하지만 통계청에서 국가통계포털(KOSIS)를 통해 제공하고 있는 방대 한 양의 국가통계 정보와 비교할 때 어떠한 차별성을 지닐 수 있는가에 대한 고민과, 한편으로는 조사데이터의 구축 및 제공에 대한 수요가 점점 더 높아지는 최근의 상황 속에서, 기존의 보건복지통계포털에서 가장 차 별화된 영역이었으며 다양한 조사연구를 기반으로 하여 생산된 마이크로 데이터에 역량을 집중할 필요성이 대두되었다. 이에 따라 2014년부터 보 건복지통계정보시스템을 보건복지데이터포털로 개편하는 작업을 진행하 였고, 2015년, 2016년에는 이를 고도화하는 작업을 수행하였다.
최근 차별화된 영역으로 다양한 조사연구를 토대로 생산된 마이크로 데이터에 초점을 둘 필요성이 제기되면서 2014년부터 보건복지통계정보시스템 개편작업이 진행되었다.