식중독의 치료에 있어 항생제의 투여는 필요하지 않으나, 세균에 의한 감염이 의심되거나 대변 도말검사에서 잠혈이나 백혈구가 다수 관찰될 때, Giardia 감염이 의심될 때 경험적으로 항생제를 투여하게 된다. 감염에 의한 설사환자에서 항생제의 사용이 인정되는 경우는 이질, 여행자설사, 위막성 대장염, 콜레라, 기생충 질환 등이며, 또한 면역억제환자, 종양환자, 심장판막 질환, 인공혈관이나 인공관절 삽입환자, 용혈성 빈혈, 신생아나 고령의 환자에서는 항생제의 사용을 고려하게 된다. 적절한 항생제의 투여는 질환의 경과를 줄이고 전파를 차단할 수 있다.
식중독의 치료에 있어 항생제의 투여는 필요하지 않으나 특수한 경우에 한해서 적절한 항생제의 투여는 질환의 경과를 줄이고 전파를 차단할 수 있다.