둘째, 원자력 분야 기초연구의 지속성 확보를 위하여 개인연구와 그룹 연구를 수행하는 ‘전략 기초연구사업’에 108.8억 원을 투자하였다. 개인 연구인‘전략 기초’는 창의적이고 도전적인 아이디어를 발굴하여 단계적으로 지원함으로써 차세대 기술을 돌파할 수 있는 연구환경을 안정적으로 조성하기 위한 과제로서 단계평가를 통해 17개 과제(모험연구 2개 과제 포함)를 지원하였다. 그룹 연구 중 2003년부터 추진해 오고 있는 ‘원자력기초공동연구소’ 사업은 원자력 분야의 학제 간 공동연구와 창의적 기초연구과제를 수행하여 미래의 원자력 신기술 창출을 목적으로 하고 있으며 2013년에는 계속과제 11개에 지원하였다.
‘전략 기초’는 차세대 기술을 뛰어 넘을 수 있는 연구환경을 안정적으로 만드는게 목표이며,  ‘원자력기초공동연구소’ 사업은 미래의 원자력 신기술을 만드는 것이 목표이다.