백분위 점수에서 나타난 각국의 남녀 간 성취도 차이를 국가별로 분석해 보면 남학생이 여학생보다 성취도가 높게 나타난 국가의 경우 남학생이 대부분의 백분위 점수에서 여학생보다 높거나 50백 분위 이상의 점수에서 남학생의 점수가 높게 나타난 것을 알 수 있다. 반면 여학생의 성취도가 남학생에 비해 높게 나타난 국가의 경우 50백 분위 이상에서는 성차가 크지 않았지만 50백 분위 이하에서 성차가 크게 나타났다. 즉, 우리나라의 경우 남학생이 여학생보다 전체 평균이 높았는데 이 차이는 주로 상위집단 학생들에게서 나타난 성차에 기인한 것이고, 스웨덴, 핀란드, 아랍에미리트 등은 여학생의 점수가 남학생보다 높았는데 이 차이는 주로 하위집단에서 나타난 성차에 기인하였다. 폴란드, 미국, 영국의 경우는 전체 평균에서의 성차는 작았지만 각 백분위 점수별로는 유의한 차이가 나타났다. 다만, 영국의 경우 백분위 점수별로 비교해도 모든 구간에서 유의한 성차가 나타나지 않는 특징을 보였다.
백분위 점수에서 남녀 간 성취도 차이를 보면 우리나라는 남학생이 상위집단의 성차로 평균이 높았으며, 스웨덴, 핀란드, 아랍에미리트는 하위집단의 성차로 여학생이 높았다. 폴란드, 미국은 성차는 작았지만 점수별 유의한 차가 있으며, 영국은 전 구간에서 차이가 없었다.