교육부가 2014년부터 정부재정지원 제한대학 평가지표를 조정하고 2015년부터 실시된 ‘대학구조개혁 평가’ 지표를 확정하면서 기존의 평가지표에서 비중이 컸던 재학생 충원율 및 취업률 비율을 낮추는 대신 전임교원확보율, 학사관리 및 교육과정, 교육비환원율 등의 지표를 포함한데 따른 결과라 할 수 있다. 다시 말해, 기존 정부재정지원 평가사업의 취업률 지표에는 졸업유예자수의 증가가 취업률 지표 산출에 유리하게 작용되었으나, 대학구조개혁 평가의 ‘전임교원확보율’의 지표에는 재학생 수로 반영되어 불리하게 작용될 수 있기 때문에, 이를 우려한 대학들이 졸업유예자 수를 줄이는 방향으로 졸업유예제 운영 방식을 바꾼 것이다(대학교육연구소, 2014.03.30.; 2015.02.02.).
졸업유예자의 증가는 정부재정지원 평가사업의 지표에는 유리하게 적용되나 대학 구조개학평가의 지표에는 불리하게 나타나 대학은 졸업유예자 수를 줄이기 위해 운영 방안을 변경하였다. 