세관의 주된 업무는 본질적으로는 19세기 중반까지 세관이 담당한 바 그대로 존속하고 있다. 이 임무에는 1930년  관세법(Tariff  Act  of 1930)에 따른 수입관세의 산정과 징수, 미국으로 들어오는 사람, 수송설비, 화물 그리고 우편물에 관한 서류작성, 관세관련 사기의 방지, 수출관리 법(Export Administration Act) 등 수출규제법규의 집행, 각종 항해법규 의 관장, 마약 및 기타 금제품 밀수 방지를 위한 법집행 책무, 각종 소비 자 보호 법규의 집행, 사기적 수출입 무역관행의 방지 그리고 은행보안법 (Bank Secrecy Act)상의 보고 요구의 집행 등이다. 1988년 의회는 또한 면세판매사업의 규제를 업무로 추가시켰다.
세관의 주요 업무는 수입관세의 산정과 징수, 관세관련 사기 방지, 수출규제 법규의 집행 등 19세기 중반의 업무가 그대로 존속되고 있으며 '88년 면세판매사업 규제 업무가 추가되었다.