하지만 블록체인이 범용 기술로 활용되기 위해서는 아직 해결해야 할 문제가 남아있다. 표준적인 암호 관리, 복구 취소 시스템의 부재, 확장성의 한계 등이 지적되며, 특히 블록체인만의 장점인 분권화된 네트워크로 인한 중앙 관리자의 부재는 통제 불가능에 대한 우려가 존재한다. 전자상거래 사이트인 실크로드의 사례와 같이, 탈세, 자금세탁, 테러 자금 지원, 마약 및 무기 판매와 같은 범죄행위를 지원하는데 악용될 가능성이 있다. 따라서 블록체인의 도입 및 적용 확대를 지원하기 위한 정책을 마련하는 한편, 블록체인 기술을 관리할 수 있는 법·제도적 측면에 대한 논의가 동시에 진행 되어야 한다.
중앙 관리자의 부재로 통제 불가능 우려 등 블록체인이 범용 기술로 활용되기엔 한계가 있어, 이를 해결할 법·제도적 측면과 도입·적용 확대를 위한 정책이 함께 논의되어야 한다.