1990년대는 김정일이 주체문예이론을 정립한 특별한 시기이다. 김정일은 <무용예술론>(1990), <음악예술론>(1991), <주체문학론>(1992) 등을 출판했는데, 이로써 주체문예이론이 체계적으로 완성되어 현재까지도 북한의 공식 문예관이 되었다. 주체문예이론에 기초한 일종의 실천 강령은 ‘종자론’과 ‘군중예술론’이다. 북한은 “작품의 핵을이루는 것이 종자이며, 종자는 그 작품의 가치를 규정하는 근본으로 창작가는 종자를 똑바로 잡아야 자기의 사상, 미학적 의도를 정확히 전달할 수 있고 작품의 철학성을 보장할 수 있다.”고 주장한다. 또한 “문예활동에서 전문일꾼 본위로 나가려는 경향을 철저히 경계 하여야 하며 창작사업에서 신비주의를 없애고 문학예술을 군중적으로 널리 발전시켜야 한다.”고 강조한다. 또한 주체문예이론의 특징은 민족주의적 경향을 강화하면서 다양한 문화조류를 포괄한다는 점이다. 1990년대 경제적 어려움으로 원자화되는 북한 사회를 통합하고자 한 북한 당국의 의지가 반영된 것으로 볼 수 있다.
1990년대 정립된 주체문예이론은 북한의 공식 문예관으로 종자론과 군중예술론을 기반으로 한다. 민족주의적 경향을 강화하며 다양한 문화를 포괄한다는 특징이 있으며 북한의 빈곤한 사회를 문화로 통합하고자 한 북한의 의지가 반영되어 있다.