이때 사용되고 있는 평가 지표로는 ‘리더십 및 전략’ (사업 계획의 적합성, 기관장 리더십 등 20%), ‘조직 효율성’(조직 및 인사관리 적절성, 재정건전성 제고성과, 업무 프로세스 개선 실적 등 30%), ‘성과 및 환류’(자체 평가 적절성 35%, 고객감동 서비스 추진실적 10%, 전년도 개선 요구 사항 반영도 5% 등 소계 50%) 등이 사용되고 있다. 이와 같은 평가 지표에 대한 실사 결과 등을 종합하여 그 결과는 기관장 성과 연봉에 반영하고, 성과 창출에 기여한 기관 및 담당자 등에 대한 인센티브(표창과 포상금)를 제공하고 있으며, 다음 단계의 성과확산 및 제도 개선을 위한 수단으로 활용하고 있다.
이미 명시되어 있는 기준에 따라 평가를 하고 그 평가 결과를 가지고 기관장의 연봉이나 우수 담당자들에 포상금을 지급하기도 하며 성공한 제도는 다른 사업 부분에 반영하기도 한다.