이어짓기 피해를 줄이기 위한 대책으로 저항성 품종의 이용, 토양 소독 등 다양한 방법이 시도되고 있다. 그중에서도 저항성 대목을 이용한 접목재배는 상대적으로 경제적이면서 손쉬운 방법이다. 수박의 경우 박이나 호박을 대목으로 이용해 접목재배를 실시한다. 접목된 수박은 덩굴쪼김병이나 선충에 의한 뿌리혹병 등 토양 전염병에 대한 저항성과 내염성, 저온 생장성 등이 증대돼 안정적인 재배를 할 수 있다. 또한 대목의 왕성한 뿌리 발육과 비료 흡수력 증가로 생육을 촉진하고 수확량도 높일 수 있다. 토양 소독제인 메틸브로마이드가 오존층 파괴 물질로 지정돼 2015년부터 사용이 금지되는 까닭에 전 세계적으로도 저항성 대목을 이용한 접목재배에 관심과 이용이 증가하고 있다. 국내에서 이용되는 채소 접목 모종은 대부분 전문 육묘장에서 생산되고 있다.
이어짓기 피해를 줄이기 위해 저항성 대목을 이용한 접목재배, 토양 소독 등의 방법이 시도되고 있다.