그러나 이러한 공공구매 정책에 있어 문제점 역시 지적되고 있다. 가장 주된 지적은 중소기업이 경쟁력을 확보하고 자생력을 갖출 수 있도록 만드는 것에는 미흡하였다는 것이다. 특히 조달청 (2015. 2. 25)은 일부 기업들의 경우 할당된 공공조달 물량에 안주하려는 경향을 보이고 있음을 지적한다. 입찰 심사 시 우대를 기대한 인증의 난립, 기존 제품의 규격 일부를 바꾸어 우수조달물품으로 지정을 신청하는 등의 행태가 발견되기 때문이다. 또한 이러한 문제점을 해결하기 위해 향후 공공조달정책은 기술융합제품, 신기술제품개발 등 중소기업의 연구개발에 중점을 둘 필요성이 있음을 강 조하였다.
공공구매 정책에 있어 중소기업이 경쟁력을 확보하도록 만드는 데에 미흡하였다는 점이 지적되었다. 조달청은 일부 기업이 할당된 물량에 안주하려는 경향이 있음을 지적한다.