학습모듈의 평가시기와 관련하여 신규로 개발된 학습모듈에 대해서는 ① NCS 학습모듈을 개발한 직후에 바로 평가, ② 학습모듈 개발 후 적용 1년~2년 이후에 평가, ③ 1안과 2안을 모두 실시하는 세 가지 방안을 제시한다. ④ 2013년부터 2016년 사이에 매년 개발된 학습모듈은 1안과 2안을 선택할 수 없는 사례가 상당수 있기 때문에 우선순위를 결정하여 평가하는 방법도 제안할 수 있다. 평가의 우선순위는 학습모듈을 가장 많이 활용하고 있는 특성화고 실무과목과 전문대학에서 가장 많이 사용되는 세분류 중에서 선정하는 것이 바람직할 것이다.
신규 학습 모듈의 평가시기로 개발 직후, 적용 후, 앞선 두 방안을 병행하는 세 가지 방안이 제시되었고 선택이 불가능한 경우 우선순위 결정 후 평가해야 한다.