정부조직법 개정안 타결 합의 사항에 따라 뉴미디어 (재)허가, 변경허가에 대한 사전 동의 절차를 마련(‘13.5월 위원회 보고)한 가운데, 양 기관의 충돌 이전에 업무의 지연과 행정낭비 등이 더 큰 문제로 지적되고 있다. 미래부는 허가여부에 대한 1차검토를 거쳐 방통위에 사전동의를 요청하고, 방통위는 사전동의 절차를 거쳐 미래부에 통보한 후에 미래부가 허가여부를 최종 결정해 사업자에 통보해야 한다. 방통위는 사업자의 절차 지연 등 부담을 최소화하기 위해 미래부의 사전동의 요청 전에 미리 외부전문가에 의한 예비검토를 진행하고, 예비검토와 미래부 의견을 검토해 쟁점이 없는 경우 추가적인 전문가 심사 없이 사전동의를 의결할 수 있다.
방통위는 뉴미디어 허가 절차 지연의 부담을 줄이기 위해 미래부 사전동의 요청 전 예비검토를 진행하고 이후 미래부 의견을 검토해 쟁점이 없을 시 사전동의를 의결할 수 있다.