육군 28사단 윤모 일병 폭행 사망 사건에서도 인권에 눈감은 인권위 실상이 드러났다. 윤 일병의 지인은 지난 4월 7일 “윤 일병의 몸과 다리에 선명한 상처와 피멍 자국이 있어 조사를 원한다”며 인권위에 진정을 냈다. 인권위는 같은 달 중순께 현장조사를 벌여 엽기적인 구타와 가혹행위를 확인했다. 하지만 군 당국이 가해자를 군 검찰에 기소했다는 이유로 진정을 각하했다. 윤 일병 사건은 그 후 묻혀있다 3개월 후인 지난 달 말 시민단체인 군 인권센터의 폭로로 진상이 밝혀졌다. 그러자 인권위는 윤 일병 사건 등 최근 발생한 군내 인권침해 사건에 대해 직권조사를 실시한다고 발표했다. 뒷북도 이런 뒷북이 없다. 만일 인권위가 윤 일병 사건을 제대로 조사했다면 끔찍한 사건의 실상이 진작에 알려지고 군 당국의 은폐도 밝혀낼 수 있었다.
육군 윤모 일병 폭행 사망 사건에서 진정서가 접수되었음에도 인권위는 군검찰 기소를 이유로 진정을 각하하였다. 이후 군 인권센터의 폭로로 조사 실시를 발표하였으나, 미흡한 초기 대응에 아쉬움이 남는다.