맥류 붉은곰팡이병은 기상 조건에 따라서 병 발생에 차이가 크다. 보리나 밀 이삭이 패는 시기부터 여물기 전 까지 비가 잦고 3∼5일 동안 습도가 95% 이상 지속되면 병이 급속히 퍼질 수 있다. 지역, 품종에 따라 맥류의 생육 상황이 달라지기 때문에 약제 살포 시기도 달라질 수 있으나 이삭이 패기 직전이나 팬 후 병 발생이 우려되는 기상조건에서는적용약제를 안전 사용 기준에 맞추어 10일 간격으로 2∼3회 뿌려주어야 한다. 붉은곰팡이병 방제는 적기를 놓치지 않는 것이 중요하므로 비가 지속적으로 올 때는 잠시 비가 갠 때 약제를 뿌린다. 적용 약제로는 캡탄수화제, 트리플록시스트로빈입상수화제, 디페노코나졸·프로피코나졸유제가 등록되어 있다. 약제는 수확 21일 전까지만 사용해야 한다.
맥류 붉은곰팡이병은 기상 조건에 따라 발생 차가 크지만 이삭 패기 직전, 직후 기상조건을 살펴 10일 간격 2-3회 적용약제를 뿌려야 한다. 비가 갠 뒤 약제를 뿌리며 수확 21일 전까지만 해야 한다.