마이스터고는 특목고의 하나이지만, 특성화고에는 없는 다양한 특전이 부여된다. 예를 들면, 학업에 어려움을 겪거나 중단하는 일이 생기지 않도록 하고, 균등한 교육 기회 제공을 위한 장학금, 기숙사 등 경제적 지원을 하고 있다. 마이스터고 지원자들 에게서는 특성화고등학교 지원자에게서 보이는 중학교 학업성적이 낮아서 밀려서 오 거나, 부모나 학교선생님의 권유에 의해서 선택한 비율은 났다. 그 대신 마이스터고 지원자들은 본인이 선택하고(47.6%), 취업전망(50.7%) 혹은 본인의 적성과 희망을 쫓 아서 진학한 비율이 높았다(김종우 외, 2015：75-76). 이처럼 마이스터고에서는 특성 화고에 비하여 학생들의 자발적 선택에 의해서 지원한 비율이 훨씬 높기 때문에 학 생들의 의욕이나 동기부여 정도가 높아서 학교에서 공부하는 분위기가 좋다. 또한 마이스터고는 교사진 구성이나 각종 장비나 설비에 대한 지원도 잘 되어 있어서 전공과 관련하여 비교적 충실한 이론교육 및 실습교육을 받고 있다. 마이스터고의 학 교에서의 현장실습은 특성화고와 비교하여 더욱 충실한 편이고 기업과의 약정에 의 한 현장실습은 특성화고와 큰 차이는 없는 것으로 보인다.
마이스터고에는 특성화고에 없는 경제적 지원 등의 특전이 부여된다. 따라서 마이스터고 지원자들은 본인의 자발적 선택에 의해 지원한 비율이 훨씬 높아 의욕과 동기부여가 높다.  또한 교사진 구성이나 설비에 대한 지원도 잘 되어 있어 전공 관련 충실한 교육을 받고 있다.