우즈베키스탄 국경 통관절차 시에는 가장 큰 문제점으로 세관 공무원의 행정 능력 부족 혹은 뇌물수수 요구 등을 꼽을 수 있다. 우즈베키스탄의 경우 통관 절차가 특별히 복잡하지는 않지만 전산화된 시스템이 미비하고 뇌물 등의 이유로 통관 시 시간이 과다하게 소요될 수 있는 애로점이 산재해 있다. 이러한 우즈베키스탄의 문제점은 투르크메니스탄 포함 중앙아시아 국가들의 전반적인 문제점으로 꼽힌다. 이에 카자흐스탄, 우즈베키스탄, 투르크메니스탄은 중앙아시아 국가 중 상대적으로 철도 인프라가 발달해있고, 국가 간 궤간이 일치하는 등 하드웨어적 요소로는 큰 장애요인이 없으나, 국경 세관에서의 통합된 통관 절차 부재 등의 소프트웨어적 많은 장애물로 투르크메니스탄까지 다소 긴 운송시간이 소요된다.
우즈베키스탄은 전산화된 시스템이 미비하고 뇌물 등의 이유로 국경 통관 시 시간이 과다하게 소요된다. 이는 투르크메니스탄 등 중앙아시아 국가들의 전반적인 문제점이다.