해군기지가 관광산업을 방해할 거라는 우려도 있다. 다분히 군사기지를 혐오시설이라고 간주하는 발상에서 비롯된 것이다. 제주도의 전통적인 효자산업인 관광산업을 더욱 발전시키려는 시각에서는 수긍할 수도 있다. 하지만 그런식의 논리라면 미 해군 태평양사령부를 비롯한 대규모의 해군기지가 들어선 하와이, 최근 몇 년 동안 역시 미군의 주력 해･공군 전력이 집중적으로 배치된 괌이 세계적인 관광명소 지위를 지키고 있다는 엄연한 사실을 설명할 수 없다. 1941년 12월 7일 일본의 진주만 공습 이후에도 하와이는 여전히 세계적인 관광 지인 동시에 태평양 지역 미 해군의 핵심기지이다. 세계적인 미항으로 손꼽히는 호주 시드니, 싱가포르, 이탈리아 나폴리 등의 군항들은 해당 지역의 관광에 장애가 되고 있지 않으며, 오히려 훌륭한 관광명소로 부상했다. 오랫동안 해군 작전사령부가 있었던 진해의 연례 군항제는 군항도 좋은 관광자원이 될 수 있음을 보여준다.
군사기지를 혐오시설로 간주하여 해군기지가 관광산업을 방해할 거라는 우려도 있다. 그러나 해군기지와 군사전력이 집중된 하와이, 괌과 세계적 미항인 시드니, 싱가포르, 나폴리등의 군항 그리고 진해의 군항제등을 볼 때 군항은 좋은 관광자원이 될 수 있다.