국가 R&D 재정 투자의 문제점을 정확히 진단하고 이를 해결하기 위한 방안의 모색이 시급한 시점이다. 이 연구에서는 국가 R&D 재정의 구조적인 문제점을 진단하고 이의 개선 방안을 모색하고자 한다. 문제 진단 및 해결방안 모색을 위한 틀로서 R&D 재정의 생산성에 영향을 미치는 요인들을 크게 세 가지 범주로 설정하였다. 첫째는 R&D 조직화로써, R&D 사업구조를 설계하고 이를 국가적으로 관리하기 위한 거버넌스 체계를 구축하는 문제이다. 둘째는 연구 몰입 환경으로써, 연구자들의 동기부여와 평가제도에 관한 문제이다. R&D 조직화와 연구 몰입 환경은 R&D 생산성의 기반적 요인들로 간주된다. 셋째는 정부 R&D 전략으로써, 민간의 혁신 기회 확대 및 혁신 비용 절감을 통해 어떻게 민간 R&D 투자 활성화할 것인가 하는 문제이다.
R&D 재무 투자의 구조적 난점을 파악하고 이를 타개하기 위한 방법의 강구가 중요하다. 생산성에 영향을 주는 원인은 크게 R&D 체계화(시스템 확립), 조사집중환경(동기부여, 평가), R&D 전술(투자 활성화) 3가지다.