한편 국토해양부가 마산만 특별관리해역을 대상으로 2004년부터 시행한 연안오염총량관리제의 편익/비용 비율은 1.44, 내부수익률은 10.7%로 사회적 할인율(5.5%)보다 높게 나타났다(국토해양부, 2012, p. 146). 따라서 해양환경분야 연구개발 및 관리를 위한 투자는 경제적 타당성을 확보한 선행 연구에 기초할 때, 새만금 외해 연구개발사업도 경제적 타당성이 있을 것으로 추정된다. 또한 과학에 기반한 해양환경관리는 경제적으로 타당한 의사결정에 기여할 수 있다는 연구결과에 비추어 볼 때, 이 연구개발사업의 성과가 2020년 이후 새만금 연안의 환경․자원․공간관리에서 합리성을 제고할 수 있을 것으로 기대된다.
국토해양부의 마산만 특별관리 해역 조사에 따르면 여기서 경제적 이득을 보았다. 그러므로 합리적 선행연구에 기초한 새만금 외해 연구개발사업에서도 이득을 볼 수 있을 것이다.