비교효과연구를 국가적인 연구개발 사업으로 발전시키기 위해서는 순수하게 연구수행 부문에만 투자할 수는 없고, 이러한 연구의 정책적 활용도를 중장기적으로 지속해 나가기 위해서는 인프라 확충이나 연구관리 및 정책화 부문에 대한 투자도 고려하여야 한다. 예를 들면 연구 수행 50%, 인프라 확충 30%, 연구 관리 및 정책화 20% 정도 등과 같이 사업 부문별로 투자 규모를 조정할 필요가 있는데, 이는 비교효과연구 사업의 초기에는 인프라 확충을 위한 비중이 상대적으로 클 것이고, 연구 기반이 정착됨에 따라 정책화를 위한 투자 비중이 증대해 갈 것이다.
비교효과연구를 발전시키기 위하여, 인프라를 확충하고 연구관리와 정책화 부문을 함께 투자해야 할 것이다. 