산학협력 교육과정은 학과 간 공동운영하는 통합형 교과목, 산업체의 현안 과제를 중심으로 운영할 수 있는 캡스톤디자인 교과목, 지식창조경제의 새로운 메가트렌드를 반영하여 다양한 내용과 혁신적 방법을 담은 교양교과 등 전통적인 대학의 교육과정과는 다른 모습을 갖게 될 가능성이 크다. 앞서 설문조사나 면담조사를 통해서도 현행 학사 지원 시스템은 학과별 학문중심의 교육과정 운영에 최적화되어 있는 경우가 많아 산학협력 교육과정이 개발되어도 학사운영상 제약으로 교육과정 운영에 어려움을 겪고 있는 것을 확인할 수 있다. 산학협력 교육과정의 개발과 효과적 운영을 위해 대학의 학사지원 시스템 역시 산학협력 친화적으로 변화할 필요가 있다.
산학협력 교육과정은 통합형 교과목, 캡스톤디자인 교과목, 교양교과 등 전통적 교육과정과 달라질 가능성이 크며, 현행 학사지원시스템 대신 산학협력 교육에 최적화된 시스템 개발이 필요하다.