지금의 오바마 정부 역시 생물무기금지협약의 검증 의정서 제정을 위한 논의가 재개되지 않기를 바라고 있다. 지난 2009년 12월 군축 및 국제안보 차관보 엘렌 타우셔(Ellen Tauscher)에 따르면, 검증 의정서 제정이 빠르게 발전하는 생물무기 위협에 효과적으로 대응할 수 없다는 점을 언급하였다. 그리고 비록 법적 구속력이 있는 검증 의정서라 할지라도 검증 의정서 제정이 국제안보에 기여할 수 있을지 의문스럽다고 말한 바 있다. 미국의 이와 같은 회의적 입장은 2011년 클린턴 전 국무장관이 제 7차 평가회의에 참석하여 다시 한 번 언급한 바 있다. 또한 그는 검증 의정서 제정보다 본 협약의 투명성 제고를 위해 당사국 양자 간 혹은 다자 간 신뢰구축 조치를 활성화해야 한다고 주장했다. 당시 미국은 이러한 측면에서 1) 협약 가입의 보편화(universality), 2) 협의(consultation)를 통한 투명성 제고 및 당사국 협약준수 강화, 3) 회기 간 절차(intersessional process) 강화 및 활성화, 4) 자연발생적 질병 발생을 포함한 전염병 감시 및 대응에 대한 국가 역량 강화, 5) 생물테러리즘에 대응하기 위한 국내적 차원의 조치 및 수단 강화를 제시했다.
오바마 정부는 생물무기금지협약의 검증 의정서 제정에 대한 논의가 재개된다 하더라도 의정서가 국제 안보에 도움이 될 수 있을지 알 수 없으며 협약의 투명성을 높이기 위해 여러 국가들의 신뢰를 높여야 한다고 주장했다. 또한 미국은 협약에 대한 내용을 추가 제시했다.