다음으로 농상공 제휴사업 계획에는 중소기업자 및 농림어업자 둘 이상의 주체적 참여가 요구된다. 중소기업자 및 농림어업자에 더해 대기업이 참가하고 판로개척 등에 있어 중요한 역할을 수행할 경우에도 지원대상이 되나, 사업에 대한 실제적 공헌 정도(전체 사업금액에서 차지하는 비율 등)에서 중소기업자 및 농림어업자가 차지하는 비율이 50% 이하일 경우에는 지원대상에서 제외된다. 또한 농상공 제휴사업 참여 중소기업자 및 농림어업자 간 규약 등을 책정하고, 공정관리나 품질관리가 통일적으로 이루어지도록 하는 역할 분담, 대외적인 거래관계에서 책임체제의 명확화, 시장으로부터 신뢰받을 수 있는 체제를 구축하는 것도 필요하다.
농상공 제휴사업 계획에는 중소기업자 및 농립어업자 둘 이상의 주체적 참여가 요구되며 참여 주체자 간 규약 책정, 역할 분담, 책임 체제의 명확화, 안전한 체제 구축 등도 필요하다.