유전자원 이용계약 활성화를 저해하는 근본적인 문제는 각 당사자의 견해 차이에 있다(Price et al., 2004; Hutton et al., 2005; Milne and Niesten, 2009). 자신의 현금흐름에 민감한 이용자는 복잡해진 유전자원 이용에 관한 절차와 유전자원 시장 등 급격한 변화를 추가적인 비용 문제로 받아들인다. 이들은 비용을 줄이기 위해 첫째, 정보 비대칭 상황을 이용해 유전자원 이용으로부터 발 생한 수익과 관련된 정보들을 감출 수 있다. 둘째, 이들이 최대한 노력할 수 있는 수준보다 낮은 수준으로 이익공유를 이행해 비용을 낮출 수 있다.
이용자는 유전자원 시장과 이용 절차의 변화를 추가 비용 발생으로 해석하고, 비용 감소를 위해 수익 정보를 숨기고 이익공유를 적게 할 수 있다.