공공연구기관과 기업이 사업화에 있어서 직면하는 가장 큰 장벽은 공공연구기관의 시장에 대한 이해와 기업의 연구성과에 대한 이해 부족이라 할 수 있다. 즉 공공연구기관에 속한 연구자는 학술적 이해와 질문(research question)에 기초하여 R&D를 기획하는 경향이 강한데 반해, 기업은 시장의 니즈, 매출 성장의 가능성 관점에서 R&D를 필요로 한다. 최근 주요 사업화 성공사례로 제시되는 독일의 Fraunhofer 연구소의 Invention-on-Demand, Steinbeis 재단의 시장 중심화, 기업의 문제해결 역량 확보 등을 위한 과제들이 갖는 주요 특징은 시장 수요에 기반한 기술의 발굴과 제공이라는 것이다. 국내에서도 R&D기획에 있어서 시장 수요를 반영하고자 하는 노력, 니즈 기반 발명을 기획하는 노력 등이 추진되고 있으나 여전히 격차가 존재한다. 기업의 경우도 공공연구기관 보유 연구성과에 대한 이해능력, 기업이 갖는 기술 애로사항을 구체적으로 명시할 수 있는 능력에 대한 한계가 지적되고 있다.
공공연구기관과 기업 사이에는 학술적 이해와 질문에 기초한 R&D와 시장의 니즈, 매출 성장의 가능성의 관점에서의 R&D 사이에 격차가 보인다. 독일의 시장 수요 기반 기술의 발굴과 제공의 성공사례도 제시되었지만, 국내는 시장 수요 반영의 노력은 있으나 한계가 지적된다.