이 시기의 특징은 기존의 양국 정상회담 합의결과 준수가 그대로 유지되는 상태에서 협상의 진척을 위해 정부에서 민간전문가로 협상체제를 전환하는 데 있다. 제2차 아시아유럽정상회의(1998.4.3)에서 김대중 대통령과 시라크 대통령은 문제 해결을 위한 협상진전을 위해 정부 간 협상에서 전문가 협상방식으로 바꾸었다. 시라크 대통령은 기존에 합의된 등가원칙에 따라 교환물품을 선정해줄 것과 양국에서 문화･역사분야의 권위자를 선정하여 이들이 협의한 후 결정하는 방안을 제의 하였고(경향신문, 1998), 이에 프랑스 대표로는 자크 살루아 감사원 최고위원이, 한국 대표로는 한상진 한국정신문화연구원장이 임명되었다.
협상의 진척을 위해 기존의 양국 정상회담 합의결과가 유지되는 상태로 정부 간 협상에서 민간전문가로 협상체제를 전환하는 게 이 시기의 특징이다.