주요 국제에너지기구들과 회원국가들로 구성되어 있는 현 글로벌 에너지 거버넌스는 몇 가지 한계를 지니고 있는 것으로 비판 받고 있다. 우선 에너지의 특성상 에너지원별 특성이 상이하고, 그에 따라 해당 에너지기구들은 독자적으로 운영되면서 서로 간 협력과 조정이 부족하다는 것이 가장 큰 약점 중 하나로 지적된다. 예를 들어, 원자력 협력을 주관하는 국제원자력기구(International Atomic Energy Agency, IAEA)나 석유수출국 모임인OPEC, 재생에너지를 다루는 IRENA, 가스수출국 모임인GECF(Gas Exporting Countries Forum) 등은 각각 해당 에너지원과 관련된 협력에만 초점을 맞추면서, 서로 간의 정책 조정이나 공통의제 해결 추진 등에 있어서는 거의 관심을 기울이지 않았다고 할 수 있다. 다만 IEA의 경우, 정책방향 제시와 에너지시장 분석 등에 있어 전체 에너지원을 모두 아우르면서 대표적인 국제에너지기구와 같은 역할을 수행하고 있으나, 이는 실질적 협력을 통솔하고 주관하는 주체라기 보다는 국가들과 다른 국제에너지기구에 대해 자문기구의 역할을 담당하고 있다는 표현이 더 정확할 것이다. 추가적으로 G20를 통해 국제 에너지기 구간 협력과 조정이 이제 조금씩 정착되고 있다고 볼 수 있기도 하지만, 아직 충분하지 못한 상황이다.
현재 글로벌 에너지 거버넌스가 가진 가장 큰 약점은 에너지원에 따라 특성이 완전히 다르고, 해당 에너지기구들이 독자적으로 운영되고 있기 때문에 서로 협력하고 조정하기가 힘들다는 것이다. IEA가 가장 대표기구 역할을 하고 있지만 자문기구 정도의 역할에 그치고 있다.  G20이 그 역할을 감당하려고 하지만 아직 부족한 상황이다.