연석회의는 협약의 의제 논의를 위해 출산·양육, 능력개발·고용확대, 노후생활 기반 구축, 역할분담 등 분야별 4개의 분과위를 구성했다.정부, 경제, 노동계는 4개 분과위에 모두 참여하고 시민사회단체는 각 분과위에 분산 참여하되 참여하지 않은 분과에 대해서도 의견을 개진할 수 있도록 조정하였다. 분과위원회 활동을 통해 합의되지 않은 쟁점사항에 대해서는 쟁점논의소위원회를 구성하여 집중 논의하였다. 각 분과위원회와 쟁점논의소위원회를 통해 도출된 결과를 바탕으로 연석회의는 정부 1명, 노동계 2명, 재계 2명, 여성계 2명, 시민사회 2명 등 총 9인의 ‘협약초안소위원회’를 구성하고 협약 초안 마련 및 협약 초안에 반영된 쟁점 조율을 위한 회의를 진행하였다. 이후 협약 초안에 대한 각계의 의견을 수렴하여 조정 작업을 거친 후 2006년6월 20일 저출산·고령화대책 연석회의는 출범 6개월 만에 ‘저출산·고령화문제 해결을 위한 사회협약’에 합의하고 채택했다.
저출산, 고령화대책 연석회의는 분과위원회와 쟁점논의소위원회를 통해 도출된 결과를 바탕으로 총 9인의 '협약초안소위원회'를 구성하고 사회협약에 합의했다.