중점과제 환류점검 외에도 성별영향분석평가센터에서는 정책 개선안이 이행될 수 있도록 모니터링을 진행하고 있다. 모니터링은 전문가(컨설턴트) 모니터링과 시민 모니터링으로 나뉜다. 전문가 모니터링단은 컨설턴트들이 성별영향분석평가 과제를 컨설팅하면서 자신들이 컨설팅한 과제들이 어떻게 정책환류가 되는지를 점검하기 위해 실시하고 있다. 그리고 2015년부터는 시민 모니터링단을 운영해왔는데 2015년에는 공공시설에 대한 대학생 모니터링단을 운영했고, 2016년에는 공원시설에 대한 육아기 전업주부 모니터링단을 운영했다. 시민 모니터링단은 성별영향분석평가 모니터링을 통해 성인지적 관점을 이해하고 성별영향분석평가가 지역 주민들의 삶을 개선하는 데 영향을 줄 수 있다는 것을 알게 되었다고 한다.
성별영향분석평가센터에서 컨설턴트가 컨설팅한 과제의 정책환류를 검토하는 전문가 모니터링과 공공시설과 공원시설에 대한 시민모니터링을 진행했다. 모니터링을 통해 시민들은 성인지적 관점을 이해하게 됐다고 한다.