외국인기능실습제도는 수용기관에 따라 기업단독형과 단체관리형으로 구분할 수 있는데, 기업단독형은 일본 기업 등의 실습실시기관이 해외현지법인, 합병기업 또는 거래처기업의 직원을 직접 받아들여 기능실습을 실시하는 형태이다. 한편 단체관리형은 중소기업단체, 상공회의소, 재단법인, 사단법인 등 영리를 목적으로 하지 않는 단체(감리단체)가 기능실습생을 받아들여 산하기업(실습실시기관) 등에서 기능실습을 실시하는 형태라고 할 수 있다. 기업단독형보다는 단체관리형의 수속절차 등이 간단하기 때문에 외국인기능실습제도의 대부분은 단체관리형에 의해 실시되고 있는데, 단체관리형의 경우 외국인기능실습생은 입국 이후에 강습(일본어교육, 기능실습생의 법적보호에 필요한 강습 등)을 받은 후 실습실시기관과 고용계약을 체결하여 최대 3년간 기능실습생으로 근무하게 된다. 기능실습생을 받아들일 수 있는 직종 및 작업은 2015년 1월 23일 현재 69개 직종, 127개 작업에 달한다.
외국인기능실습제도는 기업이 직원을 직접 받아들여 실시하는 기업단독형과 감리단체가 산하기업에서 실시하는 단체관리형으로 구분되는데, 단체관리형이 대부분을 차지한다. 단체관리형의 실습생은 입국 이후 강습을 받고, 실습실시기관과 계약해 최대 3년간 근무한다.