최근 특허권 강화와 (경제성장을 위한) 기술혁신간의 동태적 관계를 분석한 실증연구들은 ‘특허의 역설(patent paradox)’이라 불릴 정도로 특허제도의 전통적 가설에 대해 회의를 갖는 우려의 목소리도 있다. Jaffe(2000)는 미국의 경우 연구개발투자의 확대가 특허권 강화 이전에 이미 가속화되고 있었음을 지적하면서 특허권을 비롯한 지식재산권의 강화가 연구개발(R&D) 활동 및 기술혁신활동을 촉진하였다는 어떠한 근거도 발견하기 힘들다고 지적하였으며, Mark(2001)는 특허출원한 발명자가 연구개발을 통해 기술혁신을 꾀하는 것이 아니라 출원된 발명을 경쟁자가 이용하지 못하도록 방지하거나 상대 특허권자의 공격으로부터 방어, 또는 대출에 활용 등의 목적에 더욱 가중치를 두고 있다고 주장하고 있다. Sakakibara & Branstetter(2001)는 일본기업을 대상으로 분석한 결과 특허보호강화를 위해 1988년에 이루어진 특허제도의 개혁(다항제도의 변화, 특허기간의 연장)이 연구개발 지출과 특허출원을 촉진하였다는 어떠한 증거도 발견하지 못하였다고 주장함으로써 특허제도의 유효성에 대한 문제점을 지적하였다.
최근 특허권 강화와 기술혁신간의 동태적 관계를 분석한 실증연구들에서는 지식 재산권의 강화가 기술혁신활동을 촉진하였다는 근거를 발견하지 못했다는 주장이 나오고 있고, 오히려 출원된 발명을 경쟁자가 사용 못하게 하거나 상대 특허권자의 공격으로부터 방어의 목적으로 사용하는 것에 더 무게를 두고 있다고 하였다.