학계와 산업계의 문제의식과 요구를 대폭 반영한 유전공학육성법은 시행 초기 어려움을 겪기도 했다. 각 부처별로 연도별 기본계획이 수립되는 데 시간이 걸렸으며, 유전공학정책심의회의 및 산하 실무추진위원회도 원활히 운영되지 못했다. 또한 국내에서 생산이 불가능한 시약과 자재를 수입하는 데에 적용되는 수입관세 및 부가가치세 감면도 잘 시행되지 않았다. 그렇지만 10여년이 지난 1994년 과학기술처가 유전공학육성법을 근거로 ‘생명공학육성기본계획’을 수립하고 이듬해 유전공학육성법을 ‘생명공학육성법’으로 명칭 변경하면서, 유전공학(혹은 생명공학)에 대한 적극적인 정책을 전개했다.
시행초기 유전공학육성법은 어려움을 겪었다. 그러나  10년이 지난 1994년 생명공학육성법으로 명칭을 변경하면서  적극적인 유전공학 정책을 전개했다.