국토 확장, 경제적 발전 및 연구의 발전 측면에서 역량을 지닌 지방자치단체는 과감한 대학지구 건설 정책의 실행, 공동 과학 사업의 진행, 자금조달 및 실행에 있어서 CNRS의 없어서는 안 될 파트너이다. 고등교육 연구기관과의 교류 부서는 지방자치단체가 우선하고자 하는 부문에 대해 파트너 협정을 맺기 위해 CNRS의 연구소와 함께 일한다. 지방자치단체의 규모에 따라, 파트너십은 CNRS와 여타 관련기관 및 지방자치단체가 (1) 연구팀의 물질적 인적 수단 강화 (2) 기술 플랫폼 발전 (3) 강한 잠재력을 가진 과학적 부문 창출과 같은 목적을 실행하도록 여러 연구 실험실들을 지원하게 되어 있다.
CNRS의 연구소는 대학지구건설 정책 실행, 공동 과학 사업 진행, 자금조달 및 실행을 위해 지방자치단체가 우선시하는 부문과 관련하여 고등교육 연구기관과 함께 일한다.