또 다른 개정 법령인 2003년의 건강보험현대화법(Health Care Modernization Act: Gesetzliche Krankenversicherung [GKV]—Modernisierungsgesetz)의 제정으로 ‘자치행정’으로 헬스케어시스템 최고 의사결정조직을 수행하기 위한 G-BA 및 독립적 HTA 기관(전문기관)으로서 의료 질 및 효율성연구소(Institute for Quality and Efficiency in Health Care, IQWiG)가 2004년 설립되었다. IQWiG 설립의 주요 이유는 근거 중심 의학의 이용을 강화하고, '효과성, 필요성, 비용-효과성의 원칙‘에 근거한 G-BA의 평정(appraisal)을 지원하기 위함이었다. 2004년에 IQWiG에 할당된 임무는 주로 임상적 편익(benefit assessment)에 국한되어 있었다. 2007년 4월부터, IQWiG에서의 역할로 새로운 비용-편익 평가가 연방법에 의해 제정되어 G-BA에서 의료보험 급여가 적절한지, 수용가능한지를 판별할 수 있는 근거를 제공하고 있다.
건강보험현대화법의 제정으로 효율성연구소가 2004년 설립되었다. 효율성연구소는 임상적 편익의 임무에 국한되어있었지만 2007년 4월부터 새로운 비용-편익 평가가 제정되어 의료보험에 대해 판별할수 있는 근거를 제공하고 있다.