그러나 금융청 및 금융청 특정금융정보실은 수사기관이 아니기 때문에 테러 자금조달에 관한 구체적인 혐의거래사안을 수사할 권한을 행사할 수 없다. 검사가 인지한 자금세탁범죄나 테러자금제공범죄사건에 필요한 테러자금 및 자금세탁 혐의거래정보를 검사에게 제공할 수 있을 뿐이다. 따라서 구체적인 사례에서 테러자금조달과 관련된 개별 금융기관, 금융청 특정금융정보실 및 법무성 간의 정보교환은 대단히 중요하며 실무적으로도 테러자금조달이나 자금세탁과 관련된 구체적인 수사사건의 경우에는 금융청 특정금융정보실과 사건 담당 일선 검찰청 간의 긴밀한 업무협조가 이루어지고 있다.
금융청 및 금융청 특정금융정보실은 수사권한을 행사할 수 없지만 검사는 있기 때문에 금융청 특정금융정보실 및 법무성 간의 정보교환은 대단히 중요하다.