그러나 고등학교 성취평가제의 안정적 정착을 위해서는 교사의 평가 전문성 향상, 단위 학교 성적 관리에 대한 책무성 강화 및 시스템 정비 등의 여러 요소가 함께 수반되어야한다. 그 중에서도 대학입학전형 제도의 변화가 우선적으로 고려되어야 하는데, 대학입학 전형 제도의 변화는 대학수학능력시험 제도와 개별 대학의 입학전형 방식과 맞물려 단기간에 이루어지기에는 어려움이 따른다. 이에 교육부는 ‘학생․학부모 부담 완화와 학교교육 정상화를 위한 대입전형 간소화 및 대입제도 발전방안(시안)’에서 성취평가제를 2014년 고등학교 1학년부터 적용하되, 대입반영은 2019학년도까지 유예하고 2020학년도 이후의 반영 여부는 2016년 하반기에 결정하기로 하였다(교육부, 2013). 결과적으로 학교생활기록부에 성취평가제 성취도와 종전과 같이 상대평가 9등급 성적을 병행하도록 하였다
고교 성취평가제의 안착을 위해 우선 개선이 필요한 대학입학전형 제도는 제도와 전형 방식의 연관성으로 인해 단기 내 개선이 어렵다. 이에 교육부는 학교생활기록부에 성취도와 기존의 상대평가 성적을 병기하는 방안을 시행 예정이다.