혁신생태계 형성을 위한 두 번째 축은 연결성을 강화하는 것이다. 지식창출기능을 담당하는 지식생태계와 지식활용기능을 담당하는 비즈니스생태계 간의 연결을 위한 중개 및 촉진 기능의 강화가 핵심적인 방향이라고 할 수 있다. 뿐만 아니라 지식생태계 내 다양한 주체 및 기능들 간의 연결성, 비즈니스생태계 내의 연결성, 다른 지역 및 글로벌차원의 기능 간 및 주체 간 연결성을 강화하는 것도 중요하다. 연결성의 강화는 생태계 내의 상호작용을 활성화하는 데 기여할 것이다. 연결성의 강화는 소프트웨어적인 네트워크 차원에서 뿐만 아니라 공간적 근접성과 연계성을 강화하는 하드웨어적인 측면의 접근도 중요하다. 이와 관련된 정책과제로는 중개 및 촉진 기능 강화, 개방형 혁신 활성화를 위한 문화적·공간적 대책들을 들 수 있다.
혁신생태계 형성을 위해 지역 및 글로벌차원, 지식생태계 내부, 비즈니스생태계 내부의 주체 및 기능 간의 연결성을 강조해야 한다. 대책은 기능 강화 및 문화적과 공간적인 혁신 활성화 측면에서 고려해야한다.