이러한 일본의 신도에 유교가 분명한 영향을 미쳤음을 부정할 수는 없다. 오늘날 신도의 원형을 설계하는데 큰 영향을 미친 것으로 알려져 있는 쇼토쿠(聖德) 태자가 6세기에 신도와 유교, 불교의 핵심 정수를 모아 일본 문화의 원류를 만들었고(우치무라, 2003; 최인숙, 2013), 이후 주자학이 가마쿠라 막부와 도쿠가와 막부 등 일본의 막부시기에 본격적으로 소개되면서 주종관계와 상하질서를 바탕으로 한 유교의 이데올로기가 일본 사회의 기초질서가 자리잡는데 영향을 미쳤다. 여기서 유교가 일본에 미친 영향은 양면적 모습을 보이는데, 공식적으로는 ‘유교’ 그 자체가 강조되었다고 보기는 힘들고 학자 층에서도 다양한 비판들이 쏟아져 나왔으며 과거제도는 끝까지 실시되지 않았고 유학자들의 사회적 지위는 낮았으나, 다른 한편으로는 무사(武士; 사무라이)층의 유학화가 이루어지면서 유교의 존왕사상으로 인해 이후 막부의 쇼군이 아닌 천황의 친정을 요구하게 되는 과정에서 도쿠가와 체제가 흔들리고 메이지 유신으로 가게 되는 역사적 파급력이 있었고(박훈, 2014), 막부시대에도 쇼군이 다이묘와 가신들을 통제하기 위해 만든 무가제법도(武家諸法度) 또한 신분질서를 정당화하는 유교의 아이디어들을 많이 흡수하였다. 이러한 양면적 속성은 메이지 시대에도 나타나는데, 메이지 천황 본인은 유교적 사고방식을 상당 부분 가지고 있었던 인물이었고 그것이 메이지 시대 교과서들에도 반영이 되지만, 오구라 기조(小倉紀藏)에 따르면 ‘유교’라고 하는 것 그 자체는 메이지 유신이라는 근대화 과정 속에서 ‘쓰러뜨려야 할 적’으로 여겨지며 배척을 당하게 된바있다.
쇼토쿠(聖德) 태자는 6세기에 신도와 유교, 불교의 핵심 정수를 모아 일본 문화의 원류를 만들었고, 이후 주자학이 일본의 막부 시기에 본격적으로 소개되면서 유교의 이데올로기가 일본 사회의 기초질서를 마련하는데 영향을 미쳤다. 유학자들의 사회적 지위는 낮았으나, 한편으로는 유교의 존왕사상으로 인해 메이지 유신으로 가게 되는 등 유교가 일본에 미친 영향은 양면적인 모습을 보인다.