배타적 경제수역(EEZ) 문제와 관련해서도 한국의 해양안보 환경은 결코 우호 적이지 못하다. 우선 동해와 서해의 최장거리가 각각 350해리, 450해리에 불과 할 정도로 좁다. 유엔해양법이 규정하는 EEZ 범위가 200해리라는 점을 생각할 때, EEZ를 비롯해 한국 정부가 규정하는 해양 관할범위는 상당부분 중국, 일본에서 주장하는 범위와 중첩될 수밖에 없다. 따라서 이를 둘러싼 잠재적인 해양분쟁 가능성을 배제할 수 없는 것이다. 2006년 9월부터 중국이 남해에서 한국의 이어도(마라도 남단 149㎞ 지점에 위치) 관할권 행사를 문제 삼는 것도 이를 배경으로 한다.
한국은 동해와 서해가 좁아  EZZ범위의 상당부분이 중국, 일본과 겹칠수 밖에 없는데 이는 해양분쟁이 일어날 수 있다. 중국이 한국의 이어도를 문제삼는 것도 마찬가지다.