이명박 정부에서 추진한 고교 체제 개편 정책(이른바 ‘고교다양화 300 프로젝트’)은 도입초기부터 ‘일반 고등학교 위기’ 논란(중앙일보, 2011. 5. 17.)을 불러일으켰고, 학교 교육과정 편성 운영의 자율성이 많이 부여된 학교일수록 고등학교 3년간 학생들이 국 영 수를 더 많은 단위로 공부하고 있는 것으로 나타났다(민용성 외, 2011). 이것은 일반 고등학교(이하 장 제목을 제외한 모든 부분에서 일반고로 약칭함) 중에서 자율 고등학교나 창의경영학교를 지정하여 교육과정 편성 운영의 자율성을 부여함으로써 학생들의 요구에 맞는 ‘학생맞춤형’ 교육을 실시하고자 한 이전 정부의 의도가 반대의 결과를 초래하였다는 것을 의미한다. 이러한 현상의 원인으로는 교원 수급 문제, 내신평가 방식 문제, 대학입시 및 대입전형제도 문제 등이 지적되고 있다(민용성 외, 2011).
이명박 정부의 고교다양화 300 프로젝트는 오히려 학생들의 공부량을 늘렸다. 교원 수급 문제, 내신평가 방식 문제, 대입제도 등의 문제들로 인한 것이었다.