현재와 같은 고등교육 재정지원사업이 사업기관과 관련해 나타내는 특징은 단기⋅소액 사업의 비중이 크다는 점이다. 다음 <표 Ⅱ-7>을 살펴보면 2012년에 3년 미만 단기사업이 32.1%로 2011년 9.8%보다 22.3% 포인트 증가한 반면, 장기사업은 56.0%로 전년대비 3.3% 포인트 감소한 것을 알 수 있다. 단기사업은 사업의 지속성 보장에 한계가 있으며, 성과를 창출하는 데도 장기사업에 비해 제한이 많아 재정지원의 효과 및 효율성을 제고하기 쉽지 않다는 특징이 있다. 특히 2012년 사업 수가 174개로 전년의 87개보다 2배가량 증가한 것은 그만큼 재정지원 여부를 결정하는 평가의 다양성과 복잡성이 증가한다는 의미도 있기 때문에 향후 평가항목 재정비의 필요성을 시사하는 부분이기도 하다.
현 고등교육 재정지원사업은 단기/소액 사업에 집중되어 있지만, 단기사업은 지속성이 보장되지 않고 재정지원 효과의 입증이 어렵다. 재정지원 여부 평가항목이 재정비되어야 한다.