현재, 내년 예산안 심사에서 공무원 증원 재원을 놓고 여야 간 대립이 격화되고 있는데, 이는 공무원 증원에 따른 재원 추계의 차이에서 비롯된다. 정부에서는 공무원 증원 계획은 발표하면서 재정 추계에 대해서는 별도로 공개하지 않아 인건비 부담에 대한 우려가 제기되고 있다. 올해 공무원 인건비는 35조 8천억 원가량이고, 내년 공무원 3만 명 증원과 관련해 반영된 인건비는 4천억 원 정도로, 당장 내년 예산에서는 공무원 증원에 따른 부담이 크지 않아 보인다. 그러나 채용 후 이들이 퇴직할 때까지의 인건비, 퇴직 후 연금 부담 등을 감안하면 재정에 얼마나 부담을 줄지에 대해 여야 간 이견이 존재한다. 국회 예산정책처가 작성한 “신규 공무원 채용에 따른 비용”에 따르면, 2022년까지 매년 3.4만 명씩 9급 공무원을 순차적으로 채용할 경우 향후 30년간의 인건비 추가 부담액이 327조 8천억 원에 달한다. 정부와 여당은 이 금액에 대해 부풀려져 있다고 판단하고 있고, 인건비 절대 규모보다는 정부 총지출 대비 비중을 보는 것이 향후 공무원 증원에 따른 재정 부담을 정확하게 파악할 수 있다는 입장이다. 정부 총지출 대비 공무원 인건비 비중이 8%라고 가정할 때 공무원 인건비는 40조 원으로, 올해 대비 약 4조 원 증가하는 수준이다. 이는 재정에 큰 부담을 줄 정도는 아니지만, 상대적으로 인건비 부담이 적은 공무원 증원 초기 단계를 기준으로 산정한 만큼 향후 임금 상승률과 승진, 연금 부담액 등을 고려할 때 이 비중을 유지할 수 있을지에 대해 논란이 있다.
정부가 공무원을 3만 명 늘리겠다는 계획에 대해 여야 간 의견이 대립하고 있다. 국회 예산정책처에서 제시한 예산 증액분에 대해 정부와 여당은 이것이 과도 산출되었고 절대 금액이 아닌 정부 총지출 중 공무원 인건비가 차지하는 비중으로 판단해야 하고 이 비중이 부담스러운 수준이 아니라 주장했다. 그러나 초기 임금을 기준으로 했기에 향후 연차에 따른 증액을 고려해야 하므로 이는 논란의 여지가 있다.