두 번째로 검토해야 할 것은 기초과학 혹은 기초연구에 대한 추진전략이다. 정부 R&D 예산중에서 기초과학 혹은 기초연구에 대한 투자 비율을 증가시키는 것이 좋은지 아니면 축소시키는 것이 좋은지에 대한 문제는 보는 관점에 따라 논란의 여지가 많다. 분명한 것은 기초과학 및 기초연구를 통해 혁신의 싹을 발굴할 가능성은 유효하다는 것이다. 기술혁신의 싹은 의외의 곳에서 나올 수 있는 가능성이 크기 때문에 특정 분야에 집중하는 기초연구 전략은 위험이 크다. 따라서 현재 특정 기술테마를 설정해서 집중적으로 연구비를 투자하는 전략보다는 규모를 작게 하여 널리 씨앗을 뿌리는 풀뿌리 전략으로 추진하는 것이 바람직하다.
기초과학 및 기초연구 전반에 투자하면 기술혁신의 싹을 발굴하고 키울 수 있다.