행정학자와 ICT전문가들은 자칫 미래창조과학부와 방송통신위원회 간 갈등은 의사결정을 지연시키고 정치적 공방으로 비화될 경우에 정보통신기술(ICT) 발전과 이용자 편의를 저해할 가능성이 높을 것을 우려하였다. 즉, 정부조직법을 입법화 하는 과정에서 필요한 제도와 장치를 추가해야 한다는 것인데, 미래창조과학부와 방송통신위원회로 행 정이 사실상 이원화된 만큼 양 기관 간 정책협의체 구성과 운영이 필요하다는 것이다. 이와 동시에 과거 부처간 임의적으로 협의체를 구성․운영했지만 법적 구속력이 없었다는 한계를 극복하기 위해 양해각서(MOU) 교환 등을 통한 향후 운영과정에서 보완․ 협력을 도모하는 방안 강구도 필요하다고 주장하였다.
전문가들은 미래창조과학부와 방송통신위원회 간 갈등을 보고 정부조직법을 입법할 때 법적 구속력에 버금가는 MOU 교환 등을 통해 양 기관간 협업하는 대책도 필요하다고 했다.