사업관리구조는 중요한 국가 경제사회적 문제의 구조화와 이를 구체적으로 해결하기 위한 관리체계의 적합성을 확보해야 한다. 사업관리구조는 문제의 명확한 정의를 위한 문제구조화 과정 관리와 문제해결 과정 관리로 구분해서 볼 수 있다. 전자는 정부 연구개발 사업구조와 관련된 것으로서 국가 경제사회적 중요 문제들을 어떻게 구분하고 어느 수준의 사업단위로 구조화할 것인가 즉, 사업구조의 기획과 관련되어 있으며, 후자는 개별 사업단위에서의 문제정의와 해결과정 관리를 위한 개별사업관리체계와 관련되어 있다. 따라서 문제해결 중심 사업관리를 위해서는 중요 문제의 적정 단위 구조화와 문제해결 과정 관리가 필요하다. 즉, 문제해결 중심으로 전환하기 위해 사업구조는 획일화된 세부사업 중심 구조에서 벗어나 경제사회의 중요한 문제들을 의미 있는 문제단위로 구조화하는 적정 구조화 체계가 마련되어야 하며, 사업의 관리체계는 양적 연구성과 목표관리체계에서 벗어나 문제해결성과 중심의 관리체계로 변화되어야 한다.
사업관리구조는 문제의 구조화와 관리체계의 적합성을 확보해야하며 문제의 정의를 위해 구조화과정 관리와 해결과정 관리로 구분할 수 있다. 명확한 구분을 통해서 문제에 대해 적정 단위 구조화와 해결과정 관리가 필요하며 이를 체계화 하여야 한다.