문제는 시·군·구 희망복지지원단과 읍·면·동의 복지허브화사업이 시행되면서 이들 간의 관계 및 역할 분담이 명확하지 않다는 점이다. 읍·면·동 복지허브화사업은 2015년부터 시범사업 실시 등을 통해 지속적으로 준비해 왔고 2018년 전국 읍·면·동으로 확대될 예정이다. 그러나 시·군·구 희망복지지원단과의 관계 설정은 명확하지 않아 실제로는 일부 업무가 중복적이거나, 권역형 복지허브화 지역의 중심 읍·면·동의 경우 시·군·구 희망복지단의 업무가 이양되거나, 서로 다른 읍·면·동임에도 불구하고 결재를 받아야 하는 상위 기관이 추가되고 있다.
희망복지지원단과 복지허브화사업 사이의 역할 분담이 명확치않고, 복지허브화사업은 전국확대될 예정이나 희망복지지원단과의 관계 설정이 뚜렷하지 않다는 문제가 있다.