한국생명공학연구원은 1992년 우리나라 바이오 벤처 1호인 (주)바이오니아를 연구원창업으로 배출한 바 있으며, 최근까지 총 21개의 바이오 벤처를 연구원 창업형식으로 배출하였다. 또한 개인 창업이 감소하고 있는 2000년대 후반에는 국내 바이오분야 기업과 공동으로 기술을 출자하여 연구소기업 3개를 설립하였으며, 최근 신기술창업 전문회사 1개도 설립하여 총 25개 기업을 설립하거나 배출하였다. 한국생명공학연구원의 연도별 바이오 벤처 창업 현황을 보면 연구원 창업은 총 21개로 그중 19개(90.4%)가 바이오 벤처 붐이 불던 1990년대 후반~2000년에 창업되었다. 2008년도 이후에는 개인 기반의 창업보다는 연구소기업/신기술창업전문회사등 조직 기반의 창업이 주를 이루고 있다.
한국생명공학연구원은 연구원 창업을 통한 바이오 벤처를 배출해왔다. 2000년 이전에는 연구원 창업을 중심으로 운영해온 반면, 2008년 이후에는 조직 기반의 창업을 주로 진행하고 있다.