지하수(온천공) 개발과 관계된 지하수 영향조사는 현재 지하수 이용·개발에 무게중심을 두고 있기 때문에, 지하수 개발로 인한 영향이 적절하게 예측되지 않을 수 있다. 즉, 지하수 영향조사의 목적이 적정 양수량을 확보하여 지하수 개발을 도모하는 것이므로, 적정 양수량이 매우 작거나 영향반경이 넓게 산정되어 관정 개발이 불가한 경우에도 시추공을 폐공 처리하고 개발 목적이 수립될 때까지 관정 굴착을 반복하여 수행할 수 있다. 따라서 환경영향평가가 지하수 영향조사의 보고서를 인용하기 때문에 지하수 개발에 의한 영향이 없을 것으로 예측 된 경우에도, 사업에 의한 악영향은 물론 과도한 양수에 의한 영향이 발생할 가능성이 있다.
환경영향평가가 인용하는 지하수 영향조사 보고서는 지하수 이용·개발을 중시해 지하수 개발로 인한 환경 영향이 예측되지 않을 수 있고, 예측된 것과 다르게 악영향이 발생할 수도 있다.