K-ARPA의 주요 미션은 원칙적으로 기초연구(Fundamental Research)와 기술의 사업화(Technology Commercialization) 사이에 존재하는 간극을 메우는 역할을 수행하는 것이다. 즉, 가교 기술의 개발을 수행함으로써 기술과 시장 및 산업 간 연계를 창출하는 것이다. 즉, K-ARPA는 기존의 기술 로드맵을 연장하기보다는 급박한 경제사회적 필요에 맞추어 기초과학의 지식을 확장시킴으로써 산업 판도를 재편할 수 있는 신기술을 창조해야 한다. 이를 위해서는 정부 부처들이 개별 연구개발 사업의 일정 비중을 고위험 연구에 할당하고, 이를 K-ARPA에 위탁하는 방안을 검토할 필요가 있다.
K-ARPA의 주요 미션은 기초연구와 기술 사업화 간 가교 기술을 개발함으로써 기술-시장-산업 연계를 창출하는 것으로, 정부 부처 연구의 일부를 위탁하는 방안이 검토되어야 한다.