특수 전문대학은 하노버에 있는 의학/수의학 전문대학(Medizinische und die Tieraerztliche Hochschule in Hannover)이나 뤼벡에 있는 의과대학(Medizinische Universitaet in Luebeck), 그리고 드레스덴과 에어푸르트, 막데부르그에 있는 의과대학(Medizinische Akademie) 등을 들 수 있다. 슈파이어에 있는 행정전문대학(Hochschulefuer Verwaltungswissenschaften in Speyer)의 경우는 석사와 박사학위도 수여한다. 특수 전문대학은 한국의 대학원과 같이 이미 법학, 경제학, 사회학으로 학업을 마친 사람들이 진학하는 곳으로 주로 공무원과 외국의 교수들이 재학하고 있다.
특수 전문대학은 하노버, 위벡, 드레스덴·에어푸르트·막데부르그의 의과대학을 들 수 있는바, 슈파이어 행정전문대학은 석·박사학위도 수여하는데, 특수전문대학은 주로 공무원과 외국의 교수들이 재학하고 있다.