축종 별로 내성률을 비교한 결과, 닭 유래 균주의 내성률이 다른 축종에 비해 전반적으로 높게 나타났다. 축종 별로는 소 유래 균주에서는 erythromycin(34.6%)과 ciprofloxacin(21.8%), tigecycline(15.4%)의 내성률이 다른 항생제에 비해 높았다. 돼지 유래 균주에서도 erythromycin의 내성률이 48.2%로 가장 높았으며, tigecycline(17.3%), tylosin(17.3%), tetracycline(16.2%), ciprofloxacin(12.2%) 순으로 나타났다. 닭 유래 균주는 ciprofloxacin의 내성률이 56.5%로 가장 높았으며 erythromycin(45.2%), tetracycline(42.9%), tylosin(35.7%) 순으로 내성률이 높게 나타났다. 오리 유래 균주에서도 닭 유래 균주와 유사하게 ciprofloxacin의 내성률이 48.6%로 가장 높았으며, tetracycline(37.5%), erythromycin(26.4%), tylosin(13.9%) 순으로 나타났다. 그러나 닭 유래 균주에서는 ampicillin 13.7%, daptomycin 11.9%, linezolid 6.5%, 오리 유래 균주에서는 ampicillin 4.2%, daptomycin 8.3%, linezolid 5.6%로 소와 돼지 유래 균주에 비해 높게 나타났다. 사람에서 중요하게 사용하는 vancomycin과 gentamicin에 대한 내성 균주는 모든 축종에서 확인되지 않았다.
축종 별 내성률을 비교한 결과 소와 돼지 유래 균주에서는 erythromycin, 닭과 오리 유래 균주는 ciprofloxacin가 내성률이 가장 높았지만 vancomycin과 gentamicin에 대한 내성 균주는 모든 축종에서 확인이 안되었다. 