미래성장동력 분야의 정책 통합은 정책 추진의 효율성 및 책임성 확보 측면에서는 바람직하였지만, 자칫 양 부처 선정분야의 물리적 통합 수준에 머무를 수 있다는 우려도 제기되었다. 이에 정부는 책임부처가 복수인 분야는 부처 간 의견 조율 등을 효과적으로 수행할 수 있도록 간사부처를 지정하여 부처간 협력을 유도하고 관계부처 국장급 협의회를 개최하는 등 미래성장동력 추진 주체 간 긴밀한 협업체계를 마련하여 실질적 정책통합을 추진하였다고 밝히고 있다. 결과적으로 정부의 미래성장동력 분야는 중복분야를 제외하고 19대 분야로 확대되었으며, 참여정부의 10대 분야에 비해 전략적 투자분야가 2배 가까이 늘어나게 되었다.
미래 성장 동력 분야가 물리적 통합만으로 그칠 수 있다는 우려가 제기됐다. 정부가 실질적 정책 통합을 추진한 결과, 미래 성장 동력 분야가 확대되고 전략적 투자 분야가 2배 늘어났다.