부시 행정부는 사실상 여러 중동국가들 중 가장 위협적인 세력으로 이란의 영향력을 상정했다. 9·11 직후 최초로 미국 국민들에 대한 위로전문을 보낸 국가가 이란이었고, 당시 하타미(Mohmmad Khatami) 이란 대통령 행정부는 미국과의 관계 개선을 추진했었다. 그러나 미국 입장에서는 과거 팔레비 축출 후 호메이니가 보여주었던 반미 행태가 여전히 각인되어 있었다. 이러한 각인효과는 사실상 지정학적으로 이란이 갖는 엄중성과 연계된다. 걸프와 카스피해(Caspian Sea)를 함께 아우르는 부존자원 대국, 페르시아 문명의 자부심, 인구 8천만의 대국 및 우수한 과학기술 두뇌와 과거 세속주의를 경험했던 자유분방함이 함께 용해되어 있는 국가가 이란이다. 이란이 반미를 유지하며 역내 패권국가로 등장할 경우 미국으로서는 중동에서 자기 위치를 상실하게 될 가능성이 커진다. 같은 맥락에서 미국의 고전적 동맹국인 사우디아라비아를 비롯한 걸프 왕정과 최대 동맹국인 이스라엘에이란이 직접적 위해를 가할 위험이 크다는 판단하에 지속적으로 적대정책을 유지했었다. 사실상 9·11 직후 테러와의 전쟁을 명분으로 미국이 수행한 양대 전쟁은 아프가니스탄 전쟁과 이라크전쟁이었던 바, 중동의 여타 독재 국가들 중에서도 특히 이라크·아프가니스탄에서 독재자를 축출하고 민주주의를 이식한다는 목표를 세운 것은 미국이 이란을 견제한 것이라는 분석이 설득력을 얻고 있다.
하타미 이란대통령은 9·11 직후 최초로 미국에 위로문을 보내 관계개선을 추진했으나 미국은 호메이니의 반미행태가 각인돼 있었다. 이란이 반미를 유지하며 패권국가가 될 경우 미국은 중동에서 위치가 불안했다. 이스라엘에 이란이 위해를 가할 수 있어 계속 적대정책을 유지했고, 9·11 직후 테러와의 전쟁을 명분으로 이라크·아프가니스탄에서 독재자 축출도 이란을 견제한 것이다.