여기서 분석 대상 데이터의 출처로서 고등학교 3학년 코호트를 사용할 것인지 또는 중학교 3학년 코호트를 사용할 것인지가 문제가 될 수 있다. 교육고용패널에서 수능 데이터가 조사되기 시작한 1차년도(2004)를 기준으로 볼 때, 고3 코호트의 경우 수능 직전에 데이터가 수합되었으므로 탐구과목 선택 요인에 관하여는 제공할 수 있는 정보가 상대적으로 적다고 할 수 있다. 반면 중3 코호트의 경우 수능 응시보다 약 3년 전부터 데이터가 수합되었으므로 탐구과목 선택 요인에 관하여는 제공할 수 있는 정보가 상대적으로 많다고 할 수 있다. 그러므로 본 연구에서는 과학탐구 영역에서 심화과목 선택 요인을 살펴보기 위해서는 중3 코호트를 집중적으로 살펴보는 것이 바람직하다고 판단하였다. 여기서 중3 코호트의 경우 기존 패널과 신규 패널로 나뉘며 고등학교 진학 시기와 유형(일반계고/전문계고), 과학고 조기졸업 여부 등에 따라 설문지가 다양하게 변화하는 문제가 있었다. 이에 본 연구에서는 1차년도(2004)의 기존 중3코호트 중 2차년도(2005)년에 일반고에 진학하고 4차년도(2007)에 2008학년도 수능에 응시한 학생들의 데이터를 분석 대상으로 삼았다. 활용한 설문지는 1차년도(2004)의 중3 학생설문지 및 가구설문지, 2-4차년도(2005-2007)의 일반고 학생설문지, 5차년도(2008) 통합설문지로서 그 응답을 패널 ID 변수(BYSID)를 기준으로 좌우(wide) 병합하여 사용하였다. 특히 1차년도 데이터는 학생들의 자가응답뿐만 아니라 교사들의 응답이 함께 제시되어 있고, 특히 보호자들이 응답한 가구설문지 또한 포함하고 있으므로 학생들의 개인 특성 뿐 아니라 가정의 사회경제적지위(SocioEconomic Status, SES) 등 교육 연구에서 주요하게 다루어지는 변수들을 다양하게 고려할 수 있다고 판단하였다. 이와 같이 일차적으로 정리한 자료구조는 421명의 코호트에 대한 2,774개의 변수로 이루어진 행렬로서 이를 입력변수 설정의 기초 자료로 사용하였다.
본 연구에서는 과학탐구 영역에서 심화과목 선택 요인을 살펴보기 위해 제공할 수 있는 정보가 상대적으로 많은 중3 코호트를 집중적으로 살펴보는 것이 바람직하다고 판단하였다. 본 연구에서는 2005년에 일반고에 진학하고 2007에 2008학년도 수능에 응시한 학생들의 데이터를 분석 대상으로 삼고, 자료구조는 421명의 코호트에 대한 2,774개의 변수로 이루어진 행렬로서 이를 입력변수 설정의 기초 자료로 사용하였다.