현행 성과평가 결과의 활용은 사업단위 예산 삭감이 과제의 추진 여부 등에 사용되고 있으며 과제 선정평가는 상대평가 방식으로 비교적 높은 경쟁률을 의거해 역량 및 적정성을 기반으로 정량지표와 전문가 정성지표를 통해 성과지표의 설정 및 설정 달성을 위한 방법론 등을 기반으로 선정 적용하고 있으나 성과평가단계에서는 최종적으로 정량적 목표 중심으로 평가하는 경향이 있어 이를 중심으로 연구자 또한 연구목표를 설정하고 이를 달성하는 경향을 갖고 있다. 그 결과 종료평가단계에서 성공률은 93%에 달하는 수치를 보이고 있으며 질적인 성과는 나타나지 않게 된다.
현재 성과평가 결과는 삭감이 추진에 사용되며, 과제 선정평가는 상대평가 방식이다. 성과평가단계에서는 정량적 목표로 평가하는 성질이 있어 질적인 성과가 부족하다.