중기부는 향후 중복보증 최소화를 위해 보증기관 간 협약을 체결하여 보증기관의 특성과 설립취지를 살리고 기관별 가이드라인을 마련하여 보증지원의 효과성을 제고하고 한정된 보증재원을 적재적소에 지원하여 정책대상에서 소외되는 지역 또는 분야를 최소화하겠다는 의견을 제시하였다. 다만 기술가치 평가보증의 경우 규모와 업종, 성장단계 등 특수성으로 인해 다른 보증기관을 이용할 수 있고, 지역별 우수기업 특례 보증 등 정부 및 지방자치단체가 중점적으로 추진하는 정책에 대한 자율성이 필요한 부분이 있어 기관 간 중복보증을 원천적으로 차단하는 것은 정부시책사업 이행과 성장하는 기업 등에 장애요인으로 작용할 수 있으므로 이러한 점은 참작되어야 한다는 의견을 제시하였다.
중기부는 중복보증 방지를 위해 기관 간 협약 체결, 개별 가이드라인 마련 등의 방안을 냈다. 다만 기술가치 평가보증의 경우 정부시책사업 이행 및 기업 성장의 방해로 이어질 수 있어 유의해야한다.