전자증거는 증거 분석과정의 기술적 복잡성, 대용량에서 오는 문제점으로 인해 전자증거에 기존 영장주의 법리를 적용하는 데에 대한 논란이 있다. 이러한 논란을 해결하기 위해서는 첫째, 기술적 대안으로 문서의 주변부 정보까지 이미징 할 수 있는 도구를 개발하여 피의자의 프라이버시 등 헌법상 권리를 보장하면서도 수사기관이 전자증거의 특성을 반영한 수사를 통해 실체적 진실을 발견할 수 있는 균형점을 찾도록 제안하고 둘째, 임의제출자의 권리 보장을 위해서 절차적 대안으로 전자증거의 검증 과정 중에 표준화된 ‘데이터 완전삭제 솔루션’을 사용하게 하고, 임의제출자가 직접 필요 없는 데이터를 자발적으로 삭제할 수 있는 절차를 보장함으로서 제출 범위 및 증거조작에 대한 불필요한 논란을 해결하도록 제안하였다. 셋째, 전자증거의 경우 위변조 가능성을 전적으로 배제할 수 없으므로 임의제출자가 프라이버시 관련 데이터 삭제시 입회인을 참여하게 함으로 임의제출한 전자증거가 ‘의도적인 조작이 없었음을 담보’할 수 있도록 제안하였다.
전자증거는 증거 분석과정의 기술적 복잡성, 대용량에서 오는 문제점으로 인해 전자증거에 기존 영장주의 법리를 적용하는 데에 관한 논란이 있다.