두 번째 단계에서는 사업자와 환경영향평가업자가 결정된 평가항목을 토대로 환경조사와 분석을 실시하여 환경영향평가서 초안을 작성하고, 작성된 승인기관, 환경부, 기타 관계행정기관에게 제출하여 관계 행정기관의 의견을 수렴한다(김보미, 2014). 초안에는 첫째, 요약문, 둘째, 사업의 개요, 셋째, 환경영향평가 대상사업의 시행으로 인해 평가항목별 영향을 받게 되는 지역의 범위 및 그 주변 지역에 대한 환경 현황, 넷째, 법 제18조에 따라 전략환경영향평가에 대한 협의를 거친 경우 그 협의 내용의 반영 여부, 다섯째, 법 제24조제1항 및 제4항에 따른 환경영향평가항목 등의 결정 내용 및 조치 내용, 여섯째, 괄호에 해당하는 부분에 대한 평가 내용 (환경영향평가항목별 조사, 예측 및 평가의 결과, 환경보전을 위한 조치, 불가피한 환경영향 및 이에 대한 대책, 대안 설정 및 평가, 종합평가 및 결론, 사후환경영향조사 계획)이 포함되어야 한다 (「환경영향평가법」 시행령 제34조). 관계 행정기관 의견수렴 이후에는 공청회 및 설명회를 개최하여 주민의 의견을 수렴해야 한다 (김보미, 2014).
두 번째 단계에서는 사업자와 환경영향평가업자가 환경영향평가서 초안을 작성하고 관계행정기관에게 제출해 의견을 수렴한다. 이후에는 공청회 및 설명회를 개최해 주민의 의견을 수렴해야 한다.