또 다른 대안은 현재 실질적으로 국가교통물류기술 R&D를 수행하고 있는한국교통연구원 등 관련 출연(연)이 속한 경제인문사회연구회에 국가교통물류기술 R&D 전담기관을 지정하는 것이다. 예를 들면 경제인문사회연구회 산하의 출연(연) 중 하나인 한국교통연구원에 국가교통물류기술 R&D 전담기관을 지정하는 것을 검토할 수 있다. 한국교통연구원은 “교통 물류정책 및 기술을 연구 개발하고 교통정책에 관련된 국내외 각종 정보를 수집, 조사, 분석하여 이를 널리 보급함으로써 교통발전에 기여함을 목적”으로 설립되었다. 교통물류를 비롯하여 도로, 철도, 항공 등의 교통과 관련된 정책 및 기술을 연구 개발하는 종합교통연구기관으로서 2013년 교통물류연구사업(안전, 첨단, 청정, 복지, 물류 등 5대 Mobility)을 주관으로 수행하여 국가교통물류기술 R&D 비전과 중 장기 전략을 제시하였다. 한국교통연구원의 주요사업 포트폴리오가 국가교통물류기술 관련 임무수행과 방향이 일치하고, 기관 설립목적과 그 임무가 전담기관의 설립목적에 부합하며, 출연연으로서의 기관운영의 자율성 확보가 가능한 점 등으로 미루어보았을 때 국가교통물류기술 분야의 전담기관 지정에 제도적으로 특별히 어려운 문제없이 가능할 것으로 판단된다
국가교통물류기술 R&D 전담기관을 지정할때, 관련 임무수행과 방향이 일치하고, 기관 설립목적과 그 임무를 적절히 수행 할 수 있는지의 여부를 면밀히 보아야 한다. 그 실질적인 대안은 국가교통물류기술 R&D를 수행하고 있는 기관을 지정한는 것이다.