두 번째 유형은 고용 창출 규모는 크지만 고용 창출을 실현시키기까지 많은 시간이 필요한 ‘산업클러스터형 개발’이다. 기존의 공장 유치형 개발과는 달리, 지역에서의 자발적 산업・고용 창출이 기대되는 유형으로서, 경제산업성의 ‘산업클러스터 계획’과 문부과학성의 ‘지적 클러스터 창성 사업’이 진행되고 있다. 그 대표적인 예가 효고현 고베시가 진행하고 있는 ‘첨단 의료산업특구’이며, 산업클러스터 개발에 구조개혁 특구를 결합시켜 지역을 개발하려 하는 것이다. 사업 구분(역자 주: 事業仕分け- 2010년도 예산편성을 위해 민주당 정권이 도입한 수법으로서, 행정쇄신회의가 정부나 지방자치단체 등을 대상으로 예산낭비를 줄이기 위한 각 사업 예산에 집행 여부를 심의하는 것)과 관련해 유명세를 치른 슈퍼컴퓨터를 갖춘 이화학연구소, 바이오 관련 연구개발형 기업, 의료 간호계열 대학 등이 모여있다.
다음 유형은 고용 창출 규모는 크지만 실현에는 장시간을 요하는 '산업클러스터형 개발'로서 지역 자발적 진행 방식이다. 대표적 사례인 효고현 고베시 첨단 의료산업특구에는 이화학연구소, 바이오 기업, 의료 간호계열 대학 등이 모여있다.