그리고 많은 경우에 시뮬레이션 결과의 검증이 어렵다는 이슈가 존재한다. 많은 경우에 시뮬레이션을 통해서 연구하고 싶어 하는 현상이 현실에서 존재는 하지만, 결과 검증을 위한 실증적 데이터가 없다. 예를 들어, 신기술이 특정 시스템 혹은 사회에서 확산되어 가는 과정을 행위자기반모형으로 연구하는 경우, 해당 신기술이 확산되는 현상은 현실에서 관찰이 가능하기는 하지만, 실제로 그 기술이 어떻게 확산되었는지에 대한 데이터를 구하기는 쉽지 않다. 뿐만 아니라, 어떠한 경우에는 행위자기반모형을 가지고 연구하려는 현상이 실제 하지 않는 경우도 있다. 재난 예측 연구가 그러한 경우이다. 예를 들어, 특정 지역에 지진이 발생한다면 어떠한 일들이 일어날 수 있는지에 대해 시뮬레이션 연구를 하고자 하는 경우, 해당 지역에 실제로 지진이 발생하지 않았기 때문에 시뮬레이션의 결과를 검증하기 어렵다.
다수의 상황에서 시뮬레이션을 이용하여 연구하고 싶은 현상이 있지만 결과 검증을 위해 필요한 실증적 데이터가 부재하다. 또한 행위자기반모형을 토대로 연구하려는 현상이 실존하지 않을때도 있다. 