또한 최대 쟁점이었던 종합유선방송(SO)과 위성방송 등 뉴미디어정책은 미래창조과학부로 넘어갔지만 이에 대한 허가 및 재허가, 관련 법령을 제·개정하려면 방송통신위원 회의 사전 동의를 얻어야 한다. 방송통신위원회가 사전 동의하지 않을 경우 미래창조과 학부와 방송통신위원회 간의 정쟁(政爭)은 해당사업자의 업무 혼선을 초래할 수도 있다. 주파수 문제의 경우 상황이 더 복잡하다고 지적한다. 통신용 주파수는 미래창조과학 부로 방송용 주파수는 방송통신위원회가 각각 담당하고 신규·회수 주파수의 분배·재배 치는 국무총리실 산하 주파수심의위원회에서 담당하도록 한 결정은 주파수가 한정돼 있다는 점에서 미래창조과학부와 방송통신위원회는 물론 주파수심의위원회까지 가담할 경우 주파수 분쟁 가능성이 높아질 것이기 때문이다.
뉴미디어정책이 허가, 관련 법령을 개정하려면 방송통신위원회의 동의를 얻어야 한다. 특히 주파수는 미래창조과학부, 방송통신위원회, 주파수심의위원회 각각 담당하고 있는 주파수의 분배 문제가 있어 분쟁 가능성이 있다.