당시 독일연방정부는 주정부간 재정조정제도에 동독지역을 편입하지 않고 독일통일기금을 신설하였으며, 동독지역의 주정부 및 자치단체의 부족한 예산을 독일통일기금을 통하여 지원하였다. 이 독일통일기금의 재원의 일부는 다시 연방의 예산으로 조성되었으나 초기에는 대체로 자본시장 차입을 통하여 이루어졌다. 이러한 독일통일기금에 따른 재정이전 금액은 1991년 310억 DM, 1992년 240억 DM으로 정부부분의 통일비용 중 매우 큰 비중을 차지하였다. 통일기금에 의한 재정이전은 주로 구 동독정부로부터 위임받은 채무에 대한 원금 및 이자에 대한 상환과 동독지역 지자체의 재정수요를 충당하는 것에 사용되었다.
독일연방정부는 독일 통일 당시에 동독의 재정 문제를 해결하기 위해 독일통일기금을 새로 만들었다.