황석원(2015)은 연구자에 대한 평가 시스템을 설계하는 작업이 난해한 이유를 ‘행위주체별 목적함수 충돌’이라고 지적한다. 연구자를 평가하는 평가 담당자가 부처, 공무원, 연구기관 등으로 다원화되어 있고, 각자 서로 다른 목적함수를 갖고 있기 때문에 자신의 이익을 극대화하는 방향을 평가 시스템의 설계와 주어진 평가 시스템에서의 활동을 하려 할 것이다. 예를 들어 연구자가 실제로 도전적인 연구를 수행하고 성공하여 탁월한 연구 성과를 거둘 경우 연구자 개인과 기관장, 연구기관 등에게는 보상에 플러스 요인이 될 수 있으나 부처와 공무원에게는 돌아가는 보상에는 큰 영향을 미치지 않는다. 오히려 도전적인 연구를 수행하다 실패하는 경우가 발생할 경우의 마이너스 요인을 더 중요하게 고려할 수도 있다.
황석원(2015)은 연구자에 대한 평가 창구가 다원화되어 이들의 각각의 목적이 다양하다 보니 그에 따른 결과에 대한 파급을 고려하여 마이너스 요인이 되는 시스템 설계의 난해성을 기술했다.