지역 간 산업연관표의 투입 구조 및 배분 구조는 단일 지역 산업연관표와 유사하다. 투입 구조는 지역 간 산업연관표의 열을 따라 나타나는데, 특정지역 특정 산업이 생산 활동을 하기 위해 사용된 중간재 및 본원적 생산요소 등의 구입내역이 나타나 있다. 이 경우, 각 지역의 산업들에서 생산된 생산물이 중간재로 어떻게 투입이 되었는지를 알 수 있다. 배분 구조는 지역 간 산업연관표의 행을 따라 나타나는데, 특정지역 특정 산업 생산물이 해당 지역의 산업들과 타지역의 산업들에 중간재로 어떻게 투입되었는지를 알 수 있고, 또한 최종재로 판매된 내역을 알 수 있다. 이 지역 간 산업연관표가 구축되면 이를 이용하여 생산 유발계수와 부가가치 유발계수를 계산할 수 있다. 즉 각 산업의 생산 유발효과와 부가가치 유발효과를 파악할 수 있다.
지역 간 산업연관표의 투입 및 배분 구조를 통해 산업 생산물의 중간재로서의 투입 과정과 최종재의 판매내역을 알 수 있다. 그렇기 때문에 지역 간 산업연관표 구축은 생산을 유발하고 부가가치를 창출할 수 있다.