고추냉이분말(PHR)과 팽이버섯폐지(SMC)를 처리한 분뇨와 무처리군(control non-treated slurry;CNS)에서의 박테리아 균총 수(operating taxonomic unit; OTU)를 추정한 결과, CNS에서는 600여 종류의 박테리아가 확인되었으며, 고추냉이분말에서는 350 종류로 그 다양성이 낮아졌고, 팽이버섯폐지에서는 오히려 800여 종류로 증가한 것이 확인되었다. 이러한 결과는 고추냉이분말이 다량 포함하고 있으며 항균 작용 역할을 하는 페록시다아제에 의해 페놀류가 파괴됨과 동시에 페놀류 생성에 관여하는 박테리아에 대한 살균 효과를 보이는 것으로 해석이 가능하다. 팽이버섯폐지의 높은 섬유질이 첨가된 경우에는 섬유소분해에 관여하는 다양한 박테리아가 증가하여 상대적으로 악취 발생 박테리아의 군집을 축소시킨 결과에 의해 악취가 감소한 것으로 예측할 수 있다.
고추냉이분말과 팽이버섯폐지를 처리한 분뇨와 무처리군의 박테리아 균총 수를 추정한 결과, 고추냉이 분말은 무처리군보다 박테리아 종류가 더 적고 팽이버섯폐지는 무처리군보다 박테리아 종류가 더 증가한 것이 확인됐다.