이와 같이 중재판정부가 구성되고 나면 양측 대리인과 중재판정부는 절차협의를 위한 기일을 개최한다. 이는 양측과 중재인이 직접 참석하는 기일의 형태로 진행되거나, 전화회의로 개최되기도 한다. 여기서 정해지는 사항은 중재기일, 주장서면의 제출순서, 증인진술서 및 전문가 증인 진술서 제출방법, 문서개시절차의 진행방법 및 시기 등이다. 통상적으로 중재인들과 대리인들의 향후일정을 확인하여 1주 내지 2주의 심리기일 기간을 먼저 정하고, 그 심리기일 이전에 양측이 어느 정도의 시간을 두면서 주장서면 및 증거를 제출할 것인지를 정하게 된다. 국제중재절차의 중재인들은 법원 소송을 지휘하는 판사에 비하여 절차를 통제하는 권한이 약하므로, 이러한 절차 사항에 대하여는 대리인들이 미리 협의하여 합의된 사항을 중재판정부에 전달하고 합의되지 아니한 사항에 대하여만 중재인의 절차적 판단을 받도록 하는 것이 일반적이다.
중재판정부의 기일 진행 절차에 대해 국제중재절차의 중재인들은 판사에 비하여 절차를 통제하는 권한이 약하므로 합의된 사항을 중재판정부에 전달하고 합의되지 아니한 사항에 대하여만  중재인의 절차적 판단을 받는 것이 일반적이다.