사업 타당성 조사는 기재부가 예산을 편성하기 직전에 방사청의 사업 추진 기본 전략에 대한 예산 반영 여부에 대한 적정성 검토를 위한 연구이며, 비용분석도 이와 상응하여 수행하고 있다. 사업 타당성 조사에서의 비용분석은 사업 추진 기본 전략을 통하여 IPT에서 요구하는 사업 관련 예산의 적절성을 항목별로 검토하여 최종 사업 타당성 조사 결과에 반영하는 데 그 목적이 있다. 따라서 사업 타당성 조사에서의 비용분석은 전력소요검증, 선행연구 및 사업 분석(전문 비용분석 포함) 단계에서 수행하는 비용분석과 유사한 절차와 방법론을 적용 하나, 분석 대상과 분석 결과가 다르다.
기재부가 예산을 편성하기 직전에 사업타당성 조사라는 것을 한다. 사업타당성 조사에서 비용분석은 사업 추진 기본전략을 통하여 관련예산의 적절성을 검토하는데 목적이 있다.