생존분석과 이중차이 분석을 이용해 수수료 변경의 효과를 분석한 결과, 특허, 실용신안, 디자인의 경우 대체로 수수료 인상은 등록률을 낮추고, 수수료 인하는 등록률을 높이는 것으로 나타났다. 상표의 경우는 이들 산업재산권과는 다른 특색이 있는 것으로 생각되며, 수수료 인상과 등록률을 바로 연관 짓기는 어려웠다. 본 장에서는 이중차이 분석을 사용함에 있어서 통제집단으로 외국법인을 사용하였다. 외국법인을 통제집단으로 사용할 경우 기술의 진부화 등 통제할 수 없는 다른 변수들이 외국법인과 실험집단인 내국법인(또는 자연인)간에 비슷한 양상으로 나타나는 것을 전제한다. 국내경기와 해외경기 상황이 다를 수 있고, 이는 내국법인과 국내 법인에게 다른 영향을 미치므로 본 장의 수수료 변화의 효과에도 영향을 미치게 된다. DID 분석에서 제시된 특정 값 자체에 의지하기 보다는 신뢰대(confidenceband)를 설정할 필요가 있다. 또한, 통제집단과 실험집단 간 중도절단 비율이나 전기의 생존율이 미치는 영향도 완전히 배제할 수는 없을 것이다. 수수료 구조는 연차별, 청구항 별로다르기 때문에 엄밀한 분석을 위해서는 청구항 수별로 별개의 생존곡선 추정 및 DID 분석을 해야 할 것이지만, 이 경우 표본 수의 문제로 인해 표준오차가 커져서 추정치의 신뢰도가 떨어지는 단점이 있다.
특허, 실용신안, 디자인에선 수수료와 등록률이 반비례했고, 상표의 경우는 다른 특성이 있는지 연관짓기가 어려웠다. 이중차이 분석의 통제집단으론 외국법인을 사용했는데, 이 경우 통제할 수 없는 다른 변수들이 비슷하게 나타난다고 전제하게 된다. 상황이 다를 수 있으므로 신뢰대를 설정해야 한다. 또 청구항수별로 분석해야 하겠지만 그 경우 신뢰도가 낮아진다.