The authority of the President in the area of national defence is quite extensive – he is the supreme commander of the national defence. Interpreting this provision, the Supreme Court has found that the commander of national defence cannot only possess symbolic authority, and therefore the executive power should not side-step the President in making decisions regarding national defence. In reality it is quite obvious, however, that the executive power, i.e. the Ministry of Defence, can solve problems more efficiently. It is for this reason that the national defence is in the hands of several different bodies.
Vabariigi Presidendi riigikaitsealased volitused on küllaltki ulatuslikud — tegemist on Eesti riigikaitse kõrgeima juhiga. Riigikohus on seda sätet tõlgendades leidnud, et riigikaitse kõrgem juht ei saa olla ainult sümboolse võimuga ja seega ei tohiks täidesaatev võim riigikaitsealaseid otsuseid langetades Vabariigi Presidendist mööda minna. Reaalpoliitiliselt on aga ilmselge, et täidesaatev võim kaitseministeeriumi näol suudab riigikaitsealaseid küsimusi lahendada efektiivsemalt, millest tulenevalt ongi riigikaitse juhtimine jagatud mitme erineva organi vahel.