세 번째는 대부분의 기관에서 우선순위 선정절차와 방법, 즉 합의과정은 위원회나 패널을 구성하여 운영하고 있었다. 우선순위 선정기준은 기관별 목적에 따라 구성하게 되는 데이러한 기준에 따라 의사결정하기 위해서는 다양한 이해관계자들을 포함한 의사결정체를 구성하여 운영할 필요가 있을 것이다. 이러한 이유에서 대부분의 기관들에서는 다양한 이해관계자를 포함하여 위원회 또는 패널을 구성하여 운영하고 있으며, 우선순위 선정절차는 주제를 선별하는 과정과 선별된 과제에 대하여 우선순위를 설정하는 과정으로 나누어 진행하고 있었다. 실제 우선순위 설정은 특정 질환이나 집단 등에 우선순위를 두고 이에 따라 주제를 선정하는 방식을 취하기도 하며, 우선순위 선정 시 전문가 의견을 청취한 후 각 주제별로 의사결정에 필요한 정보들을 수집하여 제시하고 있었다. 이 때, 수집하는 정보와 제시하는 형태는 각 기관별로 상이하게 구성운영하고 있었다.
대부분의 기관에서 우선순위를 선정하기 위해 다양한 이해관계자를 포함시킨 위원회나 패널을 꾸려 운영하고 있다. 이들은 특정 대상을 우선적으로 생각하여 주제를 선정하기도 하며 자문을 구하기도 하는데 기관별로 다르게 운영하는 것을 알 수 있다. 