이에 따라 2006년부터 실시된 제5차 국가산림자원조사는 새로운 체계에 의해 실시되고 있다. 제5차 국가산림자원조사가 이전 조사와 다른 특징적인 차이는 다양한 산림자원조사 항목들이 포함되어 있다는 점이다. 이는 산림에 대한 국내외의 다양한 정보요구를 충족시킬 수 있는 기반을 마련하였다는 점에서 큰 의미를 갖는다. 또한 새로운 산림자원조사체계에서는 전국을 4km×4km 격자로 나눈 후 그 교차점에 그림 1과 같이 4개의 표본점을 집락으로 배치하는 계통적 집락추출법을 채택하고 있으며, 전국을 대상으로 매년 20%씩의 집락에 대한 일제조사를 실시하고 있다. 이와 같은 표본조사 방법은 대부분의 임업 선진국에서 채택하고 있는 방법이지만, 연년 산림통계를 산출하기 위해서는 특정시점을 기준으로 조사 자료를 갱신하여 표준화된 산림통계를 산출할 필요가 있다. 또한 계통적 집락추출법으로 산림통계를 산출할 경우 면적이 작은 시군구에는 배정된 표본점의 개수가 적기 때문에 현실적으로 산림통계를 산출하는데 어려움이 있다. 결과적으로 표본점의 개수가 작은 소면적(小面積) 시군구의 연년 산림통계를 어떻게 산출하는 것이 합리적인 방법이냐 하는 것이 현재의 산림자원조사 체계에서 해결하여야 할 과제이다. 한편 우리나라가 가입하고 있는 국제기구에서는 다양한 연년 국가 산림통계를 요구하고 있으며, 또한 산림통계 산출을 위한 표본조사 방법이 달라질 경우 이전 산림통계의 재계산(recalculation)을 요구하고 있다. 우리나라의 경우 제4차 국가산림자원조사에서는 임상에 의한 층화집락추출법으로 산림통계를 산출하였지만, 제5차에서는 계통적 집락추출법을 사용하기 때문에 표본조사 방법의 차이에 의해 산출되는 산림통계에 차이가 있을 것으로 예상된다. 따라서 변경된 표본조사 방법에 의한 국가 산림통계의 차이를 양적으로 평가한 후, 그 원인을 구명함과 동시에 국가 산림통계의 일관된 보고를 위해 이전 산림통계를 재계산할 필요가 있다.
제5차 국가산림자원조사에서는 층화집락추출법을 사용한 이전과는 다르게 많은 선진 임업국에서 적용하는 있는 계통적 집락추출법을 사용하여 산림 통계를 작성하였다. 그로 인해 매해 다양한 국가 산림통계를 요구하는 국제기구에 통계 자료를 다시 작성하여 제출해야 한다. 따라서 이러한 통계의 차이를 극복하고 배정 표준점의 개수가 적어 어려움을 겪는 소규모 행정단위 지역의 산림통계 산출 문제를 해결하기 위하여 현실을 감안한 합리적인 방법으로 산림통계 작성 체계를 다시 정립할 필요가 있다. 