정부 부처에서는 국가교통 R&D의 효율적인 운영을 위한 전략을 부처별로 수립하였으나, 각 부처간 중복된 과제가 존재하여 부처간 협의가 필요한 과제들이 다수 존재하고 있다. 특히 교통분야의 경우 관계부처인 국토부, 미래부, 산자부의 주요 추진과제를 하나로 도출하는 과정이 필요하며, 이를 위해 교통분야와 관계된 정부 3개 부처의 부처간 협의가 필요하다. 본 절에서는 앞서 분류한 5개 교통분야에 해당하는 정부 3개 부처 추진 과제 중에서 연관성이 높은 과제들을 정리하고, 향후 3개 정부 부처의 협의시 참고자료로서 활용되도록 제안 하고자 한다.
국가교통 연구개발에 대한 전략에 부처별 중복이 많으니 특히 관련부처인 국토부,미래부,산자부는 상호협의로 하나의 추진과제로 도출하는 역할을 수행해야한다.