한편, 제3자 보관정보의 압수･수색 과정에서 발생하는 여러 문제들의 경우 압수의 실질적 대상이 정보저장매체가 아닌 정보 그 자체라는 점에 문제의 근원이 자리잡고 있다고 할 수 있다. 정보를 담고 있는 도구에 지나지 않는 저장매체만을 압수･수색의 대상으로 삼게 되면, 압수자와 피압수자 외에 사생활의 비밀과 자유 등 실질적인 기본권의 주체에 대한 고려가 미흡하게 되는 문제점을 가질 수밖에 없다. 이러한 구조는 영장주의를 통하여 무분별한 압수･수색을 제한하고, 압수･수색 절차를 적정화함으로써 피압수자 및 피의자의 방어권을 보장하고자 했던 기존의 통제구조가 전자정보에 대한 압수･수색에 있어서는 제대로 작동할 수 없음을 의미한다. 따라서 장기적으로는 유체물에 대한 압수･수색과는 별도로 정보영장제도를 법제화함으로써 정보에 대한 압수･수색제도 자체를 체계화하는 작업이 수반되어야 할 것으로 생각된다.
장기적으로 유체물에 대한 압수･수색과 별도로 정보영장제도를 법제화함으로써 정보에 대한 압수･수색제도 자체를 체계화하여, 피압수자 및 피의자의 방어권을 보장하고자 하는 기존의 통제구조를 반영하는 작업이 수반되어야 할 것이다.