그리고 1991년에 채택된 환경 보호에 관한 남극 조약 의정서도 상세한 환경영향평가 절차를 규정하고 있다. 이 의정서는 남극 조약 지역에서 모든 활동(관광 및 다른 모든 정부･비정부 활동)의 계획을 실시하기 전에 각 국이 환경에 미치는 영향을 검토하는 초기 절차를 실시하고 환경영향의 크기에 따라 초기 환경 평가나 포괄적인 환경 평가 실시를 요구하고 있다. 특히 포괄적인 환경영향평가서안은 의견을 요구하고 공개함과 동시에 모든 체결 국가로 보내야만 한다(또한, 앞에서 서술한 70항과 같이 이 의정서를 비준함에 따라 일본에서는 ‘남극지역 환경보호에 관한 법률(1997년 법률 61호)’에 따라 그 내용이 국내법화 되고 있다.).
1991년에 채택된 남극 조약 의정서는 남극 조약 지역에서 행하는 활동에 앞서, 환경에 미치는 영향을 검토하고 포괄적으로 환경 평가를 실시해야한다고 한다. 