둘째, 통계청의 통계승인업무처리지침을 협의 하에 개정하였다. 통계승인업무처리지침 개정안의 검토는 성별구분 사유 중 자료수집 도구의 부적합성, 현실적 곤란, 법령상 곤란, 구분 부적합 등 5개의 제한 사항에 대해 검토를 하였고 이에 대해 통계청에서 다음과 같이 수용하였다. 먼저 자료수집 도구의 부적합성은 성별구분 사유에서 삭제하고 대신 통계신뢰성 한계를 추가하여, 조사모집단의 왜곡이 커 적합한 통계 생산이 어려운 경우만 성별구분 사유로 추가하였다. 현실적 곤란은 ‘불특정 다수 등을 대상으로 하는 등 통제가 불가능한 경우’에서 ‘불특정 다수 등을 대상으로 조사되어 성별구분이 현실적으로 불가능한 경우’와 ‘개별법령에 서식이 지정되어 즉시 개정이 곤란한 경우 등’으로 수정 보완되었고, 성별 구분의 응답가중으로 인해 무응답이 현저히 높아질 경우 등은 삭제하였다. 그리고 법령상 곤란은 통계법 18조(통계작성의 승인)에 이미 규정되어 있기 때문에 예외조항이 될 수 없다는 의견을 받아들어 지침에서 삭제했고 구분 부적합의 경우도 조사실익이 없는 경우라는 애매한 표현을 제외, 종합지수산정이나 임금산정 등 통계작성 목적에 부합하지 않다고 판단되는 경우로 한정하여 예외조항으로 개편하였다.
통게청은 성별구분 사유 중 자료수집 도구의 부적합성, 현실적 곤란, 법령상 곤란, 구분 부적합 등 5개 사항에 대해 검토하여 통계승인업무처리지침을 협의 하에 개정하였다.