생명윤리법에 익명화가 규정되어 있긴 하지만, 여전히 연구자들에게는 모호하거나 동의하기 힘든 부분이 있다. 한 전문가는 익명화를 해야 한다는 사실은 인지하고 있지만, 익명화의 대상, 방법, 정도에 대해 구체적인 규정이 없다고 지적한다(전문가 A, 2014.9.24. 회의 중 발언내용). 또한 일각에서는 연구를 진행하는 과정에서 환자의 개인식별정보가 반드시 필요한 경우들이 있는데 모든 연구에 대해 익명화를 요구하는 것은 무리라는 지적도 제기된다. 이러한 문제제기로 제한적이긴 하지만 개인식별정보가 꼭 필요한 암연구에 대해서는 최근 암관리법 개정으로 환자의 주민 등록번호를 유지하는 것이 허용되었고, 다른 분야에 대해서는 익명화 의무를 면제시켜야 하는지, 그렇다면 어떤 원칙을 적용해야 하는지 등을 논의 중에 있다고 한다 (전문가 C, 2014.9.24. 회의 중 발언내용). 익명화라는 문제가 원칙적으로는 필요하더라도 연구를 위해서는 예외가 필요하기 때문에 세분화하여 접근할 필요가 있다.
생명윤리법에 익명화가 정해져 있지만 어떤 연구에서 환자의 개인식별정보가 반드시 필요하다는 문제가 제기되었으며, 최근 한 암연구에서는 환자의 주민등록번호에 대한 유지가 허용되었다. 연구를 위해서라도 익명화의 의무 면제에 대해 다양한 방법으로 접근해야 할 필요가 있다.