합성생물학 역시 설계된 물질을 생산하는 공장이 필요한데 기존 산업과는 달리 대규모 공장설비가 아닌 다양한 사이즈의 설비 및 각 대상에 따라 다른 시설이 필요하다. 이는 현재 IT 반도체 산업의 파운드리와 비슷한 바이오파운드리는 산업이 탄생했다. 즉, 생물의 설계는 업체나 기관이 하고 이를 위탁해서 생산하는 업체들이 존재할 수 있는 협업의 비즈니스가 가능하다. 합성생물학은 유전자 설계 및 제작에 부품화와 모듈화를 기반으로 표준화를 접목하는 기술이며, 바이오 파운드리는 합성생물학 응용 및 연구 활성화를 위한 제조기술 및 시설로 인공유전체 및 유전자회로의 신속한 설계, 합성, 위탁제조, 및 성능시험을 위한 기술 및 시설로 인공유전체, 인공회로 기반의 생물체 개발 및 생물공정 프로세스의 상업화를 촉진 촉진할 수 있다. 2019년 전세계 합성생물학 기반의 협력 플랫폼인 글로벌 바이오 파운드리 연합GBA, Global Biofoundries Alliance이 결성됨에 따라 국가 간 바이오 파운드리 협업이 강화될 것으로 전망된다. 2019년 현재 미국, 영국, 덴마크, 중국, 일본, 싱가포르, 호주의 16개 기관과 업체가 이 협약을 체결하여 공동연구의 길을 열었다. 한국에서도 업체나 기관의 참여가 시급해 보인다.
바이오 파운드리는 합성생물학의 응용/연구 활성화를 위한 제조기술과 시설을 의미한다. 2019년 글로벌 바이오 파운드리 연합의 조직으로 각 국가 간의 바이오 파운드리 협업은 앞으로도 계속 강화될 것으로 예상되며, 이에 따라 한국도 업체나 기관의 참여가 필요할 것으로 보인다.