이처럼 경쟁을 통해 기술력과 장비 모두 발전은 하고 있으나 산업내부에서는 파산과 인수합병이 계속되고 있다. 그 결과 2013년에는 몇 개의 기업을 제외하고는 모두 파산하거나 인수 합병되었다. Helicos Biosciences는 3세대 장비를 개발하는 과정에서 시퀀싱 에러 문제를 해결하지 못하는 등 기술적 난관을 겪었고, 매출 부진 속에 고전을 면치 못하였다. Pacific Biosciences 역시 재정적, 법적 위기 속에서 경영진을 교체하는 등 경영에 어려움을 겪은 바 있다(Hayden, 2009; 2012). 염기서 열 분석 장비 시장의 치열했던 기술 경쟁은 2013년을 기점으로 조금 누그러졌다. 지난 몇 년 간이 혁신적인 시퀀싱 원천 기술의 확보기간이었다면, 2013년 이후는 개발된 기술들을 실제로 제품으로 구현하여 상용화될 수 있게끔 정교하게 다듬는 시기라고 할 수 있다(Hayden, 2013).
2013년 이전 시장 경쟁은 매우 치열하여 기술력과 장비가 발전하는 반면 기업 간의 파산과 인수합병이 빈번하게 발생되었다. 2013년부터는 기술 경쟁이 점차 누그러졌고 개발된 기술들을 실제로 구현해내는데 노력하기 시작하였다.