맞춤 의료 기술의 다학제적, 다원천적 특성은 몇 가지 조직적 과제를 제기한다. 우선 기본적으로 정보학자와 의학자의 협업이 필수적이며, 서비스의 내용에 따라 영양학자, 스포츠과학자 등 여러 전문가들의 참여도 필요하다. 조직 차원에서는 동반진단(companion diagnostics) 의약품 개발을 위해 진단회사와 제약회사의 협력 이 보편화되었는데, 본격적인 맞춤 의료 서비스의 개발을 위해서는 병원, 제약회사, 정보기술 기업 간의 협력이 필요하다. 또한 유전자 정보, 의료 기록, 생활 기록 등 다양한 원천의 데이터를 통합하기 위한 노력이 필요하다. 이런 노력은 이미 몇몇 기업들을 통해 시도되고 있다. 유전자 분석 업체인 Pathway Genomics가 전자의료 기록(Electronic Medical Record, EMR) 회사인 Practice Fusion과 협력하고 있고, 각종 생활 기록(life log)을 저장할 수 있는 ‘HealthKit’ 애플리케이션을 만든 Apple 은 이를 의료 정보와 통합하기 위해 EMR 업체 및 유명 병원들과 협력하고 있다.
맞춤의료 기술은 몇가지 과제를 제시한다. 첫째로 정보학자, 의학자, 영약학자, 스포츠과학자, 진단회사, 제약회사, 병원, 제약사, 정보기술 기업 등의 협력을 통해 다원천 데이터를 통합하기 위한 노력이 필요하다.