정부가 제시한 6년제 약학교육 시행의 기대 효과는 크게 다섯 가지로 구분된다. 첫째, 대학 입시 과열의 주요 원인으로 여겨지고 있는 의대, 약대 입시를 없앰으로써 고등학생들의 입시과열을 해소하고 고교 교육을 정상화시키는 것이다. 둘째, 학생들은 고교 졸업 직후보다는 보다 자신이 원하는 전공과 직업세계를 성숙한 판단으로 자유롭게 선택할 수 있도록 하여 사회적 효율성을 증대시킬 수 있다. 셋째, 약학대학은 인성과 적성을 갖춘 학생을 선발할 수 있다. 넷째, 폭넓은 교양을 갖춘 준비된 예비 약사를 양성할 수 있다. 다섯째, 당시 미국 다수 약학대학들이 운영하는 제도로서 벤치마킹의 용이성과 국제적 조화를 이룰 수 있다.
정부는 6년제 약학교육 시행으로 입시과열 해소와 고교 교육 정상화, 학생들의 전공에 대한 성숙, 자유로운 판단, 모두 갖춘 예비약사, 벤치마킹의 용이성과 국제적 조화를 꾀하고 있다.