본 연구는 주요 지표를 심평원 청구자료를 이용하여 산출하였는데 전산 자료의 신뢰도에 대한 문제가 있을 수 있다. 즉 청구자료 상 뇌졸중 관련 상병이 있는 경우 뇌졸중으로 보았으나 해당 상병으로 청구를 하였다고 하더라도 환자가 반드시 실제로 그 질환을 가지고 있는 것을 의미하지는 않는다. 뇌졸중이 아닌데도 뇌졸중으로 청구된 경우가 있을 수 있고 또한 실제로는 뇌졸중의 후유증에 해당하는 환자라 할지라도 뇌경색, 혹은 뇌출혈로 청구했을 수도 있다. 이를 확인하기 위해서는 실제 진료기록을 비교해보아야 하는데 본 연구에서는 의무기록과 대조가 불가능하므로 검정이 이루어지지 못하여 뇌졸중으로 청구한 상병이 실제 진단기준을 만족하는지 확인할 수 없는 한계가 있다. 이러한 점은 청구자료를 이용한 연구가 갖고 있는 태생적인 제약점이기 때문에 본 연구에서는 연구대상 환자를 뇌졸중으로 단정적인 정의를 내리지 않고 ‘뇌졸중 청구환자’로 표현하여 혼란을 최소화하고자 하였다.
심평원 청구자료를 사용하였기에 자료의 신뢰성이 낮을 수 있다. 청구자료에 뇌졸중이라고 써 있어도 그 환자가 실제로 뇌졸중을 갖고 있다고 확신할 수 없다. 실제 의무기록을 확인할 수 없기 때문에 자료의 신뢰도를 검증할 수는 없다는 제약이 있다.