신변보호가 필요한 성폭력피해자를 위해서 여성긴급전화 1366에서는 긴급피난처를 제공하고 있다. 여성긴급전화 1366의 주요 기능 중 하나가 위기상황의 피해자를 긴급 보호하는 것인바, 이를 각 시･도의 1366센터는 긴급피난처를 갖추고 있다. 2013년 6월말 현재 각 시･도별 여성긴급전화 1366센터 내에 설치되어 있는 긴급피난처는 모두 30개로서 총 266명의 피해자를 수용할 수 있다. 여성가족부는 향후 여성긴급전화 1366센터 내의 긴급피난처를 확대하고 현장상담원을 증원함으로써 성폭력피해자에 대한 긴급보호 기능을 강화시키겠다는 계획을 밝힌바 있다. 이러한 사업 추진을 통해 성폭력피해자에 대한 위기개입 및 신변보호가 보다 원활하게 수행될 것이라 기대된다
여성긴급전화 1366은 현재 총 30개의 긴급피난처를 확대하고 현장상담원을 증원할 계획이다. 이를 통해 성폭력피해자에 대한 위기개입 및 신변보호의 원활한 수행이 기대된다.