지속가능한 시스템으로의 전환을 전제로 하고 있는 시스템 전환론의 정책은 사회문제 해결형 혁신정책(challenge-driven innovation policy)의 성격을 띠게 된다. 에너지, 환경, 보건․복지, 의료, 농식품, 주거, 교통 등 우리사회를 구성하는 사회적 활동의 문제점을 지적하고 그것을 지속가능하게 만들기 위한 시스템 혁신을 주장한다. 이 때문에 산업육성과 연구의 수월성을 향상시키는 정책은 하위에 위치하게 된다. 전통적으로 혁신정책이 산업경쟁력 강화와 탁월한 원천기술 개발 등을 중심으로 논의체계를 구성해왔다면 시스템 전환론은 다른 프레임에서 접근한다. 즉 사회․기술혁신을 추진하는 과정에서 산업을 육성하고 연구의 수월성을 확보하는 것이다(정병걸, 2014).
시스템 전환론은 사회문제 해결형 혁신정책의 특성을 갖게 되는데 사회를 구성하는 사회적 활동의 문제점을 지적하고 유지할 수 있도록 사회․기술혁신을 진행하는 절차에서 산업을 육성하는 것이다. 