셋째, 공동기술지주회사와 개별 대학의 기술이전 전담조직 간 협력체계를 구축하는 것 역시 간과되지 않아야 한다. 성공가능성이 높은 자회사를 설립하고 지원하는 것은 공동기술지주회사의 주요 역할이지만, 자회사 설립을 위해 사업화가 가능한 유망기술을 효과적으로 발굴하는 것은 일차적으로 대학의 기술이전 전담조직의 역할이기 때문이다. 즉 공동기술지주회사와 기술이전 전담조직 간 협력이 이루어지지 않는다면, 실질적인 기술사업화의 성공은 담보될 수 없다. 본 연구는 공동기술지주회사 및 기술이전 전담조직 간 협력 활성화를 위하여 과정별 주도적 조직에 의해 운영되는 ‘리더 주도형 협력네트워크’를 제시한다. 이는 협력의 효율성을 증가시키기 위해 과정별로 실제 주도적인 역할을 담당하는 조직을 정의하고 그 역할을 부여하는 것이다. 구체적인 역할 분담으로 기술이전 전담조직의 경우 연구성과의 지식재산권화를 통해 기술 Screening 및 발굴을 실시하고, 실제 사업화 가능 아이템과 기술이전 가능 아이템을 구분하는 업무를 담당한다. 이러한 과정의 후속으로 공동기술지주회사는 사업화 아이템에 대한 자회사 설립 및 지원, 자회사 육성 및 기업Exit 등의 전략을 담당하는 것을 제안한다.
공동기술지주회사와 기술이전 전담조직 간 협력이 꼭 필요하며 이는 기술사업화의 주축이며 핵심 발판이다. 이 연구는 이와 관련하여 협력을 더 효율적으로 진행할 수 있게 도와주는 '리더 주도형 협력네트워크'를 제시하며 이는 연구성과 지식재산권화를 통한 기술 Screening 및 발굴 실시등 여러 역할을 한다.