SPE는 카트리지 하나씩 사용할 수도 있으나 대개 전용의 vacuum manifold 장치를 이용, 다수의 카트리지를 동시에 사용하여 간편하게 분리작업을 수행할 수 있다. 그러나 사용하는 충전제 용량에 한계가 있어 다량의 불순물을 함유한 추출액을 정제할 경우 용량 초과로 분리의 효율이 감소하는 단점이 있다. 최근에는 분말 형태의 이동상을 추출물에 첨가 및 혼합 후, 원심분리하여, 그 여액만을 취하는 매우 편리한 형태의 dispersive SPE (dSPE)도 많이 이용되고 있는데, 편리한 실험 방법 외에도, 불순물의 종류 및 혼입 정도에 따라 혼합하는 고정상의 종류 및 양을 자유롭게 조절할 수 있다는 장점이 있다.
SPE는 여러 개의 카트리지로 효율적으로 분리할 수 있으나, 충전제 용량을 초과할 경우에는 불순물들을 다 걸러내지 못하여 최근에는 분말을 이용하는 dSPE를 많이 쓴다.