국가 R&D 재정 효율화라 함은 R&D 재정의 효율적 사용을 전제하며, R&D 재정의 효율적 사용은 다시 R&D 수행에 있어서의 높은 생산성을 의미한다. 따라서 국가 R&D 재정의 효율화를 위해서는 정부 R&D 투자의 생산성에 영향을 미치는 요인들을 확인하여 평가하고 이에 대한 개선 방안을 모색하는 것이 중요하다. 우선, 정부 R&D 투자의 생산성에 미치는 핵심 요인들과 이들 간의 관계 모형을 제시하고자 한다. 그리고 이들 개별 핵심 요인들이 어떻게 작동하는가에 대한 각각의 논리모형을 설정한 후, 각각의 논리모형을 구성하는 세부 요인들 중 우선순위가 높고 정책적으로 조정이 가능한 것들을 선별하여 평가하고 각각에 대한 정책적 개선방안들을 모색하고자 시도한다.
국가 R&D 재정 효율화는 그 수행에서의 생산성을 의미한다. 이에 생산성에 영향을 주는 요인들을 확인하여 개선을 위한 모형을 제시하며, 핵심요인과 세부요인을 고려하여 정책의 개선방안을 찾는다.