하지만 과학기술인력 수급전망을 둘러싼 내 외부 환경은 그리 호의적이지 못하다. 무엇보다 기술과 제품의 생애주기가 점차 짧아지고 새로운 기술의 출현과 기술간 또는 산업간 융합이 더욱 가속화되는 상황에서 과학기술의 변화상을 예측하는 것이 어려워지고 있다. 세계화의 진전으로 인해 국내 인력의 해외 진출, 해외 인력의 국내 유입 등 인력의 국제적 유동성(international mobility)이 증가하면서 과학기술인력의 수요와 공급을 전망하는데 고려해야 할 외생 변수가 복잡다기해졌다. 이에 따라 수급전망을 실시하는 정부와 전문기관은 이러한 현실을 반영한 방법론 개발에 어려움에 봉착했고 기업, 대학 등 혁신주체들은 수급전망 결과를 불신하면서 미래에 어떠한 인재를 양성하고 어떻게 확보해야 하는지 방향을 잡기 더욱 혼란스러운 상황에 직면해 있다. 단적으로 매년 발표되는 이공계 박사인력에 대한 통계는 우리나라의 박사급 인력이 선진국에 비해 부족함을 나타내고 있으나 실제 주변에서 관찰되는 이공계 박사인력의 노동환경은 갈수록 악화되고 있어 체감 현실과 통계와의 괴리가 적지 않다.
산업 변화와 기술 발전으로 과학기술의 변화는 예측하기 어렵고 더불어 국제 유동성 증대까지 더해져 과학기기술인력은 예측이 어려워졌다. 이에 정부가 제시하는 인재 정책에 대해 기업, 대학 등은 신뢰하지 못하고 혼란스러워한다. 통계는 박사가 부족하다 나오지만 실제 노동환경은 나빠지는 괴리가 있다.