신산업유망기술개발사업에는 생물기술이나 신소재와 같이 과학과 기술 간의 경계가 뚜렷하지 않은 기술 분야와 파급효과가 매우 큰 통신, 전자부품, 신소재 등이 포함 되었다. 산업고도화촉진기술개발사업에는 기존 주력산업의 고부가가치화를 도출할 수 있는 산업들이 포함되었다. 구체적으로는 공급체인 상 수직적 분업관계가 뚜렷한 자동차‧조선‧기계분야 및 컴퓨터 시스템, 기술기반이 취약한 정밀화학, 환경 분야, 산업 고도화를 위한 신기술개발이 요구되는 섬유, 전기전자기기 분야들이 선정되었다. 공통 핵심기술개발사업은 중소기업 기술혁신지원과 기술이전 지원으로 구분되어 산업이나 기술 분야에 관계없이 지원하는 정책으로 기획되었다.
신산업유망기술개발사업은 과학과 기술의 경계가 모호한 분야 및 신소재 등을 포괄하며 산업고도화촉진기술개발사업은 고부가가치 사업 위주로 기존의 자동차,조선,화학 등이 포괄된다.