본 연구에서는 연결납세제도의 도입에 따른 법인세 세수효과를 분석하여 연결납세도입이 기업의 세부담 측면에서의 유불리 여부를 분석하고, 나아가 과세당국으로 하여금 재정여건을 고려하여 연결조정항목을 선택하여 시행할 수 있도록 정책적 대안을 제시하고자 한다.본 연구의 목적을 달성하기 위하여 과세당국에 제출된 법인세 과세표준신고서 등 세무자료와 기업이 이해관계자를 위해 금융감독원 등 외부에 공표한 연결재무제표 및 감사보고서, 그리고 해당 기업이나 세무대리인을 통하여 101개 그룹기업에 대한 자료를 입수하였다. 또한 입수된 자료를 분석하기 위하여 t-검증, 분산분석 및 중회귀분석을 실시하였다.본 연구의 결과를 요약하면 다음과 같다.첫째, 연결납세제도의 도입시 지분율 적용 변화에 따라 법인세 세수효과의 차이가 있는지를 검증하기 위하여 각각의 지분율 적용에 근거하여 t-검증 및 분산분석(ANOVA)을 실시하였다. 분석결과 지분율 적용 변화(50%~70%, 70%~99%, 100%)에 따라 법인세 세수효과에는 유의적인 차이가 없는 것으로 밝혀졌다. 이는 정책당국이 연결납세제도 도입시 지분율 적용에 특별한 고려가 없이 결정할 수 있다는 것을 시사한다고 할 수 있다.둘째, 연결납세제도 도입시 결손금, 이월결손금, 수입배당금, 그리고 재고자산의 연결조정항목이 법인세 세수효과에 어떠한 영향을 미치는가에 대한 다중회귀분석결과 이월결손금만이 연결납세제도 도입시 법인세 세수효과에 영향을 미치는 것으로 나타났다. 따라서 연결납세제도의 도입시 이월결손금만이 정책당국의 고려대상이 될 수 있으며, 나머지 연결조정항목에 대하여 별도의 고려가 요구되지 않을 것으로 판단된다.
연결납세제도의 도입에 따른 법인세 세수효과를 분석하여 연결납세도입이 기업의 세부담 측면에서의 유불리 여부를 분석하고, 나아가 과세당국으로 하여금 재정여건을 고려하여 연결조정항목을 선택하여 시행할 수 있도록 정책적 대안을 제시하고자 과세당국에 제출된 세무자료와 기업의 연결재무제표 및 감사보고서 등을 분석한 결과  법인세 세수효과에는 유의적인 차이가 없는 것으로 밝혀졌다.연결납세제도 도입시 이월결손금만 정책당국의 고려대상이 될 수 있으며,  나머지 연결조정항목은 별도의 고려사항이 되지 않을 것으로 판단된다.