줄기세포 재생의료 연구를 지원하기 위해 줄기세포주 등록제 이외에 2012년 10월 국가줄기세포은행이 설립되었다(국가줄기세포은행 웹페이지 2015.4.11.). 줄기세포주 등록제가 국내에 존재하는 인간배아줄기세포주의 현황을 집계하기 위한 제도라면, 국가줄기세포은행은 실제로 줄기세포주를 기탁 받아 연구자들에게 분양해 주는 서비스를 제공하는 기관이다. 그 외 주요업무로는 줄기세포주를 수립, 세포주에 대한 특성 분석, 고품질 줄기세포주의 대량 배양 등이 있다.(국가줄기세포은행 웹페이지 2015.4.11.). 2015년 8월 기준으로 기탁 접수된 줄기세포는 19주, 분양 가능한 줄기세포는 4주이며, 이 중에서 2주는 서울대 인구의학 연구소에서 기탁하였고, 나머지 2주는 국립 보건 연구원에서 내부 기탁한 줄기세포이다(국가줄기세포은행 웹페이지 2015.4.11.).
줄기세포은행은 줄기세포주를 기탁받아 연구자들에게 분양해 주는 것을 업무로 하는 기관이다. 그 외에 주요 업무로 줄기세포주 수립, 세포주 특성 분석, 고품질 줄기세포주의 대량 배양 등이 있다.