종교소득 과세체계 정비의 취지에도 불구하고 정기적으로 지급되는 종교인에 대한 소득이 근로소득이 아닌 기타소득으로 분류되었다는 점은 여전히 논란의 여지가 있는 것으로 보인다. 성직 활동은 소득을 위한 것이 아니기 때문에 종교소득을 근로소득으로 볼 수 없다는 의견도 있으나, 종교소득을 일시적이고 부수적인 소득으로 간주할 수 없다는 견해도 팽배하기 때문이다. 또한 종교인이 은퇴 시 그 동안의 활동에 대한 보상으로 퇴직금을 받을 경우 이는 어떤 항목으로 과세할 것인지 등 추가적인 논의도 제기될 수 있다. 해외 국가의 경우에는 종교인의 소득을 근로소득으로 원천징수하는 경우가 많으며, 종교인에게 사회보장에 대한 부담 및 혜택을 주고 있는 사례들을 확인할 수 있다.
해외 국가의 경우에는 종교인의 소득을 근로소득으로 원천징수하는 경우가 많으며, 종교인에게 사회보장에 대한 부담 및 혜택을 주고 있는 사례들을 확인할 수 있다.