자유형 집행의 정지는 형을 선고한 법원에 대응하는 검찰청의 검사 또는 형의 선고를 받은 자의 현재지를 관할하는 검찰청 검사의 지휘에 의한다. 담당 검사는 구치소 또는 교도소의 장, 형의 선고를 받은 자 또는 관계인으로부터 자유형 집행 정지의 건의 또는 신청이 있는 때에는 검사는 구치소 교도소에 출장하여 임검하되, 필요한 경우에는 구치소 또는 교도소의 의무관 또는 다른 의사로 하여금 감정하게 하는 등의 방법으로 집행정지사유의 유무에 관하여 조사하여야 한다. 검사는 형집행정지사유에 관한 조사를 마친 후 의사의 감정서를 첨부한 ‘임검결과보고서’를 작성하여 소속 고등검찰청검사장 또는 지방검찰청검사장에게 보고하고, 형집행 정지에 관한 가부의 허가를 받아야 한다(자유형 등에 관한 검찰집행사무규칙 제29조 제1항, 제2항). 형집행정지의 연장이 필요한 경우에는 정지기간 만료 7일전까지 형집행정지연장 신청을 하여야 한다(자유형집행정지 업무처리지침 제4조 제3항).
자유형 집행의 정지는 신청이 있는 때 선고법원 대응 또는 현재지 관할의 검찰청 검사가, 필요한 경우 감정 등의 방법으로 집행정지사유 유무를 조사, 임검결과보고서를 작성, 보고하고 허가를 받아야 한다. 연장은 정지기간 만료 7일 전까지 신청하여야 한다.