한편 대아세안에 대한 수산분야 투자는 과거 원양어업에서 시초를 찾을 수 있었다. 인도네시아를 시작으로 2000년 초반까지 투자액이 증가하였으나 EEZ입어 금지가 확대되면서 수산가공, 양식, 유통분야 등으로 투자가 다양화되었다. 그러나 우리나라의 대아세안 지역에 대한 수산분야 투자는 중소기업 중심으로 이뤄지고 있고, 대기업의 투자 및 현지화는 일부 기업에 한정해 매우 제한적으로 나타나고 있다. 따라서 아세안 현지에서 수산물을 수집하여 국내로 수출하는 사례가 다수를 차지하고 아세안 현지에서 생산하여 역내로 수출하거나 중국, 미국 등 해외 시장으로 진출하는 경우는 매우 제한적이었다. 이는 개별 기업의 단독투자에 따른 소규모 투자, 정보 및 자본 부족에 따라 현지화의 어려움, 아세안 단일 시장을 활용한 투자 연계에 여전히 미흡한 것으로 나타났다.
우리나라의 아세안 지역에 대한 수산분야 투자는 미흡해서 아세안 현지에서 수산물을 수집하여 국내로 수출하는 사례가 많고 아세안 현지에서 생산하여 역내로 수출하거나 해외 시장으로 진출하는 경우는 제한적이다.