제3차 개헌의 최대 특징은 국가운영을 대통령제에서 내각책임제로 바꾸었으며, 국회는 양원제(민의원, 참의원)를 채택했다는 것이다. 자유당의 독재와 헌정유린을 경험한 당시 국민들은 의원내각제가 독재를 막는 제도적 장치로 생각했다(이병규, 2010:220). 이에 따라 대통령은 국가원수이지만 의례적･형식적인 지위에 한정되었다. 반면 행정권은 국무원에 귀속되었다. 대통령이 지명해 국회의 동의하는 국무총리가 국무원을 대표하며, 행정각부를 지휘･감독하도록 했다. 국회는 정부불신임권이 부여되었지만, 정부는 국회를 해산할 수 있도록 했다. 이외에 대법원장과 대법관의 선거제를 도입했으며, 헌법재판소와 중앙선거관리위원회, 지방자치단체장 직선제 등을 도입했다. 시･읍･면의 장은 주민의 직접선거로 선출한다는 규정도 포함되었다.
제3차 개헌의 최대 특징은 국가운영을 대통령제에서 내각책임제로 바꾸었으며, 국회는 양원제(민의원, 참의원)를 채택했다는 것이다.