본 연구에서는 가뭄저항성 Agb0103 GM벼의 환경위해성 평가를 위해, 2011년부터 2014년까지 4년간 가뭄저항성 GM벼(Agb0103)와 모본주인 일미벼(NGM)의 생육기간 동안 병 발생양상 및 엽권미생물 분포를 조사하였다. 그 결과, 품종간 주요하게 발생한 병해는 잎집무늬마름병, 깨씨무늬병, 잎도열병 및 이삭누룩병이었고 Agb0103과 NGM에서는 품종간 유의한 발병율의차이를 보이지 않았다. Agb0103과 NGM의 엽권미생물의 생균수를조사한 결과, 세균과 곰팡이의 생균수는 환경영향에 의해 각각 증가하거나 감소하는 경향을 보였고 품종간에는 차이는 확인 할 수 없었다. 또한 polymerase chain with denaturing gel electrophoresis( PCR-DGGE) 결과를 기반으로 한 UPGMA 분석 결과에서도세균과 곰팡이의 DGGE 밴드 패턴은 모두 월별로 결집되었으며, Agb0103과 NGM 간에 차이는 확인되지 않았다. Agb0103과NGM 품종에서 주요하게 발생한 깨씨무늬병과 잎집무늬마름병을분리하고 접종한 결과, 각 병원균은 병원학적, 형태학적 특성에서품종별로 차이가 없었다. 따라서 가뭄저항성 형질을 갖는 GM벼Agb0103은 병 발생, 발병 균의 특성 및 표면미생물의 발생 양상이모본주인 일미벼와 유의한 차이가 없는 것으로 확인되었으며, 엽권미생물과 환경에 영향을 끼치지 않을 것으로 사료된다. 
품종간 주요하게 발생한 병해는 잎집무늬마름병, 깨씨무늬병, 잎도열병 및 이삭누룩병이었고 Agb0103과 NGM에서는 품종간 유의한 발병율의차이를 보이지 않았다. Agb0103과 NGM의 엽권미생물의 세균과 곰팡이의 생균수는 환경영향에 의해 각각 증가하거나 감소하는 경향을 보였고 품종간에는 차이는 확인 할 수 없었다. 따라서 가뭄저항성 형질을 갖는 GM벼 Agb0103은 병 발생, 발병 균의 특성 및 표면미생물의 발생 양상이모본주인 일미벼와 유의한 차이가 없는 것으로 확인되었으며, 엽권미생물과 환경에 영향을 끼치지 않을 것으로 보인다.