북한의 경제상황이 최악으로 치닫던 이 시기의 가장 비참한 희생자는 북한 어린이들이었다. 이 북한의 어린이들에 대한 지원을 목적으로 한 단체들도 생겨나기 시작했는데, 1996년에 창립된 “남북어린이어깨동무”와 1997년 설립된 “어린이의약품지원본부”가 대표적이다. 남북어린이어깨동무는 북한 어린이에 대한 지원사업 뿐 아니라, 남한아동에 대한 평화통일 교육 등 남북한 양측의 아동에 대한 사업을 같이 진행하고 있는 점이 특징이다. 2001년에 이 단체는 평양에 소재한 “어린이영양관리연구소” 내에 두유공장을 설치하여 북한 어린이들에게 좀 더 양질의 식품을 공급하는 활동을 벌였으며, “평양 어깨동무 어린이 병원”을 개설하여 의료지원 사업도 병행하고 있다. 한편, 어린이의약품지원본부는 북한 어린이와 산모들의 의약품 및 의료장비 지원을 목적으로 한 단체이다. 주로 의사나 약사, 간호사 등 보건의료인 중심으로 결성된 이 단체는 1997년 이후 의약품 및 의료도구, 의약품 제조설비 등을 제공하는 활동을 하고 있다.
북한 어린이들은 북한의 경제상황이 최악의 수준으로 진행되자, 1996년도부터 이들의 식생활이나 교육 및 의료지원 등을 목적으로 하는 남북어린이어깨동무나 어린이의약품지원본부 등의 여러 단체들이 생겨났다.