그러나 모니터링 활동가들은 모니터링 대상사업이 어떻게 정책개선에 반영되었는지 파악하기 어려워한다는 문제점도 있다. 게다가 전년도에 모니터링했던 과제가 올해 성별영향분석평가 연속과제인 경우에도 분석평가서에는 모니터링한 결과가 적절하게 반영되어 있지 않다고 평가하기도 한다. 시민단체는 동작구의 성별영향분석평가 과제에 대한 낮은 정책개선 이행점 검에 대해 문제인식을 갖고 있으며, 기관담당 공무원이 적극적으로 이행점검을 할 수 있도록 요구하고 있다. 예를 들어 ‘좋은세상을만드는사람들’은 환류점검을 위해 작년에 모니터링했던 사업들을 다시 성별영향분석평가 대상과제에 포함시켜 달라고 요청하고 있다. 그리고 매년 모니터링해왔던 결과들을 순환보직으로 인해 공무원들이 바뀔 때마다 설명해주고 있다.
그러나 모니터링 활동가들은 대상사업이 어떻게 정책을 좋게 만들었는가 파악이 어렵다는 점을 말한다. 이에 이행점검에 대한 모니터링을 유관 공무원이 적극적으로 하도록 요구하고 있다.