둘째, 현재의 생물무기금지협약은 생물테러리즘이나 생물전이 발생했을 시 나타날 수 있는 공공보건 위기 상황에 대한 어떠한 대응 방안도 명기하고 있지 않다. 즉 변화하는 안보 환경에 대한 대응이 부재하다. 이는 본 협약 체결 당시의 냉전적 상황 속에서 군비통제 차원에서 만들어진데다 당시 공중보건은 안보화되어 있지 않았기 때문에 나타난 결과이다. 동시에 국제 공중보건 관련 조약들, 예컨대 국제보건기구의 국제위생규칙(International Sanitary Regulation)에도 생물전과 생물테러리즘에 의해 발생 가능한 전염병 확산 가능성에 대해 전혀 대비하고 있지 않다. 더욱이 2차대전 이후 로 발전해온 공중보건 기술과 정책으로 인해 많은 선진국에서는 자연발생적 전염병에 대한 위협 의식도 현저히 저하되었다. 이제 국제사회 차원에서 공중보건에 대한 관심은 저개발국으로 집중되게 되었다. 이 역시 국제적 차원의 관리기구의 필요로 이어지기보다는 개별 국가별 국내입법 혹은 국내 정책적 차원의 공중보건 제고의 방향으로 발전하게 되었다. 이로 인해 국제사회는 공중보건에 대한 국제적 차원의 관리기구와 제도의 필요성에 대해 대부분 실감할 수 없게 되었다. 요컨대 공중보건과 생물무기통제 차원의 레짐은 서로의 영역이 중첩된다는 사실을 인지하지 못한 채 각각 독립적으로 발전해왔던 것이다.
현재 생물무기금지협약은 공공보건에 대한 대응이 부재, 이후의 관련 조약들을 반영하지 못한다. 공중보건에 대한 관심 또한 저개발국으로 집중되어 국내 차원으로 발전된 바, 국제 차원의 관리와 제도의 필요성이 실감할 수 없게 되었다. 요컨대 공중보건과 생물무기통제는 영역이 중첩됨에도 독립적으로 발전해온 것이다.