분석적 정확성이 확보된다고 하더라도 더 중요한 문제가 남는데, 그것은 질병 위험도에 대한 예측이 얼마나 임상적으로 검증되고 타당한 정보인가라는 문제이다. 예를 들어 ‘당뇨병에 걸릴 확률이 평균보다 20% 높다’는 예측은 객관적인 임상연구를 통해 검증되지 않는 한 임상적으로 유효한 주장이 되기 어렵다. 또한 그러한 예측이 가족력이나 생활 습관에 대한 문진을 통해 예측하는 기존 방식보다 얼마다 더 효과적인지도 의문이다. 이러한 이유로 복수의 질병에 대한 종합적인 위험도 예측 서비스가 FDA와 같은 규제 당국에서 정식 허가를 받기는 매우 어려워 보인다.
질병 위험도를 예측하기 위한 분석적 정황석 확보는 사실상 임상적 검증이 불충분하다. 개인의 유전력, 질병유무, 생활습관 등에 대한 문진이 더욱 효과적일 것이다.