설문조사대상은 예산요구기관과 예산심의기관으로 구분하였는데, 예산요구기관은 기획재정부를 제외한 각 부처의 기획재정총괄담당관이나 기획재정담당관 등의 예산안 편성 및 재정사업 성과관리 담당자 등을 대상으로 하였다. 예산심의기관은 크게 기획재정부와 국회로 나눈다. 미국, 뉴질랜드, 영국, 호주 등 외국의 프로그램 예산제도는 서울과학기술대 김재훈 교수가 집필하여 공동으로 연구보고서를 완성하였다. 프로그램 예산제도는 프로그램 사업별 총비용 산정을 핵심요소로 하지만 본 연구에서는 프로그램별 비용배분에 관한 회계측면의 접근은 연구범위에서 제외하였다.
예산요구기관은 기획재정부를 제외하고 예산안 편성과 재정사업 성과관리 담당자 등으로, 예산심의기관은 기획재정부와 국회로 설문조사대상을 선택하였다.