둘째, 국내 바이오 벤처의 제휴가 보다 활성화되기 위해서는 제약산업 부문의 구조조정이 더 필요하다. 일본의 경우 1969년 이후 76회 약가인하를 했고, 이로 인해 제약회사들이 80년대부터 M&A를 해서 지금 글로벌 top 20에 3개사가 있다. 우리나라도 제약사 간의 합병을 통해 몸집을 불리고 이 과정에서 모아진 자금으로 벤처기업과의 제휴에 보다 적극적으로 나서게 되면 우리나라의 제휴 환경이 보다 활성화될 것이다. 우리나라의 제약회사들은 전통적으로 신약 개발보다는 해외 제품의 도입과 유통, 그리고 제네릭(Generic) 판매 중심으로 성장해 와서 이러한 전환이 일본보다 더딘 측면이 있다. 그러나 최근 약가인하, cGMP 도입, 한미 FTA 체결 등 환경 변화로 인해 제네릭 중심의 사업 구조를 더 이상 유지하기 어려워지고 있어서 보다 적극적으로 신약 개발에 나서고 있는 상태이다. 이러한 제약업계의 변화가 진전될수록 바이오 벤처와의 제휴도 더 확대될 것으로 기대된다.
일본의 예로 알수 있듯이 국내 제약사들도 합병과 같은 구조조정으로 몸집을 키우고 자금을 끌어들여 바이오벤처와의 제휴를 더 활성화할 필요가 있다. 신약개발보다 제네릭이 중심인 국내 제약사의 특성상 더욱 그러하다.