The Lisbon Treaty also implies changes to the functioning of the EU which will affect the respective roles and responsibilities of the Commission and the Parliament in managing and scrutinising the use of EU funds.
Ka Lissaboni lepingus viidatakse Euroopa Liidu toimimisega seonduvatele muutustele, mis mõjutavad komisjoni ja parlamendi vastavaid rolle ja ülesandeid ELi vahendite kasutamise haldamisel ja kontrollimisel.