폰다파리눅스는 약제 자체로는 억제가 불가능하며 항트롬핀과 결합을 할때 억제 효과를 보이는 제10a인자 간접억제제이다. 폰다파리눅스는 새로운 합성 항트롬핀 물질계열의 첫 물질로 제10a인자의 선택적 억제제이다(유명철, 2010). 폰다파리눅스는 피하 주사의 형태로 투여하며 이는 용향에 상관없이 빠르고 완전하게 인체에 흡수되며 높은 생체 이용률을 보인다. 하루에 한번 2.5mg씩 피하 주사의 형태로 투여하며 수술 6-8시간 후 또는 수술 다음날 아침부터 투여를 시작하여 10일간 투여한다. 인공 고관절 수술 이후에는 14일까지 투여 가능하다(Fisher, 2011). 폰다파리눅스는 주로 정형외과 수술에서 정맥혈전색전증 예방으로 지시되기 때문에 다른 환자군보다도 정형외과 수술 환자를 대상으로 연구가 많이 진행되었다. 그럼에도 불구하고 폰다파리눅스는 다른 약물에 비해 출혈 증가의 가능성이 있어 그 사용이 한정적이다. 출혈 위험으로 50kg 이하 환자에게는 금기되어 있고 노인(65세 이상) 환자에게는 사용시 주의를 당부하는 안내문을 포함하고 있다(Deitelzwig, 2008). 또한 폰다파리눅스가 다른 약에 비해 채택되는 속도가 느린 추가적인 이유로는 긴 반감기, 신부전 환자에게 금기시, 가역성 부재 등이 있다(유명철, 2010).
폰다파리눅스는 제10a인자의 선택적 억제제로, 주로 정형외과 수술에서 정맥혈전색전증 예방용으로 사용된다. 그러나 출혈 증가, 긴 반감기, 신부전 환자에 사용불가, 가역성 부재  등의 부작용이 우려된다.