연구개발에 대한 투자액을 증가시킴과 동시에, B3사는 연구개발 관련 조직을 정비함으로써 신기술 개발 및 기술혁신활동에 대한 효율성 증대에도 노력을 진행하였다. 특히, 2005년에 연구개발 부서를 기존의 책임연구원 단일조직에서 신제품개발팀, 연구기획팀, 신규 Project-Leader 중심 운영의 3개 부서로 조직개편을 단행하였으며, 이를 통해 연구개발 부문의 도전적이고 효율적 조직으로 탈바꿈하고자 하는 노력을 진행하였다. 그리고 2006년에는 만성 적자를 보여 왔던 FTC(전자레인지용 관통형 콘덴서) 사업 부문을 폐쇄하고 관련 설비 매각을 완료함으로써 고부가가치 제품 사업영역으로의 전환 작업을 완료하는 등의 사업개편의 모습을 보였다. 이와 함께, 2005년에는 미래형 하이브리드 자동차 상용화에 대비하여, 정부출연연구소과 관련 기업들과의 컨소시엄 형성을 통한 기술교류 강화를 통해 하이브리드 자동차의 핵심부품 개발에 대한 기술개발 노력을 시작하는 등 고부가가치 부품 개발 및 양산체제 확립체제를 마련하고자 했다.
B3사는 신기술 개발과 기술혁신의 효율성 증대를 위해 투자액 증가는 물론 연구개발 부서의 조직을 개편하고, 적자 부문 사업을 폐쇄하며, 정부출연연구소 및 관련 기업들과의 기술교류를 강화하는 등 다각도로 노력하였다.