이상에서 살펴본 바와 같이 국무총리 보좌기관인 국무조정실을 보더라도 국무총리의 역할에 있어 한계가 있다는 것을 알 수 있었다. 이러한 현상은 미래의 통일시대에 바람직한 모습이라고 보기는 어렵다. 남북이 통일이 되는 과정에서 많은 행정수요가 발생할 것이고, 막대한 비용이 소모될 것이다. 따라서 정부는 발생할 행정수요를 잘 대처해야 하며, 효율적이고 경제적인 방식으로도 대처할 필요가 있는데 현행과 같은 대통령 비서실과 국무총리실의 역할중복이 통일시대에도 이어진다면 지금과는 비교할 수 없는 행정의 비효율성이 나타날 가능성이 있을 것이다.
미래의 통일시대에 대비하기 위해 대통령 비서실과 국무총리실의 역할을 명확히 할 필요가 있다.