성별영향분석평가법이 시행된 이후 분석대상이 법령・기본계획・사업으로 확대되면서 대상과제의 수는 급격하게 증가했지만 질적 수준의 향상으로 이어지고 있다고 보기는 어렵다. 특히 중앙행정기관의 경우 일부 기관을 제외한 대부분의 기관이 성별영향분석평가 제도 운영에 소극적인 편이어서, 지방자치단체들이 성별영향분석평가 결과 제안한 정책개선안이 실질적인 정책개선으로 연결되고 않고 있다. 따라서 중앙행정기관이 성별영향분석평가제도와 관심을 갖고 적극적으로 수행하기 위한 방안이 마련되어야 하며, 이는 정부업무평가지표에 성별 영향분석평가 관련 항목을 포함시킴으로써 가능하다. 성별영향분석평가의 정책 환류와 국가정책의 성평등 향상을 위해서, 정부업무평가 전문가, 국무조정실 등 관계자와의 긴밀한 협의를 통해 정부업무평가에 성별영향분석평가를 연계시키는 방안이 모색되어야 할 것이다.
성별영향분석평가법 시행 이후 대상과제의 수는 증가했지만, 중앙행정기관들의 소극적 태도로 실질적 정책개선을 이루지 못했는데, 이를 위해서는 성별영향분석평가를 정부업무평가지표에 연관시키는 중앙행정기관 수행 방안 모색이 필요하다.