각 발전공기업의 전원별 발전원가와 정산단가를 비교한 결과, 2012년 이후 원자력 발전원가는 매년 소폭 상승한 것으로 나타났다. 그러나 전력수급 상황의 악화로 계통한계가격(SMP: System Marginal Price)이 상승하고 한국전력공사의 재무상황이 악화되어 2013년까지는 정산단가가 원자력 발전원가의 상승을 반영하지 못하였다. 더욱이 원자력 발전 관련 부품비리와 잦은 발전기 고장으로 인해 계통한계가격이 더 상승한 것에 대해 한국수력원자력에 패널티를 부과하기 위해 정산조정계수를 낮게 조정하였다. 그 결과 2012~2013년 기간 동안 원자력의 경우 정산단가가발전원가보다 오히려 낮은 수준이었다.
전력수급과 한국전력공사의 상황 악화 그리고 원자력 발전과 관련된 비리 및 고장으로 정산조정계수가 적게 조정되면서 2012~2013년 원자력의 정산단가는 발전원가보다 낮았다. 