전문가들이 성별영향분석평가제도의 운영에 대해 공통적으로 제안하고 있는 것은 시민단체, 여성단체의 모니터링 활성화 방안이다. 성별영향분석 평가의 질적 성장을 위해서는 사업담당부서-기관담당부서-센터-시민이 함 께 논의할 수 있는 구조가 필요하다. 이러한 구조를 통해 정책개선안을 도출하고 환류되도록 관리하기 위해서는 시민의 역량이 강화되어야 한다는 것이다. 많은 센터에서 진행하고 있는 모니터링단 구축, 컨설턴트 양성 등은 공무원과 전문가, 시민단체 활동가들이 제도운영을 위해 협력할 수 있는 길이 되고 있다. 여성들의 역량이 축적되고 성장해야 성별영향분석평가제 도가 실효성을 높일 수 있으며 전문가들은 센터가 중심이 되어 여성들의 정책역량을 향상시키고 컨설팅의 질적 수준을 향상시키기 위한 프로그램 개발이 필요하다는 의견을 제시하고 있다.
전문가들은 공통적으로 성별영향분석평가제도에 대해 시민단체, 여성단체의 모니터링을 활성화 시키길 원하고 있다. 이에 부서와 센터, 그리고 시민 간의 소통창구가 필요하고, 그 중 시민의 역량강화가 가장 중요하다는 입장이다.