이러한 관점에서 네거티브 규제체계가 제대로 작동하기 위한 전제조건을 네거티브 규제체계를 적용하기 위한 규제선별작업을 필두로 단계별로 살펴보면 첫째 네거티브 규제체계를 적용하기 적합한 분야를 선정하는 작업이 선행되어야 하며 둘째, 사업영역별 적용규제가 확정되면 해당 규제를 네거티브 방식으로 전환할 때 금지영역에 대하여 명확한 설정을 하여야 한다. 셋째, 해당 규제의 법령형식을 네거티브로 바꾸었다고 해서 마무리되는 것이 아니라 네거티브 규제체계로의 전환 이후 발생가능한 사회적 손실에 대한 합리적 대비를 마련하여야 하며 마지막으로 네거티브 규제체계의 효과성 제고를 위해서는 단기적인 성과중심의 평가프레임을 장기적인 관점으로 전환하는 것이 필요하다. 이러한 단계별 전제조건의 구체적인 내용은 다음과 같다.
네거티브 규제체계 적용을 위해서는 적합한 분야 선정 및 금지 영역에 대한 명확한 설정, 이후 발생할 수 있는 사회적 손실에 대한 대비 마련, 장기적 관점으로의 평가 프레임 전환이 필요하다.