셋째, 시간선택제 근로자들이 사회보험, 퇴직급여 등에서 불합리한 차별을 받지 않도록 관련 제도를 정비했다. 먼저, 복수사업장에서 일하는 시간선택제 근로자들이 국민연금, 고용보험, 산재보험에 대해 개인을 기준으로 합산하여 적용받을 수 있도록 했다. 기존의 사회보험체계가 단일사업장에서 근무하는 전일제 근로자 중심으로 설계돼 있음에 따라 시간선택제 근로자에게 불리하다는 점을 고려한 것이었다. 다음으로, 전일제 근무자가 시간선택제로 전환한 직후 퇴직하더라도 퇴직급여 산정 시 불리함이 없도록, 전일제와 시간제 근로형태 구간별로 퇴직급여를 따로 산정하도록 개선했다. 시간선택제 공무원에게도 비슷한 방식으로 연금이 적용되도록 했다. 마지막으로, 중소기업에서 계약직 시간제를 무기계약직 시간제로 전환하는 경우, 그에 따른 임금 상승분의 50%를 월 60만 원 한도로 1년간 지원하도록 했다. 다만, 이는 전환 후 시간당임금이 최저임금의 120% 이상, 4대 보험을 적용하는 경우를 지원요건으로 했다.
시간선택제 근로자들이 차별받지 않도록 제도를 정비했다. 개인을 기준으로 사회보험을 적용받을 수 있고, 근로형태 구간별로 퇴직급여를 따로 산정히며, 중소기업에서 계약직 시간제울 무기계약직 시간제로 전환하고 요건을 만족하면 정해진 금액을 지원한다.