국제항공 배출권거래제 대한 국제적합의가 없는 상황에서, EU가 일방적으로 국제항공분야를 EU ETS에 편입시킨 조치는 항공 산업은 물론이고, ICAO내에서도 다수의 국가들의 반발을 불러 왔다. 라틴아메리카민간항공기위원회 회원국들은 2011년 7월 28일 EU가 동 조치로 영향을 받는 국가들과의 사전 합의 없이 외국 항공기에 대하여 ETS를 일방적으로 부과하지 말 것을 촉구하는 공동선언에 서명하였고, ICAO에 대하여 항공기의 배출가스 감축 또는 온실가스 제한과 관련한 시장에 기반 한 기준의 골격 (framework)작업을 계속할 것을 요구하였다. 미국, 중국, 인도, 일본, 한국, 러시아, 멕시코 및 여러 라틴 아메리카 국가들을 포함한 ICAO회원국들은 2011년 9월 30일 ICAO이사회 뉴델리 회의에서 EU ETS에 국제항공을 포함시키는 것에 반대하는 ‘공동선언’에 서명하였다. 동 공동선언은 2013년 ICAO총회에서 채택하기 위한 목적으로, 항공기 탄소배출기준을 개발하는 ICAO의 노력을 지지하고, EU에 대하여 비EU항공기들을 EU ETS에 포함시키는 것을 자제하고, 국제공동체와 협력하여 작업할 것을 촉구하는 것이었는데, EU회원국들과 호주, 캐나다, 뉴질랜드 등의 국가들은 동 선언에 서명하지 않았다.
라틴아메리카민간항공기위원회 회원국들의 사전 합의 없는 ETS 일방적 부과 반대 공동선언과 ICAO 회원국들의 EU ETS에 국제항공 포함 반대 공동선언을 무시하고 EU가  일방적으로 EU ETS에 국제항공분야를 편입시켜 항공 산업과 ICAO 내 다수 국가들의 반발을 불러 왔다.