지금까지 본 절에서 R&D 아키텍처를 위한 이론적 접근 방법에 대해 논의했다. 여기에서 이론적 접근이라 함은 자연 또는 사회의 사건이나 현상들에 대한 내적, 외적 관계를 파악함으로 통해 이들을 과학적 연구 대상들로 올바르게 정의 내리고 이들의 경계를 형성하기 위한 기준과 분석 모델을 제시하려는 시도를 의미한다. 이러한 이론적 접근을 통해 얻을 수 있는 주요 시사점은 첫째, 연구 대상들이 올바르게 정의되어야 하며 그렇지 않은 경우 혼란스러운 R&D사업 구조가 형성되며 불필요한 조정 비용을 발생시키며 결과적으로 R&D 생산성에 매우 큰 부정적 영향을 미칠 수 있다. 연구 대상들을 올바르게 정의하기 하기 위해서는 자연적 종의 개념이 유용할 수 있음을 제안하였다. 즉, 1차적 과학적 연구대상들은 자연적 종이 되기 위한 조건들을 갖출 필요가 있다. 둘째, 개방적 세계의 사건과 현상들은 기본적으로 복잡하고 다층화되어 있을 뿐만 아니라 각각 독립적으로 발현되는 기제들에 의해 발생하기 때문에, R&D 아키텍처를 위한 경계 형성 기준들은 층위 단계에 따라 차이가 있을 수 있다. 즉, 미시적 수준에서는 연구 대상이 지닌 고유의 자연적 속성 즉 자연적 종의 여부에 의해 결정되어야 하며, 거시적 수준에서는 연구 대상의 속성뿐만 아니라 이용가능한 자원의 규모에 따라 조직적 단일성을 기준으로 임의적으로 결정될 수 있다.
R&D 아키텍쳐를 위한 이론적 접근을 통해 얻을 수 있는 주요 시사점 두 가지가 있다. 첫째, 연구 대상을 올바르게 정의함으로써 불필요한 조정비용을 막을 수 있다. 둘째, 아키텍쳐를 위한 경계 형성 기준은 층위단계에 따라 차이가 있을 수 있으므로 이를 정의 내리는 것이 필요하다는 것이다.