소말리아 해역에 청해부대가 파견되기 이전까지 해상교통로 보호는 미국을 포함한 우방국 또는 연안국에게 전적으로 의존했다가 2009년 이후 우리의 청해 부대가 우리의 해상교통로 보호를 위해 활동하고 있지만 초국가적 위협으로부터 한국 관련 선박을 보호하기에는 아직 부족한 전력이다. 제주해군기지는 국가의 사활이 달려 있는 이러한 해상교통로를 보호하기 위한 존재가 전략기동전단의 모항으로서 연근해 작전을 위주로 편성된 함대와는 달리 제주도 남쪽에서 말라카 해협으로 이어지는 해상수송로를 보호하는 원해작전을 담당할 수 있는 능력을 보유하게 될 것이다.
타국에게 전적으로 의존해왔던 해상교통로 보호를 우리의 청해 부대가 맡게 되었지만 초국가적 위협으로부터 한국 관련 선박을 보호하기에는 아직 부족한 전력이다.