근골격계 종양에서 고주파 절제술이 주로 쓰이고 있는 유골골종은 발생률이 낮고, 종양 크기에 따라(최대 4cm 까지 가능) 고주파 절제술이 불가한 경우도 있어, 수술이 더 선호되고 있는 상황이다. 다만 크기가 작고 단단한 피질골속에 종양의 핵(nidus)이 자리 잡고 있는 경우에는 실제 수술시 발견이 어렵고 완전 절제가 잘되지 않아 이런 경우 CT 촬영을 하면서 핵의 위치를 확인 후 전극을 정확히 위치시킬 수 있는 고주파 열치료가 더 효과적으로 안전한 치료법으로 알려져 있다. 전이성 골종양의 경우에는 아직 충분하게 효과를 입증할만한 임상연구가 보고되지는 않았으며, 전이성의 경우 크기가 크고 퍼져 있는 경우가 많아 수술이나 방사선치료를 많이받고 있다. 유골골종과 비슷하게 수술적 절제가 위험한 부위의 통증성 전이성 골종양, 특히 골반골에서 주로 시행되는데, 골반골의 경우는 수술시 출혈이 다량으로 발생할 수 있어 수술 자체의 morbidity가 커서 고주파 절제술을 통해 국소적으로 치료하는 경우가 있다. 하지만, 하지 장관골의 경우에는 병적 골절을 예방 및 치료할 수 있는 내고정술이 필요한 경우가 많으므로 그 유용성은 제한적이다. 비침습적인 방법이므로 재원기간이 최소 1～3일 정도로 짧으며, 통증이 거의 없어, 시술자체는 분명한 장점을 가지고 있다.
고주파 절제술은 유골골종에 자주 쓰이는데, 종양크기에 따라 수술을 하기도 한다. 다만 크기가 작고 단단한 피질골 속에 종양의 핵이 있을 시 수술 후에도 완전 절제가 어려워 고주파 열치료가 더 효과적이다. 또한 고주파 절제술은 비침습적 방법으로 재원기간이 1~3일로 짧고, 통증이 거의 없어 골반골 치료에도 자주 쓰인다.