고등학교에 대한 평가 기준과 학부형의 선호도가 서울대학교에 몇 명을 합격시켰는가로 재단되는 현실 풍토에서 우수한 학생들을 더 키워주기 위한 선행교육을 금지하는 것은 학교의 자율성을 훼손하는 것으로 간주할 수도 있다. 물론 모든 학교에서 동시에 선행교육을 하지 않는다면 공정한 경쟁이 될 수 있지만 역시 문제는 있다. 대도시에서는 부모에게 충분한 경제력만 있으면 학교에 의존하지 않고도 얼마든지 자녀에게 선행교육을 시킬 수 있기 때문이다. 일부 대도시 지역의 학교는 사교육과의 경쟁에서 뒤처지지 않도록 최상위권을 위한 선행교육을 제공하려는 욕구가 강해 공교육 정상화법 시행 이전부터 관할 교육청에서 자체적으로 학교 정기고사의 선행 출제 여부를 점검할 정도였다. 그러나 농어촌지역이 많은 교육청의 상황은 다르다. 해당 군(郡)내에 고등학교 대상 학원이 전무후무한 곳이 태반이다. 선행교육이라기보다는 학교에서 수능 이전에 진도를 종료할 수 있도록 서둘러 수업을 진행하는 정도이다.
선행교육 금지는 대학 합격률로 재단 되는 고등학교의 현실 평가 풍토에서 학교의 자율성을 훼손 하는 것이다. 모든 학교에서 선행교육을 하지 않는다고 하더라도 충분한 경제력으로 학교 외 선행교육이 가능하므로, 공교육의 선행 금지만으로는 공정한 경쟁이라 볼 수 없다.