2000년대 중･후반 소말리아의 테러리스트 단체 알샤바브(Al-Shabaab)의 반군활동으로 케냐, 에티오피아, 지부티 등 주변 국가로의 이주가 매우 증가하였다. 그 중 소말리아로부터 가장 많은 수의 난민이 유입된 케냐 정부는 이 난민들 중 알샤바브 구성원들이 함께 유입될 것을 우려하여 국경을 자주폐쇄하였다. 이에 대한 국제사회의 비판이 제기되면서 다시 난민들의 이주를 허용하였지만 국경선에서 30km 이상 벗어날 수 없도록 통제하였다. 2013년 9월 웨스트게이트 쇼핑몰 테러사건, 그리고 최근 4월 발생한 가리사대학 테러사건 등 끊임없이 일어나는 크고 작은 테러사건들로 인하여 케냐에서 난민 문제의 안보화 경향은 심화되었다.
2000년대 중후반 케냐는 소말리아의 테러단체 유입을 우려해 국경을 폐쇄했다가 국제적 비판으로 제한 허용하였다. 그러나 지속적인 테러가 발생하여 난민 문제의 안보화 경향이 심화되었다.