2차년도에서는 기술혁신 역량에 대한 개념을 바탕으로 중소기업 기술혁신역량지표를 설계하고, 그 결과를 비교했다. 1차년도에서 파악한 국가별 중소기업 DB를 직접 수집해 총량 및 상대적 개념에서 단순비교했으며 이를 토대로 복합지표를 설계해 중소기업 기술혁신 활용 정도를 비교했다. 기술혁신 역량에 대한 개념을 바탕으로 R&D자원, 혁신활동 수행, 혁신 산출, 경제적 성과, 정부/공공 인프라 등 5개의 대항목을 구성했으며, 이를 다시 중항목(12개), 소항목(33개) 수준의 세부 평가지표로 구분하여 국가별 중소기업 기술혁신 지수를 산출하였다. 2차년도 연구 결과, 국내 중소기업은 혁신활동의 투입, 혁신기업의 비중, 혁신의 산출, 혁신을 위한 인프라는 비교적 양호한 수준이나, 혁신활동의 성과가 시장으로 연결되는 경제적 성과 측면은 아직도 미흡한 것으로 나타났다.
2차년도에는 기술혁신 능력에 대한 의미에 비추어 R&D자원, 혁신활동 수행 등 5개 대항목을 조직하고 이를 다시 세세하게 나누어 국가별 중소기업 지수를 계산하였다. 그 결과 국내 중소기업은 경제적 성과 방면에서 아직 부족했다.