한편, 지수측정 방법론의 기본원칙은 온실가스 감축이며, 사회·경제적 편익 및 환경적 영향을 보완원칙으로 제시하였다(산림청, 2013). 앞서 분류한 산림탄소사업의 공편익 유형에 부합하는 평가기준은 보완원칙에 포함되는 ‘인간’과 ‘자연’이다. 다만 환경적 영향(자연)의 세부기준들 중 비영속성 처리 및 누출 처리는 상쇄사업 효과의 지속성 및 효율성과 관련된 항목이기 때문에 보완원칙보다는 기본원칙에 부합하며, 감축효과 외 효과를 나타내는 공편익과는 무관한 세부기준으로 판단된다. 탄소흡수원 지수 방법론에서 제시한 세부기준별 평가 지표 및 산출방법을 <표 4-17>과 같이 재구성하였다.
산림탄소사업의 공편익 유형과 달리 지수 방법론의 비영속성 및 누출 처리는 상쇄사업 효과 지속성 등의 관련 항목이기에, 보완원칙보다는 온실가스 감축이라는 기본원칙에 부합한다.