현재 교육부와 보건복지부 이원화 체제로 운영되고 있는 유치원과 어린이집은 설치·운영에 있어서도 상이한 법령에 의거하여 각기 다른 기준을 적용받고 있다. 유치원은 여러 교육기관 중 유아교육기관 고유의 특수성을 반영하여 독립적으로 제정된「유아교육법」에 의거하여 유치원의 설립 및 운영, 교직원 등에 대한 기준을 적용받고, 시설·설비에 대해서는 주로「고등학교 이하 각 급 학교 설립·운영 규정」에 따라 운영되고 있다. 이에 반해, 어린이집의 설치·운영은 6세 미만의 취학 전 아동에 대한 보육서비스에 관한 전반적인 기준을 담고 있는 「영유아보육법」에 따라 이루어지고 있다.
유치원과 어린이집은 교육부와 보건복지부의 이원화 체제로 운영되어, 유치원은 교육기관으로 특수성을 반영한 유아교육법, 어린이집은 보육서비스로 영유아보육법의 적용을 받는다.