한편 한-중FTA 투자협상이 최대한의 효과를 내기 위해서는 한-중FTA 투자협상을함에 있어서 기 체결된 한-중투자보호협정과의 관계를 명확히 할 필요성이 있다. 만약 한-중투자보호협정의 효력을 유지하면서 새롭게 FTA 투자협정을 체결하는 경우 투자 자유화의 범위, 보호 수준 및 양 규범간 표현의 차이에서 오는 혼란을 최소화할 필요성이 있다. 또한 FTA 투자협상을 통해 한-중투자보호협정상의 투자 자유화 수준을 확대하고, 투자보호에 미흡한 부분을 제도적으로 보완하게 될 경우 기 체결된 한-중투자보호협정은 그 존재 의미가 크게 축소될 수밖에 없다. 그러한 점에서 한-중 투자보호협정을 한-중FTA 투자협정과 별도로 그 효력을 유지할 것인지 여부에 대한 신중한 검토가 필요할 것으로 보인다.이와 관련하여 한국-페루FTA 투자협정은 이러한 문제를 해결하는데 좋은 본보기가 될 수 있을 것으로 보이는 바, 기 체결된 BIT의 효력을 상실시키는 규정을 포함하고 있다. 따라서 양 당사국이 기 체결한 양자간 투자조약으로부터 도출된 모든 권리 및 의무뿐 아니라 그 조약도 FTA 투자 협정의 발효일에 효력이 중단된다. 이처럼 한-중FTA 투자협상에서는 양국간에 체결된 BIT의 효력을 상실시키거나, 아니면 기존 BIT와 관련해서 발생할 수 있는 문제점들에 대해 협상과정에서 명확히 하는 작업이 필요할 것으로 보인다. 특히 한-중FTA 투자협정이 소급 적용되도록 협상이 타결될 경우 한-중투자보호협정 규정과의 적용문제에 대해서도 검토가 필요할 것이다
한-중 FTA 투자협상의 최대 효과 기대를 위해 기 체결된 한-중 투자보호협정과의 관계를 명확히 하거나, FTA 투자 협정 발효일에 한-중 투자보호협정의 효력을 상실시키는 방안을 생각함으로써 추후 발생될 혼란을 최소화할 필요가 있다.