메르스는 아직 백신 및 치료제가 없어 감염이 되지 않게 예방을 하는 것이 가장 중요하다. 특히 고위험군으로 알려진 고령, 특히 당뇨, 고혈압 등 기저질환이 있는 사람의 경우 중동지역 여행 시 낙타 접촉, 호흡기 증상자 접촉 등에 대한 주의가 필요하고,항상 손 씻기 등 개인위생 준수가 요구되고, 호흡기 증상이 있을 시 마스크를 착용하여야 한다[2]. 또한 질병관리본부에서는 중동지역 여행 후 14일 이내에 발열, 기침, 호흡곤란 등 증상이 있을 시에 질병관리본부 콜센터 1339를 통해 신고를 당부하여 환자를 조기에 발견하고 신속히 대응할 수 있도록 힘쓰고 있으며 그로 인한 대규모 발생을 사전 예방하기 위해 메르스 감시체계를 강화해 운영하고 있다.
백신과 치료제가 없는 메르스는 예방이 가장 중요하므로, 중동지역 여행주의와 더불어 개인위생과 마스크 착용이 우선이다. 중동지역 방문후 증상이 있을때는 1399 콜센터에 신고해야 한다.