개별심사, 합의회의, 패널회의에서 아래와 같은 3개의 기준으로 평가를 실시한다. 첫째는 과학기술적 탁월성(scientific and/or technological quality)으로, 세부평가사항으로는 연구주제의 타당성과 연구목표의 질, 최신기술(state-of-the-art)을 넘어선 진보성, 과학기술적 방법론 및 작업계획의 질 효과성 등이 있다. 두 번째 평가항목은 프로젝트 실시 관리의 질과 효율성(implementation)으로, 관리구조와절차, 개별 참여자 차원에서 연구참여자의 질 및 전문성, 컨소시움의 정합성, 균형등 품질, 예산, 스태프, 장비 등에 대한 자원배분의 적합성과 정당성 등이 고려된다. 마지막 평가항목은 프로젝트 결과의 영향력(impact)으로, 유럽 국제적인 기여와 관련주제에 대해 예상되는 효과, 프로젝트 결과의 확산 이용방법 및 지적재산관리의 적절성 등을 평가한다. 각 평가항목은 0~5단계의 점수로 평가되고, 최소요구수준(threshold)가 각각 항목별로 3점, 종합점수로 10점으로 설정된다(European Commission, 2014).
개별심사, 합의회의, 패널회의에서 프로젝트의 평가는 1. 타당성과 진보성 등을 포함한 과학기술적 탁월성, 2. 프로젝트 관리의 효율성, 3. 결과의 영향력이라는 3개 기준에 의한다. 각 항목은 0~5단계 점수로 평가하며 최소요구수준은 항목별 3점, 종합점수 10점으로 정한다.