자주국방 의지와 맞물린 박정희 정부의 핵미사일 개발은 한미동맹 간 심각한 갈등을 야기했으며, 동맹 상대국인 미국은 한국의 핵미사일 개발이 동아시아 군비경쟁으로 이어질 것이라고 판단하면서 이를 적극적으로 저지하려 했다. 무엇보다도 미국은 한국의 핵미사일 개발에 있어 자국이 아닌 외부로부터의 시설 및 기술 도입에 민감하게 반응하며 반대했다. 미국이 본격적으로 핵무기 개발을 의심한 대목도 한국이 프랑스로부터 핵연료 재처리 플랜트 시설을 도입하려는 계획을 인지하면서 시작됐다. 미국은 핵무기 개발이 지역 내 갈등을 유발하는 원인으로 작용할 것이며, 당시 미국이 지원하던 원자력발전소 차관 문제에 부정적 조치가 취해질 것이라고 박정희 정부를 압박했다. 한편 미사일 개발에 있어 한국은 미사일 추진제 제조 기술과 장비를 확보하기 위해 프랑스와, 장거리 유도탄 부품과 기술 도입을 위해 영국과 접촉했다. 이와 같은 사실이 미국에 전해지면서 미국은 장거리 미사일 개발을 중단하라고 동맹 상대국인 한국에 요구했다. 미국은 한국의 장거리 미사일을 핵무기의 잠재적 운반 수단으로 판단했으며, 핵미사일 개발로 야기될 동아시아의 군비경쟁을 우려했다.
박정희 정부의 핵미사일 개발은 한미동맹의 분열을 야기했고, 미국은 이를 저지하고자 했다. 특히 미국은 외부로부터의 시설 및 기술도입에 반대했고, 프랑스로부터 시설을 도입하려고 하는 것에서 반대가 시작되었다. 미국은 박정희 정부를 압박했고, 동아시아 군비 경쟁을 우려해 핵미사일 개발을 반대했다고 한다.