지방권의 중요한 산업인 농업부문에 있어서도 오랜 현안이었던 구조개혁이 점차 진행되기 시작했다. 농업종사자의 대폭 감소로 인해 농업협동조합이 국정 선거에 미치는 영향력이 약화되면서, 정부는 농업개혁에 속도를 내려 하고 있다. 일본의 농업은 위기 상황에 직면하고 있고, 농업종사자 수는 최근 20년 동안 900만 명에서 560만 명으로 감소하는 한편, 경작포기 농지는 15만ha에서 40만ha로 증가하고 있다. 주로 농업에 종사하고 있는 기간적(基幹的) 농업종사자의 평균연령은 66.5세(2013년)로 고령화되고 있으며, 가까운 장래에 이들이 은퇴하게 되면 농업은 붕괴위기에 직면하게 되는 것이다. 농업이 위기에 빠지게 된 요인은 몇 가지 있으나 최대의 걸림돌은 농업부문으로의 신규 참여를 거부하는 폐쇄성이다.
일본 정부는 농업 종사자 수의 감소 및 고령화와 경작포기 농지의 증가로 붕괴위기에 처한 농업의 개혁 속도를 올리고 있는데 농업위기의 요인 중 최대 걸림돌은 농업으로의 신규 참여를 거부하는 폐쇄성이다.