청소년 참여예산제도는 ‘정책 수립 절차에 청소년의 참여 또는 의견 수렴을 보장’(청소년기본법 제 5조의 2-청소년 자치권 확대)‘ 하기 위해 조직된 청소년 참여기구(예: 청소년 참여위원회)의 기능과 유사한 측면이 있다. 그러나 청소년 참여예산제도는 단순히 청소년의 의견 수렴 뿐만 아닌 청소년의 정책 실현을 위한 예산 편성권·의결권을 부여한다는 점에서 청소년 참여기구와 차별성을 갖는다. 즉, 청소년 참여예산제도는 정책 제안, 정책 및 사업 개발, 정책 선정 및 예산 집행 결정에 청소년이 직접 참여하며 자신들의 제안을 실현 시킬 수 있다는 점에서 청소년 정책 참여의 통합적인 성격을 갖는다.
청소년 참여예산제도는 청소년들의 활동이 정책 제안에서 그치지 않고 제안의 실현까지 이어져 청소년 참여기구와 달리 통합적인 성격을 갖는다.