한편, 학교조직 구조에서 주의 깊게 살펴볼 또 하나의 내용이 학교조직의 학교 밖 구조와의 연계협력 관계이다. 그리고 이것은 학교조직이 외부 환경에 취약성을 보이는 중요한 이유로 제기되는 전략적 고위층과 운영 핵심층의 연결고리 역할을 담당하는 학교행정가의 지위와 역할 문제이기도 하다. 즉 Rowan(1982: 260)이 논의하고 있는 것처럼, 교육 조직의 혁신은 제도화된 규범과 가치에 따라 결정되는 경향이 크다는 점에서 학교 행정가로서 조직 내부에서 최상위 지위를 차지하고 있는 학교장은 외부의 변화 요구를 수용할 수밖에 없고, 이로 인해 관료적 기대에 의존하는 학교조직 구조는 자연스럽게 조직 외부 환경에 노출되어 혁신 압력을 수용할 수밖에 없게 된다. 이처럼 학교조직 구조는 학교가 기본적으로 관료 조직의 특성을 가진다는 점에서 공식적 조직과 그에 따른 개별 구성원의 지위와 역할이 중요하다고 볼 수 있지만, 공식적 조직을 도식화한 조직도에서 표현되지 않는 조직 현실, 외부 환경과의 관계를 함축하고 있다. 따라서 학교조직 외부에서 입안되어 단위 학교조직에서 실행되는 교육정책 과정 분석 연구에서는 지금까지 국내 교육행정학계에서 상대적으로 소홀히 다루어져 온 학교 내 조직 구조, 학교 외 구조와의 연계 협력 특성 등에 대한 분석 또한 긴요하다.
학교 밖에서 수립되어 학교에서 실시되는 정책분석 연구에선 학교 내 조직구조와 학교 밖 구조와의 상호 협력관계에 대한 조사가 필요하다. 학교 책임자는 바깥의 변화 요청을 받아들일 수 밖에 없는 위치와 책임을 갖고 있는데 이로 인해 관료적 구조인 학교 조직은 어쩔 수 없이 외부 압박에 의한 변화를 수용할 수밖에 없다.