사업내용을 비교하면 의과학지식센터는 의과학 연구에서의 연구 수월성을 실현하기 위하여 의과학 전자도서관 운영, 인간유전체 연구의 성과 관리, 임상연구기관에서 생성된 자료관리 지원, 질병관리본부의 조사자료에 대한 보건의료 전산자료 연계를 주요 사업내용으로 한다. 사회복지통합관리망(행복e음)은 사회복지서비스 지원 대상자의 자격정보 관리를 통하여 일선 복지 담당 공무원에 대한 복지상담 정보제공을 주요 사업내용으로 하며, EHR사업단의 주요 사업내용은 환자 진료환경 개선을 위하여 임상의사 및 환자를 대상으로 평생 전자건강의무기록을 제공하는 것이다.
의과학지식센터는 의과학 전자도서관 운영 등을, 행복e음은 담당 공무원에 대한 복지상담 정보제공을, EHR사업단은 평생전자건강의무기록 제공을 주 사업내용으로 한다. 