넷째, 현재의 계층제 조직을 개혁하는 대안을 고려할 수 있다. 이를 위해 먼저 회의체 조직 또는 TFT 조직을 만드는 것이다. 현재 행정의 전문화에 대응하여 계급제에 바탕을 두고 있으면서도 기술직, 개방형 직위제 등과 같은 직위분류제적 요소를 강화하고 있다. 이는 세부적이고 특정화된 정책문제에 대한 대응에서는 효과적일 수 있지만 지리적 분산시대에는 대응성이 떨어질 것이다. 앞서 살펴본 바와 같이 청와대와 국회에의 빈번한 출장 등으로 인하여 대면접촉이 어렵고 직무투입 및 심층적 검토시간이 부족하여 정확하고 적시성 있는 정책결정이 어려우며, 더욱이 집단토론의 곤란으로 숨겨진 정보의 교환 및 공유를 통해 최적대안을 발견하기 어렵다. 이러한 상황에서는 비정형적 정책사안이 발생할 때 전문적으로 대응할 수 있는 회의체 조직, 즉 일종의 태스크포스(TFT) 조직을 가동시키는 것이 더 효과적일 수 있다. 그 다음 국과장 복수 담당제를 도입하는 것이다. 이는 국장 공백시 과장이 국장 역할을 하고 과장 부재시 국장이 과장 역할까지 수행하는 ‘1인 2역제’를 도입하는 것이다. 국회 출장 등으로 국장 또는 과장의 공백이 발생할 때 효과적으로 대응할 수 있는 대안이 될 수 있다. 근본적으로 서울-세종 간의 조직업무에 기초한 조직진단의 필요성이 제기된다. 이를 통해서 조직구조 및 기능의 재설계에 따른 부처별 공무원 인력채용 및 증원에 대한 논의 또한 필요한 시점이다.
현 계층적 조직을 회의체 조직으로 개혁하는 것을 검토할 수 있다. 현재 계급제를 바탕으로 직위분류제적 요소를 강화하고 있으나 지리적 분산 시대에는 대응성이 약할 수 있다. 이 경우 비정형적 정책사안에 전문적 대응이 가능한 회의제 조직이 더 효과적일 수 있다. 또한 국과장 복수 담당제를 통해 국장 혹은 과장의 공백 시 서로가 서로의 역할을 수행하는 것도 대안이 될 수 있다.