국내 의사 양성 교육과정은 6년제의 의과대학(학사)과 4년제의 의학전문대학원(의무석사)으로 이원화 되어 있다. 의과대학 제도에서 의학전문대학원 제도로 전환하던 시기에 정부가 MD-PhD 과정에 대한 장학금 수혜 등을 약속하며, 복합학위과정을 따로 설치하였지만 실제로 그 길을 선택하는 의대생은 매우 적다. 또한 현재 의사양성 시스템이의학전문대학원에서 의과대학으로 회귀해 감에 따라 본 학위 과정이 점차 유명무실화 되고 있다. 따라서 외국 사례를 검토한 뒤 국내 의과대학 및 의학전문대학원의 의사과학자양성 제도를 개선하기 위해 도출한 방안은 다음과 같다.
의학전문대학원은 장학금을 제공하고 복합학위과정을 따로 두지만 수요가 적다.