셋째, 자치구의 재정압박을 해소하기 위한 제도개선을 검토할 필요가 있다. 현행 제도상 보통교부세는 특별· 광역시와 도 및 시 · 군에만 교부하도록 되어 있고 자치구에는 특별 · 광역시의 조정교부금을 통해서 간접적으로 교부되고 있다. 그러나 특별 · 광역시의 조례로 결정되는 조정교부금의 교부율이 대부분의 특별 · 광역시가 행정자치부의 권고안에 미치지 못하여 자치구의 재정압박을 완화할 수 있을 정도로 교부되고 있지 않은 상황이다. 이에 따라 일부 학계에서는 보통교부세를 자치구에 직접 교부하도록 현행 지방교부세 제도를 개편해야 한다는 방안이 제기되고 있다. 이러한 제도개선 방안은 중앙정부 내국세의 일정률을 재원으로 교부하는 보통교부세를 자치구에 직접 교부하도록 함으로써 조정교부금의 증가에도 불구하고 재정압박의 해소에는 미흡한 자치구의 재정을 보완할 수 있다는 점에서 의의가 있다.
자치구의 재정압박을 해소하기 위해 보통교부세가 특별 · 광역시의 조정교부금을 통해 간접적으로 자치구에 교부되고 있는 현행 지방교부세 제도에서 보통교부세를 자치구에 직접 교부하는 방안으로 개편하는 것을 검토할 필요가 있다.