기업 간 제휴, 그 중에서도 벤처기업과 제약회사와의 제휴는 기술개발의 위험을 분산시키고 수익을 공유하기 위해 바이오 벤처 생태계가 만들어낸 독특한 조직 구조라고 할 수 있다. 그러나 1장에서 Pisano의 지적을 인용했듯이 이러한 혁신의 분업구조는 기술개발의 위험을 분산하는 효과는 있지만 학습과 통합이라는 또 다른 과제를 해결하는 데는 취약하다는 한계를 지닌다. 학습과 통합을 위해서는 보다 수직적 통합에 가까운 조직 모델이 필요하다는 것이 Pisano의 핵심적 주장인데, 그는 그러한 예로 거대 제약회사인 Roche가 1세대 바이오 벤처인 Genentech을 인수하여 자회사로 삼은 것을 들었다. 이를 통해 바이오 벤처 본래의 혁신성을 유지하면서도 모회사와의 수직적 관계 속에서 학습과 통합이 보다 더 용이할 수 있다는 것이 그의 주장이다. 물론 한 기업 내에서 모든 과정을 수직적으로 통합하는 것이 학습과 통합을 위해서는 더 좋겠지만 이는 위험 분산이 어려운 단점을 지닌다. 이 때문에 Pisano는 한 조직 내의 수직적 통합과 두 조직 간의 제휴 사이에 있는 ‘수직 계열화’를 최적의 대안으로 제시하고 있다.
Pisano는 벤처기업과 제약회사 간의 제휴가 기술개발의 위험을 분산키는 효과가 있지만 학습과 통합이라는 과제를 해결하지 못하므로, 모기업과 자회사 구조로 수직계열화 하는 것이 최적의 방안이라고 제시했다.