이와 함께, 적격 연구개발비의 적용에 있어 지식서비스 분야의 기업에 대해선 일부 항목이 차별적으로 적용되고 있어 이에 대한 개선이 필요하다. 현재 지식서비스 분야 기업은 위탁 및 공동연구개발비에 대해 세액공제가 불가한 상태이다. 과학기술 분야와 마찬가지로 지식서비스 분야의 공동․위탁연구에 대해서도 연구인력개발비의 세액공제를 허용하는 것이 필요할 것으로 판단된다. 한국산업기술진흥협회(2012)의 기업 연구개발활동 조사결과에 따르면, 지식서비스 분야 연구소로 인정을 받은 기업의 72%가 공동․위탁연구 경험이 있거나 계획이 있는 것으로 나타났으며, 공동․위탁연구 경험이 있는 기업의 92.3%가 &D성과에 기여했다고 응답하고 있다. 또한 특허정보조사비 등 특허출원에 소요되는 비용을 연구개발 세액공제 대상에 포함시킴으로써 연구개발의 효율성을 높이고 특허분쟁을 예방하는 것이 필요할 것으로 판단된다.
지식서비스 분야의 기업에 위탁 및 공동연구개발비에 대해 세액공제가 불가한 상태로 세액공제를 허용하는 필요하다.   특허출원에 소요되는 비용을 세액공제 대상에 포함해 연구개발의 효율성을 높이고 특허분쟁을 예방하는 것이 필요하다 판단된다. 