도로이동오염원 배출량은 일반적으로 차종별 차량 등록대수를 바탕으로 산정된다(국립환경과학원, 2013). 그러나 이와 같은 방법은 국가 배출량과 같이 총량 개념을 산정하는 데는 큰 무리가 없으나, 특정 지역의 세부 배출량을 산정하는 데는 한계가 있는 것으로 판단된다. 즉, 특정 지역의 세부 배출량을 산정하기 위한 차량 등록대수는 해당 지역 내에서 통행하는 등록대수와 타 지역으로 진출 또는 타 지역에서 진입하는 등록 대수가 함께 고려되어야 할 필요가 있다. 특히, 질소산화물(NOX) 배출량 비중이 높은 화물차의 경우 차량등록지와 실제 물류활동지의 일치율이 낮기 때문에(한국교통연구원, 2011), 차량 등록대수 기반의 배출량은 과다 또는 과소 산정될 가능성이 있다.
차종별 차량 등록대수를 바탕으로 정해지는 도로이동오염원 배출량은, 해당 지역 내 등록대수만 고려해서는 정확한 파악이 어렵기에 특정 지역의 세부 배출량 산정에는 한계가 있다.