EU 회원국 및 협력 국가와의 VET 연계를 위하여 EQF는 각국의 NQF와 조화될 수 있도록 META-EQF의 특징을 갖는다. 앞에서 살펴본 바와 같이, 성공적인 EU의 VET 선진화를 위해서는 EQF와 개별국가의 자격체계(National Qualification Framework: NQF) 간의 조화로운 연계가 필수적이다. EU의 EQF와 각국의 NQF를 간략히 살펴보면, NQF는 기본적으로 학습수준, 학습량 및 학습유형에 따라 수준(단계)을 구분하는 반면, EQF는 일반적으로 자격으로 인정되거나 통용되는 NQF에 명시된 모든 학습수준의 단계를 포괄한다. 또한 수립 주체도 NQF는 지자체 혹은 국가기관에서 담당하는 반면, EQF는 EU 회원국 상호협력과정을 통해 수립된다. 그 결과, 국가 간의 협의에 따라 EQF의 주요 결정이 이루어진다. NQF는 평가, 검증, 인증 등으로 훈련자의 학습을 인정하는 반면, EQF는 국가 간 이해당사자의 선의와 신뢰가 없다면 학습효과를 인정받기 어렵다. 이처럼 EQF의 구축과 활용만으로 VET 교육기관 및 프로그램의 질이 담보되는 것은 아니다. EQF의 기준이 EU 내 국가들에 적용되기 위해서는 이 기준에 맞춰 각 국의 NQF를 EQF와 연계시키기 위한 작업이 요구된다.
NQF는 학습수준, 학습량 및 학습유형에 따라 수준을 구분하며 각국의 지차제나 국가기관에서 담당한다. EQF는 보통 NQF의 모든 학습 단계를 포함하며 EU 회원국의 협의에 따라 수립된다. 결국 나라별 이해당사자의 신뢰가 없으면 교육을 인정받기 어렵다. EQF를 예외없이 EU에 적용하기 위해 각 국의 NQF를 EQF와 연계시켜야 한다.