합성생물학이 사적인 영역에서도 자유롭게 이용할 수 있게 되면서 기술의 발전에 따라 부정적 의도・목적에 의한 합성생물학 기술의 이용이 생물다양성의 보전이라는 공통의 이익에 미칠 영향에 대한 우려 역시 제기되고 있다. 생물다양성은 인류의 공동 자산이라는 인식 하에 생물다양성협약이 채택되었으며 생물다양성 보전 및 구성요소의 지속가능한 이용, 그리고 유전자원으로부터 발생하는 이익의 공유라는 문제는 많은 국가들의 경제, 사회, 환경, 문화 등 복합적인 요소에 영향을 주고 있다. 합성생물학의 발전 역시 이와 같은 맥락에서 다양한 문제들이 복합적으로 고려되어 이에 대한 대응방안이 마련되어야 할 것이다.
생물다양성은 인류의 공동 자산이라는 인식 하에 생물다양성협약이 채택되었으며 합성생물학의 발전 역시 다양한 문제들이 복합적으로 고려되어 대응방안이 마련되어야 할 것이다.