집행정지의 운영과정에 있어서 발생할 수 있는 공정성 및 투명성의 시비로부터 자유로울 수 있는 최선의 방안은 수형자에게 교정시설에서 교정시설 외부와 동일한 정도의 의료수준을 조성하여 질병으로 인한 치료목적의 형집행정지를 차단하는 것이라고 할 것이다. 하지만 교정시설 내 의료수준의 향상이라는 조건은 국가재정의 문제와 직결된 문제이, 대학병원급의 수준을 모든 행형시설에 적용시킨다는 것은 현실적으로도 거의 불가능에 가까운 일이라고 할 수 있기 때문에 기존 행형시설의 획기적인 변화를 기대하는 것은 무리가 있다. 개정안과 같은 질병에 대한 치료목적의 형집행정지에 있어서 주거지라고 할 수 있는 의료기관의 선정과 관련하여 이를 법무부령으로 미리 정한 장소로 한정하자는 주장은 형집행정지자의 수용시설을 제한하여 도주를 예방하고 국민감정에 반하는 호화생활 등을 차단하려는 취지로 분석된다. 하지만 전담 의료기관의 지정은 형집행정지자의 잦은 이용이라는 효과로 인하여 일반인의 기피현상이 초래될 수 있다는 점, 형집행정지자마다 개별적으로 병종이나 증세가 다양할 수밖에 없기 때문에 수용자의 증상에 맞추어 수용시설을 정할 필요가 있다는 점 등의 이유로 인하여 타당하지 않다고 본다.
집행정지의 공정성, 투명성의 증진을 위해 수형자에게 외부와 똑같은 내부 교정시설을 제공해야 한다. 하지만 이는 국가재정, 의료수준 조정 등에 어려움이 있어 진행하기 어렵다. 또한 의료기관의 장소를 지정해 도주를 방지하자는 의견도 있다. 하지만 이는 일반인들에게 피해를 주고 수용자 증상에 초점을 맞춰야 하기에 어렵다. 