넷째, 1주기 학교별 평균 학업성취도 및 학교별 학업성취도 변화율과 학교 소재지, 설립유형 등 학교수준 투입변수의 관련성을 분석한 결과, 국어, 영어, 수학성취도 공히 읍면 지역이 서울지역보다 1주기 학교별 평균 학업성취도가 높은 것으로 분석되었는데 이는 서울지역이 읍면지역에 비해 학업성취도 평균값은 높으나 학교평균 SES 변수를 통제한 결과로 풀이된다. 설립유형, 남녀공학 등의 변수는 1주기 학교별 평균 학업성취도 및 학교별 학업성취도 변화율에 통계적으로 유의한 영향을 주지 않았다. 학교평균 SES는 모든 교과에서 통계적으로 유의하였으며 학교평균 SES가 높아질수록 주기에 따른 학교별 학업성취도가 향상되는 것으로 나타났다. 앞서 학생수준 SES의 학업성취도에 대한 영향력이 국어, 수학, 영어 순으로 커진다고 언급한 것과 마찬가지로 학교평균 SES의 영향력도 동일한 패턴으로 나타나 사회경제적지위가 높은 학생들이 모이는 경우 영어와 수학성취도에 대한 학교효과가 상당할 것으로 예측된다.
SES 변수를 통제한 분석 결과 국어, 영어, 수학성취도에 있어서 읍면 지역이 서울지역보다 1주기 학교별 평균 학업성취도가 높은 것으로 분석되었다. 학교평균 SES는 모든 교과에서 통계적으로 유의했으며, SES가 높아질수록 주기에 따른 학교별 학업성취도가 향상되었다.