전반적인 창업 생태계 조성 및 창업 친화적 제도 개선은 이루어지고 있으나, 부산지역의 창업 환경은 다음과 같은 문제점을 갖고 있다. 우선, 창업 지원 사업의 프로세스 간 연계성 부족으로 인해 사업 효과에 한계가 존재한다. 즉, 창업 교육 사업 등 사업화 지원, 창업 이후 멘토링 및 정책 자금 지원 사업 간 창업 생태계 조성을 위한 연계가 원활하지 못한 측면이 많다. 둘째, 창업 강좌 등의 창업 교육이 획일적이고 특성화 되지 못하였다. 고등교육에서 체계적인 창업 교육이 이루어지지 못하고 있고, 초중등에서 중장년에 이르는 기업가정신 함양 프로그램이 부재하다. 셋째, 창업 지원 정책이 창업교육 등 특정 부문 집중으로 인한 창업 이후의 성장 단계 지원은 상대적으로 미흡한 실정이다. 넷째, 초기 창업 기업에 대한 엔젤 자금 펀드 및 벤처캐피털(VC) 투자가 부족하다. 이로 인해 좋은 기술을 보유한 창업자는 기술 유출을 우려하여 투자를 받기를 꺼리고, 창업초기 창업자는 기술 미검증으로 투자를 꺼리는 미스매칭 현상이 많다. 다섯째, 창업 기업에 대한 컨설팅･멘토링 지원 등 사후 관리･지원 정책이 부족하다.
부산지역의 창업 환경은 지원 사업 간 연계성 부족, 창업 교육의 획일화, 창업 이후 지원 미흡, 창업 초기 투자 부족, 사후 관리 부족 등의 문제점을 보인다.