군 옴부즈만은 권리를 침해당한 군인이 직접 진정을 넣거나 국회 국방위원회가 요청한 사안에 대해 조사할 수 있고 내용이 중대한 경우에는 직권으로 조사할 수 있다. 군 옴부즈만은 사전통지 없이 부대에 방문하여 조사할 수 있고, 부대 운영과 관련한 정보나 기록에 대해 접근할 수 있는 권리가 있기때문에 군에서는 제도 도입과 관련하여 원칙적으로 반대를 하고 있는 상태이다. 군 옴부즈만 제도는 2005년 논산훈련소 인분사건과 연이어 발생한 28사단 김일병 총기난사 사건으로 논의가 되면서 당시 정부는 독일식 군 옴부즈만 제도를 도입하겠다는 취지로 발표한 사실이 있다.
정부는 군인의 진정과 국방위원회 요청 사안 등을 조사할 옴부즈만 제도 도입 의사를 발표했으나, 군은 통지 없는 방문 조사와 운영 정보 접근 권한 등에 반대하고 있다.