개념 기반 채점으로 걸러지지 않는 답안에 대해서는 단서어 목록을 작성하고 답안에 단서어가 출현하지 않으면 오답으로 처리하는 과정이 추가된다. 단서어는 정답 또는 부분 정답이 될 수 있는 단어이다. 단서어 기반 오답 처리는 정답 템플릿에 단서어가 존재하는 경우에만 수행되며 학생 답안에 단서어 목록에 있는 단어가 하나도 존재하지 않으면 오답으로 처리한다. 즉, ‘아름이’, ‘반달가슴곰’, ‘반달곰’ 등의 단어가 출현 하게되면 수작업 채점을 할 수 있도록 미판단 답안으로 남겨두고, 출현하지 않게 되면 오답으로 처리한다. 이는 수작업 채점을 최소화할 뿐만 아니라 자동 채점의 오류 가능성을 줄이기 위한 단계라 할 수 있다.
프로그램은 개념 기반 채점 이후 단서어를 기반으로 오답 유무를 가린다. 정답이 될 수 있는 단어 목록을 기반으로 채점 오류 가능성을 줄이는 단계이다.