사업지원팀, 정책연구팀, 홍보협력팀, 정보관리팀 등 총 4개 팀으로 구성되어 있어 각 팀마다 전담업무를 수행하고 있습니다. 사업지원팀은 지역아동보호전문기관 업무 및 종사자·전문성 역량강화 지원, 국내외 사례 개입을 담당하고 있고, 정책연구팀은 아동학대 예방 관련 연구를 진행하고 있습니다. 아동 학대는 예방이 중요한 만큼 홍보협력팀에서 아동학대 인식개선 및 예방홍보 사업을 수행하고, 정보관리팀에서 국가아동학대 정보시스템을 운영하고 있습니다. 특히 특례법 시행 이후 지역아보전을 위한 법률 자문 요청이 증가하여 수사기관 및 사법기관과 연계를 강화하고, 상근변호사를 배치하여 원활한 업무지원을 위해 노력하고 있습니다.
특례법 시행 이후 법률 자문 요청이 증가함에 따라 사업지원팀, 정책연구팀, 홍보협력팀, 정보관리팀 등 4개의 팀으로 나뉘어 원활한 업무지원을 위해 노력하고 있습니다.