MSRI는 대부분의 운영비를 NSF로부터 받지만, MSRI에서 개최하는 여름 세미나에 참석하는 100여개의 대학으로부터도 운영비를 지원받으며, 이 대학들은 MSRI의 거버넌스 과정에 참여할 수 있다. 미국 국가안보국(NSA)와 슬론재단(Sloan Foundation) 및 마이크로소프트, IBM 등 수리과학 연구와 관련된 정부, 공공기관 및 사기업으로부터도 적극적으로 연구비를 수혜받고 있다. MSRI는 산업수학보다는 보다 폭넓은 의미의 수리과학 전체를 포괄하는 연구소지만, 실제 연구의 내용은 산업수학에 가까운 부분이 많다. 예를 들면, 기후변화(climate change)의 연구에 관한 연구 세미나를 지속적으로 개최하고 있으며, 시스템 생물학, 암호학 등 인접 분야로의 확장을 꾀하고 있다.
여러 기관의 후원을 받는 MSRI는 광의적 의미로 수리과학 전체를 다루는 연구소지만 산업수학에 적합한 주제를 많이 다룬다. 예를 들어, 기후변화나 시스템 생물학 등의 근접 분야로 나아가 적극적 연구를 한다.