두 번째 단계는 NCS의 토대 위에서 국가자격체계(National Qualifications Framework: NQF)를 구축하는 작업이다. 각 산업부문별로 개발된 NCS에 상응하는 NQF를 구축할 필요가 있다. 예컨대, 각 산업부문별로 해당 직무역량을 몇 단계로 세분화하고, 각 단계별 직무역량에 자격을 부여하는 방안을 마련할 필요가 있다. 이렇게 되면 피교육생·피훈련생은 각 단계의 직무역량을 마스터할때마다 해당 직무역량에 상응하는 자격을 취득할 수 있다. 물론 각 산업부문별로 직무역량의 두께나 깊이에 따라 직무역량의 단계 수는 달라질 수 있다.
피교육생, 피훈련생들이 해당 직무역량에 맞는 자격을 취득할수 있도록 NCS를 바탕으로 각 산업부문별로 세분화하여 국가자격체계를 구축할 필요가 있다.