WHO는 감염병 발생국과 주변국들이 감염병 차단을 위해 취할 조치에 대해 일관되지 않은 대응으로 글로벌 협력에 혼선을 일으켰다. 감염병에 대한 글로벌 협력 조율기구로서 WHO의 역할은 국제공중보건비상사태(PHEIC) 발령에서 시작한다. 하지만 WHO는 코로나19의 PHEIC 발령을 지체하고 있다가 국제사회의 압력을 받아 2020년 3월 11일이 되어서야 코로나19를 PHEIC로 발령하였다. 2005년에 세계보건회의가 WHO에 그러한 권한을 부여한 후에 여섯 번째 발령이었다. PHEIC 발령은 감염병 발생국에게 낙인을 찍는 효과가 있기 때문에 감염병 발생국이 반대하는 경우가 많은데, 코로나19의 PHEIC 발령 지체에도 중국의 반대가 작용했을 수 있다. 또한 WHO는 중국이 코로나19 바이러스의 심각성을 축소 통보한 것을 문제 삼지 않았고, 중국이 코로나19 바이러스 확산을 차단하기 위해 취한 조치를 칭찬하면서 다른 국가들이 코로나19를 차단하기 위해 실시한 여행제한은 IHR 위반이라고 비판하였다.
WHO가 코로나19를 PHEIC로 발령하는 일을 지체했는데, 이는 코로나19 발생국인 중국의 힘 때문일 수도 있다. 그리고 WHO는 중국의 위험성 축소통보에 문제제기를 하지 않고, 중국과 다른 국가의 확산방지조치에 대한 상반된 태도를 보이는 등 혼선을 야기했다.