그러나 1972년의 8·3긴급조치에 의해서 법정교부율이 중단되는 사태를 맞이한 후 1982년 교육세가 신설되어 경상교부금에 통합교부될 때까지 교육재정은 많은 감손이 있었고, 이후 2000년을 기준으로 지방교육재정교부금은 보통교부금, 특별교부금, 증액교부금으로 구성되었으며, 재원은 내국세 총액의 11.8%와 의무교육기관 교원봉급 전액과 봉급을 기준으로 지급하는 수당이 포함된 봉급교부금으로 충당되었다. 2004년에는 지방교육재정의 재원 확보 및 지원구조의 단순화·투명화를 위한 법 개정 이후 봉급교부금, 증액 교부금을 보통교부금으로 통합하고 내국세 교부율을 19.4%로 인상하였으며, 2006년 재 개정을 통해 내국세분 교부금의 교부율을 20.0%로 다시 인상하여 현재의 20.27%에 이르게 되었다.
1982년 교육세가 신설될 때 까지 교육재정은 많이 감손되었으나 내국세 일부와 봉급교부금으로 보충되면서 2006년 재 개정을 통해 현재의 약 20%로 인상되었다.