효율적으로 풍수해저감 종합계획을 수립 및 운영하기 위해서는 단일 시설물적 대책 뿐만 아니라 지역적 특성을 고려한 종합적인 대책마련이 필요하다. 이를 위해 2012년에는 방재계획과 공간계획의 연계성 확보를 위해 「국토의 계획 및 이용에 관한 법률시행령」을 개정하여 풍수해저감 종합계획을 도시계획에 반영하는 것을 의무화하였다. 개정된 주요내용은 풍수해저감 종합계획의 내용을 바탕으로 도시관리 계획상 보전계 용도지역(보전녹지, 보전관리, 자연환경보전) 또는 방재지구로 지정할 수 있도록 필요자료를 제시하며, 풍수해저감 종합계획에서 제시된 사항 중 광역도시계획, 도시기본계획, 도시관리계획 및 각종개발사업 계획 등에 반영해야 할 사항을 제시하도록 하고 있다. 또한, 도시개발사업, 택지개발사업, 산업단지개발사업 등 각종 개발사업의 토지이용 계획을 반영한 재해저감 대책을 수립하고 이를 개발사업에 반영하도록 유도하고 있다.
효율적인 풍수해의 저감을 위해 각 지역적 특성을 고려한 종합계획의 수립과 운영이 필수적이다. 이를 위해 2012년 「국토의 계획 및 이용에 관한 법률시행령」을 개정하여 도시계획을 할 때 풍수해 저감 종합계획을 의무적으로 반영하게끔 하였다.