북핵 위기가 있은 후인 2007년 4월에는 그 동안 연기되었던 개성공단 1단계 2차 분양이 2.3대 1의 경쟁률 속에 성공적으로 끝났다. 183개 기업이 새롭게 개성공단 입주기업 자격을 따 내었다. 이 중에는 후술하는 외국계 기업도 3개가 포함되어 있었다. 특히 2007년 10월 4일 남북정상회담을 마친 노무현 당시 대통령은 평양에서 서울로 돌아오던 길에 개성공단을 방문하기도 하였고, 그 해 말에 남측 지역인 문산역과 북측 지역인 봉동역을 연결하는 철도화물의 수송시대가 열렸다. 그리고 문산역과 판문역, 개성역을 잇는 통근열차의 운행도 예고되었다.
북핵 위기 후 2007년에는 개성공단 분양과 노무현 대통령의 방문 및 남측과 북측 지역을 연결하는 철도가 설치되었고, 남과 북 사이의 통근열차의 운행도 예정되었다.