전문기관에게 위탁하는 방안에 대한 찬반의견은 해당 부처의 소관 규제의 규모에 따라서도 다르게 나타났는데, 소관규제가 많은 경우엔 전문기관을 지정하여 주요 규제에 대한 비용분석업무를 일괄적으로 위탁하는 방안을 긍정적으로 고려하고 있었다.64) 다만 소관규제의 수가 많은 부처의 경우에도 전문기관을 지정하여 위탁하는 방안의 현실적인 제약으로서 몇 건의 비용분석을 어느 정도의 비용으로 계약하는 것이 적정한지에 대한 판단기준이 없어 예산계획시 어려움이 있다는 점, 전문기관에게 위탁한다고 하여도 해당 공무원의 업무는 크게 줄어들지 않을 것이라는 점 등을 문제점으로 지적하고 있었다.
소관 규제 규모에 따라 부처별로 전문기관 위탁에 찬반이 갈렸는데, 소관규제가 많은 경우 긍정적으로 보지만, 예산기획의 어려움, 공무원 업무량의 불변 등은 문제로 지적했다.