다섯째, 지역간 협력 제휴는 행정기관, 민간단체, 기업, 대학 등 다양한 주체들의 참여에 의해 이루어지는 것이 바람직하지만, 대부분의 협력 제휴는 광역 및 기초자치단체 등 관 주도 협력사업으로 추진되고 있다. 민간차원의 협력 제휴는 재정적인 어려움 등으로 인해 행정의존적이고, 체계적으로 추진되지 못하고 있으며, 친선교류 차원에 한정되고 있다. 여섯째, 충청권 및 충남-전북의 협력 제휴사업이 경우를 보더라도 지방자치단체에서 재정분담이 필요한 사업보다는, 중앙정부로부터 재정적인 지원이 필요한 사업중심으로 추진하고 있다. 이와 같이 재정이 수반되는 협력 제휴사업이 활발하게 이루어지지 않는 것은 광역 및 지방자치단체의 투자재원확보의 어려움도 있지만, 재정투자 결정을 합의했다 하더라도 집행을 위해서는 지방의회의 동의를 얻어야 하는 절차를 번거롭게 생각하고 있기 때문으로 판단된다.
지역 간 협력 제휴는 재정적인 어려움이 있는 민간보다는 대부분 광역 및 기초자치단체 등 관 주도로 추진되고 있다. 또한, 중앙에서 재정이 지원되는 사업중심으로 진행되고 있는 이유는 투자재원확보의 어려움과 의회의 동의 절차 때문이다.