유치원 정보 시스템으로는 교육행정정보시스템 ‘나이스’와 정보공시시스템 ‘유치원 알리미’, 유아학비지원시스템 ‘e유치원’이 있다. ‘나이스’ 는 교육부, 17개 시·도교육청, 초·중등학교의 교육행정업무를 연계 처리하며, 국민 편의 증진을 위해 안전행정부, 대법원 등 유관기관의 행정정보를 이용하는 종합 교육행정정보시스템이다. 유치원의 경우 일부 국·공립 유치원에 한해 사용되고 있으나, 초·중등은 통계 업무 담당자의 업무 경감과 데이터의 정합성을 위해 조사 시스템을 포함하여 교육행정정보시스템의 자료를 연계하여 조사를 진행하고 있다.「교육기본통계」 조사는 ‘나이스’를 중심으로 조사입력 시스템을 확장시킬 뿐 아니라 정보공시와 연계를 통한 통계 생산의 범위를 확장하고 있다.  초·중등의 경우 공·사립 모두 같은 시스템을 사용함으로 인해 통계 생산의 편의성을 높일 수 있으나, 유치원의 경우 사립의 비중이 높고 이들은 공통 시스템을 사용하지 않고 정보공시는 ‘유치원 알리미’, 학비지원은 ‘e유치원’ 시스템을 통해 이루어지고 있다.
유치원 정보 시스템은 ‘나이스’와 ‘유치원 알리미’, ‘e유치원’이 있는데, 사립의 비중이 높은 만큼 ‘나이스’보다는 ‘유치원 알리미’, ‘e유치원’ 시스템에서 정보공시와 학비지원 업무가 이루어진다. 