신의료기술평가 이후 제도권으로 들어온 의료기술의 실질적인 효과성, 안전성 그리고 이용양상 및 비용에 관한 감시 노력이 부재하다. 건강보험 급여 의사결정의 경우에도 신기술 급여 결정에 평가 노력이 집중되어 있으며 이후 근거 변동에 따른 관리 노력이 부재하다. 여러 나라에서 의료기술평가 보고서는 근거 변동이나 평가 결과에 대한 이견 제시를 반영하여 수정되거나 재평가되고 있다. 신의료기술평가이든 건강보험급여 결정이든 사회에 새롭게 도입된 의료기술이 채택되고 합리적으로 사용되고 있는 지를 모니터링하는 노력이 지금보다 배가될 필요가 있다. 이를 통해 적정 시점에 근거를 고려한 평가가 수행되는 것이 필요하다. 신기술과 기존 기술 간에 비교효과에 대한 자료가 많지 않고 이에 따라 임상에서는 각각의 동기에 맞는 기술을 채택하고 있다. 그 선택이 합리적인지는 알 수 없다. 발달된 신의료기술의 혜택을 위해 자원 배분을 하기 위해서라도 의료기술의 선별 기준, 상대적인 평가 결과, 관련 정보 제공 등의 노력을 통해 합리적 의사결정을 위한 근거 산출에 보다 많은 노력이 기울여져야 한다.
많은 국가에서 의료기술평가 보고서는 평가결과와 근거변동에 따라 바꾸거나 재평가되고 있는데, 우리나라는 신의료기술평가와 건강보험 급여 의사결정 이후 의료기술의 감시와 근거변동에 따른 노력이 부재한 상태인데, 모니터링을 강화하고 근거를 바탕으로 평가가 수행되어야 한다.