특허가 발행된 이후, 특허 침해 여부와 함께 쟁점이 되는 것은 특허의 유효 여부이다. 이러한 특허의 유효성 판단은 법원뿐 아니라 미국특허상표청을 통해서도 이루어진다. 먼저, 특허 유효성이 쟁점이었던 연방지방법원(District Court) 사건을 살펴보면, 2007년에서 2011년 사이 총 283개의 사건이 다투어졌고, 이 가운데 243건이 특허 무효 판정을 받아 동 기간 86%의 사건이 연방지방법원에서 무효 판정을 받았다. 그리고 2002년부터 2012년까지 연방법원에 항소한 사건의 특허 무효율은 2010년을 제외하고 2007년 이후 지속적으로 15% 이상을 기록하고 있다. 또한 미국특허상표청에서 2007년 이후 당사자계 재심사(Inter Parties Reexamination) 대상 250건 중 40%가 특허 취소되었으며, 25%는 보정을 통해서 특허를 유지하였다. 그리고 결정계 재심사(Ex parte Reexamination)의 경우 발행된 특허의 11%가 특허 취소되었으며, 66%는 보정을 통하여 특허를 유지하였다.
특허의 유효성에 대해서는 법원과 미국특허상표청에서 판단하는데, 연방지방법원에서는 2007년부터 4년간 다룬 사건의 86%가 무효로 판단되었다. 미국특허상표청에서는 2007년 이후의 당사자계 재심사 사건 중 40%, 결정계 재심사 사건 중 11%를 특허 취소 처리했다.