한정애의원안은 환경부를 동물원, 수족관 및 식물원 관리의 주무부처로 지정하고 있으므로, 유관 부처에서 이에 반발하게 된다. 국회 논의과정에서 산림청은 “식물원 관련 규정은 산림청에서는 수목원의 조성 및 진흥에 관한 법률의 수목원 개념과 중복된다”고 반발한다(국회 환경노동위원회, 2013, p.38). 해양수산부는 “수족관에 대해서는 저희 해양생태계법에 규정되어 있습니다”라고 하였고, 농림축산식품부는 “동물원에서의 인수공동전염병의 관리라든지 동물복지 차원에서의 시설관리 기준 같은 경우에는 지금 동물보호법에는 일반적으로 동물의 복지 차원에 일반적인 사항만 규정하고 있습니다만 장기적으로 시설과 복지차원의 운영기준도 만들려고 생각하고 있습니다”라고 발언하였다.
장기적으로 시설과 복지차원의 운영기준도 만들려고 생각하고 있습니다”라고 발언하였다.