어린이집이 설치되지 않은 농촌 지역의 보육 사각지대를 해소하기 위하여 농림축산식품부에서는 ‘농촌 공동 아이 돌봄센터’ 사업을 진행하고 있다. 이 사업은 인구가 줄어 아동 수가 적어진 농촌 및 도서 벽지 등 일반 어린이집을 설치할 충분한 영유아 수가 충족되지 못하는 지역을 대상으로, 국가가 소수의 수요에 부응하여 보육서비스를 제공하고자 하는 의도로 보건복지부가 2009년에 시범사업을 필두로 시작한 국고지원 사업이다. 보건복지부는 이 사업을 ‘소규모 국공립보육 시설 설치 사업’이라는 이름으로 추진하였으나 2012년 동 사업이 농림축산식품부 업무로 이관되면서 ‘농촌 공동 아이 돌봄센터’라는 사업명으로 변경되었다. 명칭은 변경되었으나 그 역할이나 형태에서 달라진 점은 없다. 다만 보건복지부 관할 일반 국공립어린이집과 더 명확한 구별을 위해 사업명을 다르게 한 것으로 보인다.
보육 사각지대 해소를 위한 ‘농촌 공동 아이 돌봄센터’ 사업은 원래 아동 수가 적어 어린이집이 없는 지역에 시행하는 보건복지부의 국고지원 사업으로서 농림축산식품부로 이관되며 명칭이 변경되었지만 역할과 형태는 그대로이다.