말러바는 산업부문혁신시스템의 세 가지 구성요소로서 지식기반과 기술 도메인, 다양한, 이질적인 참여자와 그들의 네트워크, 그리고 산업부문별 제도를 들었다(Malerba 2002). 여기서 지식기반이란 어떤 산업부문과 밀접한 연관이 있는 한 개 또는 그 이상의 학제들을 말하는데, 예를 들어 화학산업은 화학과 화학공학, 전자산업은 전자공학과 전기공학에 지식의 기반을 두고 있는 것을 뜻한다. 사실 공학분야에서는 학제와 산업은 새로운 학제의 등장이 새로운 산업의 등장에 후행하는 것이 일반적이지만, 바이오산업과 같은 신산업의 경우를 보면 생물학, 생화학, 그리고 의학을 융합적 지식기반으로 하여 태동한 것을 알 수 있다. 기술도메인이란 어떤 산업부문에서 주로 사용되는 기술들의 느슨한 집합을 의미하는 것으로, 서로 다른 산업부문은 상이한 기술도메인을 기반으로 하고 있다는 것은 이론의 여지가 거의 없다. 산업부문별 제도란 해당 산업의 혁신활동에 관련된 연구개발제도, 산학연 협력과 같은 지식유동을 위한 제도적 장치, 해당 산업에 적용되는 각종 법규, 가치사슬, 명문화되어 있지는 않으나 해당 산업 종사자들이 따르고 있는 규범, 해당 산업의 역사적 맥락과 산업계의 문화, 그리고 종사자들이 그 산업에 속해 있다고 생각하는 인식론적 배경 등을 포함한다. 말러바는 산업섹터들의 전환은 이 세 가지 구성요소들의 공진화의 결과라고 설명하였다(Malerba 2004).
말러바는 지식기반, 기술 도메인, 네트워크, 산업부문별 제도가 산업부문혁신시스템을 구성하며 상호관계를 통해 전환된다고 설명했다. 신산업에서의 지식기반은 본래의 개념과는 반대로 생물학, 생화학, 의학의 학제가 산업의 전제로 등장한다. 기술도메인은 산업의 주요 기술의 집합체를 말하며 산업부문별 제도는 해당 산업의 역사적, 문화적, 인식론적 배경을 포함한다.