CYS-Net의 운영조직을 보면, 각 지역마다 지역 내 청소년상담복지센터를 중심으로 학교 및 교육청, 경찰관서, 보건소 및 정신보건센터, 공공의료기관, 청소년쉼터 및 청소년지원시설, 노동관서 등이 연계되어 위기 청소년을 지원한다. 지원 서비스의 종류로는 상담 및 정서적 지원 서비스, 사회적 보호 서비스, 기초생활 및 경제지원 서비스, 교육 및 학업지원 서비스, 자활지원 서비스, 의료지원 서비스, 법률자문 및 권리구제 지원 서비스, 문화활동지원 서비스 등이 있다([그림 Ⅲ-3]). 학교 밖 청소년의 경우도 위기 청소년의 범주에 속하므로 CYS-Net을 통한 지원대상자에 포함된다.
CYS-Net는 지역의 청소년상담복지센터를 중심으로 각종 기관과 연계되어 학교 밖 청소년을 포함한 위기 청소년을 지원한다. 상담, 교육 등 다양한 종류의 서비스를 지원한다.