제조업을 기반으로 한 고도 성장기의 정책 목표인 범용 인재의 양성과 인력의 저변 확대는 소기의 성과를 거두었다. 그러나 2000년대 이후 과기인재정책은 다양한 측면에서 한계를 보이고 있다. 우수학생들의 이공계 지원 감소로 촉발된 소위 ‘이공계 위기’는 지난 10여 년간 다양한 부문으로 확대되어 지금은 고질적인 사회적 문제로 자리잡았다. 표면적으로는 1997년 외환위기 이후 구조조정 과정에서 드러난 과학기술자의 고용 불안정성과 의약학 또는 전문직과 비교할 때 상대적인 지위 하락이 원인으로 지적되고 있다. 그러나 정부가 2000년대 이후 제시한 이공계 복지정책, 장학정책, 이공계 인력의 전주기적 관리 등 다양한 정책들은 충분한 효과를 거두지 못하였으며 우수 인재의 이공계 기피와 이공계 인력의 이탈은 여전히 지속되고 있다.
2000년대 이후 촉발된 이공계 위기의 원인으로 과학기술자의 고용 불안과 의사 등 전문직과의 지위 차이가 꼽히고 있다. 정부는 이공계 지원을 위한 여러 정책을 시도했지만, 이공계 기피 현상은 여전히 지속되고 있다.