한국은 정치 구조, 원자력발전소 건설을 결정하는 의사결정방식, 원자력산업에서의 국가의 역할, 체르노빌 원전사고의 영향 등에서 독일과 뚜렷한 차이를 보인다. 한국은 정부의 일관된 원자력 육성정책을 통해 원자력발전소를 확대하고 제3 세대 원전을 개발하고 원전 수출국가가 되었다. 중앙 집중적인 계획을 통해 단기간에 원자력산업이 발전했다는 측면에서 원자력행정의 계획 합리성을 보여준다. 그러나 이 계획 합리성의 이면에는 거대 발전소에 기초한 공급 위주 전력시스템의 고착, 재생가능에너지 발전 저해, 원전의 특정 지역 집중에 따른 지역 간 전력수급 불균형 심화 등의 계획 비합리성도 내재되어 있다. 무엇보다 원자력행정이 원자력발전소 건설에 집중된 반면 방사성폐기물 처분 프로젝트는 지속적으로 연기되었다는 사실에서 원자력행정의 비합리성이 드러난다. 독일에서 가장 오랜 기간 원자력 문제의 갈등을 일으킨 이슈는 방사성폐기물 처분 프로젝트였다. 특히 최종처분장 프로젝트는 1970년대 후반에 당시 동서독 접경지역인 고아레벤에서 착수되었으나 30년 이상 사회적 갈등을 겪고 2013년에 결국 종결되었다. 독일은 최종처분장 부지선정에 대한 기술적 기준과 사회적 합의에 관한 법적 근거를 마련하고 이에 따라 2031년까지 후보지를 선정하기로 결정했다.
한국은 독일과 비교했을 때 중앙 집중적 계획으로 단기간에 원자력 산업의 발전을 이루어 원자력 행정의 합리성을 보여 주는 반면, 방사성폐기물 처분 프로젝트의 연기 등 원자력 행정의 비합리성이 드러나기도 한다.