Most EU research funding is allocated on the basis of competitive calls, but the budget for Horizon includes funding also for the Joint Research Centre, the European Commission's in-house science service; the European Institute for Innovation and Technology and research carried out within the framework of the Euratom Treaty.
ELi teadusuuringute rahastamine toimub enamasti projektikonkursside põhjal, kuid raamprogrammis „Horisont 2020” on olemas vahendid ka Teadusuuringute Ühiskeskuse (Euroopa Komisjoni sisene teadustalitus), Euroopa Innovatsiooni- ja Tehnoloogiainstituudi ja Euratomi asutamislepingu raames tehtavate teadusuuringute rahastamiseks.