줄기세포 연구는 세포의 기원에 따라 크게 세 가지 유형으로 구분될 수 있다. 초기 발생과정 중에서 포배기 단계에 있는 내부세포괴(inner cell mass)에서 추출한 배아줄기세포(embryonic stem cell), 골수나 혈액 등 성인의 인체 조직에 일부 존재하는 성체줄기세포(adult stem cell), 그리고 일반 체세포를 초기 미분화 상태로 역분화시켜 생성한 유도만능줄기세포(Induced pluripotent stem cell, iPSC)가 그것이다(한정규, 2013). 비록 논문조작, 연구원 난자사용이라는 불명예를 안게 되었지만, 2004년과 2005년 서울대 황우석 전 교수가 Science 지에 발표했던 연구는 배아줄기세포 연구였고, 그 중에서도 체세포핵이식이라고 하는 방식으로 배아를 생성하는 연구였다. 흔히 체세포복제 배아라고 불리는데, 핵이 제거된 난자에 다른 체세포핵을 이식해서 배아를 만드는 경우이다. 한편, 2012년 노벨상을 수상한 일본의 야마나가 신야 교수가 2007년에 발표한 연구성과는 성인의 피부세포로부터 iPSC를 수립한 것이었다. 언론을 통해서 배아줄기세포나 iPSC가 많이 알려져 있긴하지만, 현 시점에서 줄기세포치료제 시장의 대부분을 차지하며 이미 상업화 단계에 진입할 정도로 발전된 분야는 성체줄기세포이다.
줄기세포 연구는 세포의 기원에 따라 크게  배아줄기세포, 성체줄기세포, 유도만능줄기세포 3가지 유형으로 구분한다. 이중에서는 배아줄기세포나 iPSC가 언론에 널리 알려져 있지만, 현재 줄기세포치료제 시장은 상업화 단계에 진입할 만큼 발달한 성체줄기세포가 큰 비중을 차지하고 있다.