자유학기제의 기본방향 중 하나는 ‘자유학기를 교육과정 운영 및 수업방식 등 학교 교육 방법 전반의 변화를 견인하는 계기로 활용’(교육부, 2013a: 3) 하겠다는 것이며, 이러한 변화를 위해 특히 ‘학생의 참여와 활동 중심으로 교수·학습방법의 다양화’(교육부, 2013a: 13)를 도모할 필요가 있다고 제시되어 있다. 우리나라의 경우 전통적으로 교과를 중심으로 견고한 계통적 수업이 전개되어 왔고 이 교과 수업의 전개는 강의식에 편중된 방식으로 이루어져 왔다. 학생을 대상으로 한 본 연구의 조사 결과에서도 나타났듯이, 학생들은 수업에 대한 내면적 참여 기회가 차단되어, 자연히 교과 수업에 대한 흥미나 동기 등이 상당히 떨어지게 된다. 자유학기제의 방향 및 취지에서 나타내고자 하는 교수·학습방법의 다양화나 변화를 도모하는 것은 기본적으로 획일적인 강의식 수업방식을 극복하고자 하는 것이라고 할 수 있다.
교육부는 자유학기를 학교 교육 방법 전반의 변화를 견인하는 계기로 활용하기 위해 학생의 참여와 활동 중심으로 교수·학습방법의 다양화를 지향하고 있다. 이는 획일적인 강의식 수업방식에서 벗어나 학생의 흥미와 동기를 유발하기 위한 것이다.