설계와 개발과정에서 완성된 개념적 모형을 적용한 대상 학교는 부산광역시에 소재한 A초등학교이며, 학습컨설팅 의뢰학생은 A초등학교 6학년 학습부진학생 15명이다. A초등학교는 학습부진학생들의 자기주도적 학습능력 향상 문제를 의뢰하였다. 연구대상학생은 2011년 3월에 부산시교육청에서 실시한 학력평가 결과에서 학업성취기준에 도달하지 못한 학생들이다. 처음 학습컨설팅에 참여한 학생은 21명이었지만, 한 학기 간 진행되는 학습컨설팅 개입 프로그램에 1회 이상 결석을 하였거나 사전-사후 검사를 성실히 이행하지 않은 학생을 6명을 제외한 나머지 15명의 학생을 대상으로 효과검증이 이루어졌다. 통제집단의 경우 같은 학교 내에서 선정을 하는 것이 좋으나, A학교의 학습부진학생 전체가 학습컨설팅의 의뢰대상이었기 때문에 A학교와 학교환경과 학교규모가 비슷한 B학교의 학습부진학생 15명을 통제집단으로 하였다. B학교의 학습부진학생 판별기준은 A학교와 동일하다.
연구는 A초등학교 6학년 학습부진학생 15명을 대상으로 효과검증이 이루어졌다. 통제집단은 같은 학교에서 선정해야 하지만 의뢰대상이 A학교 부진학생 전체여서 규모가 비슷한 B학교에서 A학교와 같은 기준으로 판별된 부진학생 15명을 통제집단으로 하였다.