방법적인 측면에서 핵심적인 판단기준은 매사에 학생들의 자율성이 얼마나 존중되는가라고 할 수 있다. 이 점에 관한 한 네 가지 프로그램들의 충실도는 그리 높지 않을 것으로 예상된다. 그 이유는 네 가지 현장 모두가 학생들의 자율성 존중과는 거리가 먼 제도적 문화적 배경을 가지고 있기 때문이다. 정규학교의 경우 일반 학교와 마찬가지로 대부분의 교육 내용과 절차들이 제도적으로 규정되어 있으며, 교사들 역시 기존의 교사중심 학교문화에 안주하는 경우가 많다. 각종학교의 경우 정규학교에 비해 교육과정 운영의 유연성이 매우 높기는 하지만, 공립의 경우는 정규학교와 유사한 문화를 가지고 있고, 사립의 경우에는 대부분의 운영자들과 교사들이 대안교육의 정서나 문화와 거리가 멀어 학생들의 자율성을 존중하는 데 한계가 있다. 위탁교육기관은 그 존재기반에서 오는 한계가, 그리고 대안교실은 공교육 틀 안에서 운영된다는 한계가 학생들의 자율성을 제약한다.
정규학교는 교육 내용과 절차가 제도적으로 규정되어 있고 교사중심 학교문화이다. 각종학교는 교육과정 운영의 탄력성이 많지만, 공립학교는 정규학교와 비슷한 문화를 가지며 사립학교는 대부분의 운영자들과 교사들이 학생들의 자율성 존중에 한계가 있다.