CODEX(국제식품규격위원회)는 과학적인 위험평가를 위하여 위험평가와 위험관리기관을 분리하되, 국가별 여건과 환경에 따라 한 기관이 통합·수행하더라도 위험평가의 독립성을 보장할 것을 권장하고 있다. 우리나라의 경우 식약처 산하의 식품의약품안전평가원이 위험평가를 전담하고 있으며, 일부기능을 농촌진흥청과 수산과학원이 담당하고 있다. 위험평가기구의 분리 독립 형태는 식품안전정책 전반에 대한 시스템 재편과도 관련되기 때문에 향후 충분한 논의를 거쳐 확정할 필요가 있다. 식품안전정책위원회는 단순한 자문역할에서 벗어나 과학에 근거하여 식품사고에 대해 위해성여부에 대해 신속한 결정을 할 수 있는 위험평가기능을 부여하는 것을 검토할 수 있다. 향후 위험평기기관의 재편이 이루어진다면 이와 연계해서 기능을 재정립할 필요가 있다.
CODEX는 과학적인 위험평가를 위해 위험평가의 독립성을 강조했다. 한국의 경우 식품안전정책 재편으로 충분한 논의가 필요하며 재편 시 식품안전정책위원회에 위험평가기능 부여와 연계해 기능을 재정립할 필요가 있다.