뇌전증의 진료비와 관련하여 2000년대 중반부터 환자들의 부담을 경감해주는 정책들이 시행되었다. 2005년 1월부로는 뇌전증에 대해 MRI 검사시 건강보험을 적용하여, 환자들이 관행적으로 지불하던 비용의 상당부분이 종합병원 기준 기존 관행수가 345,116원에서 환자본인부담 약 200,201만원으로 감소되었다. 2005년 8월 1일부로는 뇌전증질병발생부위 확인을 위한 미세전극도관(카테터)에 대해 환자부담을 약 40만원에서 8만원으로 감소시키는 정책이 시행되었다. 2006년부터는 G41.이 희귀난치성 질환으로 신규등록되어 본인부담이 10%로 경감되었다. 2006년 6월부터는 뇌전증 환자가 수술 전 질병 부위 확인을 위해 PET 촬영을 한 경우 환자부담이 100만원에서 약 37만원으로 감소되었다.
뇌전증 치료비 부담을 줄이기 위해 MRI 검사를 건강보험에 적용하였으며 미세전극도관 시술비의 부담을 75% 감축시키는 정책이 시행되었다. 또한 G41이 희귀난치성 질환으로 분류되어 부담이 크게 줄었다.