I-NERI 추진에 있어 양국은 자국에 이익이 되는 과제를 제안하고, 이에 대해 협의를 통해 선정하는 상호 호혜 원칙에 바탕을 두고 있다. 현재까지 수행된 과제들의 경향을 살펴보면 2002년에는 선진 경수로 관련 과제를 수행하였고 2003년부터는 Gen-IV와 선진 핵연료주기 기술 관련 과제가 공동연구 테마로 선정되어 수행되었다. 최근에는 재료 등 기초연구분야가 주요 공동연구분야로 채택되고 있다. 이는 미국의 최근 연구 성향이 과학기술에 기반한 연구개발 중심으로 변화되었기 때문이며, 우리나라는 제4세대 원자력 시스템 분야에 대한 협력을 중점 화하고자 노력하고 있다.
I-NERI는 자국 이익과제를 제안하고 협의 선정하는 상호 호혜 원칙을 기본으로 하였다. 우리나라는 제4세대 원자력 시스템에 관한 협력을 과제로 촛점을 두었다.