조사자체의 특성에 관한 내용은 크게 세 가지로 요약된다. 첫째, 국정과제 및 정상화과제에 대해 일반국민이 잘 모르기 때문에 일반국민을 대상으로한 국민만족도 조사결과를 활용하기 어렵다는 점이다. 조사의 신뢰성 및 타당성 제고를 위해 정책설명문 등을 제공하지만, 설명문 제시로는 한계가 있으며 설명문에 대한 부처의 피드백 및 확인 작업이 부재한 것에 대한 불만도 제기되었다. 또 국정과제가 기관의 대표적인 기능을 포괄하지 못하는 경우도 있고,국정과제별 수준 차이가 있는 등 국정과제 평가 자체에 대해서도 문제를 제기하는 것으로 나타나고 있다.
국정과제 및 정상화과제에 관한 조사는 활용도가 낮고 피드백 및 확인작업도 부재되어 있으며 국정과제평가 수준 자체에 의문을 제기하고 있다.