목천고의 진로탐색과정은 ‘내가 무엇을 할 수 있을까?’를 아는 꿈을 찾아가는 과정이라고 설명할 수 있다. 1~2학년생을 대상으로 조리·미용 분야 실습과 기초직업에 대한 탐색 과정에 초점을 맞추고 있다. 체육중점학급 역시 학교적응력을 높이기 위한 또 다른 대안교육의 일환이다. 졸업 후 사회의 일원으로 당당히 살아갈 수 있도록 생활스포츠 등 자격증 취득과 관련한 교육을 해오고 있다. 최근에는 체육중점학급 학생 23명이 국립영덕 청소년해양환경체험센터에서 스킨스쿠버 캠프에 참가하여 전원이 초급 스쿠버 다이버 과정을 수료하여 오픈 워터 자격증을 취득하기도 했다.
목천고의 꿈을 찾는 진로탐색과정 중 1~2학년은 기초직업 탐색에 집중하며, 또다른 대안교육인 체육중점학급은 생활스포츠 등 자격증 취득과 관련된 교육을 하고있다.