한편, 외국인의 유입이 증가함에 따라 외국인의 결핵환자수가 급격히 증가하고 있는 추세인데, 우리나라에 체류중인 외국인은 2002년 63만 명에서 2016년 205만 명에 이르고 있다. 이러한 외국인 증가에 따라 외국인의 결핵환자수도 증가하여, 2001년 외국인 결핵 신환자수는 126명으로 전체 결핵 신환자의 0.4%를 차지하였으나, 2016년에는 그 비중이 6.9%(2,123명)에 달하였다(그림 7). 현재 이러한 외국인 결핵환자에 대한 관리는 3단계로 이루어지고 있는데, 먼저 비자발급단계에서는 결핵 다발생 국가 국민이 장기체류 비자 신청할 때, 건강진단서 제출을 의무하고 있고, 2016년 3월부터는 비자변경 및 체류 연장 시에는 결핵여부 확인을 위해 결핵진단서를 제출토록 하고 있다. 체류단계에서는 외국인 치료 비순응자와 치료목적 입국자(다제내성 결핵환자 중 단기사증 소지자 등)를 중점관리대상자 및 입국금지대상자로 등록하여 보건소에서 관리하도록 하고 있다. 특히 다제내성 결핵환자에서 외국인이 차지하는 비중은 무려 20.5%를 차지할 정도 심각한 수준이다.
외국인의 국내 들어오는 비율이 높아짐에 따라 외국인 결핵환자 수가 높아지고 있다. 2001년 전체 환자수의 약 1%이었지만 2016년에는 약 7%로 높아졌다. 외국인 환자 관리는 3단계로 이루어지고 있고 있으며, 중점관리 대상자 및 입국금지 대상자로 등록해 관리하는 비중이 높아져 심각하다.