반면, 표준화에는 부정적 측면이 있다. 우선 표준화는 혁신을 방해하는 측면이 있다. 표준화로 고착이 되면, 그 표준화 기술보다 더 우수한 기술이 개발된다고 하여도 우수한 기술이 시장에서 사용되기가 어려울 수 있다. David(1985)는 QWERTY 자판 방식으로 시장에서 표준화가 일어남으로써, 더 우수한 드보락 자판 방식이 개발되었음에도 불구하고 시장에서 사용되지 못하는 현상에 주목하였다. 또 정부 주도의 표준화의 경우 정보의 한계로 인해 소비자의 선호를 잘 반영하지 못할 위험이 존재한다. 그리고 표준화 이후 발생하는 지대로 인해 ‘지대 추구’ 행위가 나타날 수 있다.
표준화는 고착으로 인한 혁신 방해, 정부 주도의 경우 정보 한계로 소비자 선호 미반영, 이후 발생하는 지대로 인한 지대 추구 행위의 부정적 측면이 있다.