교육계는 약학대학 학제개편 논의 시 4년 혹은 6년제 전환에 따른 교육과정에 대한 검토가 필요하다는 의견을 제시하였다. 2+4년제에서 2년간의 기초소양 교육이 이후 4년간의 전공교육에 도움이 되는지, 실무실습부분이 꼭 전공교육과정에 포함될 필요가 있는지 등 약학 교육과정 부분에 대한 전반적 검토가 필요하다고 하였다. 외국의 학제와 비교하고 우리나라에서 각각의 대안들이 교육과정을 통해서 어떻게 차이가 있는지 살펴봤을 때 학제개편에 대하여 합의할수 있는 근거가 부족하다는 의견을 제시하였다. 약학이 국가별 특성에 따라 달라질 수 있는지, 국가에 따라 달라질 수 없다면 선진국을 따라가는 것이 근거를 가질 수 있는지 의문이며, 교과목을 통해서 기르고자 하는 역량수준 차원의 검토는 협의회차원에서 이루어지지 않아 적합한 학제를 판단할 수 있는 공통의 기준 성립되기 어렵다는 의견이다. 사회적 합의 역시 도출과정을 따지기 시작하면 근거로 보는데 한계가 있다고 하였다.
교육계는 약학대학 학제개편의 검토 필요성과 더불어 개편 근거 부족을 지적했는데, 약학의 국가별 특성화와 선진국 벤치마킹에 의문을 표했으며 목표 역량수준에 대한 검토 부재와 사회적 합의의 한계를 지적했다.