약학대학 편입준비로 인한 이공계 공동화 현상 및 전공심화과정이 어려우며, 장기적으로 볼 때 이공계에 심각한 영향을 미치고 있다. 화학․생물 등 우수인력의 중도탈락으로 기초과학의 붕괴가 우려된다. 2017년 교육부의 분석에 따르면 약학대학 편입학으로 인한 자퇴생이 입학정원의 20% 이상인 학과는 15교 31개학과 모두 화학․생물계열에서 나왔다. 약학대학 편입생 수가 가장 많은 수도권주요대학과 지역거점 국립대를 포함한 6개 자연과학대학의 경우 많게는 100명이 약학대학으로 편입하고 있다. 지방 거점 국립대의 경우에도 2017년 평균 50여명의 학생이 자연과대학에서 약학대학으로 편입하였고 특히, 생물학, 화학전공 학생들이 편입 합격 학생들의 90% 이상을 차지한다.
약학대학 편입준비로 이공계 공동화 현상 및 전공심화과정이 어려우며, 우수인력의 중도탈락으로 인한 기초과학의 붕괴로 이공계에 심각한 영향을 미치고 있다.