그간의 성과평가지표를 보면, 사업에 따라 약간의 차이를 지니고 있지만, 사업별간이 체계성 차이는 크지 않았다. R&D사업의 궁극적 달성목표와 사업체계 개편 논리를 고려한 성과평가지표의 개발이 필요한 시점이라 할 수 있다. 기존에 관리되고 있는 평가지표는 계량적으로 산출하기 쉬운 평가지표에 대해서는 단순히 적용 가능한 요소들을 반영한 정량적 관리가 이루어 지는데, 이는 성과의 질적 가치를 평가하는데 한계가 있다. 현 평가지표를 SMART 평가기준을 적용하여 평가한 결과, 측정가능성, 인과성은 보통 이상으로 높은 점수가 나타났지만, 시기적 적절성과 사업특성 반영 여부에서 개선 필요성이 있는 것으로 나타났다(김종운, 2013). 사업특성 반영이 낮게 나타난 것은 사업의 목적과 사업의 내용, 성과지표의 연계성이 부족함에 기인한다(김종운, 2013).
그동안의 성과평가지표를 보면 새로운 지표를 개발해야한다. 현재 지표는 정량적 관리로인해 질적 가치평가에는 한계가 있다. SMART평가에서는 높은점수지만 목적, 내용, 지표간의 연관성 부족으로인해 개선의 필요성이 보여졌다.