NCS를 이용한 자격제도의 개편에서 몇 가지 고려해야 할 내용적 쟁점이 있다. 또 이러한 내용들은 단계적으로 이루어져야 한다. 이와 관련된 쟁점을 순차적으로 정리하면 다음과 같다. 첫째는 산업 분석이다. 이는 NCS 개발 시 충분히 분석되어야 하는 사항으로, 자격제도를 설계할 때 이 내용을 활용하거나, 필요시 추가적인 자료를 이용하여 보완해야 한다. 노동시장 구조 및 기술 분석, 업무절차 및 내용을 조사하여 자격제도 설계의 기본 방향을 설정해야 한다. 이와 관련된 내용은 전술한 ‘산업현장의 수요를 반영하는 현장성’ 부분을 참조하면 된다.
안전성을 확보하기 위한 세부 계획 지침을 마련할 필요가 있다.