어린이집 평가인증은 참여확정, 현장관찰, 심의의 3단계로 이뤄진다. 어린이집의 자발적 참여로 진행되며, 참여를 신청한 어린이집은 정해진 절차에 따라 평가인증을 받게 된다. 평가인증을 신청한 어린이집은 지자체별로 이루어지는 기본사항 확인 절차와 자체점검보고서 제출을 거쳐 참여를 확정한다. 각 시 군 구청은 신청 어린이집이 기본사항 중 9개의 필수항목을 모두 준수하였는지 여부와 예 결산서 및 재무회계 관련 사항, 8가지 행정처분 및 위반사항 민원사항을 확인하여 점수를 부여한다. 필수항목은 모두 어느 하나라도 미충족 시에는 참여확정 대상이 될 수 없으며, 기본항목은 위반 정도에 따라 감점도 가능하다.
어린이집 평가인증은 해당 어린이집에서 기본사항 확인 절차와 점검 보고서 제출을 통해 참여를 확정하고 현장을 관찰한 후, 시 군 구청에서 점수를 부여하는 심의의 단계로 이루어진다. 