정부와 민간의 역할 분담에 대한 기업 인식 조사 가운데 재정지원투자방식 문항의 응답을 깊이 분석할 필요가 있다. 기업이 선호하는 대안들을 세 개까지 응답하라고 요청한 결과 (선호 1~3순위 모두 고려), 가장 응답이 많은 첫째와 둘째 대안은 ‘R&D 조세지원의 확대’와 ‘R&D + 구매확대’였다. 매우 중요한 것들이지만, 오랫동안 시행되어온 익숙한 정책 수단들이다. 주목할 것은 그 다음 응답이 많은 대안들이 ‘융･투자방식 강화’와 ‘R&D 바우처 제도 확대’라는 점이다. 이러한 정책 수단들이 제대로 구현 되려면, 자금 지원 방식에 있어 정부 주도보다 시장 역할이 중요하다. 이는 같은 설문조사의 바로 앞 문항인 정부의 역할 재설정에 관한 설문의 응답 결과와도 부합한다. 해당 문항에서 가장 응답이 많았던 것이 연구 예산 사용의 탄력성을 대폭 강화하고 예산 통제의 최소화를 추진한다는 것이었고, 두 번째로 응답이 많았던 것이 과학기술 역량 개발을 위한 대분야의 결정은 정부가 수행하되, 세부사업의 기획(연구개발 방식, 연구비 활용, 성과목표 제시 등)은 연구자 및 민간 수준에서 주도한다는 것이었다. 정부가 하나부터 열까지 하나하나 주도권을 틀어쥐고 민간기업의 연구개발 및 혁신 활동을 주도하는 방식으로는 현재의 급격한 산업 기술 재편 움직임에 효과적으로 대응할 수 없다는 것을 의미한다.
재정지원투자방식 문항에서 기업이 선호하는 대안은 R&D 조세지원의 확대와, 구매확대, 융, 투자방식 강화, R&D 바우처 제도 확대이다. 정부 역할 재설정 문항에서는 예산 사용 탄력성 증가와 예산 통제 최소화이며 세부 사업 기획은 연구자 수준에서 주도하도록 하는 것이다.