불법어로 활동은 섬강어업계가 직면한 가장 큰 문제점 중의 하나이며, 이로 인하여 어획고가 급감하고 지속적인 어자원 관리가 되지 않아 향후 어로활동에도 큰 영향을 미칠 것으로 판단하고 있다. 특히, 불법어업자들은 많은 어획량을 목적으로 사용하지 말아야 할 장비와 포획방법을 미성어까지 포획하고 있어 문제가 심각하다. 섬강에서 발견되고 있는 불법어획방법 중 대표적인 방법은 배터리를 사용하거나 돌무덤을 이용한 어획방법이 있다. 배터리 어획법은 전기를 이용하여 물속에 있는 모든 어종을 유어·성어 가리지 않고 포획하며, 돌무덤은 산란기에 강으로 돌아오는 어류들이 쉴 수 있는 쉼터의 형태로 돌을 쌓아 조성하는 것으로 지류 주변에 20~30개 정도를 만들어 일정시간이 지난 뒤 그물로 돌무덤 주변을 감아 포획한다. 특히, 돌무덤을 이용한 불법어획은 돌무덤 하나에 10~30kg의 어류가 포획되어 과잉어획의 문제를 나타나고 있다. 이러한 문제에도 원주 섬강은 어로범위가 길고 섬강의 구역별로 접근이 쉽지 않아서 이를 단속하는데 한계점이 있다.
원주 섬강은 어로범위가 길고 구역별 접근이 어렵기 때문에 불법 어업자들을 잡는데 애로사항이 있다. 섬강의 불법어로 행위로 인해 어획고가 크게 줄었으며, 어자원 관리가 꾸준히 이루어지고 있지 않기에 향후 어로활동에 영향을 줄 것으로 예상된다. 