그러나 이런 취지와 목적에도 불구하고 현장의 저항과 불만은 높다. 저항과 불만은 다음과 같이 요약될 수 있는데 청소년안전에 대한 실효성이 과연 보장되는 법조문 개정인가에 대한 의문으로부터 시작해 청소년수련시설과 청소년수련시설이 아닌 기관과의 형평성 문제, 사전 신고 및 의무 인증활동에 대한 기준의 모호성, 신고절차 및 인증절차의 번거로움, 청소년활동에 대한 근원적인 문제제기, 인증제의 취지 훼손, 수련활동인증제의 폐기론 등에 이르는 비판들이 대두되었고, 심지어는 청소년활동을 진흥하는 법이 아니라 청소년활동을 규제하고 결국 위축되게 만드는 법이란 호된 비판에도 직면하고 있는 실정이다.
청소년 안전에 대한 실효성이 보장되는 법조문 개정인가 청소년수련시설기관과 비기관과의 형평성문제등 청소년 활동을 규제하고 위축되게 만드는 법이란 호된 비판에도 직면하고 있다.