단, 백합이 봄부터 가을까지 시기와 종패 크기에 관계없이 폐사가 지속적으로 진행되어 생존율이 각장 3cm 종패에서 6cm까지 성장하는 데 40% 내외로 높지 않다는 것이 위협요인으로 작용할 수 있다. 백합 폐사의 원인을 규명하고 생존율을 안정화시키는 노력이 성공적인 복원을 위해 필수적이다. 또한 어업인과 관광객 등의 일반 국민의 남획으로 인해 산란용 모패자원 및 치패 자원이 고갈되고 있는 것도 위협요소이다. 생산량이 급감한 품종이므로 산란용 모패 및 치패 관리를 위한 제도적 장치를 마련하여야 한다. 중국산 저품질‧저가의 활백합이 국내에 수입되어 유통되고 있어 국내산 백합이 고품질 고급패류로서의 이미지 손상 우려가 있는 것도 향후 위협요인으로 작용할 수 있다. 고급 품종 및 고부가가치 품종에 대해서는 저가‧저품질의 수입산과 시장차별화할 수 있도록 국내 원산지 표시 및 이력관리, 지역특산품화, 브랜드화 등의 전략 마련이 필요하다.
백합의 경우 지속적 폐사 원인을 밝혀 복원작업에 힘써야 한다. 또한 남획을 방지하여 산란용 모패와 치패 관리를 제도적으로 해야 한다. 한편 저가의 중국산 활백합 수입 또한 위험요인이다. 이에 맞서 고급품종의  브랜드화 전략을 모색해야 한다.