이러한 제도의 변화가 이루어지면 사업성과평가제도도 지금의 세부사업평가 중심에서 범부처 프로그램 평가로 평가의 중심 단위가 변화되어야 하며 프로그램 평가뿐만 아니라 정책평가도 활성화될 수 있다. 이렇게 창출된 성과평가 정보는 예산평가 시 프로그램 예산평가에 반영되도록 함으로써 정책-예산-평가의 정합성을 제고시킬 수 있다. 또한 부처 세부사업에 대한 평가는 지금과 같이 부처 내 자체 평가를 활성화시키되, 부처별 자율예산편성제도에 대한 책임 모니터링 강화를 위해 부처들의 정책방향과 예산 투자의 정합성 및 효율성에 대한 평가를 강화한다. 구체적으로 부처 내 프로그램 평가 및 부처별 종합평가를 도입하여 정책-프로그램-사업에 대한 종합평가를 실시하도록 한다.
제도가 변화되면 범부처 프로그램 평가가 이루어져야 하며, 성과평과정보는 프로그램 예산평가에 반영시킬 수 있다. 이를 통해 정책과 예산 및 평가의 정합성을 키울 수 있을 것이다. 