정부 업무평가를 수행하고, 부처 간 사업이나 업무의 조정 역할을 맡고 있는 국무조정실의 업무에 지출 검토를 도입하는 방안도 고려할 수 있다. 복수 부처의 사업이나 부처 간 조정이 필요한 예산사업의 경우, 국무조정실이 지출 검토에 참여할 수 있다. 실제로 외국 사례 중 일부에서는 지출 검토의 최종 승인 과정에서 재무부처와 해당 부처의 참여를 전제로 총리실이 의사결정기관으로 기능하기도 한다. 다만, 지출 검토를 실시한 대부분의 국가의 정치제도가 의원내각제와 정부 수반으로서의 총리를 주축으로 하고 있다는 점에서 대통령 중심국가인 우리나라에서 총리 산하 국무조정실이 적절한 기능을 수행할 수 있을지 검토가 필요하다. 국정과제나 주요 사업의 정부 업무평가 결과를 지출 검토 조정 대상의 기준으로 활용할 수 있는 여지는 있다.
국정과제나 주요 사업의 정부 업무평가 결과를 지출 검토 조정 대상의 기준으로 활용할 수 있는 여지는 있다.