스마트폰에 먼저 도입된 생체인식 기술은 지문인식이다. 최초로 지문인식 기능을 탑재한 스마트폰은 2011년 4월에 출시된 모토롤라사의 아트릭스다. 이후 2013년 9월, 애플은 지문인식 기술인 터치 ID(Touch ID)를 내장한 아이폰 5s를 출시하였다. 애플의 터치 ID는 2012년에 지문센서 전문 업체인 어센테크(AuthenTech)를 인수하면서 거둬들인 기술이다. 애플의 지문인식 방식은 단순히 센서에 손가락을 대면 인식이 되는 에어리어(Area) 방식이다. 그리고 터치 ID에 등록된 사용자 지문은 이미지 파일이 아닌 암호화된 데이터로 특별히 보안 영역에 저장되고 다른 동작과 별도로 관리되기 때문에 해킹이나 탈옥으로 관리자 권한을 얻는다고 해도 쉽게 정보를 빼낼 수 없고 암호 해독이 불가능하다고 한다. 삼성전자는 2014년 2월 출시한 갤럭시 S5에서부터 지문인식 기술을 도입했다. 삼성은 지문인식 기술인 패스(Pass)를 통해 잠금 화면 해지, 갤러리 내 사진 보호 등을 설정할 수 있다. 갤럭시 S5는 손가락을 위에서 아래로 문질러 지문을 스캔하는 스와이프(Swipe) 방식을 사용하고 있다. 이후 애플은 2014년 10월에 출시된 아이폰6와 아이폰6+에도 지문 영역을 넓히고 스캔 해상도를 개선한 에어리어(Area) 방식의 센서를 적용했으며, 삼성전자도 갤럭시S6와 갤럭시S6엣지 모델에는 기존 스와이프(Swipe) 방식이 아닌 에어리어(Area) 방식을 선택했다.(송초롱 등, 2015)
2011년 모토롤라사의 아트릭스가 최초로 지문인식 기능 스마트폰을 출시한 이후, 2013년 애플은 터치 ID 스마트폰에서 지문을 암호화 데이터로 보안영역에 저장해 정보유출과 암호해독을 불가능하게 했다. 삼성전자의 2014년 갤러시 S5는 지문인식기술인 패스를 통해 잠금화면 해지, 갤러리 사진보호 기능을 설정했다. 이후 애플과 삼성은 지문인식 기능을 개선한 스마트폰을 출시해가고 있다.