그러나 이 정도의 양식업에 대한 생산비 및 경영비 조사의 정보로는 지역별, 품목별, 양식방법별 양식어가의 경영상태 파악이 곤란하며, 특히, 재해 등으로 인해 양식어가의 피해가 발생할 경우 지역별, 규모별, 품목별 정보의 부재로 정확한 피해 산정이 곤란한 실정이다. 그 밖에 산발적으로 발표되는 양식수산물의 품목별 생산비 또는 경영비 조사 정보는 주로 연구소나 대학 등에서 제공하고 있으나, 공식적․주기적으로 제공되지는 못하고 있는 실정이다. 일례로, 넙치, 전복 양식 품목을 대상으로 해양수산개발원 수산업관측센터에서는 최근 2년(2011~2012)동안 넙치와 전복 관측 품목에 대한 설문조사 대상 어가를 중심으로 규모별, 지역별 양식정보 자료를 제공 하였으나, 이 또한 예산상의 한계로 표본수가 부족하여 공식적인 자료로 활용하기에는 어려움이 있다.
예산상 문제로 양식정보의 지역별·품목별·양식방법별 경영현황 파악이 어렵고 특히 재해로 인한 정확한 피해 추정이 필요할 때 난관을 겪고 있다. 연구소와 대학 등에서 자료 제공을 주나 공식적·주기적인 문제로 활용이 어렵다. 