한편 환경부를 중심으로 생물 다양성에 초점을 맞춘 범부처 관리 제도가 구축되고 있다. 환경부의 생물 다양성 관리 계획은 UN 산하 기구인 생물 다양성협약(CBD)의 국내 이행체계를 확립해가는 과정에서 추진되고 있다. 한국이 CBD에 가입한 이후 국내 이행전략에 관한 계획을 수립한 바 있으나, 보다 체계적이고 공식적인 이행체계 마련을 위해 2014년 생물 다양성 법이 제정되었다. 생물 다양성 법에서는 범부처 차원에서 생물 다양성 보전과 지속 가능 이용을 위한 ‘국가 생물 다양성 전략’을 5년마다 수립하도록 규정하고 있다. 이에 따라 환경부는 2014년 범부처 기본계획, ‘제3차 국가 생물 다양성 전략(2014.3.)’을 확정하였다.
한국이 생물 다양성협약에 가입 이후 체계적으로 이행하기 위해 생물 다양성 법이 제정되고 환경부를 중점으로 범부처 관리 제도가 시행되고 있다.