자격 종목 설계는 해당 자격의 직무를 분석하고 자격을 설계하는 것이다. 장기적으로 교육과정 이수에 따른 자격 부여 방식이 필요하고, 중기적으로는 선행학습 또는 직업 경험을 평가, 인정하며, 단기적으로는 개발된 국가자격체계를 기존 자격의 출제기준 정비에 활용하여야 한다. 과정 평가형 자격과 검정형 자격의 운영 방향을 명확히 하고, 분야별로 차별화된 자격 수여 방식으로 운영하며, 정부의 교육훈련 지원정책과의 연계 및 대국민 홍보가 필요하다. 그리고 과정 평가형 자격제도를 운영하기 위하여 표준화된 교육과정을 개발, 보급하여야 한다. NCS 교육과정과 자격을 연계할 때 모듈식으로 자격 과정을 구성하여야 한다. 모듈은 NCS의 능력 단위를 교육훈련 시 활용할 수 있도록 구성한 교수·학습 자료로서, 일과 학습의 연계를 촉진하는 매개체 역할을 하여야 한다. RPL을 운영할 경우, 산업체와 연계한 교육과정 운영을 통해 보다 효율적인 인적자원 확보가 가능하다.
자격 종목 설계는 직무 분석과 자격 설계이다. 과정 평가형 자격제도 운영을 위해 표준화된 교육과정을 개발, 보급해야 하고, NCS 교육과정과 연계 시 모듈식으로 과정을 구성해야 한다. RPL 운영 시 산업체와 연계해 효율적인 인적 자원확보가 가능하다.