건강검진사업 효과평가에 대한 이전에 수행한 연구들은 대부분 당뇨병 및 특정암 등 일개 질환 중심으로 비용효과분석을 실시하였고 추적 연구 자료의 부족으로 검진유무에 따라 특정질환의 의료비용을 추정하는 방식으로 평가가 이루어졌다. 이애경 등(2006)은 당뇨병 건강검진을 받은 군과 받지 않은 군에 대한 가상코호트를 설정하여 비용-효과분석을 한 결과 건강검진을 받은 군이 받지 않은 군에 비해서 비용이 절감되는 것으로 나타났다. 이상일 등(2003)은 우리나라 20세 여성을 대상으로 가상적인 코호트로 설정하여 자궁경부암 건강검진에 대한 비용-효과 분석을 실시하였다. 자궁경부 세포진검사를 통하여 생존기간이 연장되는 것으로 나타났다. 윤영덕 등(2010)은 국민건강보험공단 자료를 바탕으로 국가 일반건강검진 수검여부와 사망 및 심뇌혈관계 합병증 발생, 진료비 지출과의 관련성을 분석한 결과 일반건강검진 수검이 사망 발생 및 심뇌혈관 발생의 예방 가능성이 있음을 보여주었다.
검강검진사업의 효과평가는 일개 질환 중심으로 비용효과분석을 실시하여 평가하였는데, 당뇨병은 비용 감소, 자궁경부암은 예방효과 그리고, 사망 발생및 심뇌혈관 발생의 예방 가능성에 대한 연구 결과가 있었다.