방송통신위원회는 지상파사업자의 입장을, 미래창조과학부는 유료방송사업자의 입장을 대변하고 있다. 이에 정부 부처간 갈등이 벌어지는 양상이 나타나서는 곤란하다. 업무협업의 방법은 ① 이익단체(방송협회-지상파방송사, 케이블협회-SO방송사), 방송통신 위원회, 미래창조과학부가 참여하는 실무위원회를 구성하여 대가 산정 관련 사항을 조 정하고 협의가 되면, ② 각 기관의 장이 모여 실무위원회의 협의사항을 합의하는 방식 이다. 만약 실무위원회에서 일정한 안을 도출하지 못하거나 자율협상이 타결되지 않을 경우, ③ 방송통신위원회와 미래창조과학부가 조정위원회를 구성하고 강제 조정하는 방법도 필요할 것이다.
방통위와 미래창조과학부의 업무협업은 각 주체가 참여해 실무위원회에서 협의하고 기관장이 협의사항을 합의하고 실무위원회에서 협의가 안되면 강제 조정이 필요하다.