하지만 현재 캄보디아에서 전자 인사관리 시스템을 추진함에 있어 컨트롤타워의 문제, 일관된 추진체계의 부재, 지속 가능한 마스터플랜의 부재, 불명확한 책임과 역할의 문제가 존재한다. 전자 인사관리 시스템은 각 부처의 인사담당자의 협조 하에 인사와 정보화를 추진할 수 있는 강력한 컨트롤타워가 필요하다. 인사업무가 각 부처에서 개별적으로 수행되지만 통일적이고 표준적인 인사관리 시스템을 도입 운영하기 위해서는 통합 및 조정자로서 역할, 즉 컨트롤 타워로서 역할을 수행할 수 있는 조직과 인력, 권한과 역할, 전문성과 예산이 필요함에도 불구하고 이와 같은 컨트롤타워가 부재한 것이다.
현재 캄보디아에는 전자 인사관리 시스템을 도입 및 운영하기 위한 컨트롤타워가 부재하다.