2012년에는 법무부에서 신청한 안양교도소 재건축협의를 안양시에서 불가 처리함에 따라 건물 노후화에 따른 재건축 긴급성을 사유로 법무부에서 협의 불가처분 취소를 요구하는 분쟁 조정을 신청하였다. 행정협의 조정위원회는 2012년 1월 30일 인접 유휴부지에 지역 주민 편의시설을 법무부에서 제공하는 조건으로 안양시에서 재건축을 허용하도록 하는 조정 결정을 하였다. 그러나 이후 안양시에서 재건축 협의를 이행하지 않는 등 이행강제력 부재 등의 문제점이 나타나면서 이행 강제절차 도입 등 ‘행정협의 조정위원회’의 기능 강화를 위한 제도개선의 필요성이 제기되고 있다.
행정협의 조정위원회가 안양교도소 재건축을 허용하는 조정결정을 하였으나 안양시가 이를 이행하지 않아 행정협의 조정위원회의 기능 강화를 위한 제도개선이 요구되고 있다. 