또한 특별부담금에 대해서는 제정당시 특별부담금 총 징수액이 광구규모에 따라 제곱승으로 증가하던 체계에서 현재에는 비례적으로 증가하도록 하여 석유 탐사 기업들의 부담을 완화시켰다. 또한 특별부담금산정의 기초가 되는 석유 상업생산 이후 발생하는 ‘순이익’의 정의를 두고 2010년까지는 사업수익금에서 운영비를 공제한 나머지를 의미하였으나 2011년부터는 ‘운영비 미회수 누적액’을 포함함에 따라 기업이 지불해야 하는 특별부담금은 또 다시 경감되었다고 할 수 있다. 그럼에도 불구하고 석유상류부문 진출을 실질적으로 장려하기 위해선 특별부담금의 추가적인 완화를 고려할 필요가 있다는 업계의 목소리는 끊이지 않고 있다.
또한 특별부담금 징수 체계 및 순이익 정의 개정으로 석유 탐사 기업들의 부담을 완화시켰다. 그럼에도 업계는 석유상류부문 진출을 위해 특별부담금 추가 완화가 필요하다고 말한다.