정부의 연구개발 투자 방향으로 제시된 요소 중 가장 기본적이면서 중요한 것이 정부 연구개발 투자 효율성이다. 최근 우리나라 정부 연구개발 생산성은 미국의 1/3 수준에 불과하며, 과거에 비해 더 하락하고 있다. 이것은 정부 연구개발사업의 성과가 효율적, 효과적으로 창출되지 못하고 있음을 의미한다. 특히 최근 혁신 환경 변화를 고려할 때 정부 연구개발 성과가 높지 못하다는 것은 창의적인 지식 가치에 기반한 국가 경쟁력 창출력이 낮다는 것을 의미한다. 이러한 상황은 앞으로 신성장동력의 확보와 창의와 혁신에 기반을 둔 신산업․신시장 창출과 이를 통한 경제성장, 선진 국가로 안착하기 위한 국가 발전전략 측면에서도 중요한 문제이다. 따라서 정부 연구개발 생산성 제고를 위한 정책적 노력과 제도 개선이 대단히 중요하다.
우리나라 정부 연구 개발성이 미국의 1/3 수준이라는 것은 정부의 연구개발 투자효율성이 가장 중요함에도 불구하고 성과가 효과적으로 창출되지 못한다는 것을 말한다. 따라서 생산성 제고를 위한 개선이 필요하다. 