일반적으로 조제는 세척, 건조, 정선의 과정을 거치게 된다. 세척은 건조처리에 앞서 채취된 생약을 씻어서 이물질을 제거한 뒤 순도를 높이는 과정으로 청결한 물을 사용하여 생산물의 고유 함유성분의 용출, 변화가 없도록 온도와 세척시간을 조절해야 한다. 이때 물에 오랫동안 두면 수용성 유효성분이 녹아 나오거나 분해될 우려가 있으므로 짧게 할수록 좋다. 최근 개발된 고압분사 세척기를 이용하면 물세척이나 와류*세척에 비해 잔존 균수를 줄일 수 있어 미생물에 대한 안전성을 크게 높일 수 있다. 건조는 생약의 효소작용, 미생물 또는 곰팡이 발생 등 오염으로 인한 품질 저하를 막기 위해 필요한 과정으로 제조 과정 중 가장 중요하다. 건조할 때에는 공기가 충분히 통하도록 하여야 하며, 유해가스 발생 열원의 사용 금지, 건조온도 준수 등 주의가 필요하다. 자연 건조는 식물특성에 따라 햇볕이나 그늘에서 실시하되 공기가 충분히 통하도록 건조대 간격을 조절하여 변질을 방지한다. 건조기 건조는 약재의 부위와 성분함량을 고려하여 건조조건(온도, 시간 등)을 선택한 뒤 성분의 손실이나 변화가 없도록 건조한다. 이때 별도 규정이 없는한 유효성분의 변질을 막기 위해 60℃ 이하의 온도에서 건조한다.
조제의 세 과정인 세척, 건조, 정선 중 세척은 생약을 씻어 순도를 높이는 과정이다. 이때 깨끗한 물로 단시간에 세척하는 것이 좋다. 건조는 약재의 변질을 막는 가장 중요한 과정으로, 통풍에 주의하여 약재의 특성에 맞게 햇빛과 온도, 시간 등을 조절한다.