국회 예산안 심의 과정에 지출 검토를 도입하는 방안에 대해 국회가 정치적 결정의 장이라는 점에서 지출한도 설정 시 정치적 합의의 과정이 쉽지 않다는 점을 지적한다. 또한, 개별 국회의원의 집합체인 국회가 그동안의 쪽지예산이나 지역구 챙기기와 같은 관행에서 벗어날 수 있는 견제장치로 지출 검토가 활용될 수 있는 반면, 그만큼 국회의원의 예산심의권을 저해하는 제도의 도입을 결정할 것인가에 의문을 가지기도 한다. 또한, 지금까지 예산안 심의가 지나치게 세부사업이나 내역사업 수준의 심의에 머물러 있는 점을 개선하여, 다 부처 사업이나 부처 간 유사 중복사업에 대한 전반적인 조정의 역할을 수행할 수 있도록 해야 한다는 의견도 있다.
부처 사업이나 부처 간 유사 중복사업에 대한 전반적인 조정의 역할을 수행할 수 있도록 해야 한다는 의견도 있다.