2016년 9월 8일 발표된 ‘보건산업종합발전전략’에 따르면, 정부는 “신약개발에 대해 국내 수행 임상3상 시험까지 신 성장동력·원천기술 R&D 세액공제를 적용” 하고, 의약품 품질관리 개선을 위한 시설 투자에도 세액공제를 일몰 연장(’16. 12. 31.⟶’19. 12. 31.)하고, 개발신약의 생산을 위한 시설투자에 대해 중견기업은 8%, 대기업은 7% 세액공제하기로 결정하여 기업에 대한 세제 혜택이 최근 크게 증가하고 있다(국가정책조정회의, 2016: 17). 하지만, 중견기업 이상인 기업들의 법인세 인하 요구는 여전히 높은 상황이다. 전국경제인연합회(2016:4)는 바이오제약 분야의 경우 아일랜드(12.5%), 싱가포르(17%)와 비교하여 한국은 법인세율(22%)이 높고, 상대적으로 제도, 인프라가 미흡하다고 분석한 바있다.
16년도에 발표된 '보건산업종합발전전략'은 정부의 기업에 대한 세제 혜택이 크게 증가하고 있으나 여전히 중견 이상 기업의 법인세 인하에 대한 높은 요구가 나타나며 상대적으로 인프라가 부족하다고 분석했다.