한국 기업 혁신 조사 는 1990년대 말에 ‘한국의 기술 혁신 조사’라는 명칭으로 파일럿 연구가 진행 되어 2002년에 제조업 기술 혁신 조사가 최초로 발표되었다. 이 첫 조사결과부터 2011년까지의 시기에는 제조업과 서비스업을 별도의 조사 년도로 나누어 교대로 실시하였다. 이와 같이 두 산업군을 분리하여 조사하게 된 가장 주된 이유는 물론 조사 비용이나 인력 등 조사 여건에 있었다. 그러나 부분적으로는 이 두 산업군의 혁신 특성이 서로 매우 달라 하나의 조사표로 아우르기 어렵다는 점에도 그 이유가 있다. 그런 까닭에 2012년부터 한 해에 두 산업 분야의 조사를 결합하여 수행하게 된 뒤에도 용어와 조사표는 따로 구성하여 조사되며, 조사 결과 역시 별도의 통계로 독립적으로 제공되고 있다
제조업 기술 혁신 조사는 제조업과 서비스업 두 분야의 혁신 특성이 각기 달라 하나의 조사표로 나타내기 여려움이 있었고, 2012년 부터 두 산업을 결합하여 조사했으나 그 결과는 별도의 통계로 제공되고 있다.