본 연구는 기술규제에 거래비용을 적용한 기초연구로서 몇 가지 한계점 역시 가지고 있다. 첫째, 거래비용이론과 주인․대리인이론을 통해 기술규제의 비용추정을 위한 이론적 접근을 실시함에 있어 실제 작동하는 기술규제의 강도, 관련 기술의 이용도 등을 충분히 고려하지 못하였다. 둘째, 확고한 기술규제가 작동하고 있는 LED 조명산업을 주요 분석대상으로 삼았다는 점에서 기술규제가 막 태동하고 있거나 실제 기술규제가 작동하지 않는 영역에 대한 접근에는 한계를 지니고 있다. 이로 인하여 실제 기술규제가 확고히 자리 잡지 않은 분야에 본 연구의 결과를 적용할 경우 외적 타당성에 제약이 존재할 수밖에 없다. 마지막으로 심층면담조사와 기업설문조사 방법을 사용하여 거래비용을 도출하였다는 것을 한계점으로 들고자 한다. 실제 기업의 비용 관련 지출자료를 확보함에 있어 존재하는 한계로 인해 면담조사와 기업 설문을 활용할 수밖에 없었다는 것은 자료의 객관성에 있어 한계로 작용할 수밖에 없다.
기술규제에 거래비용을 적용한 기초연구로서 본 연구는 이론적 접근의 실시로 실제 작동하는 기술규제의 강도와 이용도를 간과하고, 분석대상이 아닌 기술규제가 작동하지 않는 영역의 적용에는 한계가 있고, 거래비용자료의 객관성이 떨어지는 한계점을 지녔다.