일제는 1907년 7월 보병제14연대를 포함하는 1개 여단 병력을 한국에 파견하였다. 14연대의 주요 업무는 구한국군의 강제 해산이었다. 14연대는 지방진위대를 강제 해산시켰다. 그 과정에서 해산에 반대하는 진위대와 전투도 벌였다. 14연대는 구한국군이 강제로 해산된 후에는 의병탄압에 나섰다. 14연대의 예하 부대는 각기 수비지역의 의병을 무력 탄압하였다. 1907년 9월 경기, 충청지역 의병을 탄압하기 위하여 장호원과 음성, 병천, 직산 등지에 부대를 파견하였으며, 그해 10월에는 금산대와 진산대 등을 조직하여 대둔산 일대의 의병을 탄압하였다. 1907년 9월에는 경북 산간지역의 이강년의진을 비롯하여 신돌석의진, 산남의진을 탄압하였다. 14연대장 菊池는 각지에 방문을 붙여 ‘大勢論’을 펴면서 의병의 해산을 종용하였다. 일본군의 집중적인 탄압에 의병은 경북 산간지역과 해안 지역으로 이동하면서 항전하였다. 산남의진은 영천, 청송, 흥해, 영일 등지에서 일본군과의 항전에서 많은 전과를 수립하였으나, 1907년 12월 의병장 정환직이 체포되고 말았다. 1908년 7월 이강년이 체포되었으며, 그해 12월 신돌석이 순국하였다. 14연대는 호남의병에 대한 탄압을 전개했다. 광주수비대는 지리산 연곡사 일대에서 고광순의병장을 비롯하여 40여명을 학살하였으며, 기삼연의병 23명을 사살하였다. 또한 전남 서남부와 해안지대에 부대를 재배치하고 전해산의병, 안규홍의병, 심남일의병, 양진여의병 등을 공격하여 의병들을 학살하였다. 일본군은 의병측이 무기를 밀수하려한다는 정보를 입수하고 밀수 방지를 위한 부대를 배치하기도 하였다. 이에 따라 영해에서 진주, 진주에서 고부, 고부에서 인천까지 각기 부대를 배치하여 해안을 경계시켰다. 일본군은 의병과의 교전 중에 많은 의병을 체포하였는데, 이들을 심문하고 정보를 입수한 후에는 대부분 학살하였다. 미국 선교사의 보고에 의하면 일본군은 포박되어 있는 의병을 학살하고 그 시체를 유기하였다고 한다. 이와 같이 민간인인 의병과 일본군과의 전투는 일본군이 무장도 제대로 못한 민간인에 대한 일방적인 학살이었다.
일제는 1907년 7월 보병제14연대를 포함하는 1개 여단 병력을 한국에 파견했다. 14연대는 지방진위대를 강제 해산시켰다. 광주수비대는 지리산 연곡사 일대에서 고광순의병장을 비롯해 40여명을 학살했고, 기삼연의병 23명을 사살했다.