대통령중심제 정치구조에서는 대통령의 권한이 절대적이기 때문에 행정부처 간 협업이 잘 이루어지기 위해서는 일차적으로 대통령이 어떤 의식구조에 오리엔테이션 되어 있는가, 또 어떠한 리더십을 행사하는가가 중요하다. 행정 부처 간 협업 성공의 조건은 첫째는 대통령부터 솔선수범하여 전문가들의 다양한 견해를 경청·발산시키고 다시 이를 적극 수렴하는 지도력을 보여주어야 한다는 점, 둘째는 조직구조를 재설계할 때 미국의 부처들처럼 부처 간 갈등을 조정하는 코디네이터를 만들고 여기에 많은 권한과 책임을 실어주어야 하다는 점, 셋째는 협업을 통해 성공한 정책사례와 반대로 협업을 하지 않아 실패한 사례들을 찾아내 보여주어야 한다는 점, 넷째는 부처 간 협업 ‘롤 모델’을 찾아내 조직 내 협업문화로 정착해야 한다는 점, 다섯째는 정책의 성공적 수행에는 부처 간 협업구조의 정착도 중요하지만 정부 부문뿐만 아니라 기업·대학·시민단체·NGO 등 많은 부문들과도 거버넌스에 입각한 협업구조가 정착될 때 협업행정은 성공을 할 수 있다.
대통령중심제에서 행정부처 간 협업이 성공하기 위해서는 대통령의 솔선수범, 조직구조 재설계 시 갈등조정 코디네이터의 존재, 실패 사례 제시, 롤모델을 반영하여 문화화, 정부 외 기업·대학·시민단체·NGO와의 협업구조 등이 필요하다.