인력 운영상의 문제점으로는 첫째, 실질적인 기술이전 전담인력의 규모 및 전문성 축적을 위한 기반이 부족할 뿐만 아니라 전문분야별 편차가 현저하게 나타나고 있다는 점이다. 서울대․연세대․고려대 등의 기술이전 전담인력 평균 10.5명(한국연구재단, 2012)인데 반해, 5개 과기특성화대학 기술이전전담인력의 평균 9.8명으로 과기특성화대학의 연구성과를 고려할 때 기술이전 전담인력 규모는 상대적으로 작은 수준이며, 전담인력 중 전문인력 비율 역시 낮게 나타나고 있다. 또한 기술거래사, 기술경영사, 기술가치평가사 등 기술이전.기술거래와 관련된 자격증 소지자의 비율은 높으나, 5개 대학 전체 박사급 인력 4명, 변리사 1명에 불과한 것으로 나타나고 있다. 즉 대형 기술이전을 확대하기 위해선 장기적인 투자와 전략이 필요하다는 점에서 기술거래 및 마케팅 중심의 전문인력뿐만 아니라 변리사· 회계사 등의 전문가 활용 비중이 제고되어야 할 것이다. 또한 기술이전 전담인력의 대부분이 계약직 인력으로 구성되어 있다는 것 역시 기술사업화 전 주기를 총괄할 수있는 인력양성에 한계점으로 작용하고 있다(기술이전 전담인력 중 정규직 비율: 5개 대학 평균 32.7%).
5개 과기특성화대학이 기술이전을 전담할수 있는 인력이 타 대학에 비교해볼 때 그 숫자가 상대적으로 적고 관련 자격증을 갖춘 인재도 별로 없어서 향후 장기적인 안목에서 보면 변리사, 회계사 등의 전문인력을 확보하고 현재 계약직인 기술이전 전담인력을 정규직으로 바꿔주는 것이 필요하다.