동일본 대지진 지진해일 피해의 가장 큰 시사점은 바로 방사능 문제이다. 후쿠시마 원자력발전소 붕괴는 국제원자력사고등급(INES)에서 가장 높은 등급에 해당하는 7등급으로, 이는 1986년, 구소련에서 발생한 체르노빌 원자력발전소 사고에 해당하는 등급과 같다. 체르노빌 주변의 방사성 원소가 충분히 감소하려면 900년 이상이 걸릴 것이라고 하니, 후쿠시마 주변의 방사성 원소가 감소하는 데에는 엄청난 시간이 요구될 것으로 보인다. 또한, 대부분의 원자력발전소는 냉각수 공급을 위해 해안가에 위치하는데, 이는 앞으로도 제2, 제3의 후쿠시마 원자력 발전소 사고가 발생할 위험성을 가지고 있다는 것이다.
후쿠시마 원자력발전소 붕괴의 방사능 문제 해결에는 900년 이상의 엄청난 시간이 요구될 것이며 해안가에 위치하는 원자력발전소의 특성상 앞으로 제2, 3의 사고 발생 위험도 있다.