산별노조는 결성이 되어 있지만, 사용자 단체의 조직이 미비하여 산별 교섭이 잘 되지 않기도 한다. 금속노조, 보건의료노조 등이 산별 차원의 중앙교섭을 하고 있고, 산별 차원의 협약이 체결되고 있다. 그러나 실제 중앙교섭에 참여하고 있는 사업장 수는 각 노조가 포괄하는 사업장 수보다도 적으며, 금속노조의 경우 주요 대공장이 중앙교섭에 참여하지 않아 해당 교섭단위의 범위가 협소해지며, 금속노조에 포괄되지 않은 중소영세사업장의 근로자들에 대한 협약 적용의 가능성이 거의 없는 실정이다. 대부분 산업별 사용자 단체가 구성되지 않고 산업별 교섭체계가 구축되지 않아 여전히 기업별(지부 또는 지회별) 교섭이 이루어지고 있는 등 아직 실질적 산별 교섭이 이루어지지 못하는 상태이다(김유선외, 2007: 10~11).
산별노조는 결성되어 있더라도, 대부분 사용자 단체 조직과 교섭체계의 구축이 미비하여 실질적인 산별교섭은 이뤄지지 못하고 있다.