그런데 미/소공동위원회 중심의 한반도 신탁통치 협약 체결은 결과적으로 실패하고 만다. 모스크바 3상회의 결정에 따라 1946년 3월 20일 제1차 미/소공동위원회가 개최되었지만, 그 과정에서 미국과 소련은 임시정부 수립에 참여한 한국 내 협의 대상자로서 정당과 사회단체의 자격을 놓고 합의를 하지 못하였다. 당시 국내에서는 한반도 신탁통치에 대한 찬성과 반대 세력의 대립이 극심하였는데, 이들 세력을 중심으로 신탁통치 협의 대상을 선정하는 과정에서 미국과 소련의 의견이 엇갈린 것이다. 소련은 한국의 단체들이 신탁통치에 동의하고 공동위원회의 결정에 협력한다면 협의 대상이 될 수 있다고 주장하였다. 반면 미국은 신탁통치 협약서를 제출한다고 해도 신탁통치에 대한 찬성과 반대 의견 표현의 자유가 있다는 입장이었다. 결국 이 같은 미국과 소련의 대립은 미/소공동위원회로 하여금 1946년 5월 6일 무기휴회를 선언하게 만들었다.
미국과 소련이 한국 단체의 협의 참가 자격에 관해 합의하지 못하면서 신탁통치 협약 체결은 불발되었다. 미국은 소련과 달리 신탁통치 협약서에 신탁통치 찬/반 의견 모두 포함되어도 된다고 보았다. 결과적으로 미/소 공위는 무기휴회를 선언했다.