보건산업 R&D 투자가 중장기적으로 나가야 방향은 다음과 같다. 첫째, 복지향상은 건강, 교육, 안전 등과 같은 다양한 분야에서의 문제들이 얽혀 있는 매우 복잡한 국가적 과제이다. 보다 큰 정책효과를 얻기 위해서는 문제의 복잡성을 직면하여 유연한 문제해결 방식을 모색하는 노력이 필요하다. 예를 들어 장애인의 사회참여를 지원하기 위한 이동성 향상의 문제를 해결하기 위해서도 한 부처의 정책사업으로는 역부족이다. 휠체어와 같은 기기의 개발뿐만 아니라, 교통체계 및 주거생활 개선 등이 뒤따라야하기 때문이다. 따라서 복지분야에서의 정책이 갖는 태생적 복잡성을 고려한 정책결정체계가 필요하며, 이를 위해서는 부처 간 협력이 무엇보다 요구된다.
보건 산업 R&D 투자는 중장기적으로 복지분야 정책이 갖는 본질적 복잡성을 고려하고 부처 간 협력을 바탕으로 한 정책결정체계를 마련해야 한다.