제2차 물류시설개발 종합계획은「물류시설의 개발 및 운영에 관한 법률」 제4조에 따라 물류시설의 중복·과잉 투자를 방지하고 체계적인 물류시설 공급으로 효율적인 물류네트워크의 구축방안을 목적으로 `13년 1월 발표되었다. 이 계획은 5년 단위의 종합계획으로 `10년 고시된 국가물류기본계획 수정계획(`11~`20)의 물류시설 부문의 연동계획으로 제1차 계획(`08~`12) 수립 이후 표출된 새로운 국가, 경제, 사회의 다양한 변화 및 상황을 반영하고, 기존 계획의 평가 및 분석을 통해 향후 5년간 추진해야 할 물류시설정책에 대한 기본 방향을 재정비하여 추진정책의 주요내용 및 사업 발굴을 위한 종합계획이다.
2013년 1월 효율적인 물류시설 구축을 위해 제2차 물류시설개발 종합계획이 발표되었으며, 환경 변화와 기존 계획에 대한 평가를 반영하여 물류시설정책의 방향성을 수정하였다. 