보건복지부의 Pharmaceutical Benefits Division 4개의 branches 중 하나인 PEB(Pharmaceutical Evaluation Branch)는 PBS 프로그램 운영을 담당하고 있다. PEB는 PBAC 사무국, PBAC sub-committee, PBPA 사무국을 지원한다. PEB는 약 80명 규모로 2009-10년 PBAC 등재 절차를 운영하는 비용으로 약 US$ 10million을 지출하였다(Lopert, 2009). PEB 소속으로 PES(Pharmaceutical Evaluation Sector)는 ESC 사무국 역할을 담당한다. 제약사에서 제출한 경제성 평가 자료를 ESC에 제출하기 전 사전 검토하는 역할을 수행하고, 연구결과를 평가하기 위해 외부 대학과 계약체결을 담당하고 있다. 모내쉬, 뉴캐슬, 퀸즈랜드 대학에 경제성 평가 검토 그룹이 구성되어 있다. 이 그룹들은 PES와 계약을 통해 제약사가 제출한 경제성 평가에 사용한 자료, 평가 방법론의 적절성 측면에서 검토하고 나아가 제시된 방법에 따라 평가과정을 그대로 반복함으로써 분석과정이 기술된 대로 정확히 이루어졌는지를 평가하는 역할을 한다. 다시 말해 PBAC은 근거의 생산자라기보다는 이용자로 PBS 등재를 위해 지원하는 위원회에 제출되는 근거는 제약사에 의해 준비되고 신청서류에 대한 세부적인 검토는 보건복지부를 대신하여 개별적인 계약체결을 통해 연구기관의 네트워크에 의해 이루어진다(Lopert, 2009).
PEB는 보건복지부의 사업으로, PBS 프로그램 운영을 맡고 관련 사무국을 지원한다. PES는 이에 속하여 ESC 사무국 역할을 한다. 이들은 주로 경제성 평가 자료 검토, 외부 대학과의 계약을 체결한다. 대학들은 이를 기반으로 관련 자료를 검토하고 분석과정의 평가를 진행한다. 이들을 통해 보건복지부의 역할을 대신하고 있다.