특성화학교 외에 정부에서 학력을 인정해 주는 대안교육제도로는 대안교육 위탁교육 기관 및 인가형 대안학교가 있다. 우선 대안교육 위탁교육 기관은 중고등학교에 적응하는데 어려움을 겪는 청소년들이 소속학교에 학적을 두고 원하는 교육기관에 출석하여 과정을 모두 마치면 소속학교의 졸업장을 받을 수 있는 제도이다. 이 제도 역시 대안교육 지원 정책의 하나이며 2001년부터 서울시교육청15)에서 시작한 이후 각 시ㆍ도교육청이 운영하고 있다(교육인적자원부, 2007). 위탁기간은 보통 1년이며 위탁 기관장과 소속 학교장의 협의 하에 연장이 가능하다. 2015년 현재 위탁형 대안학교의 수는 238개교(수용 가능 인원은 6,945명)이며, 현재 위탁학생 수는 초등교과과정에 137명, 중학교과과정에 1,091명, 고등교과과정에 1,748명으로 총 2,976명이다(교육부, 2015b).
대안교육제도인 대안교육 위탁교육 기관은 학교생활에 부적응한 중고등학교 청소년들이 1년 과정의 위탁기간을 거쳐 소속학교의 졸업장을 취득할 수 있는 제도로 2015년 대안학교의 수는 238개교이고 학생 수는 총 2,976명이다.