또한 기업의 사적 목적에 의한 투자에 대한 정부 지원의 정당성은 연구개발 혹은 혁신활동의 특수성을 중시하는 내생적 경제성장 이론으로 이해할 수 있다. 우선 연구개발투자의 특수성이 전제되어야 하는데, 연구개발투자의 산출물은 무형(즉 지식)이고 고정자산투자와 같은 물리적 자본투자와는 달리 성과 달성의 불확실성이매우 크다. 이와 같은 연구개발투자의 불확실성과 아울러 연구개발투자의 산출물인지식은 개발주체인 기업 이외의 경제주체들에 직간접적으로 파급되는 누출효과(spillover effect)로 인해 개발주체인 기업이 직접적인 경제적 성과를 독점하기 어렵다. 이러한 특성으로 인해 기업의 연구개발투자는 사회적 최적 수준 이하에 머물 가능성이 높고, 이러한 연구개발 과소투자 문제를 해소하기 위해 정부가 기업의 R&D유인을 강화하는 정책은 경제 전체의 효율성을 높인다는 것이다(고윤미, 이정재, 2011; 손원익, 2013).
정부의 기업 사적 투자 지원 정당성은 연구개발 등의 특수성 중시인 내생적 경제성장 이론이다. 연구개발 산출물은 무형(즉 지식)으로 불확실성이 크고 누출효과로 기업 독점이 어려워 과소투자 문제가 생기므로 정부는 기업 R&D유인을 강화하는 것이다.