평가 주체는 온타리오주의 경우 온타리오 보건의료질관리원(Health Quality Ontario, 이하 HQO)이라고 하는 비정부기관에서 수행하고 있다. HQO는 2010년 설립되어 의료기기는 물론 전반적인 서비스, 시스템까지 양질의 서비스를 제공하기 위해 품질을 평가하고 근거자료 및 권고안을 만드는 역할을 한다. 앨버타주의 경우 주정부 예산이 소요되는 공공서비스에 대한 평가가 필요하다는 전문가 자문단의 의견에 따라 앨버타의료기술평가사업(The Alberta Health Technologies Decision Process)을 통해 수행하고 있다. 브리티시컬럼비아주는 보건부가 직접 의료기술평가를 담당한다.
의료기술평가는 주마다 다르게 시행된다. 온타리오주는 비정부기관인 보건의료질관리원, 앨버타주는 주정부 예산을 통한 앨버타의료기술평가사업, 브리티시컬럼비아주는 보건부가 직접 담당한다.