분산되어 있는 데이터의 활용을 위해 행정체제 내의 조정기제 구축과 함께 필요한 것은 다양한 데이터 이해관계자가 참여하는 거버넌스 구조 마련이다. 정부가 헬스케어 데이터를 통해 의미 있는 가치를 실현하기 위해 가장 중요한 요인은 참여적이고 포괄적인 데이터 거버넌스 구조를 확립하는 것이다. 헬스케어 데이터는 광범위한 범위에서 동시다발적으로 생성되고 다수의 이해관계자가 존재하기 때문에 이미 정부가 통제할 수 있는 범위를 넘어섰으며 이로 인해 헬스케어 데이터 거버넌스 구성은 다(多)부문에 걸쳐 이루어져야 한다(OECD, 2015a). 헬스케어 데이터 구축 및 활용을 위해 국내에서는 정밀의료 프로젝트 등을 시행하고 있으며 이를 위해 범부처 차원으로 접근하고 있다. 정밀의료의 경우 2016년 8월 9대 국가전략 프로젝트 중 하나의 사업으로 선정되어(미래창조과학부 보도자료, 2016.8.10.) 범부처 차원에서 보건복지부, 미래창조과학부, 산업통상자원부가 공동으로 세부실행계획을 수립하고 있으며(‘16.10.11기준), 현재 진행 중인 예비타당성조사(~2016.11.)를 거쳐 2017년부터 프로젝트를 본격적으로 추진할 계획이다(미래창조과학부 보도자료, 2016.10.11.). 본 프로젝트를 추진하기 위해 정부, 공공기관, 민간전문가 등 총 17인의 「정밀의료 연구개발 추진위원회」를 구성하였으며, 필수 기술별 8개 실무 작업반을 두어 과제도출과 전문적 검토 등 실무 작업을 지원하고 이와는 별도로 10명 안팎의 자문위원회를 구성해 종합적인 자문을 실시하고 있다(보건복지부, 2016).
정부가 분산된 헬스케어 데이터를 활용하기 위해 포괄적인 데이터 거버넌스 구조를 마련해야 한다. 헬스케어 데이터의 광범위성, 동시다발성 때문에 거버넌스를 다부문에 걸쳐 범부처 차원에서 구성해야 한다. 정밀의료의 경우 국가전략 프로젝트 사업으로, 범부처적으로 세부실행계획을 수립, 2017년부터 추진한다. 프로젝트 추진을 위해 추진위원회와 자문위원회를 구성 및 운영했다.