정의 경우는 우리나라와 더 큰 차이를 보이고 있다. 독일의 경우는 일반적으로 박사학위과정을 위한 입학시험이나 교과학습(course work) 과정이 없다. 특히, 공학분야의 경우 대부분이 연구소의 정식 연구원 신분(wissenschaftlicher Mitarbeiter)으로 학위과정을 다닌다. 즉, 박사학위는 취업자 신분의 전문 연구원이 연구소 대학을 통해 학위를 취득하게 되는 것이다. 연구원은 연구소에서 부여된 연구를 기본적으로 수행함으로써 다양한 연구결과를 바탕으로 박사학위 논문으로 연결하게 되고, 최종적으로 박사학위를 취득하는 구조인 것이다.
독일 박사학위과정은 입학시험이나 학습과정이 없고, 공학은 연구원이 연구소대학을 통해 학위를 취득한다. 즉 연구소의 과제에 대한 연구를 통해 박사학위를 취득하는 것이다.