감사원(the National Audit Office) 또한 유니버설 크레딧 제도가 운영이 미흡하고 표적집단에 급여를 전달하는 데 실패했다고 비판한 바 있다. 북서 잉글랜드 지방에서 시범운영되었던 유니버설 크레딧 제도를 전국으로 본격적으로 확대 실시한다면, 잡센터 직원의 훈련을 위한 재원 부족과 직원의 새 제도에 대한 적응 시간 부족이 우려된다. 2013년 4월에 도입된 이래 시범운영된 지역에서 약 5만 명이 수당을 신청했는데, 이는 정부가 애초에 발표한 예상치보다 훨씬 더 적은 수이다. 컴퓨터 시스템의 문제 역시 제도 지연을 초래하였으며, 정부 각료들은 수천만 파운드를 헛되이 사용하게 된 것이다.
감사원에서는 유니버설 크레딧 제도는 재원부족, 적응기간 부족 등으로 인해 실효성이 없다고 비판했다.