다음 단계는 영역 구분에 따른 기금 할당이다. 각각에 필요한 지원 규모 및 우선순위를 파악하여 기금을 배분하며, 이를 위한 적절한 자금 조달 방법을 강구하여야 한다. 실제 수행하려면 지원 규모 확정 및 우선순위 지정보다 오히려 지원 자원 확보에 더욱 큰 어려움이 있을 수 있다. 실제 EU가 동유럽 국가들을 통합적으로 제 분야에서 지원하는 방식은 체계적이며 객관적이다. 이를 토대로 공동체는 이념대립에 의해 냉전 시기 명확하게 지켜져 왔던 지역 분할의 개념을 상쇄시켜 왔다. 이러한 과정을 통해 독일통일 이후 유럽 공동체의 경제적 편익 및 사회적 편익은 극대화하였음을 재인식하여야 한다.
EU의 동유럽 국가들에 대한 체계적인 지원 방식을 참고하여 각 영역에 필요한 지원 규모 및 우선순위를 파악하고 적절한 자금 조달 방법을 통해 기금을 배분해야 한다.