정부 R&D 전략의 수용성을 제고하기 위해서는 현재 정부조직법상 분권화된 업무 분장을 어떻게 적재적소에 배치하는가의 문제로 귀결될 수 있다고 본다. 즉, 현재의 추진체계의 문제는, 그동안 유지되어 온 집중형 R&D 시스템이 관성화되고, 업무가 국무총리실에 편제될 때 국무총리실이 비대화되는 문제에 기인한다. 그리고 시시각각 변화하는 행정수요에 대응하기 위해 정부 입법권을 신속하게 제출해야 하는 상황에도 기인하는 것으로 판단된다. 아울러 정부 R&D 예산 배분･조정의 경우에도 주요 국가 연구개발사업에 대해서 재정당국인 기획재정부가 R&D의 특성을 예산편성 전 고려해야 할 요소로 판단하고 이를 반영하여 업무를 분장한 것으로 보인다.
정부 R&D 전략의 수용성을 높이려면 관성화 된 집중형 R&D 시스템, 국무총리실 비대화 문제 등을 고려하여 업무분장을 적절히 분배하여야 한다.