고용허가제는 사업자가 내국인 근로자 고용 노력을 했음에도 불구하고 근로자를 채용하지 못한 경우, 외국인 근로자를 고용할 수 있게 허가하기 때문에 국내 노동시장 내에서 내국인 근로자와 경쟁하지 못하게 하고 있다. 또한 송출국가의 선정, 외국인 구직자 명부의 작성에 정부가 직접 관리하면서 민간기관의 개입을 철저히 배제하여 송출 과정에서의 비리를 근절하고자 한다. 마지막으로 최초 외국인 근로자의 취업기간은 3년으로 제한하고 1회에 한해 2년 미만 연장만을 인정함으로써 외국인 근로자의 국내 정주화를 방지하고, 국내법이 정하는 바에 따라 외국인 근로자라는 이유로 부당한 차별을 금지하고 있다.
고용허가제에 따라 외국인 근로자는 그 채용의 허가, 송출국가 선정, 명부작성 및 취업기간의 제한 등을 정부에서 철저히 직접 관리하여 부당차별을 금지하고 있다.