학교의 학습지원 요인의 경우 특히 하위 학생에 대한 학습부진학생 지도 프로그램의 효과가 나타났으며, 방과 후 학교 참여율이 높을수록 성취 향상 정도가 높아지는 효과는 중·하위 학생들로부터 확인되었다. 풍토 요인의 경우 학교장이 응답한 교사 풍토, 학생 풍토 및 학부모 풍토와 성취도 변화와의 연관성은 나타나지 않았고, 교수·학습에 대한 학생과 교사의 열의에 대한 학생 인식으로 구성된 학교풍토 변수는 모든 성취 수준에 걸쳐 성취 향상에 긍정적 영향을 주는 것으로 나타났다. 투입된 변인들은 성취 변화에 대한 학교 간 차이의 약 27%(하위)에서 66%(상위) 정도를 설명해주고 있다. 특히 하위 학생들의 향상과 관련하여 투입된 변수들의 설명력이 상대적으로 낮았다는 것은 하위 학생들의 수학 성취 향상과 관련한 다른 설명 요인들을 추가적으로 탐색할 필요성을 시사한다.
하위 학생 대상 부진학생 지도 프로그램의 효과, 특히 방과 후 학교 참여율이 높을수록 성취가 향상되는 것은 중·하위 학생들로부터 확인되었고, 다른 풍토변수에 반해 학교풍토는 모든 성취 수준에 걸쳐 향상에 긍정적 영향을 미쳤다.