자격제도는 국가직무능력표준과 연계되어야 한다. 이를 위해서는 두 가지가 필요하다. 첫째, 제도적 기반의 마련, 둘째, 연계방안이다. 자격제도를 설계하려면 우선적으로 국가 차원에서 자격제도의 기본 틀이 마련되어야 한다. 자격제도의 기본 틀은 국가역량체계(NQF:National Qualification Framework)로 호칭되며, 국가 차원에서 마련되어야 한다. 자격기본법 제3조 제3호는 자격체제를 “국가직무능력표준을 바탕으로 학교 교육·직업훈련(이하‘교육훈련’이라 한다.) 및 자격이 상호 연계될 수 있도록 한 자격의 수준 체계”라고 정의하고 있다. 따라서 자격제도는 국가직무능력을 기초로 수립되어야 하고, 자격제도 내에서 각각의 자격에 수준이 부여되어야 함을 의미한다. 따라서 국가자격제도를 시급히 정립해야 한다. 국가자격제도 내에서 자격체계는 이미 연구 결과가 나와 있고, 관련 부처 간에 8수준으로 합의가 된 상태이다. 다만, 수준을 설명하는 방법과 내용에 대해 이견이 있는 상태이다. 따라서 우선적으로 수준을 설명하는 지표를 확정하고, 이를 자격기본법에 반영하여야 한다.
국가직무능력표준과 자격제도의 연결을 위해서는 제도적 기반과 연계방법이 마련되어야 한다. 자격제도의 기반을 국가직무능력으로 설정해야하는데, 이미 어느정도의 과정이 진행되어 있긴하다. 하지만 세부적인 부분에 수정이 필요하다. 