일본과 협력이 가능한 또 다른 영역은 해양위협의 감소를 위한 위기관리와 신뢰구축 분야일 것이다. 특히 해상교통로 보호나 해적행위에 대한 공동 협력 그리고 재난구조나 한･미･일 해상 수색･구조 훈련(SAREX) 등은 양국 간의 신뢰구축을 확대시킬 수 있는 매우 좋은 기회가 될 것이다. 현재 중국과 일본에 비해 우리의 해상에서의 위기관리 능력은 상대적으로 크게 부족한 상황이다. 일본과 중국의 해상군비 경쟁이 심화되고 있는 상황에서 통일한국은 보다 중립적이고 객관적인 입장을 취할 수밖에 없지만, 해상 접근 능력이 지나치게 약화되지 않도록 각별한 관심과 투자가 필요하다.
해상교통로 보호, 해적행위에 대한 공동 협력, 재난구조, 한･미･일 해상 수색･구조 훈련 등 해양위협 감소를 위한 위기관리와 신뢰구축 분야는 일본과 협력 가능 영역이다.