환경부도 도시지역의 빈번한 침수에 대한 대책 마련을 위해 2012년 5월에 ‘도시침수예방 하수도정비 종합대책’을 수립하였고, 2014년도에 ‘도시침수대응’사업에 1,757억원의 예산을 배정하였으며, 2015년도 예산안에는 667억원 증액된 2,424억원이 편성되었다. 환경부의 ‘도시침수대응’ 사업은 하수범람으로 침수피해가 발생하거나 발생할 우려가 있는 지역에 하수관 정비, 저류시설 설치 등 하수도 인프라를 확충하여 상습 침수지역을 해소하고 공공수역의 수질을 개선하는 것을 목적으로 하는사업이다. 동 사업은 2017년까지 우수관거 1,105㎞ 정비, 하수저류시설 44개소 신설, 빗물펌프장 42개소 신 ․ 증설 등을 목표로 추진되고 있다.
환경부는 도시침수예방을 위해 하수도정비 대책을 수립 후 도시침수대응 사업에 예산 배정을 늘려왔다. 이 사업은 침수피해 발생 및 발생예상지역에 하수도 인프라 확충 및 수질개선을 목적으로 한다.