또한 과학철학 관점에서 보면, 시장구조 접근과 같은 실증적 방법은 대상들(objects)에 대한 구조적 속성(genotypes)과 이들의 메커니즘을 파악하기 보다는 현상 및 사건들의 규칙성을 발견하는 것에 1차적 관심을 두기 때문에 몇 가지 근본적 한계를 가질 수 있다. 첫째, 유사성 등의 형식적인 관계에 의존할 수 있어 상호의존관계가 우연적(외적)인가 또는 필연적(내적)인가에 대한 실재적 연관성을 파악하는데 한계가 있을 수 있다. 둘째, 대상들이 속한 체계의 발현적(emergent) 속성이 무시될 수 있으며, 층화(stratified) 구조에 대한 이러한 무관심은 인과성에 대한 그릇된 판별을 초래할 수 있다. 셋째, 이러한 문제에서 파생되는 결과로서 기술 또는 산업에 대한 새로운 융합적 접근과 체계의 근본적 혁신을 모색하는 것에 한계가 존재한다. 실증적인 접근에 의해서는 이른바 기존 것들을 모방하거나 추격하는 것은 가능하지만 새로운 것들을 창조하는 것은 거의 불가능할 수 있다.
실증적 방법은 구조적 속성과 메커니즘보다 현상 및 사건의 규칙성 발견에 관심을 둔다. 이는 실재적 연관성 파악이 힘들고 층화 구조에 무관심으로 인과성의 그릇된 판별을 초래한다. 새로운 융합적 접근과 체계의 근본적 혁신에 한계와 새로운  창조가 거의 불가능하다.