수술계획을 할 때는 제거해야 하는 간질 유발부위와 보존해야 하는 부위를 종합하여 수술범위를 정한다. 이때 혈관 손상을 주의하여 피질제거를 해야 하는데 특히 내측 보조운동영역 부위의 전뇌동맥은 잘 보존해야 한다. 피질제거는 수술 현미경으로 병변 부위를 통째로 제거하면서 연막하제거 기법을 함께 이용한다. 수두증이나 경막하 수종을 예방하기 위해 가능한 뇌실은 열지 않는 것이 좋다. 한쪽 전두엽 절제는 수술 후유증이 낮지만 보조운동영역 수술은 반대쪽의 자발운동의 감소와 언어장애 등의 제거 증후군 소견을 보이기도 한다. 하지만 며칠에서 몇 주정도 만에 회복된다.
수술계획은 여러 사항을 염두해 범위를 정해야 한다. 피질제거에서는 연막하제거 기법을 활용, 가능한 뇌실을 열지 않아야 하며 한쪽 전두엽 절제에서는 증후군에 유의한다.