융합연구의 차별성이 크다고 응답한 피설문자에 대해서 추가적으로 차별성의 영역에 대한 설문을 진행하였다. 차별성의 영역은 연구주제선정, 연구방법 설계, 연구진 구성, 연구성과 유형, 연구기대효과, 외부 네트워크, 기타 중 차별성이 큰 영역을 다중응답으로 선택하도록 하였다. 설문 결과를 살펴보면 연구진 구성(25%), 연구 주제 선정(21%), 연구방법 설계(19%) 순으로 차별성이 크게 나타났다. 상기 항목은 연구 계획 단계에서 주요하게 고려되는 항목으로 융합연구의 차별성이 연구 계획단계에서 두드러지는 모습을 보여준다. 이는 융합연구가 학문적 체계가 정립되지 않은 분야로 불확실성이 크기 때문에 계획 단계에서 연구자의 자유도가 높은 특성을 갖고 있기 때문으로 생각된다. 기존에 선행연구나 관련 자료에 한계가 있어 연구 초기단계에서 연구자가 연구 주제 선정 및 설계 과정에서 주관적으로 결정하고 자율성이 커지기 때문에 차이를 크게 느끼는 것으로 사료된다. 연구 결과에 관한 항목인 연구성과 기대효과(15%), 연구성과 유형(11%)에서도 기존 연구와 차이점이 있음을 볼 수 있다.
피설문자들은 융합연구의 차별성이 큰 영역을 연구진 구성, 연구 주제 선정, 연구방법 설계 순으로 꼽았다. 이러한 연구 계획 단계의 부분들이 꼽힌 이유는 융합연구가 학문적 체계가 명료하게 정립된 분야가 아니어서 계획 단계에서 연구자의 자유도와 주관성이 도드라지기 때문이다.