공동육아나눔터 활성화를 위하여 여성가족부는 기본계획 수립, 운영지침 마련 및 예산 지원, 주민공동시설, 도서관, 주민센터 등 돌봄공간제공을 위한 관계부처와 협력을 강화하고 있다. 지방자치단체는 공동육아나눔터 공간 마련, 예산 지원 등 돌봄 서비스 기관을 관리하고, 건강가정지원센터에서는 지역 내 공동육아나눔터를 운영하면서 종사자 역량강화 교육 등을 통해 돌봄 서비스를 관리하고 있다. 또한, 한국건강가정진흥원이 전국의 공동육아나눔터를 총괄적으로 지원하기 위하여 홍보 계획 수립･실시, 프로그램 개발･지원, 담당자 교육, 서비스 모니터링등의 업무를 수행하고 있다.
여성가족부는 공동육아나눔터 활성화를 위해 돌봄기관을 관리하는 지자체, 돌봄 서비스를 관리하는 건강지원 센테, 이를 총괄지원하는 한국건강가정진흥원 등 관계부처와 협력한다.