성장 동력 발굴에 대해 지속적으로 제기되는 이슈는 연구개발 사업성과의 실용화 방안에 관련된 것이다. 이는 정부 출범 초기 각계의 정책 역량이 성장 동력 발굴에 집중할 수 있는 환경인 것에 비해 연구개발 사업이 마무리되어 가는 각 정부 후반기 연구개발 성과 확산과 사업화에 집중하기 위한 정책 환경 조성이 어렵다는 점을 반증하는 것이다(과학기술부, 2005, pp.18-21; 교육과학기술부, 2010, pp.152-153; 미래창조과학부, 2016, pp.13-14). 주력 산업 육성 관련 정책에 대해서는 원천기술 부족이 만성적인 이슈로 자리 잡았다. 이에 대해서는 주력 산업 분야 및 관련 핵심기술개발 사업의 수와 예산이 꾸준히 늘어왔다는 점을 고려하여 관련 정책의 실질적 효과를 면밀히 평가하고, 이를 바탕으로 주력 산업 육성 정책의 개선 방안을 시급히 마련해야 할 것이다(산업자원부, 2007, pp.24-25; 지식경제부, 2013, pp.127-128; 산업통상자원부, 2017, pp.77-83). 거대 국책 연구개발에 대해서 역대 정부의 평가위원들은 효율적인 범부처 협력 체계 마련의 필요성이 지속적으로 강조해 왔다(과학기술부, 2008, pp.285-317; 지식경제부, 2009, pp. 91-94; 교육과학기술부, 2013,pp.68-75; 미래창조과학부, 2017, pp,48-53).
성장 동력 발굴에서 계속적으로 제시된 논쟁은 연구개발 사업성과의 실용화 관련 방안이다. 주력 산업 육성 정책 관련해서는 원천기술 부족이 고쳐지지 않는 이슈로 남아있으며, 거대 국책 연구개발에 대해 역대 정부 평가위원들은 부처 간의 효율적인 협력 체계 마련이 필요하다고 주장했다.