총체적 언어 교육을 잘못 이해한 상태에서 적용하게 되면, 총체적 언어교육이 가지고 있는 고유한 가치를 드러내지 못하고 결국 총체적 언어교육 자체를 왜곡시킬 수 있다. 이 시점에서, 총체적 언어교육에 대해 잘못 이해하고 있는 점을 분명히 짚어볼 필요가 있다. 여기에서는 총체적 언어 교육에 대한 오해 중에서 대표적인 것을 살펴보고 이것이 왜 오해인지를 해명하고자 한다. 이러한 논의는 총체적 언어교육을 제대로 이해하게 하고, 학교 현장에서 이것의 가치가 제대로 드러내는 데 나름의 가치를 지닐 수 있으리라 기대된다. 이 글에서는 총체적 언어교육에 대해 활동이 있으면 통합이 되었다고 보는 점, 하나의 방법으로 파악한 점, 총체적 언어교육을 외국어 학습 이론으로 보는 점, 문학 중심으로 파악하는 점, 유치원이나 초등학교에서 적용될 수 있는 이론으로만 보는 점 등에서 문제가 있음을 지적했다.
총체적 언어 교육을 잘못 이해한 상태에서 적용하게 되면, 총체적 언어교육이 갖고 있는 고유한 가치를 드러내지 못하고 결국 총체적 언어교육 자체를 왜곡시킬 수 있다.