일본의 국책연구소는 대학은 물론 주요기업들과 폭넓게 협력하면서 개방형 인지컴퓨팅 산업생태계 구축을 추구하는 반면, 한국은 주로 대학과 공동연구를 수행하며 주요기업은 배제한 채 소수의 중소기업과만 협력하는 폐쇄적인 연구사업을 수행하고 있다. 또한 일본의 국책연구소는 연구의 내용에서도 기업들이 각자의 응용 애플리케이션 개발에 활용할 수 있는 다양한 기반기술을 개발해 기업 활동을 지원하는데 주력하는 반면, 한국은 국책기관이 기반기술 연구보다는 IBM, 구글 등 글로벌 기업을 앞지르겠다는 명분으로 선진기업과 유사한 응용연구를 직접 수행하고 있다.
일본의 국책연구소는 개방형 인지컴퓨팅 산업생태계를 구축해 여러 기반기술 개발에 집중하는 반면 한국은 폐쇄적인 연구사업 구조 아래 응용연구를 직접 수행하고 있다.