프로그램 예산제도에 관한 선행연구들은 프로그램 예산제도의 문제점들을 규명하고 개선방안을 일부 논하고 있지만, 체계적으로 프로그램 예산제도를 평가하는 연구는 없다. 프로그램 예산이 기존 투입중심의 예산 운용을 프로그램 및 성과중심 예산운영의 패러다임으로 전환하는 기대효과를 달성하고 있는지 평가할 필요가 있을 것이다. 한국 행정연구원에서는 2013년 기본과제로 프로그램 예산제도에 대한 평가에 관한 연구를수행하였는데, 2007년에 노무 현 정부에서 도입된 ‘프로그램 예산제도’를 주된 범위로 하고 있다. 기획재정부의 예산총괄과 관계자, 재정사업 평가 담당자 등을 인터뷰하고, 성과계획서 및 성과보고서, 예산서 및 결산서의 프로그램 예산 현황 등에 대한 사례분석을 실시하였으며, 평가모형을 설정하여 설문조사를 실시함으로써 프로그램 예산제도에 대한 평가를 시도하였다.
선행연구에서 체계적인 프로그램 예산제도 평가 연구는 없다. 2013 한국 행정연구원의 평가 연구 시 2007년 도입된 '프로그램 예산제도'를 사용했다. 담당자 인터뷰 및 사례분석을 실시하고 평가모형 설문조사를 실시해 평가했다.