온라인 경매 시스템에서는 경매를 위해 가격을 부르는 경매사도 이를 저렴하게 구입하기 위해 분주하게 손을 흔드는 소비자도 없다. 단지, 규격화된 창고에 농산물을 보관하고 지게차나 로봇이 낙찰된 농산물을 운반하는 모습만 보일 뿐이다. 경매사는 경매할 농산물에 대한 각종 정보를 웹 사이트나 문자를 통해 응찰자에게 제공한다. 이후 응찰자들이 사이트에 로그인 하여, 경매 대기를 하고 경매사가 경매 시작을 알리면, 참가자들이 각자 원하는 가격을 입력하게 된다. 입력한 가격 중에서 최고 가격과 낙찰자가 화면에 나타난다. 해당 낙찰자가 가격을 입금하면 원하는 장소로 물건을 배달하면 경매 과정은 끝나게 되는 것이다. 온라인 경매 시스템의 장점은 경매를 위한 농산물을 운반하는 데 걸리는 시간과 비용을 대폭 절함할 수 있으며, 대량의 농산물을 비교적 빠른 시간 내에 경매 진행을 끝낼 수 있다.
농산물 온라인 경매는 경매사가 응찰자들에게 온라인으로 정보를 알려주고 응찰자들이 사이트에서 가격을 입력한 후 낙찰자가 돈을 입금하면 물건이 배송되는 시스템이다. 이 시스템의 장점은 운송시간과 비용, 경매시간을 단축할 수 있다는 것이다.