우리나라의 경우에는 생명윤리법이 제정되기 이전부터 이종간 핵이식 행위에 대해 상당한 의견대립이 있었다(송성수 외, 2003). 송성수 등(2003)에 따르면, 이종간 핵이식은 이를 허용할 것을 요구하는 생명공학계 및 과학기술부의 의견과 이를 금지시키려는 시민단체 및 복지부의 입장이 첨예하게 대립한 것이다(송성수 외, 2003). 2004년 제정당시에는 탈핵된 인간의 난자에 동물의 체세포핵을 이식하는 행위만 금지되었고, 이후 2009년에 탈핵된 동물의 난자에 체세포 핵을 이식하는 행위까지 추가로 금지되었다(생명윤리법 제12조 개정사안, <표 6-6> 참조). 결과적으로 국내에서는 이종간 핵이식 행위는 원칙적으로 금지되어 있는 상황이다.
2004년 생명윤리법 제정부터 인간의 난자에 동물의 체세포핵 이식을 금지하고 이어 2009년 동물의 난자에 체세포핵 이식이 금지되어 국내에서는 이종간 핵이식 행위가 금지되어 있다.