그렇다면 구제역 매몰지가 갖는 경제적 피해는 얼마나 될까? 이에 대한 2개의 중요한 연구가 있다. 임정규(2012)는 2010년 구제역이 발생한 강화군 매몰지 168개만을 대상으로 구제역 가축 매몰지의 가치손실액을 추정하였다. 전문 감정평가사인 그는 오염 부동산의 가치하락요인을 매몰지의 존재로 인한 스티그마효과, 오염정화 비용효과, 토지이용 제한과 같은 사용효과로 구분해 구제역 가축매몰지가 주는 가치손실액을 계산하였다. 스티그마효과란 부동산학에서는 무형의 혹은 측정할 수 없는 불리한 인식을 말한다. 즉 환경오염으로 인한 부동산 가치하락 요인을 말하는 것이며, 이는 설문을 통해 계산되었다. 측정시점은 매몰 완료 후 3개월이 지난 2011년 7월이었다. 강화군의 168개 매몰지 자체로 인한 경제적 피해는 오염정화 방법에 따라 큰 차이를 보이는데, 평균 63-73억원으로 계산되었다.
한정애안과 양창영안은 등록제를 제안하고, 장하나안과 유럽연합은 허가제·면허제를 도입하지만, 정부는 등록제를 채택한다.