일본의 고용시스템은 종신고용, 연공임금체계, 그리고 현장교육을 통한 교육훈련과 인재육성 시스템에 의해 유지되어 왔다고 할 수 있다. 이러한 고용시스템 하에서 정규직노동자들은 정년까지 고용이 보장되었고, 근속연수가 길어짐에 따라 지위와 임금이 올라갔으며, 재직기간중에 받은 현장교육과 배치전환을 통해 자신들의 경력을 쌓아 갈 수 있었다. 일본의 기업별노조는 지금까지 이러한 정규직노동자들의 이해를 대변해 오면서, 일본식 고용시스템의 발전에 일조해 왔다고 볼 수 있다. 이러한 일본식 고용시스템에서 대부분 남성·정규직노동자가 유리한 처우를 받을 수 있었고 여성과 비정규 노동자는 배제되어 왔다. 1990년대 이후, 버블 경제가 붕괴되고, 장기적인 경기침체가 지속되어 오면서, 일본식 고용시스템은 서서히 붕괴되기 시작했으며, 남성·정규직노동자를 포함한 전체 노동자의 노동조건은 악화되어 갔다. 그 중에서도 여성과 비정규직노동자의 처우가 집중적으로 악화되어 왔는데, 기존의 기업별노조가 이들의 처우악화에 효과적으로 대응해 오지 못했다는 것이 일반적인 평가이다.
일본의 고용시스템에서 기업별노조는 정년과 근속연수에 따른 지위 및 임금 상승이 보장되는 정규직노동자들의 이해를 대변하며 여성과 비정규 노동자는 배제했었다. 고용시스템이 붕괴되면서 여성과 비정규노동자의 처우는 매우 악화되었으나 기업별노조는 이들의 처우악화에 효과적으로 대응하지 못했다.