의료계 중 의사협회는 약학대학의 통합 6년제 전환에 대해 사회적 갈등 양산 등을 이유로 부정적인 입장이며, 그와는 별개로 약학대학 학제가 일반 국민들선호와 국제적 기준(의․치․약대)에 부합하는지를 놓고 판단해야 한다고 하였다. 일반국민의 입장에서 통합 6년제로의 전환은 사실상 수업연한의 확대이며, 이를 설득시키기 위해서는 학제 변경에 따라 약사의 역할이 전문적이고 다양하게 변화할 것이라는 설명이 가능해야 한다고 하였다. 약학대학의 교과과정은 기한을 늘리지 않고 충분히 개편이 가능하고, 6년 교육연한을 유지하면서도 학생에게 선택권을 부여해주는 4+2학제가 가장 적합한 대안이라는 입장이다.
의사협회는 약학대학의 교과과정은 6년제로 늘리지 않아도 개편이 가능하며, 6년 교육연한을 유지하면서 학생에게 선택권을 부여해주는 4+2학제가 가장 적합한 대안이라는 입장이다.