국제 교류 협회가 외국인 주민 지원에 나서는 한편 자치성은 1995년에「지자체 국제협력 추진대강의 책정에 관한 지침」을 발표하였다. 2000년 전후 버블 붕괴로 인한 재정난과 공익 법인 개혁의 흐름 속에서 지자체의 외곽 단체를 재편하는 움직임이 활발해지고 다른 외곽 단체와 통합하는 지자체(아오모리현 등)와 시설 관리 회사만 존속시키고 협회는 해산시키는 지자체(도쿄도)도 생겨났다. 또한 지정 관리자 제도의 도입으로 지자체의 시설관리업무 위탁처가 민간에 개방되었기 때문에 국제교류센터 등 시설 관리를 다루는 국제교류협회를 둘러싼 환경은 어려움을 더하고 있다.
버블 붕괴로 인해 지자체의 외곽 단체 재편 움직임이 활발해졌으며 지정관리자 제도 도입으로 인해 국제교류센터의 어려움이 커지고 있다.