The Navy is responsible for all naval operations in Estonia. The functions of the Navy are the preparation and organisation of the defence of the territorial waters and coast of the state, ensuring the security of maritime communications and sea traffic in the territorial waters and co-operation with NATO and the navies of other friendly countries around the Baltic Sea.
Merevägi vastutab kõikide mereoperatsioonide eest Eestis. Mereväe ülesanneteks on riigi territoriaalvete ja ranniku kaitse ettevalmistamine ja korraldamine, mere-kommunikatsiooniliinide ja laevaliikluse julgeoleku tagamine territoriaalvetes; koostöö NATO ja teiste sõbralike Balti mere riikide laevastikega.