이러한 논란에도 불구하고, 노사 간 중앙 차원에서 기본협약을 체결한 뒤 권역별 보충교섭에 들어갔으며 12월에 가서야 최종적으로 마무리되었다. 권역별 교섭에 들어간 이유는 지역별 편차를 노사 모두 인정하였기 때문이다. 예를 들어, 대도시와 중소도시, 농어촌 지역별로 수리건수 차이가 크기 때문에 단일한 수준의 임금 및 노동조건 결정이 어렵다고 판단하였다. 또한 원거리 방문수리로 파생되는 장거리수당을 비롯한 수당 설정도 지역별 편차를 고려해야 했다. 6월 말 기본협약이 체결된 뒤 12월 지역별 조인식까지 5개월이 소요되며 노사 모두 피로도가 상승했다. 더욱이 노조 측은 지역별 교섭으로 인해 지역별 임금격차가 발생하는 결과를 초래했다는 조합원들의 불만과 직면하게 되었다. 조합원들의 불만 증가로 노조 탈퇴까지 이어지면서 조합원 수가 950명까지 감소하자 이후 통일된 교섭형태의 필요성을 갖게 되었다. 반면, 사측은 센터별 경영성과를 반영한 센터별 교섭이 바람직하다는 원칙을 가지고 있었으나 최초 단체교섭 시작부터 경총과 노측의 기본협약 타결, 지역별 타결까지 1년이나 소요된다는 점에서 비효율적이라고 보았다.
논란은 있었으나, 노사 간 중앙 차원에서 기본협약을 맺은 후 노사 모두 지역별 편차가 존재한다는 사실을 인정하였기 때문에 권역별 보충교섭에 들어갔으며, 12월에 최종 마무리되었다.