우선 안전보장문제와 관련된 수상의 최종적 정책결정을 보좌하기 위한 목적 으로 국가안전보장회의(National Security Council)를 2013년 12월에 창설하였고, 2014년 1월에는 그 실무기능을 수행하기 위한 조직인 국가안전보장국을 내각관 방에 설립하였다(󰡔朝日新聞󰡕 2013년 12월 5일 및 1월 8일 기사 참조). 사실 1947년 미국에서 국가안보이슈에 관한 대통령의 정책결정을 보좌하기 위한 국가안 보회의(NSC)가 설치된 이후, 한국을 포함한 세계 각국은 유사한 기구들을 설치, 운영해 왔다. 일본에서도 90년대 이후 보통국가론이 대두된 이래, 국내외 안보정세에 관해 분석하여 최종정책결정권자의 정책결정을 적시에 뒷받침하는 조직의 설립 필요성이 논의되어 왔었다. 아베 수상은 이러한 논의를 이어받아 2013년 6월에 국가안보회의 설치법안을 의회에 제출하였고, 야당 측의 의견도 수렴한 끝에 11월에 관련 법안을 성립시키기에 이르렀다. 일본판 국가안보회의는 수상, 부총리, 관방장관, 외상, 방위상 등 5명의 참석자로 구성되며, 매월 2회 정도 개 최되면서, 국가안보현안에 관한 주요 정책을 논의하고, 수상의 정책결정을 보좌하게 된다. 국가안보회의의 실무기능을 지원하기 위해 후속적으로 설치된 국가 안전보장국은 외무성, 방위성, 경찰청 등에서 파견된 총 60여 명의 요원으로 구 성되며, 주로 세계 각 지역의 정세를 분석하고, 일본의 중장기 안보전략을 기획하는 역할을 담당하게 된다. 초대 국장에는 아베 수상의 외교브레인이었던 야치 쇼타로(谷內正太郞) 전 외무차관이 기용되었으며, 이례적으로 현역 자위관원 10 여 명이 실무요원으로 참가하게 되었다.
1947년 미국에서 국가안보회의가 설치된 이후 세계각국에 유사기구가 생겨났으며 일본의 경우 2013년 아베 내각에 의해 국가안보회의 설치법안이 마련되었다. 일본판 국가안보회의는 수상 등 5명이 매월 2회 국가안보 주요 정책을 다루면서 수상의 정책결정을 보좌한다. 국가안보회의 실무기능을 지원하기 위한 국가 안전보장국도 뒤이어 만들어졌다.