생물다양성협약과 카르타헤나 의정서 내 합성생물학 적용과 관련하여서는 대체적으로 큰 이견차는 없어 보인다. 생물다양성협약과 카르타헤나 의정서가 생물안전성 및 생물안정성에 미칠 부정적 또는 잠재적 영향에 대한 대응방안을 필요로 한다는 점, 특히 카르타헤나 의정서의 경우 유전자변형생물체가 인체 건강에 미칠 위해까지 고려하도록 하고 있다는 점에서 합성생물학의 규제적 관점에 대한 당위성을 확보하는 데에도 큰 무리는 없어 보인다. 생물다양성의 보전이라는 관점에서 합성생물학으로 제기될 수 있는 문제는 국제사회 공통의 이익을 보호하기 위해 다루어져야 한다는 인식이 자리잡고 있는 것으로 보아야 할 것이다. 이와 달리 나고야 의정서 내 규정하고 있는 “생물자원 및 유전자원과 전통지식 이용과 관련된 공평한 이익의 공유”와 관련된 규정은, 빠르게 진화하고 있는 합성생물학 분야를 구체적으로 포함하기에는 한계를 가지고 있다.
생물다양성협약/카르타헤나 의정서는 생물(특히 인체)안전성과 이에 유의미한 영향들에 대한 대응방안을 살펴보기 때문에, 합성생물학은 어렵지 않게 국제사회에 기여한다는 당위성을 확보할 수 있을 것으로 보인다.