예를 들어, 전기·전자 부문의 경우 주요 문제점으로 요소 부품 또는 주요핵심기술 의 부족, 비메모리분야의 핵심기술 확보 미흡, 반도체 생산을 위한 장비 및 재료의 생산기반 취약, 통신기기 및 소프트웨어 분야 원천요소기술 기반 취약 등 기술적인 한계 와 함께 소요자금 상승 및 후발개도국의 추격, 전문인력 부족 등으로 인한 도입기술의 소화능력부족과 설비투자에 대한 부담에 따른 기업의 기술개발 의지 약화와 같은 대 내외적 환경 문제들도 지적되었다. 그러나 실제적인 계획은 1단계인 1996년, 2단계 인 1997~1998년, 3단계인 1999~2000년에 개별 기술분야별로 개발되어야 할 기술 과제들을 제시하는 방식으로 구성되었다. 이처럼 주요 문제점 등을 분석하는 데에 있어서는 기술적 한계뿐만 아니라 대내외적 환경 등 시스템적인 평가가 이루어졌으나, 그 해결책으로 기술과제를 제시하는 방식의 계획 내용은 제2차 산업기술개발 5개년 계획의 한계를 보여준다. 제2차 산업기술개발 5개년계획은 생산기술에서 산업기술로 계획 대상을 확장했다는 점에 있어서는 시스템 중심의 전환을 시도했다고 볼 수 있으나, 개별 산업 수준에서까지 시스템적인 계획을 제시하지는 못했던 것이다.
전기·전자 부문의 주요 문제점인 기술적 한계와 대내외적 환경변화 등의 원인 진단은 되었으나, 그 해결책으로 제시된 계획은 개별 산업까지 적용하기엔 한계를 보여준다.