제정안 제2조는 ‘수소연료공급시설’을 수송용 연료전지에 수소를 공급하는 시설에 제한하여 정의하고 있다. 산업통상자원중소벤처기업위원회 전문위원의 검토의견처럼 용도를 제한하지 않고 연료전지에 수소를 공급하는 시설로 수정할 필요가 있는 것으로 보인다. 다음으로, 제정안 제6조는 산업통상자원부장관으로 하여금 수소경제사회 이행과 관련된 법령의 합리적인 개선을 위하여 관계 중앙행정기관의 장에게 의견을 개진하거나 개선을 권고할 수 있도록 하고 있다. 그러나 개선의견 또는 권고를 받은 중앙행정기관의 장은 특별한 이유가 없으면 이를 존중하여 해당 법령을 제정하거나 개정하도록 정한 법안은 국토교통부, 환경부, 과학기술정보통신부 등의 정책방향과의 충돌이 발생할 수도 있다. 관계 부서나 기관과의 협의나 의견을 제시할 수 있는 기회도 마련되어야 할 것이다.
제정안 제2조의 '수소연료공급시설'에 대한 정의를 수정할 필요가 있다. 또한 제정안 제6조의 '의견을 개진하거나 개선을 권고할 수 있는 자'에 대하여 관계 부서나 기관도 협의나 의견을 제시할 수 있도록 포괄하여야 한다.