2주기 연구에서는 1주기 연속 패널과 2주기 신규 패널 등 2개의 패널을 구축하도록 하였다. 1주기 연속 패널은 1주기 연구 참여자들 중, 2017년에 고등학교를 졸업한 이들 10명을 대상으로 구축하도록 한다. 2주기 신규 패널은 한국에 입국한 지 3년 이내의 초등학교 6학년 학생 10명, 중학교 3학년 학생 10명 등 총 20명으로 구축하도록 한다. 1, 2주기 패널을 합하면 총 30명의 탈북청소년이 이 연구에 참여하게 된다. 고교 졸업자의 경우에는 학생만, 초, 중등학생의 경우에는 학부모, 교사도 모두 면담 대상에 포함하여 2주기 연구를 위한 총 조사 대상 규모는 총 70명이다. 이들을 대상으로 2017년부터 2021년까지 5년 간 조사가 진행될 예정이다.
2주기 연구는 총 30명의 탈북청소년과 학부모, 교사 등을 포함하여 약 70명이 조사 대상에 포함되며, 2017년부터 5년간 조사가 진행된다.