갈등종결의 부정적인 측면은 강제적 양상과 더불어 자진철회와 소멸양상의 증가도 문제점으로 볼 수 있다. 자진철회의 경우 정부가 철회하거나 주민이 철회하여 갈등이 종결되는데 만약 정부가 추진한 정책이 최선의 대안이나 정부가 철회할 경우 반대로 가장 최악의 대안이나 주민이 철회할 경우 큰 문제로 발생할 수 있다. 소멸의 경우는 자친철회처럼 양면성도 없이 부정적인 성격만을 가지고 있다. 정부가 추진하는 정책에 반하여 대립하다가 결국 사회문제의 해결도 안되며, 정책도 추진 못하고 갈등의 지속으로 시간은 소모되고 자원은 낭비되어 막대한 피해를 입힌 후 아무런 의미 없이 흐지부지 없어져 버리는 결과이다. 가장 비효율적인 결과를 초래할 수 있다. 특히 중간에 법원판결까지 포함될 경우 엄청난 시간을 소모한다는 점에서도 큰 문제로 볼 수 있다.
갈등종결에 있어 정부 정책이 최선인데 정부가 자진철회할 경우와 최악의 대안인데 주민이 철회할 경우 문제가 발생할 수 있고, 정책을 반대하느라 시간과 자원을 낭비한 뒤 소멸되는 경우도 비효율적인 결과를 초래하므로 문제다.