이때 제기되는 이슈는 사축이동과 감염사축에서 발생하는 침출수로 인한 전염병 확산에 대한 우려인데, 침출수 누출을 방지하는 컨테이너 제작은 저수준 기술이며, 농촌 차단방역 및 환경관리 체계 전체 리스크 관리 측면에서 보면 작은 이슈 이다. 예를 들어 일본의 경우 사축을 매몰지로 이동시키는 지침을 제시하고 있다. 또한 가축질병 발생시 사축의 임시저장은 매우 효과적인 방법으로써, 소, 돼지는 파쇄하고 가금류는 그대로 저장하면 사축처분을 경제적으로 효과적으로 실행할 수 있다. 사축저장탱크에서 자연분해 등으로 체적이 감소하는 효과도 있으며, 병원균도 효과적으로 사멸하는 효과도 있다.
한정애안과 양창영안은 등록제를 제안하고, 장하나안과 유럽연합은 허가제·면허제를 도입하지만, 정부는 등록제를 채택한다.