이와 같은 지적과 관련하여 ① 비영리민간단체 공익활동 지원사업의 평가는 사업평가 60%, 회계 평가 40%로 구성하고 있으며, 세부 평가지표의 합이 90점을 넘으면 우수, 60점 이상이면 보통, 60점 미만은 미흡으로 평가하므로 부당집행으로 평가받아 반납한 금액이 있어도 ‘보통’ 이상의 평가를 받을 수 있다. 다만, 2014년에는 「비영리민간단체 공익활동 지원사업 관리정보시스템(NPAS)」을 도입하여 사업비 집행상황을 수시로 점검하여 부적정 집행과 미흡 사항을 사업 기간 중에 시정·보완할 수 있도록 운영하는 등 사업관리와 평가를 개선하였으므로 부적절한 집행으로 인한 환수 결정액이 예년에 비해 줄어들 것으로 기대하고 있다.
비영리민간단체 공익활동 지원사업 평가와 관련해 2014년에는 사업관리와 평가를 개선하여 부적절 집행으로 인한 환수 결정액이 줄어들 것으로 기대하고 있다. 