생물자원에 대한 이슈는 초기에는 자원보유국과 이용국 사이의 이익배분 문제보다 환경에 대한 이슈, 즉 생물자원의 보존에 맞춰 있었다. 생물다양성은 계속해서 감소하고 있고 한정된 생물자원으로 인해 새로운 지식 생산 및 기술 혁신을 이루기 어려워 질 것이라는 우려가 산업계 및 학계에 존재하였다(ten Kate, 2002). 분류학, 생태학 등 생물자원의 다양성이 학문 발전에 결정적 역할을 하는 분야뿐만 아니라 생물자원을 활용한 지식활동을 하는 상당수의 분과에서 생물다양성 감소 및 활용가능성 감소에 대한 우려를 표명해 왔다. 일례로 세계미생물자원은행연합(WFCC)을 위시한 미생물학계는 아직 지구상 존재하는 미생물의 1%밖에 발견하지 못했는데 많은 자원이 연구도 되지 못한 채 멸종될 수 있다고 경고했다(Dedeurwaerdere, 2011). 육종업계는 활용 가능한 유전자원이 한정될 경우 우량 돌연변이의 출현 가능성이 낮아지고 유전적 침식이 진행되어 고품질 품종을 개발하기 어려울 것이라 전망한다(이범규․서석철, 2011). 지구상 현존하는 생물자원의 다양성이 급감하여 인류가 활용 가능한 전체 생물자원의 범주(pool)가 줄어들 수 있다는 우려 속에 국제사회는 지속가능한 방식의 자원 이용을 위해 다양한 환경규제를 만들어 왔다. 1973년 멸종위기에 처한 야생동식물의 국제거래에 관한 협약(CITES)이 수립되었다.
초기 생물자원 이슈는 생물자원 보존에 맞춰 있었다. WFCC 위시 미생물학계의 경고와 같이 여러 분과에서 생물다양성 감소와 한정된 생물자원으로 기술 혁신의 어려움에 대한 우려를 밝혀 왔으며 육종업계는 고품질품종 개발의 어려움을 전망했다. 이에 따라 국제사회는 지속가능한 자원이용을 위해 CITES와 같은 여러 환경규제를 만들어 왔다.