임금보조금의 성과를 평가하는 데 있어 여러 기준 및 지표들이 제시되고 활용되고 있는데, 일반적으로 정책실무자 및 연구자들에 의해 가장 중요하고 빈번하게 활용되고 있는 지표는 바로 집행실적(참여자 수 및 예산집행률), 고용유지율, 사중손실률이며, 이 중 고용유지율 및 사중손실률은 효과성에 관한 기준으로 볼 수 있다. 그러나 이같이 양적지표와 효과성 기준만으로 임금보조금의 성과평가를 온전히 수행하기에는 한계가 있다. 효과성 이외에도 임금보조금에서의 타당한 정책설계 및 성과평가를 위해 중요하게 고려되어야 할 기준이 있으니 그것은 바로 형평성(공정성)이다.
임금보조금의 성과를 평가하기 위해 집행실적, 교용유지율, 사중손실률 활용 뿐 아니라 형평성(공정성) 역시 중요하게 고려되어야 한다.