요컨대, 인권센터 같은 인권 전문기관의 설립과 활동은 주민들의 인권 증진을 위하여 유용한 방안인데, 관건은 전문 기관으로서 전문성을 갖추는 것이다. 전문성을 확보하지 못하면, 소기의 목적을 달성할 수 없게 된다. 아울러 효과적인 운용 방안을 강구하는 것이 필요하다. 인권센터의 운영은 지역 사회의 여건에 따라 지자체가 직영하거나 위탁 경영을 하게 된다. 때로는 인권전담부서의 역할을 맡기도 한다. 곧, 인권센터와 인권전담부서를 통합하여 운용하는 경우도 있고, 나눠서 역할을 분담하는 방안도 있다. 예컨대, 인권센터는 인권교육이나 상담, 피해자 구제 같은 전문 기관의 역할을 맡는다면, 인권전담부서는 인권기본계획 수립과 집행 같은 영역에서 행정의 효율을 높이기 위한 조정 역할을 맡게 된다.
주민들의 인권증진을 위해서 지자체가 인권센터를 운영할 수 있는데 전문성을 갖추는 것이 필요하다. 여건에 따라 인권센터를 직접 또는 위탁경영으로 하고 인권전담부서와 역할분담을 하는 것도 효과적이다.