본 보고서는 바람직한 남북한 경제통합의 방향을 모색하기 위해 경제통합의 주요 부문인 무역 및 투자, 화폐통합, 인적자원 활용 등 부문별 통합제도 연구와 동북아 분업구조 및 경제협력에 대한 영향을 바탕으로 점진적인 통일 과정에서의 남북한 경제통합 추진전략을 제시하고자 하였다. 남북한의 평화적 관계 유지는 경제적인 거래의 효율성을 극대화하기 위해 필요하며, 남북한의 무역 및 투자 활성화를 위한 제도적이고 실제적인 틀이 마련되어야 함을 확인하였다. 남북한 화폐통합도 단계적이고 점진적인 방식을 고려할 필요가 있으며 그 과정에서 새로운 통합회계단위를 도입하여 운영함으로써 실물부문의 거래확대를 유도하고 남북한 경제통합 과정에서 실물부문이 연착륙으로 이어지도록 해야 함을 확인하였다. 북한 인적자원을 효과적으로 활용하고 남북한 경제통합의 긍정적 효과를 극대화하기 위해서는 북한 인적자원에 대해 적용할 최저 임금 수준과 임금 상승 조건 등의 합의, 동아시아 지역의 이해 당사자를 포함하는 글로벌 협력 확대 방안의 검토, 단계별 경제통합 프로그램을 실현할 특구 지정 등이 전제되어야 함을 확인하였다. 남북한 경제통합은 한국과 북한 모두에게 경제적으로 적지 않은 이익이 되는 것으로 나타났으며, 아울러 남북한 경제통합과 동시에 북한이 동북아 경제통합에 참여하는 시나리오의 결과를 보면 북한은 물론 한국, 중국과 일본 모두에게 긍정적인 영향을 미치는 것으로 나타났다.
한국과 북한 모두에게 이익이 될 것으로 보이는 남북한 경제통합 추진전략은 먼저 화폐통합을 위한 새로운 통합회계단위의 도입 및 운영 그리고 북한의 인적자원을 활용하는 방법과 임금수준  등이 검토되어야 한다.