그러나 엄청난 인적, 물적 교류 확대에도 불구하고 양국 간 대립과 갈등이 오히려 심화되는 동북아 패러독스 현상이 나타나고 있다. 특히, 한반도 비핵화와 강제징용 해법을 둘러싸고 한일 양국 관계는 크게 악화되고 있다. 2018년 10월 국내 대법원의 강제동원 피해자 승소 판결 이후 역사 갈등이 깊어진데다, 제주 관함식에서 일본 해상자위대 욱일기 갈등으로 인한 불참, 12월 발생한 레이더 조사(照射)문제까지 겹치면서 한일관계는 더욱 악화되었다. 2019년 7월 1일, 아베정권은 한국에 대한 경제보복을 실시하였고, 수출규제에 이어 한달 뒤인 8월 2일 화이트국가에서 배제하였다.
인적, 물적 교류는 크게 확대되었으나 역사 갈등, 레이더조사 문제, 아베의 경제보복, 화이트국가 배제 등 한일 양국의 갈등과 대립은 심화되고 관계는 악화되었다.