보건관리자 선임제 도입으로 공사금액 800억원 이상 건설공사에서 안전·보건관리자 선임인원이 1.3~1.5배 증가하게 되면 산업안전보건관리비 사용 항목 중 ‘안전관리자 등의 인건비 및 각종 업무수당 등’ 사용비율이 연계하여 증가할 수밖에 없다. 안전관리자와 대등한 임금수준으로 가정했을 때, 보건관리자 선임 인원이 안전관리자 선임인원의 21.2% 수준이므로 인건비 부담률도 21% 이상 증가할 것으로 판단된다. 제한된 산업안전보건관리비 한도 내에서 인건비 등의 사용비율이 증가하는 경우 불가피하게 안전시설비, 개인보호구 구입비 등 다른 항목의 사용에 제약을 가져오게 되어 일부 부작용이 우려된다. 이런 측면에서 건설현장의 안전·보건관리의 불균형을 최소화하고 부실화를 예방하기 위해 산업안전보건관리비의 현실화를 위한 노력이 뒤따라야 할 것으로 보인다.
보건관리자 선임은 산업안전보건관리비의 인건비 부담을 증가시킨다. 제한된 한도 내에서 인건비 비율의 증가는 다른 항목의 재정 사용에 일부 부작용이 우려되므로 건설현장의 관리 불균형을 최소화할 수 있는 현실화 노력이 필요하다.