중학교의 경우, 2016년 자유학기제의 전면 시행에 대비하여 국가 교육과정의 틀 안에서 그 운영의 근거를 마련하였지만, 총론에 제시된 포괄적이고 일반적인 지침만으로는 학교 현장의 자유학기 교육과정의 편성·운영을 구체적으로 안내하는 데에 한계가 있다. 따라서 학교에서의 자유학기 교육과정의 편성·운영과 관련된 구체적인 방안을 국가 차원에서 마련하여 제시해주고 이에 따른 교사 연수를 적극 지원할 필요가 있다. 또한, 학교스포츠클럽 활동과 관련하여 강사 지원, 학교 시설 지원 등 학교 현장의 어려움을 없애줄 수 있는 방안이 마련될 필요가 있으며,특히 자유학기에는 창의적 체험활동, 자유학기 활동, 학교스포츠클럽 활동의 관련성을 명확하게 안내함으로써 학교현장의 어려움을 덜어줄 필요가 있다.
중학교의 경우, 학교에서의 자유학기 교육과정의 편성·운영과 관련된 구체적인 방안을 국가 차원에서 마련하여 제시하며 교사 연수를 적극 지원할 필요가 있다.