중소기업에 대한 일본 정부의 지원정책은 이러한 인식을 배경으로 중소기업이 어려운 경영환경을 극복하고 지속적으로 성장할 수 있도록 세심하게 지원해야 한다는 정책이념 하에 다음과 같은 5가지 원칙에 따라 시행되어 왔다. 첫째는 경제회생의 근원으로서 중소기업의 자발적인 기술혁신 유도해야하고, 둘째로 신사업 개발 지원이다. 셋째는 창의성을 통해 새로운 시장을 창출하도록 도전정신 유도, 넷째, 시장 공정성 강화, 마지막 다섯째는 경영안정을 위한 안전망 제공이다. 이러한 원칙에 따른 다양한 지원 프로그램이 시행되고 있는데 크게 경영지원, 금융지원, 회계지원, 시장 및 지역 지원으로 구분된다. 경영지원은 창업보육, 기업혁신, 협력, 기업회생, 인적자원개발, 조달, 상호원조 등이며, 금융지원은 연구개발 자금융자 지원, 안전망 지원이며, 회계 지원은 세무 상담, 회계 상담 지원 등이 포함되고, 시장 및 지역지원은 상품판매 회생, 지역산업과의 연계, 농업･상업･산업 간 협력이 포함된다. 또한 지역의 산업 클러스터와 연계한 기술개발, 시장개척 등을 추진함으로써 지역경제 활성화도 도모하고 있다.
일본 정부의 중소기업 지원정책은 다섯 가지 원칙에 따라 다양한 프로그램이 있다. 또한 지역 산업과 연계해 기술개발 등을 추진해 동시에 지역경제 활성화도 도모하고 있다.