많은 나라에서 의료기술평가는 건강보험 급여나 국가보건의료체계 내 권장목록에 대한 의사 결정 시 이루어지고 있다. 그에 비해 우리 나라는 특히 의료행위와 관련하여 건강보험 급여 의사결정이 조금 다른 절차를 통해서 이루어지고 있다. 의약품의 경우 안전성과 유효성은 식품의약품안전처를 거치면서 검증이 끝나며 이후 건강보험 급여 대상이 되기 위해서는 해당 기업의 신청을 통해 정해진 급여 결정 절차를 거친다. 건강보험 급여 대상이 아니거나 대상이 되기를 원하지 않는 경우 비급여로 시판 절차를 거치게 된다. 대부분의 처방약의 경우 건강보험 급여가 적용되어야 환자의 부담이 경감되어 실질적인 가격 경쟁력이 생기므로 다른 나라에서의 급여 결정 절차와 큰 차이를 보이지 않는다.
우리나라는 의료행위에 대한 건강보험 급여결정절차가 다른 나라들과 다르다. 의약품은 식약처가 검증하고, 건강보험 급여대상 신청은 제약사가 한다. 처방약의 경우는 다른 나라와 큰 차이를 보이지 않는다.