정부가 최근 강조하고 있는 다부처공동기획사업은 종전의 과제단위의 협력연구와는 명백히 구분된다. 기획단계에서부터의 공동 협력과 사전조정을 강조하는 다부처공동기획사업의 효과적 발굴 추진을 위해서는 핵심 법 제도적 기반으로서 국가가 필요로 하는 기술의 연구개발을 주도적으로 담당하는 연구조직의 존재가 필수적이며, 이때 해당 조직은 특정 부처의 산하기관으로서가 아니라 각 기술 분야별로 발전 계획을 수립하고, 이를 범부처 협력 하에 전략적으로 추진할 수 있는 전문화 특성화된 조직이어야 한다. 그러나 현재 국가교통물류기술 분야에서는 다른 국가과학기술분야와 달리 해당 기술 분야의 발전 방향에 대한 장기적 계획을 수립하고 지속적으로 연구개발을 추진할 수 있는 조직 기반이 부재한 상황이다.
다부처공동기획사업의 효과적 발굴 추진을 위해서는 전문화 특성화된 연구조직의 존재가 필수적이다. 그러나 현재 국가교통물류기술 분야에서는 그러한 조직 기반이 부재하다.