여타 질환과 비교하여 HIV 감염인에 대한 의료차별 발생 원인의 차이를 살펴보기 위해서 5가지의 질환을 임의로 선정 후 이들 질환과의 차이를 비교분석을 하였다. 대조군으로서 차별이 없을 것으로 예상되는 일반적인 질환으로 고혈압을 결정하였다. 차별이 존재한다고 알려진 질환으로 정신질환 중에는 조현병을 선정하였고, 신체장애질환 중에는 다운증후군을 선정하였다. 이 외에도 감염성 질환 중 감염력이 상대적으로 높은 질환으로는 신종 인플루엔자를, HIV 감염과 전파 기전이 유사한 질환으로는 B형 간염 및 간경화를 각각 선정하였다. 상기 5가지 질환에 HIV 감염을 포함하여 총 6가지 질환별로 의료차별 발생 원인이 무엇이라고 생각하는 응답자의 의견을 물었다.
HIV를 앓고 있는 사람에 대한 의료적 차별의 현황을 밝히기 위해 고혈압, 조현병 등을 대조군으로 선정하였다. 