기초연구과제의 Merit Review방식의 정착과 확산을 위하여 외부전문가위원회를 설치, 운영토록 한다. 외부전문가위원회는 3년마다 기존 사업을 Merit Review를 통해 평가한다. 특히 고위험 도전적 과제, 학제 간 융합과제, 투자결과에 대한 질 평가를 담당하며 이를 위한 평가항목을 개발하여 운영토록 한다. 즉 이때 수월성평가 과정에서의 질과 효율성 검증을 위하여 첫째로 평가방식의 적절성, 수월성 평가를 위한 세부기준으로 평가 방식의 제시여부, 평가내용의 기재여부, 패널들의 합의여부, 의사결정시 시간적 적절성 등이 검토되어야 하며, 둘째로 평가자 선정을 위한 세부 기준으로 평가자들의 전문성 여부, 지역적 및 산학연관 별 연고성 여부 등에 대하여 검증하고, 셋째로 연구결과포트폴리오 측면에서의 세부기준으로 연구과제의 전반적 질, 규모와 기간의 적절성, 신진연구자 지원여부, 연구책임자별 분배의 균형성, 정책수행을 위한 과제선정의 적절성 등이 주요 평가항목이 될 수 있다.
메리트 리뷰방식은 위험한 도전적 과제, 학제 간 융합과제,투자결과에 대한 평가를 할때 사용할 수 있다. 효율성 검증을 위하여 세부기준을 나누고 여러사람들의 평가를 바탕으로 과제선정의 주요 평가항목을 만들 수 있다.