아홉 번째 방향은 남북한 통합 교육과정은 국어, 일반사회, 지리, 음악, 미술 등을 우선적용 교과로 하고 점차 확산한다는 데 있다. 이 교과들은 남한과 북한 사회가 갖고 있는 이념적 갈등의 소지가 비교적 적은 교과이고, 남한과 북한 주민간 동질성 회복에 도움이 되고, 국어과의 경우 통일을 위해 시급히 해결해야 하는 과제를 갖고 있다. 이에 따라 교과중에서도 특정 교과들은 먼저 통일교육에 개방적이면서 적극적으로 이른 시기에 통합을 추진하고, 이념적인 부분이거나 사회문화적 배경의 차이로 인해 통합 교육과정 적용에 신중해야 하는 문제를 다루는 교과들은 무리하게 통합을 추구하지 않도록 한다.
남북한 통합 교육과정중 특정교과는 통합을 적극적으로 추진하고 일부 교과는 무리하게 통합을 추구하지 않도록 해야한다.