외연확장기 (1990년-2000년)에는 제도적으로 공공기관에 과학기술 국제협력 사업을 위탁하여 추진하기 시작하였다. 이는 북방국가, 특히 러시아와의 국제협력을 추진하기 시작하면서 기존의 정부 조직만으로 과학기술 국제협력 업무를 수행하기에는 전문성 면이나 인력 측면에서 효과적으로 대응하기가 곤란해졌기 때문이다. 따라서 1994년 과학기술정책관리연구소에 과학기술국제협력센터를 설치하고, 이 조직에 과학기술 국제협력 업무를 위탁하였다. 정부 내 조직만으로 추진되던 과학기술 국제협력을 위탁했다는 점은 기존과는 다른 새로운 변화라고 볼 수 있다. 협력 프로그램은 공동 연구형 사업들이 계속해서 추진되고 국제협력기반조성사업은 1960년대 후반 이래 추진되었던 해외 과학기술 정보수집이나 국제 과학기술네트워크 참여 사업들과는 달리 해외 현지에 사무실을 개소하고, 공동연구센터를 설립하는 등 우리나라의 과학기술 국제협력을 활성화하기 위한 최초의 본격적 기반 구축형 사업이라 할 수 있다 (박세인, 2010)
외연확장기에 공공기관에 과학기술에 대한 국제협력 사업을 위탁했다. 러시아와의 국제협력에서 기존 정부 조직으로는 곤란했기 때문이다. 과학기술국제협력센터를 설립하여 위탁했는데 기존과는 다른 변화였다. 해외에 사무실을 열고 공동연구센터를 만드는 등 국제협력을 위한 사업이다.