세 번째 단계로 분리의 원칙에 따라 기업은 기존의 사업조직과 기업벤처링 프로그램을 분리해야 한다. 기존의 사업조직과 기업 벤처링 프로그램을 분리하기 위해서 먼저 기업벤처링 프로그램은 프로세스 선택과 프로젝트 검사가 필요하며 사업계획은 정량적 평가로 평가되어져야 한다. 둘째, 기업벤처링 프로그램 하의 프로젝트는 기업으로부터 자금관리가 이루어져야 한다. 독립형 벤처캐피탈 모델에 따르면, 기업의 신규벤처 자금지원은 단계적으로 이루어진다. 프로젝트 초기단계에서 기업은 소규모 투자를 하며 추후 투자여부는 선택사항이다. 이 단계에서 자금 지원과 관리 여부에 따라 불확실성이 높은 상황에서 프로젝트를 채택할 것인지 포기할 것인지를 선택한다. 셋째, 기업벤처링 프로그램은 조직적 프로세스, 유연성, 기업가정신 등을 포옹하는 문화를 사용해야한다.
분리의 원칙에 따라 기업은 기존의 사업조직과 기업벤처링 프로그램을 분리해야 하고,  프로젝트는 기업으로부터 자금관리가 이루어져야 하며, 조직적 프로세스, 유연성, 기업가정신 등을 포옹하는 문화를 사용해야한다. 