4차년도 연구부터 6차년도 연구에서는 연구 틀에서 큰 변화 없이 3, 4, 5차 조사가 진행되었다. 다만 4차년도 연구에서는 패널이 고등학교 2학년까지 올라감에 따라 고등학교 이후 진로와 관련된 조사 내용을 추가하여 조사하였다(한만길 외, 2013: 23-25). 5차년도 연구에서는 고등학교 이후 진로 관련 내용을 더욱 구체화하여 조사하였다(강구섭 외, 2014: 31-33). 6차년도 연구 5차 조사(강구섭 외, 2015: 30-33)에서는 고등학교 졸업자가 처음으로 나타나게 됨에 따라 기존 조사 내용과 더불어 대학 진학･대학 진학 준비, 취업･취업 준비 등의 상황에 있는 조사대상자 특성별 조사 내용을 추가하였다. 예를 들어 대학진학자의 경우, 장래 직업, (대학에서의) 학습 태도, 수업 중 활동, 수업 참여, 대학 생활 인식, 대학 생활 평가, 대학 활동 계획, 대학 생활 중 어려운 점 등을 묻는 질문이 추가되었다.
4차년도 연구에서는 패널의 고등학교 이후 진로와 관련된 조사 내용을 추가하였다. 5차년도 연구에서는 4차년도의 연구를 구체화하여 조사하였고 6차년도 연구 5차 조사에서는 고등학교 졸업자를 대상으로 한 조사 내용을 추가하였다.