청소년 참여기구 가운데 청소년 참여예산제와 기능과 역할에서 가장 중첩되는 것으로 보이는 것은 청소년참여회의이다. 청소년참여회의와 청소년 참여예산제는 지자체별로 구성되어 활동한다는 점에서 구성주체가 동일하고, 지방자치단체를 대상으로 정책을 제안하고 있다는 점에서 활동범주도 유사하다. 그러나 제시된 사례를 살펴보면, 청소년참여위원회의 활동은 지자체와 연계한 청소년 참여 행사의 제안과 이에 따른 지자체의 지원이 주를 이룬다는 점에서 지역환경 개선, 교육환경 개선을 포함한 청소년 참여예산제의 활동과 차이를 보인다. 이러한 양상은 청소년참여위원회의 경우 제안된 정책 사업에 사용되는 비용이 사전에 예산으로 책정된 것이 아니라 해당 시점에 활용 가능한 예산의 범위 안에서 집행될 가능성이 크기 때문으로 보인다. 이러한 조건은 청소년 참여위원회가 제안한 정책의 실행 여부가 단체장의 선심선 예산배정에 의존하게 하며, 이 때문에 제안되는 정책 자체가 일회성 행사에 그칠 가능성을 높인다.
청소년참여회의는 청소년 참여예산제와 구성주체와 활동범주가 유사하지만 제한적인 예산 책정의 문제로 청소년 참여예산제에 비해 활동 범위에 한계가 있다.