기관별 기대효과를 살펴보면, 생기원은 공동연구를 통하여 원천기술을 직접 개발하기 위하여 투입되는 장비, 인력, 시간 등의 비용을 줄일 수 있다. 또한 공동연구 과정에서 과기연의 특허기술 노하우를 습득할 수 있다. 과기연의 입장에서는 원천기술을 성공적으로 개발하고도 사업화 성과로 연결되지 않는 부분을 생기원의 실용화 연구 역량을 활용하여 개선할 수 있다. 이를 통해 기술이전 성공률을 높이고, 기술료 수입을 증대하며, 휴면특허 유지비용 또한 줄일 수 있는 장점이 있다. 두기관은 원천기술을 신속하게 사업화함으로써 신산업을 창출하고 시장을 선도하는 역할을 기대할 수 있다. 또한 국가연구개발사업의 중복투자를 방지함으로써 비용을 절감하고, 공공연구 분야의 연구생산성을 강화하여 국가연구개발 성과창출의 극대화를 가져올 수 있다. 그동안 연구 분야와 역할의 차이로 협력 및 연계가 이루어지지 않던 공공연구기관 간의 소통의 장을 마련하고 기술교류를 확대하여, 연구 관련 새로운 아이디어를 도출하고 연구 과정에서의 애로사항을 공유하며 공동으로 문제를 해결하는 성과도 예상된다.
생기원과 과기연은 공동연구로 각자 얻는 이득이 있다. 생기원은 비용을 아끼면서 원천기술을 개발할 수 있고 과기연의 특허기술 아이디어를 얻을 수 있다. 과기연은 원천기술 개발 뿐만 아니라 생기원의 실용화 연구로 사업화로 연결할 수 있다. 공동 연구로 투자가 중복되는 걸 막을 수 있다.