다른 한편으로, 공공기관 경영진에 대한 정치적 임용은 정부의 정책사업 수행과 경영비효율을 통하여 간접적으로 부채를 증가시킬 수 있다. 대통령은 공공기관에 대한 정치적 통제를 위하여 공공기관 경영진에 대한 정치적 임용의 유인이 발생한다(김병섭 외, 2010) 공공기관 기관장은 이러한 임명권자의 의지에 반하는 사업을 추진하기 어렵고 이는 정치적으로 임명된 공공기관장이 적극적으로 정부정책사업을 수행하게 되는 원인이 된다. 이러한 정책사업 수행은 앞서 서술한 것처럼 공공기관의 부채를 증가시키는 주요요인이 된다. 또한, 공공기관장에 대한 정치적 임용은 경영비효율을  통해서도  부채에  영향을  끼칠  수  있다.  박상희･김병섭(2012)은  자원의존이론의 관점에서 노조는 외부에서 온 기관장을 통하여 수당 및 성과금에서 이익을 취하려는 유인이 있다고 주장하였다. 낙하산 인사의 경우 정통성의 부족으로 노조와의 협상력이 떨어질 수 있고 위와 같은 유인을 가지고 있는 노조에 많은 양보를 할 가능성이 있다. 특히, 노사관계의 안정화는 경영평가의 중요한 평가항목이기 때문에, 사업실적에 자신이 없는 낙하산 인사는 노조에 많은 양보를 하고 이는 경영비효율성을 높이는 요인으로 작용할 수 있을 것이다. 결과적으로 이렇게 발생한 경영의 비효율성은 공공기관의 재무상태를 압박하여 부채를 증가시키는 원인이 될 수 있다.
공공기관 경영진에 대한 정치적 임용은 간접적으로 부채를 증가시는 주요 원인이자 경영비효율을 야기해 부채에 영향을 끼칠 수 있는데, 박상희, 김병섭(2012)는 자원의존이론에 입각해 낙하산 인사의 경우 정통성의 부족으로 노조와의 협상력이 떨어지기 때문에 노조에 많은 부분을 양보할 수 있다. 이는 결국 부채를 증가시키는 원인이 된다는 주장을 했다.