셋째, 병원균은 동물 및 곤충들과의 접촉, 질병에 걸린 가축들과의 접촉으로 인해 확산이 되기도 한다. 특히 개발도상국의 재래시장이 이러한 측면에서 많이 지적되어 왔다. 이러한 공간에서 다양한 동물들이 서로 접촉할 수 있고 또 인간과 동물이 접촉할 수 있을 뿐만 아니라, 애완용으로 거래되는 동물들 그리고 식용재료들이 유통된다. 결과적으로 병원균이 동물과 인간들 사이에 자유로이 이동할 수 있기 때문이다. 실제로 애완용 가나 쥐(Ghanaian rat)와의 접촉이 지난 2003년 미국 중서부에 창궐한 원숭이 두창(monkeypox)의 원인으로 밝혀졌다. 이는 아프리카로부터 수입한 가나 쥐가 보유하고 있던 원숭이 두창균이 미국 프레리독(Prairie dog)으로 전염이 확산되었고, 애완용으로 프레리독을 구입하려던 사람들에게 다시 원숭이 두창 병원균이 확산된 사례였다.
병원균은 동물 및 곤충과의 접촉, 질병에 걸린 가축들과의 접촉, 인간과 동물의 접촉, 애완용으로 거래되는 동물, 식용재료의 유통 등으로 확산이 된다.