DBT의 조직 구조는 제도화과정에서 지속적으로 바뀌었다. 먼저 상설기관으로 확립되기 이전 시기(1986-1994)까지 DBT는 의회 기술위원회에서 나온 9인의 의회 위원회가 DBT와 의회 사이의 매개(liason)로 존재했고, 15인의 예산 책임 의무를 맡은 위원들과 5-13인의 상설연구인력으로 이루어졌다(Kluver, 2000). 상설기관이 된 1995년 이후로는 연구부에 의해 선임되는 이사회(the Executive Board)의 의장과 10인의 임원들(연구부장관에 의해 3인, 시민계몽네트워크에 의해 1인, 공무원 노동조합에 의해 1인, 노동조합연대에 의해 1인, 고용인조직연합에 의해 1인, 덴마크 무역 발전 위원회에 의해 1인, 지방시의회에 의해 1인, 연구위원회에 의해 1인 선출), 덴마크의 수많은 조직체들과 연구부장관에 의해 선임되는 50명의 대표위원회(the Board of Representatives) 위원들, 그리고 12명의 상근인력이 프로젝트 관리와 커뮤니케이션 활동을 맡는 사무국(the Secretatriat)으로 재편되었다(Kluver, 2000).
DBT의 조직 체계는 지속적으로 재편되었다. 1994년까지 의회 기술위원회의 위원들이 DBT와 의회 간 매개 역할을 했고, 1995년 이후의 DBT는 상설기관 체제를 갖추면서 연구부와 덴마크의 조직체로부터 선임된 임원 및 위원들과 상근인력이 프로젝트 관리를 담당하는 사무국 체제로 바뀌었다. 