대학 연구 지원은 대학만이 할 수 있는 영역과 대학이 더 잘할 수 있는 영역으로 구분된다. 대학만이 할 수 있는 영역은 장기, 불확실 연구와 후속 세대 양성과 직결된 연구이며 대학이 더 잘할 수 있는 연구는 산업체나 출연연에 비해 우수한 연구자를 중심으로 한 원천 연구가 될 것이다. 연구의 자율은 책임성을 전제로 한다. 장기, 불확실 연구는 최소한의 법적 책임성과 전문적 책임성이 요구되며 연구 장려금 방식의 연구 지원이 더욱 확대되어야 한다. 반면, 원천 연구는 계약 방식에 의하고 법적 책임성과 함께 성과의 우수성에 대한 정치적 책임성이 요구된다. 지금의 혼재된 연구비 지원 방식은 사업의 비효율성과 함께 대학 연구자들에게도 서로 다른 연구의 책임성을 분명하게 인지하지 못하게 만든 결과를 가져왔다. 따라서 원천 연구는 ‘연구 거점’ 으로서 의 역량을 갖춘 소수의 대학에 보다 집중하고 장기, 불확실 연구는 상향식 과제 중심의 지원을 보다 폭넓은 범위로 확대할 필요가 있다.
연구의 성격에 맞는 지원금 지급이 중요하다. 법적, 전문적 책임성이 요구되는 장기, 불확실 연구는 장려금 방식의 폭넓은 지원을, 보다 성과의 우수성이 강조되는 원천 연구는 역량을 갖춘 소수의 대학에 집중할 필요가 있다.