글리코알칼로이드 함량은 품종의 유전적인 요인과 함께 생육기간, 수확과 수확 후 관리 등 전 과정에 걸쳐 다양한 요인이 관여한다. 특히 가뭄, 상처, 괴경의 빛 노출 등은 글리코알칼로이드 생성에 관여하는 주요한 요인이다. 감자 육질(cortex)보다 껍질(peel)에서 글리코알칼로이드 함량이 현저히 높기 때문에 일반적으로 껍질을 제거하면 글리코알칼로이드의 아린 맛과 독성은 문제가 되지 않는다. 그러나 최근 감자 전체를 이용하는 소비 경향과 편의성을 중시한 세척감자 판매가 증가하고 있다. 이러한 소매점의 진열·판매 시 형광등 사용은 글리코알칼로이드 함량을 더욱 촉진할 수 있어 식품 안전성에 문제를 유발할 수 있다.
글리코알칼로이드 함량은 유전적, 생육과 수확 전 과정의 환경적 요인이 작용하는데, 감자 껍질 제거 시 그 독성은 문제되지 않으나, 최근 세척감자 판매 증가로 안전성 문제가 유발된다.