최상위 정책 결정에서 주요하게 지적된 사항은 중장기 전략의 필요성과, 정책결정 시 전문가의 참여와 정책평가 시스템의 강화이다. 추진체계와 R&D 예산에서는 최상위 컨트롤타워 문제, 부처이기주의, 장기투자와 전 주기적 예산지원 등의 문제가 제기되었다. 본 연구에서 거버넌스 문제를 도출해 내기 위해 분야를3가지로 구분해 보았지만 실제로 이러한 문제들은 복잡성과 상호 의존성이 상당히 높고 문제별로 해결하기는 어렵기 때문에 과학기술정책 거버넌스 구조에서실제 발생하는 수준 1과 2로 나누어서 종합적 접근을 바탕으로 개선사항을 제시해야 한다.
거버넌스 문제의 복잡성, 상호 의존성 때문에 중장기 전략 필요성, 전문가 참여, 평가시스템 강화의 3가지 분야로는 해결에 한계가 있기에 종합적 접근이 필요하다.