전통지식 분쟁에 관한 대응방안을 마련하는 경우, 우선 고려해야 할 것은 전통지식의 보유자와 이용자 간에 형평성을 유지하는 것이다. 전통지식의 보유자 측면에서는 전통지식의 무단이용을 방지하는 한편 전통지식의 발전과 보전에 대한 기여를 정당하게 인정받고자 한다. 전통지식의 이용자 측면에서는 상업화에 필요한 전통지식의 활용 절차를 투명하게 하고, 경제적 개발에 장벽을 형성하는 법적 불확실성을 제거하고자 한다. 그러나 상술한 바와 같이 전통지식의 개념과 범위에 대한 일반적인 합의는 이루어지지 않았고, 전통지식 자체가 단일한 정의로 전체를 포괄할 수 있는 성질의 것도 아니다. 따라서 전통지식의 일부 요소들을 보호 가능한 법제 내에 편입시켜 해당 법익에 대한 보호를 부여하는 것을 고려할 수 있다. 전통지식의 보전과 지속가능한 이용 및 경제적 가치 창출 활성화는 전통지식 보유자와 이용자 모두에게 중요한 사항이다. 이러한 이해관계를 효과적으로 반영하는 보편적인 국제적 기준은 아직 확립되지 않았으나, 활용 가능한 현행 법·제도 및 향후 보완가능성을 통해 전통지식 분쟁에 관한 대응방안을 제시해 보고자 한다.
전통지식 분쟁에서 보호하고자 하는 보유자의 입장과, 투명하게 이용하고자 하는 이용자의 입장에서 공평하게 대응해야 한다. 하지만 아직까지 적절한 합의 절차가 진행된 적이 없기 때문에 전통지식의 일부를 법률로 보호할 수 있다. 현재 적용할 수 있는 법률적 대안을 통해 이에 대한 대안을 마련할 것이다.