저비용항공사(LCC) 선두주자인 제주항공은 지난 2분기 20분기(5년) 만의 영업손실(-274억원)을 기록했다. 진에어와 에어부산, 티웨이항공 등도 모두 적자다. LCC 업계에서는 단기적 업황 부진과 원·달러 환율 상승 등을 악재로 꼽지만 전문가들의 시각은 다르다. 국내 여행수요의 폭발적인 증가를 바탕으로 비교적 손쉽게 성장하다 여행객 증가세가 꺾이자 어려움을 겪고 있다고 본다. 따라서 새로운 사업모델을 찾지 못하면 어려움을 더욱 커질 것이란 견해가 지배적이다. 보잉 B737-NG 결함 논란도 악재 항공 업계는 2분기에 이어 3분기에도 LCC들의 실적 악화를 기정사실로 받아들이고 있다. 여름 휴가철이 포함된 3분기는 항공 업계 최대 성수기다. 특히 올해는 추석 연휴까지 포함됐다. 그런데도 적자를 기록할 것이란 예상이 우세하다. 7월부터 본격화된 '노 재팬' 운동 영향으로 일본행 여행객이 대폭 줄었기 때문이다. 증권정보업체 에프앤가이드에 따르면 국내 1위 LCC 제주항공의 3분기 실적 컨센서스(국내 증권사 전망치 평균)는 8억원 영업손실로 집계됐다. 티웨이항공(3분기 컨센서스 영업손실 62억원) 등 다른 LCC도 영업적자가 점쳐지고 있다. 더구나 최근 보잉 B737-NG 기종의 결함 논란으로 해당 기종을 운용하는 제주항공·진에어·티웨이항공·이스타항공 등은 예상 밖의 타격까지 입을 전망이다. LCC에 닥친 시련은 실적 부진뿐만이 아니다. 먼저 대한항공의 자회사인 진에어는 지난해 8월 미국인 조 에밀리의 외국인 등기이사 선임 논란으로 받았던 국토부 제재에서 아직 벗어나지 못한 상태다. 신규 기재 도입과 신규 취항이 막혀있다. 진에어는 그동안 국토부가 요구한 사항을 모두 이행했다며 제재 해제를 요청했지만 별다른 진전이 없다. 항공 업계에선 조 에 밀리 리가 한진칼의 임원직을 맡아 진에어에 영향을 끼칠 수 있는 점 등을 고려하고 있다고 보고 있다. 만약 내년 2월 정기 운수권 배분 때까지 제제가 해제 되지 않는다면 진에어의 경영난은 가중될 것으로 보인다. 더 큰 문제는 비상장사인 이스타항공·에어서울이다. 이들은 취약한 재무구조 탓에 항공면허를 유지하기 어려울 것이라는 전망까지 나오고 있다. 국토부는 지난해 10월 항공사업법 시행령 개정을 통해 1년 이상 자본금 절반이상 잠식된 항공사에 대해 재무구조 개선명령을 내리기로 했다. 지난 8월 27일에는 항공사업법 개정안을 통해 개선명령을 2년 동안 이행하지 못하는 항공사의 항공사업 면허를 취소할 수 있도록 했다. 출범 후 지속적으로 자본잠식 상태에 있던 이스타항공은 지난해 말 자본잠식률 48%를 기록했다. 가까스로 자본잠식률 50%를 벗어났지만 최근 업황 부진으로 재무구조는 더욱 악화됐을 가능성이 크다. 또 항공기 운용리스를 부채로 보는 새로운 회계 기준이 올 초부터 적용되며 이스타항공의 재무구조의 취약성은 더욱 부각될 전망이다. 국토부 항공안전관리시스템에 따르면 이스타항공이 현재 운용 중인 항공기 23대는 모두 운용리스 방식으로 도입했다. 최근 이스타항공이 회사 매각을 추진한다는 얘기가 나오는 것도 이런 배경에서다. 단기적으로 재무구조를 크게 개선할 수 있는 가능성이 크지 않다 보니 외부의 도움을 필요로 한다는 얘기다.
7월 '노 재팬' 운동으로 일본행 여행객이 감소하자 불황에 직면한 LCC 업계가 새로운 사업 모델을 찾지못하면  어려움을 더욱 커질 것이란 견해가 지배적이다.
