이후 농업관측사업은 관측사업의 안정적 운영을 위하여 정보의 수집, 가공 및 분산체계에 적합한 정보화 시스템을 구축하였고, 농업관측정보센터 홈페이지(http://aglook.krei.re.kr/index.jsp)를 구축하였다. 그리고 정보수집 부문의 농업관측지원정보시스템 구축은 2001년에 이뤄졌고, 2004년에는 PDA(Personal Digital Assistants) 조사방식이 추가되었다. 이후 웹(메일) 조사 및 전화조사 요원용 조사시스템 등이 구축되면서 보다 전산화에 많은 개선이 이루어졌다. 아울러 정보 분산과 관련하여 농축산물 생산 및 수습분석시스템이 2002년에 구축되었고, 2005년에 지리정보시스템인 GIS(Geographic Information System)를 활용하고 있는 농업관측정보서비스 시스템의 통합․운영이 실시되었다.
농업관측사업은 농업관측지원정보시스템 및 농축산물 생산 및 수습분석시스템 등이 구축하였고, 농업관측정보센터 홈페이지를 개설하였다. 2005년에는 GIS 기반의 농업관측정보서시스 시스템이 실시되었다.