교육복지 사업은 상대적으로 열위에 놓여 있는 학생들을 선별해서 다양한 교육지원프로그램들을 제공하고 있다. 사업이 초기부터 학습, 문화, 상담생활 등 세 영역으로 나누어서 다양한 프로그램들을 제공하려고 힘썼던 이유라고 할 수 있다. 그 이후 방과후학교 사업을 비롯하여 Wee센터 사업, 기초학력증진, 진로체험 및 자유학기제 사업, 학부모교육지원 사업 등이 기획되어 지역과 학교에 확산되면서 다양한 사업과 조직이 분절적으로 추진되고 있다. 이로 인해서 그 동안의 교육복지 사업은 새로운 사업들과의 중복 지원이라는 문제가 발생할 수밖에 없다. 또한 전문 인력 간의 분절적 업무 추진으로 인해서 사업 간의 시너지가 일어나지 않고 있다. 또한 학교나 지역 교육지원청에서의 업무들이 단순화․집중화되고 있지 못하다. 이로 인해서 많은 연구들이 다양한 사업들의 분화에 따른 지원의 중복에 대한 문제를 제기하고 있다. 그러나 이러한 문제 제기에도 불구하고 실제 해법으로서 제기되었던 조직․사업 통합․연계나 전문인력의 파트너십, 업무 보편화를 인한 교직원의 행정 지원업무의 간명화 등을 추진하는 교육복지 업무들 간의 통합의 혁신은 일어나지 않고 있다. 이에 대해서 한만길(2018)은 학교와 지역사회 연계 교육복지 모델로서 혁신교육지구(마을교육공동체) 사업을 통해 관련 사업을 상호 조정할 수 있어야 한다고 강조한다.
교육복지 사업은 상대적으로 열위에 위치한 학생들을 선별해 교육지원프로그램들을 제공하나 새로운 사업들과의 중복 지원이 발생하는 등 다양한 문제들이 일어나기에 여러 연구자들이 문제 제기를 하지만 변화가 일어나지는 않는다. 이를 위해 한만길은 학교와 지역사회 연계 교육복지 모델로서 혁신교육지구 사업을 통해 관련 사업을 상호 조정할 수 있어야 한다고 주장한다.