공공기관 기능조정의 기본방향은 공공부문 직접 수행이 불필요한 사업의 폐지·축소, 기관 간 유사·중복 해소 등을 통한 공공기관 기능재편, 절감된 자원의 미래지향적 활용이다. 구체적으로 기능 통·폐합 및 비교우위 기관으로 일원화을 통해 공공기관의 유사·중복기능 조정을, 설립목적외 사업, 단순위탁 업무 등의 축소를 통해 비핵심업무의 축소를, 공공부문 독·과점 수행분야 민간개방 확대를 통해 민간개방의 확대를, 민간시장 성숙분야 업무·기능의 축소 및 폐를 통ㅎ 민간경합 축소를, 재무구조 개선, 투명성 제고 및 부실정리를 통해 경영효율화를 도모하도록 하였다.
공공기관은 기능 조정을 통해 유사, 중복 기능을 조정하고, 비핵심적인 업무를 축소하고, 민간개방을 확대하고, 민간경합을 축소하고, 경영효율화를 도모하였다.