이러한 문제의식에 입각하여 본 연구의 3장에서는 연구개발투자에 있어서 정부와 민간의 역할이 어떻게 나누어져 있나 살펴보기 위하여 정부 연구개발투자에 대한 전반적 통계를 담고 있는 NTIS DB, 민간연구개발투자에 대한 전반적 현황을 담고 있는 과학기술 연구개발활동조사 DB에 의거하여 포트폴리오 분석을 수행했다. 연구개발단계별로 볼 때 정부와 민간의 연구개발투자 모두 개발연구의 비중이 높은 것으로 나타났다. 민간기업 규모에 따른 연구개발단계별 투자비중을 살펴보면, 개발연구, 응용연구, 기초연구의 순으로 투자의 우선순위가 높은 것으로 나타났다. 신기술분야의 경우 민간기업 투자의 경우, 개발연구, 그리고 시장성이 강한 분야에 투자가 집중되는 경향을 보이고 있으며, 정부 투자의 경우 시장성이 약하거나, 기초연구에도 상대적으로 투자비중이 높게 나타나고 있다.
민간기업 규모에 따른 단계별 연구개발투자비중은 개발, 응용, 기초연구 순이었고, 신기술분야에서는 민간은 개발연구와 시장성이 강한 분야, 정부는 기초연구나 시장성이 약한 분야의 비중이 높았으나 공통적으로 개발연구 비중이 높았다.