아울러 한·중수교 직후인 1993년 북한이 NPT 탈퇴를 선언하면서 ‘1차 북핵 위기’가 시작되었다. 한·중 관계는 수교와 동시에 북핵 문제가 지배적인 이슈로 부각되면서 통일 이슈는 우선순위에서 밀려나거나 부정적인 영향을 받기도 했다. 이에 따라 한국의 대중국 외교는 북핵 문제 해결, 탈북자 문제 등에 집중되면서 중국을 대상으로 본격적인 통일외교를 전개할 환경이 조성되지 못했다. 이명박 정부 등장 이후 대북정책과 북핵 문제의 해법을 둘러싼 이견이 노골화되면서 한반도 통일을 위한 한·중 양국간 협력은 현실적 어려움에 직면하게 되었다.
93년 북한이 NPT를 탈퇴하면서 북핵 위기가 최초로 시작됐는데, 남북 통일문제는 부정적 영향을 받기도 했고 통일외교를 시행할 조건이 조성되지 못했었다.