‘감초’, ‘작약’, ‘황기’, ‘지모’ 등과 같이 다년생을 수확하는 약용작물은 수확연한도 중요하다. 재배의 편의성과 자금 회전 등의 이유로 단년 근 재배가 많은 ‘황기’는 아스트라갈로사이드나 총 플라보노이드 함량 이 1〜2년생에 비해 3년생에서 월등히 많아 3년생 이상의 황기를 10월 이후 첫 서리 전까지 수확하는 것이 좋다. 다만 한약재로 이용하는 약용작물은 ‘한약재표준제조공정지침’을 준수하여야 한다. 공정서에는  약용작물의  수확시기와 이용 부위, 방법 등이 명시되어 있으므로 한 약재 생산을 목표로 하는 경우에는 주의가 필요하다.
약용작물은 수확연한이 중요하며, 특히 황기는 재배 편의성, 자금 회전 등을 이유로 10월 이후 첫서리 전까지 수확하는 것이 좋다. 