관리체계의 목표는 보육의 질 향상으로 동일하나, 사업주체별 세부 목표나 내용, 관리 주체가 다름으로 인해 서로 상이한 혹은 동일한 기준을 적용함으로써 현장에서는 중복과 과중, 공백의 어려움을 경험한다. 현재 보육품질관리는 설치 단계에서부터 법적 기준을 제시하고 있으나, 이를 충족하여도 평가인증이 요구하는 목표에 도달하기 위해서는 충분하지 않다(최윤경 외, 2013). 즉 설치인가의 시장 진입 단계의 요건을 충족하여도 평가인증의 대비에는 부족하기 때문에, 시장에 진입한 어린이집에게 평가인증의 준비와 이후 지도점검의 관리 감독은 질 관리를 위해 통상적으로 적용하는 점검 체계가 아닌 규제의 기능으로 작용하게 된다.
현재 보육품질관리에서는 설치 승인단계와 평가인증의 기준이 달라서, 어린이집 현장에서는 중복 규제로 인한 어려움을 겪게 된다.