다섯째, 독일 대학의 학위과정을 운영하는 연구소, 특히 공학분야 연구소가 원활히 운영되기 위해서는 연구원의 급여와 연구비용이 함께 마련되어야 한다. 정부에서 대학을 통해 직접 지급하는 소위 국가직(Ladesstelle) 자금은 교수를 비롯한 일부 학생의 인건비를 충당하는 데 그치므로, 그 주요 재원은 관련 정부 및 공공기관의 연구개발펀드나 기업의 펀드가 되는 경우가 많다. 이러한 상황과 산학협력 연구개발시스템의 활성화는 독일의 연구개발시스템에서 대학이 차지하는 주요한 역할이 기초연구가 아니라 응용연구의 수행이 되도록 만들고 있다. 연구개발을 수행하되 기업 등 수요처가 실제 활용할 목적으로 학생이 아니라 연구원을 고용하여 수행하여야 하는 것이다.
독일 대학의 연구소의 운영자금은 연구개발 펀드에서 나온다. 이로 인해 대학이 응용연구의 장이 되고 있다. 연구개발목적이 기술활용이 아닌 연구 자체가 되려면 연구원 급여 및 비용지원책이 필요하다.