필터는 제품에 부정적인 영향(예, 구성성분을 제거하거나 제품에 물질을 방출하는 것)을 주지 않아야 한다. 멸균필터의 완전성은 필터가 공정에 의해 손상 될 것으로 의심되는 경우에는 사용 전에 검증되어야 하고, 사용 후에 즉시 온라인 시험(On-line Test)을 통해 적절한 방법(예, 버블포인트, 확산율, 침수성 또는 압력유지 시험)으로 확인되어야 한다. 만일 필터 완전성이 시험될 수 없다면(예, 작은 배치사이즈), 위험평가를 기반으로 한 대체가능한 접근방법이 적용될 수 있다. 한 번 사용한 동일한 필터를 다른 배치에 사용하여서는 안 된다. 또한, 온라인(On-Line) 상태로 밸리데이션 된 경우를 제외하고는 동일한 필터를 작업 당일에 한 번 이상 사용하여서는 안 된다.
필터가 제품에 미치는 부정적 영향은 없어야 하며, 사용 전/후에 완전성이 확인되어야 한다. 필터의 완전성을 위해 동일한 필터를 다른 배치에 사용하거나 당일에 여러 번 사용하지 말아야 한다.