그러던 중 1974년 군부 쿠데타가 발생하였다. 그리스의 군사독재 정권의 지원을 받고 있던 키프로스 출신의 그리스 장군인 그리바스(Grivas)가 1971년 키프로스로 돌아와 ‘EOKA-B’라는 게릴라를 조직하였는데 이들은 마카리오스 대통령의 권위를 인정하지 않았다. 마카리오스 대통령 역시 이 조직을 불법 집단으로 규정하고 그리스 대통령에게 그리스 지휘관들을 철수를 요청하였다. 이에 그리스 독재자 디미트리오스 요안니디스(Dimitrios Ioannidis)는 1974년 7월 15일 마카리오스 대통령에 대항하는 쿠데타를 지시하고 이에 그리스 지휘관들이 이끄는 키프로스 국경 수비대가 대통령궁을 점령하고, 마카리오스 대통령은 영국의 도움으로 키프로스를 탈출한다. 쿠데타 세력에 의해 에노시스주의자인 니코스 삼손(Nikos Sampson)이 새로운 대통령이 되면서 그리스 통합파들로 내각이 구성되었다.
1974년 그리스 독재정권의 사주로 군부 쿠데타가 발생하자 마카리오스 대통령은 영국의 도움을 받아 키프로스를 탈출했다. 쿠데타 세력은 니코스 삼손을 대통령으로 내세워 그리스 통합파 내각을 만들었다.