또한, 사립대학의 경우 자의적으로 해석될 수 있는 내규에 따라 정년 연한이나 정년연장 인정여부를 결정하고 있기 때문에, 학교 측과 연구인력이 갈등을 빚는 경우도 발생하고 있다. 2013년 12월 도시샤대학 아사노 켄이치 교수(65세)는 정년연장이 인정되지 않는 것은 부당하다며 소속대학에 대해 지위 보전 등을 요구하는 가처분을 교토지방재판소에 제기했다(야마구치, 2013). 아사노 교수 측은 동 대학은 만 65세가 정년연한이지만 대학원 임용교수에 대해 1년 단위로 만 70세까지 일할 수 있는 제도가 있음에도 불구하고, 학내 정치적 이해관계 때문에 정년연장이 거부되었다는 것이다. 한편, 학교 측은 아사노 교수의 연구 실적 등이 기준에 미치지 못한다고 지적했는데, 동 소송은 2015년 10월 현재 진행 중으로 판결이 내려지지 않았지만, 정년연장과 관련한 실적 인정의 기준 등이 공정하고 투명하게 관리될 수 있는가에 대한 시범 케이스로서 향후 대학의 정년심사절차에도 영향을 줄 것으로 보인다.
사립대학의 정년 연장 인정여부의 결정으로 갈등을 빚고있는 가운데 일본 도시샤대학 아사노 켄이치 교수의 지위 보전 요구을 위한 가처분을 교토지방재판소에 제기해 거부된 일례는 향후 대학의 정년심사절차에 영향이 끼칠 것으로 예상되고 있다.