그러나, 위와 같이 2014년부터 고발요청권의 확대 및 공정위의 고발 의무 조항 신설로 전속고발제도가 완화되었음에도 불구하고, 아래 공정위의 ‘고발 현황’에 대한 표에서 보는 바와 같이 2014년도와 2015년도의 고발현황을 살펴보면, 2014년도의 고발건수는 62건, 2015년도 고발건수는 56건으로 2013년의 63건에 비해 오히려 줄어들었고, 고발요청권의 확대에도 불구하고 고발요청 대상사건에 대하여 법규정의 해석상 모든 사건이 대상이 되는 것이 아니라 공정위가 위법하다고 인정한 사건의 범위 내에서만 가능하여 그 제한이 있다는 지적이나 고발요청의 요건인 ‘사회적 파급효과, 국가재정에 끼친 영향, 중소기업에 미친 피해정도 등 다른 사정’이라는 것이 추상적이어서 과연 어느 정도 실효성이 있을지 의문이라는 지적 등 전속고발제도의 한계는 여전히 논란이 되고 있다.
2014년부터 고발요청권 확대와 공정위의 고발 의무 조항 신설로 전속고발제도가 완화되었지만 실제 고발건수는 오히려 줄었다. 또한 고발요청 대상사건에 제한이 있고, 고발요청 요건 또한 추상적이라 실효성에 의문이 든다는 지적도 많다.