우선 기초연구 관련 상위 정책조정 주체인 기초연구진흥협의회를 살펴보면, 기초연구진흥협의회는 국가과학기술심의회 산하 위원회로서 과학기술기본법에 따라 기초연구분야의 발전 방안 및 투자 확대 등 주요 기초연구 정책 심의를 주도하는 협의회이다. 기초연구진흥협의회가 속해 있는 국가과학기술심의회는 과학기술 주요 정책·과학기술 혁신 및 산업화 관련 인력정책·지역기술혁신정책에 대한 조정, 연구개발 계획 및 사업에 대한 조정, 연구개발 예산의 운영 등에 관한 사항 심의 등의 기능을 하고 있다. 기초연구진흥협의회도 유사한 기능을 수행하는데, 주요기능으로는 기초연구진흥종합계획 사전 심의·조정, 중앙행정기관 간 기초연구의 역할 정립 및 중복투자 조정, 기초연구비 관련 정부연구개발예산 비율 산정, 기초연구 투자 분석 및 정책방향 등에 관한 조정·심의 등이다. 협의회는 위원장과 부위원장, 그리고 위원들로 구성되어 있으며 위원장과 부위원장은 미래부 장관이 지명한다. 현재 제2기 협의회로 위원수가 15명에서 27명으로 확대되었으며 구성은 기초과학 분야 12명, 공학 및 의약한 분야 11명, 정책분야 4명 등이다, 위원의 임기는 2년이다. 2016년의 경우 「대한민국 기초연구발전비전과 목표」, 「‘16년도 정부 R&D 기초연구비 비중」, 「기초연구 투자전략」, 「기초연구지원 개선」등 안건 등을 다루었다. 기초연구진흥협의회에 대한 정책지원은 한국과학기술기획평가원(KISTEP)에서 담당하고 있다. 평가원은 기초연구진흥과 관련된 정책을 총괄하기 보다는 종합 심의와 관련된 기능 수행을 지원하는 역할을 담당한다.
기초연구진흥협의회는 주요 기초연구 정책 심의를 주도하는 협의회이다. 주요기능으로는 기초연구진흥종합계획 사전 심의·조정, 중앙행정기관 간 기초연구의 역할 정립 및 중복투자 조정 등에 관한 조정·심의 등이다. 2016년의 경우 「대한민국 기초연구발전비전과 목표」 등 안건 등을 다루었다.