청소년참여법정을 시행할 법원과 시행 시기에도 이론(異論)이 있었다. 시행할 법원은 청소년참여법정이 소년보호사건의 처리 절차이므로 소년부가 있는 법원에서만 실시하여 집중성과 효율성을 높이자는 주장이 있었고, 반면 전국적인 통일성을 위해 지원에까지 확대해서 실시해야 한다는 방안이 제기되었다. 만약 지원에서까지 청소년참여법정을 실시하면 법원에 찾아오기가 쉬워서 소년과 보호자의 부담이 경감되고 진행인 등 자원봉사자 확보도 용이한 장점이 있지만, 반대로 좁은 지역사회의 특성상 소년의 사생활을 보장하기 어려워 낙인효과가 염려되기도 하고, 처음부터 청소년참여법정을 지원으로까지 확대하는 것은 무리라는 단점도 있었다.
청소년참여법정 시행 장소에 대한 의견은 법원, 지원에까지 확대로 나뉜다. 후자는 소년과 보호자의 부담 경감 및 자원봉사자 확보가 용이하단 장점이 있지만, 낙인효과 등의 단점이 있다.