본 연구는 다양한 이해의 충돌이 일어나고 있는 SW특허 제도에 대해 SW생태계라는 측면에서 합리적인 조정방안에 대해 검토를 진행하였다. 이를 위하여 다양한 주장에 대한 인터뷰를 통해서, 주장과 문제점들에 대해 의견수렴하고자 하였다. 실제 부처간의 의견이 다른 것은 SW에 대한 접근 방식의 차이에 기인한 것이다. 즉, SW에 대한 저작권법적 보호와 특허법적 보호 방식의 차이에 기인한 방법론적인 차이이지, 철학적인 차이점은 아니기 때문에 제도적인 재단을 제대로 한다면 큰 무리는 없을 것이다. 다만, 실제 수혜 받는 SW산업계에서 생각하는 방향에 대한 고려는 필요하다. 이러한 점에서 중소 SW 사업자에게 미치는 영향에 대해 검토하면서 아울러, SW특허제도가 SW생태계에 미치는 영향에 대해 살펴보았다.
SW특허 제도의 조정방안에 대한 연구 결과, 의견 차이는 저작권법과 특허법적 보호 방식에 대한 방법론적 견해차에 불과했기에 제도적 디자인으로 해결 가능하다. 또한 실제 SW생태계에 미치는 영향도 검토되었다.