학생들이 가져야 할 핵심역량을 달성하기 위해 본 사업단의 교육 프로그램은 전공, 교양 및 비교과과정으로 구성하였고, 교육결과가 취업과 연계되고 지역 및 산학협력으로 이루어지도록 프로그램을 구성하였다. 먼저, 교육, 산학협력 및 지역연계를 위한 본 사업단의 프로그램은 크게 정규교육을 위한 ‘Engineer Root’, 실무교육을 위한 ‘Specialist Root’, 취업을 위한 ‘Career Root’, 그리고 지역 및 산학협력을 위한 ‘Network Root’로 구성하였다. 뿌리산업 선도인력의 양성을 위해 정규 교과과정을 특성화 분야로 대폭 개선하고, 뿌리산업 주제별 트랙제를 추진하며, 그에 따라 특성화 인증을 부여하고자 한다. 비교과과정으로서, 참여 교수의 연구실을 학생들의 학술동아리인 “특성화 GUILD”로 전환하여 다양한 비정규 교육과정을 소화하게 함으로써 정규 교과과정에서 다루기 어려운 내용을 보완하고 있다. 또한, 실무형 맞춤교육 및 취업 연계형 교육인 오더 메이드 교육 프로그램을 통하여 기업과 지역 및 학생을 유기적으로 연계하고자 한다. 특성화 교육을 위한 학년별 프로그램의 구성은 다음의 그림과 같다.
교육,산학협력 및 지역 연계를 위한 본 사업단의 프로그램을 정규교육, 실무교육, 취업, 지역 및 산학협력으로 구성했고 특성화 분야로 정규 교과과정을 대폭 바꿨다. 다양한 비정규 교육과정을 소화하게 하여 정규 교과과정을 보완하고 있으며 오더 메이드 교육으로 기업과 지역 및 학생을 유기적으로 연계하고자 한다.