둘째, 산출요소 가운데 논문 성과의 경우 다양한 관점에서 평가되는 것이 타당할 것으로 본다. 우선, 최근 5년간 논문 수는 단순한 정량적 관점에서 각각의 기관이 얼마나 많은 논문 성과를 가졌는가를 판단하기 위한 목적에서 채용하였다. 이와 비교할 때, 최근 5년간 논문의 평균 증가율 지표는 장․단기적 관점에서의 발전 가능성을 확인하기 위한 목적에서 채용한 지표이다. 비교 준거가 되는 8개 기관들은 장기간 해양과학 연구를 이끌어온 명실 공히 선진 연구기관인데 비해, 비교 대상이 되는 우리나라의 기관들은 상대적으로 후발주자로서의 성격을 지닌다. 따라서 정량적 성과 그 자체를 비교하는 것도 의미가 있을 것이지만, 최근 논문 성과의 증가율을 확인하는 것을 통해 장기적 관점에서의 발전 가능성을 확인할 수 있다. 또한, 정량적인 논문 성과 이외에도 정성적 관점에서의 논문 성과를 비교해 볼 필요가 있으며, 이는 피인용 지수 또는 상위 1% 또는 10% 학술지 논문 비율을 상호 비교하는 것을 통해 확인이 가능하다.
논문 성과의 경우 여러 관점에서 평가되어야 한다고 생각한다. 최근 5년간 논문 수는 단순히 정량적인 관점에서의 성과를 알 수 있다. 따라서 최근 논문 성과의 증가율을 통해 향후 발전 가능성을 확인하고, 이외에도 상위 학술지 논문 비율을 비교하는 방법도 있다.