그럼에도 불구하고 향후 중국·ASEAN 간 협상에는 많은 난관이 존재하고 있다. 첫째, 양측 간 채택된 CoC의 기본 틀이 기존의 DoC와 특별히 다른 점이 없다는 점이다. 따라서 미국, 일본, 호주 등 일부 역외 ASEAN 대화 상대국들은 우려를 표시하고 있다. 둘째, 중국은 비공식적으로 CoC의 법적 구속력에 유보적 태도를 보이고 있으며, 이를 지지하는 캄보디아 등 일부 친중 국가들과 베트남 등 핵심 당사국들 간에 이견이 계속 노출되고 있다. 셋째, 중국은 CoC 협상의 공식 개시가 역내에서 외부 세력의 간섭이 없는 안정적인 상황 하에서만 가능하다는 입장을 취하고 있기 때문에, 실질적인 공식 협상의 개시는 자동적이지 않으며 중국의 의향에 따라 결정될 수밖에 없는 구조이다. 따라서 향후 언제 어떻게 협상이 공식적으로 개시될지 예상할 수 없는 불확실성이 존재한다.
향후 중국·ASEAN 간 협상에는 많은 난관이 있을 것이다. CoC의 기본 틀이 기존과 다른 점이 없고, 중국은 CoC의 법적 구속력에 유보적 태도를 보이며,  CoC 협상 개시는 중국의 의향에 따라 결정되는 구조이기 때문이다.