하지만 이러한 선행연구는 국내 HIV 감염인의 의료차별 상황을 체계적으로 규명하기에는 한계가 있었다. 첫째, 연구의 대표성을 확보하는데 어려움이 많았다. 2000년 이 후 약제의 발달로 인하여 HIV 감염이 만성화 되면서 AIDS 상태의 감염인들이 급감하였고, 그 결과 전체 HIV 감염인 대상 연구의 경우 의료차별의 경험이 없는 HIV 감염인도 연구에 포함될 수밖에 없었다. 일반적인 의료인 대상 연구 역시 유사한 문제점이 있었다. 국내 감염인의 수는 아직도 1만명 수준이다. 전체 인구 집단에 비하면 대단히 적은 수이다. 그 결과 일반적인 의료인 대상 연구의 경우 HIV 감염인에 대한 진료 경험이 없는 의료인들이 연구에 포함될 수밖에 없었다.
국내 HIV 감염인에 관한 선행연구는 의료차별을 받아보지 못한 HIV 감염인이 연구에 포함 되었으며, HIV 감염인의 진료 경험이 없는 의료진이 연구에 포함 되었다는 한계가 있었다. 