빅데이터의 활용과 촉진의 확대에 대한 필요성을 강조하면서 우려되는 사항도 있다. 숨겨진 왜곡현상(hidden bias), 개인정보보호 등과 같은 사생활 침해 문제다. 빅데이터가 사회현상을 정확하게 반영한다고 전제하지만, 실제로 심각한 괴리가 있을 수 있다. 특정 그룹으로부터는 데이터가 거의 수집되지 않기 때문이다. 예를 들어, 스마트폰의 SNS를 통한 정보는 SNS를 거의 사용하지 않는 고령자의 자료는 반영 될 수 없기 때문에 재난을 위한 모니터링 관리와 같은 안전체계 구축 시 데이터에서 누락되면서 그룹 간의 형평성 문제를 야기할 수도 있다. 또한 ‘빅브라더(big brother)’ 행태에 대한 우려가 있다. 개개인의 정보를 수집하는 과정에서 불필요한 감시가 될 수도 있으며, 안전을 위한 데이터 수집과 제공으로 오히려 위험에 노출되는 경우가 있을 수도 있다.
빅데이터는 사회 현상을 파악하는데 효과적이라 생각하여 많은 곳에서 활용되고 있지만 사생활 침해 문제, 특정 그룹의 미반영 혹은 빅브라더와 같은 문제를 지니고 있다.