더구나 현재까지의 대안교육 제도화는 2차례의 대안학교 법제화 및 위탁 대안교육기관 제도, 기타 Wee Project 등에도 불구하고 실질적 인 효과를 거두지 못하고 있다. 2014년 이런 문제를 해결하고자 교육부는 새로운 제도화를 시도했지만 풀뿌리 교육운동인 대안교육의 현장의 현실과 목소리를 반영하기 보다는 행정중심의 ‘폐쇄를 전제로 한 등록제’를 강행하려다 강력한 현장의 반발을 받아 철회한 바 있다. 따라서 지금까지와는 다른 관점으로 현장의 목소리를 담아 접근하는 새로운 제도화가 필요할 것이다. 물론 제도화는 동시에 어떻게 대안교육을 더욱 투명하게 교육적 책무성을 다 할 수 있도록 견인해 낼 수 있을 것인가를 함께 고민할 수 밖에 없다. 이를 통해 지금까지는 민간의 선의에 기댈 수밖에 없었던 대안교육이 교사역량 및 교육 실천을 제고할 수 있는 계기가 될 수 있을 것이다.
기존의 방식과는 다르게 교육 현실의 목소리를 반영한 새로운 대안교육 제도화가 필요하다. 또 투명성과 교육의 책임 모두 달성할 수 있도록 해야한다. 이를 통해 대안교육이 교사역량과 교육 실천을 확대할 수 있는 계기가 될 것이다.