기초학력 보장 정책의 효과를 극대화하기 위해서는 국가단위 평가와 시 도 교육청 단위 평가 시스템 간의 유기적 연계가 필요하다. 즉, 기초학력의 토대를 형성하는 초등학교 3학년에서 국가 수준의 기초학력 진단평가를 실시하고, 초등학교 4～5학년에서는 시 도 교육청 연합 ‘교과학습 진단평가’와의 연계를 통해 시 도 교육청 및 단위 학교 수준에서 보정교육을 실시하며, 초등학교 6학년에서는 국가 수준 학업성취도 평가를 통해 보정교육의 결과 및 교육과정의 질을 점검하는 방안이다. 이를 통해 기초학력 보정교육 및 지원 정책을 기초학력 점검 체제와 연계하여 초등학교 3학년에서 6학년까지 ‘기초학력 진단-보정-점검’을 체계화할 수 있다(김경희 외, 2014).
국가단위 평가와 시, 도 교육청 단위평가를 통한 보정교육으로  초등학생의 기초학력 진단-보정-점검을 체계화하여 기초학력 보장 정책의 효과를 극대화할 수 있다.