평화유지활동에 대한 지휘권은 유엔안보리로부터 위임명령을 받은 사무총장에게 있다. 하지만 사무총장이 현장에서 통제할 수 없기에 각 활동의 최고 책임자인 사무총장 특별대표를 임명하여 자신의 임무를 재위임한다. 따라서 특별대표는 위임명령 범위 내에서 벌어지는 모든 활동에 대해서 사무총장을 대표하여 임무를 수행하는 최고 관리자이며 모든 활동사항에 대해서 유엔본부의 DPKO(Department of Peacekeeping Operation)와 사무총장에 보고하게 되어 있다. 특별대표의 임무는 평화활동의 촉진자로서 정치전략 및 실천계획을 수립하고, 다양한 주체들을 상대로 평화문제를 주도적으로 해결한다. 또한 중립적 위치에서 민감한 문제를 균형 있게 다루면서 신뢰를 구축하는 유엔의 대표로서 역할을 한다. 그리고 해당 활동의 최고 책임자로서 모든 활동 및 결과에 책임을 지며, 임시 또는 과도 행정관으로서 특정 국가에서의 입법, 사법, 행정권을 행사하고, 임시정부의 대표로서 정부기능을 직접 대행할 수 있다.
유엔 사무 총장은 특별대표를 임명하여 자신의 임무를 재위임한다. 특별대표는 평화활동의 촉진자, 중립적 위치의 유엔의 대표로서 역할을 한다. 또한 행정관 및 임시정부의 대표로서 정부기능을 직접 대행할 수 있다.