체세포복제 배아연구는 환자의 체세포핵을 다른 정상인의 탈핵된 난자에 이식해서 배아를 생성하는 연구이기 때문에 여성의 난자가 필요하다는 점에서 문제가 제기되지만, 여성의 난자 대신에 동물의 난자를 활용해서 인간의 체세포핵을 이식하는 이종간 연구도 가능하기 때문에 키메라와 같은 새로운 종의 탄생가능성에 대한 우려가 제기되었다. 이런 이종간 연구가 이루어지는 이유는 앞서 설명한 것처럼 여성 난자를 활용하는 데서 발생하는 윤리적인 문제와 난자의 수급이 어렵기 때문이다. 아직 배아줄기세포는 연구개발 초기단계이기 때문에 어느 정도 성과가 나타날때까지는 동물의 난자를 활용하는 것이 필요하다는 입장이 존재한다.
체세포복제 배아연구는 체세포핵을 정상인에게 탈핵,난자에 이식하여 배아생성 연구이고 하는여성의 난자가 필요하지만 동물도 가능해  새로운 종의 탄생가능성이 우려 되었다.